Pontuações de risco poligênico de dados de várias populações podem melhorar as previsões de IBD

Usando dados genéticos de quase 30, 000 pessoas, Os pesquisadores do Monte Sinai construíram pontuações de risco a partir de uma combinação de conjuntos de dados que representam populações ancestrais distintas que melhoram a previsão do risco de doenças inflamatórias intestinais (DII), incluindo doença de Crohn e colite ulcerativa. O estudo foi publicado em Gastroenterologia em 24 de dezembro.

Os pesquisadores descobriram que os escores de risco poligênico, construído usando dados de associação de várias populações no biobanco multiétnico BioMe do Monte Sinai, previsões de IBD maximizadas para cada população no biobanco. BioMe é um esforço de todo o sistema no Monte Sinai que está revolucionando o diagnóstico e a classificação de doenças de acordo com o perfil molecular do paciente.

O estudo mostrou que os escores de risco calculados a partir da integração de dados melhoraram significativamente as previsões entre os indivíduos com europeus, Judeu Ashkenazi, e ascendência hispânica na BioMe, bem como indivíduos europeus no UK Biobank, que contém dados biológicos e médicos sobre meio milhão de pessoas entre 40 e 69 anos que vivem no Reino Unido. O poder preditivo foi menor para pacientes com ascendência africana, provavelmente devido a conjuntos de dados de referência substancialmente menores e diversidade genética substancialmente maior nas populações de ascendência africana.

A capacidade de prever com precisão o risco de doenças genéticas em indivíduos entre ancestrais é uma via crítica que pode afetar positivamente os resultados dos pacientes, já que intervenções precoces e até medidas preventivas estão sendo consideradas e desenvolvidas. Essas descobertas apóiam a necessidade de maior diversidade genética, incluindo mais dados sobre as populações afro-americanas, para melhorar as previsões de risco de doenças e reduzir as disparidades de saúde para todas as populações. "

Judy H. Cho, MD, Autor sênior de Atudy, Reitor de Genética Translacional e Diretor do Instituto Charles Bronfman de Medicina Personalizada, Icahn School of Medicine, Monte Sinai

Essas pontuações de risco poligênico - representando uma estimativa do risco geral com base na soma de muitos de um indivíduo, principalmente comum, variantes genéticas - foram calculadas usando dados de associação IBD de coortes com europeus, Afro-americano, e origens judaicas Ashkenazi.

Adicionalmente, pesquisadores avaliaram variantes raras em genes associados com IBD de início muito precoce em cada população e descobriram que os portadores afro-americanos de variantes incomuns de LRBA mostraram expressão reduzida de ambas as proteínas LRBA e CTLA-4. A deficiência de LRBA aumenta a suscetibilidade a IBD e resulta em menor expressão de CTLA-4, que pode ser revertida com o medicamento antimalárico comumente prescrito cloroquina. Estudos futuros do Laboratório Cho se concentrarão em prever quais subconjuntos de pacientes podem se beneficiar com o direcionamento dessa via.

"Uma vez que a expressão reduzida de LRBA e CTLA-4 pode levar a IBD, é encorajador que a cloroquina seja capaz de recuperar parcialmente a expressão, "diz o primeiro autor do estudo, Kyle Gettler, PhD, pós-doutorado no Departamento de Genética e Ciências Genômicas da Escola de Medicina Icahn no Monte Sinai.

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