Ba yra pranešta onkogeno ir naviko slopintuvas skrandžio vėžio. Čia mes įvertinta, ar PBH nurodomoji dalis:. Leal MF Cirilo LDR, Mazzotti TKF , CALCAGNO DQ, Wisnieski F Demachki S et al., (2014) Prohibitin išraiška dereguliavimo skrandžio vėžys yra susijęs su 3 'neišverstų regione 1630 C > T polimorfizmo ir kopijų skaičiaus kitimas. PLoS ONE 9 (5): e98583. Doi: 10,1371 /journal.pone.0098583 redaktorius: Amanda Ewart Toland, Ohajo valstijos universiteto medicinos centras, Jungtinės Amerikos Valstijos Įstojo: Vasario 17, 2014 m Priėmė: Gegužės 5, 2014 m Paskelbta: Gegužės 30, 2014 Visos teisės saugomos: © 2014 Leal, et al. Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos Finansavimas:. Šis tyrimas parėmė Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de NIVEL Superior (CAPESP), Conselho Nacional de Header Científico e TECNOLOGICO (CNPq; RC, MOK ir RRB) ir Fundação de Amparo à Pesquisa padaryti Estado de São Paulo (FAPESP; MFL, PDRC ir DQC ), dotacijos ir stipendijų apdovanojimų. Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį konkuruojančių interesų. RC yra akademinis redaktorius PLoS ONE. Kiti autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja už juos. Tai nekeičia autorių laikytis PLoS ONE Redakcijos politikos ir kriterijų. Skrandžio vėžys (GC) yra ketvirtoji dažniausia vėžio ir antroji pagrindinė priežastis, dėl vėžio mirčių visame pasaulyje [1]. Nepaisant didelių Išankstiniai GC tyrimo, molekulinės pakitimai dalyvauja skrandžio kancerogenezėje lieka nežinoma. 17 chromosomos yra vienas iš labiausiai paplitusių chromosomų eksponuoti skaitiniai aberacijas GC (žr apžvalga [2]). Mūsų grupė jau anksčiau pranešė, kad 17 chromosomos Aneuploidijos buvimą, tiek pelną ir nuostolius, GC asmenims Šiaurės Brazilijoje [3], [4], [5], [6] ir visose GC ląstelių linijas nustatoma pagal neoplasias šiame gyventojų [7], [8]. Todėl šis chromosoma gali būti svarbius genus skrandžio kancerogenezėje. prohibitin-1 ( Ba Ba, atrodo, vaidina svarbų vaidmenį įvairių tipų vėžio vystymąsi. Raiškos iš PHB buvo pastebėta gimdos kaklelio vėžio, stemplės, krūties, plaučių, šlapimo pūslės, skydliaukės, kiaušidžių ir prostatos. Priešingai, sumažino PHB išraiška buvo pastebėta gliomose ir somatinių mutacijų, PBH ir PHB vaidmuo skrandžio kancerogenezėje nebuvo visiškai aiški. Kai ankstesni tyrimai aprašyti padidėjęs PHB išraišką GC pavyzdžių [15], [16], [17], [18] ir GC pacientų serume [19]. Tačiau kiti tyrimai pranešė, PHB down-regulation šiame vėžio tipui [20], [21]. Iš molekulinius mechanizmus, dalyvaujančių transkripcijos reguliavimo tyrimas, Ba Šiame tyrime mes pirmą kartą įvertino mRNR ir baltymų ekspresija PHB GC ir suderinti ne navikinių skrandžio audinių pavyzdžius. Be to, galimas sąsajas tarp , buvo tiriama PBH parsisiųsti ir klinikos ypatumai. Kadangi PHB Audinių mėginiai keturiasdešimt aštuoni poros GC mėginių ir atitinkami ne navikiniai skrandžio audinio mėginiai (> 5 cm nuo naviko krašto) buvo naudojamas įvertinti Ba Visi skrandžio mėginius buvo gautas iš pacientų, kuriems buvo atlikta pašalintas skrandis GC ne João de Barros Barreto universitetinės ligoninės (HUJBB) Šiaurės Brazilijoje. Visi pacientai turėjo neigiamų istorijų poveikio arba chemoterapija ar radioterapija prieš operaciją, ir nebuvo bendro įvykis kitų diagnozuojamų vėžio. Parašė informuotas sutikimas su patvirtinimo etikos komiteto HUJBB buvo gautas. Dalis kiekvieno išpjaustytų auglio mėginį buvo formalinu fiksuotų ir parafino įterptųjų (FFPE). Skyriai FFPE audinio buvo tamsintas hematoksilinu-eozinu už histologinio vertinimo arba naudojami imunohistocheminis (IHC) analizė. Be to, porcijos kiekvienos naviko ir suporuoti ne neoplastinių audinio pavyzdys buvo spragtelėjimu, užšaldomos skystame azoto ir saugomi -80 ° C temperatūroje, kol nukleino rūgšties gryninimo. Visi mėginių buvo klasifikuojami pagal Lauren [22], ir augliai buvo pastatytas pagal TNM sustojimo kriterijus [23]. DNR ir iRNR valymo viso DNR ir iRNR buvo vienu metu izoliuotas nuo skrandžio audinių mėginių, naudojant AllPrep DNR /RNR /baltymų Kit (Qiagen, Vokietija) pagal gamintojo instrukcijas. DNR ir RNR koncentracija ir kokybė buvo nustatoma naudojant NanoDrop spektrofotometru (Kisker, Vokietija), o RNR vientisumas nulėmė gelyje. Ba parafino skyriai buvo atliktas IHC , Naviko audinio skyriai (3 ar 4 mm storio) buvo deparaffinized į ksileno ir rehidrataciją diferencijuotai etanolio serijos. Epitopas paieška buvo atlikta citrato buferio, pH 6,0, drėgnoje šilumos greitpuodyje. Kitas, audinių dalys buvo inkubuojamos su pirminės pelės monokloninis antikūnas prieš PHB (II-14-10, skiedimo 1:100; ThermoFisher Mokslo, JAV). Sklypai reaktyvumas buvo ryškinamos naudojant SuperPicture Polymer aptikimo rinkinį (Invitrogen, JAV). Skaidrės buvo peržiūrėtas šviesos mikroskopijos naudojant "Nikon" Eclipse E600 mikroskopu (Nikon, JAV) įrengta skaitmeninio Nikon "DSM1200F kameros (Nikon, JAV). Ne tamsintas regionas (baltas regionas) buvo atrinkti ir nustatyti kaip foną. Bet dažymo buvo laikomas teigiamas rezultatas, nepriklausomai nuo to, intensyvumo. Neigiama kontrolė, kurioje pirminis antikūnas buvo pakeičiami 5% galvijų serumo albumino (BSA) tirpalo fosfato buferio druskų tirpalo (PBS), buvo įtrauktas į visų serijų, ir profiliai iš sveiko žmogaus prostatos audinio buvo naudojami kaip teigiamas kontroles. PHB Jei įvertinti kopijos numeris variantus (CNV), The qPCR procedūra buvo atliekama naudojant kiekybinius TaqMan CNV tyrimai (Life Technologies ", JAV) už PHB Ba DNR iš ne navikinių mėginių buvo naudojamas PHB. Ba alelio konkreti išraiška buvo pirmasis lemia sekos. Dvidešimt iki 40 ng DNR arba kDNR buvo naudojamas kaip PGR amplifikacijos šabloną su pradmenų, naudojamų PHB Alelių ekspresijos lygis buvo nustatomas naudojant PeakPicker programą [25]. Programinė įranga buvo naudojama pirmiausia atlikti normalizavimo žingsnį, kuriame SNP alelis aukštis buvo palyginti su etaloninių smailių aukščio supančių sekas,. Mes ribotas šį normalizavimo žingsnį per 21-šarmų lange. Verčių santykis daugiau nei 1 buvo pertvarkyta į 1 /(santykis) transformuoti visas reikšmes į 0-1 skalėje, tada vertės buvo priderintas prie didžiausio intensyvumo rodiklių iš informacinės DNR mėginio heterozigotinės už rs6917 polimorfizmo vidurkio. Genomo DNR iš heterozigotinės (n = 3) ir homozigotine mėginiai (n = 3, genotipui CK, n = 2, genotipui TT) buvo naudojamas patvirtinti analizę ir patvirtinti alelių santykį 50:50 ir 0:100, atitinkamai. Be to, kDNR iš audinių mėginių (navikinės ir ne navikinės egzemplioriai) iš dviejų dalykų homozigotinių už nepilnametį alelio į rs6917 polimorfizmo taip pat buvo naudojamas kaip kontrolės. alelio konkretus Ba heterozigotinės kDNR mėginių, alelių santykis. ≪ 0,8 ar > 1.2. Buvo laikomi rodo alelio konkrečių raiškos Statistinė analizė iRNR ekspresijos analizės, mes pirmą kartą įvertino prielaidą, kad duomenys buvo normalus pasiskirstymas naudojant Šapiro-Wilk normalios testą nustatyti atitinkamus testus vėlesnių statistinių palyginimų. PHB Rezultatai Ba PHB 1 lentelė rodo tarp asociacijos PHB Sumažintas PHB Ba reaktyvumas skrandžio navikai Baltymai imunodažymu buvo stebimas visų navikų mėginiuose įvertino IHC (2 lentelė). Visais atvejais, PHB reaktyvumas buvo aptikta neoplastinių ir ne-neoplastinių ląstelių, įskaitant žarnyno metaplastic ir uždegiminių ląstelių (pav 2A-H). PHB pirmiausia buvo išreikštas citoplazmoje. Dažymo intensyvumas ir imunoreaktyviųjų ląstelių svyravo tarp tirtų atvejų (2 lentelė), procentinė dalis. Mėginiai pristatantys. ≪ 80% vėžinių ląstelių su PHB reaktyvumas buvo mažiau iRNR raiška ( P PHB Ba Ba mes taip pat tyrė, ar nepilnametis alelio rs6917 buvimas buvo susijęs su genų ekspresijos dereguliavimo GC pacientams. Mūsų mėginio, 11 48 pacientų (22,9%) buvo heterozigotinės ir 2 pacientams (4,17%) buvo homozigotiškas už nepilnametį alelio į rs6917 polimorfizmo. Visi mėginiai su T alelio pateikti 2 kopijas PHB Viena pora heterozigotinės mėginių (auglys ir ne auglys) nebuvo naudojamas alelio-konkretizacija analizės. buvo aptikta koreliacija tarp alelių santykis rs6917 polimorfizmo nustatyto eiliškumo ir TaqMan tyrime ( P Diskusijos Ba atrodo būtini ląstelių homeostazę. Naujausi tyrimai parodė, kad PHB gali veikti kaip pro tumorogeniškas ir anti-tumorogeniškas veiksnys kelių tipų ląstelių (žr peržiūrą [10]). Šioje studijoje, baltymų ir iRNR raiška profiliai PHB pristatė nevienalytė modelis tarp navikų mėginiuose. Nors neradome reikšmingo skirtumo tarp GC ir suderinti ne navikinių mėginių, mes nustatėme, kad iRNR lygis buvo sumažintas 1,5 karto per 45,5% GC mėginių ir padidėjo 20,5% navikų. Sumažintas iRNR raiška buvo iš dalies dėl to, retesnio vėžinių ląstelių keliančių PHB reaktyvumas, kuris išryškina tarp naviko ląstelių klonų įvairiapusiškumą. Liu et al., [21] aprašyta sumažintą iRNR ekspresiją keturių skrandžio navikų, lyginant su jų atitinkamų normaliuose audiniuose, kuris iš dalies patvirtina mūsų rezultatus. Parama anti-tumorogeniškas vaidmenį, PHB blokai atvykti į S fazę [27]. Be to, laukinio tipo rs6917 Ba mūsų žiniomis, keli tyrimai įvertino galimą ryšį tarp Ba Mūsų mėginiai, labiausiai heterozigotinės pacientams pasireiškė padidėjo išraiška T alelio, palyginti su C alelio. Santykines mRNR lygių dviejų alelių skirtumas gali būti susiję su skirtingomis transkripcijos arba iRNR stabilumo rezultatas, ir jie rodo, kad šis polimorfizmas kelia cis- galima poveikis Ba Tačiau ankstesni proteominiai tyrimai pranešė PHB ląstelę skrandžio navikų [15], [16], [17] , Be to, Kang et al. [18] pranešė apie PHB baltymų ir iRNR raiška GC (palyginti su gretimų normaliomis skrandžio audinių) Azijos asmenims. Mūsų mėginio, 20,5% navikų taip pat pristatė padidėjo PHB Kang et al., [18], pranešė, kad PHB baltymų ir iRNR raiška skiriasi nuo vidutinio ir prastai diferencijuotai GC ir tik menkai diferencijuotų navikų šio PHB raiškos palyginti su ne navikinių pavyzdžius. Mūsų mėginio, keli augliai buvo klasifikuojami pagal diferenciacijos laipsnį. Tačiau mes nustatėme, kad abu prastai ir vidutiniškai diferencijuoti navikai pristatė sumažintas PHB Šiame tyrime mes nustatėme, kad 34,2% navikų įgijo kopijas PHB ir , PBH Pagrindinis apribojimas Šiame tyrime yra santykinai mažas imties dydis. Todėl, kai statistinė analizė pristatė sumažinti galią aptikti reikšmingų skirtumų tarp grupių tikriausiai dėl didelio heterogeniškumo tarp mėginių. Todėl klaidingai neigiami rezultatai galėjo įvykti. Daugiau vertinimai vis dar reikia įvertinti vaidmenį, Ba Taigi, tiek žemyn reguliavimas ir up-reguliavimo PHB autoriai dėkingi Sueli Nonogaki Adolfo Lutz (São Paulo, SP, Brazilija) už techninę paramą imunohistocheminis analizuoja.
kopijuoti numeris ir rs6917 polimorfizmas įtakos jo išraišką skrandžio vėžio. Žemyn reguliavimą ir up-reguliavimo, PBH
nepastebėta vertinamų navikų. Sumažintas išraiška buvo susijęs su naviko dedifferentiation ir vėžio pradžios. T alelis rs6917 polimorfizmo buvo susijęs su sumažėjusiu PHB
mRNR lygiais. Be to, iki-reguliavimas, PBH
pasirodė reglamentuoja papildomų genų kopijų naudos. Taigi, , PBH
kopijuoti numerį variacijos ir diferencinė išraiška rs6917 polimorfizmo gali vaidinti svarbų vaidmenį, Ba
transkripcijos reguliavimo
Įvadas
) genų žemėlapiai į chromosomų 17q21 lokuso. Šis genas koduoja visur, evoliuciškai konservatyvius baltymo, kuris randamas įvairių organizmų, įskaitant bakterijų, augalų, mielės, pirmuonių ir žinduolių [9]. PHB pradžių buvo manoma, kad vaidinti pagrindinį vaidmenį ląstelių ciklo progresavimo slopinimas. Daugiau neseniai, PHB buvo apibūdinamas kaip šaperono dalyvauja mitochondrijų baltymų stabilizavimo; Taigi, Ba buvo susijęs keliais mobiliojo ryšio procesų, įskaitant ginklų neplatinimo, apoptozės ir genų transkripcijos [10] Reglamentas.
buvo aptikta pavienių krūties vėžio [9]. Be to, funkcinis pavienių nukleotidų polimorfizmo (SNP) į PHB
genas, keičiant citozino į timiną 1630 pozicijos 3 'UTR (rs6917), sukuria variantą, kad trūksta antiproliferaciniu aktyvumu [11] , [12], o vėliau gali padidinti piktybinės augimo riziką. T alelis šio SNP buvo susijęs su padidėjusia rizika susirgti krūties vėžiu [13] ir melanomos [14]. Todėl PHB vėžio platinimo ir /ar slopinimo vaidmuo išlieka prieštaringas.
gali suteikti naujų įžvalgų į savo vaidmenį GC ir pagalbos naujų vėžio gydymo būdų kūrimą.
genas yra chromosomų regione dažnai dalyvauja skaitinių aberacijas GC [2], taip pat įvertintas PBH
kopijuoti skaičių per navikų mėginiuose. Be to, alelio specifinė išraiška Ba
mRNR buvo įvertintas ištirti santykinį transkripciją kiekvieno alelio heterozigotinių dalykų su rs6917 polimorfizmo kaip galimą mechanizmą dalyvauja Ba pervežimas reglamentą. Mūsų žiniomis, nė Ankstesnis tyrimas įvertino , PBH
kopijuoti skaičius ir alelio konkreti išraiška yra navikų mėginiuose.
Medžiagos ir metodai
iRNR raiška ir SNP rs6917 genotipą. 38 iš šių GC mėginių, PBH
kopijuoti skaičius taip pat buvo įvertintas. PHB reaktyvumas buvo įvertintas 12 GC egzempliorių.
Ba genų ekspresijos
išraiška buvo įvertintas atvirkštinės transkripcijos kiekybinis polimerazės grandininė reakcija (AT-qPCR). Pirma, papildoma DNR (kDNR) buvo susintetintas naudojant didelės talpos kDNR Archyvas komplektas (taikoma BIOSYSTEMS, Lenkija) pagal gamintojo protokolą. Realaus laiko AT-qPCR analizė atlikta naudojant QuantiFast SYBR Green Master Mix (Qiagen, vokiečių) ant 7500 Fast realiojo laiko PGR aparato (Applied Biosystems, JAV). Šie gruntai (150 nm kiekvienas) buvo skirta AT-qPCR amplifikacijos: Ba
F5'-GTGTGGTTGGGGAATTCATGTGG-3 "ir R5'-CAGGCCAAACTTGCCAATGGAC-3"; ACTB
F5'-AGAAAATCTGGCACCACA-3 "ir R5'-AGAGGCGTACAGGGATAG-3". Visi iš reakcijas buvo pakartotas tris kartus tiek tikslinio geno ir vidaus kontrolės ( ACTB
). PHB
išraiška buvo normalizuotas ACTB
išraiška. MRNR ekspresijos gausa buvo pakoreguota stiprinimo efektyvumą ( Ba
= 99% ACTB
= 102%) [24]. Ne neoplazminė skrandžio audinio mėginys buvo paskirta kaip ir kiekvieno prijungto naviko apskaičiuoti santykinę kiekybiškai (RQ) [24] kalibratorių.
Ba baltymo ekspresija
Kopijuoti Taškų
genas (Hs00178432_cn) ir vidaus kontrolės RNAse P
(.403.326). Multiplex qPCR reakcijos buvo atliktas keturiais egzemplioriais su gDNA pagal gamintojo protokolą ir dviračių sąlygas tam 7500 Fast realiojo laiko PGR aparato (Life technologies ", JAV). Santykinis kopija skaičius kiekviename mėginyje buvo įvertintas naudojant Kopijuoti Caller Software v1.0 (Life technologies ", JAV). Komercinės žmogaus gDNAs (G1471 ir G1521; PROMEGA, JAV) buvo naudojami kalibruojant
genotipo
genotipo. Dalykai buvo genotipą už rs6917 polimorfizmo naudojant Custom TaqMan SNP zondai ir gruntai (Applied Biosystems, Foster City, CA). Šie gruntai ir MGB zondai buvo skirta alelių diskriminacijos: gruntai F5'-TTGGTCCCTCTCAGATACCCA-3 "ir R5'-CCGTGAGAAGGGCAGTCTCT-3"; FAM žymėto zondas 5'-CTGCCAAAGACGTGT-3 "; ir nepilnametis alelis VIC žymėto zondą 5'-CTGCCAAAGATGTGT-3 ".
alelio konkreti išraiška
genotipavimo. Prieš sekos, PGR produktai buvo atskirtos naudojant 2% agarozės gelyje elektroforezės būdu, ir specifinėje juostoje, buvo ekstrahuojamas ir išgrynintas. Sekos buvo atlikta naudojant priekį gruntas naudojamas PGR amplifikacijos ir BigDye Terminatorius v3.1 ciklas eilės nustatymas Kit (Applied Biosystems, JAV). Sekos produktai buvo atskirta naudojant ABI 3500 Genetinis analizatorius (Taikomoji BIOSYSTEMS, JAV). Kai mėginiai buvo analizuojami bent du kartus, įskaitant skirtingų RT-projekto užbaigimo ir sekos tyrimai.
sąvoka taip pat buvo įvertintas heterozigotinių mėginių RT-qPCR, kaip aprašyta anksčiau [26]. Naudojant Pasirinktinis TaqMan SNP genotipo nustatymo tyrimai dėl Ba
genotipo, mes generuoja linijinę regresinę kreivę log10 fluorescencijos intensyvumas vs
log10 alelių santykiu grindžiamą serijos praskiesti CC ir TT genotipą genomikos DNR iš kontrolinių mėginių (mėginius iš dviejų homozigotinių asmenų) keliose santykis (CC: TT 08:01, 04:01, 02:01, 01:01, 01:02, 01:04, 01:08) RT -qPCR (1A pav.) Alelių santykis genų ekspresijos buvo ekstrapoliuoti pagal iš FAM log10 ašyje: VIC intensyvumo ant standartinės kreivės. ROX (vidaus atskaitos dažų) ir nespecifinis FAM ir VIC fluorescencija buvo normalizuotas visų analizių. Visi reakcijų buvo atliekami dviem egzemplioriais
iRNR koncentracija paprastai platinami ir buvo pertvarkyta (Z-balas) analizei. Pastabų > 2 ar < -2 buvo laikomos išsiskiriančiomis ir pašalinti iš analizės. Suporuotų T-testas buvo atliktas palyginti vidurkis PHB
išraiška tarp ne navikinių ir navikų mėginiuose. T-testas nepriklausomoms pavyzdžius ir vieną pusę ANOVA po to žaidimai-Howell post hoc testas buvo naudojamas įvertinti galimus ryšius tarp PHB
išraiška ir klinikos ypatumai, baltymų reaktyvumas, genų kopijų skaičiaus ir genotipas , Chi-kvadrato testas ar tiksli Fišerio testas buvo naudojamas įvertinti tarp santykių, PBH
kopijuoti numerį ir reaktyvumas ir klinikos veiksnius. Pearsono koreliacijos buvo naudojamas įvertinti galimą ryšį tarp sekos ir TaqMan bandinyje alelio-konkreti išraiška analizė. Iš viso analizių P
. ≪ 0,05 buvo laikomas reikšminga
iRNR raiška skrandžio navikų
išraiška nesiskyrė navikinių ir suderintų ne navikinių skrandžio mėginius (0,173 ± 0.255, vs pervežimas 0.227 ± 0.297 P
= 0,149). Tačiau iRNR koncentracija sumažėjo bent 1,5 karto 20 (45,5%) iš GC mėginių ir padidėjo 9 (20,5%), lyginant su suporuotas ne navikinių skrandžio audinių pavyzdžius.
išraiška ir klinikos ypatumai, taip pat baltymų reaktyvumas, rs6917 genotipas ir genų kopijos numeris. Prastai diferencijuotos navikai pristatė sumažintas PHB
išraiška, palyginti su vidutiniškai diferencijuoti navikai ( P
= 0,029; 1 lentelė). Tačiau tiek blogai diferencijuota GC (0,025 ± 0,022, vs
0,239 ± 0,303; P
< 0,001, ANOVA, po kurio Žaidimai-Howell post-hoc testas) ir vidutiniškai diferencijuoti GC (0,057 ± 0,051, vs
0,239 ± 0,303; P
< 0,001, ANOVA po žaidynių-Howell post-hoc testas) pristatė sumažintas , palyginti su ne PHB
išraiška navikiniai skrandžio audinio mėginiai
išraiška buvo susijęs su mažesniu invazijos ( p
= 0,002; 1 lentelė). ir limfmazgių metastazių nėra ( P
= 0,040; 1 lentelė). Be to, anksti GC pristatė sumažintas PHB
išraiška, lyginant su pažangiomis GC ( P
= 0,002; 1 lentelė). Be to, tik anksti GC pristatė ženkliai sumažinti, Ba
mRNR lygių lyginant su ne navikinių mėginių (0,044 ± 0,027 vs
0,239 ± 0,303, P
< 0.001, ANOVA, po kurio Žaidimai-Howell post-hoc testą).
= 0,036, 1 lentelė)
Kopijuoti Taškų skrandžio navikų
buvo papildyta 13 iš 38 (34,2%) navikų, įskaitant 2 mėginiuose su 4 egzemplioriais. Nėra vėžinių pristatė PHB
ištrynimo. Įdomu tai, kad po 3 mėginius, kad pateiktos išskirčių vertes, Ba
iRNR išraiškos taip pat pristatė genų amplifikacija. Todėl, kai Išskirties vertės buvo įtraukti į analizę PHB
išraiška buvo didesnis mėginių geno nei tiems, kurie neturi geno amplifikacijos (mediana ± interkvartilinis diapazonas: 0,344 ± 0,335, vs
0,047 ± 0,07 P
= 0,003, neparametriniai Mann-Whitney testas; 3 pav.) PHB
pelnas buvo susijęs su pabaigoje prasidėję GC palyginti su pradžioje prasidėję GC ( P
= 0,022; 2 lentelė). Nerastas ryšys tarp PBH
kopijų skaičiaus ir baltymų reaktyvumas ar kitų klinikos savybių (3 lentelė).
alelio konkreti išraiška
geno. Iš T alelio į rs6917 polimorfizmo buvimas buvo susijęs su sumažinti PHB
išraiška GC ( P
< 0,001; 1 lentelė; 1B pav) ir ne navikinių mėginių (vidutinis ± SD:. vs
0,045 ± 0,043 0,302 ± 0,325; p
< 0,001; 1B pav)
= 0,003; r = 0,627). Iki sekos, maždaug 50% atvejų pateikti diferencialo alelių išraišką (1c pav.) Tačiau TaqMan tyrimas parodė, kad T ir C aleliai pateikti diferencialo alelių išraišką daugumai pacientų (1d pav). Skirtumo diapazonas laipsnį tarp dviejų alelių svyravo tarp individų išraiška. T C Alelių išraiška santykis buvo panašus daugelyje porų naviko ir ne-navikų mėginiuose. Tik vienas pacientas pristatė aukštąjį C /T santykį tiek naviko ir ne navikinių mėginius abiejų tyrimų. Daugeliu atvejų, mažesnis, C /T santykis buvo aptiktas nepriklausomai taikoma metodika (skaičiais 1C ir 1D). neušfiksuota ryšys tarp diferencinę alelių saviraiškos ir amžiaus pradžios ar bet kurios kitos klinikos kintamasis.
vien 3'UTR gali slopinti ląstelinį ciklą [11], [28] ir naviko augimą [12], taip pat sumažinti ląstelių mobilumą [29]. Be to, PHB vaidina svarbų vaidmenį palaikant normalų mitochondrijų funkcijos ir morfologijos [30]. Buvo pasiūlyta, kad nuostolis mitochondrijų PHB išraiškos (citoplazmos lokalizacija, kaip pastebėjo mūsų mėginių) gali sukelti pagreitinto proteolizė membranų baltymų ir pabloginti funkciją mitochondrijų kvėpavimo grandinės [10]. Mūsų Ankstesnis PROTEOMIKOS tyrimas parodė, kad keli baltymai dalyvauja energijos apykaitos kelius (mitochondrijų disfunkciją, piruvato apykaitą, oksidacinio fosforilinimo, citratas ratas, glikolizės /gliukoneogenezėje) buvo liberalizuotas [31] ir pasiūlė, kad garsūs mitochondrijų funkcijos gali būti keičiamos, perkeliant energijos gamybą GC ląstelių ir tai rodo, Warburg poveikį [32].
mRNR lygių ir rs6917 polimorfizmo. Viename tyrime, Tang ir kt. nesilaikė didelę asociaciją tarp rs6917 polimorfizmo ir iRNR išraiškos limfoblastoidinėse ląstelių linijas įtraukti į HapMap duomenų [33]. Tačiau, šie autoriai pranešė, kad T alelis buvo susijęs su padidėjusia krūties vėžio rizika. Šiame tyrime, mes parodė, kad T alelio į rs6917 polimorfizmo buvimas buvo susijęs su sumažėjusiu PHB
išraiška į ne-neoplastinių ir neoplastinių skrandžio ląstelių. Rs6917 polimorfizmas yra į 3'UTR srities ir būna tik izoformos 1 d PHB, kuriuose buvo aptiktas šiame tyrime pagal kDNR sekos ir TaqMan tyrimu. 3'UTR yra daug , CIS UAB - ir , trans
-elementai ir šios struktūros turi plačiai įtaką iRNR vertimas, stabilumo ir pavienių ląstelių tyri- mas lokalizaciją [34] [35], [36, ]. T variantas sukuria potencialų jungimosi vietos į mikro RNR turi-Pasaulis-1292 ir turi-886-5p (http://snpinfo.niehs.nih.gov/cgi-bin/snpinfo/mirna.cgi?2_rs6917), kuris gali pakeisti genų ekspresiją arba mRNR irimo ar raštu. Kitos mikro RNR anksčiau buvo susijęs su PHB
raiškos GC reglamentą. Liu ir kt. [21], pranešė, kad Ba
reglamentuoja miR-27A, kuri yra paprastai iki-reguliuojami GC. Autoriai teigė, kad žemyn reguliavimas PHB
pagal šio MicroRNA gali paaiškinti, kodėl miR-27a slopinimas gali slopinti GC ląstelių augimą. Be to, 3'UTR Ba
koduoja RNR (genų ENSG00000250186; HAVANA http://www.sanger.ac.uk/~~HEAD=dobj). Iš retų alelių buvimas RNR gali pakeisti antrinę struktūrą ir sumažinti kcal /mol, lyginant su plataus tipo seka naudojant CLC RNR Workbench 4.0 (duomenys neparodyti). Todėl rs6917 polimorfizmas gali sukelti Ba
žemyn reguliavimo sukuriant naujas MicroRNA tikslines svetaines ar per jos reguliavimo, kurį RNR skrandžio ląsteles, tokiu būdu prisidedant prie skrandžio kancerogenezėje.
poveikį skrandžio ląstelių. Mūsų žiniomis, tai pirmasis tyrimas, siekiant įvertinti skirtumas PHB
alelio konkrečių raiškos navikų mėginiuose. Ankstesni tyrimai parodė, kad PHB
variantas su T alelio prie 1630 pozicijos 3'UTR srities trūksta antiproliferacinės ir naviko augimo slopinimo gebėjimus in vitro ir in gyvūnų modeliais [29]. Todėl T alelio buvimas, ypač, kai ji pateikiama padidėjusi išraiška, palyginti su C alelio, gali sukelti "kempinę efektas" už po transkripcijos reguliavimo, pavyzdžiui, miRNAs ir prisidėti prie skrandžio ląstelių proliferaciją, linkusiems heterozigotinės asmenis ir DC.
žemyn reglamento - dėl rs6917 polimorfizmo, pavyzdžiui - ant GC rizika yra susitarusi su asociacijomis tarp sumažintas Ba
mRNR ir mažesnis invazija, limfmazgių metastazių ir ankstyvos stadijos GC trūkumas. Mūsų žiniomis, nė Ankstesnis tyrimas literatūroje įvertino galimą ryšį tarp PHB
ekspresijos ir GC prognozinių veiksnių. Šie rezultatai rodo, kad Ba
žemyn reguliavimas gali būti reikalingas auglio pradžios.
išraiška. PHB atrodo vaidinti svarbų vaidmenį ląstelių proliferaciją, sukibimo ir migracijos, todėl, atsižvelgiant į piktybinę transformaciją progresavimo per RAS-RAF signalizacijos [37]. Mes iškėlė hipotezę, kad padidėjęs Ba
iRNR lygio reikia GC progresavimą. Žmogaus mėginių įvertinimas leidžia tik vieną laiko taške tyrimą (Tuo chirurginiam gydymui metu); Taigi, mes negalime įvertinti dinamišką reguliavimą genų ekspresiją. Tačiau PHB
išraiška greičiausiai susijęs su ląstelių kontekstą ir molekulinės fone skrandžio ląstelėse.
išraiška, palyginti su ne navikinių pavyzdžių ir kad PHB
iRNR kiekis buvo mažesnis prastai diferencijuotų navikų. Todėl, mūsų pavyzdžių PHB
išraiška atrodė mažėti naviko dedifferentiation. Tolesni tyrimai yra būtini siekiant geresnio supratimo PHB vaidmens diferenciacijos proceso normaliomis ir navikinių skrandžio ląstelėse.
. Pasikeitimai chromosomos 17 buvo susiję su naviko progresavimo ir piktybinių potencialo pirminės GC [38], [39]. Mūsų žiniomis, tai pirmasis tyrimas naudoti tikslią ir patikimą techniką įvertinti PBH
kopijuoti numerį GC pavyzdžius. Mes stebėjo tarp , PBH
kopijuoti numerį ir iRNR lygį, atskleisti cis-dozavimo poveikis CNV genų ekspresijos lygį asociacija. Todėl, mūsų rezultatai rodo, kad, CNV yra svarbi varomoji pasroviui PHB
rašybą kai kurių skrandžio navikų. Tai genetinis mechanizmas, daugiausia pastebėta pabaigoje prasidėję GC, gali prisidėti, kad PHB
kaip onkogeno vaidmenį. Ši išvada taip pat pabrėžti, kad keli mechanizmai gali sukelti Ba
dereguliavimo GC ląsteles.
kopijuoti skaičius buvo susijęs su vėlai pasireiškimo GC padidėjimas. buvo aprašyta klinikos skirtumai pradžioje prasidėjusią ir vėlai pasireiškimo GC [40], [41], [42], tačiau mažai žinoma apie genetinių pokyčių, susijusių su pradžios GC amžiaus [2]. Buffart ir kt. [43] anksčiau parodė, kad jauni ir seni ligoniai priklauso grupėms su skirtingais genomo profilius. Iš Ba
lokuso pabrėžiama GC heterogeniškumas stiprinimas.
skrandžio kancerogenezėje ir jos transkripcijos reguliavimo.
galima pastebėti GC. Sumažinimo, pasirodo PHB
išraiška dalyvauja naviko dedifferentiation procesą ir vėžio pradžios. T alelis į Ba pervežimas rs6917 polimorfizmo gali prisidėti prie stebimo sumažinimo PHB
mRNR koncentracijų ir todėl prisidėti prie GC rizika. Tačiau pasirodo PHB
iki reguliavimą turi būti reguliuojama geno kopijų skaičiaus. Skirtumas išraiška rs6917 polimorfizmo skrandžio mėginius buvo pranešta pirmą kartą, ir tai variacija gali vaidinti vaidmenį PHB
raiškos reguliavimas. Pleiotropic funkcija Ba
pabrėžia tolesnių tyrimų reikalingumą GC, nes jos veikla skrandžio ląstelėse gali būti griežtai reguliuojamas, kad būtų išvengta galimų neigiamų pasekmių dėl sumažėjusio ar padidėjusio išraiška.
Padėka
Oralinis seksas gali sukelti bakterinę vaginozę
Pirminės žmogaus mikrobiomų projekto išvados paskatino „šimtus vėlesnių tyrimų“
Ksilitolis ir greipfrutų sėklų ekstraktas žada užkirsti kelią SARS-CoV-2 infekcijai,
Vaikų sveikatos priežiūros pasirengimo strategija antrajai COVID-19 pandemijos bangai
Kodėl man reikia kolonoskopijos?
Ar komercinių kefyro produktų etiketėse teisingai nurodomas mikrobų kiekis?
Kas yra ERCP?
Jei įtariame galimą tulžies pūslės problemą, tulžies sistema, kasa, arba kepenys, galime užsisakyti endoskopinę retrogradinę cholangiopankreatografiją (ERCP). ERCP tiria, iš kur gaunamas virškinimo sk
Rūgščių neutralizuojančių savybių nustatymas OTC antacidams
USP aprašomas pakartotinis titravimas, siekiant nustatyti rūgšties neutralizavimo pajėgumą (ANC). Metodas labai greitas, lengva, ir patikimas. „Metrohm“ taikymo pastaba AN T-192 apima veiksmingą ANC
Miego kokybė gali būti vėlesnio Alzheimerio ligos tyrimo rodiklis
Naujas Kalifornijos universiteto mokslininkų tyrimas, Berkeley parodė, kad palaipsniui blogėjanti miego kokybė tarp 50–60 metų amžiaus žmonių gali rodyti baltymų susipainiojimą smegenyse, dėl kurio vė