Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: Prohibitin Expression Dereguléierung an Gastric Cancer Ass Associéierten mat den 3 "Untranslated Regioun 1630 C > T Polymorphism an Copy Number Variant

Wat VerfÜgung

PHB ass e Rapport oncogene an entholl suppressor zu gastric Kriibs. Hei, évaluéiert mir ob der PHB VerfÜgung Kopie Zuel an der rs6917 polymorphism hiren Ausdrock an gastric Kriibs betreffen. Down-Regulatioun a weider-Regulatioun vun PHB VerfÜgung waren an der bewäert erhéijen observéiert. Reduzéiert Ausdrock war mat entholl dedifferentiation a Kriibs Initiatioun assoziéiert. Den T allele vun der rs6917 polymorphism war mat reduzéierter verbonne PHB VerfÜgung mRNA Niveauen. Desweideren, déi weider-Regulatioun vun PHB VerfÜgung wossten vun de Mosconi vun zousätzleche Gentherapie Exemplare reglementéiert gin. Sou, PHB VerfÜgung Zuel Variant Copy an Ausdrock vun der rs6917 polymorphism Ënnerscheed kann zu enger Roll spillen PHB VerfÜgung transcriptional Regulatioun VerfÜgung

Fro:. Leal MF, Cirilo PDR, Mazzotti TKF , Calcagno DQ, Wisnieski F, Demachki S, et al. (2014) Dereguléierung Prohibitin Expression zu Gastric Cancer Ass Associéierten mat den 3 "Untranslated Regioun 1630 C > T Polymorphism an Copy Number Variant. PLoS NËMMEN 9 (5): e98583. Doi: 10.1371 /journal.pone.0098583 VerfÜgung

Redakter: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Vereenegt Staate vun Amerika VerfÜgung

Arnaque: 17. Februar 2014; Akzeptéiert: 5 Mee 2014; Publizéiert: Mee 30, 2014 VerfÜgung

Copyright: © 2014 Leal et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dës Etude (CNPq; RC, Maschinnen an RRB) war vun Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Ieweschte (CAPESP), Conselho nacional de Desenvolvimento Científico E Tecnológico ënnerstëtzt a Fundação de Amparo à Pesquisa Estado de São Paulo (FAPESP maachen; MFL, PDRC an DQC ) als Stipendien a Gemeinschaft Auszeechnunge kritt. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:. RC ass eng Akademesch Redakter fir PLOS NËMMEN. Déi aner Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interesse fir se existéieren. Dëst heescht net de onvergläichleche zu PLOS NËMMEN Editorial Politik a Critèren 'Auteuren ofzeänneren. VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric Kriibs (GC) ass de véiert stäerkste gemeinsam Kriibs an der zweeter Virwaat Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doudesfäll weltwäit [1]. Trotz groussen Schrett an der Etude vun GC, de molekulare zu gastric carcinogenesis Équipe hire Restaurant bleift onbekannt. VerfÜgung

Chromosome 17 ass eent vun de meescht genannten chromosomes suer- z'identifizéieren geometrescher Figur vun GC (kuckt review [2]). Eis Grupp huet matgedeelt virdrun d'Präsenz vun chromosome 17 aneuploidy, souwuel Dumouriez a Verloschter, an GC zu Individuen vun Northern Brasilien [3], [4], [5], [6] an an all GC Zell Zeilen aus neoplasias an dëser etabléierten Populatioun [7], [8]. Dofir, kann dës chromosome wichteg Genen vun gastric carcinogenesis Équipe. VerfÜgung

D'prohibitin-1 ( PHB VerfÜgung) Gentherapie Kaarten op den chromosome 17q21 nët. Dëst Gentherapie encodes engem ganzen, evolutionarily conserved FAQ datt zu engem Netzwierk vun Organismen, dorënner Bakterien, Planzen, Happ, protozoans a Mamendéieren [9] fonnt gëtt. PHB war ursprénglech geduecht eng zentral Roll an der inhibition vun Zell-Zyklus Werdegang ze spillen. Méi kuerzem, huet PHB an der Stabiliséierung vun Kënschtlech Proteinen Équipe als chaperone charakteriséiert gewiescht; also, huet PHB zu puer bewosst Prozesser agebonne ginn, dorënner d'Regulatioun vun Prolifératioun, apoptosis an der Gentherapie Transkriptiouns [10]. VerfÜgung

schéngt PHB eng Roll an der Entwécklung vun verschidden Zorte vu Kriibs ze spillen. Overexpression vun PHB gouf zu Kriibs vun der cervix, esophagus, Broscht, haett, BBC, Schild, ovary an Aarbecht gemellt. Am Géigesaz, reduzéiert huet PHB Ausdrock vun gliomas observéiert goufen, an somatic kennen PHB VerfÜgung hunn zu sporadesch Broscht Cancers fonnt goufen [9]. Zousätzlech, eng funktionell Single Nukleotid polymorphism (SNP) am PHB VerfÜgung Gentherapie, engem cytosine zu engem thymine um Positioun 1630 an der 3. 'UTR (rs6917) Decisioun, eng Variant bewierkt datt antiproliferative Aktivitéit Éloquence [11] , [12] an dono kënnt de Risiko vun malignant Wuesstem Erhéijung. Den T allele vun dëser SNP ass mat eng fräi Risiko vu Broschtkriibs Kriibs [13] an melanoma [14] assoziéiert. Dofir, bleift d'Roll vun PHB zu Kriibs Prolifératioun an /oder Ennerdréckung kontrovers. VerfÜgung

D'Roll vun PHB zu gastric carcinogenesis huet net komplett opgekläert ginn. Verschidde virdrun Studien bewonneren PHB Ausdrock am GC Echantillon beschriwwen [15], [16], [17], [18] an den serum vun GC Patienten [19]. Allerdéngs, hunn aner Studien PHB verwandelt-Regulatioun vun dësem Typ vu Kriibs gemellt [20], [21]. Der Enquête vun der molekulare am transcriptional Regulatioun Équipe Mechanisme vun PHB VerfÜgung déi vläicht nei Abléck an hir Roll an GC an Hëllef bei der Entwécklung vun neie anticancer Behandlungen. VerfÜgung

An dëser Etude, mir éischt bewäert der mRNA an FAQ Ausdrock vun PHB am GC iwwereneestëmmen Net-neoplastic gastric Otemschwieregkeeten Echantillon. Zousätzlech, tëscht de méiglech Associatiounen PHB VerfÜgung an clinicopathological Charakteristiken huet propagéieren. Well d' PHB VerfÜgung Gentherapie zu engem chromosomal Regioun dacks zu z'identifizéieren geometrescher Figur vun GC [2] Équipe wellkomm ass, och mir Uschléi PHB VerfÜgung Zuel vun de entholl Echantillon Copy. Ausserdeem, um allele-spezifesch Ausdrock vun PHB VerfÜgung mRNA évaluéieren war d'famill Transkriptiouns vun all allele zu heterozygous Sujeten mat der rs6917 polymorphism als méiglech Mechanismus vun zu Regulatioun PHB Équipe ze ermëttelen. Fir eis Wëssen, huet kee virdrun Etude bewäert PHB VerfÜgung Kopie Zuel an allele-spezifesch Ausdrock vun entholl Echantillon. VerfÜgung

spontan a Methode VerfÜgung

Ray Echantillon VerfÜgung

véierzeg-aacht Puer GC Echantillonen an entspriechend net-neoplastic gastric Otemschwieregkeeten Echantillon (> 5 cm aus der Südsäit vun der entholl) waren benotzt genotype diskutéieren PHB VerfÜgung mRNA Ausdrock an d'SNP rs6917. An 38 vun dëse GC Echantillonen, déi PHB VerfÜgung Kopie Zuel war och évaluéieren. PHB immunoreactivity war zu 12 GC uplanzen. VerfÜgung

All vun der gastric Echantillon waren kritt vu Patienten bewäert déi gastrectomy um João de Barros Barreto University Hospital (HUJBB) am Northern Brasilien fir GC mécht. All vun de Patienten déi negativ mat der aussetzt entweder ze Chimiotherapie oder radiotherapy virum Agrëff, an do war keen Co-Optriede vun anere festgestallte Cancers. Schrëftlech informéiert Zoustëmmung mam Accord vun der Ethik Comité vun HUJBB kritt huet. VerfÜgung

Deel vun all Prouf Leschten entholl war formalin-fix a paraffin Ënnerbewosstsinn (FFPE). Sektiounen vun FFPE Otemschwieregkeeten sech mat hematoxylin-eosin fir histological Evaluatioun Kierchefënster oder fir immunohistochemistry (IHC) Analyse benotzt. Weider Portiounen all entholl a vläit Net-neoplastic Otemschwieregkeeten specimen sech zu flëssegem Stéckstoff a gespäichert bei -80 ° C bis Nukleinsaier Offäll gefruer briechen. VerfÜgung

All vun der Echantillon ausseet no Lauren [22], an der erhéijen sech no der TNM Stadium Critèren Darmstadt [23]. VerfÜgung

DNA an mRNA Offäll VerfÜgung

Total DNA an mRNA sech aus gastric Otemschwieregkeeten Echantillon mat engem AllPrep DNA /RNS /Protein Kit gläichzäiteg isoléiert (QIAGEN, Däitschland) no der Taktik vum Produzent. Den DNA an RNS Konzentratioune a Qualitéit huet e NanoDrop spectrophotometer alles benotzt (Kisker, Däitschland), an der RNS Integritéit war vun gelies electrophoresis alles. VerfÜgung

PHB Gene Expression VerfÜgung

PHB
Ausdrock war vun ëmgedréint Transkriptiouns grouss polymerase Kette Reaktioun (RT-qPCR) bewäert. Éischt, ergänzen DNA (cDNA) war mat engem High-Kapazitéit cDNA Archive Kit (Obwuel Biosystems, Polen) Wierderbuch no de Protokoll d'Hiersteller. Real-Zäit RT-qPCR Analyse huet mat QuantiFast SYBR Green Master Mix (QIAGEN, Däitsch) op eng 7500 Fast Real-Time Hinnen alleguer Maschinn (Obwuel Biosystems, USA) gesuergt. Déi folgend primers (150 nm all) sech fir RT-qPCR amplification entworf: PHB VerfÜgung F5'-GTGTGGTTGGGGAATTCATGTGG-3 'an R5'-CAGGCCAAACTTGCCAATGGAC-3 "; ACTB VerfÜgung F5'-AGAAAATCTGGCACCACA-3 'an R5'-AGAGGCGTACAGGGATAG-3 ". All vun de Reaktioune waren am triplicate fir souwuel d'Zilscheif Gentherapie an d'intern Kontroll ( ACTB VerfÜgung) gesuergt. PHB VerfÜgung Ausdrock war normalized zu ACTB VerfÜgung Ausdrock. D'Heefegkeet vun mRNA Ausdrock war vun amplification Effizienz ugepasst ( PHB VerfÜgung = 99%, ACTB VerfÜgung = 102%) [24]. A Net-neoplastic gastric Otemschwieregkeeten Echantillonen gouf als calibrator fir all vläit entholl designéierte der famill quantification (RQ) [24] ze berechnen. VerfÜgung

PHB Protein Expression VerfÜgung

D'paraffin Rubriken waren zu IHC . Entholl Otemschwieregkeeten Rubriken (3 oder 4 mm déck) waren an xylene an rehydrated zu engem graded Ethanol Serie deparaffinized. Epitope retrieval war zu citrate Prellbock, pH 6.0, an fiichten Hëtzt an engem Loftdrock Buschtawenzopp gesuergt. Nächst, déi Otemschwieregkeeten Rubriken huet mat enger Primärschoul Maus monoclonal antibody géint PHB (; ThermoFisher Wëssenschaftlech, USA II-14-10, dilution 1:100) incubated. Siten vun immunoreactivity sech mat engem SuperPicture Polymer erkennen Kit (Invitrogen, USA) visualized. D'drënner waren déi Luucht microscopy mat enger Nikon Sonnendäischtert E600 microscope (Nikon, USA) equipéiert mat enger digitaler Zur Nikon DSM1200F Kamera (Nikon, USA) klicken. D'Net-Kierchefënster Regioun (wäiss Regioun) war den Hannergrond ausgewielt a virbereet. All staining war considéréiert engem positive Resultat ze ginn, onofhängeg vun der Intensitéit. Negativ Kontrollen, an deem d'Primärschoul antibody vun 5% Bovine serum albumin (BSA) zu phosphate-gefiermt Salins (PBS) ersat gouf, waren an all Liga mat abegraff, an Rubriken vun normal mënschlech Aarbecht Otemschwieregkeeten sech als positiv kontrolléiert ginn. VerfÜgung

PHB VerfÜgung Copy Number VerfÜgung

fir Kopie Zuel Variatiounen (CNV), de qPCR Prozedur war standing benotzt grouss TaqMan CNV assays (Life Technologies, USA) fir d' PHB diskutéieren
Gentherapie (Hs00178432_cn) a fir d'intern Kontroll RNAse P VerfÜgung (Ƹ3326). Multiplex qPCR Reaktioune waren am quadruplicate mat gDNA standing laut den Hiersteller d'Protokoll an Vëlos Konditiounen zu engem 7500 Fast Real-Time Hinnen alleguer Maschinn (Life Technologies, USA). Der relativer Kopie Zuel vun all Prouf war Copy Ament Software V1.0 (Life Technologies, USA) geschat. Commercial Mënsch gDNAs (G1471 an G1521; Promega, USA) sech fir Eechung benotzt VerfÜgung

PHB VerfÜgung Genotyping VerfÜgung

DNA aus Net-neoplastic Echantillon gouf benotzt fir PHB. VerfÜgung genotyping. D'Sujete waren d'rs6917 polymorphism benotzt Benotzerdefinéiert TaqMan SNP Ämter an primers (Obwuel Biosystems, Foster City, CA) genotyped. Déi folgend primers an MGB Ämter goufen fir allelic Diskriminatioun entworf: primers F5'-TTGGTCCCTCTCAGATACCCA-3 'an R5'-CCGTGAGAAGGGCAGTCTCT-3 "; FAM-Label Studiebäihëllefe 5'-CTGCCAAAGACGTGT-3 "; an minor allele VIC-Label Studiebäihëllefe 5'-CTGCCAAAGATGTGT-3 ". VerfÜgung

PHB VerfÜgung Allele-spezifesch Expression VerfÜgung

Allele-spezifesch Ausdrock éischte vun sequencing sech war. Zwanzeg bis 40 NG vun DNA oder cDNA war wéi e Skelett fir Hinnen alleguer amplification mat der primers fir PHB VerfÜgung genotyping benotzt ginn. Ier sequencing, goufen d'Hinnen alleguer Produite mat 2% agarose gelies electrophoresis getrennt, an der konkreter Band war ofgebaut a sidd. Sequencing war mat der Forward primer fir Hinnen alleguer amplification an enger BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Obwuel Biosystems, USA) benotzt gesuergt. Sequencing Produite benotzt en Abi 3500 genetesch Organer (Obwuel Biosystems, USA) getrennt. Verschiddener vun den Echantillon waren op d'mannst zweemol, dorënner z'ënnerscheedde RT-PCRs an sequencing assays. VerfÜgung

D'allelic Ausdrock Niveauen mat PeakPicker Software alles goufen analyséiert [25]. D'Software gouf benotzt, fir d'éischt e normalization Schrëtt Leeschtunge, an deem d'SNP allele Héicht mat der Héicht vun Referenzmaterial Moundalpen Reliefsailen Message Verglach war. Mir limitéiert dës normalization Schrëtt ze bannen engem 21-huel Fënster. Verhältnis Wäerter virun 1 sech op 1 /(Verhältnis) transforméiert all vun de Wäerter zu enger 0-1 Skala ze verwandelen, an d'Wäerter, waren duerno aus enger Referenz DNA Prouf heterozygous fir d'rs6917 polymorphism zu der menge vun der Héichpunkt Intensitéit nennen ugepasst. Frankräich DNA aus heterozygous (N = 3) a homozygous Echantillon (N = 3, fir genotype CC; N = 2, fir genotype TT) war benotzt d'Analyse ze validéieren an der allelic nennen vu 50:50 an 0:100 ze bestätegen, bzw.. Zousätzlech, cDNA aus Otemschwieregkeeten Echantillon (tumoral an Net-tumoral uplanzen) aus der zwee Sujeten homozygous fir de klengen allele am rs6917 polymorphism sech och als kontrolléiert. VerfÜgung

Allele-spezifesch PHB VerfÜgung benotzt Ausdrock ass och zu heterozygous Echantillon vun RT-qPCR évaluéiert, wéi virdru beschriwwen [26]. Mat Hëllef vun engem Benotzerdefinéiert TaqMan SNP genotyping assay fir PHB VerfÜgung genotyping, generéiert mir eng linear Réckgang Linn fir de log10 fluorescence Intensitéit vs VerfÜgung der log10 allelic Verhältnis baséiert op de Serien dilution vun CC- an TT- genotyped Frankräich DNAs aus Kontroll Echantillon (Echantillon aus zwee homozygous Persounen) an e puer ze nennen (CC: TT 8:1, 4:1, 2:1, 1:1, 1:2, 1:4, 1:8) vun RT -qPCR (Dorënner 1A). VIC Intensitéit op der Norm Kéier: d'allelic Verhältnis vun der Gentherapie Ausdrock war vun der offänken vun der log10 vun FAM vermëttelt. Rox (intern Referenzmaterial Hoerfaarw) an Net-spezifesch FAM an VIC fluorescence war an all Analysë normalized. All vun de Reaktioune vun zweete gesuergt huet VerfÜgung

Fir d'heterozygous cDNA Echantillonen, allelic nennen &Si besteet;. 0,8 oder &plain. 1.2 duerops allele-spezifesch Ausdrock considéréiert goufen VerfÜgung

statistique Analys VerfÜgung

fir mRNA Ausdrock Analyse, mir évaluéieren éischt der Virgab, dass d'Donnéeën en normal Verdeelung no der Shapiro-Wilk Normalitéit Test mat de passenden Tester fir spéider statistesch Vergläicher ze bestëmmen. D' PHB VerfÜgung mRNA Niveauen sech net normalerweis verdeelt an huet (z-stoung) fir Analyse transforméiert. Observatioune > +2 oder &Si besteet; -2 sech als outliers an aus der Analyse ausgeschloss. A vläit T-Test war standing der heeschen PHB VerfÜgung Ausdrock tëscht Net-neoplastic an entholl Echantillon ze vergläichen. Den T-Test fir onofhängeg Echantillonen an eent-Manéier ANOVA gefollegt vun der Games-Howell Post-hoc Test sech benotzt méiglech Associatiounen tëscht diskutéieren PHB VerfÜgung Ausdrock an clinicopathological Charakteristiken, FAQ immunoreactivity, Gentherapie Kopie Zuel an genotype . Den Chi-Feld Test oder genau Test d'Fisher war fréier d'Relatioun tëschent ze bewäerten PHB VerfÜgung Kopie Zuel an immunoreactivity an clinicopathological Facteuren. Pearson d'Korrelatioun war onzefridde méiglech Korrelatioun tëscht sequencing an der TaqMan assay fir allele-spezifesch Ausdrock Analyse ze diskutéieren. An all vun der Analyse, P VerfÜgung &Si besteet;. 0,05 war bedeitendst als VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

PHB VerfÜgung mRNA Expression zu Gastric Saachen VerfÜgung

PHB VerfÜgung Ausdrock tëscht neoplastic iwwereneestëmmen net-neoplastic gastric Echantillon (0.173 ± 0,255 vs VerfÜgung 0,227 ± 0,297, P VerfÜgung = 0.149) ënnerscheeden rauszesichen. Allerdéngs goufen d'mRNA Niveau op d'mannst 1,5-fantastesch zu 20 (45.5%) vun de GC Echantillon a fräi vun 9 (20.5%) wéi am Verglach mat vläit Net-neoplastic gastric Otemschwieregkeeten Echantillon. VerfÜgung

Table 1 weist reduzéiert d'Associatiounen tëscht PHB VerfÜgung Ausdrock an der clinicopathological Charakteristiken souwéi d'FAQ immunoreactivity, rs6917 genotype an der Gentherapie Kopie Zuel. Schlecht ënnerscheet virgestallt erhéijen reduzéiert PHB VerfÜgung Ausdrock wéi mat mëttelméisseg ënnerscheet erhéijen Verglach ( P VerfÜgung = 0,029; Table 1). Allerdéngs, souwuel schlecht ënnerscheet GC (0.025 ± 0,022 vs VerfÜgung 0,239 ± 0,303; P VerfÜgung &Si besteet; 0,001, ANOVA gefollegt vun der Games-Howell Post-hoc Test) a mëttelméisseg ënnerscheet GC (0.057 ± 0,051 vs VerfÜgung 0,239 ± 0,303; P VerfÜgung &Si besteet; 0,001, ANOVA gefollegt vun der Games-Howell Post-hoc Test) reduzéiert virgestallt PHB VerfÜgung Ausdrock Verglach mat Net- neoplastic gastric Otemschwieregkeeten Echantillon VerfÜgung

reduzéiert PHB VerfÜgung Ausdrock war mat manner Invasioun verbonne ( P VerfÜgung = 0,002; Table 1). an en Feele vun lymph Node Metastasen ( P VerfÜgung = 0,040; Table 1). Ausserdeem presentéiert fréi GC reduzéiert PHB VerfÜgung Ausdrock Verglach mat fortgeschratt GC ( P VerfÜgung = 0,002; Table 1). Desweideren, nëmmen fréi virgestallt GC en däitleche Minus am PHB VerfÜgung mRNA Niveauen am Verglach mat den Net-neoplastic Echantillon (0.044 ± 0,027 vs VerfÜgung 0,239 ± 0,303, P VerfÜgung &Si besteet; 0,001, ANOVA vun der Games-Howell Post-hoc Test duerno). VerfÜgung

PHB Immunoreactivity zu Gastric Saachen VerfÜgung

Protein immunostaining war an all vun der entholl Echantillon bewäert vun IHC (Table 2) observéiert. An all Fäll, war PHB immunoreactivity zu neoplastic an Net-neoplastic Zellen fonnt, dorënner intestinal metaplastic an demagogesch Zellen (Dorënner 2A-H). PHB war an der Zytoplasma allem ausgedréckt. D'staining Intensitéit an de Prozentsaz vun immunoreactive Zellen ënnert der studéiert Fäll variéiert (Table 2). Echantillon Fotoe &Si besteet;. 80% vun entholl Zellen mat PHB immunoreactivity zougedréckt mRNA Ausdrock reduzéiert ( P VerfÜgung = 0,036, Table 1) VerfÜgung

PHB VerfÜgung Copy Zuel vun Gastric Saachen

PHB VerfÜgung war an 13 vun 38 (34.2%) erhéijen Implikatioune verstärkt, dorënner 2 Echantillon mat 4 Exemplairen. Nee entholl virgestallt enger PHB VerfÜgung Läschen. Spannen, 3 Echantillon dass fir sou vill Senn maan Wäerter virgestallt PHB VerfÜgung mRNA Ausdrock och Gentherapie amplification presentéiert. Dofir, wann sou vill Senn maan Wäerter an der Analyse abegraff waren, PHB VerfÜgung Ausdrock war héich an Echantillon mat Gentherapie amplification wéi an deenen ouni Gene amplification (Steiren ± interquartile Gamme: 0,344 ± 0,335 vs VerfÜgung 0,047 ± 0,07; P VerfÜgung = 0,003, Net-parametric Mann-Whitney Test; Dorënner 3). PHB VerfÜgung gewannen mat spéiden-agesat GC Verglach mat fréi-agesat GC ( P VerfÜgung = 0,022; Table 2) assoziéiert gouf. Nee association tëschent PHB VerfÜgung Kopie Zuel an FAQ immunoreactivity oder soss clinicopathological Charakteristiken fonnt gouf (Table 3). VerfÜgung

PHB VerfÜgung Allele-spezifesch Expression VerfÜgung

mir propagéieren och ob der Präsenz vun der Mannerjäreger allele zu rs6917 mat der Gentherapie Ausdrock Dereguléierung an GC Patienten verbonne war. An eisem Beispill, 11 vun 48 Patiente (22.9%) waren heterozygous an 2 Patiente (4.17%) fir de klenge allele am rs6917 polymorphism homozygous goufen. All vun der Echantillon mat den T allele virgestallt 2 Exemplairen vum PHB VerfÜgung Gentherapie. Der Presenz vun der T allele am rs6917 polymorphism mat reduzéierter war verbonne PHB VerfÜgung Ausdrock am GC ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,001; Table 1; Dorënner 1B) an an Net-neoplastic Echantillon (mengen ± Fils:. 0,302 ± 0,325 vs VerfÜgung 0,045 ± 0,043; P VerfÜgung &Si besteet; 0,001; Dorënner 1B) VerfÜgung

One hien huet misse vum heterozygous Echantillon (entholl an Net-entholl) war net fir d'Analyse vun allele-spezifesch Ausdrock gebraucht. A Korrelatioun tëscht der allelic Verhältnis vun der rs6917 polymorphism vun sequencing an der TaqMan assay alles ass fonnt ( P VerfÜgung = 0,003; r = 0.627). Vun sequencing, presentéiert ongeféier 50% vun de Fäll Ënnerscheed allelic Ausdrock (Dorënner 1c). Allerdéngs huet de TaqMan assay datt den T an C alleles am meeschten Patienten (Dorënner 1D) Ënnerscheed allelic Ausdrock presentéiert. Den Ofschloss vun Ënnerscheed am Ausdrock tëschent den zwou alleles tëscht Individuën variéiert. Den T zu C allelic Ausdrock Verhältnis war ähnlech am meeschte Puer entholl an Net-entholl Echantillon. Nëmmen ee Patient eng héich C /T Verhältnis zu souwuel entholl an Net-neoplastic Echantillon vun béiden assays. An de meeschte Fäll, eng méi niddreg C /T Verhältnis war onofhängeg vun der Methodik applizéiert (Sauerdall 1c an 1D) fonnt. Nee association tëscht Ënnerscheed allelic Ausdrock an Alter vun agesat oder soss clinicopathological Variabel ass fonnt. VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

PHB zu bewosst homeostasis gin wesentlech schéngt. Rezent Studien ugeholl hunn, datt PHB als pro-tumorigenic an Anti-tumorigenic Faktor puer Zell Zorte Akt kann (kuckt review [10]). Am Moment studéieren, d'FAQ a mRNA Ausdrock Profiler vun PHB virgestallt eng heterogen Muster ënnert entholl Echantillon. Obwuel mer net e wesentlechen Ënnerscheed tëscht GC iwwereneestëmmen Net-neoplastic Echantillon fonnt hutt, observéiert mir datt de mRNA Niveau 1,5-fantastesch an 45,5% vun GC Echantillon a fräi vun 20,5% vun erhéijen reduzéiert huet. D'reduzéiert mRNA Ausdrock war zu Deel wéinst engem reduzéierten Frequenz vun entholl Zellen PHB immunoreactivity presentéieren, déi de heterogeneity ënnert entholl Zell clones Héichpunkter. VerfÜgung

Liu et al. [21] beschriwwen reduzéiert mRNA Ausdrock zu véier gastric erhéijen Verglach mat hire jeeweilegen normal Stoffer, déi deelweis eis Resultater corroborates. Ënnerstëtzen eng anti-tumorigenic Roll, PHB Bleck Element an S Phas [27]. Ausserdeem, d'Wildwest-Typ rs6917 PHB VerfÜgung 3'UTR eleng ass gebass Zell Zyklus Werdegang [11], [28] an entholl Wuesstem [12] souwéi reduzéieren Zell Mobilitéit [29] zu inhibit. Ausserdeem, spillt PHB eng Roll an normal Kënschtlech Funktioun a Wirklechkeet Erhalen [30]. Et gëtt ugeholl, datt Verloscht vun Kënschtlech PHB Ausdrock (cytoplasmic Lokalisatioun, wéi an eisem Echantillon observéiert) ze denke proteolysis vun Membran Proteinen Féierung konnt a Funktioun vun der Kënschtlech Otmungsproblemer Kette leider [10]. Eis virdrun proteomic Etude weisen, datt e puer Proteinen an Energie ukuerbelt Édouard (Kënschtlech Viagra, pyruvate ukuerbelt, oxidative phosphorylation, citrate Krees, glycolysis /gluconeogenesis) Équipe dereguléierte sech [31] an huet virgeschloen, datt groussaarteg Kënschtlech Funktiounen verännert ginn, Energieproduktioun am GC Schlaang Zellen a proposéiert den Effet Warburg [32]. VerfÜgung

Fir eist Wëssen, hunn puer Studien déi méiglech association tëschent PHB VerfÜgung mRNA Niveauen an der rs6917 polymorphism bewäert. An eng Etude, Tang et al. net e wesentleche Associatioun tëscht der rs6917 polymorphism an mRNA Ausdrock vun lymphoblastoid Zell Linnen abegraff an der HapMap Datebank [33] fest. Allerdéngs, an Untersuchungshaft dës Auteuren, datt de T allele mat eng fräi Risiko vu Broschtkriibs Kriibs verbonne war. Am Moment studéieren, hien huet mir dass d'Präsenz vun den T allele an der rs6917 polymorphism verbonne war mat reduzéierter PHB VerfÜgung Ausdrock an Net-neoplastic an neoplastic gastric Zellen. D'rs6917 polymorphism ass am 3'UTR etabléiert an ass dobäi nëmmen zu isoform 1 vun PHB, déi am Moment Etude vun cDNA sequencing an enger TaqMan assay festgestallt gouf. D'3'UTR enthält Multiple Well VerfÜgung - an Ziel VerfÜgung -elements, an deene Strukturen hunn e verbreet Afloss op mRNA Iwwersetzung, Stabilitéit a subcellular Lokalisatioun [34], [35], [36 ]. Den T Variant bewierkt eng potentiell bindend Site fir de microRNAs ass-mir-1292 an huet-886-5p (http://snpinfo.niehs.nih.gov/cgi-bin/snpinfo/mirna.cgi?2_rs6917), déi vläicht ofzeänneren Gentherapie Ausdrock vun entweder mRNA Zerfall oder Iwwersetzung. Aner microRNAs sech virdrun mat der Regelung vun verbonne PHB VerfÜgung Ausdrock am GC. Liu et al. [21] hu bericht, dass PHB VerfÜgung vum Mir-27a reglementéiert ass, déi allgemeng am GC up-reglementéiert ass. D'Auteuren, datt de verwandelt-Regulatioun vun PHB VerfÜgung vun dëser microRNA erkläre kann, firwat d'Ennerdréckung vun Mir-27a kann GC Zell Wuesstem inhibit. Zousätzlech, encodes der 3'UTR vun PHB VerfÜgung eng antisense RNS (Gene ENSG00000250186; Havana http://www.sanger.ac.uk/). D'Präsenz vun de rare allele am antisense RNS kann de Secondaire Struktur beaarbechten an der kcal /mol erof wann mat der grousser-Typ Haaptrei benotzt CLC RNS Workbench 4.0 Software Verglach (Donnéeën net gewisen). Dofir, kann de rs6917 polymorphism zu PHB VerfÜgung verwandelt-Regulatioun An deems nei microRNA Zil- Siten oder duerch hir Regulatioun vun der antisense RNS zu gastric Zellen, also bis gastric carcinogenesis matmaacht. VerfÜgung

An eiser Echantillonen, déi meescht vun de heterozygous Patienten Ausdrock vun der T allele Verglach zu der C allele virgestallt fräi. Den Ënnerscheed an der famill mRNA Niveau vun den zwou alleles konnt d'Resultat vun Differenzen an Transkriptiouns oder mRNA Stabilitéit ginn, a si weisen dass dëse polymorphism Kaddoen enger Well VerfÜgung Effet vun gastric Zellen. Fir eis Wëssen, ass dat déi éischt Etude der Ënnerscheed PHB VerfÜgung allele-spezifesch Ausdrock vun entholl Echantillon diskutéieren. Virdrun Studien hu bewisen, datt e PHB VerfÜgung Variant mam T allele um Positioun 1630 an der 3'UTR Éloquence anti-proliferative an entholl Wuesstem Ennerdréckung Fähegkeeten kënschtlech an Déier Modeller [29]. Dofir, besonnesch d'Präsenz vun den T allele, wann et sollt nik Ausdrock relativ zu der C allele Klengegkeeten, kann e "verstinn Effekt" fir Post-transcriptional Legislateuren wéi miRNAs induce an zu gastric Zell Verbreedung bäidroen, heterozygous Persounen predisposing zu GC.

déi méiglech Effet vun PHB VerfÜgung verwandelt-Regulatioun - wéinst der rs6917 polymorphism, zum Beispill - op GC Risiko am Accord mat den Associatiounen ass tëscht reduzéiert PHB VerfÜgung mRNA a klenggeschriwwene Invasioun, opgepasst lymph Node Metastasen a fréi-Etapp GC. Fir eis Wëssen, huet kee virdrun studéieren an der Literatur déi méiglech association tëscht bewäert PHB VerfÜgung Ausdrock an GC prognostic Facteuren. Dës Conclusiounen hindeit datt PHB VerfÜgung verwandelt-Regulatioun vläicht fir entholl Initiatioun verlaangt ginn. VerfÜgung

Mä virdrun proteomic Studien hu gemellt PHB upregulation zu gastric erhéijen [15], [16], [17] . Ausserdeem, Kang et al. [18] hunn d'overexpression vun PHB FAQ a mRNA am GC (Verglach mat bascht normal gastric Stoffer) an asiatesch Persounen gemellt. An eisem Beispill, 20,5% vun erhéijen virgestallt och fräi PHB VerfÜgung Ausdrock. PHB schéngt eng wichteg Roll an der Zell Prolifératioun ze spillen, Haftung a Migratioun an, also, an de Werdegang vun malignant Transformatioun duerch RAS-RAF sécher [37]. Mir hypothesize datt eng fräi PHB VerfÜgung mRNA Niveau fir GC Werdegang néideg ass. D'Evaluatioun vun de Mënscherechter Echantillon erlaabt nëmmen d'Enquête vun enger eenzeger Kéier Punkt (an der Zäit vun chirurgesch Reparatur); also, sin mir net kapabel déi dynamesch Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock ze diskutéieren. Mä PHB VerfÜgung Ausdrock ass Wahrscheinlechkeet déi bewosst Kontext a molekulare Hannergrond vun gastric Zellen dinn. VerfÜgung

Kang et al. [18] hu bericht, dass PHB FAQ a mRNA Ausdrock tëscht mëttelméisseg a schlecht ënnerscheet GC ënnerscheeden an datt nëmme ganz wéineg ënnerscheet overexpression presentéieren PHB erhéijen Verglach mat Net-neoplastic Echantillon. An eisem Beispill, goufen puer erhéijen laut dem Ofschloss vun dat séiert. Allerdéngs, observéiert mir dass souwuel schlecht an mëttelméisseg ënnerscheet erhéijen reduzéiert virgestallt PHB VerfÜgung Ausdrock Verglach mat Net-neoplastic Echantillonen an datt d' PHB VerfÜgung mRNA Niveauen an der Pro ënnerscheet erhéijen niddreg waren. Dofir, an eise Echantillonen, PHB VerfÜgung Ausdrock wossten mat entholl dedifferentiation geloss. Weider Ermëttlungen sinn néideg fir e bessert Verständnis vun PHB d'Roll vun de dat Prozess zu normal an neoplastic gastric Zellen. VerfÜgung

An dëser Etude, observéiert mir dass 34,2% vun erhéijen verdengten Kopië vun PHB VerfÜgung. Hire Restaurant zu chromosome 17 goufen mat entholl Werdegang an malignant Potential am primäre GC verbonne [38], [39]. Fir eis Wëssen, ass dat déi éischt Etude eng korrekt a sécherlech technique ze benotzen déi PHB VerfÜgung Kopie Zuel vun GC Echantillon diskutéieren. Mir observéiert eng Associatioun tëscht PHB VerfÜgung Kopie Zuel an mRNA Niveauen, eng Well-Doséierung Effet vun CNV op Gentherapie Ausdrock Niveauen demaskéierte. Dofir, proposéiere eis Resultater datt CNV e wichtegt Element ass afgerappt an dreiwend PHB VerfÜgung Transkriptiouns zu puer gastric erhéijen. Dës genetesch Mechanismus, haaptsächlech am spéiden-agesat GC observéiert, droen kann fir den PHB VerfÜgung Roll als oncogene. Dëst brengt och drëm, dass verschidde Mechanismen ze féieren kann PHB VerfÜgung Dereguléierung an GC Zellen. VerfÜgung

D'Erhéijung vun PHB VerfÜgung Kopie Zuel mat spéiden-agesat GC verbonne war. Clinicopathological Differenzen tëscht fréi-gezu goufen an spéiden-agesat GC hunn beschriwwe ginn [40], [41], [42], mä kleng ass iwwer d'genetesch Verännerungen mat den Alter vun gezu vun GC [2] verbonne bekannt. Buffart et al. [43] virdrun bewisen, dass jonk an al Patienten mat verschiddene Frankräich Profiler ze Gruppen gehéieren. D'amplification vun der PHB VerfÜgung nët Héichpunkter der heterogeneity vun GC. VerfÜgung

D'Haaptrei begrenzten Dauer vun dëser Etude ass seng relativ klengen Echantillonen Gréisst. Dofir, presentéiert e puer statistesch Analyse Muecht reduzéiert ze grouss Ënnerscheeder tëscht Gruppen entdecken wahrscheinlech wéinst der grousser heterogeneity ënnert Echantillon. Dofir, falschen-negativ Resultater Priedegt hun kann. Weider Evaluatioune sinn nach erfuerderlech d'Roll vun PHB VerfÜgung zu gastric carcinogenesis a seng transcriptional Regulatioun. VerfÜgung

An Konklusioun ze zéien, souwuel d'verwandelt-Regulatioun a weider-Regulatioun vun PHB
kann am GC observéiert ginn. D'Reduktioun vun PHB VerfÜgung Ausdrock schéngt am entholl dedifferentiation Prozess an Kriibs Initiatioun Équipe ze ginn. Den T allele am PHB VerfÜgung rs6917 polymorphism un Observatiounsongenauegkeeten Reduktioun bäidroen kënnen am PHB VerfÜgung mRNA Niveauen an dofir ze GC Risiko droen. Mä PHB VerfÜgung up-Regulatioun schéngt vun der Gentherapie Kopie Zuel reglementéiert gin. Ënnerscheed Ausdrock vun der rs6917 polymorphism zu gastric Echantillon war fir d'éischte Kéier confirméiert, an dëser Variant vläicht eng Roll an der Regulatioun vun Leeschtung PHB VerfÜgung Ausdrock. D'pleiotropic Funktioun vun PHB VerfÜgung d'Noutwennegkeet vun weider Ermëttlungen am GC Héichpunkter well seng Aktivitéiten zu gastric Zellen ass wahrscheinlech rigoréis reglementéiert gin Ausdrock ze verhënneren méiglech ongewollt Konsequenze vun ofgeholl oder fräi. VerfÜgung

Arbeschterlidder

d'Auteure sinn wëllkom fir Sueli Nonogaki vum Adolfo Lutz (São Paulo, SP, Brasilien) fir déi technesch Ënnerstëtzung vun der immunohistochemistry analyséiert. VerfÜgung

Other Languages