PLoS ONE: interakcija poveikis pri-tegul-7a-1 rs10739971 su PGC ir ERCC6 Gene polimorfizmas skrandžio vėžio ir atrofijos gastritas

Anotacija

Fonas

Šio tyrimo tikslas buvo ištirti sąveiką poveikį pri let-7a-1 rs10739971 su pepsinogen C
( PGC
) ir , iškirpimas remontas kryžius papildant 6 grupė
( ERCC6
) genas polimorfizmas ir jo asociacija su skrandžio vėžio ir atrofinį gastritas riziką. Tikėjomės nustatyti Mirna polimorfizmas ar kelių polimorfizmas, kuris gali tarnauti kaip biologinių žymenų prognozuoti skrandžio vėžiu ir jo ikivėžinius ligų riziką derinys.

Metodai

buvo naudojamas Sequenom MassARRAY platforma metodas aptikti polimorfizmas iš pri let-7a-1 rs10739971 G → A PGC
rs4711690 C → G PGC
rs6458238 G → A PGC
rs9471643 G → C ir ERCC6
rs1917799 471 skrandžio vėžiu sergančių pacientų, 645 atrofijos gastritas pacientams ir 717 kontrolės.

rezultatai

sąveika poveikis pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmo su ERCC6
buvo pastebėtas rs1917799 polimorfizmas už skrandžio vėžio rizika ( P
_{sąveika = 0,026); ir sąveikos poveikį pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas su PGC
rs6458238 polimorfizmas ( P
sąveika = 0,012) ir PGC
rs9471643 polimorfizmas ( p
sąveika = 0,039) buvo pastebėtas už atrofinį gastritas rizika.}

Išvada

ir pri let-7a-1 rs10739971 polimorfizmo ir derinys ERCC6 parsisiųsti ir PGC
polimorfizmas gali suteikti didesnę prognozavimas potencialo nei vieną polimorfizmo apie savo. Didelio masto tyrimai ir molekulinės mechanizmas tyrimai, kurių reikia patvirtinti savo išvadas

nurodomoji dalis:. Xu Klausimas Liu J-W, Jis, C-Y Sun L-p, Gong Y h Jing J-j, duomenis ir kt. (2014) sąveika Poveikis pri let-7a-1 rs10739971 su PGC parsisiųsti ir ERCC6
Gene polimorfizmas skrandžio vėžio ir atrofijos gastritas. PLoS ONE 9 (2): e89203. Doi: 10,1371 /journal.pone.0089203

redaktorius: Xiaoping Miao, Ūkio ministerija Pagrindiniai laboratorija aplinkos ir sveikatos, visuomenės sveikatos mokyklos, Tongji Medicinos kolegija, Huazhong universiteto mokslo ir technologijų, Kinija

įstojo: lapkričio 20, 2013; Priėmė: Sausis 16, 2014 m Paskelbta: Vasario 25, 2014

Visos teisės saugomos: © 2014 Xu et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Šis darbas parėmė dotacijas iš nacionalinių pagrindinių pagrindinių mokslinių tyrimų programą Kinijos (973 programa ref nr. 2010CB529304), Nacionalinis gamtos mokslų fondas Kinijoje (nuorodos Nr 31.200.968), o Mokslas technologijų projektų Liaoning provincijoje (Ref kodas 2011225002) , Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį

konkuruojančių interesų.. Autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Asmenys, turintys panašių gyvenimo įpročius ir gyvenimo panašiomis aplinkomis turi skirtingą riziką vėžio. Nustatyti ir prognozuoti asmenims gresia didelis pavojus susirgti vėžiu gali parodyti, kad keisti gyvenimo įpročių poreikį. Vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) vaidina svarbų vaidmenį prognozuoti asmenims su padidėjusios vėžio riziką. Pastaraisiais metais buvo pranešta polimorfizmas iš pri-Mirna būti biologiniai žymenys prognozuoti vėžio rizika, pavyzdžiui, pri-miR-34b /c rs4938723 polimorfizmas [1], pri-Pasaulis-218 rs11134527 polimorfizmas [2] ir pri-Pasaulis-938 rs2505901 polimorfizmas [3]. Tyrimai nustatė, kad atskirų genų polimorfizmo skaičius buvo susijęs su skrandžio vėžio [4] rizikos. Tačiau, skrandžio vėžys yra sudėtinga kelių žingsnių liga daug genų, dalyvaujančių, ir pavieniai SNP turi ribotas galimybes prognozuoti skrandžio vėžio riziką [5] - [7]. Keletas tyrimų, pranešė, kad genas-genų sąveikos yra svarbesnės nei pagrindinės poveikio tam tikrą geną, sudėtingų ligų, tokių kaip vėžio [7] - [9]. Pagrindinis mokslinių tyrimų metodas genų genų sąveikos yra ištirti dviejų ar daugiau polimorfizmas su nedideliais derinys arba jokio poveikio iš ankstesnių atskirų SNP tyrimų [10], [11]. Tačiau dauguma ankstesni tyrimai daugiausia dėmesio buvo skirta nuspėjimo vaidmens vieno geno SNP ir pamiršta galimą taikymą genų genų sąveiką.

Šiuo metu tyrėjai daugiausia dėmesio genų SNP-SNP sąveiką, kuris gali sukelti protein- baltymų sąveika, ir tik nedaugelis tyrimų ištyrė sąsajas tarp Mirna polimorfizmas ir genų polimorfizmas, kuris gali sukelti baltymų-RNR, sąveiką. mirna buvo pranešė, kad dalyvauti Daugiamandatėje-genų tinklo skrandžio kancerogenezėje [12]. Tas pats Mirna buvo pranešta reguliuoti kelis tikslinius baltymus, ir tie patys baltymai gali būti koreguojamos pagal kelis Mirna [13]. Kaip rezultatas, iš Mirna poveikis ir genai sudarė tinklą.

Mūsų Ankstesnis kandidatas genų asociacija tyrimas nagrinėjo asociacija pepsinogen C
( PGC
) ir iškirpimas remontas kryžius papildant 6 grupė
( ERCC6
) su skrandžio vėžio riziką ir nustatė, kad PGC
genų rs4711690 C → G, rs6458238 G → A ir rs9471643 G → C polimorfizmas turėjo apsauginį poveikį prieš atrofinį gastritas [4]. PGC turėjo apsauginį poveikį normaliam skrandžio ir parodė mažą raišką skrandžio vėžio, ir apsaugos praradimas buvo susijęs su skrandžio vėžio [14] atsiradimo. ERCC6 yra DNR remonto šeimai, kuri dalyvauja remonto DNR pažaidas kancerogenezėje [15] nare. ERCC6
rs1917799 T > G polimorfizmo į promotoriaus regione buvo susijęs su padidėjusia skrandžio vėžio rizikos Kinijos gyventojų [16]. Tegul-7a yra navikas slopintuvas, o naujausi tyrimai parodė, kad brandaus atvangos 7a funkcija glaudžiai susijusi su dažnis ir plėtros skrandžio vėžiu, o sumažėjo išraiška atvangos 7a yra susijęs su piktybinio biologinio elgesio [17], [ ,,,0],18]. Tačiau, leiskite-7a genetiniai variantai nebuvo tiriama jų asociacijų bei skrandžio vėžio riziką. Rs10739971 yra SNP yra -559 BP prieš srovę tegul-7a-1, kuris gali būti rengėjas regionas tegul-7a-1. Į Hapmap duomenų, minimali alelio dažnis rs10739971 yra ≥5% abiejose europiečių ir azijiečių. Bet ar yra tarp rs10739971 ir ligų riziką bei sąveikos tarp rs10739971 ir kitų polimorfizmas asociacija, lieka nežinoma. Mes iškėlė hipotezę, kad minėti variantai gali būti optimalūs kandidatai ištirti galimus SNP-SNP sąveiką dviejų ar daugiau lokusų, prisidedančių prie skrandžio vėžio etiologiją.

Šiuo atveju kontrolinio tyrimo, naudojant Kinijos gyventojų, mes ištirtas asociacija pri-tegul-7a-1 rs10739971 su skrandžio vėžio rizika ir sąveika poveikis Mirna let-7a-1 rs10739971 polimorfizmo ir PGC parsisiųsti ir ERCC6
polimorfizmas mėginiuose pati grupė, ir aptarti jos taikymo perspektyvas skrandžio vėžio ir jos ikivėžinių ligų. Mūsų žiniomis, tai pirmasis tyrimas bandant įvertinti galimą SNP-SNP sąveiką Mirna VNP-ai ir genų SNP dviem ar daugiau lokusų padariusiems skrandžio vėžio jautrumą. Tikėjomės rasti derinius genų genų polimorfizmas, kad galėtų prognozuoti skrandžio vėžiu ir jo ikivėžinius ligų riziką ir teikti eksperimentinę įrodymus, anksti diagnozuoti skrandžio vėžį.

metodų

Pacientams

šiame tyrime iš 1834 asmenų iš viso, kurioje dalyvavo 471 skrandžio vėžiu pacientams, 646 gleivinės atrofijos gastritas pacientams ir 717 kontrolę, buvo retrospektyviai įdarbinti iš pacientų, kuriems atliekama gastroskopija tyrimo patikrą, Zhuanghe regione ir pacientų, kuriems buvo atlikta gastroskopija tyrimas ar skrandžio operacijos metu pirmasis filialas ligoninės Kinijos medicinos universiteto, Liaoning Province, Kinija nuo 2002 ir 2011 nevalgius veninio kraujo buvo surinkta ir visi dalyvaujantys dalyviai buvo diagnozuota remiantis jų gastroscopic ir histopatologinių egzaminus. Skrandžio vėžys buvo diagnozuotas remiantis PSO kriterijais, ir atrofinių gastritas ir paviršiniai gastritas buvo klasifikuojami pagal Sidnėjaus klasifikaciją. Tinkamos kontrolės buvo tie dalyviai, kurių normalus skrandžio ar tik gastritas pagal gastroscopic ir patologiniai tyrimai ir neturėjo kitų ligų.

Studijos dizainas buvo patvirtintas Žmogiškųjų etikos komiteto Kinijos medicinos universiteto (Shenyang, Kinija ). Parašė informuotas sutikimas buvo gautas iš visų dalyvių. Medicinos istorijos (įskaitant amžių, lytį, rūkymą ir alkoholio vartojimą) buvo gautas klausimyną ir įrašai buvo kompiuterizuota. Kiekvienas individas dalyvauja tyrime jeigu parašyta informuoto sutikimo dėl epidemiologinį tyrimą. Išsamios dalyvis charakteristikos yra apibendrinti 1 lentelėje

Genomo DNR išgauti

Genomo DNR buvo išskirta naudojant anksčiau aprašytą metodą su nežymiais pakeitimais [19]. Trumpai tariant, sušaldyti krešulys (500 pl) buvo įtraukta į 800 įxL TE buferiu (triethanolamide), gerai sumaišyti ir centrifuguojamas 10000 × G
5 min skirstytis krešulys. Taip krešulio sutrikimo, 400 pL TE, 25 pL 10% SDS ir 5 pL 20 mg /ml proteinazės K buvo pridėta ir inkubuojamos 37 ° C temperatūroje per naktį. Supernatantas buvo ekstrahuojamas ir buvo prideda lygią tūris fenolio. Mėgintuvėlis buvo dedamas ant rotatoriaus 15 min ir tada centrifuguojamas 10000 × "g
15 min. Supernatantas buvo pašalintas ir antrojo ekstrahavimo buvo atlikta su susideda iš vienodo tūrio fenolio ir chloroformo (1:1) mišinio to. Taip centrifuguojant, supernatantas buvo pašalintas ir trečiąją ekstrakciją buvo atlikta su susideda iš vienodo tūrio chloroformo to. Taip centrifuguojant, supernatantas buvo absorbuojamas ir buvo pridėta ir inkubuojami 2 h -20 ° C temperatūroje dvi apimtys baltymų, kurie kritulių tirpalo (dviem tūriais absoliučiame etanolyje, kurio sudėtyje yra 10% 3 mol /l natrio acetato). Kiekvienas mėginys buvo centrifuguojamas 10000 × G
10 min. Po centrifugavimo, gautas DNR granulių praplautos 75% etanolio ir centrifuguojamas 10000 × "g
už 10 min. 75% etanolis nupilamas ir vamzdis apverčiama ant švarios sugeriamojo popieriaus 30 min. Gautas DNR buvo regeneruotas TE buferyje ir laikomi -20 ° C temperatūroje, kol naudojimo.

SNP genotipo

DNR mėginiai buvo praskiestas iki darbo koncentracija 50 ng /mikrol, prieš genotipavimo. Buvo atlikti, gruntas dizainas, ir genotipo 29 polimorfizmo svetainių atrinktų kandidatu susijusį geną tyrimo visi buvo atliktas CapitalBio (Pekinas, Kinija), naudojant Sequenom MassARRAY platforma (Sequenom, San Diego, CA, JAV) 2011 nuo 2011 gegužės iki gruodžio remiantis gamintojo nurodymus, [4], [20]. Penki iš 29 polimorfizmas buvo toliau pasirinktas sąveikos analizė Šiame tyrime. Norėdami įvertinti genotipo kokybę, 5% pakartotiniai mėginiai buvo genotipą ir rezultatai buvo 100% atitinka.

aptikimas H. pylori serume

serologiniams H. pylori
buvo atliekama siekiant patikrinti, H statusą. pylori
infekcija naudojant ELISA ( h. pylori
-IgG IFA komplektas, BIOHIT Plc ", Helsinkis, Suomija), kaip aprašyta anksčiau [21]. Teigiamas buvo vertinami kaip H titras. pylori
-IgG didesnis nei 34EIU (cut-off "vertės, kurią protokolą). Trumpai tariant, serumo mėginiai buvo atskiestas 1:200 (5 iL + 995 pl) su skiedikliu buferio ir gerai sumaišyti. Tada 100 įxL tuščiojo tirpalo, kalibravimo ir kontrolines ir praskiesti mėginiai buvo įtraukta į šulinius. Plokštelė buvo padengta inkubavimo viršelio ir inkubuojami 30 min 37 ° C temperatūroje. Po inkubacijos, šulinius, buvo plautos penkis kartus su 350 pL Praskiestojo (1:100) plovimo buferiu ir plokštelė švelniai patapšnoti kelis kartus ant filtro popieriaus. Tada 100 pL mišrių konjuguota tirpalo buvo pridėta į duobutes 30 min 37 ° C temperatūroje. Po inkubacijos, šulinius, vėl buvo išplauti ir 100 pL mišrių substrato tirpalo buvo pridėta į šulinėlius prieš inkubavimą 30 min kambario temperatūroje (20-25 ° C) tamsioje aplinkoje. Galiausiai, 100 pL mišrių langelio tirpalas buvo įtraukta ir absorbcija buvo perskaitytas 450 nm per 30 min.

Statistinė analizė

Visi statistinės analizės buvo atlikta naudojant SPSS 16.0 programos (SPSS, Čikaga , IL, JAV). Pearsono χ ^{2 testai buvo naudojami įvertinti skirtumus tarp lyčių atveju ir kontrolines grupes. ANOVA buvo atliktas siekiant įvertinti bet kokius skirtumus tarp epochų skirtingų grupių. buvo atlikta Galimybė santykis testai įvertinti sąveikos poveikį skrandžio vėžio rizika, lyginant modelį, kuris dalyvauja tik pagrindinius efektus ir visą modelį, kuris taip pat yra sąveikos terminą. P
-Pridėtinės. ≪ 0,05 visiems dvipusių bandymų buvo laikomas statistiškai reikšmingas}

Rezultatai

Pagrindinė poveikis analizuoja atskirų polimorfizmas

mūsų ankstesniame tyrime, mes nustatėme, kad pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas buvo reikšmingai susijęs su padidėjusia rizika atrofinį gastritas (OR = 2,59 P pervežimas = 0,018) mažesnėse studijų gyventojų, bet reikšmingo asociacijos buvo nustatyta, kad toliau patvirtinimo tyrimą kartu su didesne populiacijos (neskelbtų duomenų); PG , C
rs4711690, rs6458238 ir rs9471643 polimorfizmas buvo reikšmingai susijęs su padidėjusia rizika atrofinį gastritas ( P
= 0,093, arba = 0.75 P
= 0,015, ARBA = 0.73; P
= 0,033, arba = 0,69, atitinkamai) [4]; ERCC6
rs1917799 polimorfizmas buvo reikšmingai susijęs su padidėjusia rizika susirgti skrandžio vėžiu (OR = 1,38 P
= 0,035) [20].

Apie dvipusis sąveika PRI -ėlis-7a-1 rs10739971 ir PGC, ERCC6 polimorfizmas į skrandžio vėžio /atrofinį gastritas

rizikos ištirti, ar genų polimorfizmas ir Mirna polimorfizmas turėjo sąveikos poveikį, analizavo sąveiką Mirna polimorfizmo ir kiekvieno geno polimorfizmo , Mes nustatėme, kad Mirna polimorfizmas ir PGC parsisiųsti ir ERCC6
polimorfizmas smarkiai statistinę asociacijos skrandžio vėžio ar atrofinį gastritas. Taigi, mes analizuojama sąveika poveikį pri let-7a-1 rs10739971 polimorfizmo ir PGC parsisiųsti ir ERCC6
polimorfizmas ir jo asociacijos, su skrandžio vėžio ir atrofinį gastritas riziką. Rezultatai parodė, kad pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas ir ERCC6
rs1917799 polimorfizmas buvo sąveikos poveikį skrandžio vėžio rizika ( P
_{sąveika = 0,026, 2 lentelė). Tai SNP pora parodė padidėjusią riziką skrandžio vėžio (OR = 2,59, 95% PI = 1.12-5.97). Pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas ir PGC
rs65458238 ir rs9471643 polimorfizmas buvo sąveikos poveikis už atrofinį gastritas rizika ( P
sąveika = 0,012 ir 0,039, atitinkamai, lentelė 3). Dėl rs65458238 polimorfizmo, SNP pora parodė padidinta rizika atrofinį gastritas (arba = 2.77, 95% PI = 1,25-6,13); o kita SNP pora parodė sumažėjo rizika atrofinį gastritas (ARBA = 0,52, 95% PI = 0,28-0,97) už rs9471643 (3 lentelė).}

SNP-SNP sąveika tarp kelių SNP naudojant logistinės regresijos

toliau nagrinėjo SNP-SNP sąveiką dalyvauja trys teigiami SNP (pri-tegul-7a-1 rs10739971- PGC
rs6458238- PGC
rs9471643) ir rezultatas buvo statistiškai reikšmingas ( P
_{sąveika = 0,001, 4 lentelė). SNP derinys parodė padidėjusią riziką atrofinį gastritas (OR = 23.55, 95% PI = 3,73-148,71).}

Diskusijos

Polimorfizmas genų ar Mirna gali tarnauti kaip galimą biologinių žymeklių prognozuoti ligų riziką , Ankstesni tyrimai daugiausia dėmesio skiriama vieno geno polimorfizmo su rizikos susirgti asociacijos ir rizika dažnai buvo silpnas poveikis (OR < 1,5). Kaip ir dviejų ar daugiau SNP-SNP sąveikos kartu, rizika buvo dažnai iš vidutinio sunkumo (OR≥1.5) ar stipri efekto (OR≥2) [4], [10], [22] - [24]. Šis tyrimas pirmą kartą ištirtas sąveikos poveikį Mirna polimorfizmo ir PGC parsisiųsti ir ERCC6
polimorfizmas į Šiaurės Kinijos gyventojų. Tyrimas siekiant pateikti eksperimentiniai įrodymai anksti diagnozuojant ir mechanizmų skrandžio vėžio rasti derinius genų genų polimorfizmas, kad galėtų prognozuoti skrandžio vėžiu ir jo ikivėžinius ligų riziką.

Tarp VNP-ai iš mūsų grupė tyrė mūsų kandidatės genas asociacijos tyrimo metu ERCC6
vieno lokuso parodė silpną poveikį skrandžio vėžio rizika (arba = 1.46) [16]; Trys PGC
vieno lokuso parodė silpną apsauginį poveikį atrofinį gastritas rizikos (arba rs4711690 = 0,75 arba už rs6458238 = 0,73 arba už rs9471643 = 0,69) [4]. Todėl hipotezę, kad šie polimorfizmas gali būti optimalūs kandidatai ištirti galimus SNP-SNP sąveiką dviejų ar daugiau lokusų prisidedama prie skrandžio vėžio etiologiją. Mes atlikome sąveikos poveikio analizę Mirna polimorfizmo ir genų polimorfizmas ir rado tris SNP-SNP poras, susijusias su ligų, iš kurių viena pora sąveika (pri-tegul-7a-1 rs10739971- ERCC6
rs1917799) buvo susijęs su skrandžio vėžio rizika, o kitų dviejų porų sąveika (pri-tegul-7a-1 rs10739971- PGC
rs65458238 ir pri-tegul-7a-1 rs10739971- PGC
rs9471643) buvo susiję su atrofinį gastritas rizika. ERCC6
rs1917799 polimorfizmas ir PGC
rs6458238 ir rs9471643 polimorfizmas buvo pranešta anksčiau. Šiame tyrime mes papildomai analizuojami pri let-7a-1 rs10739971 polimorfizmas toje pačioje grupėje. Iš pri let-7a-1 rs10739971 polimorfizmo pora ir ERCC6
rs1917799 polimorfizmas turėjo ar jų sąveikos 2.59 skrandžio vėžio rizika, kuri buvo didesnė nei jų individualių vieno lokuso poveikį 0,92 ir 1,07, atitinkamai. Panašiai pora pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas ir PGC
rs6458238 polimorfizmas turėjo savo sąveikos 2.77 už atrofinį gastritas rizika, kuri buvo didesnė nei jų individualių vieno lokuso poveikį 0,74 AR ir 1.23, atitinkamai. Iš pri let-7a-1 rs10739971 polimorfizmo pora ir PGC
rs9471643 polimorfizmas turėjo ar jų sąveikos 0,52 už atrofinį gastritas rizika. Įdomu tai, kad jų pavieniai vienos lokusas poveikis prieštarauja pirmiau pateiktų išvadų, su arba 1,65 ir 1,06, atitinkamai, kuris vertas dar nepriklausomą replikaciją mūsų išvadas.

Kadangi pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas parodė sąveikos reiškiniai ir PGC
SNP apie atrofinį gastritas rizikos, mes dar atliekami sąveikos analizę trijų teigiamų polimorfizmas. Rezultatai parodė, kad už atrofinį gastritas rizika arba buvo 23,55 ( P
= 0,001). Paprastai, vieno lokusas turi silpną poveikį (ARBA < 1,5) ligų riziką, bei iš dviejų ar daugiau SNP-SNP sąveikos derinys dažnai rodo vidutinio dydžio (OR≥1.5) arba stiprų poveikį (OR≥2). Šioje tyrime pri-tegul-7a-1 vieno lokuso, arba buvo 1,61; AR sąveikos reiškiniai ERCC6
ir PGC
buvo tiek daugiau nei 2; Šių trijų teigiamų lokusų derinys parodė dar didesnį arba 23.55. Šie rezultatai parodė, paraiškos perspektyvas dviejų ar daugiau VNP-ai, kaip potencialių biologinių žymenų prognozuoti ligų riziką derinys.

Tiriant sąveiką poveikį Mirna polimorfizmas ir genų polimorfizmas prisidės prie išsamų supratimą apie genų tinklas ir vaidmuo Mirna į patogeniškumo procese. Teisingumo SNP-SNP sąveikos dažnai turi pagrindinius mechanizmus, o ne tik statistinius duomenis [9]. Trys poros VNP-ai nurodė, kad Mirna gali sąveikauti su genais skrandžio kancerogenezėje. PGC baltymas turi apsauginį poveikį normaliajai skrandžio epitelį ir jos išraiška sumažėjo į atrofinį gastritas grupės, lyginant su įprastu grupės [14], [25]. Tikslus vaidmuo PGC į atrofinį gastritas vis dar nėra aiški. ERCC6 dalyvauja DNR remonto kelyje, ir pakartojo DNR pažeidimus ir remontas gali sukelti ląstelių kancerogenezėje [15]. Remiantis šiame tyrime išvadomis, ji yra protinga manyti, kad leisti-7a gali dalyvauti PGC skatinančius atrofijos gastritas ir ERCC6 skatinančius skrandžio vėžio procesus. Pagal rezultatus Mirna tikslas prognozavimo programinės įrangos, buvo galimi jungimosi vietų tegul-7a su 3'-UTR abiem PGC parsisiųsti ir ERCC6
. Nesvarbu SNP-SNP sąveikos poveikis pastebėtas šiame tyrime buvo, nes jungiasi Mirna ir jos tikslinių genų dar reikia toliau funkcinius bandymus.

Šis tyrimas turėjo keletą trūkumų. Pirma, nors mes turėjome santykinį didelį imties dydis 471 skrandžio vėžiu sergančių pacientų, 645 atrofijos gastritas pacientams ir 717 kontrolės, tai imties dydis vis dar gali būti nepakankamos siekiant nustatyti sąveikos poveikį, ypač retų alelių. Antra, reikia patikslinti asocijuotų SNP-SNP sąveikos mechanizmai, ir vėlesni funkciniai bandymai yra privalomi. Trečia, keletas genomo asociacijos tyrimai rodo, kad duomenų genomo asociacijos tyrimų skrandžio vėžiui iš Kinijos gyventojų integraciją; Todėl, duomenys turėtų būti integruotos, ir gali būti naudojamas kaip kandidatas polimorfizmo svetainėms būti tiriamas ateityje. Ketvirta, tarp geno ir aplinkos sąveika skrandžio vėžio riziką yra svarbus veiksnys į kuriuos reikia atsižvelgti, pavyzdžiui, rūkymas ir alkoholio vartojimas. Šiame tyrime mes surinkti tam tikrus duomenis apie rūkymo ir gėrimo, bet vis dar beveik Trūkstamų duomenų iš pavyzdžių trečdaliu. Reikėtų išnagrinėti sąveika genų ir rūkymas ir alkoholio vartojimas elgesio skrandžio vėžio riziką.

Išvada

Šis tyrimas pirmą kartą, praneša, kad pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas ir ERCC6
rs1917799 polimorfizmas gali turėti sąveikos poveikį skrandžio vėžio rizika; ir pri-tegul-7a-1 rs10739971 polimorfizmas gali turėti sąveikos poveikį su PGC
rs6458238 ir rs9471643 polimorfizmas apie atrofinį gastritas rizika. Kai kurie duomenys buvo surinkti numatant galimą statybos skrandžio vėžys tinklo keliu. Ateities didelio masto tyrimai ir mechanizmo eksperimentai patvirtinti šio tyrimo išvadas.

• PLoS ONE: kompensacinė vaidmuo NF-κB į p53 Atsakas į 5-FU chemoterapijos skrandžio vėžio ląstelių linijas
• PLoS ONE: Darbo išteklių naudojimo endoskopinių Skrandžio vėžio atrankinės patikros Japonijos pirminės priežiūros aplinką: darbo Atranka Study