PLoS One: A polimorfizmus (rs2295080) a mTOR promoter régió és társítását gyomorrák a kínai Population

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

Ennek elengedhetetlen részét PI3K /Akt /mTOR útvonal , mammalian target of rapamycin (mTOR) kimutatták, hogy növeli a gyomor rákos sejtek és a daganatok. A kutatás feltárta a kapcsolat egyetlen nukleotid polimorfizmus (SNP) rs2295080 mTOR katalógusa promoter régió és a kockázat a gyomorrák (GC). Katalógusa

Módszerek

hétszázötven -három (753) gyomor adenokarcinóma betegek és 854 illesztett egészséges alanyok vettek a rákos egyesület tanulmányi és 60 szöveteket használt teszt kifejezése mTOR katalógusa. Feltétlen logisztikus regressziót kiválasztott értékelni a szövetség között rs2295080 T > G polimorfizmus és a GC kockázatot. Ezután megvizsgálták a funkcionalitás e promoter genetikai variáns által iuciferázvizsgáió és az EMSA. Katalógusa

Eredmények katalógusa

Egyének G allél volt egy 23% -kal csökkent kockázata GC, összehasonlítva azokkal hordozó T allél (korrigált OR = 0,77, 95% CI = 0,65-0,92). Ez a védőhatás a G allél állt ki jobban a férfi csoportban. Eközben GC hordozó betegeknél TG /GG genotípus is megjelenik a csökkent mRNS szintje a mTOR katalógusa ( P katalógusa = 0,004). Luciferáz vizsgálat, T allél inkább fokozza a transzkripciós aktivitását mTOR
egy hozzávetőleges 0,5-szor több mint G allél. Az EMSA továbbá tesztek kifejtette, hogy a különböző allélja rs2295080 megjelenő eltérő affinitással bizonyos transzkripciós faktor. Katalógusa

Következtetés katalógusa

A mTOR katalógusa promoter polimorfizmus rs2295080 szignifikánsan összefüggött a GC kockázatot. Ez az SNP, amely hatékonyan befolyásolja a kifejezés mTOR katalógusa, lehet egy új biomarker korai diagnózisa gyomorrák és a megfelelő indikátor kihasználva mTOR-gátló kezelés a GC. Katalógusa

Citation: Xu M, Tao G, Kang M, Gao Y, Zhu H, Gong W, et al. (2013) A polimorfizmus (rs2295080) mTOR katalógusa Promoter régió és Egyesület gyomorrák a kínai népesség. PLoS ONE 8 (3): e60080. doi: 10,1371 /journal.pone.0060080 katalógusa

Szerkesztő: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto di FIRC Oncologia Molecolare, Olaszország katalógusa

Beérkezett: november 26, 2012; Elfogadva: február 21, 2013; Megjelent: március 29, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Xu et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a tanulmány részben támogatta Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína (81230068, 30972444, 81001274 és 81102089), a kulcs Program Természettudományi Alapítvány Jiangsu tartomány (BK2010080), Természettudományi Alapítvány Jiangsu tartomány (BK2011773 és BK2012842), a kulcs Program Basic Research Jiangsu tartományi Oktatási Minisztérium (11KJB330002 és 12KJA330002), a Qing-Lan Project Jiangsu tartományi Oktatási Minisztérium, és a prioritási Akadémiai Program fejlesztése Jiangsu felsőoktatási intézmények (Közegészségügyi és Preventive Medicine). Ezúton is szeretnék köszönetet mondani Luo Y (Nanjing Vöröskereszt Blood Center) az általa nyújtott segítségért funkcionális kísérletek. A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették fenn összeférhetetlenség. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák (GC) a leggyakrabban előforduló daganat világszerte férfiak körében 640.556 és nők 349.042 új esetet és 738.069 halálesetek 2008-ban [1]. Figyelembe véve a terápiás hatékonyság, sebészi eltávolítás lehet elsődleges gyógyító kezelés korábbi szakaszában GC betegeknél [2]. Sajnos, a legtöbb gyomorrákos betegek észlelése előrehaladott stádiumban, amely időszak alatt a daganat műthető többé. Továbbá, a visszaesés a műtét után egy újabb szörnyű esemény egy szegény 5 éves túlélési arány. Figyelembe véve a betegek előrehaladott vagy kiújuló gyomorrák, ez nem kétséges, hogy a felfedezés a biomarkerek és a kérelem a hagyományos diagnózist lehet értékes jelzés és egy nagy segítséget megfogalmazni a megelőzés és a kezelési stratégia. Katalógusa

Emlős cél rapamycin (mTOR) áll 2549 aminosavból elrendezve erősen konzervált domén [3]. Szerkezetileg, mTOR tartalmaz egy rapamicin-kötő domén a középső részén, és egy kináz domént, a C-terminális [4]. Mint olyan kulcsfontosságú eleme PI3K /Akt /mTOR-útvonal, mTOR szorosan releváns a tőke sejtes folyamatok, mint például a sejtek növekedését, proliferáció, metabolizmus, a migráció, angiogenezist és apoptózist [5] - [7]. Eddig mTOR katalógusa termékekről van szó, mint két különböző komplexek (azaz mTORC1 és mTORC2) különböző érzékenységi [8], [9]. mTORC1 egy rapamicin-érzékeny komplex, amely magában foglalja az mTOR plusz FK506-kötő fehérje 12 kDa (FKBP12), emlős LST8 (mLST8), és a szabályozó-asszociált protein mTOR (Raptor). Ezzel szemben, a mTORC2 áll a SIN1, mLST8, és a rapamicin-érzéketlen társ mTOR (rictor) [10] - [12]. Zavara mTOR katalógusa gyakran jelenik meg a különféle rákos megbetegedések során karcinogenitási és romlás. Azonban ennek az oka a rendellenes jelenség még glutted vitákkal. Katalógusa

Számos tanulmány vizsgálta a szerepe egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) a mTOR katalógusa gén etiológiájában rákok különböző szervek, beleértve a nyelőcsőrák [13], tüdőrák [14], hólyagrák [15], vastagbélrák, végbélrák, [16] és akut limfoblasztos leukémia [17]. A legtöbb ilyen SNP keresse exon vagy intronok ismeretlen funkcionális hatásokat. A közelmúltban, egyre több tanulmány középpontjában a SNP ülőhelyek gén promoter régióban, amely bizonyítottan befolyásolják a kötési képesség bizonyos transzkripciós faktorok (TFS) és hatás a következő gén transzkripciót. Ebben a tanulmányban azt feltételeztük, hogy mTOR
rs2295080 T > G polimorfizmus belül a promoter régió befolyásolhatja az érzékenység GC. A teszt ezt a hipotézist, genotipizálását gyakorisága mTOR katalógusa rs2295080 próbára jelentőséget GC kockázatok egy folyamatos, kórház-alapú, eset-kontroll vizsgálat a kínai populációban. Következésképpen találtunk a mTOR katalógusa mRNS szintek különböző genotípusok szöveteiben gyomorrákos betegek. Továbbá, mi is jellemzi a funkcionalitás e genetikai variáns a mTOR katalógusa promoter transzkripció iuciferázvizsgáió és az EMSA. Katalógusa

Anyagok és módszerek katalógusa

szakterületektől katalógusa

Ez a tanulmány áll 753 beteg szövettanilag igazolt gyomor adenokarcinóma és 854 ráktól mentes ellenőrzéseket. Minden beteget vontak a Cancer Research Base Clinical Nanjing Orvostudományi Egyetem között 2006. március 2010. január És demográfiai és klinikai adatokat, köztük az életkor, a nem, a tumor mérete, telek, szövettani típusú, mélysége invázió, nyirokcsomó áttét, távoli áttétek, és a TNM stádium, alkalmazásával kaptuk egy rövid kérdőívet és a klinikai orvosi feljegyzések. katalógusa

a frekvencia illesztett, hogy ezekben az esetekben az életkor (± 5 év) és nem szerint gyűjtöttük az azonos időszakban és régiók független genetikai kapcsolat a gyomor betegség és emésztőrendszeri daganatok. Minden résztvevő aláírt egy írásos beleegyezési és adományozott 5 ml vénás vért a genomi DNS kivonás. A vizsgálati protokollt jóváhagyta az intézményi felülvizsgálati tanács Nanjing Orvostudományi Egyetem. Katalógusa

DNS kivonása és SNP Genotyping

A genomi DNS-t vontunk ki a vérből a korábban leírtak szerint [18]. Genotipizálás fejeződött TaqMan SNP genotipizálás Analitika ABI 7900HT valós idejű PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) és Sequence Detection System 2.4 (SDS 2.4). A szekvenciák primereket és próbákat kérésre, és a kontrollokat tartalmazott minden tányér pontosság érdekében genotípus. A genotipizálás vizsgálatot úgy végezzük, két személy függetlenül vak formában. Több, mint 10% -a a mintákat véletlenszerűen kiválasztott megerősítését, és az eredmény a 100% az egyezés. Primereket és próbákat táblázatban felsorolt ​​S1. Katalógusa

Cell Culture és építése Promoter riporter plazmid katalógusa

Egy normál gyomornyálkahártya epiteliálissejtvonalából (GES-1) és három különböző gyomor rákos sejtvonalak (BGC -823, MGC-803, és SGC-7901) fogadták be a vizsgálatba. Minden sejteket tenyésztettünk Dulbecco-féle módosított Egale közepes /magas glükóz táptalaj, 10% FBS-t, 10 mM HEPES, 2 mM L-glutaminnal, 1 mM piruvát nátrium, 100 U /ml penicillint és 100 ng /ml sztreptomicinnel, 37 ° C-on nedvesített atmoszférában, amely 95% levegőt és 5% CO _{2. A legtöbb reagenst a GIBCO (Burlington, Ontario, Kanada).}

luciferáz riporter plazmid, a humán mTOR
promoter szekvenciák különböző allélok az rs2295080 T > G polimorfizmus szintetizáltunk és kialakítani pGL3-basic vektor (Promega, Madison, WI, USA) által Generay Company (Sanghaj, Kína). Minden plazmidokat DNS-szekvenálással igazoltuk. Primerek részt vesz a tesztet táblázatban felsorolt ​​S2.

Tranziens transzfektálás és Luciferase Assay

GES-1, BGC-823, MGC-803, és az SGC-7901 sejteket transzfektáltunk Lipofectamine 2000 (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), 0,8 ug az egyes konstruált vektor, akár a T alléi vagy a G allélt. Ezzel párhuzamosan, a 10 ng pRL-SV40 lyukanként is transzfektáltuk, mint belső kontroll korrekciójára transzfekció hatékonyságát. Mielőtt a sejteket oltottunk 24 lyukú lemezeken éjszakán át, hogy biztosítsák a 90% -95% összefolyás idején transzfekció. Huszonnégy órával a transzfektálás után a luciferáz aktivitást mértük a Dual-Luciferase Reporter Assay System (Promega, Madison, WI, USA), és fejezzük ki az arány a szentjánosbogár luciferáz a Renilla luciferáz-aktivitás. Minden sejtet három párhuzamossal végzünk azonos körülmények között.

Elektroforetikus mobilitás-eltolódásos vizsgálati eljárás (EMSA)

A szensz próba szekvenciák a következők voltak: rs2295080 T szonda 5'-AGGGTTCCCATCCCTGAGGAC-3 '; rs2295080 G szonda 5'-AGGGTTCCCAGCCCTGAGGAC-3 '. Nukleáris fehérjéket extraháljuk NE-PERTM sejtmagban és a citoplazmában kivonószerekben (Pierce, Rock-ford, IL, USA). DNS-próbákat állítottunk elő az biotin 3'-végen DNS jelölő kit (Pierce, Rock-ford, IL, USA). Elektroforetikus mobilitás-eltolódásos vizsgálati eljárás (EMSA) végeztük egy LightShift kemilumineszcens EMSA Kit (Pierce, Rock-ford, IL, USA). Kötési reakciókat hajtottunk végre az alábbiak szerint: a nukleáris extraktumok (8 ug fehérje), és az 1 × kötőpuffer 2,5% glicerin, 5 mM MgCI _{2, 50 ng /ul poli (di-DC), 0,05% NP-40, és 20 fmol biotinnal jelzett rs2295080 T /rs2295080 G próbákat jégen inkubáljuk 30 percig egy 20 pl térfogatban. A kompetíciós vizsgálatokhoz nukleáris extraktumokat inkubáltuk jelöletlen oligonukleotid 30 percig, mielőtt hozzáadtuk volna jelzett oligonukleotid.}

expressziós szintjét a mTOR
mRNS-t.

teljes RNS-t 60 gyomor- rák szövetek, benne 753 esetben, különböző genotípusokat extraháljuk Trizol reagens (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). Az mRNS-t mértük kvantitatív valós idejű PCR (ABI 7300) reverz transzkripciót követően. GAPDH-t használtunk belső mennyiségi szabályozás az egyes mintában. Az alkalmazott primerek az mTOR amplifikáció voltak F: 5'-TTGCTTGAGGTGCTACTG-3 'és R: 5'-CTGACTTGACTTGGATTCTG-3'; a primerek GAPDH voltak F: 5'-AAGGTGAAGGTCGGAGTCAAC-3 'és R: 5'-GGGGTCATTGATGGCAACAATA-3'. Relatív számszerűsítése mTOR katalógusa mRNS alapján számították ki a 2-ΔΔCt módszerrel. Fold változások normalizálódtak tekintetében GAPDH, és minden vizsgálatot végeztünk három példányban. Katalógusa

A statisztikai elemzést. Katalógusa

A Hardy-Weinberg (HWE) értékelték a chi-négyzet illeszkedési teszt összehasonlítani a megfigyelt genotípus frekvenciák a várható az ellenőrzéseket. Egyesületek genotípusok és a kockázat a gyomorrák becsültük számítástechnikai esélyhányados (OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) származó logisztikus regressziós elemzéseket az életkor és a szex. Kétoldalas χ ^{2 teszt statisztikai jelentőségét végeztük SAS szoftver (version 9.1.3, SAS Institute, Inc., Cary, NC, USA) és a P katalógusa < 0,05 volt statisztikai jelentőséggel bír.}

Eredmények katalógusa

jellemzői a vizsgálati alanyok katalógusa

a kiválasztott jellemzőit az esetek és kontrollok foglalja össze az 1. táblázatban esetek és a kontrollok tűnt, hogy megfelelően párosított életkor ( P katalógusa = 0,424), és a szex ( P katalógusa = 0,406). Között 753 esetben tumor benne 295 cardia rák (39,2%) és 458 nem cardia rák (60,8%). Betegek diffúz típusú (437, 58,0%) mutatott valamivel nagyobb arányban intesztinális típusú (316, 42,0%). Alapján a TNM besorolás a American Joint Committee on Cancer (AJCC rák staging kézikönyv, 6 ^{th kiadás) [19], 17,3%, 17,3%, 50,6% és 14,8% -ánál a T1, T2, T3, és T4, ill. Eközben 60,6% -ánál bemutatott pozitív nyirokcsomó-metasztázis és 13,0% létezett távoli áttét. Ezek szerint a klinikai jellemzőit, minden beteget végül azonosították a színpadon I, II, III, és IV 26,8%, 21,9%, 35,3% és 16,0% volt. Katalógusa}

Az átfogó hatásai rs2295080 polimorfizmus a kockázat a GC katalógusa

a genotípus eloszlás és allél frekvenciák rs2295080 mutatjuk be a 2. táblázatban genotípus frekvenciákat a kontrollok egyetértésben HWE modell ( P katalógusa = 0,569). Amint a 2. táblázatban látható, a genotípus frekvenciái rs2295080 voltak 64,0%, 32,7%, illetve 3,3% a TT, TG, és GG genotípusok között az esetek, és 58,2%, 35,7%, és 6,1% között, a kontroll, ill. A különbség a esetek és a kontrollok statisztikailag szignifikáns volt ( P = katalógusa 0,008). Továbbá, a G allél gyakorisága szignifikánsan alacsonyabb volt, mint a kontrollok között esetek (19,7% vs. 23,9%, P katalógusa = 0,003). Ezen túlmenően, a kombinált TG /GG genotípus gyakorisága kisebb volt, mint a kontrollok esetben (36,0% vs. 41,8%, P katalógusa = 0,016). Ha figyelembe TT genotípusú referenciaként, azt találtuk, hogy a variáns genotípus (TG és GG) járt együtt csökkent kockázatával GC egy dózis-válasz módon összehasonlítva a TT genotípusú (korrigált OR = 0,83, 95% CI = 0,67-1,02 TG, és 0,49, 0,30-0,80 GG; P katalógusa _{trend = 0,003). Hasonlóképpen, mi is megfigyeltük, hogy a kombinált TG /GG genotípus kapcsolódó statisztikailag szignifikánsan alacsonyabb érzékenységet GC összehasonlítva a TT genotípus (0,78, 0,64-0,96). Együttesen ezek az adatok arra utalnak, hogy a mTOR katalógusa rs2295080 G allél lehet egy feltételezett védő allél. Katalógusa}

A hímek voltak fogékonyabbak gyomorrák rs2295080 polimorfizmusa katalógusa

Mivel ez jól megalapozott, kora és neme volt fontos tényezők a tumor karcinogenezissel beleértve a gyomorrák. Rétegzés szerinti elemzés az életkor és szex tényezők, azt találtuk, hogy szignifikáns összefüggést figyeltek meg hím csoport, nem pedig a női csoport (3. táblázat). A férfiaknál, melyen rs2295080 G allél szignifikánsan csökkent rizikófaktor (OR = 0,72, 95% CI = 0,56-0,93 TG /GG versus TT), összehasonlítva a hordozó T allél. Azonban nem volt statisztikai különbség a fiatal és idős egyénekben. Katalógusa

A rétegzett elemzése közötti összefüggéseket rs2295080 polimorfizmusa és klinikai változók gyomorrák katalógusa

Mi végzett rétegződése elemzése rs2295080 polimorfizmus minden tárgy klinikai jellemzői GC. Között a független változók, a védő hatása legfőképpen a alcsoportok betegek cardia gyomorrák (OR = 0,68, 95% CI = 0,52-0,91), intesztinális típusú (0,73, 0,56-0,96), T3 mélysége invázió (0,78, 0,60 -1,00), pozitív nyirokcsomó áttét (0,79, 0,62-1,00), a negatív távoli áttétek (0,76, 0,62-0,94), és a helyi szakasz (0,76, 0,59-0,98) (4. táblázat). katalógusa

hatása rs2295080 polimorfizmus transzkripciós aktivitását katalógusa

betekintést nyerhetnek a biológiai funkcionális hatását rs2295080 polimorfizmus mTOR katalógusa átírás, GES-1, BGC823, MGC803 és SGC-7901 sejteket a különböző luciferáz jelentés plazmidok, például a vad típusú (T allél) és mutate típusú (G allél). Ábrán látható. 1A, azt találtuk, hogy a transzkripciós aktivitását T allél magasabb volt, mint a G allél egy körülbelül 1,5-szeres fenti négy sejtvonal, ami arra utal, hogy az rs2295080 G allél dolgozott védő gyomorrák csökkentésével transzkripcióját mTOR
. katalógusa

nukleáris Fehérjekötési tevékenysége variánsok rs2295080 katalógusa

Ezután elvégeztük EMSA kísérletet, hogy elemezze a biológiai következményeit rs2295050 polimorfizmus SGC-7901 sejtek. Egy erős sáv (fehérje komplex) tolódott, amikor a nukleáris extraktumokat inkubáltuk biotinnal jelzett rs2295080 T próba, míg a gyengébb sáv volt megfigyelhető, amikor a nukleáris extraktumokat inkubáljuk biotin-jelölt rs2295080 G szondával. Az eltolódott sávokat szignifikánsan gátolta egy moláris feleslegben lévő jelzetlen rs2295080 T vagy rs2295080 G versenytárs dózis-függő módon (ábra. 1B). Ezek az eredmények azt mutatták, hogy rs2295080 G allél csökkentheti a nukleáris fehérje kötődési aktivitás bizonyos mértékig. Katalógusa

közötti társulás mTOR
rs2295080 polimorfizmusa és az Expression szintek mTOR katalógusa mRNS

a huszonnegyedik gyomorrák szövetek különböző genotípusok mTOR katalógusa rs2295080 voltak elérhetők a jelen tanulmányban. Mivel az alacsony gyakorisága GG genotípus, adtunk be a mintákat TG genotípus elemzésre. Ábrán látható. 2, az expressziós szintek mTOR
mRNS volt drámaian magasabb egyének TT genotípusú, mint azokban a TG vagy GG genotípus (átlag ± SEM TT versus TG /GG: 12,35 ± 1,51 vs. 6,17 ± 1,32, P katalógusa = 0,004). katalógusa

Vita katalógusa

a jelen tanulmányban azt bizonyította, hogy a G allélja mTOR katalógusa promoter polimorfizmus rs2295080 járt szignifikánsan kockázatának csökkenése GC. Azt találtuk, hogy a T-G változás rs2295080 változnak lényegesen transzkripciós aktivitása mTOR
gén befolyásolásán keresztül a kötődését néhány transzkripciós faktor. Azt is megfigyelték, hogy a mTOR katalógusa rs2295080 T allél magasabb mTOR katalógusa mRNS expressziós in vivo katalógusa.

emlős rapamicin célpont (mTOR) néven is ismert FRAP1, az egyik szükséges tagja PI3K /Akt /mTOR-útvonal és a központi metabolikus jelzés [20], [21]. Meg lehet aktiválni az inzulin, az inzulin-szerű növekedési faktorok és más növekedési faktorok, és inaktiválódnak a celluláris éhezés. mTOR létezik két különböző komplex nevű mTORC1 és mTORC2 között [22]. A mTORC1 komplex foszforilezi a downstream effecter p70S6K, ami indukálja a lebomlását inzulin receptor szubsztrát és tovább növeli az inzulin-vezérelt Akt aktivitását. A mTORC2 komplex foszforilezi a C-terminális az Akt a ser473, ami oda vezethet, hogy a teljes aktiválása az Akt aktiválását [9]. Mint terápiás célpont más daganattípusok [4], [8], [23] - [27], az mTOR is megjelent, mint a potenciális célpontja kezelésére gyomorrák, spontán. Szirolimusz [28] és az everolimusz [29], a mTOR-inhibitorok, azonosítottak eredményez G1 sejtciklus és gátolta a proliferációt a gyomor sejtvonalak. Nemrégiben egy új potenciális mTOR
promoter polimorfizmus rs2295080 leírták több tanulmány [30] - [32]. Azonban elégtelen funkcionális vizsgálatokat végeztünk, hogy értékelje a szerepe ennek a genetikai variáns szabályozásában mTOR katalógusa kifejezést. GC, eredményeink feltéve, hogy a bizonyíték arra, hogy rs2295080 T allél növelheti a transzkripciós aktivitása mTOR katalógusa bizonyos mértékben GES-1 sejtvonal után transzfektált in vitro katalógusa. És további Luciferase Assay három gyomor rákos sejtvonalak (azaz BGC-823, MGC-803,, SGC-7901) is megerősíti ezt a hatást az rs2295080 polimorfizmus. Ezek az eredmények a mi jelen tanulmányban összhangban voltak az eredmények a vese rákos sejtvonal és méhnyakrák sejtvonal [32]. EMSA vizsgálattal, rs2295080 jósolta, hogy keresse meg a lehetséges kötőhely, melynek polimorf változatait befolyásolhatja toborozni transzkripciós faktorok (a p-MATCH programot, amely felhasználja kötőhelyek TRANSFAC; www.gene-regulation.com). Venni ezeket az eredményeket össze, kézenfekvő, hogy a mTOR katalógusa rs2295080 polimorfizmus befolyásolhatják az expressziós szintje mTOR katalógusa és egyéni hajlam a különböző rákos megbetegedések. Katalógusa

Az SNP rs2295080, valamint mint egy másik intron SNP rs11121704, először számolt be Hildebrandt et al.
hogy keresse meg a mTOR katalógusa potenciális promoter régió [13]. Amint azt a nyelőcsőrák, rs2295080 nem látszott egyesület vagy funkció túlélés kemoradioterápia után és a műtét. De eddig, számos tanulmány azonosította a hatása a polimorfizmus mTOR katalógusa rák kockázatát [30] - [32], amelyek mindegyike tekinthető rs2295080 T allél mint kockázati tényező. A jelenlegi vizsgálat során, a szövetség között rs2295080 T allél és GC kockázati összhangban volt az eredmények a korábbi három tanulmány [30] - [32]. Ezen felül, eredményeink azt is javasolta, hogy ez a polimorfizmus lehet egy biológiai középpontjában a fejlesztés a GC. Mivel a különböző populációk és különböző mechanizmusok között előfordulása, a fejlesztés és a túlélés, mi spekulált az etnikai különbségek és mechanisztikus különbséget lehet magyarázni ezeket discordances. Katalógusa

Egy másik új eredmény származik a szövetség között nemek és mTOR
rs2295080 polimorfizmus rétegzett elemzés. Ez rs2295080 polimorfizmus kiderült, több erős jelentősége a férfiak, mint a nők. Emellett Hartgrink és munkatársai katalógusa. (2009) arról számolt be, az arány a férfiak és nők által megfertőzött gyomorrák körülbelül 02:01 évi [33]. További magyarázat kapcsolatok ezeket az eredményeket kell törekedni, és különböző fajta hormonok kifejezés férfiaknál és nőknél lesz a legjobb venni, racionálisan. Egy vizsgálatban az emlőrák, Galoian et al. Katalógusa adta az adatokat, hogy prolinerich polipeptid-1 gátló hatást fejt révén gátolja az mTOR kináz aktivitás ER-negatív MDA-231, de nem gátolja létezik lumen T47 -D-sejt, amely végez, mint egy ER-pozitív sejtvonal [34]. Azonban a tanulmányok androgén, azt hitték, hogy az androgén esetleg serkentik az mTOR aktivitás PTEN-hiányos prosztata rákos sejteket. Egy új tanulmány androgén receptor javult a szerepét androgén up-szabályozó mTORC2 tevékenység [35]. Valószínű, hogy androgén helyett az ösztrogén, növelheti a mTOR
kifejezés; androgén vezethet a magas előfordulási gyomorrák férfiak és az erős jelentősége mTOR katalógusa rs2295080 hím csoportban a vizsgálatba. katalógusa

Néhány korlátai Jelen vizsgálatunkban hangsúlyozni kell, az alábbiak szerint . Először is, rs2295080 volt az egyetlen polimorfizmus szignifikánsan meglévő mTOR katalógusa, és annak fontosságát, hogy ötvözi SNP elhanyagolták a vizsgálatba. Másodszor, mint döntő fontosságú tényező a gyomor karcinogenezis az hiányzik a Helicobacter pylori katalógusa információt, dohányzás információt, és ivott információkat is elegendőek a tanulmányban, ez kellemetlen számunkra a további vizsgálatot a hatását ez a polimorfizmus. Ezen kívül, mivel a viszonylag kis minta mérete a tanulmányban, nincs jelentős eredményeket úgy tűnt, hogy találkozhatunk különösen rétegek (kor szerinti alcsoportok női alcsoport, és más klinikopatológiai alcsoportok) rétegzett elemzés (táblázat S3 és S4). További nagyobb tanulmány több információt várták, hogy ellenőrizze a megállapításokat. Katalógusa

Összefoglalva, tanulmány világít a mTOR katalógusa rs2295080 tartózkodási helyének a promoter régió mTOR katalógusa gén szignifikánsan járó kockázat gyomorrák a kínai népesség. katalógusa

alátámasztó információk katalógusa táblázat S1.
primerek és próbák használt genotípus. katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0060080.s001 katalógusa (DOC) hotelben táblázat S2.
alapozók plazmidok. katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0060080.s002 katalógusa (DOC) hotelben táblázat S3.
kölcsönhatása elemzései mTOR katalógusa rs2295080 polimorfizmus és az életkor vagy a szexuális állapotát eset-kontroll vizsgálat. katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0060080.s003 katalógusa (DOC) hotelben táblázat S4.
kölcsönhatása elemzései mTOR katalógusa rs2295080 polimorfizmus és a kor /nem vagy klinikai karakter esetén csak tanulmány. katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0060080.s004 katalógusa (DOC)

Köszönetnyilvánítás katalógusa

Szeretnénk megköszönni Luo Y (Nanjing Vöröskereszt Blood Center) az általa nyújtott segítségért funkcionális kísérletek. katalógusa

• PLoS One: egyrészről a glutation S-transzferáz T1 Null genotípus és a gyomorrák kockázata: A meta-analízis 48 Tanulmányok
• PLoS One: Association között polimorfizmusok gyakorisága EGFR-gén exon, életmód és a kockázat az gyomorrák Nemi különbségek a kínai Han tárgyai