PLOS ONE: Gene Polimorfismos de microRNAs na Helicobacter pylori Induzida Alto Risco atrófica gastrite e câncer gástrico

Abstract

Fundo e visa

Os microRNAs (miRNAs) são conhecidos por sua função como reguladores de translação de supressor tumoral ou oncogenes. polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em genes relacionados miRNAs foram mostrados para afetar a capacidade reguladora dos miRNAs e foram ligados com câncer gástrico (GC) e as condições gástricas pré-malignas. O objetivo deste estudo foi avaliar possíveis associações entre polimorfismos de genes relacionados-miRNA ( miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492 Comprar e miR-608
) ea presença de GC ou alto risco gastrite atrófica (Hrag) na população europeia.

Métodos

Gene polimorfismos foram analisados ​​995 indivíduos (controles: n = 351; GC: n = 363; Hrag: n = 281) de ascendência europeia. miR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) e miR-608
C >. G (rs4919510) SNPs foram genotipados por RT-PCR

Resultados

no geral, SNPs dos miRNAs não foram associados com a presença de GC ou Hrag. Observou-se uma tendência para genótipo miR-196a-2
CT para ser associado com maior risco de GC quando comparado com o genótipo CC, no entanto, a diferença não alcançou o ajustado P
-valor (odds ratio (OR) - 1,46, 95% de intervalo de confiança (IC) 1,03-2,07, P
= 0,032). miR-608
genótipo GG foi mais frequente no GC quando comparados aos controles (OR -2,34, IC 95% 1,08-5,04), mas manteve-se significância marginal ( P
= 0,029). Uma tendência semelhante foi observada em um modelo recessivo para miR-608
, onde CC + CG vs comparação genótipo GG mostrou uma tendência de aumento do risco de GC com OR de 2,44 (95% CI 1,14-5,22, P
= 0,021). Os genótipos e alelos de miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492 Comprar e miR-608
SNPs teve distribuição semelhante entre os subtipos histológicos de GC e não foram relacionados com a presença de difusa ou do tipo intestinal GC.

Conclusões

polimorfismos do gene da miR -27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
, miR-492A Comprar e miR-608
não foram associados com a presença de Hrag, GC ou diferentes subtipos histológicos de GC em indivíduos europeus

Citation:. Kupcinskas J, Wex T, link a, Leja M, Bruzaite I, Steponaitiene R, et al. (2014) Gene Polimorfismos de microRNAs em Cancer Helicobacter pylori
Induzido por Alto Risco Gastrite atrófica e gástrico. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10.1371 /journal.pone.0087467

editor: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japão

Recebido: 14 de setembro de 2013; Aceito: 26 de dezembro de 2013; Publicação: 27 de janeiro de 2014

Direitos de autor: © 2014 Kupcinskas et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho foi apoiado pelo Fundo social Europeu (No. VP1-3.1-a MM-07-K-01-156) e em parte por uma concessão do BMBF (BMBF-0315905D) no marco do projeto pathogenomics eRA-Net. O recrutamento de pacientes em Letônia foi apoiado em parte do projecto do Fundo Europeu de Desenvolvimento Regional (nº 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

Apesar de reduzir a incidência de câncer gástrico (GC) nos países mais desenvolvidos, GC representaram um total de 989,600 novos casos e 738,000 mortes em 2008, em todo o mundo [1]. Helicobacter pylori
( H. Pylori
) infecção na mucosa gástrica pode levar ao desenvolvimento de gastrite atrófica (AG) e a metaplasia intestinal (GI) e é um factor de risco para o desenvolvimento de cardinal CG [2]. No entanto, o desenvolvimento de adenocarcinoma gástrico não pode ser explicado pela presença de H. pylori
sozinho. Acredita efeitos sinérgicos de factores ambientais, hospedeiras, nutricionais e bacterianos para provocar a carcinogénese gástrica, no entanto, os mecanismos de interacção e estão ainda pouco compreendidos [3]. Um certo número de alterações genéticas têm sido implicados na carcinogénese gástrica, mas nenhum deles foi ainda transferidos para a prática clínica diária, devido à falta de força de associação [4]. Dados recentes sugerem uma possível influência de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) de genes relacionados com o microRNA (miRNAs) para o risco de desenvolvimento de câncer [5].

Os miRNAs são apenas ± 22 pb de comprimento, e por causa de sua única biogênese são altamente estáveis ​​em diferentes tecidos ou espécimes, tornando-os um alvo atraente no campo da pesquisa biomarcador [6], [7]. Um número cada vez maior de estudos funcionais sugerem que a miARN pode ser envolvido em diferentes fases da carcinogénese gástrica [8]. Esta concordância também se reflete no miRNA profiling estudos que revelaram alterações específicas no padrão de expressão na mucosa dos pacientes do GC. Além disso, as mudanças de expressão de miRNA já são detectáveis ​​nos estágios iniciais da carcinogênese gástrica, incluindo H. pylori
induzida AG [8].

O aumento da compreensão do papel funcional dos miRNAs abriu um novo capitel em pesquisa polimorfismo do gene no câncer [7], [9]. Único miRNA é capaz de segmentar vários genes; portanto, a importância dos SNPs na sequência do gene de miARN pode ser potencialmente associada a alterações notáveis ​​na regulação da expressão do gene e a modificação do risco para o desenvolvimento de certas doenças humanas, incluindo a [8] GC. Diferentes estudos demonstraram que determinados genes de SNPs miARN-codificam podem alterar a expressão de miARN ou do seu papel funcional e deste modo influenciar o risco de desenvolvimento de cancro ou a progressão [10], [11]. Número crescente de estudos caso-controle têm mostrado associação entre os polimorfismos dos genes que codificam miRNAs e o risco de diferentes neoplasias [5]. polimorfismos do gene de cinco genes miRNA-relacionados, miR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) e miR-608
C > G (rs4919510), foram escolhidos para o presente estudo por causa de associação sugerido anteriormente com os riscos de cancro [5], [12] - [14]

o acima mencionado miRNAs têm sido implicados em várias vias relacionadas ao câncer.. Liu et al. mostrou que miR-27a
é regulado para cima em GC e atua como um oncogene, visando proibitina [15]. SNP de miR-27a
(rs895819) contribui para a suscetibilidade GC através afetando a expressão de miR-27a
e tem como alvo gene dedo de zinco e um domínio BTB contendo 10 ( ZBTB10
) [16]. miR-146a
foi mostrado para modular H. pylori
induziu uma resposta inflamatória em células epiteliais gástricas humanos, visando IL-1 quinase associada 1 ( IRAK1
) e receptor de TNF associado fator de 6 ( TRAF6
) [17]. Além disso, miR-146a
SNP (rs2910164) tem sido associado a AG em indivíduos Japoneses [18]. Estudos anteriores demonstraram aberrante sobre a expressão de miR-196a-2 Comprar e consequente regulação negativa da p27 (KIP1) em GC [16]. Outro estudo mostrou que o polimorfismo do gene da miR-196a-2
(rs11614913) foi associado com aumento do risco de GC [19], [20] enquanto um estudo realizado por Ahn et al. (2012) não pôde confirmar esta associação, mas este SNP foi associada com a sobrevivência em pacientes GC [21]. miR-492
foi identificada a desempenhar um papel importante na progressão de tumores malignos do fígado embrionárias [22] e é desregulado no cancro colorrectal quando comparado com a mucosa de cólon normal, [23]. Um relatório na população chinesa mostrou que SNP de miR-608
(rs4919510) podem influenciar o risco de câncer de mama HER2-positivo e proliferação do tumor [14].

A maioria dos estudos de genotipagem publicados atualmente relacionado para genes de miRNA em GC foram realizadas apenas em assuntos asiáticos, são limitados pelo pequeno tamanho das amostras e relatório resultados parcialmente conflitantes. Além disso, poucos estudos têm abordado anteriormente o papel desses SNPs miRNA-relacionados em condições gástricas pré-malignas. Com base nas provas apresentadas acima, foi realizada a análise da genotipagem sistemático para miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR- 492
e miR-608
SNPs em pacientes com GC, de alto risco gastrite atrófica e controles usando três grupos de pacientes da Alemanha, Lituânia e Letónia de ascendência europeia.

Métodos

Ética declaração

o estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética da Universidade Magdeburg Otto-von-Guericke, Universidade de Ciências da Lituânia de Saúde e Comissão de Ética médica Central da da Letónia. Todos os pacientes assinaram um termo de consentimento para participar do estudo.

População do estudo

Os indivíduos incluídos no estudo vêm de nossos projetos de pesquisa anteriores sobre SNPs em GC e condições gástricas pré-malignas [24] , [25]. Pacientes e controles foram recrutados durante os anos de 2005-2012 em três centros de gastroenterologia na Alemanha (Departamento de Gastroenterologia, Hepatologia e Doenças Infecciosas, Universidade Otto-von-Guericke, Magdeburg) Lituânia (Departamento de Gastroenterologia da Universidade de Ciências da Lituânia Saúde, Kaunas) e na Letónia (Hospital Universitário Riga Médio e Doenças digestivas Centro GASTRO, Riga). Pacientes com Hrag e controles foram incluídos a partir dos departamentos de ambulatório, que foram encaminhados para endoscopia digestiva alta por causa de sintomas de dispepsia. Os critérios de inclusão de Hrag e controles foram sem história de malignidade, doença gastrointestinal ou cirurgia. pacientes GC teve verificação histológico de adenocarcinoma gástrico e foram recrutados a partir de ambulatório e departamentos estacionárias. No total, 995 indivíduos, para os quais o material com a qualidade do DNA apropriado foi disponíveis (351 controlos, 281 e 363 Hrag GC), foram incluídos no estudo. Havia 310 indivíduos do grupo alemão (63 controles, 106 GC e 141 Hrag), 340 indivíduos do grupo Letão (142 controles, 139 GC e 59 Hrag) e 345 indivíduos do grupo da Lituânia (146 controles, 118 GC e 81 Hrag). Todos os pacientes eram de ascendência europeia.

A análise histológica e H. pylori
estatuto

avaliação histológica detalhada da mucosa gástrica foi realizada em controles e grupos Hrag acordo com a classificação Sydney modificado [26]. Hrag foi definida como pan-gastrite (pontuações inflamatórias semelhantes em antro e do corpus), Corpus-predominante gastrite com ou sem a presença de atrofia gástrica, e IM quer no antro ou corpos do estômago [27]. H. pylori
estatuto foi determinada através do teste de anti- H. pylori
anticorpos IgG no soro. subtipagem histológica de GC foi realizada de acordo com a classificação de Laurén em tipos difundem-intestinais e [28].

extracção de DNA e genotipagem

O ADN genómico a partir de grupo alemão foi extraído a partir de células mononucleares de sangue periférico utilizando o kit de sangue QIAamp DNA (Qiagen, Hilden, Alemanha) de acordo com as instruções do fabricante. O ADN genómico a partir de amostras de grupos lituanas e letães foi extraído utilizando o método de extracção com fenol-clorofórmio a partir de células mononucleares do sangue periférico. As amostras de ADN foram armazenados a -20 ° C até à análise. SNPs da miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913 ), miR-492
C > G (rs2289030) e miR-608
C > G (rs4919510) foram genotipados usando ensaios TaqMan ® predefinidos com 7500 ™ termociclador em tempo real, de acordo com as instruções do fabricante (Life Technologies, CA, EUA). atribuições dos genótipos foram confirmadas manualmente por inspeção visual com o software SDS 2.0.5 compatível com o sistema TaqMan®.

A genotipagem de controle de qualidade

procedimentos de controle de qualidade foram aplicados em toda a genotipagem das amostras. Depois de genotipagem, foram seleccionados aproximadamente 10% de amostras em cada grupo de genótipo por análise repetitiva com taxa de concordância de 100%. amostras duvidosas teve análise repetitivo tripleto. Todas as partes envolvidas no genotipagem foram cegos para o caso ou controle de status das amostras. As amostras que não conseguiu genótipo foram registrados como indeterminada

A análise estatística

Todos os indivíduos foram classificados em três grupos de estudo:. Controles (n = 351), Hrag (n = 281), GC (n = 363). Idade é mostrado como médias e desvios padrão, e foi comparado usando análise de variância e teste t de Student não pareado. Os dados categóricos (por exemplo, sexo, H pylori
, subtipos histológicos GC, distribuição de genótipos ou alelos.) são apresentados como frequências; comparações foram feitas usando o teste do qui-quadrado.

As avaliações de qualidade e análise estatística dos dados de genotipagem foram realizadas utilizando software Plink versão 1.07 [29]. Os indivíduos com mais de 10% em falta genótipos e SNPs com uma taxa de chamada abaixo de 90% ou desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW) nos controlos ( P
< 0,05) foram excluídas da análise posterior. A taxa média de genotipagem em todas as amostras foi de 99,6%. Diferenças nas freqüências alélicas entre casos e controles foram calculados na amostra estudo alemão, lituano e letão combinados, utilizando o teste de Breslow-Day para heterogeneidade das RUP. Apenas um SNP ( miR-608
C > rs4919510 g) mostrou a heterogeneidade das RUP entre os três grupos de estudo GC ( P
_{BD < 0,05) e, portanto, o país de parto foi incluída como co-variável em análise posterior. Associação entre Hrag e GC com polimorfismos do gene foi calculada usando análise de regressão logística com ajuste para idade, sexo e país de nascimento, com intervalos de confiança de 95% (IC). Os riscos relativos para mutações foram estudados utilizando o modelo recessivo e dominante, que levou a uma comparação entre o tipo selvagem + heterozigotos vs. tipo homozigoto e selvagem vs.
Heterozigotos + homozigoto, respectivamente. Para ajustar para testes de múltipla calculamos um corrigida limiar de significância α = 0,01 (0,05 /5).}

Resultados

Características dos indivíduos

As características de controle, GC e grupos Hrag são apresentados na Tabela 1. de acordo com a idade da vida real, os indivíduos diferem significativamente de acordo com a idade e distribuição de sexo entre os grupos. Como esperado, os machos foram responsáveis ​​por 63,6% no grupo de GC, enquanto que nos grupos de controlo e Hrag deste género constituído 26,8% e 37,7%, respectivamente. indivíduos do grupo controle foram significativamente mais jovem do grupo Hrag (3 anos) e grupo GC (5 anos). 52,6% dos pacientes foram positivos para H. pylori
no grupo GC, no entanto, em cerca de 27% dos indivíduos do grupo GC H. pylori
estado IgG não poderia ser obtida. Mais de 47% dos indivíduos no grupo controle e 42,7% no grupo Hrag foram H. pylori
positivo. A classificação histológica para tipos difusos e GC intestinal foi recuperado para 62,0% dos pacientes do GC (Tabela 1).

Associações de miRNA SNPs e risco de GC e Hrag

A distribuição genotípica para todos os cinco polimorfismos o estudo foram semelhantes aos esperados para Hardy-Weinberg: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0,44); rs11614913 (p = 0,95); rs2289030 (p = 0,44); rs4919510 (p = 0,39). distribuições genotípicas e alélicas para miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
C > G (rs2289030) e miR-608
C > polimorfismos G (rs4919510) do gene em GC e grupos de estudo Hrag são apresentados na Tabela 2. Nenhuma associação significativa foi observada para as doenças em estudo seguintes correção para testes múltiplos. Observou-se uma tendência para genótipo miR-196a-2
CT para ser associado com maior risco de GC quando comparado com o genótipo CC, no entanto, a diferença não atingiu o limite de significância ajustado (OR - 1,46, 95% CI 1,03-2,07, P
= 0,032). miR-608 genótipo GG
foi marginalmente associada com maior risco de GC quando comparado com o genótipo CC (OR - 2,34, 95% CI 1,08-5,04, P
= 0,029). Uma tendência semelhante foi observada em um modelo recessivo para miR-608
, onde CC + CG vs comparação genótipo GG resultou em uma OR - 2,44 (IC 95% 1,14-5,22), ( P
= 0,021).

Associações de miRNA SNPs e risco de intestinal e do tipo difuso GC

miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492 Comprar e miR-608
associações SNP foram testados com dois tipos histológicos de GC (difuso ou intestinal type-GC). Genotípicas e alélicas frequências para os grupos de estudo são apresentados na Tabela 3. modelo dominante para a miR-27a
mostrou uma tendência para o alelo T vs. C estar relacionada com maior risco de tipo difuso GC (OR - 2,07 , IC 95% 1,13-3,79, P
= 0,018). miR-196-a2
SNP mostrou uma tendência para a redução do risco de tipo intestinal GC no modelo recessivo (CC + CT vs. TT), no entanto, a força de associação não alcançou significância estatística (OR - 0,47, 95 CI% 0,20-1,08, P
= 0,077). Observação semelhante foi feita em um modelo dominante para miR-492
SNP (OU - 1,95, IC de 95% 1,01-3,75) onde GG GC vs. comparação levou a um aumento do risco de GC-tipo difuso, no entanto, o P
valor não alcançara o nível de significância exigido ( P
= 0,046). Todas as outras comparações entre controle e difunde ou grupos GC do tipo intestinal não revelou associações ou tendências significativas durante cinco SNPs de miRNAs.

Discussão

No presente estudo foi realizada uma análise da genotipagem para miR-27a
(rs895819), miR-146a
(rs2910164), miR-196a-2
(rs11614913), miR-492
(rs2289030) e miR-608
(rs4919510) polimorfismos do gene em estudo caso-controle, incluindo 351 controles, 281 Hrag e 363 pacientes do GC de três grupos de estudos europeus. Estes polimorfismos foram associados com o risco de GC ou riscos de câncer em geral; no entanto, os dados reportados são parcialmente conflitantes ou baseado em poucos estudos relacionados com grupos asiáticos. Apesar de algumas pequenas diferenças, nossos resultados não suportam a ligação entre o miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR- 492
e miR-608
polimorfismos do gene ea presença de GC ou Hrag. Além disso, não foi possível encontrar uma associação entre SNPs de miRNAs ea presença de diferentes subtipos histológicos de GC. Desde miARNs têm mostrado ter um efeito profundo na carcinogénese gástrica [8], que se espera que estes polimorfismos pode modificar o risco de GC ou dos seus precursores. Para nosso melhor conhecimento, este é o primeiro estudo que investigou as associações entre esses polimorfismos de miRNA e o risco de GC ou Hrag em indivíduos de ascendência europeia. Mais do que isso, SNPs de miR-492
(rs2289030) e miR-608
(rs4919510) não foram estudados em relação ao GC ou condições gástricas pré-malignas anteriormente.

Gene polimorfismo de miR-27a é actualmente um dos SNPs mais estudados em estudos caso-controle de câncer relacionados. Esperávamos que os portadores do alelo C para miR-27a
SNP poderia ter um risco reduzido de GC como foi sugerido por alguns grupos de pesquisa. Um estudo de caso-controle chinesa, incluindo 311 pacientes do GC e 425 controles sem câncer descobriram que menor alelo C de rs895819 no miR-27a
significativamente reduzido risco de GC com OR - 0,77 [30]. Outro estudo mostrou um risco significativamente aumentado de GC (OR - 1,48) para o miR-27a
SNP e análises funcionais adicionais indicaram que genótipos variantes pode ser responsável por elevada miR-27a níveis Comprar e reduzida ZBTB10
níveis de mRNA [16]. Em contraste, um estudo, incluindo 2.380 participantes com lesões gástricas diversas não encontrou um risco aumentado de IM gástrica ou displasia para rs895819 [12]. Uma meta-análise que resume as conclusões dos vários estudos de caso-controle revelaram que o polimorfismo rs895819 foi significativamente associada com diminuição do risco de câncer em branco, mas não em asiáticos [31]. Os resultados do nosso estudo não suportam o possível efeito protetor da C alelo para o desenvolvimento GC em indivíduos europeus. Nosso estudo é o primeiro que avaliou o papel da miR-27a
rs895819 em GC e Hrag em indivíduos de ascendência europeia, no entanto, não foram observadas associações significativas.

Considerando a evidência existente sobre miR-146a
SNP (rs2910164) para o desenvolvimento do câncer que queríamos para avaliar a possível associação em nosso grupo de pacientes com GC e Hrag. Song et al. descobriu que as transportadoras cc de rs2910164 tiveram um risco significativamente aumentado de IM (OR - 1,42) e displasia (OR - 1,54) em comparação com as transportadoras GG [12]. Uma observação semelhante foi feita em outro estudo em que foi observado efeito combinado de miR-146a
(rs2910164) G /L e TLR4 SNP sobre o risco aumentado de AG grave entre os indivíduos japoneses [18]. Um papel por Okubo et al. [32] relatou que o transporte do genótipo rs2910164 CC foi associado com um risco significativamente maior de GC quando comparados com indivíduos não-cancerosas (OR - 1,30). Uma meta-análise por Wang et al. [33] no miR-146a
rs2910164 incluindo 19 estudos de caso-controle encontrados que rs2910164 estava ligado com o aumento da susceptibilidade ao câncer nos asiáticos com geral OR - 1,18, mas a mesma meta-análise insta para estudos mais bem desenhados com tamanho de amostra grande para posterior identificação de riscos. Os resultados do nosso estudo caso-controle não revelaram uma associação significativa entre rs2910164 eo risco de GC ou Hrag

miR-196a-2
C >. T SNP (rs11614913) é uma do melhor estudada miRNA SNPs em relação a diferentes doenças malignas. Um relatório por Wang et al. (2013) mostraram que o genótipo CC foi associada com um risco significativamente reduzido de cancro gástrico (OU - 0,78) em comparação com os genótipos CT e TT em um grande estudo de controlo de caso [33]. Uma meta-análise por Wang et al. (2013) encontraram um aumento significativo do risco GC, mas a associação foi observada somente em comparação homozigoto. Esta meta-análise demonstrou que o polimorfismo rs11614913 é significativamente associada com o risco geral de câncer gastrointestinal [34]. Okubo et al. [32] não encontrar um link para este SNP e GC, no entanto, em sua rs11614913 estudo foi associada com o grau de H. pylori
infiltração de células mononucleares induzida. Curiosamente, uma outra meta-análise sobre o mesmo SNP não determinou relação entre rs11614913 e desenvolvimento GC [35]. Os resultados do nosso estudo estão em consonância com a conclusão da última meta-análise, não observamos associação significativa entre o SNP de miR-196a-2 Comprar e GC risco.

O polimorfismo do miR-492
(rs2289030) é hipótese para mediar o risco de câncer, mas os dados sobre possíveis associações para este SNP eo risco de câncer ainda são escassos. Um estudo realizado por Yoon et al. (2012) não encontraram uma associação entre o SNP de miR-492 Comprar e o risco ou a sobrevivência em pacientes com câncer de pulmão não-pequenas células [36]. Outro estudo sobre câncer colorretal demonstrou que a sobrevivência livre de progressão dos pacientes com o combinado miR-492
CG e genótipo GG foi significativamente pior do que a dos pacientes com a miR-492
CC genótipo [13]. Nossos resultados indicam que rs2289030 de miR-492
não estava ligada com a presença de GC ou Hrag. Para nosso melhor conhecimento, este é o primeiro estudo que analisa a relação entre a miR-492
SNP e condições gástricas pré-malignas ou GC e, portanto, sem comparação para os nossos dados podem feitas.

SNP de miR-608
(rs4919510) não foi estudada em relação ao GC riscos anteriormente. Nosso estudo é o primeiro a relatar associação nula entre esse polimorfismo eo risco de GC ou condições gástricas pré-malignas. Em pacientes com câncer colorretal rs4919510 foi significativamente associada com recorrência e morte [37] câncer. Outro estudo de caso-controle em pacientes com câncer colorretal não encontrou uma associação com o risco de câncer, mas os seus resultados mostraram que o genótipo GG foi associado com um risco aumentado de morte em população branca e redução do risco de morte em afro-americanos [38]. Além disso os estudos de escala maiores pode determinar o papel miR-608
rs4919510 SNP em malignidades gástricos e outros.

intestinal e difuso tipos de GC ter sido demonstrado que têm diferentes vias moleculares [3]. Alguns estudos descobriram que os polimorfismos de miRNA pode ter efeitos diferentes para os subtipos histológicos de GC. Após estratificar os pacientes dos grupos GC intestinal e do tipo difuso, miR-499
rs3746444 foi mostrada para afetar o risco de tipo difuso GC na população coreana [21]. Embora o número de indivíduos dentro intestinal e grupos GC-tipo difuso não foi muito alta em nosso estudo, foi realizada análise comparando esses dois tipos histológicos distintos de GC. No geral, miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492 Comprar e miR-608
SNPs não estavam ligados à presença de diferentes subtipos histológicos de GC. Embora algumas tendências descritas na seção resultados foram observados entre o subgrupo histológico de GC, as diferenças de genótipos e alelos frequências não atingiram níveis de significância necessários.

Os resultados do nosso estudo apoiam claramente a importância da avaliação cuidadosa de polimorfismos do gene em diferentes grupos étnicos. Anteriormente sugeridas SNPs relacionados ao miRNA não apresentaram diferenças relacionadas GC substanciais na nossa população europeia. No entanto, admitimos que existem várias limitações relacionadas com o design do nosso estudo. Houve diferenças de distribuição de gênero entre GC, Hrag e grupos de controle; No entanto, quando da realização de análise estatística, incluímos o gênero como uma co-variável, minimizando assim a possível influência do gênero para o resultado dos nossos resultados. Aqui neste estudo que incidiu sobre as alterações histológicas, em vez de a presença de H. pylori
; Portanto, os testes adicionais para além de anticorpos IgG no soro para detecção não foram aplicados esta bactéria. Além disso, é sabido que a gastrite atrófica crónica é causada por H. pylori
infecção. Nós não ajustar ou para H. pylori
anticorpos IgG, CagA
ou VacA
estatuto, porque essa informação não estava disponível para todas as disciplinas. Nós não poderia realizar a análise de associação para SNPs de miRNAs no que diz respeito à sobrevivência de pacientes do GC, que a informação estava disponível apenas para uma pequena proporção de indivíduos. Devido ao mesmo motivo, também não realizar a análise de acordo com a localização anatômica do no estômago (proximal versus distal). Neste estudo foram realizadas exclusivamente análise polimorfismo do gene sem abordar as diferenças de expressão de miRNA em tecidos cancerosos e não cancerosos e, portanto, não podemos postular se esses polimorfismos podem ter um papel funcional. Novos estudos devem avaliar o papel dos SNPs para os níveis de miRNA no tecido GC e avaliar genes alvos potenciais em estudos funcionais. O número de indivíduos dentro dos subgrupos em nosso estudo de grupos GC intestinal e difuso do tipo é relativamente pequeno e pode ser underpowered para detectar associações específicas. Encontramos algumas diferenças para miR-196a-2 e miR-608 SNPs entre os grupos com P Art < 0,05; No entanto, pensamos que não podemos relatar uma associação significativa, uma vez que eles não chegar ao nosso ajustada P valor
. As comparações múltiplas para testes de associação genética foram aplicadas neste trabalho e acreditamos que devemos usar o P valor
ajustados para tirar as conclusões.

Conclusões

Nosso estudo mostra que os polimorfismos do gene da miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492 Comprar e miR -608
não estão associados com risco de GC e Hrag em indivíduos de ascendência europeia. Estes SNPs não aparecem como potenciais biomarcadores para identificar indivíduos com risco aumentado para o GC.

Reconhecimentos

Gostaríamos de agradecer Lina Baldauskiene para excelente ajuda com experimentos de genotipagem em laboratório.

• PLOS ONE: MicroRNA-10a é regulada pelo DNA metilação e funciona como um supressor tumoral no câncer gástrico Cells
• PLOS ONE: associação entre os polimorfismos no gene XRCC1 e Tratamento resultados de pacientes com cancro gástrico avançado: uma revisão sistemática e meta-Analysis