PLoS ONE: Identifikacija HSA-Mir-335 kao prognostički Potpis na rak želuca

Sažetak pregled

Pozadina pregled

Rak želuca (GC) je jedan od najčešćih malignih oboljenja i primarni uzrok smrti u pacijenata oboljelih od raka kineski. Ponavljanje je jedan od glavnih faktora dovodi do neuspjeha liječenja i niske razine 5-godišnje preživljavanje u GC pacijenata nakon kirurške resekcije. Stoga, identifikacija biomarkera s potencijalom u predviđanju rizika recidiva je ključni problem prognozu u GC pacijenata. Pregled

Ispitanici i metode

Ukupno 74 GC pacijenata odabrani su za sustavne analize, koji se sastoji od 31 bolesnika s recidiva i 43 bolesnika bez recidiva. Prvo, miRNAs microarray i bioinformatiku metode se koriste za karakterizaciju diferencijalne izražene miRNAs iz uzoraka primarnih tumora. Nakon koristili smo ROC metodu za odabir potpis s najboljim osjetljivosti i specifičnosti. Konačno, potvrđen mi je potpis u uzorcima GC (smrznuto svježe i uzorci krvi) pomoću kvantitativne PCR. Pregled

Rezultati

Mi smo identificirali 12 diferencijalne miRNAs toga 7 regulira prema gore i 5 dolje reguliranim miRNAs u grupi recidiva. Koristeći ROC metode, možemo dodatno utvrditi, HSA-Mir-335 kao potpis za prepoznavanje ponavljanje i ne-ponavljanje slučajeva u uzorcima treninga. Osim toga, provjeravaju se ovaj potpis pomoću kvantitativne PCR metode u 64 ispitnih uzoraka s dosljednom rezultat sa treninga seta. Visoka učestalost recidiva i siromašnih opstanak zabilježen je u GC slučajevima s visokom razinom HSA-Mir-335 ( P izvoznici < 0,001). Dodatno, procijenili smo da HSA-miR-335 su bili uključeni u regulaciju ciljnih gena u nekoliko onkogena signala putova, poput p53, MAPK, TGF-β, Wnt, erbB mTOR, Toll-like receptor i fokalne adhezije.

Zaključak

Naši rezultati pokazuju da je HSA-mir-335 ima potencijal da prepozna opasnost ponavljanja i odnose se na prognozi GC pacijenata pregled

Izvor:. Yan Z, Xiong Y, W Xu, Gao J, Cheng Y, Wang Z, et al. (2012) Identifikacija HSA-Mir-335 kao prognostički Potpis na rak želuca. PLoS ONE 7 (7): e40037. doi: 10,1371 /journal.pone.0040037 pregled

Urednik: Alfons Navarro, Sveučilište u Barceloni, Španjolska pregled

Primljeno: 21. veljače 2012; Prihvaćeno: 30. svibnja 2012; Objavljeno: 3. srpnja 2012 pregled

Copyright: © 2012 Yan i sur. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Ovi autori nemaju podršku ili sredstva za prijaviti pregled

suprotstavljenih interesa:.. autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled

Trenutno kirurgija je još uvijek glavni izbor za liječenje karcinom želuca (GC), no čak i nakon provođenja ljekovito resekcija, oko 40-65% GC pacijenata će doživjeti recidiv bolesti eventualno obuhvaća lokalni recidiv, peritonealnoj širenje ili hematogenozni metastaza [1], [2]. Iz tog razloga, 5 godina stopa preživljavanja GC pacijenata je i dalje na niskoj razini. Glavni izazov za poboljšanje kliničkih ishoda je za bolje razumijevanje molekularnih mehanizama i prepoznaju robustan potpisa za prognozu GC. Pregled

Nekoliko čimbenika rizika, uključujući patološki serosa stanje, status marže, promjene gustoće tumor mikropora i ekspresije gena povezanih s ponavljanje je opisano [3], [4]. Osim toga, nekoliko prediktivni ili dijagnostički postupci korišteni su za procjenu rizika ponavljanje temelju profiliranje ekspresije gena ili skup kliničkim varijablama [5] - [8]. Međutim, ti više zapažanja uključujući nekoliko gena ili proteina promjene mogu ugroziti njihovu kliničku primjenu. Pouzdan i praktičan molekularni markeri za kliničkih praktičara su potrebne za prognozu u GC. Pregled

A nedavno otkrivena od miRNAs su visoko konzervirani u genomima beskralješnjaka, kralježnjaka i biljaka. Oni služe kritične funkcije u više bioloških procesa [9], uključujući razvojne vremena, obrazaca i embriogeneze, diferencijaciju organogeneze i apoptozu [10]. S obzirom na njegove višestruke esencijalne biološke funkcije, to je ne čudi da je izraz nenormalni miRNAs će dovesti do bolesti pa čak i rak [11]. Pregled

miRNAs prikazani su kao učinkoviti potencijalnih biomarkera za praćenje podrijetla tkiva u zloćudnim tumorima nepoznatog primarnog podrijetlo [12]; miRNAs izraz profili su u mogućnosti da odražavaju razvojni lozu i diferencirano stanje tumora [11]. Sustavna analiza stabilnosti miRNAs kao optimizirani uvjeti za ekspresijski analizu pomoću formalinom fiksne parafin uklopljenih i krvi su prethodno opisano [13] - [15], rasvjetljavanju njihove neočekivanu dijagnostički potencijal. Postoji ograničen broj miRNAs [16] u ljudskom genomu koje su poznate za reguliranje približno 30% gena [17]. Ovi atributi miRNAs mogu nam pružiti jednostavan način da predvidi opasnost ponavljanja za rak pacijenata. Pregled

U ovom istraživanju, identificirali smo Mirna (HSA-Mir-335) koji ima potencijal za predviđanje recidiva rizik od GC temelji se na microarray i kliničkim podacima uzorku male veličine u kineskim GC pacijenata. Naši rezultati pokazuju da HSA-Mir-335 može biti čin kao klinički prognostičkim potpisa za GC. Pregled

Metode

kliničkim uzorcima

Ova studija je odobren od strane Etičkog povjerenstva Wuhan Opće bolnice Guangzhou zapovjedništva, PLA. Svi bolesnici rak želuca i ne-raka bolesnika s bolesti probavnog sustava pruža pismeni informirani pristanak u našem istraživanju. Pregled

Bolesnici koji se podvrgavaju gastrektomije za potencijalno izlječiv GC u Wuhan opće bolnice Guangzhou vojnog zapovjedništva su ispitanici u ovom istraživanju. Ispunjavanje uvjeta za uključivanje u ovom istraživanju je sudjelovalo histološki potvrđena adenokarcinom želuca ili gastroezofagealnog spoja. Svi pacijenti su primili kompletne resekcija uključujući i pokušaj potpunog uklanjanja tumora s uključivanjem široke negativne margine i druge retroperitonealnog Limfadenektomija (tipa D2). Informacije o kliničko, terapijske i ishod parametara pacijenata od svibnja 2005. do veljače 2012. godine prikupljeni retrospektivno. Rak inscenacije je izveden prema petom izdanju američkog Zajedničke komisije za rak TNM kriterijima. Pregled

Ponavljanje je definirana kao bilo koji rak recidiva uključujući limfnog čvora, preostalog želudac, lokalne, peritonejsku i hematogenozni metastaza. Svi pacijenti koji su doživjeli ponovnu pojavu raka je dijagnosticiran klinički ili radiološki, a potvrđeno biopsijom preko gornjeg probavnog endoskop ili perkutane punkcije. Rendgenski standard za dijagnozu recidiva uključen CT ili MRI prsa, trbuha, zdjelice, glave i sken kostiju, ili druge dijagnostičke testove koji su korišteni samo u posebnim okolnostima. Svi uzorci su dobiveni iz kirurških uzoraka bolesnika s želučanim adenokarcinom i svi pacijenti dali pisani pristanak upotrebu tih tkiva za istraživačke svrhe. Odabrali smo uzorke (uključujući smrznute svježe i krvnih uzoraka) od 74 bolesnika sa i bez GC recidiva. pregled

Mirna Microarray pregled

Analiza Mirna mikropostrojima je izvedena kao što je opisano u detalje na web stranici CapitalBio ( http://www.capitalbio.com), a također prema Hua je postupkom [18]. Ukratko, 50-100 ug ukupne RNA korišten je za izdvajanje miRNAs pomoću Mirni izolacija kit AM1560 (Ambion, USA). Fluoresceinom obilježeni miRNAs korišteni su za hibridizaciju na Affymetrix Mirni Chip sadrži 1075 sondi. Fluorescencijski signal je skeniran od GeneChip Skaner 3000 7G (Affymetrix, USA). Sirovi podaci su normalizirani i analizirati GeneChip Command konzole 1.1 softvera (Affymetrix, USA). Pregled

RNA ekstrakcija iz zamrznute i uzorci krvi

RNA je ekstrahirana iz zamrznutih svježih GC tkiva pomoću standardnog Trizola protokol (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). Za uzorke krvi, Mirni su ekstrahirane korištenjem miRNease kita (Qiagen). Ukratko, 700 ul QIAzol reagensa doda se 200 ul uzorka plazme i inkubira 5 min na sobnoj temperaturi. Zatim se doda 140 ul kloroforma, miješane 15 sekundi i inkubirana tijekom 3 min pri sobnoj temperaturi. To je uslijedila centrifugiranjem 14000 rpm na 4 ° C tijekom 15 min. Gornja, Vodena faza je uklonjena i 1.5 puta od njegovog volumena dodano u 100% etanola. Svaki 700 ul smjese se stavi na kolonu i centrifugirani pri 13000 okretaja u minuti na sobnoj temperaturi tijekom 15 sekundi. Nakon, 500 ul pufera RPL se doda na kolonu i centrifugirani pri 13000 okretaja u minuti na sobnoj temperaturi tijekom 2 minute. Zatim se stupac centrifugirani pri 13000 okretaja u minuti na sobnoj temperaturi da se osuši. Je sljedeće korak elucije s 20 ul nuclease-free water. Elucirani RNA je pohranjen na -70 ° C. Pregled

Real-time PCR Kvantitativni pregled

Mature Mirna sekvence nabavljeni iz Sanger Institute miRBase Sequence Database (http://microrna.sanger.ac .uk /sekvence /). Stem-loop reverzne transkripcije (RT) primeri su dizajnirani u skladu s Chen [19]. Reakcijski uvjeti korišteni RT uključeni inkubacije na 16 ° C tijekom 30 min; 37 ° C 30 min, a zatim na 72 ° C tijekom 10 minuta. Termalni biciklizam protokol za PCR uključeni početnim korakom denaturacije na 95 ° C tijekom 5 minuta, nakon čega slijedi 40 ciklusa na 95 ° C za 30 s, 57 ° C za 30 s i 72 ° C tijekom 30 s. Krivulje taline za svaku PCR oprezno se analizirati za određivanje bilo nespecifičnog pojačanja. Izraz svakog Mirna je izračunata pomoću 2 ^{-ΔΔ C
_{T formulu i normalizirana na U6 snRNA izrazu [20]. Pregled}}

nekontrolirano Algoritam pregled

SAM [21] se koristi za obavljanje nadzirane izračun clustering. Gušeći za značaja određuje se usklađivanja parametara Delta, od strane korisnika na temelju lažne pozitivne stope i zastupa Q vrijednost izabrao. Odabrali smo fold promjena veći od 2, a q = 0, kao kriterija odabira za diferencijalne ekspresije miRNAs. pregled

ROC i Kaplan-Meier opstanak Curve Analiza pregled

Analiza ROC krivulja je provedena su MedCalc programskih paketa (inačice 8.2.1.0; Mariakerke, Belgija). AUC krivulje daje mjeru ukupnu učinkovitost dijagnostičkog testa. Omjer Mirna intenziteta signala i CT vrijednosti svake Mirna korišteni su za izračun ROC u uzorcima. Survival analize također su provedena od strane MedCalc programskog paketa. Pregled

Statistička analiza pregled

Klinički podaci su analizirani korištenjem hi-kvadrat test. Kumulativna krivulja preživljavanja je u odnosu od log-rank testa. Za sve analize, razlika s P pregled. ≪ 0,05 smatrana je statistički značajna pregled

Mirna ciljanog gena Predviđanje i signalni put Analize pregled

koristila Mirna ciljanu predviđanja gen baze podataka TargetScan (http://www.targetscan.org) za odabir uvjerljive ciljeva diferencijalne izrazio miRNAs. Integrirani gen ontologija sustav baze podataka molekularna označavanje (MAS3.0, http://www.capitalbio.com) korišten je za istraživanje Mirne ciljanih gena i njihovog sudjelovanja u različitim signalnim putovima. Pregled

Rezultati pregled

Klinička obilježja GC Pacijenti

ukupno 74 pacijenata sa /bez recidiva su odabrani za sustavne analize. 31 pacijenata je ponavljajućih GC koji je dokazano patološki biopsijom na anastomoze mjestima putem endoskopije. 43 bolesnika bez recidiva izabrani su kao kontrolna skupina s utakmice u spolu, dobi pri dijagnozi, TNM, liječenja i broju zahvaćenih limfnih čvorova (Tablica 1). Pregled

Nije bilo značajne razlike u spolu ( P pregled = 0.469), dob ( P pregled = 0,502), Tumor mjesto ( P pregled = 0,299), diferencijacija ( P pregled = 0,511) , limfnih čvorova resekcija ( P pregled = 0,217) i status adjuvantne kemoterapije ( P pregled = 0,214). Bilo je značajna razlika u UICC fazi ( P pregled = 0,108) i omjer preživljavanja /smrti navedeno (8/23 u grupi recidiva vs. 34/9 u ne-grupi recidiva, P izvoznici <0.001), s medijanom vremena preživljavanja od 18,9 mjeseci u recidiva vs 43,9 mjeseci u ne-grupi recidiva odnosno ( P pregled. < 0,001) (Tablica 1) pregled

Mirna Expression Profili Associated GC recidiva Netlogu

Mi smo koristili miRNAs microarray čip za mjerenje miRNAs razina ekspresije kod 10 uzoraka GC sa /bez recidiva (5/5) kao trening set. Kada se uspoređuju Mirna izraz među skupinama, 7 regulira prema gore i 5 dolje regulirane miRNAs su otkrili da su statistički značajne u GC periodičan skupine (tablica 2). Ovi 12 miRNAs bi se mogla koristiti za razlikovanje između GC sa i bez recidiva temelji na hijerarhijskom analizom klastera (Slika 1). Pregled

HSA-Mir-335 je najbolji potpis za klasifikaciju GC sa i bez recidiva na trening set pregled

Mi smo koristili ROC metoda za analizu osjetljivost i specifičnost od biomarkera kandidata na temelju Mirna microarray podatke. Dobili smo 2 miRNAs HSA-Mir-335 i HSA-Mir-128B sa najboljim osjetljivosti i specifičnosti u razvrstavanja uzoraka GC sa i bez recidiva (Slika 2, tablica 3). U kombinaciji s FC vrijednosti (FC _{HSA-Mir-335 = 4,675; FC HSA-Mir-128B = 1,453) svakog biomarkera, smo odabrali HSA-Mir-335 za daljnje istraživanje pregled}

ovjere potpisa u testnih uzoraka u realnom vremenu PCR Netlogu

razinu ekspresije HSA-Mir-335 je otkriven u realnom vremenu PCR u 64 uzoraka testa GC u usporedbi s odgovarajućom susjedna tkiva kao kontrola. Rezultati su pokazali da je u 26 slučajeva sa recidiva, 21 slučajeva (21/26, 80.8%) bili su visoko izražen HSA-Mir-335; au 38 slučajeva bez recidiva, 29 slučajeva (29/38, 76,3%) bile su niske izrazio HSA-Mir-335 (Slika 3). Isti rezultati opaženi su u uzorcima krvi na uzorku krvi iz mješovitih 20 nekanceroznih pacijenata s bolesti probavnog sustava kao što su kontrola: U 26 slučaja s recidiva, 19 slučajeva (19/26, 73.1%) bilo je visoko izražene HSA-Mira -335; au 38 slučajeva bez recidiva, 30 slučajeva (30/38, 78.9%) su niske izrazio HSA-Mir-335 (Slika 3). Bilo je 11 slučajeva (11/64, 17.2%) ne podudaraju u razini ekspresije HSA-Mir-335 u odnosu na rezultate između smrznute svježe i krvnih uzoraka. Pregled

Osim toga, otkrili smo razinu ekspresije HSA-Mir-128B u 64 uzoraka GC krvi pomoću real-time PCR. Rezultati su pokazali da je u 26 slučajeva sa recidiva, 18 slučajeva (18/26, 69,2%) bile su velike izrazio HSA-Mir-128B; au 38 slučajeva bez recidiva, 27 slučajeva (27/38, 71.1%) su niske izrazio HSA-Mir-128B. FC vrijednost HSA-Mir-128B i HSA-Mir-335 bili su 1,647 i 3,589 u usporedbi recidiva s uzorcima jednokratnosti, odnosno (slika 4a). Također smo analizirali osjetljivost i specifičnost, HSA-Mir-335, HSA-Mir-128B i HSA-Mir-335 /128B (u kombinaciji sa Mir-335 i Mir-128B kao potpis) koji se temelji na stvarnom vremenu PCR podataka. Rezultati su pokazali da HSA-Mir-335 je više osjetljiv i specifičan, s AUC vrijednosti 0,88 od HSA-Mir-128B (AUC = 0,79) i HSA-Mir-335 /128B (AUC = 0,84) u klasificiranju recidiva i ne- uzorci recidiva (Slika 4b, tablica 3). pregled

HSA-mir-335 kao progresije bolesti Potpis predvidjeti recidiva rizik u GC pacijenti

74 GC pacijenti bili su podijeljeni u dvije skupine, uključujući 31 bolesnika s recidivom kao grupa i 43 bolesnika bez recidiva kao grupu. Pacijenata koji su doživjeli ponovnu pojavu GC imala značajno smanjenu medijan preživljenje ( P pregled i 0,001; Slika 5A). Otkrili smo razine ekspresije HSA-Mir-335 u svim 74 uzoraka GC. Značajna razlika je promatrana u dvije skupine koje predstavljaju velike izrazio HSA-Mir-335 skupnih i niske izrazio HSA-Mir-335 skupine kako slijedi: miR-335 (+) i Mir-375 (-). GC bolesnika (n = 35) sa Mir-335 (+) imalo je značajno smanjena medijan preživljavanja u usporedbi s onima (n = 39) sa Mir-375 (-) ( P pregled i 0,001; 5B). pregled

signalnog puta i Gene ontologije analiza prolaznosti HSA-Mir-335 ciljanog gena pregled

kako bi istražili mogući mehanizmi regulacije HSA-Mir-335 u procesu GC recidiva, mi koji se koriste bioinformatika baze podataka za odabir uvjerljive ciljeva ove Mirne. Ukupno 255 gena su predviđeni kao ciljnih gena HSA-Mir-335. Signalni put, analiza je pokazala da je većina ciljanih gena koji su regulirani HSA-Mir-335 su bili uključeni u istim putevima, kao što je p53, MAPK, TGF-β, Wnt, erbB, mTOR, Toll-like receptora, žarišna prianjanja ( tablica 4, Slika 6). Predložili smo da se ti više put prolazi promjene bi mogle biti uključene u kliničkim patoloških osobina i pacijenata ishod GC. U međuvremenu, koristili smo integrirani gena Ontologija baze podataka za obilježavanje molekularnu funkciju Mirne ciljanih gena. Rezultati su pokazali da geni regulirani HSA-Mir-335 je sudjelovao u većini važnih bioloških procesa povezana s rakom kod ljudi (Tablica 5). Pregled

Rasprava pregled

Ponavljanje je česta u GC bolesnika nakon operacije; Stoga je važno prepoznati slučajeve s visokim rizikom recidiva. Tradicionalna klinika patološki faktori su ponekad neadekvatna za predviđanje recidiva kod pojedinaca i mnogih istraživačkih skupina su pokušali identificirati biomarkera pomoću nove tehnologije koje bi mogle razlikovati ove slučajeve visokog rizika. Niz nedavnih istraživanja su zabilježila Mirni promjene koje su uključene u inicijaciju i progresiju raka kod ljudi. Mirna izraz profiliranje tumora kod ljudi identificirali izraz potpisa povezanih s dijagnoze, odmorišta, napredovanje, prognozu i odgovor na liječenje. pregled

U ovoj studiji analizirali smo slučajeve primarne GC kako bi se predvidjeti ponavljanje bolesti i definira ne ponavljaju slučajevima kao i oni bez GC najmanje godinu dana nakon kurativne resekcije. Mi identificirati HSA-Mir-335 kao uvjerljivoj prognozu potpisom GC temelju podataka iz microarray od 10 uzoraka GC kao trening set. Nadalje, ovjeren smo taj potpis na 64 ispitnih uzoraka s više od prosječno 85% osjetljivosti i specifičnosti. Opstanak analize rezultati su pokazali da bolesnici s visokim razinama ekspresije, HSA-Mir-335 je smanjila ukupnu stopu preživljavanja u odnosu na one s niskim razinama ekspresije HSA-Mir-335. Ovi rezultati pokazuju da je taj potpis imao potencijal da predvidi ponavljanje GC. Pregled

Microarray tehnologija je znatno razvio i postala sveobuhvatan i koristan način da nam pomoći da bolje razumije raka [22]. To je sada široko koristi za proučavanje funkcionalne uloge miRNAs u mnogim vrstama raka [23], s nekoliko značajnih Mirna učinaka na onkogena i tumor supresorski geni identificirani. Od 12 miRNAs identificiranih u ovoj studiji, HSA-Mir-373 je bio jedan od regulirano miRNAs u rekurentne grupi. To može biti onkogena funkcionira kroz dobro poznate p53 put koji je uključen u karcinogeneze [24]. Neki miRNAs, kao što su HSA-Mir-19a i HSA-Mir-32, nalaze se u raka povezane genomske regije, koji bi mogli biti uključeni u zloćudnih bolesti putem brisanja, pojačavanja ili epigenetičkim izmjena mehanizama [25]. Osim toga, HSA-Mir-429 su viša u ponavljanim slučajevima i grupirani na kromosomu 1, potvrđujući da su neki miRNAs kao što su HSA-Mir-200B grupirani s HSA-MIR-429 i mogućnosti da zajedno uređuju svoje ciljane gene [26 ]. pregled

do sada je Mirna označen u ovoj studiji se predvidjeti rizik od GC recidiva nisu dobro karakteriziran. HSA-Mir-335, koja je prepisana iz regije kromosoma genomske 7q32.2, objavljeno je na diferencijalnu izraženo u benignih i malignih tumora [27]. Važno je, također je pokazala da Mir-335 regulira RB1 i kontrole stanične proliferacije u p53 ovisan način [28]; sudjeluje u razvoju raka dojke [29]; regulira rast i invaziju malignih stanica [30]. Najnovija istraživanja navodi da Mir-335 može funkcionirati kao metastaza supresor u GC ciljajući Bcl-2 i SP1, a može se i dalje razvijati kao potencijalni prognostički faktor [31]. Da sumiramo stavove gore, funkcija Mir-335 bio je kontroverzna. Naši rezultati pokazuju da HSA-Mir-335 je viša u uzorcima GC recidiva i koji su uključeni u većini onkogena signalnih putova, kao što je p53, MAPK, TGF-β, Wnt, erbB, mTOR, Toll-like receptora, žarišna adhezije , Ovi višestruki signalni put prolazi promjene, posebno uključujući p53 puta, možda opravdano utjecati na klinički ishod uključujući GC recidiva rizika [32]. Iako je prognostički uloga HSA-Mir-335 kod raka želuca je poznato, naši rezultati su ohrabrujući. Pregled

Krv je najdostupniji uzorak u bolnicama. Klinički značaj identifikacije biomarkera koji bi se mogao lako otkrivene kao HSA-Mir-335 je očito. Osim toga, u arhivi parafin uklopljenih primjerci su također jedan od lako dostupnih materijala u bolnicama, koje su često vodi s dobro dokumentiranim kliničkopatološkim podataka. Oni predstavljaju odlične izvore za prognostički primjenu u istraživanjima i kliničkim studijama. miRNAs u rasponu veličina od 19-25 nt i zaštićene su RNA inducirana nijemi kompleks, koji ih mogu učiniti manje podložan propadanju RNA u odnosu na mRNA u tim tkivima [33]. Dakle, bili smo u mogućnosti otkriti Mirna izraz u parafin uklopljenih uzoraka i usmjerena na sustavnu analizu pomoću ovog potpisa za relevantne prognostičku vrijednost. Metoda klasifikacije PCR-based Stoga se čini, da nam pružiti određeni način, koristeći lako dostupne kliničke uzorke, predvidjeti ponavljanje bolesti pregled.

U sažetku, identificirali smo prognozu vezane Mirne koji može predvidjeti rizik od ponavljanja GC bolesnika. Kombinirajući ovaj potpis s konvencionalnim kliničko faktora, trebali bismo biti u mogućnosti predvidjeti ishod bolesti pacijenta točnije. Osim toga identifikacija bolesnika s visokim rizikom će dovesti do razmatranja dodatne terapijske intervencije i može na taj način obavijestiti liječnika o boljem follow-up program. Pregled

Izvori pregled

Zahvaljujemo dr Li Wang (National Institute of Environmental Health Sciences, USA) za uvid komentare i rukopis uređivanje. pregled

• PLoS ONE: Smanjena Izražavanje ARID1A gena povezana s lošom prognozom u Osnovnoj želučani Cancer
• PLoS ONE: klinički potencijal DNA metilacije u rak želuca: A Meta-Analysis