PLOS NËMMEN: DBGC: Eng Datebank vu Mënscherechter Gastric Cancer

Wat VerfÜgung

der Datebank vu Mënscherechter Gastric Cancer (DBGC) ass eng ëmfaassend Datebank datt verschidde Mënsch gastric Kriibs-Zesummenstouss Ressourcen integréiert. Mënsch gastric Kriibs-Zesummenhang transcriptomics Projeten, proteomics Projeten, déi kennen, biomarkers an Drogenofhängeger-senisitive Genen aus verschiddene Quellen huet an dëser Datebank gesammelt an vereenegt. Desweideren, epidemiological Statistike vun gastric Kriibs Patienten an China an clinicopathological Informatiounen forcéiert mat gastric Kriibs Fäll goufen och an der DBGC integréiert. Mir gleewen, datt dës Datebank Fuerschung iwwert Mënsch gastric Kriibs zu ville Beräicher staark vereinfacht ginn. DBGC ass fräi sinn um http://bminfor.tongji.edu.cn/dbgc/index.do VerfÜgung

Fro: Wang C, Zhang J, Cai M, Zhu Z, Gu W, Yu Y, et al . (2015) DBGC: Eng Datebank vu Mënscherechter Gastric Cancer. PLoS NËMMEN 10 (11): e0142591. Doi: 10.1371 /journal.pone.0142591 VerfÜgung

Redakter: Arun Sreekumar, Baylor College vun der Medezin, USA VerfÜgung

Arnaque: 18. Februar 2015; Akzeptéiert: 24 Oktober 2015; Publizéiert: 13. November 2015 VerfÜgung

Copyright: © 2015 Wang et al. Dëst ass eng oppen Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der BY Creative Commons Lizenz verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt si vum original Auteur an d'Quell Kaiser VerfÜgung

Data Disponibilitéit: Data sinn availabe via Datadryad (https://datadryad.org). Den eenzegen Bäitrëtt Zuel ass: Doi:. 10,5061 /dryad.271dk VerfÜgung

Funding: Dës Aarbecht war deelweis duerch Subventioune vum National Natural Science Foundation vu China ënnerstëtzt (81172329, 31571363, 81372644, 81372645 an 8157111077), Chinesesch national High Tech plangen (2012AA02A504 an 2012AA02A203), International Coopérative Project vu Shanghai Wëssenschaft an Technologie Kommissioun (12410706400), Innovation Foundation vun respektiv Medezin vu Shanghai JIAO Tong University School of Medezin (15ZH1002 an 15ZH3001), Fong Shu Fook Tong Foundation an Gastrointestinal Carcinoma Biobank Project vu Shanghai JIAO Tong University School vun Medezin. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Als ee vun de stäerkste gemeinsam Cancers, huet gastric Kriibs der drëtter héchste lethality an véiert héchste morbidity vun all weltwäit Cancers [1]. Laut der GloboCan Statistike vun 2012, nei Fäll gastric Kriibs nummeréiert bal eng Millioun (952,000), a méi wéi 700.000 Doudesfäll goufen vun gastric Kriibs ëmmer; bal d'Halschent vun deene Patienten huet aus China (405,000 nei Fäll an 325.000 Doudesfäll) [1, 2]. Obwuel esouwuel den lethality an morbidity vun gastric Kriibs an de leschte Joeren ofgeholl hunn, de 5-Joer bleift Iwwerliewe Zënssaz relativ niddreg [3]. Dofir, wäert gastric Kriibs fir eng laang Zäit eng vun de schwieregste Erausfuerderunge fir Fuerscher an Dokteren bleiwen [4]. VerfÜgung

Wëssenschaftler weltwäit vill genomics ofgeschloss hunn, transcriptomics, proteomics, an epidemiological Ermëttlungen a Krankheete Prozesser iwwert d'pathogenesis an Therapien vun gastric Kriibs [5-10]. Dës Ënnersich generéiert hunn enorm Zommen vun Donnéeën relevant ze gastric Kriibs, an d'Vitesse vun dësen Ermëttlungen ass mat der séierer Wuesstem vun Kriibs Wëssen schnelle, ofgeholl Käschten vun Detectioun an Berechnung, an Diffusioun vun den Internet [11]. Dës Donnéeën enthalen wichteg Informatiounen fir enquêtéiert an gastric Kriibs Réischtermaschinn. Mä wéinst der limitéierter Hannergrond Wëssen vun clinicians a fundamental Fuerscher, de Potential vun dësen Daten net voll entwéckelt ginn. Nei Technologien a Fuerschung Methoden brauchen nach Entwécklung; Ee, niddereg Effizienz Daten zu Verwalte ass eng primär begrenzten Dauer vun dëser Entwécklung [12]. Wéinst der langfristeg Heefung vun dezentral Fuerschung, dës Daten an hir Formater nëmmen individuell Besoinen zefriddestellen, suivéiert Integratioun a Stan- an doraus an der Diversifikatioun, isomerization, an dissection vun Kriibs Donnéeën [13, 14]. VerfÜgung

am Moment, räich Medeziner a fundamental Studien gastric Kriibs iwwert sinn oder am Fortschrëtt geplangt. Verschiddenen Zorte vun Daten sinn an verschidden Datebank Systemer [13], ouni sharing oder Kommunikatioun gespäichert. Sou, staark soll Informatiounen bleift isoléiert, an wat sinn "Informatiounen Inselen" genannt. Op der enger Säit, méi Daten dissection der Schwieregkeet vun Donnéeën Grouwen, während op der aner Hand, hält et clinicians aus nees voll Benotzung vun de Resultater vun fundamental Fuerschung Medeziner Prozesser a Programmer ze entwéckelen a behuelt fundamental Fuerscher aus leeschtungsfäeg efficace ëmmer Etuden déi Referenz klinesch relevant Informatiounen [15]. VerfÜgung

an dëser Situatioun, op gastric Kriibs ëmfaassend Informatiounen Fotoen ass net eng einfach Aufgab, an Portiounen vun dësen Daten am Ozean vun der Internet verschwannen kann, wat hefteger wier.

Dëst Fuerschung, dee vu Ressourcen aus dem Internet a Publikatiounen aus der chinesescher Center fir Genau Grousshändler a Präventioun (CDC) an Gastric Cancer Center fir alt a Behandlung Key schafft vun Gastric Neoplasms zu Shanghai. Dës Etude systematesch verschidden Zorte vun gastric Kriibs-Zesummenstouss, integréiert dës Donnéeën Ressourcen der filtration a Stan- gesammelt, an aleng endlech déi éischt ëmfaassend Wëssen durstellen fir gastric Kriibs analyséiert. VerfÜgung

spontan a Methode VerfÜgung

Donnéeën Resources VerfÜgung

der Datebank vu Mënscherechter gastric Cancer (DBGC) de folgenden gastric Kriibs-Zesummenhang Ressourcen integréiert huet: VerfÜgung

Epidemiological Statistike vun gastric Kriibs Patienten an China aus CDC Publikatiounen VerfÜgung

Clinicopathological Informatiounen iwwer gastric Kriibs Otemschwieregkeeten der chirurgesch resection vu Patienten op Shanghai Ruijin Hospital festgestallte VerfÜgung

cuisine biologescher Daten op gastric Kriibs vum ëffentlechen online Ressourcen (dorënner gastric Kriibs-Zesummenhang kennen, biomarkers, Drogen--senisitive Genen, transcriptomics Projeten an differentially Gene ausgedréckt, an proteomics Projeten an entspriechend differentially ausgedréckt Proteinen) VerfÜgung

eege Fuerschung Daten aus der Shanghai Institut vun Digestive befënnt a Shanghai Key schafft vun Gastric Neoplasms

Data Collection entspriechend

1) Epidemiological Statistike vun gastric Kriibs Patienten an China. VerfÜgung

D'CDC enger etabléierter Kriibs Berichterstattung System fir vill Joren huet missen an huet räich epidemiological Informatiounen iwwert Kriibs Patienten an China alldeeglech. D'epidemiological Statistike vun gastric Kriibs, dorënner Fall Zuel, Doud Zuel, Heefegkeet Tarif (Brutto Tarif, Alter-seng Taux an entwéckele Taux), veruerteelt Tarif (Brutto Tarif, Alter-seng Taux an entwéckele Taux), an Heefegkeet (oder veruerteelt) Verdeelung vun Altersgrupp sech manuell aus CDC Publikatiounen ofgebaut. DBGC 1.0 couvréieren all epidemiological Statistike fir all typesch Regiounen vu China aus de Joren 2004 bis 2009, an zousätzlech Statistike ginn am installéiert Versioun agebaut ginn. VerfÜgung

2) Clinicopathological Informatiounen iwwer gastric Kriibs Otemschwieregkeeten. VerfÜgung

Clinicopathological Informatiounen war vun Shanghai Ruijin Hospital gëtt. Der Klassifikatioun an Stadium Methoden allgemeng fir gastric Kriibs Diagnos benotzt goufen Fäll benotzt gastric Kriibs bei Ruijin Hospital festgestallte forcéiert. Typesch gastric Kriibs Stoffer vun verschiddenen Etappen an Zorte sech aus engem gastric Kriibs Biobank ausgewielt, datt mer fir Joer haten. All Patient Informatiounen war anonymized an de-identifizéiert virun eiser Analyse. VerfÜgung

3) cuisine biologescher Daten op gastric Kriibs vum ëffentlechen online Ressourcen. VerfÜgung

cuisine biologescher Date goufen aus online Ressourcen ofgebaut an curated. Transcriptomics Date goufen aus der Geo Datebank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) an EBI Datebank (http://www.ebi.ac.uk/) gesammelt. Proteomics Date goufen aus der publizéiert Literatur duerch manuell Liesen a Stan- ofgebaut [16, 17]. Stattfannen Date goufen aus der dbVar Datebank gesammelt (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbvar/), OMIM Datebank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/), HGMD Datebank (http://www.hgmd.org/), a publizéiert Literatur [18, 19]. All uweist Date goufen aus publizéiert Literatur ofgebaut [20, 21]. Cargolux-Zesummenhang Genen sech aus der PharmGKB Datebank Quecksëlwer (http://www.pharmgkb.org/), CancerDR Datebank (http://crdd.osdd.net/raghava/cancerdr/) an publizéiert Literatur [22, 23]. Mir entworf detailléierte Extraktioun Standarden fir all Zort vun molekulare biologescher Donnéeën Ressource, an all Date Kollektioun Prozedur hu fir dës Standarden verfollegen fir Daten coherency suergen. Déi detailléiert Kollektioun Prozedur ass hei ënnendrënner: VerfÜgung

Transcriptomics Daten: VerfÜgung

Search der Geo Datebank folgend Schlësselwieder benotzt :( "Mo. neoplasms" [Mesh Konditioune] ODER "Mo. Kriibs" [All Fields] ) a "Homo" [porgn]. VerfÜgung

d'Resultater manuell Filter, a wielt déi fir Mënsch gastric Kriibs fir spéider Informatiounen Extraktioun wëssenschaftlech Publikatiounen. VerfÜgung

klassifizéieren d'Programmer vun Prouf Gréisst a Prouf Typ . VerfÜgung

Extrait Publikatioun Informatiounen (Titel, Publikatioun Zäit, Experimenter Typ, Otemschwieregkeeten Typ, Prouf Quantitéit, Prouf Beschreiwung, Prouf vun Experimenter, Prouf vu Kontrollen, Plattform, GSE ID, Handysnummer IDen, download Linken, a Literatur Fro manuell), an MIAME Referenz (Minimum Informatiounen Iwwer eng Microarray fonnt). VerfÜgung

Pre-Prozess raw Daten (Serie Matrixentgasung Fichieren an der Geo Datebank) Perl mat den Ënnerscheeder aus diversen Quaien eliminéiert. VerfÜgung

Extrait

proteomics Daten: VerfÜgung

Search raw Daten zu PubMed de folgenden Schlësselwieder benotzt: ( "proteomics" [Mesh Konditioune] ODER "proteomics" [ ,,,0],all Fields]) AND ( "Mo. neoplasms" [Mesh Konditioune] OR ( "Mo." [all Fields] A "neoplasms" [all Fields]) ODER "Mo. neoplasms" [all Fields] OR ( "gastric" [all Fields] aN "Kriibs" [All Fields]) oDER "gastric Kriibs" [All Fields]). VerfÜgung

Filter d'Resultater manuell, a wielt de proteomics Publikatiounen zu Mënsch fir spéider gastric Kriibs Zesummenhang Informatiounen erauszéien. VerfÜgung

dës Aarbechten als Som Literatur Benotzt an d'Referenze erëm ewechgeholl. VerfÜgung

klassifizéieren de Publikatioune vun Prouf Gréisst a Prouf Typ. VerfÜgung

manuell Aarbechten liesen a Publikatioun Informatiounen (Titel, Publikatioun Zäit ofzebauen, Prouf Quantitéit, Prouf Experimenter, Prouf Kontroll, Prouf Beschreiwung, Technologie Methode benotzt, änneren fantastesch, Quantitéit an gereegelt-FAQ, verwandelt-reegelen FAQ Quantitéit, an Lokalzäit) an entspriechend an-reegelen Proteinen a verwandelt-reegelen Proteinen (baséiert op Conclusioune vun der Auteuren)

stattfannen Daten:. VerfÜgung

Search an der OMIM, HGMD an dbVar Datenbanken de Schlësselwieder "gastric Kriibs" mat an Extrait stattfannen Informatiounen (Gentherapie, stattfannen Typ, Beschreiwung vun cDNA , Beschreiwung vun voll AA, Beschreiwung vun AA, an Lokalzäit) VerfÜgung

Search zu PubMed de folgenden Schlësselwieder benotzt:. ( "stattfannen" [Mesh Konditioune] oDER "stattfannen" [All Fields]) aND ( "Mo. neoplasms "[Mesh Konditioune] OR (" Mo. "[All Fields] A" neoplasms "[All Fields]) ODER" Mo. neoplasms "[All Fields] OR (" gastric "[All Fields] A" Kriibs "[All Fields]) oDER "gastric Kriibs" [All Fields]). VerfÜgung

d'Resultater manuell Filter, an wielt den Aarbechten am Zesummenhang mat mënschlechen gastric Kriibs fir spéider Informatiounen erauszéien. VerfÜgung

Maacht dës Aarbechten als Som Literatur an filter der Fusioun erëm. VerfÜgung

dës Aarbechten Weiderliesen an stattfannen Informatiounen manuell (Gentherapie, stattfannen Typ, Beschreiwung vun cDNA, Beschreiwung vun voll AA, Beschreiwung vun AA, an Referenz). VerfÜgung

leschen zweete Donnéeën Extrait vun de véier Quellen

uweist Daten:. VerfÜgung

Search zu PubMed de folgenden Schlësselwieder benotzt: VerfÜgung ( "biologesch lues" [Mesh Konditioune] OR ( "biologesch" [All Fields] A "lues" [All Fields]) ODER "biologesch lues" [All Fields] ODER "uweist" [All Fields]) AND ( "Mo. neoplasms" [Mesh Konditioune] OR ( "Mo." [All Fields] A " neoplasms "[All Fields]) ODER" Mo. neoplasms "[All Fields] OR (" gastric "[All Fields] A" Kriibs "[All Fields]) ODER" gastric Kriibs "[All Fields]). VerfÜgung

d'Resultater Filter manuell, an d'Pabeiere wielt Zesummenhang mat mënschlechen gastric Kriibs fir spéider Informatiounen erauszéien. VerfÜgung

dës Aarbechten als Som Literatur Huelt an d'Referenze erëm ewechgeholl. VerfÜgung

dës Aarbechten Weiderliesen an stattfannen Extrait Informatiounen manuell (uweist Numm, all Numm, Typ, Bühn, Beschreiwung, Mechanismus, Sensibilitéit, Spezifizitéit, a Referenz). VerfÜgung

klassifizéieren der biomarkers vun uweist Typ, Bühn, Spezifizitéit an Empfindlechkeet.

Cargolux-Date:. VerfÜgung

Search zu PharmGKB de Schlësselwieder "gastric Kriibs" mat an manuell EPO-sensiblen Informatiounen (Alkohol- Numm, Gentherapie Numm, Gentherapie Typ, Mechanismus, an Lokalzäit) Extrait VerfÜgung

Search zu PubMed de folgenden Schlësselwieder benotzt: "Resistenz" [All Fields] AND ( "Mo. neoplasms" [Mesh Konditioune] OR ( "Mo." [All Fields] a "neoplasms" [All Fields]) ODER "Mo. neoplasms "[All Fields] OR (" gastric "[All Fields] a" Kriibs "[All Fields]) oDER" gastric Kriibs "[All Fields]) VerfÜgung

manuell d'Resultater Filter, an wielt den Aarbechten am Zesummenhang mat Mënsch gastric Kriibs Drogenofhängeger Resistenz fir spéider Informatiounen erauszéien. VerfÜgung

Maacht dës Aarbechten als Som Literatur an filter nees de Referenzen. VerfÜgung

WikiCommons 19 Drogen allgemeng fir d'Medeziner Behandlung vun gastric Kriibs benotzt (5- fluorouridine, camptothecin, carboplatin, cisplatin, docetaxel, doxorubicin, doxorubicin hydrochloride, epirubicin, etoposide, fluorouracil, irinotecan, leucovorin, mitomycin c, oxaliplatin, paclitaxel, tamoxifen, Stad, vinblastine, an vincristine). VerfÜgung Alles "cisplatin" als e Beispill, Sich zu PubMed benotzt Schlësselwieder: VerfÜgung ( "cisplatin" [Mesh Konditioune] ODER "cisplatin" [All Fields]) a "Resistenz" [All Fields] AND ( "Mo. neoplasms" [Mesh Konditioune] OR ( " Mo. "[All Fields] A" neoplasms "[All Fields]) ODER" Mo. neoplasms "[All Fields] OR (" gastric "[All Fields] A" Kriibs "[All Fields]) ODER" gastric Kriibs "[All Fields ]). VerfÜgung

manuell d'Resultater Filter, an d'Pabeiere wielt Zesummenhang mat mënschlechen Resistenz gastric Kriibs Drogenofhängeger fir spéider Informatiounen erauszéien. VerfÜgung

dës Aarbechten als Som Literatur Huelt an d'Referenze erëm ewechgeholl.

dës Aarbechten Weiderliesen an Drogenofhängeger-senisitive Informatiounen manuell (Alkohol- Numm, Gentherapie Numm, Gentherapie Typ, Mechanismus, an Referenz).

Mir forcéiert an dëser Datebank all Genen an Drogen ze hëllefen Benotzer besser verstoen an dës Donnéeën Ressourcen benotzen. D'Genen sinn laut NCBI forcéiert (http://www.ncbi.nlm.nih.gov), HGNC (http://www.genenames.org/), Ensembl (http://feb2014.archive.ensembl.org /) an Gene Kaarte (http://www.genecards.org/). D'Drogen sinn laut DrugBank forcéiert (http://www.drugbank.ca/). VerfÜgung

Ausserdem, am TCGA Projet fonnt kennen sech och Genen am DBGC zu Annotéiert. Benotzer kënnen all kennen vun engem bestëmmte Gentherapie an der TCGA Projet fonnt fannen. Dës kennen sech duerch ICGC Filteren (https://dcc.icgc.org) baséiert op TCGA Donnéeën a vun all stattfannen an der DBGC referenzéiert. VerfÜgung

Zousätzlech, e puer gastric Kriibs-Zesummenhang fundamental Fuerschung Projeten goufen gehaal vun eiser Fuerschung Equipe. Projet beschreiwen an raw Daten ginn an der DBGC fir download a weider analyséiert gëtt. VerfÜgung

Datebank Construction VerfÜgung

D'DBGC ass eng relational Datebank mat engem MySQL Donnéeën futti. E User-frëndlech Interface konzipéiert HTML a Javascript ze organiséieren an Affichage Donnéeën Ressourcen benotzen. Der Interaktioun tëscht der Donnéeën Layer an der Web Interface war mat der Java EE Plattform ofgeschloss. VerfÜgung

Resultater an Diskussioun VerfÜgung

Datebank Beschreiwung VerfÜgung

Dëst Datebank allem vun dräi longitudinal Donnéeën Systemer besteet , epidemiological, clinicopathological a molekulare biologescher Donnéeën (Lalumi 1). D'molekulare biologescher Daten aus gastric Kriibs-Zesummenhang transcriptomics, proteomics, stattfannen, uweist an Drogen-senisitive Gentherapie Daten. Déi allgemeng Statistik vun dësen Daten an Table opgezielt sinn 1. Entspriechend der epidemiological Statistike vun gastric Kriibs Patienten an China an der clinicopathological Informatiounen forcéiert mat gastric Kriibs Fäll, all dës Donnéeën goufen aus ëffentlech Datenbanken ofgebaut, Publikatiounen a publizéiert Literatur. VerfÜgung

Datebank Schnëttplazen VerfÜgung

1) Quick Search (Lalumi 2). D'Spectateure Sich Funktioun Modul mécht d'Roll vun engem Gene oder FAQ zu gastric Kriibs Erkenntnesser méiglech via an der Navigatioun läit Schlësselwieder an der Sich Këscht Daten. D'Sich Resultat wäert Dir soen ob der Gentherapie oder FAQ differentially zu all transcriptomics Projeten oder proteomics Projeten ausgedréckt ass an ob et esou eng uweist fir gastric Kriibs oder engem Alkohol--senisitive Gentherapie identifizéiert gouf. Ausserdeem, wann der Gentherapie all stattfannen muss, datt zu gastric Kriibs Zesummenhang ass, gëtt eng detailléiert Lëscht op d'Resultater Säit ugewisen. Zum Beispill, "EGFR" als Begrëff benotzt, kann mir schléissen, datt et esou eng weider-reegelen Gentherapie zu GSE51936 an GSE27342 a wéi engem Ugrëff-reegelen Gentherapie zu GSE29630 identifizéiert huet. Déi entspriechend FAQ vun der Gentherapie EGFR war als eng weider-reegelen FAQ zu 3 proteomics Projeten (: 23161554, 24263233 oder 24722433 PubMed IDen) identifizéiert. EGFR gouf als hätt Faktor vun gastric Kriibs gemellt an ass fir Drogenofhängeger Resistenz am Zesummenhang mat irinotecan, wat ass eng allgemeng benotzt Drogenofhängeger fir d'Behandlung vun gastric Kriibs. Véier Projet'en vun EGFR zu gastric Kriibs Zesummenhang goufen gemellt (c.2361G > A, c.2402A > G, c.2573T > G, c.2588G > A). VerfÜgung

2) Kuckt an Search (Lalumi 3). D 'Navigatioun, kënne Benotzer entspriechend Artikelen klickt d'Donnéeën Ressourcen an der DBGC gëtt ze duerchsichen. Detailléiert Informatiounen wäerten drënner opgelëscht ginn. Mir hunn och e puer Sich Critèrë fir all Zort vun Donnéeën Ressource duerch déi all Daten heizou datt d'Konditiounen erfëllen etabléierten ugewisen ginn. VerfÜgung

3) Eis Datebank Ënnerscheed vun aneren online Ressourcen well vun der Abezéiung vu epidemiological Statistike vun gastric Kriibs Patienten an China. Benotzer kënnen domatter déi Geschlecht (männlech a weiblech), Gebitt (urban an ländleche), an den Alter bei Diagnos oder Doud vergläichen. Fall Zuel, Doud Zuel, Heefegkeet Tarif, a veruerteelt Taux vun engem gewielte Joer Gamme kënnt an souwuel Grafik an Dësch Format (Lalumi 4) ugewisen. VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

Gastric Kriibs ass eng Virreiderroll Kriibs weltwäit an zwee veruerteelt an morbidity. Héich Heefegkeet a veruerteelt vun gastric Kriibs sinn an asiatesch Regiounen, besonnesch an China observéiert. D'epidemiological statistesch Donnéeën vun gastric Kriibs an dëser Datebank sech virun allem aus Publikatioune vun der CDC kritt, wat fir e puer Joerzéngten zu malignant entholl Studien engagéiert gouf an huet ëmfaassend Archiver vun malignant entholl Patienten an China etabléiert. Dës Donnéeën hunn eng wichteg Roll an der Promotioun Kriibs Préventioun a Gesondheet policymaking an China huet [24-26]. der gastric Kriibs epidemiology Donnéeën an dëser Datebank duerch Fotoen, Fuerscher an clinicians kann séier d'epidemiological Trends vun gastric Kriibs an China bestëmmen. VerfÜgung

Gastric Kriibs-Zesummenhang kennen, biomarkers, Drogen--senisitive Genen, transcriptomics Projeten an entspriechend differentially ausgedréckt Genen, an proteomics Experimenter an entspriechend differentially ausgedréckt Proteinen sech manuell aus online Datebanken an publizéiert Literatur gesammelt. D'Spectateure Sich Funktioun vun der DBGC gëtt erméiglecht Fuerscher d'Roll vun engem Gene oder FAQ zu gastric Kriibs ze identifizéieren. Dës differentially ausgedréckt Genen an Proteinen enthält räich wichteg Informatiounen iwwer gastric Kriibs, a vill analytesch Studien konnt mat hinnen gehaal ginn. VerfÜgung

Eis Fuerschung Equipe ass fir vill Joren zu gastric Kriibsfuerschung engagéiert an huet Erfahrungen entholl cumuléiert epidemiological Fuerschung, gastric Kriibs clinicopathology an uweist Fuerschung, Biobank Gebai, molekulare biologescher Mechanismus Fuerschung, Bioinformatik Analyse a grouss-Skala Datebank Bau [27-30]. Fir déi Enquêtekommissioun an Analyse Handwierksgeschir dat méi bequem a praktesch fir gastric Kriibs Fuerscher sinn, gebaut mir dës Datebank. Déi aktuell Versioun ass 1.0. Well de grousse Quantitéiten vu duerch verschidden Experimenter Quaien an ënnerschiddleche Beräicher entsteet Donnéeën immens verspreet a heterogen sinn, vläicht e puer nëtzlech Informatiounen an eisem Prozess vun Donnéeën Kollektioun Goalkeeper. Mir wäerten och weiderhin dësen Daten Fotoen an der läscht Daten fir eng laang Zäit unzepassen der timeliness a Vollständegkeet vum Daten ze assuréieren. An den nächsten Versioun, waerte mer am Joar Mënsch gastric Kriibs-Zesummenhang kennen, biomarkers an Drogenofhängeger-senisitive Genen ze decken. Transcriptomics Donnéeë gëtt de Wäert vun der nächster Versioun sinn, an déi all transcriptomics Projeten Ugeschwat-analyséiert ginn differentially ausgedréckt Genen bei verschiddene fantastesch änneren Wäerter ofzebauen. Sou, konnt Benotzer fonktionnéiert ob eng bestëmmte Gentherapie differentially duerch configuring d'Prouf Typ ausgedréckt ass a änneren Wäert fantastesch. VerfÜgung

Conclusioun VerfÜgung

D'Datebank an dësem Artikel beschriwwen, de DBGC, ass eng ëmfaassend a Web -accessible Datebank vum Mënsch gastric Kriibs. Dës Datebank huet eng ganz Rei vun Donnéeën Ressourcen integréiert ze gastric Kriibs dinn a gëtt e puer einfach-ze-benotzen web-baséiert funktionell Moduler. Mir gleewen, datt de DBGC wäert eng wichteg Stäip fir gastric Kriibs clinicians, entholl fundamental Fuerschung Wëssenschaftler, Kriibs Nepgen Fuerscher, Regierung Gesondheet gemeinsam, an gastric Kriibs Patienten. VerfÜgung

• PLOS NËMMEN: Podocalyxin als Prognostic context zu Gastric Cancer
• PLOS NËMMEN: Cepheid Model fir Gastric Cancer Heefegkeet vun Koreanesch Population