PLO-ON: Genetski polimorfizmi u TOX3 je povezana s preživljenje rak želuca u kineskoj Population

Sažetak pregled

Svrha pregled

Nedavno genetičkog polimorfizma (rs3803662C > T) u TOX3 pregled je uočeno da inducira rizik od raka dojke. U ovom istraživanju, pretpostavili smo da rs3803662 bi mogli utjecati na želudac rezultate za preživljavanje raka. Pregled

Metode pregled

S multipleks metodom snimak, mi genotipiziran TOX3
rs3803662 u 880 želučanih bolesnika s kirurške resekcije , Povezanost genotipa i preživljavanja ishodima izvedeno je Kaplan-Meier metodi, Cox modela regresijska analiza i log-rank testa. Pregled

Rezultati pregled

Nije bilo udruženje u analizama rs3803662 i preživljavanja od raka želuca. Međutim, slojevita analiza histoloških nalaza su pokazali da rs3803662 CT /TT genotip povezan sa značajno boljim opstanka difuzna tipa rakom želuca (log-rank p pregled = 0.030, omjer rizika [HR] = 0,67, 95 % interval pouzdanosti [CI] = 0,46-0,96), nego CC genotipa. Osim toga, ovaj povoljan učinak je posebno očito kod pacijenata oboljelih od raka želuca s veličinom tumora >. 5 cm, T3 i T4 dubine invazije, limfnih čvorova metastaza, bez pića, bez udaljenih metastaza, bez kemoterapije i želučanog raka cardia pregled

Zaključci pregled

TOX3
rs3803662 može igrati važnu ulogu u prognostički ishod i liječenje karcinoma želuca, posebno možda više pomoći u objašnjavanju smanjen rizik od smrti povezane s difuzno tipa raka želuca . pregled

Izvor: Zhang X, Zhu H, Wu X, Wang M, Gu D, Gong W, et al. (2013) je genetski polimorfizam u TOX3 je povezana s preživljenje rak želuca u kineskoj populaciji. PLoS ONE 8 (9): e72186. doi: 10,1371 /journal.pone.0072186 pregled

Urednik: Xiaoping Miao, MOE Ključ Laboratorij za okoliš i zdravlje, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong Sveučilišta znanosti i tehnologije, Kina pregled

Primljeno: 29. travnja 2013; Prihvaćeno: 6. srpnja 2013; Objavljeno: 17. rujna 2013 pregled

Copyright: © 2013 Zhang i sur. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Rad bio podržan od potpora iz Nacionalne zaklade prirodoslovni Kine dr J. Chen (Grant br 81071641), dr Z Xu (Grant br 81000880); bespovratna sredstva iz Nacionalnog Basic Science Research programa dr J. Chen (2013CB911300); grant od Jiangsu pokrajinske 12. petogodišnjeg programa za izradu zdravlje tehnologije i obrazovanja Projekt dr J. Chen, dr H. Zhu (Grant br 81001274), dr Z Zhang (30972444, 81230068 i BK2010080), Dr. M. Wang (81.102.089 i BK2011773) je Qin Lan Projekt Jiangsu Pokrajinskog ured za obrazovanje, a po prioritetu Akademski program razvoja Jiangsu visokih učilišta (javno zdravstvo i preventivnu medicinu). U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled

U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled

rak želuca je četvrti najčešći tip malignog tumora u svijetu i vodeći uzrok smrti od raka u Kini, Japanu i zemljama istočne Europe [1]. Sustavno liječenje uključuje operacije, kemoterapije, radioterapije i ciljanu terapiju može dati lijek za pacijente s uznapredovalim rakom želuca [2]. Unatoč tome, opstanak u bolesnika s uznapredovalim karcinomom želuca i dalje loš. Rak želuca je složen i Višeparametarska bolest koja se smatra da je rezultat iz jedne interakcije između genetsku pozadinu i okolišnih čimbenika. Neke studije pokazale su da Helicobacter pylori pregled ( H. Pilorus pregled) infekcija, sol očuvan konzumacija hrane i pušenje duhana su glavni egzogeni čimbenici i povećati rizik od raka želuca [3], [ ,,,0],4]. Opsežna epidemiološke studije su pokazale da genetske varijante, posebno u jednom nukleotidu gena (SNP), vjerojatno da modulira djelovanje faktora rizika za okoliš putem mijenjanja funkcije raznih bioloških puteva koji su uključeni u želučanom karcinogenezi kao odgovor na izloženost okoliša. U posljednjih nekoliko godina, nekoliko zajedničkih niske penetrirati geni su identificirani kao potencijalni rak želuca osjetljivosti genetskih varijanti, kao što su glutation S-transferaze M1 ( GSTM1
) polimorfizma. Utvrđeno je genetska varijanta može biti koristan marker za predviđanje prognozu bolesnika s karcinomom želuca. Prethodne studije izvijestio PSCA pregled rs2294008 i APE1
rs1760944 su povezane s preživljavanjem raka želuca [5], [6]. Pregled

TOX3 pregled gen, član visoke mobilnosti grupe obitelji ne histona kromatina proteina, koji se također nazivaju trinukleotida sadrži 9 ( TNRC9 pregled) gen nalazi na kromosomu 16q12 [7]. Ovaj gen regulira ovise o Ca2 + neurona transkripciju kroz interakcije s cAMP-odgovora elementa se veže na protein (CREB) [8]. Na normalnim ljudskim tkivima, TOX3 pregled je uglavnom eksprimiran u središnjem živčanom sustavu (CNS), u ileumu i u mozgu i u frontalnom i zatiljnog režnja. TOX3 pregled prekomjernom ekspresijom inducira transkripciju uključuje izolirane estrogena reagiraju elemente i estrogena koje reagiraju promotore i štiti neuronske stanice od smrti stanice uzrokovane stresom endoplazmatski retikulum ili prekomjernoj ekspresiji Bax indukcijom anti-apoptotičkim transkripata i potiskivanja pro- apoptične transkripti [9]. On je predložio da rs3803662 (C > T prijelaz) u TOX3 Netlogu bila povezana s povećanim rizikom od raka dojke u oba BRCA1 i BRCA2-mutacije prijevoznika i estrogen receptor (ER) pozitivnih bolesnika [10]. Osim toga, Fasching et al. izvijestili rs3803662 ( TOX3 pregled) bio je povezan s operativnim sustavom od raka dojke [11]. Ova udruga je viđen sličan način u drugoj studiji koja je pokazala da kada se analizira opstanak prema molekularnih podtipova, bolesnici s luminalnog A tumora koji su nosili taj alel rizik imali kraće OS u odnosu na bolesnike homozigota za alel koji nisu rizika [12] dijagnoze.

Međutim, GWAS usmjerena na polimorfizma lokusa na TOX3 pregled gen, koji je povezan s preživljavanjem tumora dojke, pogotovo u estrogenski receptor (ER) pozitivne pacijente. Neke studije tvrde da je ER izraz bio povezan s opstankom rakom želuca [13]. Dakle, varijanta identificirati u istraživanjima raka dojke može imati isti učinak na rizik od raka želuca. Udruga genetskih varijacija u TOX3 pregled sa preživljavanje raka želuca provedeno je u našem istraživanju. Pretpostavljamo da TOX3 pregled rs3803662 je povezan s želučanim preživljavanja raka u kineskoj populaciji, koja se može identificirati kao samostalni prognostički biljeg za preživljavanje raka želuca. Pregled

stanovništvo Studija pregled

istraživanje je provedeno na ukupno 1022 pacijenata oboljelih od raka želuca s kirurške resekcije tumora u Yixing narodne bolnice, Yixing City, Narodne Republike Kine (PR Kina), od siječnja 1999. do prosinca 2006. [6]. Svi su bolesnici niti rukovodi adjuvantne radioterapije niti kemoterapije prije kirurške resekcije. U našoj ispitivanoj populaciji, sve analize su ograničene na kineskom. U roku od najviše 119,0 mjeseci perioda praćenja, 78 bolesnika su bili isključeni iz naše studije nedostaje dovoljno praćenja informacija. Ova studija je odobren od strane institucionalnog etiku pregled odbor Nanjing medicinskog sveučilišta, a svi sudionici dala pisani pristanak. Pregled

rezultati skup pregled

Ukupno preživljenje je bio glavni studija krajnja točka. Pacijenti živi na zadnjem follow-up date smatrani su cenzurirani i rak želuca smrti koje su povezane su definirane kao smrt. Vrijeme preživljenja je definirano kao dan od operacije raka na rak želuca smrti koje su povezane ili posljednje praćenja. Datum smrti je dobiven od bolničkih i ambulantnih evidencija ili rođaka bolesnika od follow-up telefonskih poziva. Informacije patoloških parametara na sijelo tumora, Histotip, invazije, limfnih čvorova, dalekoj status metastaza, piće i pušenje također su dobiveni u bolesnika s rakom želuca. Lauren je kriterij bio korišten u klasificiranju tumora u crijevnom tipa ili difuznog tipa rak želuca [14]. TNM stadij bolesti je mjeren u skladu s američkim Zajedničke komisije za rak inscenacije (AJCCS) [15]. Bilo je 306 bolesnika liječenih adjuvantne kemoterapije s različitim režimima nakon operacije. Terapijski režim uključuje FOLFOX4, FOLFOX6, XELOX i tako dalje. Naša studija je odobren od strane Institutional Review Board of Nanjing Medical University, Nanjing, NR Kina. Pregled

Bolesnici i metode

genotipa pregled

Genska DNA je izvađen iz tumorskih uzoraka po proteinaze K digestija, ekstrakcije izopropanol i etanol taloženje [6]. TOX3 pregled (rs3803662) SNP je pregledao multipleks Snapshot tehnologija pomoću metode analiza alela diskriminacije ABI fluorescentna-temeljen (tnom City, CA, USA), kao što je ranije opisano [16]. SNP-ovi analizirani su pomoću ABI3130 genetskog analizatora i genotipovi su određene pomoću softvera Genemapper4.0 (Applied Biosystems). U stvari, 880 želučani bolesnici prihvatljivi su upisani u konačnoj analizi, 64 slučaja su bili isključeni iz daljnje analize zbog kvalitete DNA nedostatku u genotipizacija. Oko 10% uzoraka su odabrani na slučajan potvrdu s ponovnom genotipa; rezultati su 100% podudaraju. pregled

Statistička analiza pregled

Utjecaj TOX3 pregled varijanta na preživljavanje raka želuca procijenjena je krivulja Kaplan-Meier preživljavanja i log-rank test. Tri genetski modeli (kodominantni, dominantnih i recesivnih) su korišteni za procjenu povezanost TOX3 pregled rs3803662 s ishodom preživljavanja pacijenata s rakom želuca. Svi P
vrijednosti u ovoj studiji bili su 2-sided. P izvoznici < 0,05 smatrana je statistički značaj. Sirove omjeri opasnosti (sati), njihovih interval pouzdanosti 95% (CIS) i namjesti HRS-a procijenjeni su Cox regresijska analiza. Cox stupnjevita regresijska analiza je provedena kako bi se utvrdilo prognostički faktor kod raka želuca, uz razinu značajnosti P izvoznici < 0,05 za unos i P izvoznici > 0,10 za uklanjanje odgovarajuće nezavisne varijable. Srednje vrijeme preživljavanja je uvjet kad ne mogu se izračunati srednja vrijednost vremena preživljenja (MST). Sve statističke analize provedene su s SPSS programa. Pregled

Rezultati

Karakteristike i kliničkopatološkim značajke pacijenti

Karakteristike i kliničkopatološkim značajke konačnih 880 pacijenata s rakom želuca u ova studija sažeti su u tablici 1. postotak muškaraca bio je 76,9%. Broj pacijenata umrlo tijekom perioda praćenja je 408. Jednosmjerna Cox regresijska analiza patoloških parametara pokazala da je tumor, histologija, dubina invazije, limfni čvor metastaze, udaljena metastaza i TNM stadij su značajno povezane s vremena preživljavanja (sve em <> P izvoznici < 0,05, log-rank test). Naime, difuzni tip bolesnika s rakom želuca, imaju značajno veći rizik od smrti u usporedbi s crijevni tipa pacijenata s rakom želuca (HR = 1,46, 95% CI = 1,19-1,79). I bolesnici s veličinom tumora ≤5 cm imala 41% značajno povećan opstanak je, u usporedbi s onima s veličinom tumora > 5 cm (HR = 1,41, 95% CI = 1,16-1,71). Osim toga, kako je dubina invazije i TNM fazi povećana je limfni čvor metastaze i udaljene metastaze proširen, a onda je vrijeme preživljavanja od raka želuca značajno smanjio u skladu s tim (log-rank P izvoznici < 0.001 za dubinu invazija, TNM stadij i čvor metastaze u limfnim;. log-rank p pregled = 0,031 za udaljenim metastazama) pregled

Efekti rs3803662 na preživljavanje raka želuca pregled

Kao što je prikazano u tablici 2, udruge TOX3 pregled genotipova rs3803662 s želučane preživljavanja raka u različitim genetskim modelima su ocijenjeni od strane analizira Cox regresijska. Nije bilo statistički značajne razlike između preživljavanja raka želuca i genotipova u bilo genetskih modela. Kako bi se dodatno procijeniti povezanost, pacijenti su poredani po histologiju s crijevne tipa i difuzna tipa raka želuca. Kao rezultat toga, rs3803662 je utvrđeno da je povezan sa značajno povoljne učinke kod difuznog tipa (log-rank P pregled = 0,030, sl. 1), ali ne i crijevni tipa (log-rank P pregled = 0.720, sl. 2) pacijenata oboljelih od raka želuca u dominantnom modelu. Cox regresijska analiza pokazala je da pacijenti s difuzno vrsta raka želuca nosi CT /TT genotip smanjuje rizik za 33% smrti značajno (HR = 0,67, 95% CI = 0,46-0,96), u odnosu na one koji su bili CC nositelji.

Slojevito analizira među difuznog tipa raka želuca pregled

TOX3
rs3803662 se ispitaju na preživljavanje oboljelih od raka želuca difuzna tipa po slojevite analize veličine tumora, histologiju, dubini invazije, limfni čvor metastaza, udaljenim metastazama, TNM stadij, pijenje status i sijelo tumora. Kao što je prikazano u tablici 3, nakon usklađivanja kovarijanata uključujući dob i spol, smanjeni rizik od smrti bio je znatno očito među pacijentima s veličinom tumora > 5 cm (HR = 0,35, 95% CI = 0,21 do 0,56), T3 i T4 dubina invazije (HR = 0,63, 95% CI = 0,42-0,94 za T3, HR = 0,07, 95% CI = 0,01-0,83 za T4), limfnih čvorova metastaze (HR = 0,62, 95% CI = 0,41 - 0,93), nema udaljene metastaze (HR = 0,68, 95% CI = 0,46-1,00), ne pije (HR = 0,63, 95% CI = ,43-0,92), bez kemoterapije (HR = 0,54, 95% CI = 0,34-0,86) i želuca rak srčana (HR = 0,50, 95% CI = 0,25-1,00). Iako bolesnici s T1 dubini invazije i fazi sam pokazao sličnu bolji rezultat, moglo bi biti ispod optimalne statistička snaga za otkrivanje statističku razliku u vremenu preživljavanja, zbog malog broja bolesnika u tim podskupine. Za razliku od toga, čini se da postoji loša preživljenja bolesnika s veličinom tumora ≤5 cm i piće, iako nije statistički značajna. Osim toga, multivarijatna postupno Cox regresijska analiza je također koristi za potvrdu nezavisnu ulogu rs3803662 genotipova u difuzna tipa preživljavanje raka želuca. Pet varijable (piće, limfni čvor metastaza, tumora na mjestu, kemoterapije i rs3803662) su uključene u regresijski model s razinom pouzdanosti od 0.05 za ulazak i 0,10 za uklanjanje varijablu (podaci nisu prikazani). Kad dob i spol su uključeni u konačni model, rs3803662 CT /TT genotip je pokazala da je znatno povoljnija prediktor za opstanak difuzna tipa raka želuca. (CT /TT vs CC: HR = 0,63, 95% CI = 0,43-0,90) (tablica 4) pregled

Rasprava pregled

U ovoj studiji smo istražili učinak TOX3
rs3803662 na preživljavanje pacijenata s rakom želuca. Dominantni model bio najbolji dolikuje model za TOX3 pregled rs3803662. Rs3803662 CT /TT genotip pokazao je značajnu povezanost s boljim preživljavanje kod pacijenata oboljelih od raka želuca difuzna tipa. Takva razlika nije pronađen kod pacijenata oboljelih od raka želuca intestinalna tipa. Mehanizam želučanih uzoraka preživljavanja raka koje su varirale prema histološkoj tek treba razjasniti. Rezultati se razlikuju u dvije glavne histoloških tipova karcinoma želuca može biti zbog njihove razilaze u mnogim kliničkim karakteristikama i molekula, uključujući i njihove etiologije, epidemiologije, karcinogeneze i napredovanje, mRNA i /ili proteina izražavanja profilu, broju kopija gena, mikrosatelitne nestabilnosti, gubitak heterozigotnosti te mutacije profilu [17]. Nadalje, s obzirom na učinke TOX3 pregled na živčanim stanicama [9], rs3803662 povećava preživljavanje difuzna tipa karcinoma želuca u vladajućem modelu može se pripisuju se nastanjuju stanice domaćina u tumorskih stanica ili stanica raka višestruko brzo od strane nepoznatih mehanizama. U našoj studiji, nema pitke je zaštitni faktor za preživljavanje difuzno tip pacijenata s rakom želuca ', što se može vidjeti da je primarna prevencija popularizirao u ljudi svakodnevnom životu će biti koristan za smanjenje rizika od smrti među difuzna tipa raka želuca. Koliko je nama poznato, ovo je prva studija koja ispituje povezanost između TOX3
rs3803662 i preživljavanje raka želuca. Naši rezultati pružaju podršku za studije želučane preživljavanje raka, posebice kineskim stanovništvom genoma bazi. Interakcija pregled

Gene-gen je vruća tema u genetskom epidemiologije, uključujući i prognozu studija. Niti jedan lokus može u potpunosti objasniti njihovu genetičku podložnost i prognozu. Liu et al. izvijestio da je Višeparametarska interakcije između polimorfizama u MMP-2, FasL i FAS igrati važniju ulogu u razvoju OKS. Slično tome, oni su također otkrili da je učinak gena doza u suradnji s prognozom NSCLC bolesnika [18], [19]. Winkelmann et al. promatrao rs3803662 koji je u niskom LD s rs3104767 pokazao povezanost s RLS (λ-ispravljen nominalni P _{GWA = 7.29 × 10 ^{-7). Međutim, logistička regresijska analiza uvjetom rs3104767 pokazala je da je ova udruga ovisi o rs3104767 [20]. Stoga su rezultati iznad podigao mogućnost da kombinacija SNP-u TOX3 pregled ili negdje drugdje u činu gena kumulativno povećati rizik. Pregled}}

Riaz et al. otkrili da je rizik aleli rs3803662 blizu TOX3 pregled, gen koji je povezan s nižim izrazom TOX3 pregled mRNA kod raka dojke i pretpostavili tumor supresorski ulogu ovog gena [21]. Ovi rezultati ukazuju na kritične uloge TOX3 Netlogu u bolesti. Opaženo je da su specifične SNP i gena koji se odnose na prognozu mogu razlikovati od onih koji su uključeni u osjetljivosti. Ipak, varijanta identificirati u istraživanjima raka dojke može imati isti učinak na rizik od raka želuca. Dakle, da li rs3803662 što promijenilo u prognozi raka želuca također može utjecati na povećani rizik za bolesti u bolesnika je potrebno da bi se opravdalo. Ako validirane u daljnjim istraživanjima, TOX3
rs3803662 također može biti shvaćena kao potencijalni genetskog markera za želučane osjetljivosti raka, osim za prognozu. Pregled

Malo ograničenja treba uzeti u obzir kada se interpretirati rezultate. Prvo, naša studija je provedena u populaciji Kineza; da li postoji neka razlika za isti SNP u karakteristikama i opstanak raka želuca kod različitih populacija treba i dalje ispituje. Drugo, više istraživanja koristeći veće populacije pacijenata je potrebno kako bi potvrdili naša saznanja zbog relativno malog uzorka u stratificiranom analize, kao i da se isključi mogućnost udruživanja došlo slučajno. Treće, H. pilorus pregled je općenito prihvaćeno da je glavni uzročnik za peptičkog ulkusa, kao i za želučane adenokarcinoma [22]. Međutim, nismo istražiti na H. pylori infekcije, jer nije bilo dovoljno strpljivi klinička informacija. Pregled

U zaključku, TOX3 pregled rs3803662 igra važnu ulogu u preživljavanju bolesnika s rakom želuca, osobito se može smatrati kao samostalni prognostički marker difuzno tipa raka želuca. Važno je da naši rezultati nude vrlo obećavajuće izglede za upoznavanje i prevođenje naše rezultate u daljnjim mogućim kliničkim i dijagnostičkim terapeutske primjene kod raka želuca. Pregled