PLOS ONE: Gene polymorphismes de microARN dans Helicobacter pylori induit un risque élevé atrophique Gastrite et cancer gastrique

Résumé

Contexte et vise

microARN (miARN) sont connus pour leur fonction en tant que régulateurs de translation de suppresseur de tumeur ou oncogènes. On a montré que simples polymorphismes nucléotidiques (SNP) dans les gènes miARN liés à une incidence sur la capacité de réglementation des miARN et ont été liés avec le cancer gastrique (GC) et des conditions gastriques précancéreuses. Le but de cette étude était d'évaluer les associations potentielles entre les polymorphismes du gène miRNA liées ( miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
et miR-608
) et la présence de GC ou risque élevé gastrite atrophique (Hrag) dans la population européenne.

Méthodes

Gene polymorphismes ont été analysés dans 995 sujets (contrôles: n = 351; GC: n = 363; Hrag: n = 281) d'origine européenne. miR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) et miR-608
C >. G (rs4919510) SNPs ont été génotypés par RT-PCR

Résultats

Dans l'ensemble, les SNP de miARN ne sont pas associés à la présence de GC ou Hrag. Nous avons observé une tendance à miR-196a-2
CT génotype d'être associé à un risque plus élevé de GC par rapport à génotype CC, cependant, la différence n'a pas atteint le ajusté P
-value (odds ratio (OR) - 1.46, 95% intervalle de confiance (IC) 1,03 à 2,07, P
= 0,032). miR-608
génotype GG était plus fréquente chez les GC par rapport aux témoins (OR -2.34, IC à 95% 1,08 à 5,04), mais la signification est restée marginale ( P
= 0,029). Une tendance similaire a été observée dans un modèle récessif pour miR-608
, où CC + CG vs comparaison GG génotype ont montré une tendance à un risque accru de GC avec OR de 2,44 (IC à 95% 1,14 à 5,22, P
= 0,021). Les génotypes et allèles de miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
et miR-608
SNP avaient la même répartition entre les sous-types histologiques de GC et ne sont pas liées à la présence de diffus ou de type intestinal GC.

Conclusions

polymorphismes de gènes de miR -27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
, miR-492a
et miR-608
ne sont pas associés à la présence de Hrag, GC ou différents sous-types histologiques de GC chez des sujets européens

Citation:. Kupcinskas J, Wex T, Link A, Leja M, Bruzaite I, Steponaitiene R, et al. (2014) Gene polymorphismes de microARN dans Helicobacter pylori
induite par un risque élevé atrophique Gastrite et le cancer gastrique. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10.1371 /journal.pone.0087467

Editeur: Masaru Katoh, National Cancer Center, le Japon

Reçu le 14 Septembre 2013; Accepté 26 Décembre 2013; Publié le 27 Janvier, 2014

Droit d'auteur: © 2014 Kupcinskas et al. Ceci est un article en accès libre distribué sous les termes de la licence Creative Commons Attribution, qui permet une utilisation sans restriction, la distribution et la reproduction sur tout support, à condition que l'auteur et la source originelle sont crédités

Financement:. Ce travail a été soutenue par le Fonds social européen (n ° VP1-3.1-Å MM-07-K-01-156) et en partie par une subvention du BMBF (BMBF-0315905D) dans le cadre du projet ERA-net PathoGenoMics. Le recrutement de patients en Lettonie a été pris en charge dans le cadre du projet du Fonds européen de développement régional (n ° 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). Les bailleurs de fonds ont joué aucun rôle dans la conception de l'étude, la collecte et l'analyse des données, la décision de publier, ou de la préparation du manuscrit

Intérêts concurrents:.. Les auteurs ont déclaré aucun conflit d'intérêts existent

Introduction

Malgré diminution de l'incidence du cancer gastrique (GC) dans les pays les plus développés, GC représentaient un total de 989,600 nouveaux cas et 738.000 décès en 2008 dans le monde [1]. Helicobacter pylori
( H. Pylori
) infection dans la muqueuse gastrique peut conduire au développement de la gastrite atrophique (AG) et la métaplasie intestinale (GI) et est un facteur de risque de cardinal pour le développement de la GC [2]. Néanmoins, le développement de l'adénocarcinome gastrique ne peut pas être expliquée par la présence de H. pylori
seul. Effets synergiques des facteurs environnementaux, hôtes, nutritionnels et bactériennes sont censés déclencher la carcinogenèse gastrique, cependant, les mécanismes et les interactions sont encore mal compris [3]. Un certain nombre de modifications génétiques ont été impliqués dans la carcinogenèse gastrique, mais aucun d'entre eux n'a encore été transféré dans la pratique clinique quotidienne en raison du manque de force de l'association [4]. Des données récentes suggèrent une influence potentielle des polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) de gènes liés microARN (miARN) pour le risque de développement du cancer [5].

MiRNAs ne sont ~22 pb, et en raison de son unique, biogenèse sont très stables dans les différents tissus ou des échantillons, ce qui les rend une cible intéressante dans le domaine de la recherche de marqueurs biologiques [6], [7]. Un nombre croissant d'études fonctionnelles suggèrent que miARN peuvent être impliqués dans les différentes étapes de la cancérogenèse gastrique [8]. Cette concordance est également reflétée dans miRNA profilage des études qui ont révélé des altérations spécifiques dans le modèle d'expression dans la muqueuse des patients du GC. En outre, les changements d'expression de miARN sont déjà décelable dans les stades précoces de la cancérogenèse gastrique, y compris H. pylori
induite AG [8].

Accroître la compréhension du rôle fonctionnel des miARN a ouvert une nouvelle capitel dans la recherche de polymorphisme du gène dans le cancer [7], [9]. Simple miARN est capable de cibler des gènes multiples; Par conséquent, l'importance des SNP dans la séquence du gène de miARN peut éventuellement être associé à des modifications remarquables dans la régulation de l'expression génique et la modification du risque pour le développement de certaines maladies humaines, y compris GC [8]. Différentes études ont montré que certains SNPs de gènes miRNA codant peuvent modifier l'expression des miARN ou son rôle fonctionnel et de cette manière influencer le risque de développement du cancer ou de la progression [10], [11]. Un nombre croissant d'études cas-témoins ont montré une association entre les polymorphismes des gènes codant pour les miARN et le risque de différentes tumeurs malignes [5]. polymorphismes de gènes de cinq associés miRNA gènes, miR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) et miR-608
C > G (rs4919510), ont été choisis pour l'étude actuelle en raison de association suggéré précédemment avec les risques de cancer [5], [12] - [14]

mentionné ci-dessus miARN ont été impliqués dans diverses voies liés au cancer.. Liu et al. a montré que miR-27a
est régulée à la hausse dans la GC et agit comme un oncogène en ciblant prohibitin [15]. SNP de miR-27a
(rs895819) contribue à la susceptibilité GC en affectant l'expression de miR-27a
et cible gène doigt de zinc et le domaine BTB contenant 10 ( ZBTB10
) [16]. miR-146a
a été montré pour moduler H. pylori
induit une réponse inflammatoire dans les cellules épithéliales gastriques humaines en ciblant IL-1 kinase associée 1 ( IRAK1
) et le récepteur TNF associé facteur 6 ( TRAF6
) [17]. En outre, miR-146a
SNP (rs2910164) a été associée à AG chez des sujets japonais [18]. Des études antérieures ont démontré aberrante sur l'expression de miR-196a-2
et par conséquent la régulation négative de p27 (Kip1) en GC [16]. Une autre étude a montré que le polymorphisme du gène de miR-196a-2
(rs11614913) a été associée à un risque accru de GC [19], [20] tandis qu'une étude réalisée par Ahn et al. (2012) n'a pas pu confirmer cette association, mais ce SNP a été liée à la survie des patients du GC [21]. miR-492
a été identifié à jouer un rôle important dans la progression des tumeurs malignes du foie embryonnaire [22] et est dérégulée dans le cancer colorectal par rapport à la muqueuse du côlon normale [23]. Un rapport de la population chinoise a montré que SNP de miR-608
(rs4919510) peuvent influer sur le risque de cancer du sein HER2-positif et la prolifération tumorale [14].

La plupart des études de génotypage actuellement publiés connexes à des gènes miRNA dans GC ont été réalisées uniquement chez les sujets asiatiques, sont limitées par la taille réduite des échantillons et les résultats du rapport partiellement contradictoires. En outre, très peu d'études ont déjà abordé le rôle de ces liés miRNA-SNP dans des conditions gastriques précancéreuses. Sur la base des preuves fournies ci-dessus, nous avons effectué une analyse de génotypage systématique pour miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, Mir- 492
et miR-608
SNP chez les patients avec GC, risque élevé gastrite atrophique et les contrôles en utilisant trois groupes de patients en provenance d'Allemagne, la Lituanie et la Lettonie d'origine européenne

Méthodes.

éthique déclaration

l'étude a été approuvée par les comités d'éthique de l'Université Otto von Guericke de Magdebourg, Université lituanienne des sciences de la santé et de l'éthique médicale centrale de la Lettonie. Tous les patients ont signé un formulaire de consentement éclairé pour participer à l'étude.

Les sujets de l'étude population inclus dans l'étude proviennent de nos précédents projets de recherche sur les SNP dans GC et conditions gastriques précancéreuses [24] , [25]. Les patients et les contrôles ont été recrutés au cours des années 2005-2012 dans trois centres de gastro-entérologie en Allemagne (Département de gastro-entérologie, hépatologie et maladies infectieuses, Université Otto-von-Guericke, Magdeburg) Lituanie (Département de gastro-entérologie, Université lituanienne des sciences de la santé, Kaunas) et en Lettonie (Riga University Hospital East et maladies digestives Centre GASTRO, Riga). Les patients atteints de Hrag et les contrôles ont été inclus dans les services de consultations externes, qui ont été référés pour une endoscopie digestive haute en raison de symptômes dyspeptiques. Les critères d'inclusion de Hrag et les témoins étaient sans antécédent de tumeur maligne, d'une maladie gastro-intestinale ou une chirurgie. patients du GC avaient une vérification histologique d'un adénocarcinome gastrique et ont été recrutés de l'extérieur du patient et les services fixes. Au total, 995 personnes, pour qui le matériel avec une qualité d'ADN appropriée était disponible (351 contrôles, 281 et 363 Hrag GC), ont été inclus dans l'étude. Il y avait 310 sujets du groupe allemand (63 contrôles, 106 GC et 141 Hrag), 340 sujets du groupe letton (142 contrôles, 139 GC et 59 Hrag) et 345 sujets du groupe lituanien (146 contrôles, 118 GC et 81 Hrag). Tous les patients étaient d'origine européenne.

L'analyse histologique et H. pylori
état

évaluation histologique détaillée de la muqueuse gastrique a été réalisée dans les contrôles et les groupes Hrag selon la classification modifiée Sydney [26]. Hrag a été défini comme pan-gastrite (scores inflammatoires similaires antre et corpus), corpus prédominant gastrite avec ou sans la présence d'une atrophie gastrique, et IM soit dans l'antre ou corps de l'estomac [27]. H. pylori de statut a été déterminé en testant anti H. pylori
anticorps IgG dans les sérums. Le sous-typage histologique de CG a été effectuée conformément à la classification en types Laurén diffus intestinaux et [28].

Extraction de l'ADN et génotypage

ADN génomique du groupe allemand a été extrait à partir de cellules mononucléaires du sang périphérique en utilisant le kit QIAamp DNA de sang (Qiagen, Hilden, Allemagne) selon les instructions du fabricant. L'ADN génomique à partir d'échantillons de groupes lituanien et letton a été extrait à l'aide méthode d'extraction phénol-chloroforme à partir de cellules mononucléaires du sang périphérique. les échantillons d'ADN ont été stockés à -20 ° C jusqu'à l'analyse. SNPs de miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913 ), miR-492
C > G (rs2289030) et miR-608
C > G (rs4919510) ont été génotypés en utilisant des essais de TaqMan préconçus avec 7500 ™ cycleur en temps réel, en conformité avec les instructions du fabricant (Life Technologies, CA, USA). missions génotypiques ont été confirmées manuellement par inspection visuelle avec le logiciel SDS 2.0.5 compatible avec le système TaqMan.

contrôle de la qualité de génotypage

procédures de contrôle de la qualité ont été appliqués tout au long de génotypage des échantillons. Après génotypage, environ 10% des échantillons dans chaque groupe de génotype ont été sélectionnés pour une analyse répétitive avec un taux de concordance de 100%. échantillons douteuses avaient l'analyse répétitive de triplet. Toutes les parties impliquées dans le génotypage ont été aveuglés au cas ou le contrôle état des échantillons. Les échantillons qui ont échoué à génotype ont été enregistrés comme indéterminé

L'analyse statistique

Tous les sujets ont été classés en trois groupes d'étude:. Contrôles (n = 351), Hrag (n = 281), GC (n = 363). L'âge est affiché comme moyens et les écarts-types, et a été comparé en utilisant ANOVA et le test t de Student non apparié. Les données catégoriques (par exemple le sexe, H pylori infection
, sous-types histologiques de GC, la distribution des génotypes ou allèles.) sont présentés sous forme de fréquences; les comparaisons ont été effectuées en utilisant le test du chi carré.

évaluations de la qualité et l'analyse statistique des données de génotypage ont été effectuées en utilisant la version PLINK du logiciel 1,07 [29]. Les personnes ayant plus de 10% des génotypes et SNP manquant avec un taux d'appel inférieur à 90% ou écart par rapport à Hardy-Weinberg (HWE) dans les contrôles ( P
< 0,05) ont été exclus de l'analyse. Le taux de génotypage moyenne dans tous les échantillons était de 99,6%. Les différences dans la fréquence des allèles entre les cas et les contrôles ont été calculés dans l'échantillon d'étude allemand, lituanien et letton combiné, en utilisant le test de Breslow-Day pour l'hétérogénéité des RUP. Seul un SNP ( miR-608
C > G rs4919510) ont montré l'hétérogénéité des RUP entre les trois groupes d'étude de GC ( P
_{BD < 0,05) et, par conséquent, le pays de naissance a été inclus comme covariable dans une analyse plus approfondie. Association entre Hrag et GC avec des polymorphismes du gène a été calculée en utilisant une analyse de régression logistique avec ajustement pour l'âge, le sexe et le pays de naissance avec des intervalles de confiance à 95% (IC). Les risques relatifs à des mutations ont été étudiés en utilisant le modèle récessive et dominante qui a conduit à une comparaison entre le type sauvage + hétérozygote vs type homozygote et sauvage vs.
Hétérozygote + homozygote, respectivement. Pour régler pour les tests multiples, nous avons calculé un corrigé seuil de signification α = 0,01 (0,05 /5).
de}

Résultats Caractéristiques des sujets:

Les caractéristiques de contrôle, GC et groupes Hrag sont présentés dans le tableau 1. en fonction de l'âge de la vie réelle, les sujets diffèrent considérablement selon l'âge et la répartition par sexe entre les groupes. Comme prévu, les hommes représentaient 63,6% dans le groupe GC, tandis que dans les groupes témoins et Hrag ce sexes constituait 26,8% et 37,7%, respectivement. Les sujets témoins étaient significativement plus jeunes que le groupe Hrag (3 ans) et le groupe GC (5 ans). 52,6% des patients étaient positifs pour H. pylori
dans le groupe de GC, cependant, dans environ 27% des personnes dans le groupe GC H. le statut IgG de pylori n'a pu être obtenue. Plus de 47% des sujets dans le groupe témoin et 42,7% dans le groupe Hrag étaient H. pylori
positif. classification histologique pour les types diffus et GC intestinal a été récupéré pour 62,0% des patients du GC (tableau 1).

Associations de miRNA SNP et risque de GC et Hrag

distribution de Génotype pour les cinq polymorphismes l'étude étaient similaires à ceux attendus pour Hardy-Weinberg Equilibrium: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0,44); rs11614913 (p = 0,95); rs2289030 (p = 0,44); rs4919510 (p = 0,39). Génotype et allèles distributions pour miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
C > G (rs2289030) et miR-608
C > polymorphismes G (rs4919510) du gène en GC et des groupes d'étude Hrag sont présentés dans le tableau 2. Aucune association significative n'a été observée pour les maladies à l'étude après correction pour les tests multiples. Nous avons observé une tendance à miR-196a-2
CT génotype d'être associé à un risque plus élevé de GC par rapport à génotype CC, cependant, la différence n'a pas atteint le seuil de signification ajusté (OR - 1,46, 95% CI 1,03 à 2,07, P
= 0,032). miR-608
génotype GG a été légèrement associé à un risque plus élevé de GC par rapport à génotype CC (OR - 2,34, IC à 95% 1,08 à 5,04, P
= 0,029). Une tendance similaire a été observée dans un modèle récessif pour miR-608
, où CC + CG vs comparaison GG génotype abouti à un OU - 2,44 (IC à 95% de 1,14 à 5,22), ( P
= 0,021).

associations de miRNA SNP et le risque de l'intestin et de type diffus GC

miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
et miR-608
associations SNP ont été testés avec deux types histologiques de GC (diffuse ou intestinale de type GC). Génotype et allèles fréquences pour les groupes d'étude sont présentés dans le Tableau 3. Modèle dominant pour miR-27a
a montré une tendance pour l'allèle T vs C à être lié à un risque plus élevé de type diffus GC (OR - 2,07 , IC à 95% 1,13 à 3,79, P
= 0,018). miR-196-a2
SNP a montré une tendance à la réduction du risque de type intestinal GC dans le modèle récessif (CC + CT vs TT), cependant, la force de l'association n'a pas atteint la signification statistique (OR - 0,47, 95 % CI 0,20 à 1,08, P
= 0,077). Une observation similaire a été faite dans un modèle dominant pour miR-492
SNP (OR - 1,95, IC à 95% 1,01 à 3,75) où GG vs comparaison de GC a conduit à un risque accru de type diffus GC, mais le P
valeur n'a pas atteint le niveau de signification requis ( P
= 0,046). Toutes les autres comparaisons entre le contrôle et diffusent ou des groupes GC de type intestinal n'a pas révélé des associations ou des tendances significatives pour cinq SNP de miARN.

Discussion

Dans la présente étude, nous avons effectué une analyse de génotypage miR-27a
(rs895819), miR-146a
(rs2910164), miR-196a-2
(rs11614913), miR-492
(rs2289030) et miR-608
(rs4919510) des polymorphismes de gènes dans une étude de contrôle de cas dont 351 contrôles, 281 Hrag et 363 patients du GC de trois groupes d'études européens. Ces polymorphismes ont été associés à un risque de GC ou l'ensemble des risques de cancer; cependant, les données rapportées sont partiellement contradictoires ou sur la base de seulement quelques études relatives à des groupes asiatiques. Malgré quelques différences mineures, nos résultats ne soutiennent pas le lien entre les miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, Mir- 492
et miR-608
polymorphismes du gène et la présence de GC ou Hrag. De plus, nous ne pouvions pas trouver une association entre les SNP de miARN et la présence de différents sous-types histologiques de GC. Comme il a été montré miARN d'avoir effet profond dans la carcinogenèse gastrique [8], nous nous attendions à ce que ces polymorphismes pourraient modifier le risque de GC ou de ses précurseurs. À notre connaissance, cette étude est la première qui a enquêté sur les associations entre ces polymorphismes miARN et le risque de GC ou Hrag chez les sujets d'origine européenne. Plus que cela, les SNP de miR-492
(rs2289030) et miR-608
(rs4919510) n'a pas été étudiée en relation avec GC ou conditions gastriques précancéreuses précédemment.

Gene polymorphisme de miR-27a est à l'heure actuelle un des SNP les plus étudiés dans les études cas-témoins liés au cancer. Nous nous attendions à ce que les porteurs de l'allèle C pour miR-27a
SNP pourraient avoir un risque réduit de GC comme cela a été suggéré par certains groupes de recherche. Une étude cas-contrôle chinois, y compris 311 patients du GC et 425 témoins sans cancer a révélé que mineur allèle C de rs895819 dans le miR-27a
significativement réduit le risque de GC avec OR - 0,77 [30]. Une autre étude a montré une augmentation significative du risque GC (OR - 1,48) pour miR-27a
SNP et des analyses plus fonctionnelles ont indiqué que des variantes de génotypes pourraient être responsables de élevée miR-27a
niveaux et réduit les taux d'ARNm de ZBTB10 [16]. En revanche, une étude incluant 2380 participants ayant des lésions gastriques divers n'a pas trouvé un risque accru de IM gastrique ou dysplasie pour rs895819 [12]. Une méta-analyse résumant les conclusions de différentes études cas-témoins a révélé que le polymorphisme rs895819 était significativement associée à une diminution des risques de cancer en blanc, mais pas chez les Asiatiques [31]. Les résultats de notre étude ne supportent pas l'effet protecteur possible de l'allèle C pour le développement de GC chez les sujets européens. Notre étude est la première qui a évalué le rôle de miR-27a
rs895819 en GC et Hrag chez les sujets d'origine européenne, cependant, aucune association significative n'a été observée.

Compte tenu des données existantes sur miR-146a
SNP (rs2910164) pour le développement du cancer nous avons voulu évaluer l'association possible dans notre groupe de patients avec GC et Hrag. Song et al. constaté que les transporteurs CC de rs2910164 avaient un risque significativement accru de IM (OR - 1,42) et de la dysplasie (OR - 1,54) par rapport aux transporteurs GG [12]. Une observation similaire a été faite dans une autre étude où l'effet combiné de miR-146a
(rs2910164) G /G et TLR4 SNP sur le risque accru de AG sévère chez les sujets japonais a été observée [18]. Un document par Okubo et al. [32] ont rapporté que le transport de rs2910164 génotype CC a été associée à un risque significativement plus élevé de GC par rapport aux sujets non-cancer (OR - 1,30). Une méta-analyse par Wang et al. [33] sur miR-146a
rs2910164 dont 19 études cas-témoins a constaté que rs2910164 était liée à une susceptibilité accrue du cancer chez les Asiatiques avec l'ensemble OU - 1,18, mais le même méta-analyse invite pour d'autres études bien conçues avec une grande taille de l'échantillon pour une identification plus poussée des risques. Les résultats de notre étude cas-témoins n'a pas révélé une association significative entre rs2910164 et le risque de GC ou Hrag

miR-196a-2
C >. T SNP (rs11614913) est un du miRNA SNP mieux étudié par rapport à différentes tumeurs malignes. Un rapport de Wang et al. (2013) ont montré que le génotype CC a été associée à un risque significativement réduit de cancer gastrique (OR - 0,78) par rapport aux génotypes CT et TT dans une vaste étude cas-témoins [33]. Une méta-analyse par Wang et al. (2013) ont constaté un risque de GC a augmenté de manière significative, mais l'association a été observée seulement en comparaison de homozygote. Cette méta-analyse a démontré que rs11614913 polymorphisme est significativement associée à un risque global de cancers gastro-intestinaux [34]. Okubo et al. [32] n'a pas trouvé un lien pour ce SNP et GC, cependant, dans leur rs11614913 d'étude a été associée avec le degré de H. pylori de induit par une infiltration de cellules mononucléaires. Fait intéressant, une autre méta-analyse sur le même SNP n'a pas déterminé la relation entre rs11614913 et le développement de GC [35]. Les résultats de notre étude sont en accord avec la conclusion de cette dernière méta-analyse que nous n'avons pas observé d'association significative entre SNP de miR-196a-2
et GC risque.

Polymorphisme de miR-492
(rs2289030) est émis l'hypothèse de médiation risque de cancer, mais les données sur les associations possibles pour ce SNP et le risque de cancer sont encore rares. Une étude menée par Yoon et al. (2012) n'a pas trouvé une association entre SNP de miR-492
et le risque ou la survie chez les patients atteints de cancer non à petites cellules du poumon [36]. Une autre étude sur le cancer colorectal a démontré que la survie sans progression des patients avec le miR-492 combiné
CG et génotype GG était significativement pire que celle des patients avec le miR-492
génotype CC [13]. Nos résultats indiquent que rs2289030 de miR-492
n'a pas été liée à la présence de GC ou Hrag. À notre connaissance, cette étude est la première qui examine la relation entre miR-492
SNP et conditions gastriques précancéreuses ou GC et, par conséquent, aucune comparaison de nos données peut fait.

SNP miR-608
(rs4919510) n'a pas été étudiée en relation avec GC risques précédemment. Notre étude est la première à signaler association nulle entre ce polymorphisme et le risque de GC ou conditions gastriques précancéreuses. Chez les patients atteints d'un cancer colorectal rs4919510 était significativement liée à la récidive du cancer et la mort [37]. Une autre étude cas-témoins sur les patients atteints de cancer colorectal n'a pas trouvé une association avec le risque de cancer, mais leurs résultats ont montré que génotype GG était associé à un risque accru de décès dans la population blanche et réduit le risque de décès chez les Afro-Américains [38]. De plus grandes études à grande échelle pourraient déterminer le rôle miR-608
rs4919510 SNP dans les tumeurs malignes gastriques et autres.

Intestinal et diffus types de GC ont été montré pour avoir différentes voies pathogéniques [3]. Certaines études ont montré que les polymorphismes miARN pourraient avoir des effets différents pour les sous-types histologiques de GC. Après stratifier les patients dans les groupes GC intestinaux et de type diffus, miR-499
rs3746444 a été montré à influencer le risque de type diffus GC dans la population coréenne [21]. Bien que le nombre d'individus au sein de l'intestin et des groupes de GC de type diffus n'a pas été très élevé dans notre étude, l'analyse comparant ces deux types histologiques distincts de GC a été réalisée. Dans l'ensemble, miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
et miR-608
SNP n'a pas été liée à la présence de différents sous-types histologiques de GC. Bien que certaines tendances décrites dans la section des résultats ont été observés entre le sous-groupe histologique de GC, les différences de génotype et de l'allèle fréquences n'a pas atteint les niveaux de signification requis.

Les résultats de notre étude confirment clairement l'importance d'une évaluation minutieuse des polymorphismes des gènes dans les différents groupes ethniques. SNPs miRNA liées Auparavant proposées ne montrent pas GC liées différences substantielles dans notre population européenne. Néanmoins, nous admettons qu'il ya plusieurs limitations liées à la conception de notre étude. Il y avait des différences de distribution entre les sexes entre GC, Hrag et les groupes de contrôle; cependant, lorsque l'analyse statistique, nous avons inclus le sexe comme covariable, minimisant ainsi l'influence potentielle du genre pour le résultat de nos résultats. Ici, dans cette étude, nous avons mis l'accent sur les changements histologiques plutôt que la présence de H. pylori
; par conséquent, des tests supplémentaires en dehors des anticorps IgG sériques pour la détection de cette bactérie ne sont pas appliquées. En outre, il est bien connu que la gastrite atrophique chronique est causée par H. pylori
infection. Nous ne sommes pas ajuster ou pour H. Les anticorps IgG de pylori, CagA
ou VacA de statut parce que cette information n'a pas été disponible pour tous les sujets. Nous ne pouvions pas effectuer des analyses d'association SNP pour des miARN par rapport à la survie des patients atteints de GC, car l'information était disponible seulement pour une petite proportion de sujets. En raison de la même raison, nous avons également ne pas effectuer des analyses selon la localisation anatomique de la dans l'estomac (proximale vs. distale). Dans cette étude, nous avons effectué uniquement analyse du polymorphisme du gène sans tenir compte des différences d'expression des miARN dans les tissus cancéreux et non cancéreux et, par conséquent, nous ne pouvons pas postuler si ces polymorphismes pourraient avoir un rôle fonctionnel. D'autres études devraient évaluer le rôle des SNP pour les niveaux de miARN dans les tissus de GC et d'évaluer les gènes cibles potentiels dans les études fonctionnelles. Le nombre de personnes au sein des sous-groupes dans notre étude des groupes GC intestinale et de type diffus est relativement faible et pourrait être la puissance suffisante pour détecter des associations spécifiques. Nous avons trouvé des différences pour miR-196a-2 et miR-608 SNPs parmi les groupes avec P
< 0,05; Cependant, nous pensons que nous ne pouvons pas signaler une association significative, car ils ne sont pas parvenus à notre ajustée P
valeur. Comparaisons multiples pour les tests d'association génétique ont été appliquées dans le présent document et nous pensons que nous devrions utiliser le P
valeur ajustée pour tirer les conclusions.

Conclusions

Nos spectacles d'étude que des polymorphismes du gène de miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
et miR -608
ne sont pas associés à un risque de GC et Hrag chez les sujets d'origine européenne. Ces SNP ne semblent pas en tant que biomarqueurs potentiels pour identifier les individus à un risque accru pour GC.

Remerciements

Nous tenons à remercier Lina Baldauskiene pour une excellente aide avec des expériences de génotypage dans le laboratoire.

• PLOS ONE: microARN-10a est régulée à la baisse par méthylation de l'ADN et les fonctions comme un suppresseur de tumeur dans le cancer gastrique Cells
• PLOS ONE: Association entre polymorphismes dans XRCC1 Gene and Outcomes traitement des patients atteints du cancer avancé de l'estomac: Une revue systématique et méta-Analysis