PLoS ONE: Genų Polimorfizmas apie mikro RNR Helicobacter pylori sukeltos Didelės rizikos Atrophic gastritu ir skrandžio Cancer

Anotacija

Fono ir siekia

mikro RNR (miRNAs) yra žinomas dėl savo funkcijos, kaip transliacijos reguliavimo naviko slopintuvas ar onkogenų. Vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) in miRNAs susijusių genų buvo įrodyta, turi įtakos reguliavimo pajėgumus miRNAs ir buvo susijęs su skrandžio vėžiu (GC) ir ikivėžinių skrandžio sąlygomis. Šio tyrimo tikslas buvo įvertinti potencialius ryšius tarp Mirna susijusių genų polimorfizmas ( Pasaulis-27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2
Pasaulis-492 parsisiųsti ir Pasaulis-608
) ir GC ar didelės rizikos atrofinį gastritas (HRAG) buvimą Europos gyventojų.

metodai

Genų polimorfizmas buvo analizuojami 995 dalykų (kontrolė: N = 351; GC n = 363; HRAG: N = 281) Europos kilmės. , MIR-27a
T > C (rs895819) Pasaulis-146A
"G > C (rs2910164) Pasaulis-196a-2
, C > T (rs11614913) Pasaulis-492
"G > C (rs2289030) ir Pasaulis-608
, C >. G (rs4919510) SNP buvo genotipą RT-PCR

rezultatai

Apskritai, SNP iš miRNAs nebuvo susijęs su GC ar HRAG buvimą. Mes pastebėjo tendenciją, Pasaulis-196a-2
KT genotipas turi būti susijęs su didesne rizika, GC, palyginti su CC genotipą, tačiau skirtumas nebuvo pasiekti reguliuojamas P
-Pridėtinės (šansų santykis (OR) - 1,46, 95% pasikliautinasis intervalas (PI) 1,03-2,07 P
= 0,032). , MIR-608
GG genotipą buvo dažnesnės GC, lyginant su kontrole (arba -2.34, 95% PI 1.08-5.04), bet reikšmė išliko nedidelis ( P
= 0,029). Panaši tendencija buvo pastebėta, kad recesyvinis modelio Pasaulis-608
, kur CC + CG vs VS genotipo palyginimas parodė tendenciją didinti rizikos GC su arba 2,44 (95% PI 1.14-5.22, P
= 0,021). Genotipų ir alelių iš Pasaulis-27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2
Pasaulis-492 parsisiųsti ir MIR-608
SNP buvo panašus paskirstymą tarp histologinių potipių GC ir nebuvo susijęs su pasklidosios arba žarnyno tipo GC buvimą.

Išvados

Genų polimorfizmas yra miR -27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2
Pasaulis-492
Pasaulis-492a parsisiųsti ir Pasaulis-608
nebuvo susijęs su HRAG, GC ar skirtingų histologinių potipių GC buvimo Europos dalykų

nurodomoji dalis:. Kupčinskas J Wex T susieti, Leja, M, Bružaitė aš, Steponaitiens R, ir kt. (2014) genas Polimorfizmas apie mikro RNR į Helicobacter pylori
indukuotų Didelės rizikos Atrophic gastritu ir skrandžio vėžio. PLoS ONE 9 (1): e87467. Doi: 10,1371 /journal.pone.0087467

redaktorius: Masaru Katoh, Nacionalinis vėžio centras, Japonija

Įstojo: rugsėjo 14, 2013; Priėmė: Gruodžio 26, 2013 m Paskelbta 27 sausio 2014

Visos teisės saugomos: © 2014 Kupčinskas ir kt. Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Šis darbas parėmė Europos socialinio fondo (Nr VP1-3.1-a-mm-07-K-01-156), ir iš dalies dėl dotacijos iš BMBF (BMBF-0315905D) atsižvelgiant į ERA-NET PathoGenoMics projekto rėmo. Pacientų Latvijoje įdarbinimas rėmė iš dalies iš Europos regioninės plėtros fondo projekto (Nr 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį

konkuruojančių interesų.. Autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Nors mažėja sergamumas skrandžio vėžiu (GC) į labiausiai išsivysčiusių šalių, GC sudarė iš 989,600 naujų atvejų iš viso ir 738,000 mirčių 2008 visame pasaulyje [1]. Helicobacter pylori
( h. Pylori
) infekcijos skrandžio gleivinės gali baigtis atrofinį gastritas (AG) ir žarnyno metaplazijos (IM) plėtros ir kardinolas rizikos veiksnys plėtojant GC [2]. Nepaisant to, skrandžio adenokarcinoma plėtra negali būti paaiškinti H buvimą. pylori
vieni. Sinergetinį poveikį aplinkai, šeimininkus, mitybos ir bakterinių veiksnių yra manoma, kad sukelti skrandžio kancerogenezės Tačiau mechanizmai ir sąveika vis dar menkai suprantama [3]. Iš genų pakitimų skaičius buvo susijęs skrandžio kancerogenezėje, tačiau nė vienas iš jų buvo dar perkeltas į kasdieninėje klinikinėje praktikoje dėl asociacijos stiprumo [4] trūkumo. Naujausi duomenys rodo, kad potencialią įtaką vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) iš MicroRNA susijusių genų (miRNAs) už vėžio išsivystymo [5] rizika.

miRNAs tik ~22 BP ilgai, ir dėl unikalios biogenesis yra labai stabilus skirtingų audinių ar egzempliorių, todėl jiems patrauklią tikslą biologinis mokslinių tyrimų srityje [6], [7]. Daugėja funkcinių tyrimų rodo, kad miRNAs gali dalyvauti įvairiuose etapuose skrandžio kancerogenezėje [8]. Tai sutapimas taip pat atsispindi Mirna profiliavimo tyrimai, kurie atskleidė konkrečius pakeitimus išraiška modelis gleivinės GC pacientams. Be to, Mirna ekspresijos pokyčiai jau aptinkamas ankstyvosiose stadijose skrandžio kancerogenezėje įskaitant H. pylori
sukeltas AG [8].

Didinti supratimą apie funkcinį vaidmenį miRNAs atidarė naują Capitel genų Polimorfizmas tyrimų vėžio [7], [9]. Vienvietis Mirna gali nukreipti kelis genus; todėl iš Mirna genų sekos VNP-ai reikšmė potencialiai gali būti susijęs su puikių pokyčių reguliuoja genų ekspresiją ir keitimo rizikos plėtojant tam tikrų ligų, įskaitant GC [8]. Įvairūs tyrimai parodė, kad tam tikri SNP iš Mirna-koduojančių genų gali pakeisti Mirna išraiška arba jos funkcinį vaidmenį ir tokiu būdu įtakoti vėžio išsivystymo ar progresuoja [10] riziką [11]. Daugėja atvejo-kontrolės tyrimai parodė asociaciją tarp genų, koduojančių miRNAs polimorfizmas ir įvairių piktybinių navikų [5] rizika. Genų polimorfizmas penkių Mirna susijusių genų Pasaulis-27a
T > C (rs895819) Pasaulis-146A
"G > C (rs2910164) Pasaulis-196a-2
C > T (rs11614913) Pasaulis-492
"G > C (rs2289030) ir Pasaulis-608
, C > G (rs4919510), buvo pasirinktas šios studijos, nes anksčiau siūlė asociacija su vėžio riziką [5], [12] - [14]

Minėti miRNAs buvo susijęs įvairių vėžio susijusių kelius.. Liu ir kt. parodė, kad Pasaulis-27a
yra iki-reguliuojami GC ir veikia kaip onkogeno nukreipiant prohibitin [15]. SNP iš Pasaulis-27a
(rs895819) prisideda prie GC jautrumo per įtakos Pasaulis-27a
išraišką ir skirta genų cinko pirštų ir BTB domeną, turintį 10 ( ZBTB10
) [16]. , MIR-146A
buvo parodyta moduliuoti H. pylori
sukelta uždegiminė reakcija į žmogaus skrandžio epitelinių ląstelių nukreipiant IL-1, susijusios kinazės 1 ( IRAK1
) ir TNF receptoriaus susijęs veiksnys 6 ( TRAF6
) [17]. Be to, Pasaulis-146A
SNP (rs2910164) buvo susijęs su AG japonų [18]. Ankstesni tyrimai parodė, netipinė per išraiška Pasaulis-196a-2
ir dėl to žemyn reguliavimo P27 (kip1) GC [16]. Kitas tyrimas parodė, kad genų polimorfizmas yra Pasaulis-196a-2
(rs11614913) buvo susijęs su padidėjusia rizika GC [19], [20] o tyrimas Ahn et al. (2012) negalėjo patvirtinti šią asociaciją, tačiau tai SNP buvo susijusi su išlikimo GC pacientų [21]. , MIR-492
buvo nustatyta, kad svarbų vaidmenį piktybinių kepenų navikų embriono [22] progresavimo ir nereguliuojama ir tiesiosios žarnos vėžiu, palyginti su normalaus storosios žarnos gleivinės [23]. Ataskaitą Kinijos gyventojų paaiškėjo, kad SNP iš Pasaulis-608
(rs4919510) gali turėti įtakos HER2 teigiamas krūties vėžio riziką ir naviko proliferaciją [14].

Daugelis šiuo metu paskelbtus genotipo tyrimus, susijusius į Mirna genų GC buvo atliekami tik Azijos dalykų, yra tik mažų imčių dydžių ir ataskaitų iš dalies prieštaringus rezultatus. Be to, labai nedaug tyrimų anksčiau kreipėsi į šių Mirna susijusių VNP-ai iš ikivėžinių skrandžio sąlygomis vaidmenį. Remiantis įrodymais aukščiau pateikta, mes atliekame sistemingą genotipo analizę Pasaulis-27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2
miR- 492 parsisiųsti ir MIR-608
SNP pacientams, sergantiems GC, didelės rizikos atrofinį gastritas ir kontrolės, naudojant tris pacientų grupes iš Vokietijos, Lietuvoje ir Latvijoje Europos nusileidimas.

metodai

etika pareiškimas

tyrimas patvirtino etikos komitetų Otto-von-Guericke universiteto Magdeburg, Lietuvos sveikatos mokslų universitetas ir Centrinės medicinos etikos komiteto Latvijos. Visi pacientai pasirašė informuoto sutikimo formą dalyvauti tyrime.

tiriamojoje populiacijoje

Dalykai įtraukti į tyrimo ateina iš mūsų ankstesnių tyrimų projektuose VNP-ai GC ir ikivėžinių skrandžio sąlygomis [24] [25]. Pacientai ir kontrolė buvo įdarbinti per metus 2005-2012 trys gastroenterologijos centrų Vokietijoje (departamentas Gastroenterologijos, Hepatologijos ir infekcinių ligų, Otto-von-Guericke universiteto, Magdeburg) Lietuva (departamentas Gastroenterologijos, Lietuvos sveikatos mokslų universitetas, Kaunas) ir Latvijoje (Ryga Rytų universiteto ligoninė ir virškinimo sistemos ligos centras GASTRO, Ryga). Pacientai, sergantys HRAG ir kontrolės buvo įtraukti iš nestacionariose departamentų, kurie buvo atvykę endoskopinio nes dispepsijos simptomų. Įtraukimo kriterijai HRAG ir kontrolės nebuvo piktybinių, virškinimo trakto liga arba chirurgijos istorija. GC pacientų histologinės patikrinti skrandžio adenokarcinoma ir buvo įdarbinti iš Ambulatorinė ir stacionarių skyriuose. Iš viso 995 asmenų, kuriems buvo prieinama medžiaga su atitinkamu DNR kokybė (351 kontrolę, 281 HRAG ir 363 GC) buvo įtraukti į tyrimą. Nebuvo 310 tiriamieji iš Vokietijos grupės (63 kontrole, 106 GC ir 141 HRAG), 340 tiriamieji iš Latvijos grupės (142 kontrolę, 139 GC ir 59 HRAG) ir 345 tiriamieji iš Lietuvos grupės (146 kontrolę, 118 GC ir 81 HRAG). Visi pacientai buvo Europos nusileidimas.

histologinis tyrimas ir h. pylori
statusas

Detali histologinis įvertinimas skrandžio gleivinės buvo atlikta kontrolės ir HRAG grupes pagal modifikuotą Sidnėjaus klasifikaciją [26]. HRAG buvo apibrėžta kaip visos gastritas (panašių uždegiminių balai antralinėje dalyje ir corpus), Corpus-dominuojantis gastritas su arba be skrandžio atrofija akivaizdoje, MP nei antralinėje dalyje arba corpus skrandžio [27]. h. pylori
statusas nustatomas ištiriant už kovos su H. pylori
IgG antikūnų serume. Histologinis potipius GC buvo atliktas pagal Lauren skirstymo į žarnyno ir pasklidusius-tipų [28].

DNR išskyrimas ir genotipo

Genomo DNR iš Vokietijos grupės buvo išskirta iš periferinio kraujo ląstelių vienabranduolėse naudojant QIAamp DNR kraujo komplektas (Qiagen, Hilden, Vokietija) pagal gamintojo instrukcijas. Genomo DNR mėginius Lietuvos ir Latvijos grupių buvo ekstrahuojamas naudojant fenolio-chloroformo nusiurbimo metodą nuo periferinio kraujo mononuklearų ląsteles. DNR mėginiai buvo laikomi -20 ° C temperatūroje, kol analizės. SNP iš Pasaulis-27a
, C > G (rs895819) Pasaulis-146A
C > G (rs2910164) Pasaulis-196a-2
C > T (rs11614913 ) Pasaulis-492
, C > G (rs2289030) ir Pasaulis-608
, C > G (rs4919510) buvo nustatytas genotipas naudojant sukonstruotų TaqMan® tyrimus, atliekamus su 7500 ™ realaus laiko Jutiklis ciklų, pagal gamintojo instrukcijas (Life technologies, CA, JAV). Genotipo užduotys buvo rankiniu būdu patvirtina apžiūrint su TVS 2.0.5 programine įranga suderinama su TaqMan® sistema.

genotipo kokybės kontrolė

Kokybės kontrolės procedūros buvo taikomos visoje genotipo mėginių. Po genotipo, maždaug 10% mėginių kiekvienam genotipui grupės buvo atrinkti pasikartojantis analizę 100% konkordanci- norma. Abejotinos mėginiai buvo tripleto pasikartojantis analizę. Visi dalyvaujantys genotipo šalys buvo apakinti teismų ar kontrolės statusą mėginių. Mėginiai, nepavyko genotipo buvo registruojami kaip Nenustatyta

Statistinė analizė

Visi tiriamieji buvo suskirstyti į tris studijų grupes:. Kontrolės (n = 351), HRAG (n = 281), GC (n = 363). Amžius rodomas kaip vidurkius ir standartinius nukrypimus, ir buvo lyginamas naudojant ANOVA ir neporiniai Stjudento t-testą. Kategoriškas duomenis (pvz lytis H.pylori
infekcija, histologiniai GC potipiai, platinimas genotipų ar alelių.) Yra pristatomi kaip dažniais; palyginimai buvo atliekami naudojant chi kvadrato testas.

Kokybės vertinimai ir statistinė analizė genotipo duomenų buvo atliekamas naudojant Šaudyti programinės įrangos versiją 1,07 [29]. Asmenys, turintys daugiau kaip 10% trūksta genotipus ir SNP su skambučių tarifas mažesnis nei 90% arba nukrypimas nuo Hardy-Weinberg pusiausvyros (HWE) kontrolinių ( P
< 0,05) buvo pašalinti iš tolesnei analizei. Vidutinis genotipo norma visose mėginių buvo 99,6%. Skirtumai alelių dažnius tarp atvejų ir kontrolės buvo apskaičiuojamas Kombinuotosios Vokietijos, Lietuvos ir Latvijos studijų mėginio, naudojant Breslow-Day testą heterogeniškumo atokiausių regionų. Tik vienas SNP ( Pasaulis-608
, C > G rs4919510) parodė, heterogeniškumas iš atokiausių regionų tarp trijų GC tyrimo grupių ( P
_{BD < 0,05), todėl iš šalies gimimo buvo įtrauktas į tolesnę analizę kovariantiniu. Asociacija tarp HRAG ir GC su genų polimorfizmas buvo apskaičiuotas naudojant logistinės regresijos analizės koregavimo amžių, lytį ir gimimo šalį su 95% pasikliovimo intervalai (PI). Santykiniai rizika mutacijų buvo tiriami naudojant recesyvinį ir dominuojantis modelis, kuri atvedė į palyginimą laukinio tipo + heterozigotinės vs homozigotiškas ir laukinio tipo vs.
Heterozigotinės + homozigotiškas, atitinkamai. Norėdami reguliuoti daugkartiniam bandymų mes apskaičiavome pataisyta reikšmė riba α = 0,01 (0,05 /5).}

Rezultatai

Charakteristikos dalykų

kontrolės charakteristikos, GC ir HRAG grupės pateikta 1 lentelėje pagal realaus gyvenimo amžių, dalykų skyrėsi reikšmingai pagal amžių ir lyčių pasiskirstymą tarp grupių. Kaip ir tikėtasi, vyrai sudarė 63,6% GC grupės, o kontrolės ir HRAG grupių šis lyčių sudarė 26,8% ir 37,7%, atitinkamai. Kontrolinės grupės tiriamųjų buvo žymiai jaunesnis nei HRAG grupės (3 metai) ir GC grupės (5 metų). 52,6% pacientų buvo teigiamas H. pylori
GC grupės, tačiau apie 27% asmenų GC grupės H. pylori
IgG statusas negalėjo būti gautas. Per 47% asmenų kontroline grupe ir 42,7% iš HRAG grupėje buvo h. pylori
teigiamas. Histologinis klasifikacija pasklidųjų ir žarnyno GC tipų buvo ištrauktas 62,0% GC pacientų (1 lentelė).

asociacijos Mirna VNP-ai ir rizikos GC ir HRAG

genotipas paskirstymas visuose penkiuose polimorfizmas į tyrimas buvo panašios į tas, tikimasi Hardy-Weinberg Equilibrium: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0.44); rs11614913 (p = 0.95); rs2289030 (p = 0.44); rs4919510 (p = 0.39). Genotipo ir alelių pasiskirstymo Pasaulis-27a
, C > G (rs895819) Pasaulis-146A
, C > G (rs2910164) Pasaulis-196a 2-
, C > T "(rs11614913) Pasaulis-492
, C > G (rs2289030) ir Pasaulis-608
, C > G (rs4919510) genų polimorfizmas GC ir HRAG tyrimo grupių pateikti 2 lentelėje. Nėra pastebėta reikšmingų asociacijos ligų pagal studijų šiais korekcijos kelių bandymų. Mes nustatėme tendenciją Pasaulis-196a-2
KT genotipas turi būti susijęs su didesne rizika, GC, palyginti su CC genotipą, tačiau skirtumas nebuvo pasiekti patikslintą reikšmingumo ribą (AR - 1,46, 95% PI 1,03-2,07 P
= 0,032). , MIR-608
GG genotipą buvo nežymiai susijęs su didesne rizika, GC, palyginti su CC genotipą (arba - 2,34, 95% PI 1,08-5,04 P
= 0,029). Panaši tendencija buvo pastebėta, kad recesyvinis modelio Pasaulis-608
, kur CC + CG vs VS genotipo palyginti lėmė arba - 2,44 (95% PI 1,14-5,22), ( p
= 0,021).

asociacijos Mirna VNP-ai ir rizikos žarnyno ir difuzinis tipo GC

, MIR-27a
Pasaulis-146A
, Pasaulis-196a-2
Pasaulis-492 parsisiųsti ir , MIR-608
SNP asociacijos buvo išbandytas su dviem histologinių tipų GC (išplitęs arba žarnyno tipo GC). Genotipo ir alelių dažniai tyrimo grupių, pateikti 3 lentelėje dominuojančia modelio Pasaulis-27a
parodė tendenciją alelio T vs C būti susijęs su didesne rizika difuzinis tipo GC (arba - 2.07 , 95% PI 1,13-3,79 P
= 0,018). , MIR-196-A2
SNP parodė polinkį mažesne rizika žarnyno tipo GC į recesyvinis modelio (CC + CT vs TT), tačiau asociacija stiprumas nebuvo statistiškai reikšmingas (arba - 0,47, 95 % PI 0,20-1,08 P
= 0,077). Panaši pastaba buvo padaryta dominuojančia modelio Pasaulis-492
SNP (arba - 1,95, 95% PI 1,01-3,75), kur VS vs GC palyginti lėmė padidėjusi rizika difuzinis tipo GC, tačiau P
vertė nepasiekė reikalingos reikšmingumo lygmuo ( P
= 0,046). Visi kiti palyginimai tarp kontrolės ir išplitęs arba žarnyno tipo GC grupės neatskleidė reikšmingų asociacijoms ar tendencijas penkerius VNP-ai iš miRNAs.

Diskusijos

Šios studijos atlikome genotipo analizė Pasaulis-27a
(rs895819) Pasaulis-146A
(rs2910164) Pasaulis-196a-2
(rs11614913) Pasaulis-492
(rs2289030) ir Pasaulis-608
(rs4919510) genų polimorfizmas tuo atveju kontrolinio tyrimo įskaitant 351 kontrolę, 281 HRAG ir 363 GC pacientų iš trijų Europos studijų grupes. Šie polimorfizmas buvo susijęs su GC arba bendra vėžio rizikos rūšis; Tačiau pateikti duomenys yra iš dalies prieštaringi arba remiantis tik kelis tyrimus, susijusius su Azijos grupes. Nepaisant kai kurių nedidelių skirtumų, mūsų rezultatai nepalaiko tarp Pasaulis-27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2
miR- nuorodą 492 parsisiųsti ir Pasaulis-608
genų polimorfizmas ir GC ar HRAG buvimą. Be to, mes negalėjome rasti tarp VNP-ai iš miRNAs ir skirtingų histologinių potipių GC akivaizdoje asociacija. Nuo miRNAs buvo įrodyta, kad turėti didelį poveikį skrandžio kancerogenezėje [8], tikėjomės, kad šie polimorfizmas gali pakeisti GC ar jo pirmtakų riziką. Mūsų žiniomis, tai pirmasis tyrimas, kuris tyrė ryšį tarp šių Mirna polimorfizmas ir GC ar HRAG rizikos subjektų Europos kilmės. Daugiau nei, kad SNP iš Pasaulis-492
(rs2289030) ir Pasaulis-608
(rs4919510) netirta, susijusių su GC ar ikivėžinių skrandžio sąlygomis anksčiau buvusių.

Genų polimorfizmas miR-27a šiuo metu yra viena iš labiausiai tiriamų VNP-ai vėžiu susiję atvejo-kontrolės tyrimai. Mes tikėjomės, kad vežėjai C alelio už Pasaulis-27a
SNP gali turėti mažesnį pavojų GC kaip buvo pasiūlyta kai kurių mokslinių tyrimų grupių. Kinų atvejo ir kontrolės tyrimas, įskaitant 311 GC pacientams ir 425 vėžiu be kontrolės nustatė, kad nepilnametis alelis C rs895819 į miR-27a
žymiai sumažino riziką GC su AR - 0,77 [30]. Kitas tyrimas parodė, kad gerokai padidėjusi rizika GC (arba - 1,48) už Pasaulis-27a
SNP ir toliau funkciniai tyrimai rodo, kad variantas genotipai gali būti atsakingas už padidėjusi Pasaulis-27a
lygiai ir sumažinta ZBTB10
iRNR lygiui [16]. Priešingai, tyrimas, įskaitant 2380 dalyvių su įvairiais skrandžio pakitimų nerado, padidėja rizika susirgti skrandžio IM arba displazija už rs895819 [12]. Metaanalizė apibendrinant įvairių atvejo-kontrolės tyrimų rezultatai parodė, kad rs895819 polimorfizmas buvo reikšmingai susijęs su sumažėjusiu riziką vėžio balta, bet ne azijiečių [31]. Mūsų tyrimo rezultatai nepalaiko galimą apsauginį poveikį C alelio GC plėtra Europos dalykų. Mūsų tyrimas yra pirmasis, kuris įvertino, Pasaulis-27a
rs895819 GC ir HRAG asmenims, Europos kilmės, tačiau buvo pastebėta jokių reikšmingų asociacijos vaidmenį.

Atsižvelgiant į esamą įrodymų Pasaulis-146A
SNP (rs2910164) vėžio vystymosi norėjome įvertinti galimą asociaciją mūsų grupės pacientams, sergantiems GC ir HRAG. Daina ir kt. nustatė, kad CC vežėjai rs2910164 turėjo žymiai didesnę riziką IM (arba - 1.42) ir displazija (arba - 1.54), palyginti su GG vežėjams [12]. Panaši pastaba buvo padaryta kitą tyrimą, kuriame bendras poveikis, buvo pastebėtas Pasaulis-146A
(rs2910164) G /g, ir TLR4 SNP padidėjusią riziką sunkus AG tarp japonų [18]. Popieriaus iki Okubo et al. [32] pranešė, kad vežimas rs2910164 CC genotipą buvo susijęs su didesne rizika, GC, palyginti su ne vėžio dalykų (arba - 1,30). Metaanalizė Wang et al. [33] dėl Pasaulis-146A
rs2910164 įskaitant 19 atvejo-kontrolės tyrimai parodė, kad rs2910164 buvo susijęs su padidėjusia vėžio jautrumą azijiečiams su bendra ARBA - 1,18, tačiau pats metaanalizė ragina tolesniam gerai suprojektuoti tyrimų su dideliu imties dydis tolesniam rizikos nustatymo. Mūsų atvejo-kontrolės tyrimo rezultatai neatskleidė reikšmingos asociaciją tarp rs2910164 ir GC ar HRAG rizikos

, MIR-196a-2
, C >., T SNP (rs11614913) yra vienas iš geriausiai mokėsi Mirna VNP-ai, atsižvelgiant į įvairių piktybinių navikų. Ataskaita Wang et al. (2013) parodė, kad CK genotipas buvo susijęs su žymiai mažesne rizika skrandžio vėžio (arba - 0,78), palyginti su CT ir TT genotipų didelio atvejo-kontrolės tyrimo [33]. Metaanalizė Wang et al. (2013) nustatė, žymiai padidėjo GC riziką, tačiau asociacija buvo stebimas tik homozigotos palyginimui. Ši metaanalizė parodė, kad rs11614913 polimorfizmas yra reikšmingai susijęs su bendra rizika virškinimo trakto vėžio [34]. Okubo ir kt. [32] nerado šiam SNP ir GC nuorodą, tačiau, jų studijų rs11614913 buvo susijęs su H laipsnį. pylori
indukuotų limfocitų infiltracija. Įdomu tai, kad kita metaanalizė tą pačią SNP nebuvo nustatyti ryšį tarp rs11614913 ir GC plėtros [35]. Mūsų tyrimo rezultatai atitinka pastarosios metaanalizę išvadą, mes nesilaikė reikšmingas ryšys tarp SNP yra Pasaulis-196a-2 parsisiųsti ir GC rizika.

Polimorfizmas Pasaulis-492
(rs2289030) yra hipotezę tarpininkauti vėžio riziką, tačiau duomenys apie galimus asociacijų šio SNP ir vėžio rizika vis dar menki. Atliktas tyrimas Yoon et al. (2012) nerado tarp SNP asociacija Pasaulis-492 parsisiųsti ir rizika arba išlikimas pacientams su nesmulkiųjų ląstelių plaučių vėžiu [36]. Kitas tyrimas dėl storosios žarnos vėžio įrodė, kad be ligos progresavimo pacientų su Kombinuotosios miR-492 pervežimas CG ir GG genotipą buvo žymiai blogesnė nei pacientų su miR-492
CK genotipas [13]. Mūsų rezultatai rodo, kad Pasaulis-492
nebuvo susijęs su GC ar HRAG akivaizdoje rs2289030. Mūsų žiniomis, tai pirmasis tyrimas, kuriame nagrinėjama, tarp Pasaulis-492
SNP ir ikivėžinių skrandžio sąlygų ar GC, todėl negalima lyginti mūsų duomenų gali padaryti.

SNP Santykių Pasaulis-608
(rs4919510) nebuvo tirtas lyginant su GC rizikuoja anksčiau. Mūsų tyrimas yra pirmasis pranešti null asociaciją tarp šio polimorfizmo ir GC ar ikivėžinių skrandžio sąlygomis rizika. Gaubtinės ir tiesiosios žarnų vėžiu sergantiems pacientams rs4919510 buvo žymiai siejamas su vėžio pasikartojimo ir mirties [37]. Kitas atvejis-kontrolė tyrimas dėl storosios žarnos vėžiu sergančių pacientų neradote su vėžio rizika asociaciją, tačiau jų rezultatai parodė, kad VS genotipas buvo susijęs su padidėjusia mirties rizika baltame gyventojų ir sumažinta riziką mirties Afrikos amerikiečiai [38]. Daugiau didesni masto tyrimai gali nustatyti vaidmenį Pasaulis-608
rs4919510 SNP skrandžio ir kitų piktybinių navikų.

Žarnyno ir pasklidųjų taršos tipais GC buvo įrodyta, kad turėti skirtingas patogenezės kelius [3]. Kai kurie tyrimai parodė, kad Mirna polimorfizmas gali turėti įvairius efektus histologinių potipių GC. Po stratifikuoti žarnyne ir difuzinis tipo GC grupių pacientams Pasaulis-499
rs3746444 buvo įrodyta, turi įtakos pasklidosios tipo GC riziką Korėjos gyventojų [21]. Nors atskirose šalyse žarnyno ir difuzinis tipo GC grupių skaičius nebuvo labai didelis mūsų tyrime buvo atlikta analizė, lyginant šiuos du skirtingus histologinius tipus GC. Apskritai, Pasaulis-27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2
Pasaulis-492 parsisiųsti ir Pasaulis-608
SNP nebuvo susijęs su įvairių histologinių potipių GC buvimą. Nors kai kurie aprašyti rezultatų skyriuje tendencijos pastebėtos tarp histologinio pogrupio GC, į genotipą ir alelių dažnių skirtumų nebuvo pasiekti reikiamus reikšmingumo lygiai.

rezultatai mūsų tyrime aiškiai remti atidžiai įvertinus svarbą geno polimorfizmas skirtingų etninių grupių. Anksčiau rasti Mirna susijusios SNP neparodė didelių GC susiję skirtumus mūsų Europos gyventojų. Vis dėlto, mes pripažinti, kad yra keletas apribojimai, susiję su mūsų tyrimą. Nebuvo lyčių pasiskirstymo skirtumai tarp GC, HRAG ir kontrolinės grupių; Tačiau atliekant statistinę analizę mes įtraukti lyties kovariantiniu, taip sumažinant galimą įtaką lytį mūsų rezultatus rezultatus. Čia, šiame tyrime mes sutelktas į histologinių pokyčių, o ne į H buvimą. pylori
; Todėl, papildomi bandymai be serumo IgG antikūnų nustatymui ši bakterija nebuvo taikomos. Be to, ji yra gerai žinoma, kad lėtinis atrofinio gastritas sukelia H. pylori
infekcija. Mes ne reguliuoti arba h. pylori
IgG antikūnai CagA
arba Vaca
statusas, nes ši informacija nebuvo prieinama visiems subjektams. Mes negalėjome atlikti asociacijos analizę VNP-ai iš miRNAs susiję su išlikimo GC pacientams, kaip buvo galima informacija tik maža dalis tiriamųjų. Dėl tos pačios priežasties mes taip pat neatliko analizės, atsižvelgiant į anatominės vieta skrandyje (proksimalinio vs distalinės). Šiame tyrime mes atliekame tik genų polimorfizmo analizę nesprendžiant Mirna raiškos skirtumus vėžinių ir nevėžinės audiniuose, todėl mes negalime postuluoja, jei šie polimorfizmas gali turėti funkcinį vaidmenį. Tolesni tyrimai turėtų įvertinti VNP-ai vaidmenį Mirna lygiais GC audinio ir įvertinti galimas tikslines genų funkcinių tyrimų. Asmenų per mūsų tyrime žarnyno ir difuzinis tipo GC grupių pogrupių skaičius yra santykinai mažas ir gali būti underpowered aptikti būdingus asociacijas. Mes nustatėme, kai kurių skirtumų Mir-196a-2 ir mir-608 VNP-ai tarp grupių, P
< 0,05; Tačiau mes manome, kad mes negalime pranešti didelę asociaciją, nes jie nepasiekė mūsų reguliuoti P
vertę. Keli palyginimai genetines asociacijos bandymų buvo taikomi šiame dokumente, ir mes manome, kad mes turėtume naudoti pritaikytą P
vertės piešimo išvadas.

Išvados

Mūsų tyrimas rodo, kad genų polimorfizmas iš Pasaulis-27a
Pasaulis-146A
Pasaulis-196a-2 pervežimas Pasaulis-492
ir miR -608
nėra susiję su rizika GC ir HRAG tiriamųjų Europos kilmės. Šie SNP neatrodo kaip potencialių biologinių žymenų nustatymo asmenims su padidėjusia rizika GC.

Padėka

Mes norėtume padėkoti Lina Baldauskiene puikios pagalbos genotipo eksperimentų laboratorijoje.

• PLoS ONE: MicroRNA-10A žemyn reguliuojama DNR metilinimo ir funkcionuoja kaip auglio slopinamojo skrandžio vėžio ląsteles
• PLoS ONE: Asociacija tarp polimorfizmai XRCC1 genų ir gydymo rezultatus pacientams, sergantiems išplitusiu skrandžio vėžiu: sisteminė apžvalga ir metaanalizė