PLoS One: A genetikai polimorfizmusa TOX3 társul Survival gyomorrák egy kínai népesség

absztrakt katalógusa

Cél katalógusa

Az utóbbi időben genetikai polimorfizmus (rs3803662C > T) TOX3 katalógusa jelentették, hogy rábírja a mellrák kialakulásának kockázatát. Ebben a tanulmányban azt feltételeztük, hogy rs3803662 befolyásolhatja a gyomorrák túlélési eredmények. Katalógusa

Módszerek katalógusa

A multiplex Snapshot mód, azt genotipizálását TOX3 katalógusa rs3803662 880 gyomor betegek sebészi eltávolítását . Az egyesület a genotípus és a túlélés eredmények végeztük a Kaplan-Meier-módszerrel, Cox regressziós analízis modellek és a log-rank teszt. Katalógusa

Eredmények katalógusa

Nem találtunk összefüggést a elemzései rs3803662 és túlélés a gyomorrák. Azonban a rétegzett elemzés azt mutatta, hogy a szövettani rs3803662 CT /TT genotípus összefüggött egy szignifikánsan jobb túlélési diffúz típusú gyomorrák (log-rank p katalógusa = 0,030, relatív hazárd [HR] = 0,67, 95 % -os megbízhatósági intervallum [CI] = 0,46-0,96), mint a CC genotípus. Ezen túlmenően, ez a kedvező hatás volt, különösen nyilvánvaló körében gyomorrák betegek tumor méretét > 5 cm, T3 és T4 mélysége invázió, nyirokcsomó-metasztázis, nem iszik, nincs távoli áttét, nincs a kemoterápia és a cardia rák.

Következtetések katalógusa

TOX3 katalógusa rs3803662 játszhat fontos szerepet a prognosztikai eredményét és kezelésére gyomorrák, különösen talán további segítséget magyarázatában csökkentette a halál kockázatát járó diffúz típusú gyomorrák .

bevezető hivatkozás: Zhang X, Zhu H, Wu X, Wang M, Gu D, Gong W, et al. (2013) A genetikai polimorfizmusa TOX3 társul Survival gyomorrák a kínai népesség. PLoS ONE 8 (9): e72186. doi: 10,1371 /journal.pone.0072186 katalógusa

Szerkesztő: Xiaoping Miao, MOE legfontosabb Laboratórium Környezetvédelmi és Egészségügyi, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong Egyetem Természettudományi és Technológiai, Kína katalógusa

Fogadott: április 29, 2013; Elfogadva: július 6, 2013; Megjelent: szeptember 17, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Zhang et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Finanszírozás: A munka ben támogatták Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína Dr. J Chen (Grant No. 81071641), Dr. Z Xu (Grant No. 81000880); támogatásával Országos Alapellátási Science Research Program Dr. J Chen (2013CB911300); támogatásával Jiangsu tartományi 12. ötéves Program fejlődő egészségügyi a technológia és Oktatási Projekt Dr. J Chen, Dr. H. Zhu (Grant No. 81001274), Dr. Z Zhang (30972444, 81230068 és BK2010080), Dr. M. Wang (81102089 és BK2011773), a Qin Lan Project Jiangsu tartományi Oktatási Minisztérium, valamint a Priority Akadémiai Program fejlesztése Jiangsu felsőoktatási intézmények (Közegészségügyi és Preventive Medicine). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák a negyedik közös típusú rosszindulatú daganat a világon, és a vezető oka a rákos halálesetek Kínában, Japánban és kelet-európai országok [1]. A rendszeres kezelés, beleértve a műtét, kemoterápia, sugárterápia és a megcélzott terápia nyújthat gyógyítja betegek előrehaladott gyomorrák [2]. Ennek ellenére a betegek túlélésének előrehaladott gyomorrák továbbra is gyenge. Gyomorrák egy komplex és multifaktoriális betegség, amely úgy gondolják, hogy erednek közötti kölcsönhatás genetikai háttér és a környezeti tényezők. Egyes vizsgálatok arra utalnak, hogy a Helicobacter pylori katalógusa ( H. Pylorus katalógusa) fertőzés, sóval tartósított élelmiszerek fogyasztása és a dohányzás jelentős külső tényezők és növeli a gyomorrák [3], [ ,,,0],4]. Kiterjedt járványtani vizsgálatok kimutatták, hogy a genetikai variánsok, különösen egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP), valószínűleg modulálják a hatását a környezeti kockázati tényezők révén módosításával funkcióit különböző biológiai útvonalak részt gyomor karcinogenezis válaszul a környezeti expozíció. Az elmúlt években, több közös alacsony penetráns gént azonosítottak, mint potenciális gyomorrák hajlamosító genetikai variánsok, mint például a glutation-S-transzferáz M1 ( GSTM1
) polimorfizmus. Azt találtuk, genetikai variáns lehet egy hasznos marker előrejelzésére a prognózist betegek gyomorrák. Korábbi vizsgálatok szerint PSCA katalógusa rs2294008 és APE1 katalógusa rs1760944 társított gyomorrák túlélési [5], [6]. Katalógusa

TOX3 katalógusa gén, a tagja a high mobility group család nem-hiszton kromatin proteinek is neveznek trinukleotid ismétlődést tartalmazó 9 ( TNRC9
) gén található kromoszóma 16q12 [7]. Ez a gén szabályozza a Ca2 + -függő neuronális transzkripciós kölcsönhatás révén a cAMP-válasz-elem-kötő fehérje (CREB) [8]. A normális emberi szövetekben, TOX3 katalógusa nagyrészt expresszálódik a központi idegrendszer (CNS), a csípőbélben, valamint az agyban a frontális és occipitalis lebeny. TOX3
overexpressziója transzkripcióját indukálja bevonásával izolált ösztrogén-érzékeny elemek és az ösztrogén-érzékeny promoterek, és védi a neuronális sejteket a sejt halálát okozta endoplazmás retikulum stressz vagy BAX overexpressziója indukálása útján, anti-apoptotikus transzkriptumok és az elnyomás pro- apoptotikus transzkriptumok [9]. Azt javasolták, hogy rs3803662 (a C > T átmenet) TOX3 katalógusa járt fokozott az emlőrák kockázata mind a BRCA1 és BRCA2-mutációt hordozók és az ösztrogén receptor (ER) pozitív betegek [10]. Továbbá, Fasching et al. jelentett rs3803662 ( TOX3 katalógusa) összefüggésbe hozták OS emlőrák [11]. Ez az összefüggés volt látható hasonlóan más tanulmány, amely azt mutatta, hogy ha a túlélési arány elemeztük szerint molekuláris altípusok, diagnosztizált betegek luminális A tumorokban szenvedő végzett kockázati allél rövidebb volt OS képest homozigóta betegek a nem-kockázat allél [12].

azonban GWAS középpontjában egy lókusz polimorfizmusának a TOX3
gén társított mellrák túlélési, különösen az ösztrogén-receptor (ER) pozitív betegek. Néhány tanulmány arra utalt, hogy az ER-expresszió kapcsolódó túlélés a gyomorrák [13]. Ezért a variáns azonosított emlőrák vizsgálatok azonos lehet a hatása a gyomorrák kockázatát. Az egyesület a genetikai variáció TOX3 katalógusa gyomor rák túlélési végeztek a vizsgálatba. Feltételezzük, hogy TOX3 katalógusa rs3803662 társul gyomorrák túlélési kínai népesség, amely lehet azonosítani, mint egy független prognosztikai Gyomorrák túlélési. Katalógusa

Study lakosság katalógusa

a vizsgálat során, összesen 1022 gyomorrákos betegek sebészi eltávolítását a daganat Yixing Népi kórház, Yixing City, a Népköztársaság Kína (Kína), 1999 januárjától 2006 decemberéig. [6] Minden beteget sem adminisztrátora adjuváns sugárkezelés, sem a kemoterápia előtt sebészi eltávolítását. A vizsgált populációban, mind elemzések korlátozódik kínai. Számított legfeljebb 119,0 hónapos követési idő 78 betegeket kizárták a vizsgálatból hiányzik az elegendő nyomon követési adatokat. A jelen tanulmány által jóváhagyott intézményi etikai bizottsága Nanjing orvosi egyetem, és minden résztvevő írásos beleegyező nyilatkozatban. Katalógusa

Eredmények gyűjtemény katalógusa

A teljes túlélés volt a fő vizsgálati végpont. A beteg életben az utolsó nyomonkövetési dátum tartották cenzúrázott és gyomorrák val kapcsolatos halálesetet definiált haláleset. A túlélési idő definíció szerint a dátum a rák műtét gyomorrák val kapcsolatos halálesetek, illetve az utolsó nyomon követése. A halál időpontja kapunk fekvő- és járóbeteg nyilvántartások vagy a rokonok a betegek nyomon követése telefonhívásokat. Információ a patológiai paraméterek a tumor helyén, Szövettípus, invázió, nyirokcsomó, távoli áttétek állapot, ivás és a dohányzás állapot kaptunk a gyomorrákos betegek. Lauren feltételt alkalmaz minősítette a tumorok bél típusú vagy diffúz típusú gyomorrák [14]. TNM stádiumban mértük szerint amerikai vegyes bizottság Cancer Staging (AJCCS) [15]. Voltak 306 kezelt betegek adjuváns kemoterápia különböző sémák a műtét után. A terápiás séma FOLFOX4, FOLFOX6, XELOX és így tovább. Vizsgálatunk jóváhagyta az Institutional Review Board of Nanjing Orvosi Egyetem, a Nanjing, Kína. Katalógusa

Betegek és módszerek katalógusa

Genotyping katalógusa

A genomi DNS-t vontunk ki daganatminták proteináz K emésztés, izopropanol extrakcióval és etanolos kicsapással [6]. A TOX3 katalógusa (rs3803662) SNP vizsgáltuk multiplex pillanatfelvétel-technológia ABI fluoreszcencia-alapú vizsgálati allél megkülönböztetés módszerrel (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), ahogy korábban. [16] Az SNP-k elemeztük alkalmazásával ABI3130 genetikai analizátor, és a genotípusok felhasználásával határoztuk meg Genemapper4.0 szoftver (Applied Biosystems). Tény, hogy 880 támogatható gyomor beteget vontak be a végső soron, 64 esetben kizárták a további elemzéseket, mert a DNS minőségi kudarcot genotipizálás. Mintegy 10% -a mintákat véletlenszerűen kiválasztott megerősítést ismételt genotipizálás; az eredmények 100% az egyezés. katalógusa

A statisztikai elemzés katalógusa

A hatása TOX3 katalógusa változatot gyomorrák túlélést Kaplan-Meier túlélési görbék és a log-rank teszt. Három genetikai modellek (kodomináns, domináns és recesszív) alkalmaztunk, hogy értékelje az egyesület a TOX3 katalógusa rs3803662 túlélési kimenetelét gyomorrákos betegek. Minden P katalógusa értékek ebben a vizsgálatban 2-oldalas. P katalógusa < 0,05 esetén tekintettük statisztikailag jelentősége. A nyers kockázati arányok (HR), a 95% -os konfidencia intervallum (CI) és korrigált HR becslése Cox regressziós analízissel. Cox lépésenkénti regresszió analízist is végeztünk annak megállapítására, prognosztikai faktor gyomorrák, szignifikancia szint P katalógusa < 0,05 beviteléhez és P katalógusa > 0.10 eltávolítására vonatkozó magyarázó változók. Átlagos túlélési időt, feltéve, ha az átlagos túlélési idő (MST) nem lehetett számítani. Az összes statisztikai elemzést az SPSS szoftver segítségével. Katalógusa

Eredmények katalógusa

A jellemzők és a klinikopatológiai jellemzői a betegek katalógusa

A jellemzők és a klinikopatológiai jellemzői a végső 880 gyomorrák betegek ez a tanulmány foglalja össze az 1. táblázat A százalékos hímek 76,9% volt. A betegek száma meghaltak a követési idő alatt volt 408. Az egyváltozós Cox regressziós elemzés a patológiai paraméterek kiderült, hogy a daganat mérete, szövettani mélysége invázió, nyirokcsomó áttét, távoli áttétek és TNM szignifikáns összefüggést mutattak a túlélési idő (mind P katalógusa < 0,05, log-rank teszt). Pontosabban, diffúz típusú gyomorrákos betegek szignifikánsan magasabb volt a halálozás kockázata, mint intesztinális típusú gyomorrákos betegek (HR = 1,46, 95% CI = 1,19-1,79). És a betegek tumor mérete ≤5 cm volt egy 41% jelentősen növelte a túlélést, mint azok a tumor méretének > 5 cm-es (HR = 1,41, 95% CI = 1,16-1,71). Ezen kívül, mint a mélysége invázió és TNM nőtt, a nyirokcsomó-metasztázis és távoli áttétek bővült, majd a túlélési idő a gyomorrák jelentősen csökkent ennek megfelelően (log-rank P katalógusa < 0,001 mélysége invázió, TNM és a nyirokcsomó metasztázis log-rank P katalógusa = 0,031 távoli metasztázis). katalógusa

hatásai rs3803662 a gyomorrák túlélési katalógusa

a táblázatból látható 2, a társulások TOX3 katalógusa rs3803662 genotípusok gyomorrák túlélési különböző genetikai modellt értékelték Cox regressziós analízissel. Nem volt statisztikailag szignifikáns különbség nem volt kimutatható a túlélés a gyomorrák és a genotípusok genetikai modellek. Folytassa az egyesület, a betegeket az szövettan intesztinális típusú és diffúz típusú gyomorrák. Ennek eredményeként rs3803662 találták társítható jelentősen kedvezőbb hatást között diffúz típusú (log-rank P katalógusa = 0.030, Fig. 1), de nem az intesztinális típusú (log-rank P katalógusa = 0.720, Fig. 2) gyomorrák betegek domináns modell. Cox regressziós analízis kimutatta, hogy a betegek diffúz típusú gyomorrák hordozó CT /TT genotípus csökkent 33% a halálozás kockázata szignifikánsan (HR = 0,67, 95% CI = 0,46-0,96), összehasonlítva azokkal, akik voltak CC hordozók.

Sztratifikált elemzések között diffúz típusú gyomorrák katalógusa

TOX3 katalógusa rs3803662 vizsgáltam túlélés diffúz típusú gyomorrákos betegek rétegzett elemzés tumor mérete, szövettani mélysége invázió, nyirokcsomó-metasztázis, távoli áttétek, TNM, ivás állapotát, és a daganat helyén. Amint a 3. táblázatban látható, beállítása után kovariáns beleértve kor és nem, a csökkentett a halálozás kockázata sokkal nyilvánvaló betegek között a tumor méretét > 5 cm-es (HR = 0,35, 95% CI = 0,21-0,56), T3 és T4 mélység az invázió (HR = 0,63, 95% CI = 0,42-0,94 T3; HR = 0,07, 95% CI = 0,01-0,83 T4), nyirokcsomó áttét (HR = 0,62, 95% CI = 0,41-0,93), nincs távoli áttét (HR = 0,68, 95% CI = 0,46-1,00), nem iszik (HR = 0,63, 95% CI = 0,43-0,92), nincs kemoterápia (HR = 0,54, 95% CI = 0,34-0,86), és gyomor szív rák (HR = 0,50, 95% CI = 0,25-1,00). Bár a betegek T1 mélysége invázió és az I. szakaszban is hasonló jobb eredmény, ott lehetett volna egy optimális statisztikai képes jelezni a statisztikai különbség a túlélési idő, mert a kis számú beteg Ezen csoportokban. Ezzel szemben, úgy tűnt, hogy egy szegény szenvedő betegek túlélési tumor mérete ≤5 cm és ivás bár statisztikailag nem szignifikáns. Ezen kívül, egy többváltozós lépcsőzetes Cox regressziós analízist is alkalmaztunk, hogy erősítse meg egy független szerepét rs3803662 genotípusok diffúz típusú gyomorrák túlélést. Öt változók (ital, nyirokcsomó metasztázisok, a tumor helyén, kemoterápia és rs3803662) vontak be a regressziós modell szignifikancia szint 0,05 beviteléhez és 0,10 eltávolítására változó (nem közölt adatok). Amikor kor és nem vontak be a végső modell, az rs3803662 CT /TT genotípus azt mutatta, hogy egy jelentősen kedvezőbb előrejelzője a túlélés a diffúz típusú gyomorrák. (CT /TT, CC: HR = 0,63, 95% CI = 0,43-0,90) (4. táblázat). Katalógusa

Vita katalógusa

A mi jelen tanulmányban azt hatását vizsgálták TOX3 katalógusa rs3803662 túlélésére gyomorrákos betegek. Domináns modell a legjobban illeszkedő modellt TOX3 katalógusa rs3803662. Az rs3803662 CT /TT genotípus mutatott szignifikáns összefüggést a jobb túlélési között diffúz típusú gyomorrákos betegek. Egy ilyen különbséget nem találtunk az intesztinális típusú gyomorrákos betegek. A mechanizmus a gyomorrák túlélési minták, amelyeket változatos szövettani altípusok még nem tisztázott. Az eredmények eltérő a két fő szövettani típusú gyomorrák lehet miatt széttarthatnak sok klinikai jellemzői és molekuláris, beleértve azok etiológia, járványtan, karcinogenezis és progressziójában, mRNS és /vagy fehérje expressziós profiljának, gén kópiaszámát, mikroszatellita instabilitás, elvesztése heterozigótaság és a mutáció profile [17]. Továbbá, mivel a hatása TOX3 katalógusa idegsejtekre [9], rs3803662 növelése túlélését diffúz típusú gyomorrák domináns modell lehet tulajdonítani, hogy él egy gazdasejt egy tumorsejt vagy rákos sejtek szaporodnak gyorsan ismeretlen mechanizmusok. Tanulmányunkban, nem iszik egy védő tényező diffúz típusú gyomorrákos betegek túlélése, akkor látható, hogy az elsődleges megelőzés népszerűvé az emberek mindennapi életében hasznos lesz, hogy csökkentse a halálozás kockázata diffúz típusú gyomorrák. A legjobb tudásunk szerint, ez az első tanulmány, amely megvizsgálja a szövetség között TOX3 katalógusa rs3803662 és gyomorrák túlélést. Eredményeink támogatást nyújt a genom vizsgálatok alapján a gyomorrák túlélési, különösen a kínai lakosság. Katalógusa

gén-gén kölcsönhatás egy forró téma a genetikai epidemiológia, beleértve prognózis tanulmány. Nem egy locus teljes mértékben magyarázható a genetikai hajlam és a prognózis. Liu et al. számolt be, hogy a többtényezős közötti kölcsönhatások polimorfizmusok MMP-2, FASL és FAS egyre nagyobb szerepet játszanak a fejlesztés a GCA. Hasonlóképpen, az is kiderült, hogy egy gén-dózis hatás kiváltásához prognózisa NSCLC-betegek [18], [19]. Winkelmann és munkatársai. megfigyelhető az rs3803662 amely alacsony LD az rs3104767 asszociációt mutatott az RLS (λ-korrigált nominális P _{GWA = 7,29 × 10 ^{-7). Azonban logisztikus regressziós analízis feltétele az rs3104767 bizonyították, hogy ez a társulás függ rs3104767 [20]. Ezért a fenti eredmények felvetette annak lehetőségét, hogy a kombináció SNP belül TOX3 katalógusa, vagy máshol a gén jogszabály együttesen növeli a kockázatot. Katalógusa}}

Riaz et al. megállapították, hogy a kockázat alléljai rs3803662 közelében, a TOX3
gént társult alacsonyabb expressziója TOX3
mRNS mellrák és feltételezték tumorszuppresszor szerepe e gén [21]. Ezek az eredmények azt sugallják, a kritikus szerepét TOX3 katalógusa betegségekben. Megjegyezzük, hogy a specifikus SNP-k és a gének kapcsolódó prognózis eltérhetnek részt fogékonyság. Mindazonáltal, a variáns azonosított emlőrák vizsgálatok azonos lehet a hatása a gyomorrák kockázatát. Így akár rs3803662 amely megváltoztatta a gyomorrák prognózisa szintén befolyásolhatják nagy a kockázata a betegség betegeknél van szükség, hogy indokolja. Ha érvényesített további kutatásban, TOX3 katalógusa rs3803662 azt is venni, mint potenciális genetikai marker gyomorrák hajlamosító kivéve prognózis. Katalógusa

Egyes korlátozások figyelembe kell venni, amikor az eredmények értelmezése. Először is, a tanulmány került végrehajtásra populációk kínai; hogy van-e valamilyen különbség az azonos SNP jellemzőit és túlélését gyomorrák különböző populációknál tovább kell vizsgálni. Másodszor, több kutatás segítségével nagyobb betegcsoportokban szükséges, hogy erősítse meg a megállapítások következtében a viszonylag kis minta a rétegzett elemzés, valamint hogy kizárják annak lehetőségét, egyesület véletlenül következett be. Harmadszor, H. pylorus
Általánosan elfogadott, hogy a fő etiológiai ágens peptikus fekély betegség, valamint a gyomor adenokarcinóma [22]. Mi azonban nem vizsgálta a H. pylori fertőzés, mert nem volt elég türelmes klinikai adatokat. Katalógusa

Végeredményben TOX3 katalógusa rs3803662 fontos szerepet játszik a túlélés a gyomorrákos betegek, különösen a lehet tekinteni, mint egy független prognosztikai markere diffúz típusú gyomorrák. Ami fontos, az eredményeik nagyon ígéretes kilátás felfedezésére és tolmácsolják a felfedezések további lehetséges klinikai és diagnosztikai terápiás alkalmazások gyomorrákban. Katalógusa

• PLoS One: VEZT, a Novel feltételezett tumor szupresszor, meggátolja a növekedési és tumorgenézisre Gyomorsav Cancer
• PLoS One: Candidate mikroRNS biomarkerek az emberi gyomorrák: módszeres áttekintése és validálása Study