Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: Transkriptioun fir op an microRNA-Co-reegelen Genen vun Gastric Cancer Missiounen an Ex VIVO

Wat VerfÜgung

Aberrant miRNA Ausdrock modulates abnormal Gentherapie Ausdrock vun Zellen an kann bis tumorigenesis zu Mënschheet bäidroen. Dës Etude System relevant differentially ausgedréckt Genen mat der Transkriptiouns Facteuren an miRNA-Co-reegelen Reseau Analyse fir gastric Kriibs identifizéiert. D'TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau vu cDNA microarray an miRNA Ausdrock profiling vun gastric Kriibs Stoffer kritt baséiert op Daten gebaut. De Réseau zesumme mat hire Co-reegelen Genen war mat der Datebank fir Annotation, Visualization an Integréiert Discovery (DAVID) an Transcriptional Regulatioune Element Datebank (TRED) analyséieren. Mir fonnt uechtzéng (17 bis-reglementéiert an 1 verwandelt-reegelen) differentially ausgedréckt Genen déi vun Transkriptiouns Facteuren an miRNAs Co-regulariséiert goufen. Kegg Passerelle Analyse verroden, datt dës Genen Deel vun der extracellular Matrixentgasung-receptor Interaktioun an Brennwäit Haftung sécher Weeër goufen. Zousätzlech, zougedréckt qRT- Hinnen alleguer a Western blot Daten eng Erhéijung vun COL1A1 an Ofsenkung NCAM1 mRNA an FAQ Besatzungszäit gastric Kriibs Stoffer. Sou, gëtt dës Donnéeën den éischten Hiwäis fir dat verännert Gentherapie Reseau mat gastric Kriibs Invasioun verbonne war. Weider Studium mat engem grousse Prouf Gréisst a méi funktionell Experiment ass néideg dës Donnéeen ze confirméieren an ze diagnostic a Behandlung Strategien fir gastric Kriibs bäidroen VerfÜgung

Fro:. Shi Y, Wang J, Xin Z, Duan Z, Wang G , Li F (2015) Transkriptioun fir op an microRNA-Co-reegelen Genen vun Gastric Cancer Missiounen am Ex VIVO VerfÜgung. PLoS NËMMEN 10 (4): e0122882. Doi: 10.1371 /journal.pone.0122882 VerfÜgung

Akademesch Redakter: Jian-Jun Zhao, Dana-Farber Cancer Institut, USA VerfÜgung

Arnaque: November 8, 2014; Akzeptéiert: 24. Februar 2015; Publizéiert: April 10, 2015 VerfÜgung

Copyright: © 2015 Shi et al. Dëst ass eng oppen Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz CC BY verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt si vum original Auteur an d'Quell Kaiser VerfÜgung

Data Disponibilitéit: All Daten sinn bannent de Pabeier a seng Ennerstëtzung Informatiounen Fichieren VerfÜgung

Funding:. Dëst Wierk war déi Subventioune vum National Natural Science Foundation of China (̭20108025 an̮72662) ënnerstëtzt. Et ass och am Kader vum National Natural Science Foundation of China (̬71897 an̮01712), JILIN Key schafft vun Biomedical Materialie Foundation vun JILIN Province Wëssenschaft an Technologie Pompjeeën (É30522013JH anÉ40414048GH) an den Norman Bethune plangen vun JILIN ënnerstëtzt Universitéit (É2219) VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. d'Auteuren erkläert hunn, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric Kriibs ass eent vun de meescht genannten Form vun malignancies zu der Welt, zu engem Drëttel vun Kriibs-Zesummenhang Doudesfäll am Männer Contributioun an e Fënneftel ënnert de Fraen [1]. Ongeféier, geschéien zwee-Drëttel vun gastric Kriibs Fäll vun der Entwécklungslänner. An China, d'Heefegkeet an veruerteelt ze gastric Kriibs Zesummenhang geklommen drëtt ënnert aner Forme vun malignancies [2] an et gouf confirméiert, datt gastric Kriibs méi dacks am ländleche Raum a mat engem Trend vun jonken Leit betraff sinn, déi et an de leschte Jore geschitt [3 ]. Ëmweltproblemer (wéi Helicobacter pylori VerfÜgung Krankheet oder Konsum vun gefëmmt Liewensmëttel) a genetesch Faktoren ( E-cadherin VerfÜgung stattfannen) de waat fir gastric Kriibs Erhéijunge vun hire Restaurant zu oncogenes /entholl suppressor Genen Pinguin an /oder epigenetic Profil [4]. Verfall vun dësen kritescher Faktoren Resultater am Manque Regulatioun vun Zell Wuesstem, apoptosis, an dat also carcinogenesis Spur. Multiple Gentherapie reglementaresche Netzwierker Co-koordinéieren d'Transformatioun vun normal Zell fir eng Zell entholl an entholl Werdegang fueren. Mä, fir Datum, ass den detailléierte Versteesdemech vun der Basisdaten Multiple Gentherapie reglementaresche Netzwierker an pathogenesis vun gastric Kriibs nach gin definéiert. Detailléiert molekulare mechanistic Reseau Bestëmmung mat gastric Kriibs Entwécklung an Werdegang verbonne konnt de Versteesdemech vun carcinogenesis zu gastric Stoffer verbesseren, sou den Roman an effikass Strategien an d'Préventioun, Diagnos an Behandlung vun gastric Kriibs beschte Wee. VerfÜgung

Gene Ausdrock vun Zellen ass souwuel um Transkriptiouns an Post-transcriptional Niveauen kontrolléiert haten. Transkriptioun Faktoren (TFs) Gentherapie Transkriptiouns koordinéieren, iwwerdeems miRNAs Ausdrock Gentherapie reguléieren Post-transcriptional Evenementer mediating, wéi mRNA ofgeschnidden an FAQ Iwwersetzung [5]. Dofir, kënnen all hire Restaurant zu miRNA Funktioun Resultat vun der Entwécklung vum Kriibs zu Mënschen [6,7]. Transkriptioun Facteure sinn Proteinen déi zu bestëmmten DNA Message kruet den Taux vun Transkriptiouns vun genetesch Informatiounen aus DNA zu mRNA [8,9] ze kontrolléieren, iwwerdeems miRNAs engem Grupp vun enger klenger Net-coding RNS vun Zellen a Funktioun vun RNS silencing an Post sinn -transcriptional Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock [10,11]. D'TF-miRNA Gentherapie reglementaresche Netz bestëmmt Punkto Gentherapie Ausdrock Profil an Zellen gewëssermoossen. Dofir, Analyse vun der TF-miRNA Co-reglementaresche Netzwierker an gastric Kriibs Stoffer kéinten eis hëllefen eis Versteesdemech fir weider op wéi TFs an miRNAs d'Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock koordinéieren ze gastric carcinogenesis Contributioun [12]. An eiser leschter Etude, profiléiert mir differentially Gene ausgedréckt an uechtzeg Puer gastric carcinoma-bascht normal Stoffer mat cDNA microarrays [13] an eng Rei vu Genen mat verännert Ausdrock, dorënner TFs fonnt. Baséierend op d'Informatiounen aus Transcriptional Regulatioune Element Datebank (TRED) [14], mir gebaut a konsolidéiert engem TF-Gentherapie reglementaresche Netz. An dëser Etude profiléiert, mir ausgedréckt differentially miRNAs zu fënnef Puer gastric carcinoma-bascht normal Stoffer an enger miRNA-Zil- reglementaresche Reseau fir gastric Kriibs gebaut vun der miRNA gezielt Gentherapie Datenbanken integréiert, dorënner Targetscan, Miranda, miRDB, an miRWalk [15] . Mir gebaut dann d'TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau eis virdrun Daten benotzt an dann standing GO an Kegg Passerelle analyséiert a standing real Zäit Hinnen alleguer a westlech blot Analyse dës Donnéeën ze validéieren. Sou, kéint wichteg Hiweiser fir zukünfteg Studien op miRNA an TFs Funktiounen am gastric Kriibs déi esouwuel vun der Methode an analyséiert. VerfÜgung

spontan a Methode VerfÜgung

Ray Echantillon VerfÜgung

A Ganzen 25 gastric carcinoma Patienten sech fir dës Etude aus Déi éischt Hospital vun JILIN University, Changchun, China agestallt. Gastric Kriibs Stoffer an de passende wäit Net-kriibserreegend Stoffer goufen surgically resected an flëssegem Stéckstoff bannent 10 min no der resection gespäichert. Schrëftlech informéiert Autorisatioune goufen aus all den Themen kritt an d'Donnéeë sech anonym analyséiert. D'TNM an histological Klassifikatioun sech no Weltgesondheetsorganisatioun (DÉI) Critèren. Dës Etude vun der Ethik Comité vun College vun Grondakommes Medical Sciences, JILIN University ofgeseent gouf. VerfÜgung

Profiling vun differentially ausgedréckt mRNA an microRNA zu gastric Kriibs Stoffer VerfÜgung

D'differentially ausgedréckt mRNA Daten tëscht gastric Kriibs an normal Stoffer war vun 80 Patiente gehaal an Untersuchungshaft virdrun [13]. Mir benotzt ≥ 2-fantastesch änneren der differentially ausgedréckt Genen fir dës Etude ze Profil. VerfÜgung

An dëser Etude, differentially ausgedréckt miRNAs zu 5 Puer gastric Kriibs-bascht normal Stoffer (kuckt Patienten Donnéeën vun S2 Table) sech Hëllef Affymetrix miRNA microarray Fritten profiléiert no der Ëmwelt- d'Hiersteller. mat der mirVana miRNA Isolatioun Kit (Ambion, Austin, Suerge, USA) an dann zu Gene Chip microRNA vill ënnerworf kuerz, war total RNS aus Otemschwieregkeeten Echantillon isoléiert war mat der Trizol (Invitrogen, Karlsbad CA, USA) an miRNA isoléiert an Dir sidd Analyse. D'Daten benotzt GeneChip Scanner3000 mat GeneChip Zesummen Software (GCOS) an analyséiert gescannt. VerfÜgung

Bau vun TF-Gentherapie, miRNA-gezielt Gentherapie, an TF-miRNA Co-reglementaresche Netzwierker VerfÜgung

Baséierend op der GeneChip Mënscherechter Exon 1.0 ST microarray Donnéeën (Affymetrix, CA, USA), gebaut mir de TF-Gentherapie Netzwierk vun der Gentherapie Ausdrock Profiler an transcriptional reglementaresche Element Datebank (TRED) integréiert. Reglementaresche Interaktiounen tëschent microRNA an hir Zil- Genen huet baséiert op Informatiounen etabléierten aus Targetscan, Miranda, miRDB an miRWalk Datebank. D'TF-miRNA Co-reglementaresche Netzwierker sech duerch phpNuke dësen zwou Sektiounen gebaut. Hub-Genen déi vun TFs Co-reglementéiert an miRNAs goufen och identifizéiert. D'Netzer waren benotzt Cytoscape Software (Institut vu Systemer Biologie, USA, http://www.cytoscape.org) gebaut. VerfÜgung

Fonctionnement configuréieren vun ausgewielt Genen VerfÜgung

Online analytesch Tools wéi Datebank fir Annotation, Visualization an Integréiert Discovery (DAVID) an Kyoto Enzyklopedie vun Genen an Genomes (Kegg) sech applizéiert der funktionell Passerelle beschen mat differentially ausgedréckt Genen assoziéiert. Kegg Weeër mat p &Si besteet signifikativ beräichert; 0,01 sech bestëmmt an analyséiert weider. VerfÜgung

Chemeschen RT-Hinnen alleguer (qRT-Hinnen alleguer) VerfÜgung

Fir mRNA Niveau z'entdecken, et geheescht mir 5 μg total RNS Echantillon vun all Prouf mat der an cDNA zu reversely tippen éischt staarkt cDNA Synthes Kit (Takara, Dalian, China) an dann fir Ausdrock vun COL1A1 benotzt qPCR Implikatioune verstärkt, an NCAM1 mRNA mat SYBR Premix Ex Taq (Takara) zu Obwuel Biosystems 7300 Fast Real-Time Hinnen alleguer System no der Hiersteller 'Instruktiounen. Der relativer Ausdrock vun mRNA Niveauen war normalized zu β-actin mRNA vun Komparativ CT Method (2 -ΔΔCt, ΔCt = CT Zil--CT β-actin, ΔΔCt = ΔCt entholl-ΔCt normal). All primers sech entworf mat Primer Premier 6 Software, primer Message fir amplification zu Table opgezielt goufen 1. Data aus qRT-Hinnen alleguer mat GraphPad Prism Version analyséiert goufen 5.0 Ënnerscheeder tëschent Gruppe waren statistesch vun Prouf eent-tailed Student d'T-Test mat p bewäert Wäert &si besteet;. 0,05 als bedeitendst VerfÜgung

Protein erauszéien a Western blotting VerfÜgung

Ray uplanzen mat 1 mm 3 zu Gréisst waren Buedem an flëssegem Stéckstoff an homogenized an enger Zell lysis Prellbock (Beyotime , Peking, China) bei 4 ° C fir 20 min. D'Konzentratioun vun FAQ am Echantillon war mat engem BCA Protein Assay Kit (Bio-Rad, Hercules, CA, USA) sech an der Proteinen Echantillon vun Natrium dodecyl sulfate-polyacrylamide gelies electrophoresis (SDS-PAGE) mat 10% gelies getrennt goufen an dann op engem PVDF Membran transferéiert (0.45 μm; Bio-Rad, Hercules, CA, USA) fir 2 h. 1000, eng Maus anti-NCAM1 /CD56 antibody (Novus Biologicals) op engem dilution vun 1:: D'Schläimhait sech dann mat engem Kanéngchen anti-collagen ech antibody (Novus Biologicals, Littleton, CO, USA) op engem dilution vun 1 incubated 400 , oder eng Kanéngchen anti-β-actin antibody (Proteintech, Chicago IL, USA) op engem dilution vun 1: 2000 um 4 ° C Iwwernuechtung an dono mat Tris-baséiert Salins-Tween 20 (TBST) no wäschen, goufen d'Schläimhait incubated mat enger Geess anti-Kanéngchen IgG (Beyotime) oder Geess anti-Maus IgG (Proteintech) op engem dilution vun 1: 2000 fir 2 h. D'FAQ Signaler sech duerch autoradiography fonnt, déi verstäerkte chemiluminescence reagent benotzt (Beyotime, Peking, China), gefollegt vun aussetzt der radiographs. D'Dicht vun FAQ Band huet mat enger gelies Image System (Tanon, Shanghai, China) laachen an sech normalized zu β-actin Niveauen déi als Luede Kontrollen benotzt gouf. VerfÜgung

statistique Analyse VerfÜgung

LIMMA ( Linearschrëft Modeller fir microarray Daten) Analys war standing der differentially ausgedréckt miRNAs mat engem präventive-Wäert vun op d'mannst 2-fantastesch Ännerungen (FC) mat p &Si besteet ze identifizéieren; 0,05 an FDR &Si besteet; 0,05. SPSS 21,0 Software (SPSS, Chicago, IL, USA) war benotzt Receiver Zesummen charakteristesche (ROC) rop an Logistikzenter Réckgang Analyse ze maachen. Der Sensibilitéit, Spezifizitéit an der Géigend ënner dem Bou (AUC) waren berechent Moettelmier-ID! Statistesch Software an p Wäert &Si besteet benotzt; 0,05 war als statistesch relevant ze ginn. Western blotting Date goufen duerch GraphPad Prism Version 5.0 (San Diego, CA, USA) an Ënnerscheed tëscht entholl an normal Stoffer analyséiert goufen vun der eent-tailed Student d'T-Test an enger p Wäert &Si besteet bewäert; 0,05 war als statistesch relevant ze ginn. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

TF-Gentherapie reglementaresche Reseau an Ausdrock vun miRNAs zu gastric Kriibs Ënnerscheed VerfÜgung

TF-Gentherapie reglementaresche Netzwierk wéi zu Lalumi 1 dës gouf vun engem fréiere Etude [13] op differentially ausgedréckt Genen (≥ 2 fantastesch) aus 80 Puer gastric Kriibs Stoffer kritt baséiert op den Donnéeën gebaut. Speziell, Faktoren fënnef Transkriptiouns MYB, MYBL2, ETV4, LEF1 an TFAP2A sech weider-reglementéiert a geformt der TF-Gentherapie reglementaresche Netzwierker mat 41 Genen, 38 vun deem sech weider-reglementéiert an 3 waren verwandelt-reglementéiert gastric Kriibs Stoffer (S1 Dësch). Ausserdeem, profiléiert mir miRNA Ausdrock benotzt Affymetrix microRNA flamenden Ofgrond zu fënnef Puer gastric Kriibs-entspriechend normal Stoffer (Clinicopathological Charakteristiken vun de Patienten wéi zu S2 Table gewisen). Eng total vun 93 miRNAs sech zu gastric Kriibs Stoffer (p &Si besteet; 0,05) differentially ausgedréckt, vun deenen 27 miRNAs up-regulariséiert goufen, wobäi 66 goufen verwandelt-reegelen (Lalumi 2 an S3 Table). Dorënner differentially ausgedréckt miRNAs, hunn e puer vun virdrun Studien, wéi miRlet-7, miR409, Mir-28-5p, Mir-625, etc. [16-19] gemellt ginn. Duerno, huet Targetscan, Miranda, miRDB, an miRWalk Datenbanken der Zil- Genen vun dësen differentially ausgedréckt miRNAs ze soe ofgebauter. VerfÜgung

TF-miRNA Reseau differentially ausgedréckt Genen vun gastric Kriibs Regulatioun VerfÜgung

op der Basis Daten aus cDNA an miRNA microarray wéi virdrun erwähnt, mir en aberrant TF-miRNA Reseau datt den Ausdrock vun Genen vun gastric Kriibs (Lalumi 3 an S4 Table) gereegelt gouf. Besonnesch, dës aberrant TF-miRNA Netzwierker reegelen Ausdrock vun 18 Genen ( COL1A1 VerfÜgung, COL1A2 VerfÜgung, COL5A2 VerfÜgung, COL11A1 VerfÜgung, DSG3 VerfÜgung, Zännwéi VerfÜgung, SERPINE1 VerfÜgung, SERPINB2 VerfÜgung, CXCL5 VerfÜgung, MMP1 VerfÜgung, PLAU
, SPP1 VerfÜgung, GJB2 VerfÜgung, CLDN2 VerfÜgung, CDKN2A VerfÜgung, CENPF VerfÜgung, MAD2L1 VerfÜgung, an NCAM1 VerfÜgung), déi meescht vun deenen (17 vun 18) sech weider-reglementéiert gastric Kriibs Stoffer (Lalumi 4). VerfÜgung

Fonctionnement Analyse vun deene 18 Dréischeif-Genen benotzt DAVID (d' Datebank fir Annotation, Visualization an Integréiert Discovery) [20] weisen dass et zwou mein beräichert Kegg Édouard de ECM-receptor Interaktioun Passerelle an Brennwäit Haftung Passerelle. Fënnef Genen ( COL1A1 VerfÜgung, COL1A2 VerfÜgung, COL5A2 VerfÜgung, COL11A1 VerfÜgung, an SPP1 VerfÜgung) waren déi vill geännert an huet all an der ECM-receptor Interaktioun Équipe an Brennwäit Haftung Passerelle (Table 2). Analyse vun de Ko-reglementaresche Réseau gewisen, datt dës 18 Dréischeif-Genen enger anerer Node Diplome Verdeelung hat, iwwerdeems COL1A1 VerfÜgung a NCAM1 VerfÜgung den héchste Mooss Verdeelung zougedréckt (Lalumi 5). VerfÜgung

Association vun COL1A1 VerfÜgung a NCAM1 VerfÜgung Ausstralung mat clinicopathological Status VerfÜgung

Mir supposéierter datt Genen mat héijer Mooss distributions eng grouss Roll an de reglementaresche Reseau spille konnt. Sou, mir Ausdrock vun dësen Genen mat clinicopathological Charakteristiken vun gastric Kriibs Patienten assoziéiert. De Receiver Fonctionnementskäschten Analyse charakteristesche (ROC) Bou weist, datt Ausdrock vun COL1A1 VerfÜgung a NCAM1 VerfÜgung Potential discriminators tëscht Kriibs ginn hätt an entspriechend normal Stoffer mat AUC (Géigend ënner rop) = 0.806 fir COL1A1 VerfÜgung an 0,677 fir NCAM1 VerfÜgung. D'Kombinatioun vun COL1A1 VerfÜgung a NCAM1 VerfÜgung Ausdrock eng besser dat Conditioun mat AUC gëtt = 0,829, Empfindlechkeet = 70,7% an Spezifizitéit = 84,0%, wéi dat vun eenzelne COL1A1 VerfÜgung oder NCAM1 VerfÜgung Ausdrock (Lalumi 6 a Table 3). VerfÜgung

Weideren mir de microarray Daten benotzt qRT-Hinnen alleguer a Western blot an aner 20 Puer gastric Kriibs an bascht normal Stoffer (Patienten validéiert " Informatiounen opgezielt zu S2 Table). D'COL1A1 an NCAM1 mRNA Ausdrock zougedréckt 3,10 ± 1,08 fantastesch up-Regulatioun an 0,37 ± 0,02 fantastesch verwandelt-Regulatioun vun entholl Stoffer vs. normal mannste (p &Si besteet; 0.01), während Western blot Daten eng kloer Differenz tëschent der famill FAQ Dicht zougedréckt vun COL1A1 zu Kriibs Stoffer (0.92 ± 0.02) vs. bascht normal Stoffer (0,29 ± 0,01; p &Si besteet; 0,01), während Ausdrock vun NCAM1 zu Kriibs Stoffer (0.11 ± 0.002) vs. normal mannste (0.85 ± 0,05) (p &Si besteet; 0,01 Lalumi 7). Sou, konnt de Suivi-Regulatioun vun COL1A1 an Ugrëff-Regulatioun vun NCAM1 Ausdrock net nëmmen tëschent Kriibs an normal Stoffer z'ënnerscheeden, mä och de Kriibs Patienten an verschidden entholl Etappen opdeelen. Den Niveau vun COL1A1 Ausdrock héich war an der Hautfaarf an serosa iwwerfale erhéijen, iwwerdeems NCAM1 Ausdrock Lien negatif mat entholl Invasioun (Lalumi 8). VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

An der aktueller Etude, Daten verbonne ginn vun der cDNA an miRNA war microarray der Transkriptiouns Faktoren-miRNA Co-reglementaresche Réseau zu gastric Kriibs an identifizéiert 18 Dréischeif-Genen dass reglementéiert waren déi zwee Transkriptiouns Facteuren an miRNAs ze bauen benotzt. Dës Genen gehéieren zu extracellular Matrixentgasung-receptor Interaktioun an Brennwäit Haftung sécher Weeër. Ausserdeem, d'Expressioun vun COL1A1 VerfÜgung a NCAM1 VerfÜgung war zu gastric Kriibs Stoffer bestätegt an huet mat gastric Kriibs Invasioun verbonnen; awer, et bleift onbekannte déi miRNA (s) regléieren hiren Ausdrock an gastric Kriibs. VerfÜgung

Transkriptioun Faktoren MYB, MYBL2, ETV4, LEF1, TFAP2A sech zu gastric Kriibs Stoffer up-reegelen. Iwwerhaapt sinn d'MYB Famill Proteinen dicht zu eukaryotic Organismen verdeelt an expresison vun MYB-Transkriptiouns Faktor ass kritesch fir entholl Wuesstem an mammary carcinogenesis [21] [22], während MYBL2 (B-MYB) ass eng oncogenic Transkriptiouns Faktor zu Zell Zyklus Équipe , G2 /M Werdegang [23]. Als Member vun oncogenic ETS VerfÜgung Genen, ETV4 protien gouf Rapport un Kriibs Metastasen zu Maus Modeller [24] an ass verbonne mat aarmséileg hätt an gastric adenocarcinoma [25] förderen. D'TCF /LEF Famill ass eng kleng Famill vun DNA-verbindlech Facteuren an LEF1 Akten haaptsächlech als activator mat enger Roll an inhibition vun Zell apoptosis [26]. TFAP2A ass eng Transkriptiouns Faktor datt haaptsächlech Zell Wuesstem an dat reguléieren. An nasopharyngeal carcinoma, TFAP2A reegelen entholl Zell Wuesstem an Iwwerliewe duerch d'HIF-1α-mediated VEGF /PEDF sécher Passerelle, datt TFAP2A suggeréiert hätt e Potential uweist fir nasopharyngeal carcinoma Behandlung [27] ginn. Ausserdeem, an der miRNA-TF Co-reglementaresche Netz, identifizéiert mir 18 Dréischeif-Genen datt déi béid TFs an miRNAs regulariséiert goufen. Funktionell Analyse vun deene 18 Genen Optakt vun zwee groussen Kegg Édouard de extracellular Matrixentgasung (ECM) -receptor Interaktioun Passerelle an Brennwäit Haftung Passerelle. Rezent Etuden bewisen, dass ECM-kenne (Integrins) mediated sécher e grousse Grupp vun Signaler Contributioun Iwwerliewe zu Zell a stellt eng Iwwerliewe Virdeel fir verschidden Zorte vu Kriibs Zellen [28]. ECM kann och Zell Prolifératioun, dat, Doud an carcinogenesis [29] regléieren. Als strukturellen Linken tëscht ECM an actin cytoskeleton, déngt Brennwäit adhesions den Siten fir Signal transduction aus der ECM zu intracellular unzekräizen [30]. Eis aktuell Donnéeën gewisen, datt déi fënnef Genen ( COL1A1 VerfÜgung, COL1A2 VerfÜgung, COL5A2 VerfÜgung, COL11A1 VerfÜgung, an SPP1 VerfÜgung) Co-reegelen souwuel TFs an miRNAs un ECM-receptor Interaktioun an Brennwäit Haftung Weeër. Virdrun Etude zougedréckt overexpression vun SPP1 VerfÜgung (secreted phosphoprotein 1) zu gastric Cancers a sengem Veräin mat Kriibs Werdegang [31]. D'Genen COL1A1 VerfÜgung, COL1A2 VerfÜgung, COL5A2 VerfÜgung, an COL11A1 VerfÜgung dem collagen FAQ Famill, wesentlech strukturell Komponente vun ECM gehéieren. Up-Regulatioun vun collagens ass wichteg entholl Wuesstem wéi collagen catabolized vun Matrixentgasung metalloproteinases (MMPs) verréid der verstoppte bindend Siten déi weider förderen angiogenesis an entholl Invasioun ze förderen. A leschter Etude gewisen, datt Ausdrock vun COL1A1 an COL1A2 war zu malignant colorectal endothelium Zellen nik [32], suggeréiert, dass dës zwee Proteinen eng Roll an angiogenesis an Opstellung vun desmoplasia während colorectal Kriibs Entwécklung Leeschtung [33]. Desweideren, Ausdrock vun COL5A2 VerfÜgung a COL11A1 VerfÜgung war mat colorectal carcinogenesis verbonne [34] weisen dass COL5A2 VerfÜgung war Co-ausgedréckt mat COL11A1 VerfÜgung zu colorectal entholl Echantillonen, mä net zu normal Colon epithelia; Ee, bleift et onbekannte déi miRNA (s) regléieren hiren Ausdrock an gastric Kriibs. Déift vum Kriibs Invasioun ass e wichtege Faktor vun der Cepheid vun Iwwerliewe a Behandlung Planung. Collagen ass eent vun de wichtegsten Deeler vun der entholl microenvironment, déi experimentell Resultater vun subtractive hybridization an microarray uginn verschiddenste collagen Genen datt abnormal zu entholl Stoffer ausgedréckt huet, wéi COL1A1 Zeechesaatz vum Typ 1 collagen [35]. COL1A1 VerfÜgung gouf mat gastric Kriibs Invasioun an Metastasen [33] zu Associé identifizéiert. Eis aktuell Donnéeën confirméiert datt Ausdrock vun COL1A1 bedeitend an gastric Kriibs Stoffer nik war an ass mat entholl Werdegang assoziéiert. Desweideren, eis aktuell Etude awer och, datt Ausdrock vun NCAM1 FAQ negatif mat gastric Kriibs Invasioun verbonne war. NCAM ass eng Salle Membran FAQ zu Zell dat Équipe, Migratioun, Mä synapse Wuesstem, a speziell Musteren vun synaptic Verbindungen. A leschter Etude confirméiert datt NCAM1 Ausdrock mat der invasiv Wuesstem vun glioma [36] verbonne war. No inoculating der transfected stellate glioma Zellen an d'Gehir vun deër, WestYork et al VerfÜgung., Confirméiert, datt d'invasiveness vun entholl Zellen reduzéiert, wat beweist, datt um Niveau vun NCAM1 Ausdrock negatif mat entholl invasiveness [37] verbonne war. Obwuel Verloscht vun NCAM1 Ausdrock vun gastric Kriibs huet net virun gemellt ginn, eis aktuell Donnéeën iwwert d'ëmgedréit, et gesäit Associatioun mat gastric Kriibs Invasioun ass konsequent mat virdrun Studie vun gliomas [37]. Weider Studien sinn néideg der Ausdrock Status vun COL1A1 an NCAM1 Proteinen als potentiell biomarkers fir fréi Diagnos an Cepheid vun gastric Kriibs Werdegang ze confirméieren. VerfÜgung

Bau vun der TF-miRNA Co-reglementaresche Reseau ass e nëtzlechen Outil vun der Identifikatioun vu kriteschen Legislateuren an hir Zil- Genen am mënschleche Cancers. Allerdéngs, eis aktuell Etude ass just e Beweis-vun-Prinzip Effort an Zukunft Studie mat enger grouss Echantillonen Gréisst sinn néideg der aktueller Conclusiounen ze confirméieren. Et soll zur mechanistic Etuden duerno ginn d'Verständnis iwwert d'Roll vun de Schlëssel Molekülle an der Gentherapie Weeër an gastric Kriibs ze wäit. VerfÜgung

Informatiounen Ennerstëtzung VerfÜgung S1 Table. Resumé vun de reglementaresche Interaktiounen TF-Gentherapie Reseau VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0122882.s001 VerfÜgung (XLSX) VerfÜgung S2 Table. Patienten Charakteristiken (25 Puer gastric Kriibs an bascht normal Stoffer fir d'miRNA microarray (n = 5) a Western blot (n = 20) Analyse an RT-qPCR (n = 20) Analyse) VerfÜgung Doi:. 10,1371 /Zäitschrëft .pone.0122882.s002 VerfÜgung (Intrigue) VerfÜgung S3 Table. . Satz vun 93 differentially ausgedréckt miRNAs zu gastric Kriibs Stoffer vs. wäiter normal Stoffer VerfÜgung Gene Ausdrock Niveauen am gastric Kriibs Stoffer vs. wäiter normal Stoffer waren op d'mannst 2-fantastesch verschiddene mat engem p-Wäert &Si besteet;. 0,05
Doi: 10,1371 /journal.pone.0122882.s003 VerfÜgung (XLS) VerfÜgung S4 Table. . D'Interaktiounen miRNAs an hir reegelen Genen an TF-Gentherapie reglementaresche Reseau All Regulatioun VerfÜgung war vun transcriptional reglementaresche Element Datebank (TRED) ofgeleet VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0122882.s004 VerfÜgung (XLSX ) VerfÜgung

Arbeschterlidder VerfÜgung

Dës Aarbecht am Kader ënnerstëtzt gouf duerch Subventioune vum National Natural Science Foundation of China (̭20108025 an̮72662), National Natural Science Foundation of China (̬71897 an̮01712) , JILIN Key schafft vun Biomedical Materialie Foundation vun JILIN Province Wëssenschaft an Technologie Pompjeeën (É30522013JH anÉ40414048GH), an den Norman Bethune plangen vun JILIN University (É2219). Mir soen och dem Medjaden Bioscience Limited (Hong Kong, China) fir Redaktioun an proofreading dëst eng mëttelalterlech Handschrëft. VerfÜgung

Other Languages