PLoS ONE: geenipolymorfismien of MikroRNA in Helicobacter pylori aiheuttama suuri riski atrofisen gastriitin ja Mahalaukun Cancer

tiivistelmä

Tausta ja tavoitteet

MikroRNA (miRNA) ovat tunnettuja toimivat translaation sääntelyviranomaisten kasvain vaimennin tai onkogeenien. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in miRNA liittyviä geenejä on osoitettu vaikuttavan sääntelyn kapasiteettia miRNA ja olivat yhteydessä mahalaukun syöpä (GC) ja syöpää edeltävä mahalaukun olosuhteissa. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli arvioida mahdollisia assosiaatioita miRNA liittyvien geenipolymorfismien ( miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
ja miR-608
) ja läsnäolo GC tai korkean riskin atrofinen gastriitti (HRAG) Euroopan väestöstä.

Methods

Gene polymorfismit analysoitiin 995 koehenkilöä (valvonta: n = 351; GC: n = 363; HRAG: n = 281) eurooppalaista syntyperää. MiR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) ja miR-608
C > G (rs4919510) SNP genotyypattiin RT-PCR.

Tulokset

Kaiken SNP miRNA eivät liittyneet läsnäolo GC tai HRAG. Havaitsimme taipumus miR-196a-2
CT genotyypin liittyvän suurempi riski GC verrattuna CC-genotyyppi, mutta ero ei yltänyt oikaistu P
-arvo (riskisuhde (OR) - 1,46, 95%: n luottamusväli (CI) 1,03-2,07, P
= 0,032). MiR-608
GG-genotyyppi oli yleisempää GC verrattuna kontrolleihin (OR -2,34, 95% CI 1,08-5,04), mutta merkitys pysyi marginaalinen ( P
= 0,029). Samanlainen suuntaus havaittiin resessiivinen malli miR-608
, jossa CC + CG vs GG-genotyyppi Vertailun taipumus suurentunut GC OR 2,44 (95% CI 1,14-5,22, P
= 0,021). Genotyypit ja alleelien miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
ja miR-608
SNP oli samanlainen jakautuminen histologisia alatyyppejä GC ja ei ollut siteitä läsnäolo levinnyttä tai suoliston-tyyppinen GC.

Johtopäätökset

geenipolymorfismien on miR -27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
, miR-492A
ja miR-608
eivät liittyneet läsnäolo HRAG, GC tai erilaisia ​​histologisia alatyyppejä GC eurooppalaisessa aiheista.

Citation: Kupcinskas J, Wex T, Link A, Leja M, Bruzaite I, Steponaitiene R, et ai. (2014) Gene polymorfismit MikroRNA in Helicobacter pylori
aiheuttama suuri riski atrofisen gastriitin ja mahasyövässä. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10,1371 /journal.pone.0087467

Editor: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japani

vastaanotettu: 14 syyskuu 2013; Hyväksytty: 26 joulukuu 2013; Julkaistu: 27 tammikuu 2014

Copyright: © 2014 Kupcinskas et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat Euroopan sosiaalirahaston (nro VP1-3.1-MM-07-K-01-156) ja osittain avustusta BMBF (BMBF-0315905D) kehyksessä ERA-Net PathoGenoMics projekti. Potilasrekrytointi Latviassa tuettiin osittain hankkeen Euroopan aluekehitysrahastosta (nro 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

huolimatta yleisyyden mahasyövän (GC) useimmissa kehittyneissä maissa, GC oli yhteensä 989600 uutta tapausta ja 738000 kuolemantapausta vuonna 2008 maailmanlaajuisesti [1]. Helicobacter pylori
( H. Pylori
) hoitoon mahalaukun limakalvon voi johtaa kehitystä gastriitin (AG) ja suoliston metaplasiaa (IM) ja on kardinaali kehittymisen riskitekijä GC [2]. Kuitenkin, kehittäminen mahalaukun adenokarsinooman ei voida selittää läsnäolo H. pylori
yksin. Synergiavaikutuksen ympäristön, isäntä, ravitsemukselliset ja bakteerien tekijöistä uskotaan laukaisevan mahasyövän kuitenkin mekanismeja ja vuorovaikutus tunnetaan edelleen huonosti [3]. Useita geeniterapian muutoksia ovat sekaantuneet mahasyövän, mutta yksikään niistä ei ole vielä siirretty päivittäin kliininen käytäntö puutteen yhdistymis- vahvuus [4]. Tuoreet tiedot viittaavat mahdolliseen vaikutus yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t) on mikroRNA liittyvien geenien (miRNA) varten syöpäriskiä kehitys [5].

miRNA vain ~22 bp pitkä, ja koska se on ainutlaatuinen biogeneesissä ovat erittäin stabiileja erilaisissa kudoksissa tai näytteitä, mikä tekee niistä houkuttelevan tavoite biomarkkereiden tutkimusalalla [6], [7]. Kasvava joukko toiminnallisia tutkimusten mukaan miRNA voi olla mukana eri vaiheissa mahasyövän [8]. Tätä vastaavuutta heijastuu myös miRNA profilointi tutkimuksissa joka paljasti tiettyjä muutoksia ilmentämiskuviota limakalvolla GC potilaista. Lisäksi miRNA ilmaisu muutokset ovat jo havaittavissa alkuvaiheessa mahasyövän lukien H. pylori
aiheuttama AG [8].

Lisätään tietoisuutta toiminnallista roolia miRNA on avannut uuden Capitel geenien polymorfismi tutkimukseen syövän [7], [9]. Single miRNA pystyy kohdistaminen useiden geenien; Siksi merkitys SNP miRNA geenisekvenssi voi mahdollisesti liittyä merkittäviä muutoksia geenin ilmentymisen säätelyyn ja muuttaminen riskin kehittymistä tiettyjen ihmisen sairauksien, kuten GC [8]. Eri tutkimukset ovat osoittaneet, että tietyt SNP miRNA-koodaavat geenit voivat muuttaa miRNA ilmaisua tai sen toiminnallista roolia ja näin vaikuttaa syövän kehittymisen riski tai etenemisen [10], [11]. Kasvava määrä tapausverrokkitutkimukset ovat osoittaneet yhdistyksen välillä polymorfismien geenien koodaavat miRNA ja riski erilaisten pahanlaatuisten kasvainten [5]. Geenipolymorfismien viiden miRNA liittyviä geenejä, miR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) ja miR-608
C > G (rs4919510), on valittu tämän tutkimuksen vuoksi aiemmin ehdottanut yhdessä syöpäriski [5], [12] - [14].

edellä mainitut miRNA on liitetty eri syöpään liittyvien reittejä. Liu et ai. osoittivat, että miR-27a
on säädellään ylöspäin GC ja toimii onkogeenin kohdistamalla prohibitin [15]. SNP on miR-27a
(rs895819) edistää GC alttius kautta vaikuttavia ilmaus miR-27a
ja tavoitteet geeni sinkkisormen ja BTB verkkotunnuksen, joka sisältää 10 ( ZBTB10
) [16]. MiR-146a
oli osoitettu moduloivan H. pylori
indusoiman tulehduksellisen vasteen ihmisen mahalaukun epiteelisolujen kohdistamalla IL-1: een liittyvä kinaasi 1 ( IRAK1
) ja TNF-reseptori liittyy tekijä 6 ( TRAF6
) [17]. Lisäksi miR-146a
SNP (rs2910164) on liittynyt AG Japani aiheita [18]. Aikaisemmat tutkimukset ovat osoittaneet poikkeava yli ilmentyminen miR-196a-2
ja siitä alaspäin säätely p27 (kip1) GC [16]. Toinen tutkimus osoitti, että geeni polymorfismi miR-196a-2
(rs11614913) liittyi lisääntynyt riski GC [19], [20] kun tutkimus Ahn et al. (2012) ei voinut vahvistaa tätä yhdistys, mutta tämä SNP oli yhdistetty selviytymisen GC potilailla [21]. MiR-492
tunnistettiin olevan tärkeä rooli etenemistä pahanlaatuisten alkion maksakasvaimien [22] ja vapautetaan säännöstelystä peräsuolen syövän verrattuna normaaliin paksusuolen limakalvolle [23]. Raportti Kiinan väestö osoitti, että SNP on miR-608
(rs4919510) voivat vaikuttaa HER2-positiivisen rintasyövän riskiä ja kasvaimen leviämisen [14].

Useimmat julkaistut genotyypityksen tutkimuksiin liittyvä jotta miRNA geenien GC tehtiin vain Aasian aiheita, rajoittavat pienestä otoksesta ja raportti osittain ristiriitaisia ​​tuloksia. Lisäksi hyvin harvat tutkimukset ovat aiemmin käsitelty rooli näiden miRNA liittyvien SNP syöpää edeltävä mahalaukun olosuhteissa. Perustuen näytön yläpuolelle, suoritimme systemaattinen Genotyyppausanalyysiin varten miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, asennuspalveli- 492
ja miR-608
SNP potilailla GC, korkean riskin atrofinen gastriitti ja valvontaa kolmella potilasryhmille Saksasta, Liettua ja Latvia eurooppalaista syntyperää.

Methods

Ethics selvitys

tutkimus hyväksyi eettisten komiteoiden Otto-von-Guericke University Magdeburgissa, liettua University of Health Sciences ja Keski Medical Ethics komitean Latvian. Kaikki potilaat ovat allekirjoittaneet tietoisen suostumuksen lomakkeella osallistua tutkimukseen.

Tutkimuskanta

Oppiaineet tutkimuksessa mukana tulevat aikaisemmista tutkimushankkeisiin SNP GC ja premaligni mahalaukun olosuhteissa [24] , [25]. Potilaiden ja verrokkien rekrytoitiin vuosina 2005-2012 kolmessa gastroenterologian keskuksissa Saksassa (Department of Gastroenterology, Hepatology and Infectious Diseases, Otto-von-Guericke University, Magdeburgin) Liettua (Department of Gastroenterology, Liettuan University of Health Sciences, Kaunas) ja Latvia (Riga East University Hospital ja Digestive Diseases keskus GASTRO, Riika). Potilaat, joilla HRAG ja kontrollia sisällytettiin päässä avohoidon yksiköissä, jotka on alistettu ylemmän tähystykseen takia happovaivat. Sisällyttäminen kriteerit HRAG ja ohjaus ei ole aiemmin todettu maligniteetti, ruoansulatuskanavan sairaus tai leikkaus. GC potilaalla oli histologinen tarkastamisen mahalaukun adenokarsinooman ja rekrytoitiin avohoidon ja paikallaan osastojen. Kaikkiaan 995 yksilöitä, joille materiaalia sopiva DNA laatu oli käytettävissä (351 valvonta, 281 HRAG ja 363 GC), otettiin mukaan tutkimukseen. Oli 310 koehenkilöllä saksalaisen ryhmän (63 valvontaa, 106 GC ja 141 HRAG), 340 aiheita Latvian ryhmässä (142 valvonta, 139 GC ja 59 HRAG) ja 345 aiheita Liettuan ryhmä (146 valvonta, 118 GC ja 81 HRAG). Kaikki potilaat olivat eurooppalaista syntyperää.

Histologinen analyysi ja H. pylori
tila

yksityiskohtainen histologista arviointia mahalaukun limakalvon suoritettiin tarkastuksia ja HRAG ryhmiin muunnetun Sydney luokittelun [26]. HRAG määriteltiin yleiseurooppalainen gastriitti (samanlainen tulehduksellinen tulokset antrumissa corpus), corpus-hallitseva gastriitti kanssa tai ilman läsnäoloa mahalaukun surkastuminen, ja IM joko antrumissa tai corpus mahan [27]. H. pylori
tila määritettiin testaamalla anti- H. pylori
IgG seerumista. Histologinen alatyypitys GC suoritettiin mukaisesti Laurén luokittelu suoliston ja diffuusi-tyypit [28].

DNA: n eristämistä ja genotyypityksen

Perimän DNA Saksan ryhmästä eristettiin perifeerisen veren mononukleaarisissa soluissa käyttämällä QIAamp DNA veri (Qiagen, Hilden, Saksa) mukaan valmistajan ohjeiden. Genomi-DNA-näytteistä Liettuan ja Latvian ryhmien uutettiin käyttäen fenoli-kloroformilla uuttomenetelmällä perifeerisen veren mononukleaarisia soluja. DNA-näytteet säilytettiin -20 ° C: ssa analyysiin asti. SNP miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913 ), miR-492
C > G (rs2289030) ja miR-608
C > G (rs4919510) genotyypattiin käyttämällä predesigned TaqMan® määrityksiä kanssa 7500 ™ reaaliaikaista cycler, mukaisesti valmistajan ohjeiden (Life Technologies, CA, USA). Genotyyppi toimeksiantoja manuaalisesti varmistettiin silmämääräisesti kanssa SDS 2.0.5 ohjelmisto yhteensopivia TaqMan® järjestelmään.

genotyypin laadunvalvonta

Laadunvalvontamenettelyt sovellettiin koko genotyypitys näytteitä. Sen jälkeen genotyypityksen, noin 10% näytteistä kunkin genotyypin ryhmässä valittiin toistuvia analyysi 100% konkordanssin korko. Epäilyttävä näytteillä oli kolmikon toistuvia analyysi. Kaikki osapuolet genotyypitys sokaisi tapaukseen tai valvonta-asema, näytteitä. Näytteitä, jotka eivät genotyyppi kirjattiin määrittelemätön.

Tilastollinen

Kaikki potilaat luokiteltiin kolmeen opintoryhmistä: valvonta (n = 351), HRAG (n = 281), GC (n = 363). Ikä näkyy keskiarvot ja keskihajonnat, ja verrattiin käyttämällä ANOVA ja parittomia Studentin t-testiä. Kategorinen data (esim. Sukupuoli, H. Pylori
infektio, histologiset GC alatyyppejä, jakelu genotyyppien tai alleelien) esitetään taajuuksia; vertailut suoritettiin käyttäen Chi-square test.

Laatu arviointeja ja tilastollinen analyysi Genotyyppaustulokset tehtiin käyttäen Plink ohjelmistoversio 1.07 [29]. Yksilöt yli 10% puuttuu genotyypit ja SNP kanssa puhelun luokan alle 90% tai poikkeama Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kontrolleissa ( P
< 0,05) jätettiin pois lisäanalyysiä. Keskimääräinen genotyypitys nopeudella kaikkien näytteiden oli 99,6%. Erot alleelifrekvenssit tapausten ja kontrollien välillä laskettiin yhdistetyssä Saksan, Liettuan ja Latvian Tutkimuksen otokseen, käyttäen Breslowin päivän testi heterogeenisyys syrjäisimpien alueiden. Vain yksi SNP ( miR-608
C > G rs4919510) osoitti heterogeenisuus syrjäisimpien alueiden välillä kolmen GC tutkimusryhmissä ( P
_{BD < 0,05), ja siksi maan syntymä sisällytettiin kuin kovariaattina jatkotarkastelussa. Association välillä HRAG ja GC kanssa geenipolymorfismien laskettiin regressioanalyysimme korjattuna iän, sukupuolen ja -maa 95%: n luottamusväli (CI). Suhteellinen riskit mutaatioita tutkittiin käyttämällä väistyvä ja hallitseva malli, joka johti vertailu villityypin + heterotsygoottinen vs. homotsygoottisia ja villityypin vs.
Heterotsygoottinen + homotsygoottista, vastaavasti. Säädä useita testaus laskimme korjatun merkitys kynnys α = 0,01 (0,05 /5).}

Tulokset

Ominaisuudet aiheista

ominaisuudet ohjaus, GC ja HRAG ryhmiä on esitetty taulukossa 1. mukaisesti tosielämän ikä koehenkilöt poikkesivat huomattavasti iän ja sukupuolen jakautuminen ryhmien välillä. Kuten odotettua, miehillä osuus oli 63,6% GC ryhmässä, kun taas ohjaus ja HRAG ryhmät tämä sukupuoli muodostivat 26,8% ja 37,7%, tässä järjestyksessä. Verrokeilla olivat huomattavasti nuorempia kuin HRAG ryhmä (3 vuotta) ja GC ryhmä (5 vuotta). 52,6% potilaista oli positiivinen H. pylori
GC ryhmässä kuitenkin noin 27% yksilön GC ryhmä H. pylori
IgG tila ei saatu. Yli 47%: lla kontrolliryhmässä ja 42,7% vuonna HRAG ryhmässä olivat H. pylori
positiivinen. Histologinen luokittelu hajanainen ja suoliston GC tyypit noudettiin varten 62,0% GC potilaista (taulukko 1).

yhdistysten miRNA SNP ja riski GC ja HRAG

genotyyppi jakelu kaikkien viiden polymorfismit tutkimuksessa olivat odotetun kaltaiset Hardy-Weinberg Equilibrium: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0,44); rs11614913 (p = 0,95); rs2289030 (p = 0,44); rs4919510 (p = 0,39). Genotyyppi ja alleeli jakaumat miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
C > G (rs2289030) ja miR-608
C > G (rs4919510) geenipolymorfismien GC ja HRAG opintoryhmää on esitetty taulukossa 2. mitään merkittäviä yhdistysten havaittiin tauteja tutkitaan seuraavat korjausta useille testaus. Havaitsimme taipumus miR-196a-2
CT genotyypin liittyvän suurempi riski GC verrattuna CC-genotyyppi, mutta ero ei saavuttanut oikaistun merkitys kynnys (OR - 1,46, 95% CI 1,03-2,07, P
= 0,032). MiR-608
GG-genotyyppi marginaalisesti liittyy suurempi riski GC verrattuna CC genotyyppi (OR - 2,34, 95% CI 1,08-5,04, P
= 0,029). Samanlainen suuntaus havaittiin resessiivinen malli miR-608
, jossa CC + CG vs GG genotyypin vertailu johti OR - 2,44 (95% CI 1,14-5,22), ( P
= 0,021).

yhdistysten miRNA SNP ja riski suoliston ja diffuusi-tyypin GC

miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
ja miR-608
SNP yhdistysten testattiin kahdella histologisia tyyppejä GC (diffuusi tai suoliston tyyppi-GC). Genotyyppi ja alleeli taajuudet tutkimusryhmissä on esitetty taulukossa 3. Dominant malli miR-27a
osoitti taipumusta alleelin T vs. C olevan yhteydessä suurempi riski diffuusi-tyyppinen GC (OR - 2,07 , 95%: n luottamusväli 1,13-3,79, P
= 0,018). MiR-196-a2
SNP osoitti taipumusta pienempi riski suolen tyyppiä GC väistyvä malli (CC + CT vs. TT), mutta yhdistys vahvuus ei ollut tilastollisesti merkitsevä (OR - 0,47, 95 % CI 0,20-1,08, P
= 0,077). Samanlainen havainto tehtiin määräävä malli miR-492
SNP (OR - 1,95, 95% CI 1,01-3,75) kun GG vs. GC verrattuna lisäsi riskiä diffuusi-tyyppinen GC, mutta P
arvo ei pääse tarvita merkitsevyystasolla ( P
= 0,046). Kaikki muut vertailuja ohjaus ja diffuusi tai suoliston-tyyppinen GC ryhmät eivät paljastaneet merkittäviä yhdistyksiä tai trendejä viiden SNP miRNA.

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa teimme Genotyyppausanalyysiin varten miR-27a
(rs895819), miR-146a
(rs2910164), miR-196a-2
(rs11614913), miR-492
(rs2289030) ja miR-608
(rs4919510) geenipolymorfismien asiassa verrokkitutkimuksessa lukien 351 valvonta, 281 HRAG ja 363 GC potilaiden kolmesta Euroopan tutkimusryhmissä. Nämä polymorfismit on liitetty riski GC tai yleinen syöpäriski; kuitenkin kerrotut tiedot ovat osittain ristiriitaisia ​​tai jotka perustuvat vain harvoja tutkimuksia, jotka liittyvät Aasian ryhmille. Vaikka joitakin pieniä eroja, tuloksemme eivät tue välistä yhteyttä miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, asennuspalveli- 492
ja miR-608
geenipolymorfismien ja läsnäolo GC tai HRAG. Lisäksi emme löytäneet yhdistyksen välillä SNP miRNA ja esiintyy erilaisia ​​histologisia alatyyppejä GC. Koska miRNA on osoitettu olevan syvällisiä vaikutuksia in mahasyövän [8], odotimme, että nämä polymorfismit voivat muuttaa riski GC tai sen esiasteita. Parhaan tietomme, tämä on ensimmäinen tutkimus, jossa selvitettiin yhdistysten näiden miRNA polymorfismien ja riski GC tai HRAG koehenkilöillä eurooppalaista syntyperää. Enemmän kuin, että SNP miR-492
(rs2289030) ja miR-608
(rs4919510) ei ole tutkittu suhteessa GC tai premaligni mahalaukun olosuhteissa aiemmin.

Gene polymorfismi miR-27a on tällä hetkellä yksi eniten tutkittu SNP syöpään liittyvissä tapaus-verrokki tutkimuksissa. Odotimme, että kantajia C alleeli miR-27a
SNP voi olla pienempi riski GC kuten on ehdotettu joidenkin tutkimusryhmät. Kiinalainen tapauskontrollitutkimuksessa lukien 311 GC potilasta ja 425 syöpää vapaa valvonnan havaittu, että pienet alleeli C rs895819 miR-27a
vähensi merkittävästi riskiä GC OR - 0,77 [30]. Toinen tutkimus osoitti merkitsevästi suurentunut GC (OR - 1,48) ja miR-27a
SNP ja edelleen toiminnallisia analyysejä osoitti, että muunnos genotyypit voivat olla vastuussa kohonnut miR-27a
tasoja ja vähensi ZBTB10
mRNA [16]. Sen sijaan tutkimuksessa lukien 2380 osallistujien monipuolista mahavaurioita ei löytänyt suurentunut mahalaukun IM tai dysplasian varten rs895819 [12]. Meta-analyysi yhteenvedon havainnot eri tapausverrokkitutkimukset paljastivat, että rs895819 polymorfismi merkitsevästi liittyy pienentynyt riski syövän valkoinen, mutta ei aasialaisilla [31]. Tulokset Tutkimuksemme eivät tue mahdollinen suojaava vaikutus C-alleelin GC kehitystä eurooppalaisessa aiheista. Tutkimuksemme on ensimmäinen, jossa arvioitiin rooli miR-27a
rs895819 GC ja HRAG koehenkilöillä eurooppalaista syntyperää, mutta mitään merkittäviä yhdistyksiä ole havaittu.

Kun otetaan huomioon olemassa olevat todisteet miR-146a
SNP (rs2910164) syövän kehityksen halusimme arvioida mahdollista yhteyttä meidän potilasryhmässä GC ja HRAG. Song et ai. havaitsivat, että CC kantajia rs2910164 oli huomattavasti lisääntynyt riski IM (OR - 1.42) ja dysplasia (OR - 1,54) verrattuna GG harjoittajille [12]. Samanlainen havainto tehtiin toisessa tutkimuksessa, jossa yhteinen vaikutus miR-146a
(rs2910164) G /G ja TLR4 SNP on lisääntynyt riski saada vakavia AG keskuudessa Japani koehenkilöillä havaittiin [18]. Paperi by Okubo et al. [32] kertoi, että kuljettaminen rs2910164 CC-genotyyppi liittyi huomattavasti suurempi riski GC verrattuna ei-syöpäpotilailla (OR - 1,30). Meta-analyysi Wang et al. [33] on miR-146a
rs2910164 lukien 19 tapaus-verrokki-tutkimuksissa havaittiin, että rs2910164 liittyi lisääntynyt syöpäalttiutta aasialaisilla yleisten OR - 1,18, mutta sama meta-analyysi vaatii edelleen hyvin suunniteltu tutkimuksissa suuret otoskoko edelleen riskien tunnistamiseen. Tulokset meidän tapauskontrollitutkimuksessa ei havaittu merkittävää yhteyttä välillä rs2910164 ja riskin GC tai HRAG.

MiR-196a-2
C > T SNP (rs11614913) on yksi parhaista tutkittu miRNA SNP suhteessa eri syöpäsairauksia. Raportti Wang et al. (2013) osoittivat, että CC-genotyyppi liittyi merkittävästi vähentää mahalaukun syövän riski (OR - 0,78) verrattuna CT ja TT-genotyyppien suuressa tapauskontrollitutkimuksessa [33]. Meta-analyysi Wang et al. (2013) havaitsivat huomattavasti GC riski, mutta yhdistys havaittiin vain homotsygoottisia verrattuna. Tämä meta-analyysi osoitti, että rs11614913 polymorfismi liittyy merkittävästi kokonaisriski ruuansulatuskanavan syöpien [34]. Okubo et ai. [32] ei löytänyt linkkiä tämän SNP ja GC kuitenkin tutkimuksessaan rs11614913 liittyi aste H. pylori
indusoimaan mononukleaaristen solujen infiltraatiota. Mielenkiintoista on, että toinen meta-analyysi samalla SNP ei määritellä suhde rs11614913 ja GC kehittämiseen [35]. Tulokset Tutkimuksemme ovat linjassa tekemisen jälkimmäisen meta-analyysissä emme noudata merkitsevästi yhteydessä SNP on miR-196a-2
ja GC riskiä.

polymorfismin miR-492
(rs2289030) on arveltu toimia välittäjänä syöpäriski, mutta tiedot mahdollisista yhdistysten tämän SNP ja syöpäriskin ovat yhä harvinaisia. Tekemässä tutkimuksessa Yoon et al. (2012) ei löytänyt yhdistyksen välillä SNP on miR-492
ja riski tai eloonjäämistä potilailla, joilla on ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [36]. Toinen tutkimus peräsuolen syöpä on osoittanut, että ilman taudin etenemistä potilaiden kanssa yhdistetyn miR-492
CG ja GG-genotyyppi oli merkittävästi huonompi kuin potilaiden kanssa miR-492
CC-genotyyppi [13]. Tuloksemme osoittavat, että rs2289030 on miR-492
ei liity läsnäolo GC tai HRAG. Parhaan tietomme tämä on ensimmäinen tutkimus, jossa tarkastellaan suhdetta miR-492
SNP ja syöpää edeltäviin mahalaukun ehtoja tai GC ja siksi mitään vertailua meidän tiedot voidaan tehdä.

SNP miR-608
(rs4919510) ei ole tutkittu suhteessa GC riskit aiemmin. Tutkimuksemme on raportoi ensimmäisenä nolla yhdistyksen välinen polymorfismin ja riski GC tai syöpää edeltävä mahalaukun olosuhteissa. Kolorektaalisyövässä potilailla rs4919510 merkitsevästi sidoksissa syövän uusiutuminen ja kuoleman [37]. Toinen tapaus-verrokki tutkimuksessa peräsuolen syövän potilaista ei löytänyt yhdistys syöpäriskiä, ​​mutta niiden tulokset osoittivat, että GG-genotyyppi liittyy suurentunut riski kuolla valkoisen väestön ja vähentää riskiä kuolemaan Afrikkalainen amerikkalaiset [38]. Lisäksi suuremman mittakaavan tutkimuksia voisi määrätä rooli miR-608
rs4919510 SNP mahalaukun ja muiden pahanlaatuisten kasvainten.

Suoliston ja diffuusi-tyyppisiä GC on osoitettu olevan erilaiset patogeeniset reittejä [3]. Jotkut tutkimukset ovat osoittaneet, että miRNA polymorfismit saattaa olla erilaisia ​​vaikutuksia histologista alatyyppien GC. Sen jälkeen kerrostetaan potilaiden suoliston ja hajanainen-tyypin GC ryhmiä, miR-499
rs3746444 osoitettiin vaikuttavan riskiä diffuusi-tyyppinen GC in Korean väestöstä [21]. Vaikka määrä yksilöiden suoliston ja hajanainen-tyypin GC välillä ei ollut kovin korkea tutkimuksessamme, analyysi vertaamalla näitä kahta eri histologisia tyyppejä GC suoritettiin. Kaiken miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
ja miR-608
SNP ei ollut siteitä esiintyy erilaisia ​​histologisia alatyyppejä GC. Vaikka jotkut suuntaukset kuvattujen tulosten jaksossa on havaittu välillä histologinen alaryhmä GC, erot genotyyppi ja alleelifrekvenssit eivät saavuttaneet tarvita merkitystä tasolle.

tulokset Tutkimuksemme tukevat selvästi merkitystä huolellisen arvioinnin geenipolymorfismien eri etnisiä ryhmiä. Aiemmin ehdottanut miRNA liittyvä SNP ei ilmennyt merkittäviä GC liittyviä eroja meidän Euroopan väestöstä. Olemme kuitenkin myönnettävä, että on olemassa useita rajoituksia, jotka liittyvät suunnitteluun tutkimuksemme. Oli sukupuolijakauma erot GC, HRAG ja kontrolliryhmiin; kuitenkin, kun suoritetaan tilastollinen analyysi olemme mukana sukupuolten kovarianssina minimoiden siten mahdollinen vaikutus sukupuolen tuloksesta meidän tuloksia. Täällä tässä tutkimuksessa keskityimme histologisia muutoksia sijaan läsnäolo H. pylori
; siksi, lisätestejä lisäksi seerumin IgG havaitsemiseksi tätä bakteeria ei sovellettu. Lisäksi on hyvin tunnettua, että krooninen atrofinen gastriitti on aiheuttanut H. pylori
infektio. Emme säädä tai H. pylori
IgG, CagA
tai VacA
asema sillä näitä tietoja ei ollut saatavilla kaikista aiheista. Emme voineet tehdä yhdistyksen analyysi SNP miRNA suhteen selviytymisen GC potilaiden, koska tiedot olivat saatavilla vain pienen osan aiheista. Samasta syystä myös ei tehnyt analyysin mukaan anatominen sijainti mahalaukussa (proksimaalinen vs. distaalinen). Tässä tutkimuksessa suoritetaan yksinomaan geenin polymorfismi analyysi, ilman että puututaan miRNA ilmaisun erot syöpä- ja ei-syöpä kudoksiin ja siksi emme voi olettaa, jos nämä polymorfismit voisi olla toiminnallinen rooli. Jatkotutkimukset tulisi arvioida roolia SNP varten miRNA tasoilla GC kudosten ja arvioida mahdollisia kohdegeenien toiminnallisia tutkimuksissa. Henkilöiden määrä sisällä alaryhmien tutkimuksessamme suoliston ja hajanainen-tyyppinen GC ryhmiä on suhteellisen pieni ja voidaan alitehoinen spesifisten yhdistyksille. Löysimme eroja miR-196a-2 ja miR-608 SNP keskuudessa ryhmien P
< 0,05; Olemme kuitenkin sitä mieltä, että emme voi ilmoittaa merkittävää yhteyttä, koska he eivät pääse meidän oikaistu P
arvo. Useat vertailut geneettisiä yhdistyksen testejä on sovellettu tässä asiakirjassa, ja uskomme, että meidän pitäisi käyttää säädettiin P
arvo piirtämiseen päätelmiä.

Johtopäätökset

Tutkimuksemme osoittaa että geenipolymorfismien on miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
ja miR -608
eivät liity vaaraa GC ja HRAG koehenkilöillä eurooppalaista syntyperää. Nämä SNP eivät näy mahdollisina biomarkkereita yksilöiden tunnistamiseksi, joilla on suurentunut GC.

Kiitokset

Haluamme kiittää Lina Baldauskiene erinomaisesta apua genotyypitys kokeita laboratoriossa.

• PLoS ONE: MicroRNA-10a säätyy alas DNA Metylointi ja funktiot tuumorisuppressorina mahasyövän Cells
• PLoS ONE: Association between polymorfismit XRCC1 Gene ja hoitotuloksia potilaan kanssa edennyt mahasyöpä: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi