PLoS ONE: Variationer i Helicobacter pylori Cytotoxin-associerade gener och deras inflytande i Progression till Gastric Cancer: Inblandning för förebyggande

Abstrakt

Helicobacter pylori
(HP) är en bakterie som koloniserar människans mage och kan etablera en långsiktig infektion i magslemhinnan. Ihållande Hp-infektion inducerar ofta gastrit och förknippas med utvecklingen av magsår, atrofisk gastrit och magcancer. Virulent HP isolat härbärgera cag (cytotoxin associerade gener) patogenicitet ö (cagPAI), ett 40 kb sträcka av DNA som kodar för komponenter av en typ IV sekretionssystem (T4SS). Detta T4SS bildar en pilus för injicering av virulensfaktorer i värd målceller, såsom CagA onkoproteinet. Vi analyserade den genetiska variationen i cagA Mössor och andra utvalda gener i HP cagPAI ( Cagc
, bur
, CAGL
, CAGT
, cagV Köpa och CAG Gamma
) med DNA som extraherats från frysta gastriska biopsier eller från kliniska isolat. Försökspersoner var 95 cagA + patienter som histologiskt diagnostiserats med kronisk gastrit eller magcancer i Venezuela och Mexiko, områden med hög förekomst av HP-infektion. Sekvenseringsreaktioner utfördes genom både Sånger och nästa generations pyrosekvensering (454 Roche) metoder. Vi hittade totalt 381 varianter med entydiga samtal som observerades i åtminstone 10% av den ursprungligen provade prover och referensstammar. Vi jämförde frekvensen av dessa genetiska varianter mellan magcancer och kronisk gastrit fall. Tjugosex SNP (11 icke-synonyma och 14 synonymt) visade statistiskt signifikanta skillnader (P < 0,05), och två SNP, på plats 1039 och 1041 av bur
visade en mycket signifikant samband med cancer (p -värde = 2,07 × 10 ^{-6), och varianten kodonet var belägen i VirB3 homologidomänen av Agrobacterium
. Resultaten från denna studie kan ge preliminär information för att rikta antibiotikabehandling för högriskindivider, om effekterna av dessa varianter bekräftas i ytterligare undersökningar}

Citation. Rizzato C, Torres J, Plummer M, Muñoz N, Franceschi S, Camorlinga-Ponce M, et al. (2012) Variationer i Helicobacter pylori Cytotoxin-associerade gener och deras inflytande i Progression till Gastric Cancer: Inblandning för förebyggande. PLoS ONE 7 (1): e29605. doi: 10.1371 /journal.pone.0029605

Redaktör: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan

emottagen: 6 okt 2011; Accepteras: 1 december 2011. Publicerad: 3 januari 2012

• PLOS ONE: Effekter av interleukin-10 polymorfismer Helicobacter pylori-infektion och rökning på risken för Noncardia Gastric Cancer
• PLOS ONE: DNA-reparationsgenen APE1 T1349G Polymorfism och Risk för magcancer i en kinesisk Population