PLoS ONE: Het omzetten van een Microarray handtekening in een diagnostische test: een proef van Custom 74 Gene Array om opheldering en voorspelling van de prognose van maagkanker

De abstracte

Achtergrond

Maagkanker (GC) is geassocieerd met een hoge sterfte en een ongunstige prognose in een vergevorderd stadium. Bovendien zijn er geen effectieve werkwijzen voor de diagnose van maagkanker in een vroeg stadium of voor het voorspellen van de uitkomst van de selectie van patiëntspecifieke behandelingen. Daarom is het van belang om nieuwe werkwijzen voor diagnose GC onderzocht.

Methodologie /voornaamste bevindingen

Om het gebruik ervan in een diagnostische setting te vergemakkelijken, een groep van 74 genen met diagnose en prognose werd vertaald in een aangepaste microarray met een beperkte reeks van 1.042 probes die geschikt zijn voor high throughput verwerking. In dit verslag tonen we voor de eerste keer dat de aangepaste mini-array kan worden gebruikt als een betrouwbaar diagnostisch hulpmiddel bij maagkanker. Met een AUC waarde van 0,565 (95% CI 0,305-0,825) voor een perfecte test, de gevoeligheid en specificiteit van de diagnose van de curve werd berekend 70% en 80%, respectievelijk zijn.

Conclusies /Belang

De gegevens tonen duidelijk de reproduceerbaarheid en de robuustheid van de kleine maat microarray. De array is een uitstekend hulpmiddel voor de indeling en het voorspellen van de uitkomst van de ziekte bij patiënten met maagkanker

Visum:. Yin Y, Zhuo W, Zhao Y, Chen S, Li J, Wang L, et al. (2013) Het omzetten van een Microarray handtekening in een diagnostische test: een proef van Custom 74 Gene Array om opheldering en voorspelling van de prognose van maagkanker. PLoS ONE 8 (12): e81561. doi: 10.1371 /journal.pone.0081561

Editor: Courtney G. Montgomery, Oklahoma Medical Research Foundation, de Verenigde Staten van Amerika

Ontvangen: 25 juni 2013; Aanvaard: 14 oktober 2013; Gepubliceerd: 3 december 2013

• PLoS ONE: mutatie op intronic Herhalingen van de Ataxia-Telangiectasia Gemuteerde (ATM), Gene en ATM eiwitverlies in het jeugdwerk MaagKanker met microsatelliet Instability
• PLoS ONE: RhoE Bevordert metastase bij maagkanker door middel van een mechanisme Afhankelijk van verhoogde expressie van CXCR4