PLoS ONE identifikavimas HSA-miR-335 kaip prognostinio parašas Skrandžio Cancer

Anotacija

Fonas

Skrandžio vėžys (GC) yra vienas iš labiausiai paplitusių piktybinių navikų ir pagrindinė priežastis mirtis Kinijos vėžiu sergantiems pacientams. Pasikartojimas yra pagrindinis veiksnys, darantis įtaką gydymo nesėkmės ir po chirurginių rezekcijos žemo lygio 5 metų išgyvenamumas GC pacientams. Todėl identifikavimas biologinių žymenų su potencialu prognozuojant pasikartojimo rizika yra pagrindinė problema, kad GC pacientų prognozei.

Pacientai ir metodai

74 GC pacientai buvo atrinkti sisteminės analizės, kurią sudaro iš 31 pacientų, sergančių pasikartojimo ir 43 pacientų be pasikartojimo. Pirma, miRNAs mikrogardeliq ir bioinformatikos metodai buvo naudojami apibūdinti diferencialinės išreikštas miRNAs iš pirminių navikų mėginiuose. Po, mes panaudojome ROC būdą pasirinkti parašą su geriausia jautrumo ir specifiškumo. Galiausiai, mes patvirtinęs GC mėginių parašas (šaldytų šviežių ir kraujo mėginiai), naudojant kiekybine PGR.

Rezultatai

Mes nustatėme 12 diferencialinės miRNAs įskaitant 7 iki reguliuojama ir 5 žemyn reguliuojamų miRNAs į pasikartojimų grupės. Naudojant ROC metodą, mes ir toliau nustatyti HSA-mir-335 kaip pasirašymo pripažinti pasikartojimo ir ne pasikartojimo atvejus mokymo pavyzdžių. Be to, mes patvirtinti šį parašą, naudojant kiekybine PGR metodu 64 bandinių su nuosekliai rezultato mokymo rinkinys. Aukšto dažnio pasikartojimo ir vargšų išlikimo buvo pastebėtas GC atvejais su aukšto lygio HSA-miR-335 ( P
< 0,001). Be to, mes įvertino, kad HSA-Pasaulis-335 dalyvavo reguliuojant tikslines genus keliose onkogeniniam signalo kelius, pavyzdžiui, p53, MAPK, TGF-β, WNT, erbB, mTOR, Toll-tipo receptorių ir židinio sukibimas.

Išvada

Mūsų rezultatai rodo, kad HSA-Pasaulis-335 turi galimybę pripažinti pasikartojimo riziką ir yra susiję su GC pacientų prognozei

nurodomoji dalis:. Jonas Z Xiong Y, Xu W, Gao J, Cheng Y, Wang Z, ir kt. (2012) identifikavimas HSA-miR-335 kaip prognostinio parašas skrandžio vėžio. PLoS vieną iš 7 (7): e40037. Doi: 10,1371 /journal.pone.0040037

redaktorius: Alfons Navarro Barselonos universitetas, Ispanija

Įstojo: Vasario 21, 2012 m Priėmė: May 30, 2012 m Paskelbta liepos 3, 2012

Visos teisės saugomos: © 2012 Jonas et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Šie autoriai neturi paramą ar finansavimą pranešti

konkuruojančių interesų:.. autoriai paskelbė, kad konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Šiuo metu chirurgija vis dar yra pagrindinis variantas gydyti skrandžio vėžio (GC), tačiau net ir po atliekant gydomąjį rezekcija, maždaug 40-65% GC pacientų patirs ligos pasikartojimo galbūt apimantis vietinį atkryčio, pilvaplėvės platinimą ar hematogenous metastazių [1], [2]. Dėl šios priežasties, 5-metų išgyvenamumas GC pacientams buvo vis dar yra žemo lygio. Pagrindinis uždavinys, kaip pagerinti klinikinius rezultatus yra geriau suprasti molekulinius mechanizmus ir pripažinti patikimas parašus dėl GC prognozė.

Keletas rizikos veiksniai, įskaitant patologinę serosa valstybės, maržos statusą, naviko kraujagyslių tankio ir genų ekspresijos pokyčius, susijusius su pasikartojimo buvo pranešė, [3], [4]. Be to, keletas prognozavimo arba diagnostikos metodai buvo naudojami įvertinti pasikartojimo riziką remiantis genų ekspresijos arba klinikinių kintamųjų rinkinį [5] - [8]. Tačiau šie keli pastebėjimai, įskaitant keletą genų ar baltymų pakitimai gali trukdyti jų klinikinį taikymą. Patikimi ir patogūs molekuliniai žymenys klinikinių praktikų yra reikalingi GC prognozė.

neseniai atrasta ir miRNAs yra labai užkonservuoti į bestuburiai, stuburinių ir augalų genomų. Jie tarnauja kritines funkcijas keliose biologinių procesų [9] Įskaitant vystymosi laikas, raštas ir embriogenezės, diferenciacija, organogenezės ir apoptozės [10]. Atsižvelgiant į tai, jos daug esminės biologinės funkcijos, todėl nenuostabu, kad nenormalūs miRNAs išraiška bus ligos ir net vėžys [11].

miRNAs buvo pristatytas kaip veiksmingas potencialių biologinių žymenų atsekti audinių kilmę piktybinių navikų Nežinoma pagrindinis kilmė [12]; miRNAs ekspresijos profilius galime atspindėti vystymosi Lineage ir diferencijuotą būklę navikų [11]. Sisteminė analizė remiantis miRNAs stabilumą, taip pat optimizuota sąlygos išraiška analizė, naudojant formalinu fiksuotos parafiną įterptųjų ir kraujo mėginius buvo pranešta anksčiau [13] - [15], nušviečiant jų nenumatytą diagnostikos galimybes. Yra ribotas skaičius miRNAs [16] žmogaus genomo, kurie yra žinomi reguliuoti maždaug 30% genų [17]. Šie miRNAs atributai gali pateikti mums paprastas metodas prognozuoti pasikartojimo riziką vėžiu sergantiems pacientams.

Šiame tyrime mes nustatė Mirna (ŽSA-mir-335), turintis potencialą prognozuoti pasikartojimo riziką GC remiantis microarray ir klinikiniais duomenimis mažo dydžio mėginį iš Kinijos GC pacientams. Mūsų rezultatai parodė, kad HSA-Pasaulis-335 gali būti aktas, kaip klinikinės prognostinį parašo GC.

Metodai

klinikinius mėginius

Šis tyrimas buvo etikos komitetas patvirtino Wuhan General Hospital Guangzhou vadovavimo, PLA. Visi skrandžio vėžiu sergantys pacientai ir ne vėžiu sergantiems pacientams, kurių virškinimo sistemos ligos teikiamų raštišką informuoto sutikimo mūsų tyrime.

Pacientai, kuriems atliekama pašalintas skrandis potencialiai išgydomos GC tuo Wuhan General Hospital Guangzhou karinio vadovavimo buvo dalykai šiame tyrime. Tinkamumas įtraukti į šį tyrimą buvo įtraukti histologiškai patvirtinta adenokarcinoma skrandžio arba gastroezofaginio sankryžos. Visi pacientai gavo išsamius rezekcijų įskaitant, esant visiškam naviko pašalinimo su įtraukimo pločio neigiamų maržos ir pratęsė retroperitoninį limfadenektomija (D2 tipo) bandymas. Informacija apie clinicopathologic, gydomasis ir rezultatų rodiklių pacientų iš 2005 gegužės iki Vas 2012 buvo renkamas atgaline data. Vėžys sustojimo buvo atlikta pagal penktuose Amerikos Jungtinio komisijos Vėžys TNM kriterijus.

pasikartojimas buvo apibrėžiamas kaip bet koks vėžio pasikartojimo įskaitant limfmazgiuose, likutis skrandžio, vietos, pilvaplėvės ir hematogenous metastazių. Visi pacientai, kurie patyrė pasikartojimo vėžio buvo diagnozuota kliniškai ar radiografijos ir patvirtinta biopsija per viršutinės virškinimo trakto dalies endoskopu ar poodinės punkcijos. Radiografiniais standartas pasikartojimo diagnozę įtraukti CT ar MRT krūtinės, pilvo, dubens, galvos ir kaulų skenavimas, ar kitus diagnostinius tyrimus, kurie buvo naudojami tik ypatingomis aplinkybėmis. Visi mėginiai buvo imami iš chirurginio egzempliorių pacientams, sergantiems skrandžio adenokarcinoma ir visi pacientai davė raštišką sutikimą dėl šių audinių tyrimų tikslais. Mes atrinko (įskaitant sušaldytus šviežių ir kraujo mėginiai) nuo 74 pacientų su ir be GC pasikartojimo.

Mirna mikrogardeliq

Mirna Mikrogardelė analizė buvo atliekama kaip išsamiai aprašyta apie CapitalBio svetainėje ( http://www.capitalbio.com), taip pat atsižvelgiant į Hua anketa procedūros [18]. Trumpai tariant, 50-100 mikrogramų visos RNR buvo naudojama išgauti miRNAs naudojant Mirna izoliacija komplektas AM1560 (Ambion, JAV). Fluoresceino žymėto miRNAs buvo naudojami hibridizacijos Affymetrix Mirna Chip, kuriame 1075 zondai. Fluorescencijos signalas buvo nuskaityti GeneChip Scanner 3000 7G (Affymetrix, JAV). Pirminiai duomenys buvo normalizuotas ir analizuojami GeneChip komandų konsolės 1.1 programinę įrangą (Affymetrix, JAV).

RNR išskyrimo iš šaldytų šviežių ir kraujo mėginius

RNR buvo išskirta iš šaldytų šviežių GC audinių naudojant standartinę Trizol protokolas (Invitrogen, Karlovi Varai, CA, JAV). Kraujo mėginių, Mirna buvo paimti naudojant miRNease rinkinį (QIAGEN). Trumpai tariant, 700 pL QIAzol reagentu buvo įtraukta į 200 pL plazmos mėginyje, ir inkubuojami 5 min kambario temperatūroje. Tada, buvo įtraukta 140 mikrol, chloroformo, pavartomas 15 sek ir inkubuojami 3 min kambario temperatūroje. Tai buvo po kurio 14000 rpm centrifuguojant, esant 4 ° C temperatūroje 15 min. Viršutinė, vandeningos etapas buvo pašalintas ir 1,5 kartus didesnis už vidurkį tūrio papildomas 100% etanolio. Kiekvienas 700 pL mišinio buvo dedamas ant stulpelio ir centrifuguojamas 13000 rpm ir ties kambario temperatūroje 15 sek. Taip, 500 mikrol, buferio RPL buvo įtraukta į kolonėlę ir centrifuguojamas 13000 rpm ir ties kambario temperatūroje 2 min. Tada kolonėlė centrifuguojamas 13000 rpm ir ties kambario temperatūroje, kad jį išdžiūti. Toliau buvo eliuavimo žingsnis 20 įxL nukleaziniu be vandens. Išplautų RNR buvo laikomi -70 ° C.

Realaus laiko kiekybine PGR

Brandaus Mirna sekos buvo įsigytas iš Sanger instituto miRBase Sequence duomenų bazėje (http://microrna.sanger.ac .uk /sekas /). Kamieninių kilpa atvirkštinės transkripcijos (RT) pradmenys buvo sukurta pagal Chen [19]. RT reakcijos sąlygos naudojamas susijusioms inkubavimų, esant 16 ° C temperatūroje 30 min; 37 ° C temperatūroje 30 min, o po to 72 ° C temperatūroje 10 min. Šilumos dviračiu protokolas, skirtas PGR dalyvauja pradinį denaturavimo žingsnį ne mažesnis nei 95 ° C, 5 min, po to 40 ciklų, esant 95 ° C temperatūroje 30 S, 57 ° C temperatūroje 30 s ir 72 ° C temperatūroje 30 s. Lydytų kreivės kiekvieną PGR buvo kruopščiai analizuojamas, kad būtų nustatyti bet kokį nespecifinį amplifikacija. Kiekvieno Mirna išraiška buvo apskaičiuota naudojant 2 ^{-ΔΔ C
_{T formulę ir standartizuoti U6 snRNA išraiška [20].}}

be priežiūros algoritmas

SAM [21] buvo atlikti be priežiūros grupavimo skaičiavimą. Dėl reikšmės Apipjaustymas nulėmė Tuning parametro deltos pasirinktos vartotojui grindžiamas klaidinga teigiama norma ir atstovauja q vertė. Mes pasirinkome fold pokytis didesnis nei 2, ir q = 0, kaip atrankos kriterijus, diferencinė ekspresija miRNAs.

ROC ir Kaplano-Mejerio išgyvenimo kreivės analizė

ROC kreivė analizė buvo atlikta naudojant kad MedCalc programinės įrangos paketai (Pagal angliškai 8.2.1.0; Mariakerke, Belgija). AUC kreivės pateikė bendro veiklos diagnostinį testą priemonę. Iš Mirna signalo intensyvumo ir Ct reikšmė kiekvienos Mirna santykis buvo naudojami ROC apskaičiavimo pavyzdžius. Išgyvenimo analizė taip pat buvo vykdo MedCalc programinės įrangos paketo dalis.

Statistinė analizė

klinikiniai duomenys buvo analizuojami naudojant chi kvadrato testas. Kaupiamasis išlikimo kreivė buvo lyginamas pagal žurnalą rango testą. Dėl visų analizių, skirtumas su P
. ≪ 0,05 buvo laikomas statistiškai reikšmingas

Mirna Tikslinės Genų prognozavimas ir signalo kelią analizė

panaudojo Mirna tikslinio geno prognozavimo duomenų bazę TargetScan (http://www.targetscan.org) pasirinkti tikslai yra priimtini skirtumo išreiškė miRNAs. Integruotas genų ontologija duomenų molekulinės anotacija sistema (MAS3.0, http://www.capitalbio.com) buvo naudojamas tirti Mirna tikslinių genų ir jų įtraukimą į įvairių signalų kelius.

Rezultatai

Klinikiniai Charakteristikos GC pacientai

74 pacientai su /be pasikartojimo buvo atrinkti sisteminės analizės. 31 pacientai buvo pasikartojančių GC, kad buvo įrodyta, patologiškai ne Anastomoza svetainių per endoskopija biopsija. 43 pacientai be pasikartojimo buvo pasirinktas kaip kontrolinės grupės su degtukais seksu, amžiaus diagnostika, TNM sustojimo, gydymo ir susijusių limfinio mazgo (1 lentelė) skaičius.

Nebuvo jokio reikšmingo skirtumo sekso ( P
= 0,469), amžius ( P
= 0,502), naviko vietą ( P
= 0,299), diferencijavimas ( P
= 0,511) , Limfmazgių rezekcija ( P
= 0,217) ir statusas palaikomąja chemoterapija ( P
= 0,214). Nebuvo didelio skirtumo UICC etapas ( P
= 0,108) ir išlikimo /mirties santykis pažymėti (8/23 iš pasikartojimų grupės vs 34/9 ne pasikartojimų grupės P
< 0,001), vidutinis išlikimo laikas 18,9 mėnesių pasikartojimo vs 43.9 mėnesiams ne pasikartojimų grupės atitinkamai ( P
. < 0,001) (1 lentelė)

Mirna išraiška profiliai Associated su GC pasikartojimo

Mes naudojamas miRNAs mikrogardelių matuoti miRNAs raiškos lygį 10 GC mėginių su /be pasikartojimo (5/5) kaip mokymo rinkinys. Lyginant mirna išraiška tarp grupių, 7 iki reguliuojama ir 5 žemyn reguliuojamos miRNAs buvo nustatyta, kad buvo nustatytas statistiškai reikšmingas GC periodinio grupės (2 lentelė). Šie 12 miRNAs gali būti naudojama diskriminuoti GC su ir be pasikartojimo remiantis hierarchiniu klasterinės analizės (1 paveikslas).

HSA-Pasaulis-335 yra geriausias Parašas klasifikavimo GC su ir be pasikartojimo mokymo rinkinys

Mes naudojome ROC metodą analizuoti jautrumas ir specifiškumas kandidačių biologinių žymenų remiantis Mirna microarray duomenis. Gavome 2 miRNAs HSA-Pasaulis-335 ir HSA-Pasaulis-128B su geriausia jautrumo ir specifiškumo klasifikuojant GC mėginius su ir be pasikartojimo (2 pav, 3 lentelė). Kartu su Fc vertė (FC _{HSA-Pasaulis-335 = 4,675; FC HSA-Pasaulis-128B = 1,453) kiekvieno biologinis žymuo, mes pasirinkti HSA-mir-335 tolesniam tyrimo
patvirtinimas bandomuosiuose mėginiuose pasirašymas realaus laiko PGR}

Sąvoka lygio HSA-miR-335 buvo aptiktas realaus laiko PGR 64 testas GC mėginių, palyginti su suderintos gretimų audinių kaip kontroliuoti. Rezultatai parodė, kad 26 atvejais, kurių pasikartojimo, 21 bylos (21/26, 80,8%) buvo aukštos išreiškė HSA-miR-335; ir 38 atvejais be pasikartojimo, 29 bylos (29/38, 76,3%) buvo mažai išreikšti HSA-miR-335 (3 paveikslas). Tokie patys rezultatai buvo pastebėta kraujo mėginių, naudojant mišraus kraujo mėginį iš 20 ne vėžio pacientams, sergantiems virškinimo ligomis, kaip kontroliuoti: 26 atvejais, kurių pasikartojimo, 19 bylos (19/26, 73,1%) buvo aukštos išreiškė HSA-miR -335; ir 38 atvejais be pasikartojimo, 30 atvejų (30/38, 78,9%) buvo mažai išreikšti HSA-miR-335 (3 paveikslas). Buvo 11 atvejai (11/64, 17,2%) nesiderino į ekspresijos lygį HSA-miR-335 palyginimas tarp šaldytų šviežių ir kraujo mėginių rezultatus.

Be to, mes nustatėme, ekspresijos lygį HSA-miR-128B iš 64 GC kraujo mėginių, naudojant realaus laiko PGR. Rezultatai parodė, kad 26 atvejais, kurių pasikartojimo, 18 bylos (18/26, 69,2%) buvo aukštos išreiškė HSA-miR-128B; ir 38 atvejais be pasikartojimo, 27 bylos (27/38, 71,1%) buvo mažai išreikšti HSA-miR-128B. FC vertė HSA-miR-128B ir HSA-Pasaulis-335 buvo 1,647 ir 3,589, lyginant pasikartojimo su ne pasikartojimo mėginių, atitinkamai (4a pav.) Mes taip pat analizavo jautrumas ir specifiškumas HSA-miR-335, HSA-mir-128B ir HSA-mir-335 /128B (kartu su miR-335 ir miR-128B kaip parašu), remiantis realiojo laiko PGR duomenų. Rezultatai parodė, kad HSA-Pasaulis-335 buvo labiau jautrūs ir specifiški su AUC vertė 0,88 nei HSA-miR-128B (AUC = 0,79) ir HSA-miR-335 /128B (AUC = 0.84) klasifikuojant pasikartojimo ir ne- pasikartojimo mėginiai (4b paveikslas, 3 lentelė).

HSA-Pasaulis-335 kaip ligos progresavimo Parašas prognozuoti pasikartojimo rizika GC pacientai

74 GC pacientai buvo suskirstyti į dvi grupes, įskaitant 31 pacientai, sergantys pasikartos kaip grupės ir 43 pacientai be pasikartojimo kaip grupė. Pacientų, kurie patyrė GC pasikartojimo turėjo gerokai sumažintas vidutinis išgyvenamumas ( P
< 0,001; 5A pav.) Mes nustatėme, ekspresijos lygį HSA-miR-335 visų 74 GC pavyzdžius. Didelis skirtumas pastebėjo į dvi grupes, kurios yra aukštos išreikštas HSA-miR-335 grupės ir žemos-išreikštas HSA-miR-335 grupės taip: miR-335 (+) ir miR-375 (-). GC pacientai (n = 35) su miR-335 (+) buvo žymiai sumažintas, vidutinis išgyvenimo palyginti su tais, (n = 39) su miR-375 (-) ( P
< 0,001; Figūra 5B).

signalinio kelio ir Genų ontologija analizė HSA-Pasaulis-335 tikslinių genų

norint ištirti galimą reguliavimo mechanizmus HSA-miR-335 į GC pasikartojimo procesą, mes naudojamų bioinformatikos duomenų pasirinkti tikslai yra priimtini, šios Mirna. Nuo 255 genų viso buvo prognozuojama kaip tikslinės genų HSA-miR-335. Signalizacijos kelią analizė parodė, kad dauguma tikslinių genų, kurie buvo reguliuojami HSA-Pasaulis-335 buvo įtraukti į tų pačių kelius, pavyzdžiui, p53, MAPK, TGF-β, WNT, erbB, mTOR rinkliavų panašaus receptoriaus, židinio sukibimo ( 4 lentelė, 6 pav). Mes pasiūlėme, kad šie keli kelio metu pakitimai gali būti įtraukti į klinikinių patologinių funkcijų ir pacientų rezultatus GC. Tuo tarpu, mes naudojamas integruotas genas ontologijos duomenų bazę komentuoti molekulinę funkciją iš Mirna tikslinių genų. Rezultatai parodė, kad genai reguliuoja HSA-miR-335 dalyvavo dauguma svarbių biologinių procesas, susijęs su žmogaus vėžio (5 lentelė).

Diskusijos

pasikartojimas yra dažnos GC pacientams po operacijos; Todėl svarbu nustatyti atvejus, kai su aukšto pasikartojimo rizika. Tradicinė klinikos patologiniai veiksniai kartais nepakanka prognozavimas pasikartojimo asmenims ir daugelio mokslinių tyrimų grupių bandė nustatyti biologinius žymenis naudojant naujas technologijas, kurios galėtų atskirti šiuos didelės rizikos atvejais. Iš naujausių tyrimų skaičius užfiksavo Mirna pakeitimus, kurie yra susiję su inicijavimo ir progresavimo žmogaus vėžio. Mirna išraiška profiliavimas žmogaus navikų nustatė išraiška parašus, susijusius su diagnoze, stadija, progresavimo, prognozė ir atsaką į gydymą.

Šiame tyrime mes analizuojami pirminiai GC atvejais, siekiant prognozuoti ligos pasikartojimo ir apibrėžiamas ne pasikartojanti atvejais, kaip tie be GC mažiausiai vienerius metus po radikalių rezekcija. Mes nustatyti HSA-mir-335 kaip logiško prognozių pasirašymo GC remiantis mikrogardeliq duomenimis 10 GC pavyzdžių kaip mokymo rinkinys. Be to, mes patvirtinti šį parašą ant 64 bandinių, turinčių daugiau nei 85% jautrumo ir specifiškumo vidurkį. Išlikimo analizės rezultatai parodė, kad pacientams, sergantiems aukštos raiškos lygių HSA-miR-335 buvo sumažintas bendras išgyvenamumas, palyginti su žemos raiškos lygių HSA-miR-335. Šie rezultatai rodo, kad šis parašas turėjo galimybę prognozuoti pasikartojimo GC.

mikrogardeliq technologija sparčiai vystėsi ir tapo išsamus ir naudingas būdas padėti mums geriau supranta vėžio [22]. Ji dabar yra plačiai naudojami tyrimo funkcinius vaidmenis miRNAs įvairių tipų vėžiu [23], su keliais dideliais Mirna poveikį onkogenų bei navikų slopintuvas genų identifikuoti. Iš 12 miRNAs nustatytų šiame tyrime, HSA-Pasaulis-373 buvo vienas žemyn reguliuojama miRNAs į periodinio grupei. Tai gali būti onkogeno veikia per gerai žinomas p53 keliu, kuris yra įtrauktas į kancerogenezėje [24]. Kai miRNAs, pavyzdžiui, HSA-miR-19a ir HSA-miR-32, yra įsikūręs vėžį susijusios genomo regionų, kurie gali būti susiję su piktybinių navikų per ištrynimą, stiprinimas, arba epigenetinių modifikavimo mechanizmų [25]. Be to, HSA-Pasaulis-429 buvo iki-reguliuojami pasikartojančių atvejais ir susitelkę chromosomos 1, patvirtinantis, kad kai kurie miRNAs tokių kaip HSA-miR-200B yra susitelkę su HSA-miR-429 ir sugebėti bendradarbiauti reguliuoti savo tikslines genus [26 ].

iki šiol paskirta šiame tyrime Mirna prognozuoti GC pasikartojimo rizika nebuvo gerai charakterizuojamas. HSA-Pasaulis-335, kuris yra perrašoma iš genomo regione chromosomos 7q32.2, buvo pranešta, kad skirtumas išreikštas gerybinių ir piktybinių navikų [27]. Svarbu tai, kad ji taip pat parodė, kad Pasaulis-335 reglamentuoja RB1 ir kontroliuoja ląstelių proliferaciją į p53 priklausomu būdu [28]; dalyvauja krūties vėžio [29] plėtrai; reguliuoja augimą ir invazija piktybinių ląstelių [30]. Naujausių tyrimų duomenimis, Pasaulis-335, gali veikti kaip metastazių slopintuvas GC nukreipiant BCL-2 ir SP1, ir galėtų būti toliau plėtojama kaip galimą prognostinis faktorius [31]. Apibendrinant aukščiau pateiktas nuomones, miR-335 funkcijos buvo prieštaringas. Mūsų rezultatai rodo, kad HSA-Pasaulis-335 buvo reguliuojama GC pasikartojimo mėginių ir dalyvauja dauguma onkogeniniam signalizacijos būdus, pavyzdžiui, p53, MAPK, TGF-β, WNT, erbB, mTOR, Toll-tipo receptorių, židinio sukibimo , Šie keli signalo kelio metu pakeitimai, ypač įskaitant p53 keliu, gali pagrįstai įtakos klinikinei baigčiai įskaitant GC atsinaujinimo riziką [32]. Nors prognozės vaidmuo HSA-miR-335 skrandžio vėžys yra nežinoma, mūsų išvados teikia vilčių.

Kraujo yra labiausiai prieinama pavyzdys ligoninėse. Klinikinė reikšmė nustatant biologinius žymenis, kurie gali būti lengvai aptikti tiesiog kaip HSA-miR-335 yra žinoma. Be to, archyve parafino įterptųjų pavyzdžiai taip pat yra vienas iš lengvai prieinamų medžiagų ligoninėse, kurie dažnai laikomi gerai dokumentuotos klinikos duomenimis. Jie atstovauja puikių šaltinių prognostinį taikymo tiek fundamentiniams tyrimams ir klinikinius tyrimus. miRNAs skirtingo dydžio 19-25 NT ir jie būtų apsaugoti taikant RNR sukeltas triukšmo slopinimo kompleksas, galinčių padaryti juos mažiau jautrūs RNR degradacija, palyginti su mRNR šių audinių [33]. Taigi, mes galėjome aptikti Mirna išraišką parafino įterptųjų mėginių ir orientuota į sisteminę analizę, naudojant šį parašą atitinkamos prognostinė vertė. Todėl PGR pagrįstas klasifikavimas metodas, atrodo, kad mums taip, naudojant lengvai prieinamas klinikiniai mėginiai, prognozuoti ligos pasikartojimo.

Apibendrinant, mes nustatėme tam prognozė susijusių Mirna, kuri gali nuspėti pasikartojimo riziką GC pacientams. Derinant šį parašą su įprastiniais clinicopathologic veiksnių, turėtume sugebėti prognozuoti paciento ligos baigtį tiksliau. Papildomai didelės rizikos pacientams, identifikavimo lemtų papildomą terapinį intervencijos svarstyti ir todėl gali informuoti apie geresnį tolesnių programos gydytoją.

Padėka

Mes dėkojame dr Li Wang (nacionalinis institutas aplinkos sveikatos mokslų, JAV) įžvalgos komentarus ir rankraščių redagavimas.

• PLoS ONE: sumažėjęs išraiška ARID1A genas yra siejamas su prastomis prognoze pirminis navikas
• PLoS ONE: Klinikinis potencialas DNR metilinimas skrandžio vėžiu: metaanalizė