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PLOS ONE: factores de transcripción y genes regulados-microARN-Co en el cáncer gástrico Invasión de Ex Vivo

Extracto

La expresión aberrante de los genes miARN modula de forma anormal la expresión génica en las células y puede contribuir a la tumorigénesis en humanos. Este estudio identificó funcionalmente los genes expresados ​​diferencialmente relevantes utilizando los factores de transcripción y análisis de redes miARN-co-regulados para el cáncer gástrico. La red de co-regulación TF-miARN se construyó sobre la base de los datos obtenidos a partir de microarrays de ADNc y los genes miARN perfiles de expresión de los tejidos de cáncer gástrico. La red junto con sus compañeros de genes regulados se analizó utilizando la Base de datos para anotación, y Visualización Integrada Discovery (DAVID) y la base de datos al elemento regulador transcripcional (TRED). Encontramos dieciocho (17 hasta regulada y 1 regulada hacia abajo) los genes expresados ​​diferencialmente que eran co-regulados por factores de transcripción y miRNAs. KEGG vía de análisis reveló que estos genes eran parte de la interacción matriz extracelular del receptor y las rutas de señalización de adhesión focal. Además, los datos de transferencia de Western QRT-PCR y mostraron un aumento en COL1A1 y la disminución de NCAM1 ARNm y los niveles de proteína en tejidos de cáncer gástrico. Por lo tanto, estos datos proporcionan la primera evidencia para ilustrar que la red gen alterado se asoció con la invasión del cáncer gástrico. Se necesitan más estudios con una muestra de gran tamaño y los experimentos más funcionales para confirmar estos datos y contribuir a las estrategias de diagnóstico y tratamiento para el cáncer gástrico

Visto:. Shi Y, Wang J, Xin Z, Z Duan, Wang G , Li F (2015) factores de transcripción y genes regulados-Co-microARN en el cáncer gástrico invasión en Ex Vivo
. PLoS ONE 10 (4): e0122882. doi: 10.1371 /journal.pone.0122882

Editor Académico: Jian-Jun Zhao, Instituto de Cáncer Dana-Farber, Estados Unidos

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