PLoS ONE: Association keskuudessa polymorfismit EGFR Gene eksonit, elämäntapa ja mahalaukun syövän riski kanssa sukupuolten erot Chinese Han aiheet

tiivistelmä

Background

kasvutekijän reseptorin (EGFR) geeni on keskeinen rooli kasvaimen selviytymisen, invaasio, angiogeneesi, ja metastaattinen leviäminen. Viimeaikaiset tutkimukset osoittivat, että mahasyövän (GC) liittyi polymorfismia EGFR-geenin ja ympäristön vaikutukset, kuten elintapoihin liittyvien tekijöiden. Tässä tutkimuksessa seitsemän tunnettua SNP EGFR eksonia tutkittiin korkean riskin Kiinan väestön Jiangsun maakunnassa testata, geneettistä vaihtelua on EGFR eksonien ja elämäntapa liittyy lisääntynyt riski GC.

Menetelmät /Principal havainnot

sairaala-pohjainen tapaus-control tutkimus suoritettiin Jiangsun maakunnassa. Tulokset osoittivat, että tupakointi, juominen ja mieltymys suolaista ruokaa liittyivät merkittävällä tavalla riskiä GC. Erot elämäntapaa Miesten ja naisten välillä saattaa olla syynä korkeamman ilmaantuvuus miehillä kuin naisilla. Seitsemän eksoni SNP: tä genotyypitettiin rs2227983, rs2072454, rs17337023, rs1050171, rs1140475, rs2293347, ja rs28384375. Todettiin, että variantin rs2072454 T-alleeli ja TT-genotyyppi liittyi merkittävästi lisääntynyt riski GC. Mielenkiintoista, tuloksemme ehdotti ACAGCA haplotyyppi saattaa liittyä alentuneeseen GC. Kuitenkaan mitään merkittävää yhteyttä tutkittiin välillä muut kuusi SNP ja riski GC sekä koko väestöstä ja ikä-matching väestöstä jopa sukupuolten välisiä eroja.

Johtopäätökset

Tupakointi, juominen ja mieltymys suolaista ruokaa merkittävästi liittyvä riski GC Jiangsun maakunnassa sukupuolten välisiä eroja. Vaikka vain yksi SNP (rs2072454) oli merkitsevästi liittyy suurentunut riski GC, yhdisti kuusi EGFR eksonin SNP yhdessä voivat olla hyödyllisiä ennustettaessa riskiä GC.

Citation: Zhang J, Zhan Z, Wu J Zhang C, Yang Y, Tong S, et ai. (2013) yhdistys keskuudessa polymorfismit EGFR Gene eksonit, elämäntapa ja mahalaukun syövän riski kanssa sukupuolten erot Kiinan Han aiheet. PLoS ONE 8 (3): e59254. doi: 10,1371 /journal.pone.0059254

Editor: Eithne Costello, The Liverpool Cancer Research UK Centre, Iso-Britannia

vastaanotettu: 19 syyskuu 2012; Hyväksytty: 13 helmikuu 2013; Julkaistu: 29 maaliskuu 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat Priority Academic ohjelmasuunnitteluosastoon Jiangsun korkeakouluista (papD), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2008461), National Natural Science Foundation of China (30973715 ja 81001502), Research Fund Tohtorikoulutuskeskus of Higher Education of China (20103237110011) Young opettajat Nanjing University perinteisen kiinalaisen lääketieteen. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Vaikka sekä ilmaantuvuus ja kuolleisuus mahasyövän (GC) ovat laskeneet viime vuosina, GC oli neljänneksi yleisin maligniteetti maailmassa vuonna 2008 noin 989600 uutta tapausta. Miehet yleensä kehittää GC kaksi kertaa niin usein kuin naiset ja noin 72% uusista tapauksista tapahtuu kehitysmaissa. Yleensä suurimman vaikutuksen hinnat ovat Aasiassa, erityisesti Itä-Aasian maissa kuten Koreassa, Japanissa ja Kiinassa [1].

Itse asiassa lähes 40% kaikista GC tapauksista esiintyy Kiinassa, ja on merkittävä maantieteellinen vaihtelu GC hinnat kaikkialla Kiinassa [2]. Yli kaksi kolmasosaa potilaista diagnosoitu GC Kiinassa on leikkaushoitoon sairaus ja eloonjäämismediaani kuudesta yhdeksän kuukautta. Lisäksi potilailla, joilla on resektoitavissa kasvaimia, paikalliset ja etäpesäkkeenä hinnat ovat korkeat, ja 5 vuoden pysyvyys on alle 30% [3]. Sun et al.
[4] arvioinut GC Kiinan väestön epidemiologisen analyysin sen kuolleisuuden jakelun 1990-1992, tulokset osoittivat, että GC oli suurin syy syöpään liittyvää kuolleisuutta Kiinassa .

nyt on yleisesti hyväksytty, että patogeneesissä GC liittyy monitekijäinen vuorovaikutus ympäristön laukaisee ja geneettinen alttius. Epidemiologiset tutkimukset ovat tunnistaneet iän, sukupuolen erot ja useat ympäristö- tekijöitä, jotka voivat edistää GC, kuten suolainen ruokavalio, tupakointi, alkoholin kulutus ja helikobakteeri
infektion [5] - [8] . Muut tutkimukset ovat tunnistaneet isäntäsolugeenit ja geneettisiä muutoksia, jotka myös tärkeä rooli kehityksen ja etenemisen GC kautta geenin ympäristön vuorovaikutukset [9], [10].

kasvutekijän reseptorin (EGFR) geeni sijaitsee lyhyen varren ihmisen kromosomin 7 ja tuottaa glykoproteiini, jonka molekyylipaino on 170 kDa: n, jolla on suuri affiniteetti ligandeja, mukaan lukien epidermaalinen kasvutekijä (EGF) ja transformoivan kasvutekijä alfan (TGF-α). EGFR osallistuu useita olennaisia ​​tuumorigeenisia mekanismeja, kuten kasvain säilymiseen, invaasio, angiogeneesi, ja metastaattinen leviäminen. EGFR on havaittu lukuisissa ihmisen kasvaimissa, ja useat tutkimukset osoittivat, että yli-ilmentyminen EGFR korreloi huonon lopputuloksen [11]. GC, EGFR yli-ilmentyminen korreloi kehittynyt kasvain vaiheessa ja huono kliininen tulos [12]. Kuitenkin roolit että EGFR yli-ilmentyminen ja geneettisiä muutoksia pelata mahasyövän jää epäselväksi. Lisäksi vain muutama yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t) on todettu yhdistää GC kehityksestä ja lopputuloksista [11], [13].

Tässä tutkimuksessa olemme arveltu, että ympäristöaltisteiden ja sukupuolten erot ovat vaikutus määritteet on taustalla geneettistä vaihtelua EGFR eksoneissa, jotka voivat vaikuttaa EGFR toiminta vaikuttaa siten GC alttius. Tämän hypoteesin testaamiseksi, sairaala-pohjainen tutkimus tehtiin, jossa 387 GC tapauksissa ja 392 syöpää vapaa valvonnan korkean riskin Kiinan väestön genotyypattiin seitsemän tunnettua SNP EGFR eksonit eli rs2227983 A > G, rs2072454 C > T, rs17337023 A > T, rs1050171 G > A, rs1140475 C > T, rs2293347 G > A, ja rs28384375 T > C.

Materiaalit ja menetelmät

rekrytointi asiat ja valvonta Osallistujat

Aluksi 401GC tapauksia ja 420 kontrolliraskauksiin; 3 syöpätapauksia puute kyselyihin sekä 11 kasvaimia muuta kuin adenokarsinooman suljettiin pois; 18 verrokit poissuljettu kohtuuttomaan seerumin syöpään liittyvien biomarkkerit ja 10 ohjaa jätettiin maantieteellisen poikkeama. Kaiken kaikkiaan väestön 387 tapausta ja 392 valvontaa varten oli käytettävissä nykyisen tutkimuksen perusteella mahdollisen tehon analyysien, se on sääli, että kontrollit olivat noin 10 vuotta nuorempi kuin tapauksissa näin, ikään matching väestön 294 tapausta ja 294 valvonta uutettiin koko väestöstä keräämisen ikään matching. Kaikki koehenkilöt olivat geneettisesti jotka eivät liity etnisten Han kiinalaisia. Potilaat, joilla on primaarinen GC rekrytoitiin Department of Surgical Gastroenterology Jiangsun Provence sairaalan perinteisen kiinalaisen lääketieteen (TCM) tammi 2008 ja heinäkuun 2010 Nanjing kaupungissa, Jiangsun maakunnassa. Syöpä-vapaa tervettä verrokkia peräkkäin rekrytoitiin Jiangsu Hospital TCM, ja he olivat sairaalassa kävijöitä varten vuositarkastus samana aikana. Jotta sisällytetään tutkimuksessa potilaat (a) miehillä tai naisilla yli 20 vuotta vanha, mutta alle 80-vuotias, (b) oli oltava Han kiinalaisten etnisyyden (itse ilmoitettu), (c) tuli kolmen alueen Jiangsun maakunta ja piti olla paikallinen asukas vähintään 5 vuotta, (d) piti olla vasta histopatologisesti diagnosoitu primaarinen GC, (e) oli puuttuvan edelliseen pahanlaatuisia kasvaimia muissa elimissä, ja (f) ei ollut antituumorisessa terapiassa ennen rekrytointia , kuten kemoterapiaa ja sädehoitoa. Koulutettu haastattelijat käytetään ennalta testattu kyselylomake keräämään epidemiologisia tietoja osallistujille, nimittäin, demografiset tekijät, kuten ikä ja sukupuoli, ja tunnettuja riskitekijöitä GC (kuten tupakoinnin, alkoholin kulutus, ja suvussa ruoansulatuskanavan syöpä) . Yksilöt, jotka savustettu kerran tai useita kertoja päivässä yli vuoden määriteltiin tupakoitsijoita, ja ne, jotka kulutetaan kolme tai useampia alkoholijuomia viikossa yli 6 kk katsottiin krooninen juovat [14], [15]. Kirjautumisen jälkeen ilmoitti suostumuslomakkeet, kuhunkin aiheeseen lahjoitti 3-5 ml ääreisverenkierron käytettävän genomisen DNA: n eristämiseksi. Tutkimus protokolla hyväksyi Institutional Review Board of Jiangsu Provence sairaalan TCM.

Perimän DNA Eristys ääreisverisoluissa

Kaupallista veren DNA: n eristämiseksi pakki (AxyPrep-96 kit, Axygen, CA, USA) käytetään erottamaan genomista DNA: ta verinäytteestä. Puhdistettua DNA: t säilytettiin -20 ° C: ssa, kunnes ne käytettiin genotyypin testaus. Laatu DNA arvioitiin agaroosigeelielektroforeesilla.

Genotyypin

Polymeraasiketjureaktio-ligaa- tunnistus (PCR-LDR) menetelmiä käytettiin genotyypin [16]. Alukkeet syntetisoitiin Shanghai Sangon Biological Engineering Technology and Services (No.698, Xiangmin Road, Songjiang District, Shanghai, Kiina). Jokainen sarja ligaasin detektioreaktiossa antureista käsitti yksi yhteinen koetin ja kaksi erotteleva koettimia kahden (taulukko S1).

Kohde-DNA-sekvenssit monistettiin käyttäen multiplex PCR-menetelmällä. PCR: t kullekin koehenkilölle suoritettiin lopullisessa tilavuudessa 20 ui, joka sisälsi 1 x PCR-puskuria, 3,0 mmol /l MgCl _{2, 2,0 mmol /l deoksinukleotiditrifosfaattia, 1 ui alukkeet, 0,2 ui QIAGEN HotStarTaq Polymerase (QIAGEN, Kiina ), 4 ui 1 x Q-ratkaisu, ja 10-20 ng genomista DNA: ta. Lämpökäsittelyyn suoritettiin viisi SNP: (rs2227983, rs17337023, rs1140475, rs2293347 ja rs2072454) Gene Amp PCR -järjestelmää 9600 (PerkinElmer), jossa ensimmäinen denaturaatio 15 minuutin ajan 95 ° C: ssa, jota seurasi 35 sykliä denaturointi 94 ° C: ssa 30 s, pariutuminen 59 ° C: ssa 1 min ja pidentäminen 72 ° C: ssa 1 min, jota seurasi lopullinen pidentäminen 72 ° C: ssa 7 min. Protokolla rs28384375 monistus koostui alkudenaturaatio 15 minuutin ajan 95 ° C: ssa, jota seurasi 35 sykliä denaturointi 94 ° C: ssa 30 s, pariutuminen 56 ° C: ssa 1 min ja pidentäminen 72 ° C: ssa 1 min , jota seurasi lopullinen pidentäminen 72 ° C: ssa 7 min. Protokolla rs1050171 koostui alkudenaturaatio 15 minuutin ajan 95 ° C: ssa, jota seurasi 35 sykliä denaturointi 94 ° C: ssa 30 s, pariutuminen 53 ° C: ssa 1 min ja pidentäminen 72 ° C: ssa 1 minuutin ajan, seurasi lopullinen pidentäminen 72 ° C: ssa 7 min.}

Ligaatioreaktio kullekin koehenkilölle suoritettiin lopputilavuudessa 10 ui, joka sisälsi 1 x NEB Taq DNA-ligaasi-puskuria, 12,5 pmol kumpaakin koetinseosta , 0,05 ui Taq DNA-ligaasia [NEB Biotechnology (Beijing)], ja 1 ui monen PCR-tuotteen. Koetinsekvenssit esitetään taulukossa S2. Kaikkiaan, 35 sykliä, jotka koostuivat 95 ° C 2 min, 94 ° C: ssa 30 s, ja 60 ° C: ssa 2 min tehtiin. Fluoresoiva tuotteet ligaasi detektioreaktiot oli eriytetty ABI sekvensseri 377 (kuva S1). Tarkkuuden varmistamiseksi PCR-LDR genotyypitysmenetelmää, suora DNA-sekvensointi satunnaisesti valitun PCR-tuotteiden suoritettiin. Osuus sekvensointi näytteitä oli noin 5%. PCR-LDR -genotyypitystulosten osoitti täydellistä kanssa suora DNA: n sekvensointi tuloksia.

TILASTOANALYYSI

Kaikki tilastolliset analyysit tehtiin SPSS ohjelmistoversio 16.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, YHDYSVALLAT). Vertaamaan havaittu genotyypin taajuudet verrokkiryhmässä kanssa Esiintymistiheyksien, Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) testattiin hyvyyttä-of-fit χ ^{2-testi. Kotelot ja valvonta verrattiin kannalta demografisia ominaisuuksia, elämäntapatekijöiden ja alleelifrekvenssien kunkin SNP käyttäen χ 2
-testi. Kunkin polymorfismin, kertoimet suhdeluvut (OR) ja 95% luottamusvälit (CI) laskettiin ehdollisesta logistisen regression avulla voidaan arvioida pääasiallinen vaikutus jokaisen polymorfismin GC säädettäessä jatkuvan iän, sukupuolen ja elämäntapa tekijöitä. Logistinen regressio analyyseistä pääalleelille referenssinä käytettiin arvioimaan säädetty syrjäisimpien alueiden, 95% CI, ja P
arvoja. Olemme kuitenkin havainneet, että sukupuoli ja ikä muuttujaa ei vastannut oletukseen suhteellisuuden. Siten sukupuoli kerrostuneisuus ja ikä-matching käytettiin mittaamaan syrjäisimmille alueille ja 95% CI. Sillä elämäntapa muuttujia, osoitti merkittäviä suhteita GC analyysejä ohjattu yhteensopivien tekijät vain, me edelleen arvioida heidän riippumattomuuttaan analyyseissä oikaistu uuden mahdollisen sekoittavien tekijöiden (eli tupakointi, juominen, suolaista ruokaa, syö aikaa ja syö aamiaista) ikä-matching väestöstä. Ja vaihe ohjelmistopaketin version 2.0 käytettiin päättelemään haplotyyppifrekvenssejä perustuu havaittu EGFR genotyypit. Kaikki P
arvot olivat kaksipuolisia ja P
arvo < 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä.}

Tulokset

Ominaisuudet oppiaineista

ominaisuudet koehenkilöistä olivat yhdenmukaisia ​​aiemmin kuvattu [17], [18]. Tässä asiakirjassa, koko väestöstä 387 tapausta ja 392 valvontaa ja ikään matching väestön 294 tapausta ja 294 kontrollia sisällytettiin nykyiseen analyyseissä. Sukupuoli, ikä, ja maantieteellinen alue jakelu koehenkilöistä esitetään taulukossa 1.

Tutkia eroja GC esiintyvyys miesten ja naisten välillä, jakaumat valitse elämäntapa muuttujia analysoitiin sukupuolten välisiä eroja. Tulokset osoittivat, että kuusi elämäntavan vaikutuksista (eli säännöllisesti ottaen ateriat, mieltymys suolaista ruokaa, syö aikaa, tupakointi asema, juominen tila, ja syö aamiaista) on merkittävästi korreloi riskiä GC, ja niiden vaikutukset saattavat muuttaa sukupuolen ja ikä. Neljä elämäntavan vaikutuksista, ts mieltymys suolaista ruokaa, syö aikaa, tupakoinnista ja juo tila, olivat merkittävästi erilaiset Miesten ja naisten välillä ( P
< 0,05) (taulukko 2). Todettiin, että prosenttiosuudet miehistä kuljettaa epäterveelliset ruokailutottumukset, kuten mieltymys suolaista ruokaa, lyhyt syöminen aikaa, tupakointi ja juominen, olivat huomattavasti korkeammat kuin naaraat ( P
< 0,05), jotka saattavat olla syynä korkeamman ilmaantuvuus miehillä kuin naisilla. Vuonna koko väestöstä, säännöllisesti ottaen aterioita ja syö aamiaista vähensi naisten GC, kun juominen voi lisätä riskiä miehen GC (taulukko 3). Lisäksi sekä mieltymys suolaista ruokaa ja tupakointi lisäsi riskiä miehen ja naisen GC ( P
< 0,05). Samanlaisia ​​tuloksia havaittiin myös, kun ikääntymiseen matching että säännöllisesti ottaen ateriat vähensi GC ja parempana suolaista ruokaa ja tupakointi lisäsi riskiä sekä miesten että naisten GC ( P
< 0,05, taulukko 4). Oli kuitenkin kaksi poikkeusta, joka joi lisäsi riskiä mies GC ( P
< 0,05), mutta ei naisten GC ( P
> 0,05) ehkä johtuu rajallisen naispuolinen väestö, kun taas päivittäinen syöminen aamiaista vähensi naisten GC ( P
< 0,05), mutta ei mies GC ( P
> 0,05) (taulukko 4).

genotyypin Jakelu ja vaara GC

Tässä tutkimuksessa, vain T-alleelin missense lokuksen rs28384375 havaittiin. Mitä tulee kuusi jäljellä SNP, havaitun genotyyppi taajuudet kontrolleissa oli HWE. Koska mitään tilastollista merkittävyyttä oli kadonnut vain oikaistu tilastolliset tulokset on esitetty taulukoissa. Vuonna koko väestöstä, yhdistys joukossa jakautumista EGFR-geenin alleelien, genotyyppien ja riski GC esitetty taulukossa 5. Vain pieni ero havaittiin kannalta alleelinen jakelun rs2072454 ( χ ^{2
= 3,844, P =
0,050), ja logistinen regressio analyysit paljastivat, että variantti tämän alleelin voi liittyä GC riski (säädetty OR = 1,23, 95% CI = 1,00-1,50). Ei kuitenkaan ole merkittäviä eroja tapausten ja kontrollien suhteen alleelin jakelu havaittiin sukupuolieroja. Rs2293347 polymorfismi liittyi mies GC tapauksissa, koska 73,0% GC tapauksista kuljetti G-alleelin verrattuna 29,5% terveystarkastusten (oikaistu OR = 6,45, 95% CI = 4,89-8,51, P
< 0,001 ), mutta ei genotyypit merkitsevästi liittyvä riski GC. Päinvastaisessa naisväestöä GA genotyyppi voisi pienentää riskiä naisten GC takia 34,5% GC tapauksista kuljettaa GA genotyyppi verrattuna 38,9% terveydenhuollon valvonnan, mutta merkittäviä eroja jakelun alleelin ja genotyypin taajuuksilla ( P
> 0,05). Lisäksi ei havaittu merkittäviä eroja tarkasteltiin neljää muuta SNP ( P
> 0,05), eli rs2227983, rs17337023, rs1050171 ja rs1140475 tapausten ja kontrollien välillä jopa sukupuolten välisiä eroja.}

ikä-matching väestöstä, yhdistys joukossa jakautumista EGFR-geenin alleelien, haplotypes ja riski GC esitetty taulukossa 6. merkittävä ero havaittiin kannalta Alleelifrekvenssien jakelun ( χ ^{2
= 4,795, P =
0,029) ja genotyyppi jakelu ( χ 2
= 6,668, P =
0,036) ja rs2072454, muut kuin tulokset Taulukko 5. lisäksi logistinen regressio analyysit paljastivat, että variantti rs2072454 T alleelin voisi lisätä riskiä GC (oikaistu OR = 0,77, 95% CI = ,61-+0,97; P
< 0,05). Mukaan genotyyppijakauman, merkitsevä ero havaittiin myös miespuolisesta väestöstä ( χ 2
= 7,914, P =
0,019) kuin naisista ( χ 2
= 0,452, P =
0,798). Kuitenkin, ei ollut merkittäviä eroja tapausten ja kontrollien välillä jopa sukupuolten välisiä eroja jäljellä SNP, nimittäin rs2227983, rs17337023, rs1140475, rs1050171 ja rs2293347 ( P
> 0,05).}

Jos haluat sulkea pois ympäristön vaikutuksesta, tutkimme assosiaatiota mahdollisten kolmen GC liittyviä SNP ja riski GC iässä-matching väestön kuljettaa terveys elämäntapa (taulukko 7). Yksi selkeä ero tutkittiin kannalta genotyypin jakelun rs2072454 ( χ ^{2
= 6,036, P =
0,049). Erityisesti, logistinen regressio analyysit paljastivat, että TT-genotyyppi huomattavasti riskiä GC väestössä päivittäin syöminen aamiaisella (oikaistu OR = 1,92, 95% CI = 1,07-3,44, P
< 0,05).}

eksonit ei vain koodata aminohapposekvenssiä proteiinin, mutta sisältävät myös sekvenssejä, jotka vaikuttavat käännös tai mRNA: n hajoamisen [19]. Käyrän yhdistettiin ja alistettiin haplotyyppi päätteleminen käyttämällä PHASE 2.0 ohjelman. Oli neljä mahdollista haplotyyppien koko väestöstä ja kolme mahdollista haplotyyppien iän matching väestön taajuudella > 4% (taulukko 8, taulukko 9). Verrattuna GTTGCG haplotyyppi, logistinen regressio analyysit paljastivat, että ACAGCG haplotyyppi liittyi merkittävästi vähentynyt riski GC (OR = 0,67, 95% CI = 0,49-0,92, P
< 0,05 ikä-, sukupuoli ja elämäntapaan liittyvien tekijöiden) osuus väestöstä (taulukko 8) pikemminkin kuin ikään matching väestöstä (OR = 0,83, 95% CI = 0,58-1,19, P
> 0,05 oikaistu iän, sukupuolen ja elämäntapa tekijät) (taulukko 9). Toinen haplotypes liittyivät merkittävästi vähentynyt riski GC (oikaistu OR = 0,69, 95% CI = 0,52-0,90 varten koko väestöstä; säätää OR = 0,74, 95% CI = 0,56-0,99 iän-matching väestöstä). Verrattuna ACAGCG haplotyyppi, The ACAACG voisi pienentää riskiä GC (OR = 0,61, 95% CI = 0,40-0,94 säädetty iän, sukupuolen ja elämäntapa) koko väestöstä, mutta P
arvo teki ollut tilastollisesti merkitsevä mukaan Bonferroni korjaus (taulukko 8).

keskustelu

Vaikka suuri määrä uusia GC tapausta nähtiin kaikkialla maailmassa viimeisten vuosikymmenien tarkka mekanismit mahasyövän ovat ei vielä täysin ymmärretä. Samanlaisia ​​aiempaan tutkimukseen [20], [21], tuloksemme osoittivat, että miehet yleensä ovat kehittäneet GC kaksi kertaa niin usein kuin naiset Kiinassa. Esitettiin Michael et al.
Että suuri osa maailmanlaajuista vaihtelua syövän ilmaantuvuus on katsottu johtuvan ympäristön vaikutuksia, kuten ravinnon mieltymykset ja epäterveellisten elämäntapojen tekijät [22]. Esillä olevassa tutkimuksessa, siis olimme kiinnostuneita testaamaan, onko joitakin epäterveellisten elämäntapojen tekijät voivat lisätä riskiä GC kanssa sukupuolieroja Kiinassa. Kuusi elämäntavan tekijät, kuten säännöllisesti ottaen ateriat, mieltymys suolaista ruokaa, syö aikaa, tupakointi asema, juominen tila, ja syö aamiaista, havaittiin vaikuttavan riskiä GC kanssa sukupuolieroja, mikä oli yhdenmukainen aiempien tutkimusten Itä-Kiinassa [20], [23], [24]. Erityisesti parempana suolaista ruokaa, juominen ja tupakointi olivat vahvin ja johdonmukainen riskitekijöitä GC.

Viimeaikainen tutkimukset ehdotti, että suuri suolan (natrium) voi lisätä riskiä GC [21], [ ,,,0],24] - [26]. Lisäksi osoituksena havaintomme, että GC potilaat Jiangsun maakunnassa olivat parempana suolaisia ​​ruokia, kuten suolattu liha, suolakurkkua, ja maustekurkkua vihannesten mehua, joka voisi saastua N-nitroso yhdisteet. Kuitenkin N-nitroso yhdisteet olivat useimmin ehdotettu liittyy suurentunut ylemmän ruoansulatuskanavan syöpien [27]. Juominen ja tupakointi, toinen kaksi hallitseva riskitekijöitä GC maailmassa [28], tutkittiin tässä tutkimuksessa. Löysimme Merkitsevä yhteys juominen ja GC riski Jiangsun maakunnassa. Se oli todisteiden Laboratoriotutkimuksessa että tupakointi voi lisätä apoptoosin rotan mahalaukun limakalvon lisääntyminen XO toimintaa [29], ja alkoholi voivat myös vaikuttamaan haponeritystä mahalaukun tyhjenemistä, ja tietyt happoon liittyviä sairauksia, kuten gastriitti mukana vaurioita mahalaukun limakalvon, ja seuraavat tulehdusreaktio puolestaan ​​edistää mahalaukun solujen lisääntymistä ja erilaistumista [30]. Prosessissa, N-nitroso yhdisteet ja mykotoksiinien joistakin suolaista ruokaa voi aiheuttanut geenimutaatioita [31], [32], mikä mieltymys suolaista ruokaa voi olla alkuperäistä riski GC. Ja todisteet viittasivat yhdistyksen väylien mukana kehitysprosessien [33]. Avainmolekyylejä näistä reiteistä olivat reseptorityrosiinikinaasit, joiden todettiin olevan poikkeavasti aktivoida tai yli-ilmentyy eri kasvaimia ja näin ollen edustavat lupaavia kohteita terapeuttiseen interventioon [13].

EGFR oli yksi avainmolekyylejä ja monta riviä todisteet viittaavat siihen, että erittäin invasiivinen GC liittyy poikkeava aktivaatio tai yliaktivoituminen EGFR johtuen geenin monistaminen tai rakenteellisia muutoksia [13]. Aivan viime aikoina tapauskontrollitutkimuksessa 61 tapauksissa ja 20 ohjaa Henanin maakunnassa, joka sijaitsee keskellä Kiinassa, osoittivat, että EGFR rs28384375 C /T-polymorfismi voi edistää esiintyminen ja kehittämistä GC [34]. Lisäksi toinen tapauskontrollitutkimuksessa 138 tapausta ja 170 valvontaa Jiangxin maakunnassa, joka sijaitsee Kaakkois-Kiinassa, paljasti, että EGFR rs763317 G /A-polymorfismi voi liittyä lisääntyneeseen riskiin GC [35].

EGFR on kasvutekijän reseptori tyrosiinikinaasin ja alue reseptorityrosiinikinaasin superperheen, jonka jäsenet on tunnusomaista solunulkoisen domeenin (jossa ligandin sitoutuminen ligandeihin tapahtuu), lyhyen lipofiilinen transmembraanidomeeni, ja solunsisäinen domeeni, joka suhtautuu tyrosiinikinaasi aktiivisuus [36]. EGFR voidaan aktivoida sitovia ligandeja, kuten EGF: n ja TGF-α, ja sillä keskeisiä rooleja kehityksen, lisääntymistä ja erilaistumista. Aktivointi EGFR voi edistää muutosta solun fenotyyppejä ja antaa kasvainsoluja merkittävää kasvua ja selviytymistä etuja [37]. Monet ihmisen kasvaimissa esiintyy EGFR yli-ilmentyminen, joka korreloi kehittynyt kasvain vaiheessa tai huono kliininen tulos, kuten ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [38], peräsuolen syöpä [39], rintasyövän [40], pään ja kaulan alueen syöpä [ ,,,0],41], virtsarakon syöpä [42], ja GC [43].

Tällä hetkellä kasvava kiinnostus SNP mutaatioita EGFR, koska ne voivat vaikuttaa tehoon EGFR tyrosiinikinaasin estäjä (TKI) käsittely eri syövät [44], paksusuolen ja peräsuolen syövän [39], ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [45], GC [46] - [49]. On hyvin tunnettua, että eksonit, paitsi koodata aminohapposekvenssiä proteiinin, mutta sisältävät myös sekvenssejä, jotka vaikuttavat käännös tai mRNA: n hajoamisen [19]. Näin ollen, EGFR eksonin SNP: t voivat vaikuttaa EGFR-geenin ilmentyminen ja /tai proteiinin aktiivisuuden ja siten muuttaa affiniteettia EGFR varten ei vain sen ligandeja, mutta myös syövän vastaisia ​​aineita, jotka kohdistuvat tämän proteiinin. Todellakin, Puyo et al.
Havaittu, että mutaatiot eksoneissa 18-21 EGFR aktiivisuuden lisäämiseksi TKI, kun taas poistetaan eksonien 2-7 liittyy glioblastooma oncogenesis [49]. Lisäksi kaksi kliinistä tutkimusta osoittivat, että SNP EGFR eksonit 18, 19, 21, ja 25 vaikuttavat kliiniseen tehoon gefitinibin ja saattavat olla mahdollisia biomarkkereita ennustamiseen kliiniseen tulokseen gefitinibin saaneilla potilailla, joilla on edennyt ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) [50], [51].

Tässä tutkimuksessa kuusi eksonit SNP EGFR lievästi liittyy riski GC sekä koko väestöstä ja ikä-matching väestön vaikka sukupuolten eroja. Todettiin, että SNP rs2072454 oli merkitsevästi yhteydessä riskiä GC. Erityisesti variantti rs2072454 T-alleeli ja TT genotyyppi liittyi suurentunut GC. Kuitenkin rs2227983, rs17337023, rs1050171 ja rs1140475 SNP ei koskenut GC riski. Mitä tulee missense lokukseen rs28384375, vain T-alleelin havaittiin tapauksissa ja valvontaa. Monet raportit ehdotti, että useat EGFR SNP, kuten rs2227983 (myös nimetty Arg521Lys tai R497K) [39], [52], [53], rs1050171 (myös nimetty Q787Q) [54], [55] ja rs2293347 (C2982T) [ ,,,0],56], olivat todennäköisemmin vaikuttaa biologiseen käyttäytymiseen kasvaimet (kuten kasvaimen kasvua, invaasio, etäpesäke, ja eteneminen) kuin määritellä alttiutta syövän kehittymisen. Koska EGFR, keskeinen välittäjäaine angiogeneesiä, voi säädellä sen kohdegeenien, kuten VEGF, joka voi suoraan vaikuttaa kasvaimen biologista käyttäytymistä. Nämä tulokset selittäisi myös miksi EGFR SNP voi toimia keskeisiksi tekijöiksi vastaus EGFR-TKI-kemoterapian [11]. Siksi nämä geenimutaatioita voivat antaa monimutkaisuus ja hämmennystä GC hoitoon ja säilymiseen [57].

Kun Puyo et al
. [49] analysoi yhdistyksen välillä tietty EGFR toiminnallisten polymorfismien ja syöpälääkettä aktiivisuutta 60 ihmisen tuumorisolulinjaa perustettu National Cancer Institute, taajuus nonsynonymous SNP rs28384375 (myös nimetty Val592Ala) oli 0,5, kun taas heterotsygoottinen taajuus -216G > T SNP (myös nimetty rs287129) oli 0,346. Solulinjat, jotka olivat heterotsygoottisia ja muunnoksen homotsygoottisia -216 G > T SNP osoitti merkittävästi korkeampi ilmentyminen EGFR-geenin kuin homotsygoottinen villityypin linjat. Lisäksi, verrattuna solulinjojen ilman variantin alleelin, solulinjat, joissa on vähintään yksi variantti T-alleeli on -216 G > T SNP olivat herkempiä erlotinibin ja vähemmän herkkä geldanamysiini, topoisomeraasi I ja II-inhibiittorit, ja alkyloivat aineet. Mielenkiintoista, tuloksemme osoittivat, että GTTGCG haplotyyppi oli yleisempiä GC tapauksissa kuin syöpää vapaa valvontaa, ja että ACAGCG haplotyyppien liittyi merkitsevästi alentuneeseen GC (oikaistu OR = 0,67, 95% CI = +0,49-,92 varten ACAGCG, säätää tai = 0,69, 95% CI = 0,52-0,90 muille) koko väestöstä (taulukko 8). Kuitenkin ikään matching väestöstä, ei merkittävää yhteyttä tutkittiin välillä ACAGCA haplotyypin ja riski GC (oikaistu OR = 0,83, 95% CI = 0,58-1,19) (taulukko 9). Näin ollen, T-alleelien rs2072454 ja rs17337023, erityisesti entisen, saattaa liittyä riski GC. Siksi yhdistetty analyysi kuuden SNP: iden, erityisesti T alleelien rs2072454 ja rs17337023, voivat olla hyödyllisiä ennustettaessa riskiä GC.

Useat rajoituksia esillä olevassa tutkimuksessa on käsiteltävä: 1) sen otoksen koon ei ehkä ole riittävän suuri havaita SNP: iden, joilla on alhainen variantti taajuus, kuten rs28384375; 2) polymorfismit, joita tässä tutkimuksessa valittiin sen perusteella, niiden vaikutukset EGFR toiminta ja ei voi antaa kattavaa näkemystä geneettistä vaihtelua pitkällä EGFR eksonit; 3) yksityiskohtaiset tiedot GC tapauksista ei kerätty, kuten potilaan selviytymistä, ovatko kasvaimet olivat suoliston tai diffuusi tyyppi, oliko etäpesäke, ja mikä vaikutus lääkehoidon oli.

Yhteenvetona Tässä tutkimuksessa ehdotetaan, että erot elämäntapaa Miesten ja naisten välillä saattaa olla syynä korkeamman ilmaantuvuus miehillä kuin naisilla. Vaikka vain yksi SNP (rs2072454) oli merkitsevästi liittyy suurentunut riski GC yhdistettynä analysoida muut kuusi EGFR eksoni SNP yhdessä voivat olla hyödyllisiä ennustettaessa riskiä GC. Lisätutkimukset ovat perusteltuja vahvistaa nämä havainnot ja käsitellä taustalla olevien mekanismien.

tukeminen Information
Kuva S1.
fluoresoiva tuotteet LDR oli eriytetty ABI sekvensseri 377 seitsemälle SNP EGFR eksonit. Kaikkiaan yli 90% tuotteista onnistuneesti eriytetty ABI sekvensseri 377.
doi: 10,1371 /journal.pone.0059254.s001
(TIF) B Taulukko S1.
PCR alukesekvenssit seitsemän loci on EGFR-geenin. Alukkeet suunnitellut Primer Premier 6 ohjelmisto ja syntetisoida Shanghai Sangon Biological Engineering Technology and Services.
Doi: 10,1371 /journal.pone.0059254.s002
(DOC) B Taulukko S2.
Probe sekvenssit seitsemän SNP EGFR geenissä. Alukkeet syntetisoitiin Shanghai Sangon Biological Engineering Technology and Services.
Doi: 10,1371 /journal.pone.0059254.s003
(DOC) B

Kiitokset

Toteamme Master Jingye Wang ja Haixia Xu varten apua DNA eristys.

• PLoS ONE: polymorfismi (rs2295080) in mTOR promoottorialueen ja sen yhteys mahasyövän kiinalainen Population
• PLoS ONE: Prognostic Value of Cancer Stem Cell Marker CD133 Expression mahasyövän: järjestelmällinen katsaus