PLoS ONE: polimorfizama gena za mikroRNA u Helicobacter pylori izazvan visokog rizika atrofičnog gastritisa i rak želuca

Sažetak pregled

Pozadina i ima za cilj pregled

mikroRNA (miRNAs) su poznati po svojoj funkciji kao translacijske regulatori tumor supresor ili onkogena. Polimorfizama (SNP-ova) u miRNAs srodnih gena su pokazala da utječu na reguliranje za miRNAs te su povezana s karcinomom želuca (GC) i premalignih želučane uvjete. Svrha ovog istraživanja bila je procijeniti potencijalne povezanost između Mirna vezanih polimorfizama gena ( Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2 pregled, mir-492 pregled i mir-608 pregled) i prisutnost GC ili visokog rizika atrofični gastritis (HRAG) u europske populacije. pregled

Metode pregled

Gene polimorfizmi su analizirani u 995 ispitanika (kontrola: n = 351; GC: n = 363; HRAG: n = 281) od europskog podrijetla. Mir-27a pregled T &C (rs895819), Mir-146a pregled G &C (rs2910164), Mir-196a-2 pregled, C > T (rs11614913), mir-492 pregled G &C (rs2289030) i mir-608 pregled C >. G (rs4919510) SNP genotipizirane pomoću RT-PCR pregled

Rezultati pregled

Sve u svemu, SNP od miRNAs nisu bili povezani s prisutnošću GC ili HRAG. Zapaženo je da je sklonost za Mir-196a-2 pregled, CT genotip da je povezan s većim rizikom od GC u odnosu na CC genotipa, međutim, razlika nije dostigla podesiti P pregled-vrijednost (omjer izgleda (OR) - 1,46, 95% interval pouzdanosti (CI) 1,03-2,07, P pregled = 0,032). Mir-608 pregled GG genotipa bio je češći u GC u usporedbi s kontrolnom skupinom (ILI -2.34, 95% CI 1.08-5.04), ali značenje je ostao marginalan ( P pregled = 0,029). Sličan trend zabilježen je u recesivni modela za Mir-608 pregled, gdje CC + CG vs GG genotipom usporedbe pokazuju veću sklonost za povećanim rizikom od GC sa ili od 2,44 (95% CI 1.14-5.22, P pregled = 0,021). Genotipovi i aleli Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2 pregled, Mir-492 pregled i Mir-608
SNP imali sličnu raspodjelu između histoloških podtipova GC i nisu bili povezani s prisutnošću difuzne ili crijevni tipa GC.

Zaključci

polimorfizama gena za Mir -27a pregled, mir-146a pregled, mir-196a-2 pregled, mir-492 pregled, mir-492a pregled i mir-608 pregled nisu bili povezani s prisutnošću HRAG, GC ili različitih histoloških podtipova GC u europskim temama pregled

Izvor:. Kupcinskas J, WEX T, povezati, Leja M, Bruzaite sam, Steponaitiene R, et al. (2014) polimorfizama gena za mikroRNA u Helicobacter pylori pregled inducira visoki rizik atrofičnog gastritisa i rak želuca. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10,1371 /journal.pone.0087467 pregled

Urednik: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan pregled

Primljeno: 14. rujna 2013. godine; Prihvaćeno: 26. prosinac 2013; Objavljeno: 27 siječanj 2014 pregled

Copyright: © 2014 Kupcinskas et al. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Ovo djelo je podržan od strane Europskog socijalnog fonda (br VP1-3.1-a mm-07-K-01-156), a djelomično grant od BMBF (BMBF-0315905D) u okviru ERA-Net PathoGenoMics projekta. Zapošljavanje pacijenata u Latviji je podržan u sklopu ovog projekta od Europskog fonda za regionalni razvoj (br 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled

U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled

Unatoč smanjenju incidencije karcinoma želuca (GC) u većini razvijenih zemalja, GC iznosio ukupno 989,600 novih slučajeva, a 738,000 smrtnih slučajeva u 2008. godini u svijetu [1]. Helicobacter pylori pregled ( H. Pylori pregled) infekcije u želučane sluznice može dovesti do razvoja atrofični gastritis (AG) i intestinalne metaplazije (IM) i faktor kardinal rizika za razvoj GC [2]. Ipak, razvoj želučanog adenokarcinoma ne može se objasniti prisustvom H. pylori
sama. Sinergističko djelovanje na okoliš, domaćina, prehrambene i bakterijskih faktora se vjeruje da aktiviraju želučani karcinogeneze, međutim, mehanizmi i interakcije su još uvijek slabo razumio. [3] Niz genskih promjena su upleteni u želučanom karcinogeneze, ali nitko od njih još nije prebačen u svakodnevnoj kliničkoj praksi zbog nedostatka snage udruge [4]. Najnoviji podaci ukazuju na mogući utjecaj polimorfizama (SNP-ova) gena mikrornk vezane (miRNAs) za rizik od razvoja raka [5]. Pregled

MiRNAs samo ~22 bp dugo, a zbog svog jedinstvenog biogeneza su vrlo stabilna u različitim tkivima ili primjeraka, što ih čini privlačnim ciljem za biomarker području istraživanja [6], [7]. Sve veći broj funkcionalnih studije sugeriraju da miRNAs mogu biti uključeni u različitim fazama želučane karcinogeneze [8]. Ova podudarnost se također odražava u Mirni profiliranje studija koja otkriva određene promjene u ekspresije u sluznici GC pacijenata. Nadalje, Mirna izraz promjene su već prepoznatljiv u ranim fazama želučane karcinogeneze, uključujući H. pylori
izazvana AG [8]. pregled

Povećanje razumijevanja funkcionalne uloge miRNAs je otvorio novu Capitel u polimorfizma gena istraživanja raka [7], [9]. Jedan Mirna je sposoban cilja više gena; dakle, značaj SNP u slijedu Mirna gena potencijalno može biti povezana s izvanredne promjene u regulaciji ekspresije gena i modifikacije rizika za razvoj određenih bolesti ljudi, uključujući i [8] GC. Različite studije su pokazale da određene SNP Mirne-kodiraju geni mogu mijenjati Mirna izraz ili svoju funkcionalnu ulogu i na taj način utjecati na rizik od razvoja raka ili progresije [10], [11]. Sve veći broj case-control studije su pokazale povezanost između polimorfizama gena koji kodiraju miRNAs i rizik od različitih malignih bolesti [5]. Polimorfizama gena za pet gena Mirna povezane, Mir-27a pregled T &C (rs895819), Mir-146a pregled G &C (rs2910164), Mir-196a-2
C > T (rs11614913), mir-492 pregled G &C (rs2289030) i mir-608 pregled C > G (rs4919510), odabrani su za ove studije zbog prethodno predložen povezanost s rizik od raka [5], [12] - [14] pregled

gore navedenih miRNAs uključeni su u različitim rakom putevi.. Liu et al. pokazala je da Mir-27a pregled je viša u GC i djeluje kao onkogena ciljajući prohibitin [15]. SNP u Mir-27a pregled (rs895819) pridonosi GC osjetljivosti kroz koji utječu na ekspresiju Mir-27a Netlogu i cilja gen cink prst i BTB domene sadrži 10 ( ZBTB10 pregled ) [16]. Mir-146a pregled pokazalo se da modulira H. pylori
izazvana upalni odgovor u ljudskim stanicama epitela želučanih ciljajući IL-1 povezana kinaza 1 ( IRAK1 pregled) i TNF receptora povezani faktor 6 ( TRAF6 pregled) [17]. Nadalje, Mir-146a pregled SNP (rs2910164) je povezana s AG u japanskom ispitanika [18]. Prethodne studije pokazale su nenormalna preko izražavanja Mir-196a-2 Netlogu i posljedičnog smanjenja lučenja p27 (kip1) u GC [16]. Druga studija je pokazala da polimorfizam gena Mir-196a-2 pregled (rs11614913) je povezana s povećanim rizikom za GC [19], [20], dok je studija Ahn et al. (2012) nije mogao potvrditi tu vezu, ali to SNP bio povezan s preživljavanjem u GC bolesnika [21]. Mir-492 pregled identificiran je da igraju važnu ulogu u progresiji malignih embrionalnih tumora jetre [22] i deregulirano u kolorektalnog karcinoma u odnosu na normalnu debelog sluznice [23]. Izvješće u kineskoj populaciji pokazala je da SNP u Mir-608 pregled (rs4919510) može utjecati na HER2-pozitivnim rizik od raka dojke i proliferacije tumora [14]. Pregled

Većina danas objavljenih genotipizacije studija na srodne da Mirna geni u GC provedena su samo u azijskim subjekata, ograničene su malene uzorke i izvješća djelomično proturječnim rezultatima. Nadalje, vrlo malo studija prethodno obratio ulogu ovih Mirna povezane SNP u premalignih želučane uvjetima. Na temelju dokaza gore navedenog, proveli smo sustavnu analizu genotipizacija za Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2 pregled, miR- 492 pregled i Mir-608 pregled SNP-a u bolesnika s GC, visokog rizika atrofični gastritis i kontrola pomoću tri skupine pacijenata iz Njemačke, Litve i Latvije europskog porijekla. pregled

Metode

Etika izjava pregled

istraživanje je odobreno od strane povjerenstva za etiku u Otto-von-Guericke Sveučilišta Magdeburg, litvanski Sveučilišta Health Sciences i Srednje medicinske etike odbora Latvije. Svi pacijenti su potpisali obrazac informiranog pristanka za sudjelovanje u istraživanju. Pregled

ispitivanoj populaciji pregled

Osobe uključene u istraživanje dolaze iz naših prethodnih istraživačkih projekata na SNP-u GC i premalignih želučanih uvjetima [24] , [25]. Pacijenti i kontrole su regrutirani u godinama 2005-2012 na tri Gastroenterologija centrima u Njemačkoj (Zavod za gastroenterologiju, hepatologiju i infektivne bolesti, Otto-von-Guericke University, Magdeburg) Litva (Zavod za gastroenterologiju, litavskog Sveučilišta Health Sciences, Kaunas) i Latviji (Riga East Sveučilišna bolnica i bolesti probavnog sustava centar GASTRO, Riga). Bolesnici s HRAG i kontrole bili uključeni iz out-pacijent odjela, koji su upućeni na gornju endoskopiju zbog dispeptičkih simptoma. Kriteriji za uključivanje u HRAG i kontrola nisu bili Povijest malignih oboljenja, gastrointestinalnih bolesti ili operacije. GC pacijenti imali histološki provjeru želučanog adenokarcinoma i bili regrutirani iz out-pacijent i stacionarnih odjela. Ukupno, 995 osoba, za koje materijal s odgovarajućom kvalitetom DNA je bio dostupan (351 kontrola, 281 HRAG i 363 GC), uključeni su u studiju. Bilo je 310 ispitanika iz njemačke grupe (63 kontrola, 106 GC i 141 HRAG), 340 ispitanika iz latvijske skupine (142 kontrole, 139 GC i 59 HRAG) i 345 ispitanika iz litvanske grupe (146 kontrole, 118 GC i 81 HRAG). Svi pacijenti su europskog podrijetla. Pregled

Histološka analiza i H. pylori pregled statusa pregled

Detaljni Histološka analiza želučane sluznice izvršena je u kontroli i HRAG skupine prema modificiranom Sydney klasifikaciji [26]. HRAG je definirana kao pan-gastritis (slično upalnim bodova u antruma i korpusa), corpus-dominantna gastritisa sa ili bez prisustva želučane atrofije, i IM bilo u antruma ili korpusu želuca [27]. H. pylori pregled status određen testiranjem anti H. pylori
IgG protutijela u serumu. Histološka subtyping GC je provedena prema klasifikaciji Laurenov u crijevnih i difuzno tipa [28]. Pregled

ekstrakcija DNA i genotipizacija pregled

Genomska DNA iz njemačke skupine se ekstrahira iz mononuklearnih stanica periferne krvi pomoću krvi kit QIAamp DNA (Qiagen, Hilden, Njemačka) prema naputku proizvođača. Genomska DNA iz uzoraka litvanskim i latvijskim skupina je dobivena pomoću postupka ekstrakcije fenol-kloroform s mononuklearnih stanica periferne krvi. DNA uzorci su pohranjeni na -20 ° C do analize. SNP u Mir-27a pregled C > G (rs895819), Mir-146a pregled C > G (rs2910164), Mir-196a-2 pregled, C > T (rs11614913 ), mir-492 pregled C > G (rs2289030) i mir-608 pregled C > G (rs4919510) genotipizirane pomoću predesigned TaqMan® testove s 7500 ™ u realnom vremenu ciklički uređaj, u skladu s uputama proizvođača (Life Technologies, CA, USA). Genotipova zadaci su ručno potvrđeno vizualnim pregledom sa softverom SDS 2.0.5 kompatibilan sa TaqMan® sustava. Pregled

Kontrola kvalitete genotipa pregled

postupci kontrole kvalitete se primjenjuju tijekom genotipa uzoraka. Nakon genotipa, oko 10% uzoraka u svakoj genotipom grupe izabrani su za ponavljaju analizu sa 100% stope njenih mještana. Sumnjiva uzorci imali triplet ponavljaju analizu. Sve strane uključene u genotipa su zaslijepljeni sudskoj ili kontrolne status uzoraka. Uzorci koje nisu genotipa zabilježeni kao neodređena pregled

Statistička analiza pregled

Svi ispitanici su razvrstani u tri studijske grupe. Kontrola (n = 351), HRAG (n = 281), GC (n = 363). Dob prikazan kao srednje vrijednosti i standardne devijacije i uspoređen korištenjem ANOVA i Nespareni Student t-testa. Rangirane podatke (npr spol, H pylori pregled infekcija, histološka GC podtipova, distribucija genotipova ili alela.) Predstavljaju kao frekvencija; usporedbe su provedena pomoću hi-kvadrat test. pregled

Procjene kvalitete i statistička analiza podataka o genotipizacije su provedena pomoću plink softvera verziju 1.07 [29]. Pojedinci s više od 10% nedostaje genotipova i SNP-ova s ​​pozivom stope ispod 90%, odnosno odstupanja od Hardy-Weinberg ravnoteže (HWE) u kontrolama ( P izvoznici < 0,05) su isključeni iz daljnje analize. Prosječna stopa genotipizacija u svim uzorcima bio je 99,6%. Razlike u učestalosti alela između predmeta i kontrole izračunati su u kombinaciji njemačkog, litvanske i latvijske uzorku ispitivanja, koristeći Breslow-Day test za heterogenosti ORS. Samo jedan SNP ( Mir-608 pregled C > G rs4919510) pokazala je heterogenost ORS između tri GC studijske grupe ( P pregled _{BD < 0,05), a time i zemlja porod je bio uključen kao kovarijata u daljnju analizu. Povezanost između HRAG i GC sa polimorfizama gena je izračunata logističkom regresijskom analizom prilagodbe za dob, spol i država rođenja s 95% intervala pouzdanosti (CI). Relativni rizik za mutacije su upotrebom recesivni i dominantni model koji je doveo do usporedbe između divljeg tipa + heterozigotni vs homozigota i divljeg tipa vs. Pregled heterozigotni + homozigota, respektivno. Za podešavanje za više testiranja smo izračunali ispravljeni značaj prag α = 0.01 (0.05 /5). Pregled}

Rezultati

Karakteristike ispitanika pregled

Karakteristike kontrole, GC i HRAG skupine prikazani su u tablici 1. u skladu sa stvarnim doba, tema se razlikovali značajno s obzirom na dob i raspodjele po spolu među skupinama. Kao što se očekivalo, muškarci čine 63,6% u GC skupini, dok je u kontrolnim i HRAG skupini ta rodna činili 26,8% i 37,7%, respektivno. Kontrolni ispitanici su bili znatno mlađi od HRAG grupi (3 godine) i GC grupe (5 godina). 52,6% bolesnika bilo je pozitivno na H. pylori
u GC skupini, međutim, u oko 27% pojedinaca u GC grupe H. ne može se dobiti pylori pregled IgG status. Više od 47% ispitanika u kontrolnoj skupini i 42,7% u HRAG skupini bili su H. pylori
pozitivan. Histološka klasifikacija za difuzne i crijevna GC vrsta je uzeo za 62,0% od GC bolesnika (Tablica 1). Pregled

Udruge Mirna SNP i rizik od GC i HRAG Netlogu

distribucija genotip za svih pet polimorfizama studija su bile slične onima očekuje Hardy-Weinberg ravnoteže: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0.44); rs11614913 (p = 0,95); rs2289030 (p = 0.44); rs4919510 (p = 0,39). Genotipova i alela distribucija za Mir-27a pregled C > G (rs895819), Mir-146a pregled C > G (rs2910164), Mir-196a-2 pregled, C > T (rs11614913), mir-492 pregled C > G (rs2289030) i mir-608 pregled C > G (rs4919510) genskih polimorfizama u GC i HRAG studijskih grupa prikazani su u tablici 2. Nema značajne udruge uočene su kod bolesti pod studiju nakon korekcije za višestruko testiranje. Zapaženo je da je sklonost Mir-196a-2 pregled, CT genotip da je povezan s većim rizikom od GC u odnosu na CC genotipa, međutim, razlika nije dostigla usklađene prag značajnosti (OR - 1,46, 95% CI 1,03-2,07, P pregled = 0,032). Mir-608 pregled GG genotipa marginalno bio povezan s većim rizikom od GC u odnosu na CC genotipa (OR - 2,34, 95% CI 1,08-5,04, P pregled = 0,029). Sličan trend zabilježen je u recesivni model za Mir-608 pregled, gdje CC + CG vs GG genotipom odnosu rezultirala je ili - 2,44 (95% CI 1,14-5,22), ( P
= 0.021). pregled

Udruge Mirna SNP i rizik od crijevnih i difuznog tipa GC pregled

Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2 pregled, Mir-492 pregled i Mir-608 pregled SNP udruge su testirana dva histoloških tipova GC (difuzne ili crijevni tipa GC). Genotipova i alela frekvencije za studijske grupe prikazane su u tablici 3. vladajućeg modela za Mir-27a pregled pokazuje tendenciju alela T vs C biti povezan s većim rizikom od difuzna tipa GC (OR - 2,07 , 95% CI 1,13-3,79, P pregled = 0,018). Mir-196-A2 pregled SNP pokazuju veću sklonost ka smanjenim rizikom od crijevnih tipa GC u recesivnim modelom (CC + CT naspram TT), međutim, snaga udruga nije dostigla statističku značajnost (ili - 0,47, 95 % CI 0,20-1,08, P pregled = 0,077). Slično opažanje u vladajućem modelu za Mir-492 pregled SNP (ILI - 1,95, 95% CI 1,01-3,75) gdje je GG vs GC odnosu dovelo do povećanog rizika od difuznih tipa GC, no P pregled vrijednost nije dosegla potrebnu razinu značajnosti ( P pregled = 0,046). Sve ostale usporedbe između kontrole i difuzne ili crijevni tipa GC skupine nije pokazao značajne udruge ili trendove pet SNP od miRNAs. Pregled

Rasprava pregled

U ovom istraživanju smo proveli analizu genotipizacija za mir-27a pregled (rs895819), mir-146a pregled (rs2910164), mir-196a-2 pregled (rs11614913), mir-492 pregled (rs2289030) i mir-608 pregled (rs4919510) genskih polimorfizama u case control studija, uključujući 351 kontrola, 281 HRAG i 363 GC pacijenata iz tri europske studijske grupe. Ovi polimorfizmi su povezani s rizikom od GC ili ukupnoj rizika od raka; Međutim, izvijestio podaci djelomično proturječni ili na temelju samo nekoliko studija vezanih za azijske grupe. Unatoč manjim razlikama, naši rezultati ne podržavaju vezu između Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2 pregled, miR- 492 pregled i mir-608 pregled polimorfizama gena i prisutnost GC ili HRAG. Osim toga, nismo mogli pronaći vezu između SNP-u miRNAs i prisutnost različitih histoloških podtipova GC. Jer miRNAs je pokazano da ima značajni učinak u želučanom karcinogeneze [8], očekuje se da su ti polimorfizmi može modificirati rizik GC ili njegovih prekursora. Prema našem najboljem saznanju, ovo je prva studija koja je istraživala povezanost između tih Mirna polimorfizama i rizik od GC ili HRAG u ispitanika europskog podrijetla. Više od toga, SNP Mir-492 pregled (rs2289030) i Mir-608 pregled (rs4919510) nije ispitana u odnosu na GC ili premalignih želučane uvjete prije. Pregled

Gene polimorfizam Mir-27a je danas jedan od najvažnijih studirao SNP u case-control studija raka povezane. Očekivali smo da nositelji C alela za Mir-27a pregled SNP mogao imati smanjen rizik od CPG kako je predložen od strane nekih istraživačkih skupina. Kineski case-control studija, uključujući 311 GC pacijenata i 425 oboljelih od raka bez kontrole utvrđeno da maloljetnik alel C od rs895819 u Mir-27a
značajno smanjuje rizik od GC sa ili - 0,77 [30]. Druga studija je pokazala značajno povećan rizik od GC (ili - 1,48) za Mir-27a pregled SNP i dalje funkcionalne analize pokazuju da su varijante genotipovi mogao biti odgovoran za povišene Mir-27a
razinama i smanjene ZBTB10 pregled razine mRNA [16]. Za razliku od toga, studija uključujući i 2.380 sudionika koji dolaze iz raznih oštećenja probavnog sustava nisu pronašli povećani rizik od želučanog IM ili displazije za rs895819 [12]. Meta-analiza sažima rezultate različitih studija slučaja kontrola pokazala da polimorfizam rs895819 je značajno povezan s smanjenje rizika od raka u bijeloj boji, ali ne u Azijata [31]. Rezultati našeg istraživanja ne podržavaju mogući zaštitni učinak C alela za razvoj GC u europskim temama. Naša studija je prva koja ocjenjuje ulogu Mir-27a
rs895819 u GC i HRAG u ispitanika europskog podrijetla, međutim, nema značajnijih udruge su promatrane. Pregled

S obzirom na postojeće dokaze o mir-146a pregled SNP (rs2910164) za razvoj karcinoma smo željeli procijeniti moguću povezanost u našoj skupini bolesnika s GC i HRAG. Song et al. utvrdio da CC nositelji rs2910164 imali značajno povećan rizik od IM (ili - 1,42) i displazija (ili - 1,54) u odnosu na GG nosača [12]. Slična primjedba je napravljen u drugoj studiji, gdje se uočava zajednički učinak Mir-146a pregled (rs2910164) G /G i TLR4 SNP o povećanom riziku od ozbiljnog AG među japanskim ispitanika [18]. Dokument Okubo et al. [32] izvijestili da je prijevoz rs2910164 CC genotipa bio je povezan sa značajno većim rizikom od GC u odnosu na ispitanike koji nisu raka (ili - 1,30). Meta-analiza koju Wang et al. [33] na Mir-146A
rs2910164 uključujući 19 case-control utvrđeno da rs2910164 bio povezan s povećanom osjetljivošću od raka u Azijata sa sveukupno ILI studija - 1,18, a isti je meta-analiza poziva za daljnje dobro dizajnirane studije s velikim veličine uzorka za daljnju identifikaciju rizika. Rezultati našeg case-control studija nije pokazao značajnu povezanost između rs2910164 i rizik od GC ili HRAG pregled

Mir-196a-2 pregled, C >. T SNP (rs11614913) je jedan od najboljih studirao Mirna SNP u odnosu na različite malignih bolesti. Izvješće Wang et al. (2013) su pokazali da CC genotip je povezan sa značajno smanjenim rizikom od raka želuca (ili - 0,78) u usporedbi s CT i TT genotipova u velikom case-control studiji [33]. Meta-analiza koju Wang et al. (2013) utvrdili su značajno povećan rizik GC, no udruga zabilježena je samo u homozigot usporedbu. Ova meta-analiza pokazala je da polimorfizam rs11614913 značajno je povezana s ukupnom rizika gastrointestinalnih karcinoma [34]. Okubo et al. [32] nije našao link za ovaj SNP-a i GC, međutim, u svom studiju rs11614913 bio povezan sa stupnjem H. pylori pregled induciranu infiltraciju mononuklearnih stanica. Zanimljivo je da je još jedna meta-analiza na istom SNP nije utvrđena povezanost između rs11614913 i razvoj GC [35]. Rezultati našeg istraživanja su u skladu sa zaključkom potonjem meta-analize jer nismo promatrati značajnu povezanost između SNP Mir-196a-2
i GC rizika. Pregled

Polimorfizam mir-492 pregled (rs2289030) Pretpostavlja se da posreduje rizik od raka, ali podaci o mogućim udruženja za ovaj SNP-a i rizika od raka su još uvijek rijetki. Studija Yoon et al. (2012.) nisu pronašli povezanost između SNP u Mir-492 pregled a rizik ili preživljavanje u bolesnika s ne-malih stanica raka pluća [36]. Druga studija na rak debelog crijeva pokazalo je da bez progresije opstanak bolesnika s kombiniranom Mir-492
CG i GG genotipa bio je znatno lošije nego kod bolesnika s Mir-492 Netlogu CC genotipa [13]. Naši rezultati pokazuju da rs2289030 Mir-492 pregled nije bio povezan s prisutnošću GC ili HRAG. Prema našim najboljim saznanjima ovo je prva studija koja ispituje odnos između Mir-492 pregled SNP-a i premalignih želučanih uvjeta ili GC i, prema tome, ne može se uspoređivati ​​naše podatke možete napravio.

SNP mir-608 pregled (rs4919510) nije studirao u odnosu na GC riskira ranije. Naša studija je prva prijaviti null vezu između polimorfizma i rizik od GC ili premalignih želučane uvjete. U bolesnika s kolorektalnim karcinomom rs4919510 je značajno povezana s recidiva raka i smrti [37]. Još jedan case-control studija o pacijentima s kolorektalnim karcinomom nisu pronašli povezanost s rizikom od raka, ali njihovi su rezultati pokazali da je GG genotipa bila je povezana s povećanim rizikom od smrti u bijelom populacijom i smanjuje rizik od smrti u Afroamerikanaca [38]. Daljnje veće studije razmjera moglo utvrditi ulogu Mir-608
rs4919510 SNP kod želučanog i drugih malignih bolesti. Pregled

crijeva i difuzno vrste GC su pokazala da imaju različite patogenetskih putevi [3]. Neke studije su otkrili da je Mirna polimorfizmi mogu imati različite učinke za histoloških podtipova GC. Nakon raslojavanju pacijenata u crijevnih i difuzna tipa GC skupina, Mir-499
rs3746444 se pokazalo da utječu na rizik od difuzna tipa GC u korejskom stanovništva [21]. Iako je broj pojedinaca unutar crijeva i difuzna tipa GC skupina nije bila vrlo visoka u našoj studiji, analizu uspoređujući ove dvije različite histološke tipove GC je provedena. Sve u svemu, Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2 pregled, Mir-492 pregled i Mir-608 pregled SNP nisu bili povezani s prisutnošću različitih histoloških podtipova GC. Iako su neke tendencije opisane u rezultatima uočene su između histološkom podskupini GC, razlike u genotipu i učestalosti alela nije dosegla potrebnu razinu značajnosti. Pregled

Rezultati našeg istraživanja jasno podržavaju važnost pažljive procjene genskih polimorfizama u različitim etničkim skupinama. Ranije predložena Mirna vezane SNP nije pokazala značajne GC povezane razlike u našem europskom stanovništvu. Ipak, priznaju da postoji nekoliko ograničenja vezana za dizajn našeg istraživanja. Bilo je spolne razlike raspodjela između GC, HRAG i kontrolne skupine; Međutim, kada je izvođenje statističke analize uključili smo rod kao kovarijata, čime se smanjuje potencijalni utjecaj spola za ishod naših rezultata. Ovdje u ovom istraživanju smo se fokusirali na histološkim promjenama, a ne prisustvo H. pylori
; dakle, dodatna ispitivanja osim serumskog IgG protutijela za otkrivanje nisu primijenjeni ova bakterija. Osim toga, dobro je znati da je kronični atrofični gastritis uzrokovan H. pylori
infekcije. Nismo prilagoditi ili H. pylori pregled IgG antitijela, CagA pregled ili Vaca pregled statusa jer ti podaci nisu bili dostupni za sve subjekte. Nismo mogli izvršiti analizu pridruživanju na SNP-u miRNAs s obzirom na preživljavanje GC pacijenata, kao što su informacije dostupne samo za mali udio ispitanika. Zbog istog razloga mi također nije izvršila analizu prema anatomskom položaja u želucu (proksimalni vs. distalno). U ovom radu provedena isključivo gena analiza polimorfizma bez rješavanja Mirne izraz razlike u kancerozne i ne-kancerogen tkiva i, dakle, ne možemo pretpostaviti ako ti polimorfizmi mogli imati funkcionalnu ulogu. Daljnja istraživanja trebala bi se procijenila uloga SNP za razine Mirne na GC tkiva i procijeniti potencijalne ciljne gene u funkcionalnim ispitivanjima. Broj osoba unutar podskupine u našoj studiji crijevnih i difuzna tipa GC grupa je relativno mala i može se underpowered detektirati određene asocijacije. Pronašli smo neke razlike za Mir-196a-2 i Mir-608 SNP među skupinama s P izvoznici < 0,05; Međutim, smatramo da ne možemo prijaviti značajnu povezanost, jer nisu stigli do podesiti P
vrijednost. Više usporedbe za genetske testove udruge su primijenjena u ovom radu i vjerujemo da bismo trebali koristiti prilagođen P
vrijednost za crtanje zaključke.

Zaključci

Naša studija pokazuje taj gen polimorfizmi Mir-27a pregled, Mir-146a pregled, Mir-196a-2
, Mir-492 Netlogu i Mir -608 pregled nisu povezani s rizikom od GC i HRAG u ispitanika europskog podrijetla. Ovi SNP-ovi se ne pojavljuju kao potencijalni biomarkeri za identifikaciju pojedinaca s povećanim rizikom za GC. Pregled

Priznanja

Želimo se zahvaliti Lina Baldauskiene za izvrsnu pomoć kod genotipizacije eksperimenata u laboratoriju. Pregled

• PLoS ONE: mikrornk-10A je podregulira metilacije DNA i funkcionira kao supresor tumora na rak želuca Cells
• PLoS ONE: povezanost između polimorfizama XRCC1 Gene i liječenje ishoda bolesnika s uznapredovalim rakom želuca: sustavni pregled i meta-Analysis