NIH:n tutkijat kehittävät uuden näytteenvalmistusmenetelmän SARS-CoV-2:n havaitsemiseksi

National Institutes of Health (NIH) -tutkijat ovat kehittäneet uuden näytteenvalmistusmenetelmän SARS-CoV-2:n havaitsemiseksi. virus, joka aiheuttaa COVID-19-viruksen. Menetelmä ohittaa viruksen geneettisen RNA -materiaalin uuttamisen, yksinkertaistaa näytteen puhdistusta ja vähentää mahdollisesti testiaikaa ja -kustannuksia. Menetelmä on tulosta National Eye Institutein (NEI) tutkijoiden yhteistyöstä, NIH:n kliininen keskus (CC), ja National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIDCR).

Diagnostinen testaus on edelleen tärkeä väline taistelussa COVID-19-pandemiaa vastaan. Vakiotestit SARS-CoV-2:n havaitsemiseksi sisältävät viruksen RNA:n monistamisen havaittaville tasoille käyttäen tekniikkaa, jota kutsutaan kvantitatiiviseksi käänteistranskriptio-PCR:ksi (RT-qPCR). Mutta ensin, RNA on uutettava näytteestä. RNA-uuttopakkausten valmistajilla on ollut vaikeuksia vastata kysyntään COVID-19-pandemian aikana, heikentää testauskapasiteettia maailmanlaajuisesti. Uusien virusmuunnelmien ilmaantuessa tarve parempaan, nopeammat testit ovat parempia kuin koskaan.

Robert B.Hufnagelin johtama tiimi, M.D., Ph.D., NEI:n lääketieteellisen genetiikan ja silmägenomisen yksikön päällikkö, ja Bin Guan, Ph.D., kollega NEI:n oftalmisen genomiikan laboratoriossa, käytti laboratorioyhtiö Bio-Radin valmistamaa kelatointiainetta nimeltä Chelex 100 -hartsi SARS-CoV-2-RNA:n säilyttämiseksi näytteissä RT-qPCR:n havaitsemiseksi.

"Käytimme nenänielun ja syljenäytteitä eri virionipitoisuuksilla arvioidaksemme, voisiko niitä käyttää suoraan RNA:n havaitsemiseen, "sanoi Guan, tekniikkaa käsittelevän raportin pääkirjailija, joka julkaistiin tällä viikolla iScience -lehdessä. "Vastaus oli kyllä, selvästi suurella herkkyydellä. Myös, tämä valmiste inaktivoi viruksen, jolloin laboratoriohenkilöstön on turvallisempaa käsitellä positiivisia näytteitä. "

Hufnagelin tiimi teki löydön testaamalla erilaisia ​​kemikaaleja käyttämällä synteettisiä ja ihmisnäytteitä tunnistaakseen ne, jotka voisivat säilyttää RNA:n näytteissä vähäisellä hajoamisella ja sallien samalla viruksen suoran havaitsemisen RT-qPCR:llä.

Jos haluat vahvistaa testin, NIDCR:n Blake M.Warner, D.D.S., Ph.D., M.P.H., ja hänen tiiminsä keräsivät potilasnäytteitä (Research Protocol NIH IRB 20-D-0094) ja tallensivat ne joko viruksen kuljetusväliaineeseen, tai äskettäin kehitetty kelatoiva hartsi-puskuri NIH:n oireenmukaisessa testauslaitoksessa.

NIH:n kliinisen keskuksen COVID-19-testausryhmä testasi viruskuljetusaineiden näytteet, johtaa Karen M. Frank, M.D., Ph.D., käyttämällä tavanomaista RNA-uuttoa ja RT-qPCR-testausta. Kelatointihartsipuskurissa olevat näytteet kuumennettiin ja viruksen RNA sitten, testattu RT-qPCR:llä. Uusi valmiste lisäsi merkittävästi testattavaa RNA -saantoa, standardimenetelmään verrattuna.

Uskomme, että tällä uudella menetelmällä on selviä etuja herkkyyden lisäämisessä, kustannuksia ja aikaa säästäviä testejä. Menetelmä stabiloi RNA:n huoneenlämmössä kuljetuksen helpottamiseksi, varastointi, ja hoito kliinisissä olosuhteissa. "

Robert B.Hufnagel, M.D., Ph.D., NEI:n lääketieteellisen genetiikan ja silmägenomisen yksikön päällikkö

NEI on suojannut tämän tekniikan ympärillä olevaa immateriaalioikeutta ja etsii kumppaneita yhteiskehitykseen/lisensointiin. Ota yhteyttä [email protected] saadaksesi lisätietoja.

• Uusi näyttöön perustuva lähestymistapa laadukkaiden hiilihydraattiruokien määrittelyyn
• Tutkijat dokumentoivat mikrobilääkeresistentin keuhkokuumeen tartunnan ihmisestä toiseen