Sažetak pregled
Pozadina pregled
Trenutno, to je dobro utvrđeno da je rak javlja u kronično upaljenog tkiva. Brojni NOD nalik receptori (NLRs) oblik inflammasomes, unutarstanični višeproteinskim kompleksima koji su bitni za generiranje zrele pro-upalne citokine (IL-1 i IL-18). Kao što je kronična upala sluznice želuca posljedica je Helicobacter pylori pregled infekcija, istražili smo ulogu genetičkih polimorfizama i ekspresije gena uključenih u NLR signalnog puta u H. pylori pregled, infekcija i srodne karcinom želuca (GC). pregled Materijali i metode pregled Pedeset jedan genetski polimorfizmi genotipizirane u 310 etničkog kineski (87 bez kardija GC slučajeva i 223 kontrola s funkcionalna dispepsija). Osim toga, ekspresija gena od 84 molekula uključenih u NLR signalnog puta je procijenjena u THP-1 stanice su imunizirani dva H. pylori s Rezultati CARD8 pregled -rs11672725, NLRP3 pregled -rs10754558, NLRP3 pregled -rs4612666, NLRP12 pregled -rs199475867 i NLRX1 pregled -rs10790286 pokazali značajna povezanost s GC. Na multivarijatne analize, CARD8 Zaključci Novi povezanost između polimorfizama u NLR signalnog puta ( CARD8 pregled, NLRP3 pregled, NLRP12 pregled, NLRX1 pregled i CASP1 pregled) i GC identificirani su u kineskim pojedinaca. Naši genetski polimorfizmi gena i rezultati izraz istaknuti relevantnost NLR signalnog puta u želučanom karcinogeneze i njegov bliski interakciju s NF-kB pregled Izvor:. Castaño-Rodríguez N, Kaakoush NE, Goh KL, Fock KM, Mitchell HM (2014) NOD-like receptora Signalizacija Put u Helicobacter pylori pregled, infekcija i srodnih rak želuca: case-control studija i Gene Expression analize. PLoS ONE 9 (6): e98899. doi: 10,1371 /journal.pone.0098899 pregled Urednik: David M. Ojcius, University of California Merced, Sjedinjene Američke Države Netlogu Primljeno: 2. ožujka 2014. godine Prihvaćeno: 8. svibnja 2014; Objavljeno: 5. lipanj 2014 pregled Copyright: © 2014 Castaño-Rodríguez i sur. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan financiranja. Ovo djelo je podržan u sklopu koje je rak vijeće New South Wales, Australija (Grant no.66 /04). NE. Kaakoush je podržan od strane ranog zajedništvo karijeru od Nacionalnog zdravstva i Vijeće za medicinska istraživanja u Australiji. U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled Uvod pregled ukupna incidencija raka želuca (GC) je u rasponu široko od zemlje do zemlje. Prema svjetskim statistikama raka, ukupno 952,000 novih GC slučajeva i 723,000 smrtnih slučajeva GC vezane Procjenjuje se da su se dogodili u 2012, što čini 6,8% od ukupnog broja slučajeva raka i 8,8% smrtnih slučajeva vezanih za rak ukupnih [1]. Više od 70% novih slučajeva i smrtnih slučajeva javlja se u zemljama u razvoju, čije su najviše stope pojave se prijavio u istočnoj Aziji, istočnoj Europi i Srednjoj i Južnoj Americi. [2] pregled bakterijski uzročnik Helicobacter pylori pregled je bitan uzročni faktor za GC (IARC, 1994), međutim, ranije studije ukazuju na to da osim H. pylori pregled, infekcija i prehrambenim faktorima, domaćin genetika doprinijeti GC [3]. Genetski polimorfizmi su se pojavili u posljednjih nekoliko godina kao odrednice podložnost bolesti i težini, što je osobito istinito u probavnom malignosti [4]. Dakle, polimorfizmi unutar gena koji sudjeluju u urođenog i stečenog imuniteta može igrati važnu ulogu u patogenezi H. pylori klice linije kodiran receptore poznate kao receptore obrazaca za priznavanje (PRRS), dio su urođeni imuni sustav i središnji za otkrivanje invarijantnim mikrobnih motivima poznatog kao uzročnika -associated molekularnih uzoraka (PAMPs). PRRS su podijeljeni u pet različitih genetičkih i funkcionalnih clades: nukleotid-vezujući oligomerizacije domenu (NOD) -kao receptora (NLRs), Toll-like receptora, C-tip lektin receptora, retinska kiselina gen inducibilni (Rig) -l-like receptora i odsutna u melanomu 2 (AIM2) -kao receptori [5] [6]. pregled obitelj NLR ne samo prepoznati PAMPs nego oštećenja povezanih molekularni uzoraka (prigušuje) u citoplazmi, koji su endogeni ligandi proizvedene nakon ozljede tkiva ili stanične smrti [7]. NLRs karakteristična struktura uključuje središnji nukleotida koji vežu i oligomerizacijom (Nacht) domenu koja je prisutna u svim članovima obitelji NLR, a C-terminalni leucin bogate ponavlja (LRRs) i N-terminalna kaspaze zapošljavanje (kartica) ili pyrin (PYD ) domena. Na temelju filogenetskom analize Nacht domene, utvrđeno je da je obitelj NLR sastoji se od tri potporodice: 1) NOD obitelj koja uključuje NOD1-2, NOD 3 /NLRC3, NOD4 /NLRC5, NOD5 /NLRX1 i CIITA, 2) da su NLRPs uključujući NLRP1-14 (također poznat kao NALPs), i 3) IPAF podporodica koji se sastoji od IPAF (NLRC4) i NAIP [7]. NLRP3 inflammasome, najviše u potpunosti karakterizira inflammasome, sastoji se od NLRP3 skela proteina, apoptoza povezana mrlja nalik proteina (ASC) i kaspaze-1. NLRP3 interakciju i zapošljava ASC adapter preko PYD-PYD interakcije [8]. Ova interakcija dovodi do regrutiranja caspase-1, unutarstanični aspartat specifičan cistein proteaze, koji bi doveli do sazrijevanja i otpuštanje proupalnih citokina, kao što su IL-1 i IL-18. Pregled H. pylori pregled, infekcije, prve četiri fizikalno-kemijske barijere sluz sloj, želučanih epitelnim stanicama, TLRs i NLRs. Ograničen broj studija procjenjuje interakcija između NLR signalnog puta i H. pylori Dakle, prethodne studije jasno pokazuju da je, u odgovoru na H. pylori pregled, inflammasome ovisan kaspaze-1 aktivacija je kritična za stvaranje zrelih pro-upalnih citokina koji su od ključne važnosti za Th1 odgovora povezanih sa želučanom imunopatologiju. S obzirom da se malo zna o ulozi inflammasomes i drugih molekula koje sudjeluju u NLR signalni put, kao odgovor na H. pylori materijali i postupci genotipizacija polimorfizama koji su uključeni u receptoru Signalizacija stazu pregled etiku izjave NOD-sl. pregled Ovo je ispitivanje odobrena od strane odbora za ljudska etiku (HREC) Sveučilišta New South Wales (UNSW) (HREC 08115 i HREC 02.144). Pismeni informirani pristanak dobiven je od svakog pojedinca regrutiraju se u studiji. Pregled Ispitanici. Pregled Ispitanici su etničke kineski pojedinci koji su bili podvrgnuti gornjeg gastrointestinalnog endoskopiju pri Općoj bolnici Changi (Singapur) i Sveučilišne bolnice Malezije (Kuala Lumpur), u razdoblju od siječnja 2004. do travnja 2007. Pacijenti se zna da su zaraženi virusom ili koji humane imunodeficijencije nije propisano nesteroidni protuupalni lijekovi, antimikrobna sredstva ili kiseline suppressants u razdoblju od dva mjeseca prije zapošljavanja bili isključeni. pregled Osamdeset sedam pacijenata novo s primarnim bez cardia GC (Međunarodnoj klasifikaciji bolesti, 9 th revizije, broj 151) na temelju histološke potvrde su pozvani da sudjeluju u dijagnozom studija. Kontrolna skupina sastavljena 223 pojedinaca s funkcionalne dispepsije (FD), dijagnoza koja se definira kao trajna ili povratna simptome (bol ili nelagoda sa središtem u gornjem dijelu trbuha) u odsutnosti organske bolesti (uključujući endoskopskog), u skladu s Rimskim II klasifikacijski sustav [14]. pregled Helicobacter pylori pregled otkrivanje. pregled H. pylori pregled IgG antitijela u tim kineskim pojedinaca određene su pomoću in-house enzim-linked imunosorpcijske analize [15] i imunoblot (MPD Helicobacter izbrisat 2.1, MP Biomedicals, Australija). pregled polimorfizmi izbor. Elektronske baze podataka (PubMed, Scopus, Science Direct, Ovidije, BIOSIS Pregledi, Scirus baze podataka, CINAHL, IMBIOMED, Scielo i ljiljane) su tražili do veljače 2013. za polimorfizama koji su uključeni u NLR signalnog puta koji su povezani s rakom, zarazne bolesti ili su funkcionalno relevantne. Pedeset i jedan polimorfizmi u 6 gena, koji su prijavili da imaju manju učestalost alela >. 1% u Nacionalnom centru za biotehnološke informacije (NCBI) dbSNP, odabrani su za analizu (Tablica S1 u tablicama S1) pregled genotipizacija tehnike. pregled genotip 51 odabranih polimorfizama u NLR signalnog puta svakog pojedinca uključena u studiju, genomska DNA je ekstrahirana iz uzoraka periferne pune krvi pomoću QIAamp DNA Blood Mini kita kako je opisano od proizvođača (Qiagen; Chadstone, Australija). DNA se rehidriraju u sterilnoj vodi, te normalizirana na 10 ng /ul prilagođeni SNP genotipa primjenom matriksa uz pomoć laserske desorpcije ionizacija time-of-Flight (MALDI-TOF) masenom spektrometrijom, Sequenom MassARRAY iPLEX? Pokus (San Diego, CA , SAD) [16], [17] na Australian Genome Research Facility doo, St. Lucia, Sveučilište u Queenslandu, Australija. pregled Jedan polimorfizam koji nisu mogli biti uključeni u Sequenom MassARRAY iPLEX testu, poznat kao NLRP3- pregled 42 bp-VNTR, bio genotipiziran kroz standardne PCR. Primeri su dizajnirani s Oligo Primer Analiza Software verziju 6.71 (Molecular Biology Insights, Inc; Colorado Springs, SAD). Pokusi su provedeni primjenom 2720 Thermal Cycleru (Applied Biosystems, Foster City, USA). PCR produkti su podvrgnuti 1.5% agaroza gel elektroforezom i promatrana UV transilumintoru pomoću gel Doc 2000 System (Bio-Rad, Hercules, USA). Sekvencijama i toplinskih prilika za biciklizam za genotip ovog polimorfizma su opisane u tablici S2 u u tablicama S1. Pregled Četiri polimorfizmi ( CARD8 Statistička analiza. pregled pojedinačna Studentov t pregled -test se koristiti za analizu kliničkih karakteristika. Metoda izravan rezultat je bio korišten za procjenu genotipa i učestalosti alela. Odstupanje od Hardy-Weinberg ravnoteže (HWE) ispitan je pomoću hi-kvadrat goodness-of-fit test (χ 2). Određivanje spojnici neravnoteže (LD) temelji se na testu omjera vjerojatnosti u kojoj se nalazi značaj promatranog omjera vjerojatnosti izračunavanjem nultu distribuciju tog omjera pod hipotezom povezivanja ravnoteže, koristeći postupak permutacija [18]. Haplotip zaključak je izveden pomoću očekivanju-maksimiziranja (EM) algoritam za multi-locus genotipske podataka [19]. U omjeri vjerojatnosti (OR) i intervali 95% pouzdanosti (CI) izračunati su pomoću Fisher testu egzaktne vjerojatnosti (dvosmjerni p pregled -values). Kako bi se ispravila za čimbenike, binarna logistička regresija (LR) podesiti H. pylori pregled statusa i spola je provedena. P pregled -values < 0,05 smatrane su statistički značajne. Kvaliteta filteri za isključenje polimorfizama iz statističke analize uključene poziv stope ispod 95%, a odstupanje od HWE. Podaci su analizirani pomoću programa Arlequin verzija 3.1 [20], GraphPad Prism verzija 5.02 (GraphPad Software Inc, San Diego, SAD) i SPSS verzija 19.0.0. (SPSS Inc., Chicago, USA) pregled Gene Expression of molekule uključene u receptoru Signalizacija stazu pregled Kultura stanice sisavca NOD-kao pregled humane leukemije stanične linije THP-1 (broj: TIB-202). (American Type Culture prikupljanje, Manassas, USA) bio je uzgojene u RPMI 1640 mediju uz dodatak 10% toplinski inaktiviranog fetalnog goveđeg seruma (FBS) (Invitrogen, Mulgrave, Australija), 1 mM natrijevog piruvata (Invitrogen), 2500 mg /l natrijevog bikarbonata (Invitrogen ) i 100 ug /mL otopine penicilin-streptomicina (Invitrogen). Stanice su održavane u 25 cm 2 kulture u posudama tkiva (Greiner Bio--Na, Frickenhausen, Germany).. Pri 37 ° C s 5% CO 2 pregled bakterijske kulture pregled H pylori pregled soj GC026 ( CagA pregled +, kavezu pregled +, cagL pregled +, cagT pregled + Vaca pregled s1 m1 +, Baba pregled +, oipA pregled +, dupa pregled + i Saba pregled +) izolirana je iz GC pacijent u Klinici Malezije, Kuala Lumpur [21], [22]. H. pylori pregled soj 26695 ( CagA pregled + i Vaca pregled s1m1 +) izolirana je iz pacijenta s gastritisom [23] (ATCC šifra 700392). Oba H. pylori pregled sojevi su rasle za dva dana na agar konj krvi ploče (krvni agar baze No.2 s dodatkom 6% sterilna defibriniziranom konja u krvi (Oxoid, Heidelberg West, Vic., Australija) na 37 ° C u anaerobnim posudu koja je sadržavala proizvodna plin komplet (oksoid) osigurati microaerobic atmosferu od 6% o 2, 10% CO 2 i 84% N 2. pregled Infekcija test. pregled THP-1 stanice su posađene na ploči kulture sa 6 jažica pri koncentraciji od 5 x 10 5 stanica /ml, a zatim diferenciran u makrofagima forbol myrastate acetata (Sigma-Aldrich) tijekom 72 sata [24]. prije bakterijske infekcije, stanice sisavaca su inkubirane na antibiotike bez medija. h. pylori pregled sojeva GC026 i 26.695 se potom doda u medij pri multiplicitetu infekcije 1 i inkubiraju 6 sati na 37 ° C ° C i 5% CO 2, dodan bakterijska koncentracija je određena na temelju standardne krivulje i optičke gustoće (oD) očitanja pri 595 nm pomoću bio-Rad čitačem mikroploča modela 550 (bio-Rad). Stvarna koncentracija dodane potvrđena brojanjem jedinica koloniziranja (cfu) uzgajane na pločama agara koje konja u krvi nakon serijskog razrjeđenja bakterijske suspenzije. Nakon infekcije, ne izazvan i H. pylori pregled -challenged THP-1 stanice su korištene za izolaciju mRNA pomoću minikompleta Qiagen RNeasy kao što je opisano od proizvođača (Qiagen). Za analizu ekspresije gena od 84 molekula uključenih u NLR signalnim putovima, cDNA sintetiziran je iz 0,8 ug ukupne RNA pomoću RT 2 First Strand cDNA Kit (Qiagen), a nakon toga dodatno analizirani koristeći ljudski Inflammasome RT 2 Profiler PCR array (PAH-097R) (Qiagen) prema preporuci proizvođača. Gene Expression profili dobiveni su iz tri nezavisna pokusa H. pylori pregled GC026-om, H. pylori Za analizu ekspresije gena podataka, metoda ΔΔ Ct-based relativne kvantifikacije je implementiran pomoću web-based RT 2 Profiler PCR Array Analiza podataka verzija 3.5 (http://pcrdataanalysis.sabiosciences.com/pcr/arrayanalysis.php). Najmanje dva dvostruka promjene (≥2, ≤0.5) i P pregled -values. ≪ 0,05 smatrane su statistički značajno pregled SDS-PAGE i Western blot-pregled THP -1 stanice su nasađene, diferencirane i zaraze na moi od 1, kao što je prethodno opisano. Proteini se ekstrahiraju pomoću RIPA puferom, odvojena na 12% natrij dodecil sulfata poliakrilamidne gel elektroforeze gelovi, i prebaci u metanol tretirane polyvinylidine difluorid membranu pomoću sustava za prijenos stanica Trans-blot (Bio-Rad). Membrane su imunološki sa zečjim anti-human poliklonskih protutijela protiv NLRX1 (1:200) ili mišja anti-humana monoklonalna antitijela protiv beta-aktin (1:1000) (Santa Cruz). Kozji anti-zečji i anti-mišji IgG protutijela vezane na HRP (1:2000, Bio-Rad) su korišteni kao sekundarna antitijela, respektivno. Membrane su ispitane u skladu s Pierce ECL Western blot-podloge protokola (Thermo Scientific, Scoresby, Australija). Pregled Rezultati kliničke osobitosti Klinički karakteristike ispitanika uključujući spol, H. pylori pregled statusa infekcije i srednja dob prikazani su u tablici S3 u tablicama S1. Muški spol je utvrđeno da je izraženiji u GC bolesnika nego u FD kontrole, pokazuju pozitivnu korelaciju s razvojem GC u ovoj etničkoj kineskog stanovništva (ILI: 2,15, 95% CI: 1.29-3.58, P polimorfizama gena uključenih u NOD-like receptora signalno put su povezane s rakom želuca u etničkim kineski pojedinaca pedeset i jedna polimorfizama gena uključenih u NLR signalnog puta bili genotipiziran u 310 etničkih kineskih pojedinaca (87 GC slučajeva i 223 FD kontrola). Stopa poziv svim odabranim polimorfizama je 97-100% u ovoj studiji. Svi polimorfizmi u NLR signalnog puta su otkrili da se u HWE u kontrolnoj skupini koja pokazuje beznačajna χ 2 vrijednosti, osim za CARD8 pregled -rs12984929 (χ 2: 35.98), CARD8- pregled rs4802445 (χ 2: 5,87) i CARD8- pregled rs6509368 (χ 2: 5,43). Dvadeset jedan polimorfizmi u NLRP3 alel i frekvencije genotipova kao i OR 'i 95% CI za preostalih 27 polimorfizama prikazani su u tablici 1 i tablici S4 u tablicama S1. CARD8 pregled -rs11672725 TT genotip pokazao snažnu povezanost s GC u bivarijantnih statistička analiza (ili: CI 4.80, 95%: 1.39-16.58). Osim CARD8 analiza haplotipova polaze snažan pristup secirati arhitekturu složenih bolesti. U trenutnoj studiji, EM algoritam prepoznaje 25 haplotipova s frekvencijom > 0,01 u GC slučajeva (Tablica S5 u tablicama S1). Koristeći veliki haplotip u kontrolnoj skupini kao referentni haplotip, dva CARD8-NLRP12 pregled (Hap1 i Hap8), jedan NLRP3 pregled (Hap3) i tri NLRX1-CASP1 polimorfizama gena uključenih u NOD-like receptora Signalno Put su povezani s Helicobacter pylori pregled Infekcija u etničkim kineski pojedinaca s obzirom da je H. pylori pregled Poznato je da je glavni faktor rizika povezan s GC, ispitano je procijeniti povezanost genetičkih polimorfizama koji su uključeni u NLR signalnog puta i H. pylori Zajednički Učinak Helicobacter pylori pregled Infekcija i genskih polimorfizama Značajno povećava rizik od raka želuca u. Etničke kineski Pojedinci pregled Daljnje analize su izvedene za procjenu ne samo prisutnost ili odsutnost odabranih polimorfizama, ali i H. pylori Helicobacter pylori pregled utjecaja. ekspresiju nekoliko molekula koje su uključene u NOD-like receptora Signalno Pathway Netlogu za daljnju karakterizaciju učinak H. pylori Helicobacter pylori pregled Sojevi pridruženih s rakom želuca i gastritis dovesti do različitih razina ekspresije citokina i kemokina pregled s obzirom da je upala je znak želučane karcinogeneze, mi dodatno analizirati ekspresiju proupalnih citokina i kemokina nakon izlaganja dva H , pylori pregled sojeva. Izraz devet gena koji kodiraju pro-upalne citokine ( IFNB1 Helicobacter pylori pregled infekcije Rezultati u up-regulaciji NFKB1 pregled uz simultani označena dolje regulacijom NLRP12 pregled i NLRX1 Trinaest geni koji kodiraju NLRs ispitana su u ovoj studiji, uključujući članove IPAF podvrstu (NAIP, NLRC4), NLRPs (NLRP1, NLRP3-6, NLRP9, NLRP12) i NOD (NOD2, NLRC5, NLRX1 i CIITA) (Slika 1B). Izraz pet gena koji kodiraju NLRs značajno je regulirana u H. pylori izazvan stanica (NLRC4, NLRC5, NLRP9, NLRP12 i NLRX1) (Tablica 5). Od tih, NLRP12 (fold propis: 0.03, p-vrijednost: 0.016298) i NLRX1 (fold propis: 0,02, p-vrijednost: 0.01762) su izrazito dolje regulirana u H. pylori GC026-izazvan stanica. Kao tehnika valjanosti daljnje Western blot testovi istražuju izraz NLRX1, provedeni su. Dosljedno, smanjena razina NLRX1 pronađeni su u THP-1 stanica izazvan s obje H. pylori GC026 i 26695 (pratećeg informacijskog Slika S3). Pregled S obzirom da je NF-kB negativno regulirana je NLRP12 i NLRX1, mi i dalje u odnosu izraz NFKB1 pregled i relativnog pregled između H. pylori pregled GC026- i 26.695 izazvan stanice. Zanimljivo je da, iako je relativnog pregled pokazao smanjena razina u THP-1 stanicama koje su izložene i H. pylori pregled sojeva (fold propis: 0,49, p pregled-vrijednost: 0,044673 i preklopite propis: 0.26, p pregled-vrijednost. 0,131017 za H pylori pregled GC026 i 26.695, respektivno), statistički značajno up-regulacija NFKB1 pregled zabilježeno je samo u H. pylori pregled GC026 izazvan stanice (fold propis: 2.50, p pregled-vrijednost: 0,006825). (Slika 1C) pregled Helicobacter pylori pregled povećava ekspresiju PTGS2 pregled i BIRC3 Ekspresija drugih molekula uključenih ne samo u NLR signalni put nego u karcinogenezi također analizirana usporedbom stanica THP-1 odgovora na oba H. pylori pregled sojeva. Zanimljivo, PTGS2 pregled bila je značajno viša u THP-1 stanicama nakon izlaganja i H. pylori pregled, sojevi, H. pylori pregled GC026 izazvan stanice (fold propis: 54.03, p pregled-vrijednost: 0,0247) pokazuje znatno višu razinu ekspresije u odnosu na H. pylori Rasprava pregled GC sada smatra multifaktorijalni proces, u kojem su bakterijske, zaštite okoliša i domaćin genetika faktori koji su uključeni u različitim fazama u patofiziologiji raka. Trenutno, dobro je utvrđeno da rak se javlja u kronično upaljenog tkiva, a to je posebno značajna u gastrointestinalnom traktu, [4]. Kao kronične upale sluznice želuca posljedica je H. pylori Prema našim saznanjima, ovo je prvi izvijestio dokaze da su polimorfizmi su uključeni u NLR signalnog puta povezana s povećanim rizikom od GC u ljudskoj populaciji. Multivarijatna statistička analiza je pokazala da je CARD8 pregled -rs11672725 TT genotip je dosljedan faktor rizika za GC u kineskim pojedinaca. CARD8 pregled, koji se nalazi na 19q13 kodira protein kaspaze zapošljavanje domene 8 (CARD8), također poznat kao Tucan, koji je prijavljen za interakciju s NLRP3, potisnuti NF-kB aktiviranjem signala i biti izraženo u ljudskim tkivima oboljelih od raka uključujući karcinom jajnika, pluća i dojke tkiva [25] - [27]. Do danas, samo jednom istraživanju, koje je provedeno u njemačkom stanovništvu, ocijenila ulogu ovog polimorfizma u bolest [28]. Ovi autori obratio povezanost CARD8 pregled -rs11672725 i rak debelog crijeva, ali nisu pokazala značajne rezultate (ili: 1,02, 95% CI: 0,86-1,21) [28]. Razlike u vrsti raka i ispitivane populacije moglo objasniti ove kontradiktorne rezultate. Pregled H. pylori pregled Poznato je da je glavni faktor rizika za GC, mi također ispituje utjecaj genetskih polimorfizama koji su uključeni u NLR signalnog puta na
vlakovi, GC026 (GC) i 26.695 (gastritis). pregled
-rs11672725 ostao faktor rizika (OR: 4.80, 95% CI: 1.39-16.58). Nadalje, NLRP12- pregled rs2866112 povećava rizik od H. pylori
infekcije (OR 2.13, 95% CI: 1,22-3,71). Statističke analize procjene zajednički učinak H. pylori
infekcije i odabrane polimorfizmi otkrila jake asocijacije s GC ( CARD8 pregled, NLRP3 pregled, CASP1 pregled i NLRP12 pregled polimorfizam). U analizu ekspresije gena, pet gena koji kodiraju NLRs značajno su regulirana u H. pylori pregled -challenged stanice ( NLRC4 pregled, NLRC5 pregled, NLRP9 pregled, NLRP12 pregled i NLRX1 pregled). Zanimljivo, uporni up-regulacija NFKB1 pregled uz istovremeno smanjivanje regulacije NLRP12 pregled i NLRX1 pregled zabilježeno je u H. pylori pregled GC026 izazvan stanice. Nadalje, NF-kB ciljne gene koji kodiraju pro-upalnih citokina, kemokina i molekula uključenih u karcinogeneze izrazito viša u H. pylori pregled GC026 izazvan stanice. pregled
infekciju i razvoj H. pylori pregled povezani s grupom komplikacije, uključujući GC. pregled
. Na primjer, početno proučavanje od Basak sur. [9] su pokazali da ne samo da H. pylori pregled lipopolisaharida (LPS) aktivira kaspaze-1, ali da se to caspase-1 aktiviranje je uključen u LPS-inducirana IL-1β sazrijevanja. Kasnije Hitzler et al. [10] pokazalo je da H. pylori infekcija pregled aktivira kaspaze-1, što dovodi do IL-1 /IL-18 obradu i sekrecije, i u kulturi dendritičke stanice (DCS) i in vivo pregled. Dosljedno, dvije novije studije, koje koriste ljudske stanične linije želudac, potvrdila je povećana ekspresija kaspaze-1, IL-1β i IL-18 u H. pylori pregled -infected stanice [11], [12]. Nadalje, nedavna studija koju je Kim et al. [13] pokazalo je da lučenje IL-1 od strane DC zaraženih H. pylori pregled zahtijeva TLR2, NOD2 i NLRP3 inflammasome. pregled
infekcije, te da je funkcionalno relevantne polimorfizama u genima ove ruku imunološkog sustava imaju potencijal da utječu na veličinu i smjer odgovora domaćina protiv infekcija, istražili smo ulogu NLR signalnog puta, uključujući inflammasome- vezane molekule, u H. pylori
su povezane s razvojem GC procjenjujući 51 genetskih polimorfizama u kineskoj pojedinaca, poznatu populaciju s visokim rizikom za GC, a obraćajući se na ekspresiju gena od 84 molekula uključenih u NLR signalnih putova u monocitne stanične nakon izlaganja H , pylori pregled. pregled
-rs2043211, CARD8 pregled -rs6509368 CARD8 pregled -rs12984929 i NLRP3 pregled -rs10754558) genotipiziran pomoću MALDI-TOF masene spektrometrije nasumično odabrani su za potvrdu rezultata u stvarnom vremenu PCR. Sekvencijama i toplinskih prilika biciklističke navedene su u tablici S2 u Tablice S1. Kao validacije metodologije provodi za određivanje genotipa NLRP3- pregled 42 BP-VNTR, sekvenciranja Analize su provedene u 10% slučajno odabranih uzoraka studija, u Ramaciotti Centra UNSW u Australiji. Pregled
ekstrakcija RNA pripremu cDNA i PCR polja. Pregled
26.695 inficiranih i odgovarajuće nezaraženih (kontrola) uzoraka. Eksperimenti su provedeni korištenjem Rotor-Gene Q brojača (Corbett Life Sciences, Doncaster, Australija). Pregled
-vrijednost: 0,0036). H. pylori pregled infekcija je utvrđeno da je prisutna u 68,7% osoba u ovoj studiji (73/87 GC bolesnika i 140/223 FD kontrola). Usporedba prevalencije H. pylori pregled infekcije u GC bolesnika i FD kontrola pokazala da je H. pylori pregled infekcija je faktor rizika za razvoj GC (OR: 2,38, 95% CI: 1,41-3,99, P pregled-vrijednost: < 0.0001). Iako su ispitanici u ovom istraživanju su uspoređeni prema 5 godina dobne skupine, prosječna dob GC bolesnika (65,3 godina) bila je značajno viša od one FD kontrole (54.3 godina) ( P pregled-vrijednost: <. 0,0001) pregled
(n = 5), NLRP12
(n = 3), NLRX1
(n = 3), ASC Netlogu (n = 4) i CASP1 pregled (n = 6) nađeno je da su ne-polimorfni u ovom etničke kineskog stanovništva (tablica S1 u u tablicama S1).
-rs11672725, još četiri polimorfizama pokazali granične rezultate u bivarijantnih analize ( NLRP3 pregled -rs10754558, NLRP3 pregled -rs4612666, NLRP12
-rs199475867 i NLRX1 pregled -rs10790286) (Tablica 1). Daljnje multivarijatne statističke analize, podešavanje za h. pylori pregled infekcije i ženskog spola, pokazalo je da je CARD8 pregled -rs11672725 TT genotip ostao faktor rizika za GC u ovoj etničkoj kineskog stanovništva (tablica 2). pregled
(Hap21, 23 i 24) pronađeni su haplotipovi povećati rizik od GC u ovoj etničkoj kineskog stanovništva. Zanimljivo, Hap1 krije se CARD8 pregled -rs11672725 T alel i Hap21 i Hap23 luka NLRX1
-rs10790286 C alel, koji pokazuje dosljednost s rezultatima dobivenim iz alela i genotipova analize.
infekcije. Zanimljivo je da je naš etnički Kinezi case-control studija pokazala je da NLRX1 pregled -rs10790286, NLRP12 pregled -rs2866112, NLRP12 pregled -rs4419163 i ASC pregled -rs8056505 bili povezani sa značajno povećanim rizikom od H. pylori
infekcije u tih pojedinaca (tablica S6 u tablicama S1). Multivarijatna statistička analiza potvrdila je da NLRP12 pregled -rs2866112 bila povezana s povećanim rizikom od H. pylori
u kineskim pojedinaca (OR 2.13, 95% CI: 1.22-3.71) pregled
statusa u odnosu na rizik od GC, u pokušaju da se postojanje biološki interakcije u obliku sinergizma ili antagonizma. Nevjerojatno, pojedinci nose deset odabranih polimorfizama ( CARD8
-rs10405717, NLRP3 pregled -rs12079994, NLRP3 pregled -rs3806265, NLRP3 pregled -rs4612666, NLRP12 pregled -rs2866112, NLRP12 pregled -rs4419163, NLRX1 pregled -rs10790286, CASP1 pregled -rs2282659, CASP1 pregled -rs530537 i CASP1 pregled -rs61751523) i inficirane s H. pylori pregled su opazili da se najviše opasnosti od GC, većina tih ORS i kreću u rasponu 4,0-5,0 (Tablica 3.). Nasuprot tome, u nedostatku H. pylori pregled infekcija, CARD8 pregled -rs2043211 značajno smanjen rizik od GC (OR: 0,19, 95% CI: 0,06-0,63)
na molekule koje sudjeluju u NLR signalnog puta, procjenjuje izražaj 84 gena koji kodira NLRs, druge inflammasome komponente, negativni regulatori pro-upalnih citokina, pro-upalne kaspaze i molekula uključenih u nizvodnom signalizacije, u THP-1 izvedeni makrofagi nakon izlaganja na dva različita h. pylori pregled sojeva (GC026 i 26695). U H. pylori pregled GC026 izazvan THP1 stanice, 49 geni su s različitiom ekspresijom u odnosu na kontrolnu grupu (Tablica S7 u tablicama S1 i slici S1 na Slikama S1). Od tih, statistički značajna up-regulacija i down-regulacije najmanje dva puta pronađena je u 17 i 28 gena, odnosno (tablice 4 i 5). Trideset i pet geni su s različitiom ekspresijom između kontrolne skupine i skupine koja je izložena H. pylori
26695 (tablica S7 u tablicama S1 i S2 na slici u slikama S1). Od tih, statistički značajna up-regulacija i down-regulacije najmanje dva puta pronađena je u 5 i 23 gena, odnosno (tablice 4 i 5). Pregled
, IL1B
, IL12B
, IL6
, IL33
i TNF pregled) i kemokina ( CXCL1 pregled, CXCL2, CCL5 pregled) bili su znatno viša u THP-1 stanica izazvan s obje H. pylori pregled GC026 i 26695 sojeva (Tablica 4). Nadalje, intenzivan imunološki odgovor ( CXCL1 pregled, CXCL2 pregled, CCL5 pregled, IL6 pregled, IL12B pregled, TNF pregled i IFNB1 pregled) je pokrenut protiv H. pylori pregled GC026 (Slika 1A). Zanimljivo je da veliki broj gena koji kodiraju kemokina ( CCL2 pregled i CCL7 pregled) i citokina ( IL18 pregled, TNFSF11 pregled i CD40LG
) podregulirani u H. pylori pregled -challenged Stanice THP-1 (Tablica 5). pregled
26.695 izazvan stanice (fold propis: 19.56, P pregled-vrijednost: 0,016089) (Slika 1D). Nadalje, drugi gen uključen u karcinogeneze, BIRC3 pregled, isključivo regulira prema gore u H. pylori pregled GC026 izazvan stanice (fold propis: 12.28, p pregled-vrijednost: 0.001638). (Slika 1D) pregled
infekcije i ova bakterija se najprije na meti PRRS, istražili smo ulogu molekula uključenih u NLR signalnog puta u H. pylori pregled infekcija i srodne GC. pregled