PLoS ONE: En genetisk polymorfisme i TOX3 er assosiert med overlevelse av magekreft i en kinesisk Befolkning

Abstract

Formål

Nylig genetisk polymorfisme (rs3803662C > T) i TOX3
ble rapportert å indusere risikoen for brystkreft. I denne studien hypotese vi at rs3803662 kan påvirke mage kreft overlevelse utfall.

Metoder

Med multiplex Snapshot metode, vi genotypet TOX3
rs3803662 i 880 mage pasienter med kirurgisk reseksjon . Sammenhengen mellom genotype og overlevelses utfall ble utført av Kaplan-Meier metoden, Cox regresjonsanalyse modeller og log-rank test.

Resultater

Det var ingen sammenheng i analysene av rs3803662 og overlevelse av magekreft. Men stratifisert analyse ved histologi viste at rs3803662 CT /TT genotype var assosiert med en signifikant bedre overlevelse for diffus-type magekreft (log-rank p
= 0,030, hazard ratio [HR] = 0,67, 95 % konfidensintervall [CI] = 0,46 til 0,96), enn CC genotype. I tillegg var spesielt tydelig hos magekreftpasienter med tumorstørrelse >denne gunstige effekt;. 5 cm, T3 og T4 dybde av invasjon, lymfeknutemetastase, ingen drikking, ingen fjernmetastaser, ingen kjemoterapi og magekreft cardia

Konklusjoner

TOX3
rs3803662 kan spille en viktig rolle i den prognostiske utfallet og behandling av magekreft, spesielt kanskje mer hjelp i å forklare den reduserte risikoen for død forbundet med diffuse-type magekreft .

Citation: Zhang X, Zhu H, Wu X, Wang M, Gu D, Gong W, et al. (2013) En genetisk polymorfisme i TOX3 er assosiert med overlevelse av magekreft i en kinesisk befolkning. PLoS ONE 8 (9): e72186. doi: 10,1371 /journal.pone.0072186

Redaktør: Xiaoping Miao, MOE Key Laboratory for miljø og helse, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Kina

mottatt: 29 april 2013; Godkjent: 06.07.2013; Publisert: 17.09.2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Finansiering:. Arbeidet ble støttet med tilskudd fra National Natural Science Foundation of China til Dr. J Chen (Grant nr 81071641), Dr. Z Xu (Grant nr 81000880); et stipend fra National Basic Science Research Program til Dr. J Chen (2013CB911300); et stipend fra Jiangsu Provincial 12. femårsprogram på Developing Health av teknologi og utdanning Prosjekt til Dr. J Chen, Dr. H. Zhu (Grant nr 81001274), Dr. Z Zhang (30972444, 81230068 og BK2010080), Dr. M. Wang (81102089 og BK2011773), Qin Lan-prosjektet i Jiangsu Provincial Department of Education, og ved Priority Academic Program Utvikling av Jiangsu høgskolerådet (Public Health og forebyggende medisin). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

Innledning

Magekreft kreft~~POS=HEADCOMP er den fjerde vanligste typen ondartet svulst i verden og den ledende årsak til kreft dødsfall i Kina, Japan og østeuropeiske land [1]. En systematisk behandling inkludert kirurgi, cellegift, strålebehandling og målet terapi kan gi en kur for pasienter med avansert magekreft [2]. Til tross for dette, overlevelse hos pasienter med avansert magekreft er fortsatt dårlig. Magekreft er en kompleks og multifactor sykdom som antas å skyldes en interaksjon mellom genetisk bakgrunn og miljøfaktorer. Noen studier har antydet at Helicobacter pylori product: ( H. Pylorus
) infeksjon, salt bevarte matinntak og tobakksrøyking er viktige eksogene faktorer, og øke risikoen for magekreft [3], [ ,,,0],4]. Omfattende epidemiologiske studier har vist at genetiske varianter, og særlig enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs), er sannsynlig å modulere virkningen av miljømessige risikofaktorer ved å modifisere funksjonene i forskjellige biologiske mekanismer som er involvert i gastrisk karsinogenese i respons på miljøeksponering. I de senere årene har flere vanlige lavt penetrant gener er identifisert som potensielle magekreft resistens genetiske varianter, for eksempel glutation S-transferase M1 ( GSTM1
) polymorfisme. Det har blitt funnet genetisk variant kan være en nyttig markør for å forutsi prognosen for pasienter med magekreft. Tidligere studier rapporterte PSCA
rs2294008 og APE1
rs1760944 er forbundet med magekreft overlevelse [5], [6].

TOX3
genet, en medlem av høy mobilitet gruppe familie av ikke-histone kromatin proteiner, også kalt trinucleotide gjenta inneholder 9 ( TNRC9
) genet ligger på kromosom 16q12 [7]. Dette genet regulerer Ca2 + -avhengig nevronale transkripsjon gjennom interaksjon med cAMP-respons-element-bindende protein (CREB) [8]. I normale humane vev, TOX3
er i stor grad uttrykt i sentralnervesystemet (CNS), i ileum, og i hjernen i det frontale og occipitale lobe. TOX3
overekspresjon induserer transkripsjon innebærer isolert østrogen-responsive elementer og østrogen-responsive arrangører, og beskytter nerveceller fra celledød forårsaket av endoplasmatisk retikulum stress eller BAX overekspresjon gjennom induksjon av anti-apoptotiske utskrifter og undertrykkelse av pro- apoptotiske transkripsjoner [9]. Det har vært antydet at rs3803662 (en C > T overgang) i TOX3
var forbundet med en økt risiko for brystkreft hos både BRCA1 og BRCA2-mutasjonsbærere og østrogen reseptor (ER) positive pasienter [10]. I tillegg Fasching et al. rapportert rs3803662 ( TOX3
) var assosiert med OS av brystkreft [11]. Denne foreningen ble sett på samme måte i andre studier som viste at når overlevelse ble analysert i henhold til molekyl subtyper, pasienter diagnostisert med luminal A svulster som bar risiko allelet hadde kortere OS sammenlignet med pasienter homozygote for de ikke-risiko allel [12].

imidlertid GWAS fokusert på en loci polymorfisme ved TOX3
genet som er forbundet med brystkreft overlevelse, spesielt i østrogenreseptoren (eR) positive pasienter. Noen studier antydet at ER uttrykk var assosiert med overlevelse av magekreft [13]. Derfor kan variant identifisert i brystkreftstudier har samme effekt på magekreftrisiko. En sammenslutning av genetisk variasjon i TOX3
med magekreft overlevelse ble gjennomført i vår studie. Vi hypotese at TOX3
rs3803662 er forbundet med magekreft overlevelse i en kinesisk befolkning, som kan identifiseres som en uavhengig prognostisk markør for magekreft overlevelse.

Study befolkningen

studien ble utført på totalt 1022 magekreftpasienter med kirurgisk fjerning av svulsten ved Yixing Folkets sykehus, Yixing City, Folkerepublikken Kina (PR Kina), fra januar 1999 til desember 2006 [6]. Alle pasientene ble verken administreres av adjuvant strålebehandling eller kjemoterapi før kirurgisk reseksjon. I vår studie befolkning, ble alle analysene begrenset til kinesisk. Innen maksimalt 119,0 måneders oppfølging periode, ble 78 pasienter ekskludert fra vår studie for mangler av nok oppfølging informasjon. Denne studien ble godkjent av Institutional Etikk Review Board of Nanjing Medical University, og alle deltakerne ga skriftlig informert samtykke.

Utfall samling

Total overlevelse var den viktigste studieslutt. Pasienter i live på den siste oppfølgingsdato ble vurdert sensurert og mage kreft-relaterte dødsfall ble definert som dødsfall. Overlevelsestiden ble definert som datoen fra kreft kirurgi til magekreft -relaterte dødsfall eller siste oppfølging. Dato av død ble innhentet fra innleggelse og polikliniske poster eller slektninger av pasienter ved oppfølging telefonsamtaler. Informasjon fra patologiske parametere på tumorlokalisering, histotype, invasjon, lymfeknute, fjernmetastaser status, drikking og røyking status ble også oppnådd for mage kreftpasienter. Lauren kriterium ble anvendt i å klassifisere tumorer i tarm-type eller diffus-type magekreft [14]. TNM stadium av sykdommen ble målt i henhold til amerikanske Joint Commission for Cancer Staging (AJCCS) [15]. Det var 306 pasienter behandlet med adjuvant kjemoterapi med ulike regimer etter operasjonen. Den terapeutiske regime inkludert FOLFOX4, FOLFOX6, XELOX og så videre. Vår studie ble godkjent av Institutional Review Board of Nanjing Medical University, Nanjing, Kina.

Pasienter og metoder

Genotyping

Genomisk DNA ble ekstrahert fra vevsprøver av proteinase K fordøyelse, isopropanol ekstraksjon og etanolutfelling [6]. TOX3
(rs3803662) SNPs ble undersøkt ved multiplex snapshot teknologi ved hjelp av en ABI fluorescens-basert analyse alleliske diskriminering metode (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) som beskrevet tidligere [16]. De SNPs ble analysert ved hjelp ABI3130 genetisk analysator og genotypene ble bestemt ved hjelp Genemapper4.0 programvare (Applied Biosystems). Faktisk ble 880 kvalifiserte mage pasienter inkludert i den endelige analysen, ble 64 tilfeller ekskludert fra videre analyser på grunn av DNA kvalitet mislykkes i genotyping. Om lag 10% av prøvene ble tilfeldig valgt for bekreftelse ved gjentatt genotyping; Resultatene var 100% konkordant.

Statistisk analyse

Påvirkningen av TOX3
variant på magekreft overlevelse ble estimert av Kaplan-Meier overlevelseskurver og log-rank test. Tre genetiske modeller (codominant, dominerende og recessive) ble brukt for å vurdere sammenslutning av TOX3
rs3803662 med overlevelse utfallet av mage kreftpasienter. Alle P
verdier i denne studien var to-sidig. P
< 0,05 ble ansett som statistisk signifikans. De grove hazard ratio (HRS), deres 95% konfidensintervall (CIS) og justert timer ble estimert ved Cox regresjonsanalyse. Cox trinnvis regresjonsanalyse ble også utført for å bestemme prognostisk faktor i magekreft, med et signifikansnivå på P
< 0,05 for inn og P
> 0,10 for å fjerne de respektive forklaringsvariablene. Gjennomsnittlig overlevelsestid ble gitt når median overlevelsestid (MST) ikke kan beregnes. Alle de statistiske analysene ble utført med SPSS programvare.

Resultater

Egenskaper og clinicopathological funksjoner av pasienter

Egenskaper og clinicopathological egenskapene til slutt 880 mage kreftpasienter i dette studiet er oppsummert i tabell 1. prosent~~POS=TRUNC av hannene var 76,9%. Antallet pasienter døde under oppfølging ble 408. Univariat Cox regresjonsanalyse av de patologiske parametrene viste at tumorstørrelse, histologi, dybden av invasjonen, lymfeknutemetastase, fjernmetastaser og TNM stadium var signifikant assosiert med overlevelse (alle P
< 0,05, log-rank test). Spesielt diffuse-type mage kreftpasienter hadde signifikant høyere risiko for død, sammenlignet med intestinal-type mage kreftpasienter (HR = 1,46, 95% CI = 1,19 til 1,79). Og pasienter med tumorstørrelse ≤5 cm hadde en 41% betydelig økt overlevelse, sammenlignet med dem med tumorstørrelse > 5 cm (HR = 1,41, 95% CI = 1,16 til 1,71). I tillegg, som dybden av invasjon og TNM trinnet økes, lymfeknutemetastase og fjernmetastaser utvidet, og deretter overlevelsestiden av magekreft reduseres betraktelig tilsvar (log-rank P
< 0,001 til dybden av invasjon, TNM stadium og lymfeknutemetastase,. log-rank P
= 0,031 for fjernmetastaser)

Effekter av rs3803662 på magekreft overlevelse

Som vist i tabell 2, sammenslutninger av TOX3
rs3803662 genotyper med magekreft overlevelse i ulike genetiske modeller ble vurdert av Cox regresjonsanalyser. Ingen statistisk signifikante forskjeller ble funnet mellom overlevelsen av magekreft og genotyper i alle genetiske modeller. For evaluering av foreningen, ble pasientene stratifisert ved histologi med intestinal-type og diffuse-type magekreft. Som et resultat ble rs3803662 funnet å være assosiert med en signifikant positiv effekt blant diffuse-type (log-rank P
= 0,030, fig. 1), men ikke intestinal-type (log-rank P
= 0,720, fig. 2) magekreftpasienter i dominerende modellen. Cox regresjonsanalyse viste at pasienter med diffuse-type magekreft bærer CT /TT genotype redusert en 33% risiko for død signifikant (HR = 0,67, 95% CI = 0,46 til 0,96), sammenlignet med de som var CC bærere.

stratifisert analyser blant diffus-type magekreft

TOX3
rs3803662 ble undersøkt med overlevelse av magekreftpasienter diffuse-type ved stratifisert analyse av tumorstørrelse, histologi, dybden av invasjonen, lymfeknutemetastase, fjernmetastaser, TNM stadium, drikking status, og svulststedet. Som vist i tabell 3, etter justering for kovariatene som alder og kjønn, redusert risiko for død var mye tydelig blant pasienter med tumorstørrelse > 5 cm (HR = 0,35, 95% CI = 0,21 til 0,56), T3 og T4 dybde av invasjon (HR = 0,63, 95% CI = 0,42 til 0,94 for T3, HR = 0,07, 95% CI = 0,01 til 0,83 for T4), lymfeknutemetastase (HR = 0,62, 95% CI = 0,41 til 0,93), ingen fjernmetastaser (HR = 0,68, 95% CI = 0,46 til 1,00), ingen drikking (HR = 0,63, 95% CI = 0,43 til 0,92), ingen kjemoterapi (HR = 0,54, 95% CI = 0,34 til 0,86) og mage hjerte kreft (HR = 0,50, 95% CI = 0,25 til 1,00). Selv om pasienter med T1 dybden av invasjonen og scene jeg viste en tilsvarende bedre resultat, kan det ha vært en suboptimal statistisk styrke til å påvise en statistisk forskjell i overlevelse tid på grunn av lite antall pasienter i disse undergruppene. I motsetning til dette syntes det å være en dårlig overlevelse hos pasienter med tumorstørrelse ≤5 cm og drikker selv om det ikke er statistisk signifikant. I tillegg ble en multivariat trinnvis Cox regresjonsanalyse også brukt til å bekrefte en uavhengig rolle rs3803662 genotyper i magekreft overlevelse diffus-type. Fem variabler (drikke, lymfeknutemetastase, tumor språk, kjemoterapi og rs3803662) ble inkludert i regresjonsmodellen med et signifikansnivå på 0,05 for å legge inn og 0,10 for å fjerne en variabel (data ikke vist). Når alder og kjønn ble inkludert i den endelige modell, ble rs3803662 CT /TT genotype viste å være en betydelig gunstig prediktor for overlevelse av diffust-type magekreft. (CT /TT vs. CC: HR = 0,63, 95% CI = 0,43 til 0,90) (tabell 4)

Diskusjoner

I denne studien undersøkte vi effekten av TOX3
rs3803662 på overlevelse av mage kreftpasienter. Dominerende modellen var den beste sittende modell for TOX3
rs3803662. Den rs3803662 CT /TT genotype viste en signifikant sammenheng med bedre overlevelse blant magekreftpasienter diffus-type. En slik forskjell ble ikke funnet for mage kreftpasienter intestinal-type. Mekanismen for mage kreft overlevelse mønstre som ble variert ved histologiske subtyper er ikke avklart. Resultatene er forskjellige ved de to store histologiske typer av magekreft kan skyldes deres divergere i mange kliniske egenskaper og molekyl, inkludert deres etiologi, epidemiologi, karsinogenese og progresjon, mRNA og /eller protein ekspresjon profil, gen kopiantall, mikro ustabilitet, tap av heterozygositet og mutasjon profil [17]. Videre, gitt effekten av TOX3
på nerveceller [9], kan rs3803662 øke overlevelsen av diffuse-type magekreft i en dominerende modellen attributt å bebo en vertscelle inn i en svulst celle eller kreftceller formere raskt av ukjente mekanismer. I vår studie er ingen drikking en beskyttende faktor for diffus-type magekreftpasienters overlevelse, kan det ses at primærforebygging popularisert i folks daglige liv vil være gunstig for å redusere risikoen for dødsfall blant diffus-type magekreft. Så langt vi kjenner til, er dette den første studien som undersøker sammenhengen mellom TOX3
rs3803662 og magekreft overlevelse. Våre funn gir støtte for genombaserte studier av magekreft overlevelse, spesielt til kinesiske populasjoner.

Gene-genet interaksjon er et hett tema i genetisk epidemiologi, inkludert prognose studien. Ikke en eneste locus kan fullt ut forklare deres genetisk mottakelighet og prognose. Liu et al. rapporterte at de multifaktor samspill mellom polymorfismer i MMP-2, Fasl og FAS spille viktigere rolle i utviklingen av GCA. På tilsvarende måte, har de også funnet at et gen-doseeffekt i forbindelse med prognosen for pasienter med NSCLC [18], [19]. Winkelmann et al. observerte rs3803662 som er i lav LD med rs3104767 viste assosiasjon til RLS (λ-korrigert nominell P _{GWA = 7,29 × 10 ^{-7). Men logistisk regresjonsanalyse forutsetning av rs3104767 vist at denne foreningen er avhengig rs3104767 [20]. Derfor resultatene ovenfor hevet muligheten for at en kombinasjon av SNPs innenfor TOX3
eller andre steder i genet handling kumulativt for å øke risikoen.}}

Riaz et al. fant at risikoallelene av rs3803662 nær TOX3
genet ble assosiert med en lavere uttrykk for TOX3
mRNA i brystkreft og en hypotese en tumor suppressor rolle i dette genet [21]. Disse funnene tyder de kritiske rollene til TOX3
i sykdommer. Det skal bemerkes at de spesifikke SNP'er og gener relatert til prognose kan avvike fra de som er involvert i følsomhet. Likevel kan variant identifisert i brystkreftstudier har samme effekt på magekreftrisiko. Så om vi rs3803662 som forandret i prognosen for magekreft kan også påvirke høy risiko for sykdom hos pasienter som er nødvendig for å rettferdiggjøre. Hvis validert i videre forskning, TOX3
rs3803662 kan også tas som potensiell genetisk markør for magekreft mottakelighet bortsett prognose.

Noen begrensninger må vurderes når vi tolke resultatene. Først vår studie hadde blitt implementert i populasjoner av kinesisk; hvorvidt det er noen forskjell for den samme SNP i karakteristikkene og overlevelse av magekreft mellom forskjellige populasjoner behov for å bli testet videre. For det andre er mer forskning ved hjelp av større pasientpopulasjoner nødvendig for å bekrefte våre funn på grunn av en relativt liten utvalgsstørrelse i stratifisert analyse samt å utelukke muligheten for foreningen skjedde ved en tilfeldighet. Tredje, H. pylorus
er generelt akseptert å være den viktigste etiologiske for magesår sykdom samt ved adenokarsinom i [22]. Vi har imidlertid ikke undersøke på H. pylori infeksjon fordi det ikke var nok pasient klinisk informasjon.

I konklusjonen, TOX3
rs3803662 spiller en viktig rolle i overlevelse av mage kreftpasienter, spesielt kan betraktes som en uavhengig prognostisk markør av diffust-type magekreft. Viktigere, våre resultater tilby en meget lovende prospekt for utforsking og oversette våre funn inn i ytterligere potensielle kliniske og diagnostiske terapeutiske anvendelser i magekreft.

• PLoS ONE: VEZT, en Novel Antatte Tumor lyddemper, Undertrykker Vekst og tumorgenisiteten av Gastric Cancer
• PLoS ONE: Kandidat mikroRNA Biomarkører i Human Gastric Cancer: en systematisk og validering Study