Полигенные оценки риска на основе данных из нескольких популяций могут улучшить прогнозы ВЗК

Используя генетические данные почти 30, 000 человек, Исследователи горы Синай построили оценки риска на основе комбинации наборов данных, представляющих различные предковые популяции, которые улучшают прогноз риска воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК), включая болезнь Крона и язвенный колит. Исследование опубликовано в Гастроэнтерология 24 декабря.

Исследователи обнаружили, что оценки полигенного риска, построенный с использованием данных ассоциации из нескольких популяций в многоэтническом биобанке BioMe на горе Синай, максимальные прогнозы IBD для каждой популяции в биобанке. BioMe - это общесистемная программа Mount Sinai, которая революционизирует диагностику и классификацию заболеваний в соответствии с молекулярным профилем пациента.

Исследование показало, что оценки риска, рассчитанные на основе интеграции данных, значительно улучшили прогнозы среди лиц с европейскими, Евреи ашкенази, и латиноамериканское происхождение в BioMe, а также европейские частные лица в Биобанке Великобритании, который содержит биологические и медицинские данные о полумиллионе человек в возрасте от 40 до 69 лет, проживающих в Великобритании. Прогностическая сила была ниже у пациентов африканского происхождения, вероятно, из-за значительно меньшего объема базовых наборов данных и значительно большего генетического разнообразия среди популяций африканского происхождения.

<цитата>

Способность точно предсказать риск генетических заболеваний у людей разных предков является важным направлением, которое может положительно повлиять на результаты лечения пациентов. поскольку ранние вмешательства и даже профилактические меры рассматриваются и разрабатываются. Эти данные подтверждают необходимость большего генетического разнообразия, включая больше данных о населении афроамериканцев, для улучшения прогнозов риска заболеваний и уменьшения неравенства в отношении здоровья для всех групп населения ».

Джуди Х. Чо, Доктор медицины, Старший автор Атуди, Декан трансляционной генетики и директор Института персонализированной медицины Чарльза Бронфмана, Медицинская школа Икана, Гора Синай

Эти полигенные оценки риска - представляют собой оценку общего риска, основанную на сумме множества индивидуальных, в основном распространены, генетические варианты - были рассчитаны с использованием данных ассоциации IBD из когорт с европейскими, Афроамериканец, и еврейское происхождение ашкенази.

Кроме того, исследователи оценили редкие варианты генов, связанных с очень ранним началом ВЗК в каждой популяции, и обнаружили, что афроамериканские носители необычных вариантов LRBA показали сниженную экспрессию обоих белков LRBA и CTLA-4. Дефицит LRBA увеличивает восприимчивость к ВЗК и приводит к снижению экспрессии CTLA-4, которые можно исправить с помощью обычно назначаемого противомалярийного препарата хлорохина. Будущие исследования лаборатории Чо будут сосредоточены на прогнозировании того, какие подгруппы пациентов могут выиграть от нацеливания на этот путь.

«Поскольку снижение экспрессии LRBA и CTLA-4 может привести к ВЗК, отрадно, что хлорохин способен частично восстанавливать экспрессию, "говорит первый автор исследования Кайл Геттлер, Кандидат наук, постдокторант кафедры генетики и геномных наук Медицинской школы Икана на горе Синай.

• Исследование определяет влияние недоедания на выживаемость пациентов после кардиохирургических операций.
• Исследование COVID-19 фазы 2/3 оценивает безопасность,