skrandžio sveikatos > tyrimai > Asocijavosi su PTPN11 G /A polimorfizmo ne intronas 3 su Helicobactor pyloriseropositivity, skrandžio atrofija ir skrandžio vėžio Japanese

Asocijavosi su PTPN11 G /A polimorfizmo ne intronas 3 su Helicobactor pyloriseropositivity, skrandžio atrofija ir skrandžio vėžio Japanese

asociacijų su PTPN11 pervežimas G /A polimorfizmo ne intronas 3 su Helicobactor pylori
seropozityvumo, skrandžio atrofija ir skrandžio vėžio Japonijos
Santrauka
faktai
ankstesni tyrimai atskleidė, kad Helicobacter pylori
(H. pylori pervežimas) infekcijos rizikos veiksnys skrandžio vėžiui reikšmę. Citotoksinas susijęs genas A (CagA
) pozityvumo buvo įrodyta, kad nustatyti klinikinei baigčiai H. pylori
infekcijos į SHP-2 akivaizdoje (src homologijos 2 domenų, kurių sudėtyje yra baltymų tirozino fosfatazės-2). Šis tyrimas skirtas išnagrinėti anksčiau pranešė asociacija G /A PTPN11 (baltymo tirozino fosfatazės, 11 nonreceptor tipo)
polimorfizmo (rs2301756) su skrandžio atrofija, taip pat asociacijos su skrandžio vėžio Japonijos gyventojų naudodamas didelis imties dydis.
metodai
dėstomus dalykus buvo 583 histologiškai diagnozuota pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu (429 vyrų ir 154 moterų) ir pagal amžiaus grupes ir lytį dažnio atitikimo 1,636 ne vėžio ambulatoriškai (jai bus skirtas 1203 vyrai ir 433 moterys), lankęsis Aichi vėžio centro ligoninė tarp 2001-2005. Serumas Anti-O. pylori
IgG ir pepsinogens buvo matuojamas įvertinti H. pylori
infekcijos ir skrandžio atrofija, atitinkamai. Kursai koeficientai (PVA) ir 95% pasikliautinieji intervalai (CIS), buvo apskaičiuotas logistikos modelį.
Rezultatai
Tarp H. pylori
seroteigiamiems ne vėžio ambulatoriškai, The amžiumi ir seksas pakoreguotas ARBA skrandžio atrofija buvo 0,82 (95% PI 0,62-1,10, p
= 0,194) už G /A
, 0,84 (95% PI 0,39-1,81, p
= 0,650) A /A
, ir 0,83 (95% PI 0,62-1,09, p
= 0,182) už G /A
+ A /A
, lyginant su G /g,
genotipas, ir kad sunkus skrandžio atrofija buvo 0,70 (95% PI 0,47-1,04, p
= 0,079), 0,56 (95% PI 0,17-1,91, p
= 0,356) ir 0,68 (95% PI 0,46-1,01, p
= 0,057) , atitinkamai. Tarp H. pylori
infekuotų asmenų (H. pylori
serologiškai teigiamų dalykų ir seronegatyvius su skrandžio atrofija), kurios pakoreguota ARBA sunkios skrandžio atrofija buvo dar labiau sumažintos; 0,62 (95% PI 0,42-0,90, p
= 0,012) už G /A
+ A /A pervežimas. Iš genotipo paskirstymo pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu, reikšmingai nesiskyrė nuo H. pylori
infekuotų asmenų, be skrandžio atrofijos.
Išvada
Mūsų tyrimo rezultatai parodė, kad tie, su A /A
genotipas PTPN11
rs2301756 polimorfizmo yra ne mažesnis pavojus sunkus skrandžio atrofijos, bet nėra susiję su sumažėjusiu rizika skrandžio vėžio, kuriuo iš dalies palaikė mūsų ankstesnę išvadą, kad į PTPN11
geno, koduojančio SHP-2 polimorfizmas buvo susijęs su skrandžio atrofijos pavojaus H. pylori
užsikrėtę japonus. Biologiniai vaidmenys šio PTPN11
polimorfizmo reikalauja tolesnio tyrimo.
Background
Helicobacter pylori
(H. pylori
) infekcija yra nusistovėjęs rizikos veiksnys skrandžio vėžiui per skrandžio vystymąsi atrofija ir vėlesni ikivėžinių pakitimų. Ypač, H. pylori
kamienai su citotoksinas susijęs genas A (CagA
) yra stipri asociacija su padidintu skrandžio adenokarcinomos rizika [1]. Rimtas skrandžio atrofija ir Corpus-dominuojantis gastritas kartu su žarnyno metaplazijos yra gerai žinomi kaip vyraujančių polinkiu skrandžio [2] vėžiu. Kompiuterių priešuždegiminiais genetinių veiksnių vienu metu su buvo pranešė, kad bakterijų virulentiškumo veiksniai, tokie kaip CagA nustatyti skrandžio žalos sunkumą ir galimam klinikiniam rezultatus H. pylori
infekcijos [3, 4]. Skrandžio vėžio rizika dauginama keletą kartų, jei kompiuteris išreiškia abiejų šių veiksnių [5, 6]. Rytų Azijos populiaciją, didžioji dauguma H. ​​pylori
yra CagA
-positive atmainos. CagA yra padalintas į dvi pagrindines potipių, Rytų Azijos tipą ir Vakarų tipo [7]. Skrandžio atrofija ir skrandžio vėžio rizika kategorija yra didesnė pacientams, sergantiems Rytų Azijos CagA
-positive padermių nei tie, su CagA
negative ar Vakarų CagA
-positive atmainos [8].
CagA baltymas yra perkelta iš pridedamas H. pylori
į priimančiąsias skrandžio epitelio ląsteles įvairiais bakterijų IV tipo sekrecijos aparato, ir patiria tirozino fosforilinimo ląstelių-šeimininkių [9]. Tai skatina pasklido fenotipų skrandžio epitelio ląsteles, vadinamas "kolibris fenotipą", kuris, kaip manoma, vaidina lemiamą vaidmenį CagA
-positive H. pylori
infekcijos patogenezę, galiausiai vedantis į skrandžio karcinoma. Šiame CagA-priklauso nuo morfologinės transformacijos skrandžio epitelinių ląstelių, iš SHP-2 buvimas (src homologija 2 domenas, kurių sudėtyje yra baltymas tirozino fosfatazės-2) yra labai reikšmingas [10]. SHP-2 vaidina svarbų vaidmenį ląstelėje signalizacijos pasroviui nuo augimo faktorių, hormonų skaičius ir citokinai [11, 12]. Pernešami CagA suformuoja fizinį kompleksą su SHP-2 taip skatinant jos fosfatazės aktyvumą [10]. Po Erk (Ekstraląstelinė signalo reguliuojamas kinazės) veikla taip pat prisideda prie CagA sukeltas "kolibrių fenotipo" [13]. Taigi, CagA /SHP-2 komplekso formavimas gali sukelti nenormalus platinimu, judėjimą skrandžio epitelinių ląstelių ir ląstelinių pokyčių, kurie gali įtikinamai sukelti skrandžio atrofija ir skrandžio karcinoma.
Nuo SHP-2 glaudžiai sąveikauja su CagA baltymų, tai yra natūralu spėlioti, jog funkcinio polimorfizmas į PTPN11 (baltymo tirozino fosfatazės, 11 nonreceptor tipo) pervežimas geno, koduojančio SHP-2 galiausiai gali turėti įtakos skrandžio atrofija ir transformacijos laipsnį skrandžio vėžio infekuotų asmenų. Yra 9 vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) nedideliuose alelio dažnis & gt; 0.05 PTPN11
geno japonų d HapMap, kurie visi yra įsikūręs ne kodavimo regionuose, ir dauguma jų yra absoliutus šarnyro pusiausvyros pažeidimo (LD) (D '
= 1 ir r
2 = 1) arba pilnosios jungties pusiausvyros sutrikimo (D '
= 1 ir r
2 & lt; 1) viena su kita. Penki iš 9 VNP-ai yra įrodyta, kad būti visiškai LD ir 3 iš jų yra įrodyta, kad absoliučia LD arba beveik absoliutaus LD (D '
= 1 ir R
2 & gt; 0,9) baltaodžiams kaip parodyta 1 paveiksle, remiantis HapMap tinklalapio http:. //www hapmap org.. Mūsų nesena ataskaita parodė, kad vienas PTPN11 G /A
SNP ne introno 3 (rs2301756) buvo visiškai LD į kitą PTPN11 G /A
SNP ne intronas 10 (rs12229892) [14]. Šiame tyrime, G /A
SNP ne intronas 3 (rs2301756), vienas iš 3 VNP-ai absoliutaus LD buvo pasirinktas kaip šių susijusių VNP-ai atstovas. 1 pav Ryšys pusiausvyros sutrikimo (LD) tarp 9 vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) su nedideliu alelio dažnis & gt; 0,05 per PTPN11 genų regione tarp baltaodžių (CEU: Jutos gyventojai su protėvių iš Šiaurės ir Vakarų Europoje). LD žemėlapiai rodomi dviem parametrais, R pervežimas 2 ir D
"už baltaodžių (CEU: Jutos gyventojams protėvius iš Šiaurės ir Vakarų Europoje). SNP numeriai LD žemėlapius atitinka aprašytus viršutiniame dešiniajame žemėlapius RS skaičių
H. pylori
susijusios skrandžio vėžiu, procesas, kuris liga turi tris veiksmus.; H. pylori
infekcija, skrandžio atrofijos vystymąsi ir kancerogenezės. Kiekviename žingsnyje, genetinių bruožų ir jų sąveika su gyvenimo būdo, gali įtakoti procesą [15]. Dėl genetinių bruožų, didelių asociacijų interleukino
(IL
) -1b
, C-31T ir C-511T Polimorfizmas [16, 17], naviko nekrozės faktoriaus (TNF) -α
, C-857T ir T-1031C polimorfizmas [18], o NAD (P) H dehidrogenazės, chinono 1 (NQO1)
C609T polimorfizmas [19] su H. pylori infekcija
ir asociacijos G /A
polimorfizmas ne intronas 2 Grb2 susijęs rišiklis 1
(gab1
) [20], interleukino
(IL pervežimas) 2, T-330G, ir IL-13
C-1111T [21 ] su skrandžio atrofija buvo pranešta apie iki šiol. Kintamojo numeris tandemas kartojasi (VNTR) polimorfizmas apie mucino 1 (MUC1)
taip pat buvo įrodyta, kad įtakos H. pylori
infekcija [22, 23]. Nors yra keletas studijų, įrodančių Polimorfizmais reikšmingai susijęs su skrandžio vėžio riziką, tik keli tyrimai vertinami už žingsnio nuo skrandžio atrofijos skrandžio vėžio [15] riziką.
Mūsų ankstesnių tyrimų tarp Japonijos ir Japonijos brazilai , AA
genotipas introno 3 buvo įrodyta, kad sumažinti skrandžio atrofijos vystymuisi [24, 25] riziką. Neseniai buvo nustatyta kito PTPN11
SNP (rs11066322 at intronas 10 visiškai šarnyro pusiausvyros pažeidimo, kad rs2301756) turi būti reikšmingai susijęs su apoB lygių britų gyventojų [26] serumo, remti hipotezę, kad tai PTPN11
polimorfizmas yra funkcinis , Šis tyrimas skirtas patvirtinti anksčiau praneštą asociaciją tarp PTPN11
polimorfizmo (rs2301756) ir skrandžio atrofijos matuojamas serumo pepsinogens daugelyje Japonijos dalykų, taip pat išnagrinėti asociacijos skrandžio vėžio riziką.
Būdai
Dalykai
tiriamieji dalyviai HERPACC (ligoninė įsikūrusi epidemiologinių tyrimų programa Aichi vėžio centras) tyrimas, kuriame pirmasis apsilankymas ambulatoriškai buvo iš eilės kviečiami teikti gyvenimo būdo duomenis ir kraujo mėginį gavus informuoto sutikimo [27]. Tarp dalyvių, kurie lankėsi Aichi vėžio centro ligoninė nuo 2001 - 2005, 583 atvejų diagnozuota skrandžio vėžio ir amžiumi ir seksas dažnio atitikimo 1,638 vėžio nemokama ambulatoriškai buvo atrinktas kaip kontroline grupe, tarp kurių du ambulatoriškai buvo įtraukti, kadangi jie negalėjo genotipas, paliekant 583 atvejus ir 1,636 kontrolę, tinkamų analizės. Informuotas sutikimas buvo gautas iš visų dalykų, o tyrimas protokolas buvo patvirtintas Etikos komitetų Aichi vėžio centro ir Nagojos universiteto Graduate School of Medicine.
Pavyzdžiai ir diagnostiniai kriterijai
Jų serumo mėginiai buvo nedelsiant laikomi -20 ° C temperatūroje iki analizės. Anti-O. pylori
IgG buvo matuojamas fermentas imunologinė (PAV) rinkinys "E plokštelės" EIKEN "H. pylori
antikiinu" (EIKEN Kagaku, Tokijas, Japonija). Pagal pateiktus su šiuo rinkiniu, 10.0 vienetų arba didesnes nurodymus buvo laikomas serologinio tyrimo rezultatas teigiamas. Serumas pepsinogens (PG) buvo matuojamas chemiluminescencja imunofermentinį (CLEIA). Skrandžio gleivinės atrofija buvo suskirstyti į "nėra" (PG I & gt; 70 ng /ml arba žąsis I /PG II & gt; 3), "lengva" (PG i ≤ 70 ng /ml ir PG I /PG II ≤ 3, išskyrus "sunkių" atvejai), arba "sunkus" (PG i ≤ 30 ng /ml ir PG Aš /PG II ≤ 2). Nuo planuota serumo mėginiai skrandžio vėžio atvejų turi būti naudojami tyrimo su didesniu prioritetu, antikūnų ir GG atvejų nebuvo matuojamas.
Genotipo
DNR buvo išskirta iš leukocitų sluoksnio naudojant Qiagen DNeasy mini rinkinys ( Qiagen, Hilden, Vokietija). PTPN11
G /A polimorfizmo (rs2301756) buvo nustatytas genotipas su polimerazės grandininės reakcijos su kuriomis susiduria dvi poros pradmenis (PCR-CTPP) [28]. Pradmenys buvo F1 GGA TTA PVG GCA taa GCC AC, R1: GAA ŠMC TPI AKTAS TCT taa ATG AGC, F2: katė TTG TCT CTA AAG GAC TGT GGA ir R2: CTC TGG BTK TCT CGT ACA AGA. Amplifikacijos sąlygos buvo 10 min pirminio denatūruojant 95 ° C temperatūroje, o po 95 ° C temperatūroje, 1 min, esant 64 ° C, ir 1 min, esant 72 ° C, tada 5-min paskutinį kartą pratęsti po 72 ° 30 ciklų 1 min C. Amplifikuota DNR buvo vizualizuota 2% agarozės gelyje su etidžio bromido dažymo. Papildyta DNR buvo 201 bp G /g,
genotipo 201 bp ir 339 bp G /A
genotipo, 339 bp už A /A
genotipo ir 490 bp už bendrą grupės [24].
Statistinė analizė
proporcijomis skirtumų buvo išnagrinėti su tikslia Fišerio testo. 95% pasikliautinieji intervalai (CIS) procentinės buvo apskaičiuotos remiantis dvinarę paskirstymo. Logistinės regresijos analizė atliekama vertinant šansų santykį (AR) ir 95% NVS. Amžius buvo pakoreguotas, kaip nuolatinio kintamojo logistikos modelį. H.pylori
infekuotiems asmenims buvo apibrėžtas kaip tie su H. pylori
seropozityvumo arba skrandžio atrofijos, nes didžioji dauguma atvejų skrandžio atrofija vystosi po H. pylori
infekcijų. Už H. pylori
infekcija, skrandžio atrofijos ar skrandžio vėžio vystymosi tendencijos pagal lytį ar amžiaus kategorijose buvo lyginami naudojant χ 2 testą tendencija. Skaičiavimai atlikti naudojant Stata versija 7 (Stata Corp ", College Station, TX).
Rezultatai
Charakteristikos temos ir alelio dažnis PTPN11 polimorfizmo Viesbutis The iš ypatybėmis apibendrinti 1 lentelėje . amžiaus vidurkis ± standartinis nuokrypis buvo 58,7 ± 10,6 m (diapazonas: 25-84 Y) už kontrolę ir 58,8 ± 10,5 m (diapazonas: 27-80 Y) atvejus. Moterys buvo 26,5% kontrolinės grupės moterų ir 26,4% tais atvejais. Apie tris ketvirtadalius kontrolės buvo užsikrėtę H. pylori
, o apie trečdalis kontrolės turėjo skrandžio atrofija. Genotipas dažnis PTPN11
polimorfizmo tarp kontrolės buvo Hardy-Weinberg pusiausvyros (χ 2 = 0,047, p
= 0,828). Mes išbandėme H. pylori
infekcijos tendenciją, skrandžio atrofija arba skrandžio vėžio vystymąsi sekso ar amžiaus kategorijose, kuris atskleidė reikšmingą tendenciją aukštojo H. pylori pervežimas infekcijų dažnis vyrų (p
-Pridėtinės tendencijos & lt; 0,001) ir aukštojo amžiaus kategorijų (p
& lt; 0,001), ir aukštojo paplitimo skrandžio atrofijos aukštosiose amžiaus kategorijų (P
& lt; 0,001) .table 1 Charakteristikos dalykų ir PTPN11
rs2301756 polimorfizmas.

kontrolės n = 1636
bylose N = 583 pervežimas pervežimas H. Helicobacter pylori (-)
Helicobacter pylori (+)
GA (-)
GA (+)
N
699
442
495
583
sex
Vyras
479 (68,5%)
363 (82,1%) pervežimas 361 (72,9%) pervežimas 429 (73,6%)
Moteris
220 (31,5%) < Br> 79 (17,9%)
134 (27,1%)
154 (26,4%)
Amžius
& lt; 30
6 (0,9%)
1 (0,2%)
1 (0,2%)
2 (0,3%)
30-39
(9,6%)
67 11 (2,5%)
3 (0,6%)
31 (5,3%)
40-49
138 (19,7%)
54 (12,2%)
31 (6.3% )
64 (11,0%)
50-59 pervežimas 194 (27,8%) pervežimas 151 (34,2%) pervežimas 141 (28,5%) pervežimas 214 (36,7%)
60-69
211 (30,2%)
152 (34,4%)
221 (44,7%)
166 (28,5%)
70-
83 (11,9%)
73 (16,5%)
98 (19,8%)
106 (18,2%)
genotipo
G
/G
483 (69,1%)
293 (66,3%)
350 (70,7%)
396 (67,9%)
G
/A
198 (28,3%)
135 (30,5%)
131 (26,5%)
174 (29,9%)

/A
18 (2,6%)
14 (3,2%)
14 (2,8%)
13 (2,2%)
GA (-). ir G. (+) rodo be atrofijos ir atrofija, atitinkamai
PTPN11 polimorfizmas H. pylori
serologinis pozityvumas, skrandžio atrofija ir skrandžio vėžys
nebuvo reikšmingas ryšys tarp PTPN11 pervežimas polimorfizmas ir serologinis pozityvumas, nors A arba /A
genotipo buvo 1,19, lyginant su G /g,
genotipas (2 lentelė) .table 2 Kursai santykis (AR ) ir 95% pasikliautinieji intervalai (CIS) iš PTPN11
rs2301756 polimorfizmo H. pylori
seropozityvumo.
genotipo , alelis

N

H. pylori +
H. pylori + (%)
ORa,
95% CI

Pvalue

G
/G

1126
643
57.1
1
Reference
-
G
/A

464
266
57.3
1.02
0.81–1.28
0.865
A
/A

46
28
60.9
1.19
0.64–2.22
0.577
G
2716
1552
57,1
1
Reference -

556
322
57,9
1.03
0,85-1,25
0,387
AOR kiekvienam genotipui buvo apskaičiuojamas pagal amžių ir lytį reguliuoti logistinės regresijos modelį, ir neapdorotas arba buvo apskaičiuojamas kiekvienam alelio.
nebuvo 937 H. pylori
serologiškai teigiamos dalykai, tarp kurių 495 (52,8%) tiriamųjų atrofija. Viena vertus, buvo 45 (6,4%) pacientai su atrofija tarp 699 seronegatyvius. Į paplitimo skirtumas buvo statistiškai reikšmingas (p
& lt; 0,001)
3 lentelė rodo, genotipas pasiskirstymą pagal seropozityvumo ir atrofija.. Nebuvo jokių dalykai su A /A pervežimas genotipo tarp Seronegatyvių atrofija dalyviams. Atitinkamai koreguojama ARBA skrandžio atrofija tarp seronegatyvius nebuvo apskaičiuojamas už A /A pervežimas genotipo; genotipas paskirstymas nebuvo reikšmingai susijęs su skrandžio atrofijos iki miesto 3 × 3 Fišerio testą (p pervežimas = 0,196) .table 3 PTPN11
rs2301756 genotipas pasiskirstymas pagal H. pylori
seropozityvumo ir skrandžio klasės atrofija.
genotipas
H.pylori seroneigiami
H.pylori seropozityvūs


GA (-)
GA (+)
GA (++)
GA (-)
G. (+)
GA (++)
G
/G
447 (68,3%)
11 (64,7%)
25 (89,3%)
293 (68,4%)
223 (68,2%)
127 (75,6%)
G
/A
189 (28,9%)
6 (35,3%)
3 (10,7%)
135 (28,9%)
93 (28,4%)
38 (22,6%)

/A

18 (2,8%)
0 (0.0%)
0 (0.0%)
14 (2,7%)
11 (3,4%)
3 (1,8%)
Iš viso
654 (100%)
17 (100%)
28 (100%)
442 (100%)
327 (100%)
168 (100%)
GA (-). GA (+) ir GA (++) nerodo jokio atrofija, lengvas atrofija ir sunkus atrofija, atitinkamai
amžiumi ir seksas pakoreguotas ARBA skrandžio atrofija tarp H. pylori
serologiškai teigiamos dalykai buvo 0,82 (95% PI 0,62-1,10, p
= 0,194) už G /A
, 0,84 (95% PI 0,39-1,81, p
= 0,650) A /A
ir 0,83 (95% PI 0,62-1,09, p
= 0,182) už G /A
+ A /A
, palyginti su G /g,
genotipą. Į amžiaus grupes ir seksas pakoreguotas ARBA sunkios skrandžio atrofijos tarp H. pylori
serologiškai teigiamos dalykai buvo 0,70 (95% PI 0,47-1,04, p
= 0,079) už G /A
, 0,56 (95% PI 0,17-1,91, p
= 0,356) A /A pervežimas ir 0,68 (95% PI 0.46-1.01, p
= 0,057) už G /A pervežimas + A /A
kai kurie neturi sunkus skrandžio atrofija buvo apibrėžta kaip nuoroda (4 lentelė). Kai H. pylori
serologiškai teigiamos dalykai ir Seronegatyvūs dalykai, kurių skrandžio atrofija buvo laikomas H. pylori
infekuotų asmenų, The amžiumi ir seksas pakoreguotas ARBA sunkios skrandžio atrofijos tarp H. pylori
užkrėstų toliau buvo sumažintas; 0,62 (95% PI 0,42-0,90, p
= 0,012) už G /A
+ A /A
(4 lentelę) .table 4 genotipo dažnių PTPN11
rs2301756 polimorfizmo, šansai santykis ( AR) ir 95% pasikliautinieji intervalai (CIS) iš skrandžio atrofija H. pylori
serologiškai teigiamos dalykai (A) ir H.pylori
infekuotiems asmenims (b)
(A)









genotipą, alelio

N
visi skrandžio atrofija (%)
ORa,
95% PI
Pvalueb
Rimtas skrandžio atrofija (%)
Orb

95% PI
Pvalueb
G
/G
643
350 (54,4)
1
Nuoroda
- CR.LT 127 (19,8)
1
Reference -
G
/A
266
131 (49,2)
0,82
0,62-1,10
0,194
38 (14,3)
0,70 0,47-1,04 0,079

/A
28
14 ( 50,0)
0,84
0,39-1,81
0.650
3 (10,7)
0,56
0,17-1,91
0,356
G
/A
+
/A
294
145 (49,3)
0,83
0,62-1,09
0,182
41 (13,9)
0,68
0.46- 1.01
0,057
G
1552 (53,5)
1
831 Nuoroda
- 292 (18,8)
1
Nuoroda -

322
159 (49,4)
0,85
0.66-1.08
0.097
44 (13,7)
0,67
0,45-0,96
0,015
(b)
genotipas, alelis
N
Visi skrandžio atrofija (%)
arba
95% PI
P vertę b punktas < Br> Sunkus skrandžio atrofija (%)
arba
95% PI
P vertę b
G
/G
677
383 (56,6)
1
Nuoroda
- 151 (22,3)
1
Nuoroda
- G
/A
274
139 ( 50,7)
0,80
0,60-1,06
0,123
41 (15,0)
0,63
0,43-0,93
0,019

/A
< Br> 28
14 (50,0)
0,77
0,36-1,67
0,512
3 (10,7)
0.49
0.14-1.67
0,254
G < Br> /a
+ A
/A
302
153 (50,7)
0,80
0,60-1,05
0,106
44 (14,6) < Br> 0,62
0,42-0,90
0,012
G
1628 (55,6)
1
905 Nuoroda
- 343 (21,1)
1
Nuoroda -

330
167 (50,6)
0,82
0,64-1,05
0,102
47 (14,2 )
0,62
0.44-0.87
0,005
AOR kiekvienam genotipui buvo apskaičiuojamas pagal amžių ir lytį reguliuoti logistinės regresijos modelį, ir neapdorotas arba buvo apskaičiuojamas kiekvienam alelio.
BP
vertės mažesnis nei 0,05 rodomi kursyvu
.
2 pav vaizduoja su pepsinogen paskirstymo I /II santykis pagal PTPN11
rs2301756 genotipo tarp H. pylori
infekuotų asmenų su PG i ≤ 70 ng /ml. Pagal išvada, kad tiriamųjų, kurie pervežimas alelio buvo gerokai mažesne rizika sunkus skrandžio atrofijos, asmenų su PG I dažnis /II santykis mažesnis kaip 2 buvo mažesnis tiriamųjų su pervežimas alelio nei su G /G
genotipą. 2 paveikslas skirstiniai pepsinogen (PG) I /II santykis pagal PTPN11 rs2301756 genotipo tarp H. pylori infekuotų asmenų su PG I lygio ≤ 70 ng /ml.
Ištirti, kaip ši PTPN11 polimorfizmas
prisideda prie skrandžio Kancerogeninis tarp H. pylori
užsikrėtę dalykus, mes taip pat apskaičiavo arba skrandžio vėžiu, palyginti su H. pylori
infekuotų asmenų be skrandžio atrofijos. Amžiumi ir seksas pakoreguotas ARBA skrandžio vėžio buvo 0,97 (95% PI 0,74-1,28, p
= 0,839) už G /A
, 0,71 (95% PI 0,33-1,53, p =
0,381) A /A pervežimas ir 0,95 (95% PI 0.73-1.23, p
= 0,689) už G /A
+ A /A
, lyginant su G /g,
genotipas, kurių nė vienas buvo statistiškai reikšmingas (5 lentelė) .table 5 genotipo dažniai PTPN11
rs2301756 polimorfizmo, amžiaus lyties įtaką šansai santykis (AR) ir 95% pasikliautinieji intervalai (CIS) skrandžio vėžio palyginti su H. pylori
infekuotų asmenų be skrandžio atrofija (AG-užsikrėtę be atrofija).
genotipas
"HP užsikrėtę be atrofija n = 442

skrandžio vėžys, n = 583
ARBA
95% PI
P vertę
G
/G

293 (66,3%)
396 (67,9%)
1
Nuoroda
- G
/A
135 (30,5%) < Br> 174 (29,8%)
0,97
0,74-1,28 0,839

/A
14 (3,2%)
13 (2,2%) < Br> 0,71
0,33-1,53 0,381
G
/A
+ A
/A
149 (33,7%)
187 (32,1% )
0,95
0,73-1,23
0,689
G
721 (81,6%)
966 (82,8%)
1
Nuoroda UAB -

163 (18,4%)
200 (17,2%)
0.92
0,72-1,16
0,243
AOR kiekvienam genotipui buvo apskaičiuojamas pagal amžių ir lytį pakoreguotas logistinės regresijos modelis, ir neapdorotas arba buvo apskaičiuojamas kiekvienam alelio.
Diskusijos
Šis tyrimas parodė, kad tie, kurie uosto a
alelių iš PTPN11
rs2301756 polimorfizmo ne intronas 3 turėjo daug mažesnę riziką sunkios skrandžio atrofija. Tai pagal mūsų hipotezę, kad skrandžio atrofija plėtra po CagA
-positive H. pylori
infekcijos buvo retesnis tarp tų, su A /A pervežimas genotipo nei tarp tų, su G /g,
genotipo [24 25], nors buvo pastebėtas tik sunkus skrandžio atrofijos šiame tyrime reikšmingas ryšys. Nuo biologinių procesų infekcijos, atrofijos vystymąsi, ir Kancerogeninis skiriasi [15], šio polimorfizmo tik su atrofinį plėtros asociacija atrodė biologiškai tikėtinas.
Nors buvo ribota informacija apie galimą funkcija PTPN11
polimorfizmas, biologines savybes SHP-2 tapo vis suprantama. SHP-2 yra viena iš dviejų esamų žinduolių ne-transmembraninis (ląstelėje) baltymų tirozino fosfatazės (PTPs), kurių sudėtyje yra src homologijos 2 (SH2) domenų. Įrišimas tirozino fosforilinto CagA į SH2 domenų turėtų sukelti konformacinius pokyčius SHP-2, kad silpnina slopina sąveika tarp PTP ir N-galinių SH2 domenus, galiausiai vedantis į SHP-2 fosfatazės [10, 29, 30] aktyvavimo , G /A
Polimorfizmas introno 3 d PTPN11
yra 223 bazinių porų prieš srovę nuo 4 egzono, kuri koduoja pradinį dalį SH2 domeno C-terminalo. Nors biologinis vaidmuo šioje polimorfizmo dar clearified, The polimorfizmas gali turėti tam tikrą įtaką PTPN11
mRNR sandūrų variantų formavimas, iš kurių buvo pranešta iki šiol (SpliceMinor puslapį sukūrė genomikos & 8 formos; Bioinformatika grupė (GBG) pagal NVI: http: //www tigerteamconsult ING lt /SpliceMiner /)... LD duomenimis tarp PTPN11
VNP-ai parodyta 1 paveiksle yra tai, kad baltaodžių, ir ne tiksli informacija apie LD japoniškai yra šiuo metu. Taip pat yra keletas PTPN11
SNP kurio LD statusas liko nežinoma (SNP8 ir SNP9 1 paveiksle). Iš PTPN11
polimorfizmas ne egzono 3 (rs2301756) ir kitų PTPN11
VNP-ai dėl tarp SHP-2 ir CagA sąveikos Japonijos ir kitų tautybių reikalauja tolesnio tyrimo funkcija.
Nors G
alelio iš PTPN11
gali būti genetinių bruožų dalis plėtoti skrandžio atrofijos per signalo perdavime nuo CagA, atrodo, kad kiti genetiniai bruožai, dalyvaujančių šiame procese. CagA jungiasi kelios molekules; Grb2, kuris transduces signalą į RAS-MAPK keliu sukelia ląstelių proliferaciją, C-MET hepatocitų augimo faktoriaus (HGF) receptorių, kurie turi ląstelių proliferaciją ir judrumas vaidmenį, ZO-1, stora-sankryža baltymų ir par1 /Pažymėti kinazės, kurios turi esminį vaidmenį epitelinių ląstelių poliškumą [31-35]. Nors tyrimų neatlikta, funkciniai polimorfizmas šių molekulių gali būti taip pat kandidatai genetinių bruožų skrandžio atrofijos.
A
alelis buvo dominuojantis alelis PTPN11
polimorfizmas ne intronas 3 tarp baltaodžių (0,875 iš 120 chromosomos), bet ne tarp japonų (0,178 iš 902 chromosomos) ir kinų (0,083 48 choromosomes) [26]. Šis tyrimas parodė, kad A
alelio dažnis buvo 0,170 tarp mūsų Japonijos kontrolinės grupės tiriamųjų, panašių į ataskaitinį alelio dažnis japoniškai.
Šis tyrimas turi keletą trūkumų. Nors H. pylori
statusas kontrolinės grupės tiriamųjų buvo tiriama su serologinių tyrimų, mes ne patikrinti CagA statusą. Kaip pranešė Japonijoje, beveik 100% H. pylori
padermių turėti funkcinį CAG
patogeniškumo sala (CAG
PAI), kuris koduoja ir sukelianti CagA baltymų [36]. Ankstesnis tyrimas taip pat patvirtina, kad beveik visi išskirtų iš mūsų japonų buvo Rytų Azijos CagA
-positive atmainos [37] rodo, kad H. pylori
padermių mūsų studijų dalykų taip pat turi CagA. Kitą apribojimas yra susijęs su skrandžio atrofijos diagnozė. Tai buvo padaryta vien iš pepsinogen koncentracija serume, o ne per histologinio vertinimą, nes dauguma kontrolinės grupės tiriamųjų nebuvo atlikta virškinimo trakto endoskopija su biopsija. Tačiau pepsinogen metodas yra gerai žinomas kaip surogatinis žymeklis skrandžio atrofija [38-40]. Įteisintų kriterijus skrandžio atrofijos yra PG i ≤ 70 ng /ml ir PG I /II santykis ≤ 3.0, ir, kad yra sunkus skrandžio atrofijos yra PG i ≤ 30 ng /ml ir PG I /II santykis ≤ 2,0, abi kuris yra turėtų būti patikima, kadangi jie yra plačiai naudojami praktikoje Japonija [41, 42]. Dėl skrandžio vėžio atvejų nebuvo išnagrinėjo H. pylori
metu teigiamas ir pepsinogen lygiai, tačiau dauguma iš skrandžio vėžio atvejų atrodė H. pylori
teigiami atvejai su skrandžio atrofijos [43, 44]. Atsižvelgiant į tai, kad žarnyno tipas skrandžio vėžio, dominuojantis tipas skrandžio vėžio Japonijoje, kyla iš skrandžio atrofijos, kurią sukelia Helicobacter pylori
infekcija, ir pasklidųjų tipo skrandžio vėžio įvyksta nepriklausomai nuo skrandžio atrofijos [45], atrodo intriguojantis atlikti pogrupių analizę pagal šių dviejų histologinių tipų. Ši analizė gali atskleisti šio PTPN11 pervežimas polimorfizmo su skrandžio kancerogenezėje žingsnių daugiau aiškiai asociacija. Tačiau, mes negali atlikti šią analizę dėl to, kad iš ląstelių tyrimo duomenimis nebuvimu.

Other Languages