De uitdagingen van het vinden van het gen dat verantwoordelijk is voor een zeldzame autosomaal dominant maagkanker gevoeligheid syndrome

de uitdagingen van het vinden van het gen dat verantwoordelijk is voor een zeldzame autosomaal dominant maagkanker gevoeligheid syndroom
adenocarcinoom en proximale Polyposis van de maag (GApps) is een nieuw beschreven, zeldzame autosomaal dominant syndroom, gekenmerkt door fundic klier polyposis met af en toe hyperplastische en adenomateuze poliepen. We gediagnosticeerd GApps in een grote Australische (Gezin 1) en twee kleinere Noord-Amerikaanse gezinnen (gezin 2 en 3). Mutaties in APC
, MUTYH
, CDH1
, SMAD4
, BMPR1A
, STK11 Kopen en PTEN
werden uitgesloten in alle gezinnen door middel van sequentie analyse van exonen en flankerende gebieden, en door testen voor deletie of duplicatie van exons. We bracht de GApps gen in Gezin 1 door linkage analyse (LOD score 4.21) tot een 20Mb gebied dat ongeveer 60 genen bevat. Short tandem repeat genotypering bleek dat de betrokken leden van het gezin 2 delen een haplotype in deze 20Mb regio, maar de analyse van Affymetrix SNP 6.0 gegevens van drie betrokken leden van het gezin 2 toonde aan dat ze ook gedeeld een aantal andere regio's van het genoom. Echter, zowel gezin 2 en 3 zijn te klein voor definitieve linkage analyse.
Wij hebben volledige exome sequencing drie getroffen personen in Gezin 1 uitgevoerd (en gerichte sequentiebepaling van de gekoppelde regio in een ander individu), en van de drie betrokken leden van Family 2. hebben we geen zeldzaam codering te vinden of splitsingsplaats varianten in de gekoppelde regio die werden gedeeld door alle getroffen leden van Gezin 1; noch van dezelfde regio in beide betrokken gezinsleden 2. Alle coderende exons en miR genen in de gekoppelde regio werden gesequenced tenminste 30X in een stelling of door Sanger sequentiebepaling, behalve zeven exons waarvoor Sanger sequentiebepaling nog moet worden ingevuld. We zullen ook Sanger sequencing gebruiken om de dekking van exons in het gekoppelde gebied Family 2.
echter verbeteren onze huidige hypothese is dat de niet-coderende mutaties in het gekoppelde gebied verantwoordelijk voor de GApps syndroom zowel Families 1 en 2 en zo hele genoom sequentie-analyse voor twee betrokken leden in Gezin 1 is uitgevoerd en de analyse is aan de gang.

• Chek 2 genmutaties en het risico op maagkanker
• Genetische Screening op Familial maagkanker