Plos ONE: Zveza med polimorfizmov v EGFR Gene eksonov, načina življenja in tveganja želodčnega raka z razlikami med spoloma v kitajski Han Subjects

Povzetek

Ozadje

epidermalni rastni faktor receptor (EGFR) genov igra ključno vlogo pri nastanku tumorja, invazije, angiogenezo in metastaze. Nedavne študije so pokazale, da je rak želodca (GC) povezan s polimorfizmi gena EGFR in okoljske vplive, kot so dejavniki življenjskega sloga. V tej študiji je bilo sedem znanih SNP v EGFR eksonov raziskovali v kitajskega prebivalstva z visokim tveganjem v provinci Jiangsu preizkusiti, ali so genetske variante EGFR eksonov in življenjski slog povezana s povečanim tveganjem za GC.

Metodologija /Principal ugotovitve

študija primerov in kontrol, ki temelji bolnišnica je bila izvedena v provinci Jiangsu. Rezultati so pokazali, da so kajenje, pitje in prednost za slano hrano močno povezana s tveganjem za GC. Razlike v načinu življenja med moškimi in ženskami je lahko kot zaradi višjih stopenj incidence pri moških od tistih pri ženskah. Sedem EXON SNP so genotipizacijo rs2227983, rs2072454, rs17337023, rs1050171, rs1140475, rs2293347 in rs28384375. Ugotovljeno je bilo, da so bile variantne rs2072454 T alel in TT genotipa močno povezana s povečanim tveganjem za GC. Zanimivo je, da je naša rezultat predlagal ACAGCA haplotip se lahko povezano z manjšim tveganjem za GC. Vendar pa je bila preučena ni pomembna povezava med ostalimi šestimi SNP in tveganjem GC tako v celotni populaciji in starosti ujemanje prebivalstva celo z razlikami med spoloma.

Sklepi

kajenje, pitje in prednost za slano hrano so močno povezana s tveganjem za GC v provinci Jiangsu z razlikami med spoloma. Čeprav je bil samo en SNP (rs2072454) močno povezana s povečanim tveganjem za GC, skupaj šest EGFR ekson SNP skupaj lahko koristno za napovedovanje tveganja GC

Navedba. Zhang J, Zhan Z, Wu J Zhang C Yang Y, Tong S, et al. (2013) Zveza med polimorfizmov v EGFR Gene eksonov, načina življenja in tveganja želodčnega raka z razlikami med spoloma v kitajski Han subjektov. PLoS ONE 8 (3): e59254. doi: 10,1371 /journal.pone.0059254

Urednik: Eithne Costello, UK center Liverpool Cancer Research, Velika Britanija

Prejeto: September 19, 2012; Sprejeto: 13. februar 2013; Objavljeno: 29. marec 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Financiranje:. Ta študija je bil podprt s Priority Academic razvoj programa Jiangsu visokošolskih zavodov (PAPD), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2008461), National Natural Science Foundation Kitajske (30973715 in 81001502), raziskovalni sklad za doktorski program za visoko šolstvo Kitajske (20103237110011) , Mladi Učitelji v Nanjing University tradicionalne kitajske medicine. Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa

nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi

Uvod

Čeprav sta incidenca in umrljivost zaradi raka želodca (PK) zmanjšal v zadnjih letih, je GC četrti najpogostejši malignom na svetu v letu 2008, s približno 989.600 novih primerov. Moški na splošno razvijajo GC dvakrat pogosteje kot ženske in približno 72% novih primerov se pojavljajo v državah v razvoju. Na splošno so najvišje stopnje pojavnosti so v Aziji, zlasti v vzhodnoazijskih državah, kot so Koreja, Japonska in Kitajska [1].

Pravzaprav, skoraj 40% vseh primerov GC pride na Kitajskem, in da je izjemna geografska razlike v stopnjah GC vsej Kitajski [2]. Več kot dve tretjini bolnikov z diagnozo GC na Kitajskem imajo neizrezljiv bolezni in mediano preživetje šest do devet mesecev. Poleg tega je pri bolnikih s resektabilne tumorji, lokalnih in oddaljenih ponovitev bolezni pa so visoke, in 5-letno preživetje je manj kot 30% [3]. Ne et al.
[4] ocenila vpliv GC na kitajskega prebivalstva, ki ga epidemiološke analize distribucije umrljivosti od leta 1990 do 1992, so rezultati pokazali, da je GC vodilni vzrok smrti, povezanih z rakom na Kitajskem .

zdaj je splošno sprejeto, da je patogeneza GC vključuje več dejavnikov interakcijo med okoljskimi sprožilcev in genetsko predispozicijo. Epidemiološke študije so ugotovili starost, razlike med spoloma in številne okoljske dejavnike, ki lahko prispevajo k razvoju GC, vključno s slano prehrano, kajenja, uživanja alkohola in Helicobacter pylori
okužba [5] - [8] . Druge študije so ugotovili gostitelja dejavnike in genetske spremembe, ki prav tako igrajo pomembno vlogo pri razvoju in napredovanju GC z geni in okoljem interakcij [9], [10].

epidermalni rastni faktor receptor (EGFR) gen se nahaja v kratkem kraku človeškega kromosoma 7 in proizvaja glikoprotein z molekulsko maso 170 kDa, ki ima visoko afiniteto do njegovih ligandov, vključno epidermalni rastni faktor (EGF) in preoblikovanje rastnega faktorja alfa (TGF-α). EGFR sodeluje pri več bistvenih tumorogenih mehanizmov, kot so tumorja, invazije, angiogenezo in metastaze. EGFR izraz so opazili v številnih človeških tumorjev, in številne študije pokazale, da prekomerno EGFR povezana s slabim izidom [11]. V GC, EGFR čezmernim povezana s fazi tumorja in slabo kliničnim izidom [12]. Vendar pa so vloge, ki imajo EGFR prekomerno in genetske spremembe v želodcu rakotvornost ostajajo nejasne. Poleg tega je bilo ugotovljeno, le nekaj mononukleotidnih polimorfizmov (SNP), povezati z razvojem GC in rezultatov [11], [13].

V tej študiji smo predpostavili, da okoljske izpostavljenosti in razlike med spoloma so delovali kot učinek modifikatorji o ozadju genetske variacije EGFR eksonov, ki lahko vplivajo na EGFR funkcijo, s čimer se oblikuje GC občutljivost. Da bi preverila to hipotezo, je bila izvedena študija, ki temelji na bolnišnica, v kateri so bili genotipizacijo 387 primerov GC in 392 kontrol rak brez v kitajskega prebivalstva z visokim tveganjem za sedem znanih SNP v EGFR eksonov, in sicer rs2227983 A > G, rs2072454 C > T, rs17337023 A > T, rs1050171 G > A, rs1140475 C > T, rs2293347 G > A in rs28384375 T >. C

Materiali in metode

Zaposlovanje zadevah in nadzor udeležencev

Na začetku primeri 401GC in 420 kontrol so bile ugotovljene; so bili izključeni 3 primerov raka pomanjkanja vprašalnike kakor tudi 11 tumorji, razen adenokarcinomom; 18 Nadzor je izključil biomarkerjev, povezanih z rakom nezmernega serumu in 10 kontrol so bili izključeni po geografski odklon. Na splošno je bilo skupno število prebivalcev v 387 primerih in 392 kontrol na voljo za tekoče študije, na podlagi bodočega moči analiz, da je škoda, da so bile kontrole približno 10 let mlajši od primerov, torej starostno ujemanja populacije s 294 primerih in 294 nadzor je bila vzeta iz celotnega prebivalstva za primerjanje starostno ujemanja. Vsi predmeti so bili gensko nepovezanih etnične Han kitajski. Bolniki s primarnim GC so bili zaposleni na oddelku za kirurške gastroenterologijo v Provansi bolnišnici Jiangsu tradicionalne kitajske medicine (TCM) v obdobju od januarja 2008 do julija 2010 v mestu Nanjing, provinci Jiangsu. Rakave brez zdravih kontrol so bili zaporedoma zaposleni iz bolnišnice Jiangsu TCM, in so bili v bolnišnici obiskovalcev za letni check-up v istem obdobju. Ki jih je treba vključiti v študijo so bolniki (a) samci ali samice, starejše od 20 let, vendar mlajših od 80 let, (b) je moral biti Han kitajske narodnosti (self-poročali), (c) je iz treh regij Jiangsu province in je moral biti domačin za najmanj 5 let, (d), je moral imeti novo histopathologically diagnozo primarni GC, (e), je bilo pomanjkanje prejšnje maligne tumorje v drugih organih, in (f) ni imela protitumorsko terapijo pred zaposlovanjem vključno kemoterapijo in radioterapijo. Usposobljeni anketarji uporabljajo predhodno preizkušen vprašalnik za zbiranje epidemioloških podatkov od udeležencev, in sicer, demografski dejavniki, kot so starost in spol, ter znanih dejavnikov tveganja za GC (kot so kajenje tobaka, uživanje alkohola in družinsko anamnezo raka prebavnega trakta) . Posamezniki, ki so kadile enkrat ali večkrat na dan, več kot eno leto, so bili opredeljeni kot kadilci, in tiste, ki porabijo tri ali več alkoholnih pijač na teden, za več kot 6 mesecev, so menili, da je kronični pivci [14], [15]. Po podpisu premišljene oblike soglasij za vsak predmet podaril 3-5 ml periferne krvi, ki se uporabljajo za ekstrakcijo genomske DNA. Raziskava Protokol je bil odobren s strani Institutional Review Board Jiangsu Provence Bolnišnica TCM.

genomske DNK Izolacija iz celic periferne krvi

A komercialna ekstrakcija Komplet krvi DNA (AxyPrep-96 kit, Axygen, CA, ZDA) je bila uporabljena za pridobivanje genomske DNA iz vzorcev krvi. Očiščene DNA smo shranili pri -20 ° C dokler so bile uporabljene za testiranje genotipa. Kakovost DNK je bila ocenjena z agarozno gelsko elektroforezo.

genotipizacijo

Verižna reakcija s polimerazo-ligacija reakcija detekcijo (PCR-LDR) metode so bile uporabljene za genotipizacijo [16]. Temeljni premazi smo sintetizirali Shanghai Sangon biološki inženiring tehnologije in storitve (No.698, Xiangmin Rd, Songjiang District, Šanghaj, Kitajska). Vsak niz odkrivanja ligaza reakcijskih sond sestavljajo eno skupno sondo in dva diskriminacijskih sonde za dve vrsti (tabela S1).

Cilj DNA sekvence smo pomnožili s pomočjo multipleks metodo PCR. PCRs Za vsak predmet so bile izvedene v končnem volumnu 20 ul z 1 × PCR pufer, 3,0 mmol /l MgCl _{2, 2,0 mmol /l deoksinukleotid trifosfate, 1 ul primerji, 0,2 ul QIAGEN HotStarTaq polimerazo (QIAGEN, Kitajska ), 4 xl 1 × Q-rešitev, in 10-20 ng genomske DNA. Termična kolesarjenje smo izvedli pet SNP (rs2227983, rs17337023, rs1140475, rs2293347 in rs2072454) v Gene Amp PCR sistem 9600 (PerkinElmer) z začetnim denaturacija pri 15 min pri 95 ° C, čemur sledi 35 ciklov denaturacijo pri 94 ° C za 30 sekund, žarjenje pri 59 ° C 1 min in podaljšanje pri 72 ° C 1 minuto, nato pa končni razširitvi pri 72 ° C za 7 min. Protokol za rs28384375 pomnoževanje sestavljena iz začetnega denaturacija pri 15 min pri 95 ° C, čemur sledi 35 ciklov denaturacijo pri 94 ° C 30 sekund, žarjenje pri 56 ° C 1 min in podaljšanje pri 72 ° C 1 min , čemur sledi končno razširitvijo pri 72 ° C za 7 min. Protokol za rs1050171 sestavljena iz začetnega denaturacijo za 15 minut pri 95 ° C, čemur sledi 35 ciklov denaturacijo pri 94 ° C za 30 sekund, prileganje pri 53 ° C 1 min in podaljšanje pri 72 ° C 1 min čemur sledi končno razširitvijo pri 72 ° C 7 minut.}

ligacija reakcijo za vsak predmet je bila izvedena v končnem volumnu 10 ul, ki vsebuje 1 x NEB Taq DNA ligaze blažilnik, 12,5 pmol vsakega mešanice sonde 0,05 ul Taq DNA ligaze [NEB biotehnologija (Peking)], in 1 ul multi-PCR produkta. Sekvence sonda so prikazani v tabeli S2. Skupno je bilo opravljenih 35 ciklov, ki sestojijo iz 95 ° C za 2 min, 94 ° C za 30 sekund in 60 ° C za 2 min. Fluorescentne produkti reakcij za odkrivanje ligaza so bile diferencirane z ABI sekvencer 377 (slika S1). Za potrditev natančnost metode PCR-LDR genotipizacije, je bil opravljen neposredno zaporedja DNK naključno izbranih produktov PCR. Delež vzorcev zaporedja je približno 5%. Rezultati genotipizacijio PCR-LDR pokazala popolno soglasje z neposrednimi rezultati DNK zaporedja.

Statistične analize

Vse statistične analize, s pomočjo SPSS različico programske opreme 16,0 bile opravljene (SPSS Inc., Chicago, IL, ZDA). Za primerjavo opažene genotipov v kontrolni skupini s pričakovanimi frekvencami, je bil Hardy-Weinberg ravnovesje (HWE) testiran s χ ^{2-test bog-of-fit. Primeri in kontrole smo primerjali glede na demografske značilnosti, dejavniki življenjskega sloga, in alelov frekvenc vsakega SNP uporabo χ 2
-test. Za vsak polimorfizem, so kvote razmerja (OR) in intervali 95% zaupanja (CI), izračunan iz pogojnih logističnih regresijskih modelov za ocenjevanje glavni učinek vsake polimorfizma z GC pri prilagajanju za neprekinjene starost, spol in dejavniki življenjskega sloga. Logistična regresija analizira z veliko alel kot je bilo sklicevanje zaposleni oceniti prilagojenih najbolj oddaljenih regij, 95% čujejo, in P
vrednosti. Vendar pa smo ugotovili, da je spremenljivka spol in starost, ni v skladu s predpostavko sorazmernosti. Tako so bili uporabljeni stratifikacija spol in starostno ujemanja za merjenje oddaljenih regij in 95% CIS. Za spremenljivke življenjskega sloga, ki so pokazali pomembne odnose z GC v analizah je imela samo za ujemanje dejavnikov, smo dodatno ocenili njihovo neodvisnost pri analizah, prilagojene za dodatnih potencialnih confounders (tj, kajenje, pitje, slana hrana, prehranjevanje časa in jedo zajtrk) v starostni ujemanja prebivalstva. In FAZA programski paket različice 2.0 je bila uporabljena sklepati haplotip frekvenc, ki temeljijo na opazovanih EGFR genotipov. Vse
P vrednosti so dvostranski in P
vrednost. ≪ 0.05 smo imeli statistično značilno}

Rezultati

Značilnosti študijskih predmetov

značilnosti teh študijskih predmetov je bilo v skladu s prej opisano [17], [18]. V tem dokumentu je bilo celotno prebivalstvo z 387 primerov in 392 kontrol in o starostni ujemanje prebivalstva s 294 primerov in 294 kontrol, vključenih v sedanjih analiz. Spol, starost, in geografska porazdelitev regija študijskimi predmeti so prikazani v tabeli 1.

Da bi preučili razlike v pojavnosti GC med moškimi in ženskami, so porazdelitve izbranih spremenljivk življenjskega sloga analizirali z razlikami med spoloma. Rezultati so pokazali, da je bilo šest dejavnikov življenjskega sloga (tj redno jemljejo hrano, prednost za slano hrano, jedo čas, kadilski status, status, pitje in prehranjevanje z zajtrkom) močno povezana s tveganjem za GC, in njihove učinke lahko spremenijo glede na spol in starost. Štirje vpliv dejavnikov življenjskega sloga, to je prednost za slano hrano, jedo čas, kajenja in stanja pitne, znatno razlikuje med moškimi in ženskami ( P
< 0,05) (tabela 2). Ugotovljeno je bilo, da so bili odstotki moških, ki prevažajo nezdravih prehranjevalnih navad, kot so želje za slano hrano, kratek čas prehranjevanja, kajenje in pitje bistveno višje od tistih samic ( P
< 0,05), ki bi lahko kot zaradi višjih stopenj incidence pri moških od tistih pri ženskah. V celotni populaciji, ki redno hrano in jedo zajtrk zmanjšala tveganje za ženske GC, medtem ko bi pitje poveča tveganje za moškega GC (tabela 3). Poleg tega sta oba prednost za slane hrane in kajenje poveča tveganje za moške in ženske GC ( P
< 0,05). Podobne rezultate je bilo ugotovljeno tudi po starostni ujemanja, ki redno jemljejo jedi zmanjšala tveganje za GC in preference za slano hrano in kajenje povečano tveganje moških in ženskih GC ( P
< 0,05, tabela 4). Vendar pa je bilo dve izjemi, ki je bil pitne povečano tveganje za moškega GC ( P
< 0,05), ne pa ženski GC ( P
> 0,05), morda zaradi omejene ženske prebivalcev, medtem ko je vsak dan jesti zajtrk zmanjšalo tveganje za žensko GC ( P
< 0,05), ne pa moški GC ( P
> 0,05). (Tabela 4)

genotipizacijo Distribucija in tveganje za GC

v tej študiji je bila odkrita šele alel T missense locus rs28384375 je. Glede šestih preostalih SNP so bili opazovani genotipov pri kontrolah v HWE. Ker ni bilo statistično značilnih razlik izgubili, so bile prilagojene statistični rezultati prikazani samo v tabelah. V celotni populaciji je bila zveza med distribucijo EGFR genskih alelov, genotipov in tveganja GC prikazani v tabeli 5. je bilo opaziti le majhna razlika v smislu porazdelitve alelov z rs2072454 ( χ ^{2
= 3,844, P =
0,050), in logistično regresijo analiz so pokazali, da je varianta tega alel lahko povezana z GC tveganjem (popravljeni OR = 1,23, 95% CI = 1.00-1.50). Vendar pa ni bilo opaziti pomembnih razlik med primerov in kontrol v smislu porazdelitve alelov z razlikami med spoloma. Rs2293347 polimorfizem je bila povezana z moškimi primerih GC, saj 73,0% primerov GC izvaja alela G v primerjavi z 29,5% zdravstvenih kontrol (popravljeni OR = 6,45, 95% IZ = 4.89-8.51, P
< 0,001 ), vendar ne genotipov so znatno povezano s tveganjem GC. V nasprotnem žensko populacijo bi GA genotip zmanjša tveganje za ženske GC zaradi 34,5% primerov GC nosijo GA genotip v primerjavi z 38,9% zdravstvenih kontrol, pa ni bistvenih razlik med porazdelitvijo alelov in genotipov frekvencah ( P
> 0,05). Poleg tega so bili pregledani ni bistvenih razlik v ostalih štirih SNP ( P
> 0,05)., Tj rs2227983, rs17337023, rs1050171 in rs1140475 med primeri in nadzira tudi z razlikami med spoloma}

V starost-ujemanje prebivalstva, združenje med distribucijo EGFR genskih alelov, haplotipov in tveganja GC je prikazano v tabeli 6. Občutne razlike so opazili v smislu porazdelitve alelov ( χ ^{2
= 4,795, P =
0,029) in distribucija genotipa ( χ 2
= 6,668, P =
0.036) iz rs2072454, razen podatkov iz Tabela 5. Poleg tega analize logistična regresija je pokazala, da bi varianta alel rs2072454 T poveča tveganje za GC (prilagojena OR = 0,77, 95% CI = 0,61-0,97; P
< 0,05). V skladu z delitvijo genotip, so opazili tudi velika razlika pri moških ( χ 2
= 7,914, P =
0,019) kot ženska populacija ( χ 2
= 0,452, P =
0,798). Vendar pa ni bilo bistvenih razlik med primerov in kontrol tudi z razlikami med spoloma za preostale SNP, in sicer rs2227983, rs17337023, rs1140475, rs1050171 in rs2293347 ( P
> 0,05).}

Če želite izključiti okoljskega vpliva, smo raziskovali povezavo med potencialnimi tri SNP, povezanih z GC in tveganjem GC v starosti ujemanja prebivalstva, ki nosi zdravje načina življenja (Tabela 7). Ena ločena razlika je bila preučena glede porazdelitve genotipa rs2072454 ( χ ^{2
= 6,036, P =
0,049). Posebej, analize logistična regresija je pokazala, da je TT genotip znatno povečala tveganje za GC v populaciji z dnevnega prehranjevanja zajtrk (popravljeni OR = 1,92, 95% CI = 1.07-3.44, P
< 0,05).}

eksonov ne le kodira aminokislinsko zaporedje proteina, ki pa vsebuje tudi zaporedja, ki vplivajo prevod ali mRNA degradacijo [19]. Lokusov smo združili in podvržemo analizo haplotip sklepanja s programom FAZA 2.0. Tam so bili štirje možni haplotipov v celotni populaciji in tri možne haplotipov v starosti ujemanja prebivalstva, s frekvenco > 4% (Tabela 8, Tabela 9). V primerjavi z GTTGCG haplotipom, analize, logistična regresija je pokazala, da je bila ACAGCG haplotip povezana z bistveno zmanjšano tveganje za GC (OR = 0,67, 95% CI = 0,49-0,92, P
< 0,05 prilagojeni za starost, spol in dejavniki življenjskega sloga), v celotni populaciji (tabela 8) in ne na starost ujemanja prebivalstva (OR = 0,83, 95% CI = 0,58-1,19, P
> 0,05 prilagojena za starost, spol in življenjski slog dejavniki) (tabela 9). Drugi haplotipi so bili povezani z bistveno zmanjšano tveganje za GC (prilagojena OR = 0,69, 95% IZ = 0,52-0,90 za celotno prebivalstvo; popravite OR = 0,74, 95% IZ = 0,56-0,99 za starost ujemanja prebivalcev). V primerjavi z ACAGCG haplotipom, lahko ACAACG zmanjša tveganje za GC (OR = 0,61, 95% CI = 0.40-0.94 prilagojena za starost, spol in življenjski slog), v celotni populaciji, vendar P
vrednost storil ni dosegla statistične značilnosti, ki jih Bonferronijev popravek (tabela 8).

Pogovor

Čeprav je bilo veliko število novih primerov GC videti po vsem svetu v zadnjih desetletjih ni mehanizmi osnovni želodca karcinogeneza so še ni povsem jasen. Podobno kot v prejšnjih raziskavah [20], [21], naši rezultati pokazali, da so ljudje na splošno so bile v razvoju GC dvakrat pogosteje kot ženske na Kitajskem. Podan je bil predlog, ki ga Michael et al.
, Da je bil velik del svetovne razlike v pojavnosti raka pripišemo okoljskim vplivom, vključno prehrambne navade in nezdravih dejavniki življenjskega sloga [22]. V tej študiji, zato nas je zanimalo, preveriti, ali bi bilo nekatere nezdrave dejavniki življenjskega sloga poveča tveganje za GC s razlik med spoloma na Kitajskem. Šest vpliv dejavnikov življenjskega sloga, vključno z redno ob obroku, prednost slano hrano, jedo čas, kadilski status, status, pitje, in jedo zajtrk, so bile ugotovljene, da bo vplivala na tveganje za GC z razlikami med spoloma, kar je bilo v skladu s prejšnjimi študijami na vzhodu Kitajske [20] [23] [24]. Še posebej je bila prednost za slano hrano, pitje in kajenje najmočnejši in najbolj dosledna dejavniki tveganja za GC.

V nedavni raziskave kažejo, da bi lahko visok vnos soli (natrija) poveča tveganje za GC [21], [ ,,,0],24] - [26]. dokazuje, da je bila tudi naša ugotovitev, da so bili bolniki GC v provinci Jiangsu prednost slani hrani, kot so soljeno meso, vložene zelenjave in kisle zelenjavnih sokov, ki bi utegnili biti onesnaženi z N-nitrozo spojin. Vendar so N-nitrozo spojin najpogosteje predlagani povezana s povečanim tveganjem zgornjih-gastrointestinalnega raka [27]. Piti in kaditi, še dve prevladujoči dejavniki tveganja za GC v svetu [28], so bili pregledani tudi v tej študiji. Ugotovili smo, pomembno povezavo med pitjem in GC tveganja v provinci Jiangsu. Je bil dokaz z laboratorijsko študijo, da bi kajenje poveča apoptozo v podganji želodčne sluznice s povečanjem XO aktivnosti [29], in alkohol lahko izvaja tudi vpliv na izločanje kisline, praznjenja želodca in nekaterih bolezni, povezanih s kislino, kot je gastritis spremlja poškodbe želodčne sluznice in po vnetna reakcija pa bo pospeševanje proliferacije želodca celic in diferenciacije [30]. V procesu, lahko N-nitrozo spojin in mikotoksinov iz neke slano hrano indukcijo genske mutacije [31], [32], s čimer se daje prednost slano hrano lahko prvotna nevarnost GC. In dokazi so izpostavili povezavo s poti, ki sodelujejo pri razvojnih procesov [33]. Ključne molekule teh poti so receptorji tirozinkinaze, katere je bilo ugotovljeno, da se odklonsko aktivira ali prekomerno v različnih tumorjev in zato predstavljajo obetavne cilje za terapevtsko intervencijo [13].

je EGFR eden od ključnih molekul , in veliko podatkov kaže, da je zelo invazivna GC povezana z odklonskega aktiviranje ali overactivation EGFR zaradi gena ojačanje ali strukturnih sprememb [13]. Pred kratkim je študija primerov in kontrol od 61 primerov in 20 kontrol, v provinci Henan, ki se nahaja v osrednjem Kitajskem, je pokazala, da lahko EGFR rs28384375 C /T polimorfizem spodbujajo nastanek in razvoj GC [34]. Poleg tega je druga študija primerov in kontrol od 138 primerov in 170 kontrol v provinci Jiangxi, ki se nahaja na jugovzhodu Kitajske, je pokazala, da je EGFR rs763317 G /A polimorfizem lahko povezujejo s povečanim tveganjem za GC [35].

EGFR je receptorja rastnega faktorja tirozin kinaze in pripada receptorja tirozin kinaze superdružine, katerih člani so označena z zunajcelično domeno (kjer vezavo ligand ligande odvija), kratek lipofilnega transmembranske domene, ter znotrajcelično domeno, ki pristanišč na tirozin kinaze dejavnost [36]. EGFR se lahko aktivira vezati ligande, kot so ESPG in TGF-a, in je igra osrednje vloge v razvoj, rast in diferenciacijo. Aktivacija EGFR lahko prispeva k preoblikovanju celičnih fenotipov in zagotoviti tumorske celice z velikimi rasti in preživetja prednosti [37]. Veliko človeških tumorjev kažejo EGFR prekomerno, kar je v korelaciji s poznejši fazi tumorja ali slabo klinični izid, kot ne-drobnoceličnega pljučnega raka [38], kolorektalnega raka [39], raka dojke [40], raka glave in vratu [ ,,,0],41], rak mehurja [42], in GC [43].

trenutno narašča zanimanje za SNP mutacije EGFR, glede na to, da bi lahko vplivala na učinkovitost EGFR zaviralcem tirozin kinaze (TKI) zdravljenje v različnih raka [44], kolorektalnega raka [39], nedrobnocelični pljučni rak [45] GC [46] - [49]. Znano je, da eksonov kodirajo ne le aminokislinsko zaporedje proteina, ki pa vsebuje tudi zaporedja, ki vplivajo prevod ali mRNA degradacijo [19]. Tako bi EGFR ekson SNP vplivati ​​EGFR izražanje genov in /ali proteinski aktivnosti in s tem spremeni afiniteto EGFR ni le njena liganda, ampak tudi zdravili proti raku, ki ciljajo na ta protein. Dejansko Puyo sod.
Ugotovili, da mutacije eksonov 18-21 EGFR povečati aktivnost TKI, medtem ko izbris eksonov 2-7 povezana z glioblastoma onkogenezo [49]. Poleg tega sta dve klinične študije so pokazale, da SNP v EGFR eksonov 18, 19, 21 in 25 vplivajo na klinično učinkovitost gefitiniba in se utegnejo biomarkerji za napovedovanje kliničnega izida bolnikov gefitiniba zdravljenih z napredovano nedrobnoceličnim pljučnim rakom (pljuč) [50], [51].

v tej raziskavi so šest eksonov SNP v EGFR so nekoliko povezano s tveganjem GC tako v celotni populaciji in starosti ujemanje prebivalstva tudi s spolom razlike. Ugotovljeno je bilo, da je bil v SNP rs2072454 močno povezana s tveganjem za GC. Še posebej so bili alel T varianta rs2072454 in TT genotipa povezana s povečanim tveganjem za GC. Vendar pa rs2227983, rs17337023, rs1050171 in rs1140475 SNP niso povezani z GC tveganjem. V zvezi s missense locus rs28384375 je bila le alel T odkriti v primerih in kontrolah. Mnoga poročila kažejo, da je več EGFR SNP, vključno rs2227983 (imenovana tudi Arg521Lys ali R497K) [39] [52] [53], rs1050171 (imenovan tudi kot Q787Q) [54], [55] in rs2293347 (C2982T) [ ,,,0],56], je bilo bolj verjetno, da vplivajo na biološke lastnosti tumorjev (kot so tumorske rasti, invazije, metastaz in napredovanje) kot opredeliti dovzetnost za razvoj raka. Ker EGFR, je ključni posrednik angiogenezo, mogoče urediti svoje ciljne gene kot VEGF, ki lahko neposredno vplivajo tumorja biološke lastnosti. Ti rezultati bi tudi pojasniti, zakaj lahko EGFR SNP služijo kot ključne dejavnike odziv na kemoterapijo, ki temelji-TKI EGFR [11]. Zato lahko te genske mutacije daje kompleksnost in zadrego za zdravljenje GC in preživetja [57].

Ko Puyo et al
. [49] analizirali povezavo med specifično EGFR funkcionalnih polimorfizmov in proti raku dejavnosti drog v 60 celičnih linij človeških tumorjev, ki jih je National Cancer Institute, frekvenco nonsynonymous SNP rs28384375 (imenovan tudi kot Val592Ala) je 0,5, medtem ko je heterozigotnim frekvenca -216G > T SNP (imenovan tudi kot rs287129) je bil 0,346. V celične linije, ki so bile heterozigotno in varianta homozigotna za -216 G > T SNP je pokazala bistveno večjo ekspresijo EGFR gena, kot so homozigotno linij divjega tipa. Še več, v primerjavi s celične linije brez alel varianto, linije celic z najmanj eno varianto alel T pri -216 G > sta T SNP bolj občutljiva erlotinib in manj občutljiv na Geldanamicinski, topoizomeraze I in inhibitorjev II in alkilatnih agentov. Zanimivo je, da so naši rezultati pokazali, da je GTTGCG haplotip bolj pogosta v primerih GC kot v kontrolni skupini rakavih brez, in da so bile ACAGCG haplotipov povezana z bistveno zmanjšano tveganje za GC (prilagojeno OR = 0,67, 95% IZ = 0.49-0.92 za ACAGCG, prilagojena OR = 0,69, 95% iZ = 0,52-0,90 za druge) v celotni populaciji (tabela 8). Vendar pa je v starosti ujemanja prebivalcev, je bila preučena ni pomembna povezava med ACAGCA haplotipom in tveganje GC (prilagojena OR = 0,83, 95% CI = 0,58-1,19) (tabela 9). Tako bi se alela T za rs2072454 in rs17337023, zlasti bivši, povezana s tveganjem GC. Zato se lahko kombinira analizo šestih SNP, zlasti alelov T rs2072454 in rs17337023, koristno za napovedovanje tveganja GC

potrebujejo več omejitve v tej študiji, je treba obravnavati: 1). Njena velikost vzorca morda ni bil dovolj velik, da zazna SNP z nizko frekvenco varianta, kot rs28384375; 2) da polimorfizmi, ki so raziskovali v tej študiji so bili izbrani na podlagi njihovih učinkov na delovanje EGFR in ne sme podati celovit pogled na genetske variabilnosti EGFR eksonov; 3) podrobne informacije o primerih, GC ni bilo odvzeto, tudi preživetje bolnikov, ali so bili tumorji črevesno razširjene ali tip, ali je prišlo do metastaz, in kakšen je bil učinek zdravljenja z drogami za.

Na koncu je ta študija je predlagal, da bi lahko razlike v načinu življenja med moškimi in ženskami, kot zaradi višjih stopenj incidence pri moških od tistih pri ženskah. Čeprav je bil samo en SNP (rs2072454) močno povezana s povečanim tveganjem za GC v kombinaciji z analizo drugih šest EGFR eksonu SNP skupaj lahko koristne za napovedovanje tveganja za GC. Nadaljnje raziskave so upravičena za določitev teh ugotovitev in obravnavanje osnovnih mehanizmov.

Podpora Informacije
Slika S1.
Tudi fluorescentna izdelki LDR so diferencirane glede ABI sekvencer 377 za sedem SNP v EGFR eksonih. Skupaj je bilo več kot 90% izdelkov uspešno razlikuje glede ABI sekvencer 377.
doi: 10.1371 /journal.pone.0059254.s001
(TIF)
Tabela S1.
PCR začetnih oligonukleotidov zaporedja za sedem lokusov v genu EGFR. Primerji je oblikoval Primer Premier 6 programsko opremo in sintetizirajo Shanghai Sangon biološki inženiring tehnologije in storitve
doi:. 10,1371 /journal.pone.0059254.s002
(DOC)
tabeli S2.
Probe zaporedja sedmih SNP v EGFR gena. Primerji smo sintetizirali Shanghai Sangon biološki inženiring tehnologije in storitve
doi:. 10,1371 /journal.pone.0059254.s003
(DOC)

Priznanja

Zavedamo Master Jingye Wang in Haixia Xu za pomoč pri izolaciji DNK.

• Plos ONE: polimorfizma (rs2295080) v mTOR Promotor regijo in njene povezave s Rak želodca v kitajski Prebivalstvo
• Plos ONE: prognostični Vrednost Cancer Stem Cell Marker CD133 izražanja želodčnega raka: sistematični pregled