Stomach Health > mave Sundhed >  > Q and A > mave spørgsmål

Polygeniske risikoscores fra data fra flere befolkninger kan forbedre IBD-forudsigelser

Ved hjælp af genetiske data fra næsten 30, 000 mennesker, Mount Sinai -forskere har opbygget risikoscores fra en kombination af datasæt, der repræsenterer forskellige forfædres befolkninger, der forbedrer forudsigelse af risiko for inflammatoriske tarmsygdomme (IBD), herunder Crohns sygdom og ulcerøs colitis. Undersøgelsen blev offentliggjort i Gastroenterologi den 24. december.

Forskerne fandt ud af, at polygeniske risikoscorer, bygget ved hjælp af associeringsdata fra flere befolkninger i Mount Sinais multietniske BioMe Biobank, maksimerede IBD -forudsigelser for hver befolkning i biobanken. BioMe er en systemomfattende indsats på Sinai-bjerget, der revolutionerer diagnose og klassificering af sygdomme i henhold til patientens molekylære profil.

Undersøgelsen viste, at risikoscores beregnet ud fra integrering af data signifikant forbedrede forudsigelser blandt personer med europæisk, Ashkenazi jøde, og spansk herkomst i BioMe, samt europæiske personer i den britiske biobank, som indeholder biologiske og medicinske data om en halv million mennesker mellem 40 og 69 år, der bor i Storbritannien. Forudsigelseskraften var lavere for patienter med afrikansk afstamning, sandsynligvis på grund af væsentligt mindre referencedatasæt og væsentligt større genetisk mangfoldighed inden for populationer af afrikansk afstamning.

Evnen til præcist at forudsige genetisk sygdomsrisiko hos individer på tværs af forfædre er en kritisk vej, der kan have en positiv indflydelse på patientens resultater, da tidlige interventioner og endda forebyggende foranstaltninger overvejes og udvikles. Disse fund understøtter et behov for større genetisk mangfoldighed, herunder flere data om afroamerikanske befolkninger, at forbedre forudsigelser om sygdomsrisici og reducere sundhedsmæssige forskelle for alle befolkninger. "

Judy H. Cho, MD, Atudys seniorforfatter, Dekan for translationel genetik og direktør for Charles Bronfman Institute for Personalized Medicine, Icahn School of Medicine, Mount Sinai

Disse polygene risikoscores-repræsenterer et skøn over den samlede risiko baseret på summen af ​​en persons mange, mest almindelig, genetiske varianter-blev beregnet ved hjælp af IBD-associeringsdata fra kohorter med europæiske, Afro amerikaner, og Ashkenazi jødisk baggrund.

Derudover forskere vurderede sjældne varianter i gener forbundet med meget tidligt begyndende IBD inden for hver befolkning og fandt, at afroamerikanske bærere af ualmindelige LRBA-varianter viste reduceret ekspression af både proteiner LRBA og CTLA-4. LRBA-mangel øger modtagelighed for IBD og resulterer i lavere CTLA-4-ekspression, som kan vendes med det almindeligt foreskrevne malaria -lægemiddel chloroquin. Fremtidige undersøgelser fra Cho Laboratory vil fokusere på at forudsige, hvilke undersæt af patienter, der kan have gavn af at målrette denne vej.

"Siden nedsat LRBA- og CTLA-4-ekspression kan føre til IBD, det er opmuntrende, at chloroquin er i stand til delvis at genoprette udtryk, "siger undersøgelsens første forfatter Kyle Gettler, Ph.d., postdoktor ved Institut for Genetik og Genomiske Videnskaber ved Icahn School of Medicine på Mount Sinai.

Other Languages