absztrakt katalógusa
Háttér katalógusa
Jelenleg ez jól Megállapították, hogy a rák keletkezik a krónikusan gyulladt szövetben. Számos NOD-szerű receptorok (NLRs) formában inflammasomes, intracelluláris multiprotein komplexek kritikus generálására érett gyulladáskeltő citokinek (IL-1β és IL-18). Például a krónikus gyulladás a gyomor nyálkahártya a következménye, Helicobacter pylori Anyagok és módszerek katalógusa Ötvenegy genetikai polimorfizmusok genotipizálása 310 etnikai kínai (87 non-cardia GC esetekben és 223 kontrollok funkcionális diszpepszia). Ezen túlmenően, a gén expresszióját 84 molekulák részt vesznek a NLR jelátviteli útvonal értékelték THP-1 sejteket megtámadta két H. pylori s katalógusa vonatok, GC026 (GC) és 26695 (gastritis). katalógusa Eredmények katalógusa CARD8 katalógusa -rs11672725, NLRP3 katalógusa -rs10754558, NLRP3 katalógusa -rs4612666, NLRP12 katalógusa -rs199475867 és NLRX1 katalógusa -rs10790286 szignifikáns egyesületek GC. A többváltozós elemzés, CARD8 Következtetések katalógusa Új szövetségek közötti polimorfizmus az NLR jelátviteli útvonal ( CARD8 katalógusa, NLRP3 katalógusa, NLRP12 katalógusa, NLRX1 katalógusa, és CASP1 katalógusa) és GC azonosítottak kínai magánszemélyek. A genetikai polimorfizmusok és génexpressziós eredmények rámutatnak a jelentősége a NLR jelátviteli gyomor carcinogenesis és szoros kölcsönhatás NF-kB. Katalógusa Citation: Castaño-Rodríguez N Kaakoush NO, Goh KL, Fock KM, Mitchell HM (2014) A NOD-like receptor jeladás Út Helicobacter pylori fertőzés és a kapcsolódó katalógusa gyomorrák: Egy eset-kontroll vizsgálat és Gene Expression elemzések. PLoS ONE 9 (6): e98899. doi: 10,1371 /journal.pone.0098899 katalógusa Vágó: David M. Ojcius, University of California Merced, Amerikai Egyesült Államok katalógusa Beérkezett: március 2, 2014; Elfogadva: május 8, 2014; Megjelent: június 5, 2014 katalógusa Copyright: © 2014 Castaño-Rodríguez et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa Forrás: Ez a munka részben támogatta a The Cancer Tanács New South Wales, Australia (Grant No.66 /04). NEM. Kaakoush alátámasztja egy pályakezdő ösztöndíjat a Nemzeti Egészségügyi és Orvosi Kutatási Tanács, Ausztráliában. A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa Bevezető A teljes előfordulási gyakorisága gyomorrák (GC) széles skálán országok között. Szerint a globális rák statisztika, összesen 952.000 új GC esetekben és 723.000 GC összefüggő halálesetek Becslések szerint történt 2012-ben, a számviteli 6,8% -át a daganatos megbetegedés és 8,8% -a rákos halálesetek [1]. Több mint 70% -a új megbetegedések és halálesetek fejlődő országokban következik be, a legmagasabb előfordulási aránya jelentették, Kelet-Ázsiában, Kelet-Európában, valamint Közép- és Dél-Amerikában [2]. Katalógusa A patogén baktérium Helicobacter pylori Germ-line kódolt receptorok ismert minta-felismerő receptorok (PRRS) részét képezik a veleszületett immunrendszer, és döntő szerepet játszanak a kimutatására invariáns mikrobiális motívumok ismert kórokozó -asszociált molekuláris mintázatok (PAMP). PRR osztották öt különböző genetikai és funkcionális clade: nukleotid-kötő oligomerizációs domén (NOD) -szerű receptorok (NLRs), Toll-like receptorok, C-típusú lektin receptorok, retinsav-indukálható gén (RIG) -I-szerű receptorok és hiányzik melanoma 2 (AIM2) szerű receptorok [5] [6]. katalógusa az NLR család nemcsak felismerik kórokozó baktérium, hanem károsítja-asszociált molekuláris mintázatok (csillapítja) a citoplazmában, amelyek endogén ligandok után gyártott szöveti sérülés vagy sejthalál [7]. A NLRs jellegzetes szerkezet tartalmaz egy központi nukleotid-kötő és oligomerizációs (NACHT) dómén, amely jelen van minden NLR családtagok, egy C-terminális leucin-gazdag ismétlődés (Lrrs) és egy N-terminális kaszpáz toborzás (kártya) vagy pyrin (PYD ) domain. Alapján filogenetikai elemzés NACHT domain, megállapítottuk, hogy a New Left Review család három tagból áll alcsalád: 1) a NOD család, amely magában NOD1-2, NOD 3 /NLRC3, NOD4 /NLRC5, NOD5 /NLRX1 és CIITA, 2) a NLRPs beleértve NLRP1-14 (más néven NALPs), és 3) a IPAF alcsalád amely IPAF (NLRC4) és NAIP [7]. A NLRP3 inflammasome, a legtöbb teljesen jellemzi inflammasome áll a NLRP3 állvány fehérje, az apoptózis kapcsolódó porszem-szerű fehérje (ASC) és a kaszpáz-1. NLRP3 kölcsönhatásba és toboroz az adapter ASC keresztül PYD-PYD kölcsönhatás [8]. Ez a kölcsönhatás vezet a felvételi kaszpáz-1, intracelluláris aszpartát specifikus cisztein proteáz, amely vezetnének az érés és felszabadulását gyulladásos citokinek, mint az IL-1β és IL-18. Katalógusa H. pylori Tehát a korábbi vizsgálatok egyértelműen azt mutatják, hogy válaszul a H. pylori Anyagok és módszerek katalógusa genotipizálása polimorfizmusok Részt vesz a NOD-like receptor jeladás útvonal katalógusa Etikai nyilatkozatot. katalógusa Ez a tanulmány által jóváhagyott humán etikai bizottság (HREC), a University of New South Wales (UNSW) (HREC 08115 és 02144 HREC). Írásos beleegyezését adta minden egyes toborzott a tanulmány. Katalógusa Vizsgálati alanyok. Katalógusa Az alanyok etnikai kínai magánszemélyek átesett a felső gasztrointesztinális endoszkópia a Changi General Hospital (Szingapúr) és az Egyetemi Kórház Malajzia (Kuala Lumpur) között 2004. január 2007. április ismerten fertőzött a humán immundeficiencia vírus vagy aki felírt nem szteroid gyulladáscsökkentő szerek, antimikrobiális szerek vagy savas gátló a két hónapos határidő előtt felvételi kizárták. katalógusa Nyolcvanhét betegek újonnan diagnosztizált primer nem cardia GC (betegségek Nemzetközi osztályozása, 9 th felülvizsgálatát, kód 151) alapján szövettani megerősítés vehettek részt a a tanulmány. A kontroll csoportban 223 diagnosztizált egyének funkcionális diszpepszia (FD), amely definíció szerint állandó vagy visszatérő tünetek (fájdalom vagy kellemetlen érzés középre a has felső részében) hiányában organikus betegség (beleértve a felső endoszkópia), összhangban a Róma II osztályozási rendszer [14]. katalógusa Helicobacter pylori katalógusa felderítése. H. pylori A polimorfizmus kiválasztása. az elektronikus adatbázisok (PubMed, Scopus, Science Direct, Ovidius, Biosis Bemutatók, Scirus adatbázisok, CINAHL, IMBIOMED, Scielo és LILACS) kerestünk februárig 2013-polimorfizmusok részt vesz a New Left Review jelátviteli útvonalat, mely kapcsolatban állt a rák, fertőző betegség, vagy volt olyan, funkcionálisan releváns. Ötven egy polimorfizmusok 6 gén, amely a jelentések szerint egy minor allél frekvencia > 1% a National Center for Biotechnology Information (NCBI) dbSNP választottak elemzés (táblázat S1 táblázatokban S1). Katalógusa genotípus technikákat. genotípus a 51 kiválasztott polimorfizmusok a NLR jelátviteli útvonal minden egyes részt a vizsgálatban, genomiális DNS-t vontunk ki a perifériás teljes vérmintákból QIAamp Blood DNA Mini Kit, mint a gyártó által leírt (Qiagen; Chadstone, Ausztrália). DNS-t rehidratálásuk steril vízben és a normalizált 10 ng /ul testreszabott SNP genotipizálást alkalmazása révén a mátrix segített lézer deszorpciós ionizációs time-of-járat (MALDI-TOF) tömegspektrometria, a Sequenom MassARRAY IPLEX? Assay (San Diego, CA , USA) [16], [17] az Australian Genome Research Facility Ltd, St. Lucia, University of Queensland, Ausztrália. katalógusa Egy polimorfizmus, amely nem szerepel a Sequenom MassARRAY IPLEX vizsgálattal, az úgynevezett NLRP3- katalógusa 42 bp-VNTR volt genotipizálását keresztül standard PCR. Primereket terveztünk, oligo Primer Analysis Software verzió 6,71 (Molecular Biology Insights, Inc., Colorado Springs, USA). Kísérleteket hajtottunk végre az 2720 Thermal Cycler (Applied Biosystems; Foster City, USA). PCR-termékeket vetettük alá 1,5% -os agaróz gél elektroforézissel és láthatóvá UV átvilágítás mellett a Gel Doc 2000 rendszer (Bio-Rad; Hercules, USA). A primer szekvenciák és a termikus ciklus feltételei genotípus e polimorfizmus táblázat mutatja az S2 táblázat S1. Katalógusa Négy polimorfizmusok ( CARD8 Statisztikai elemzés. katalógusa a páratlan Student t katalógusa -teszt használták, hogy elemezzék a klinikai jellemzőit. A direkt száma módszert becsléséhez használt genotípus és allél frekvenciákat. Eltérés a Hardy-Weinberg (HWE) teszteltük a chi-négyzet jóságát fit teszt (χ 2). Meghatározása kapcsolódási egyenlőtlenség (LD) alapult valószínűségi arány vizsgálat, amely a jelentősége a megfigyelt valószínűség arányt talált számításával null eloszlása ez az arány feltételezve kapcsolat egyensúly, egy permutációs eljárással [18]. Haplotípus következtetés segítségével végeztük az elvárás-Maximization (EM) algoritmus több lókusz genotípus adatokkal [19]. Az esélyhányados (OR) és a 95% -os konfidencia intervallum (CI) útján Fisher valószínűsége teszt (kétfarkú p katalógusa -értékei). Annak érdekében, hogy korrigáljuk a zavaró tényezőket, a logisztikus regresszió (LR) beállítása az H. pylori katalógusa állapot és nemek végeztünk. P katalógusa -értékei < 0,05 tekintettük statisztikailag szignifikánsnak. Minőségi szűrők kizárása polimorfizmusok a statisztikai elemzés tartalmazza hívja árak 95% alatti, és eltérés a HWE. Az adatokat elemeztük segítségével a programok Arlequin 3.1 verzió [20], GraphPad Prism változat 5,02 (GraphPad Software Inc., San Diego, USA) és az SPSS változat 19.0.0 (SPSS Inc., Chicago, USA). emlőssejttenyészet. katalógusa a humán monocita leukémia sejtvonal THP-1 (kód: TIB-202) (American Type Culture Collection; Manassas, amerikai Egyesült Államok), tenyésztettünk RPMI 1640 tápközegben, amelyet 10% hővel inaktivált magzati borjúszérummal (FBS) (Invitrogen; Mulgrave, Ausztrália), 1 mM nátrium-piruváttal (Invitrogen), 2500 mg /l nátrium-hidrogén-karbonát (Invitrogen ) és 100 ng /ml penicillin-sztreptomicin-oldatot (Invitrogen). Sejteket tartottunk fenn 25 cm-es 2 szövettenyésztő lombikokban (Greiner Bio-On; Frickenhausen, Németország), 37 ° C-on, 5% CO 2. A H pylori katalógusa törzs GC026 ( cagA katalógusa +, ketrec katalógusa +, cagL katalógusa +, cagT katalógusa + vacA katalógusa s1 m1 +, Baba katalógusa +, oipA katalógusa +, dUPA katalógusa + és SABA katalógusa +) t izoláltunk GC beteg a University Hospital of Malaysia, Kuala Lumpur, [21] [22]. A H. pylori a THP-1 sejteket szélesztettünk 6 lyukú tenyésztő lemezen koncentrációban 5 × 10 5 sejt /ml, és ezt követően differenciálódtak makrofágok forbol myrastate acetát (Sigma-Aldrich) 72 órán [24]. előtt a bakteriális fertőzés, emlős sejteket antibiotikum-mentes táptalajon. a H. pylori után fertőzés, nem fertőzött és H. pylori A génexpressziós adatok elemzése, a ΔΔ Ct-alapú módszer a relatív mennyiségi valósult a webes alapú RT 2 Profiler PCR Array Data Analysis 3.5 verzió (http://pcrdataanalysis.sabiosciences.com/pcr/arrayanalysis.php). Legalább két-szeres változásokat (≥2, ≤0.5) és a P katalógusa -értékei < 0,05 tekintettük statisztikailag szignifikánsnak. Katalógusa SDS-PAGE és Western blot katalógusa THP -1 sejteket oltottunk, differenciált és fertőzött MOI 1, amint azt korábban leírtuk. A fehérjéket extraháljuk RIPA-pufferben, elválasztjuk, 12% -os nátrium-dodecil-szulfát poliakrilamid gél-elektroforézis gélen, és át metanol kezelt polivinilidin-membránokat használva a transz-blot sejt-transzfer rendszer (Bio-Rad). A membránokat immunolabeled nyúl anti-humán poliklonális antitestek ellen NLRX1 (1:200) vagy egér anti-humán monoklonális antitestek ellen β-aktin (1:1000) (Santa Cruz). Kecske anti-nyúl és anti-egér IgG antitestek kötődnek HRP (1:2000; Bio-Rad) alkalmaztunk másodlagos antitestekkel, ill. Membránokat vizsgáltunk összhangban Pierce ECL Western blot Alapfelület protokoll (Thermo Scientific; Scoresby, Ausztrália). Katalógusa Eredmények katalógusa klinikai jellemzők katalógusa A klinikai jellemzői a vizsgálati alanyok beleértve a nemek közötti, H. pylori fertőzés katalógusa állapot és az átlagéletkor táblázat S3 táblázat S1. Férfi nemi találták még nagyobb jelentőséggel bír GC betegekben, mint a FD ellenőrzések mutató pozitív összefüggést a fejlesztési GC ebben etnikai kínai népesség (OR: 2,15, 95% CI: 1,29-3,58, P katalógusa -érték: 0,0036). H. pylori a polimorfizmus a gének a NOD-like receptor jeladás útvonal társított gyomorrák Etnikai kínai magánszemélyek katalógusa ötvenegy polimorfizmusok résztvevő gének NLR jelátviteli útvonal genotípusú 310 etnikai kínai magánszemélyek (87 GC esetek és 223 FD ellenőrzések). A hívás aránya az összes kiválasztott polimorfizmusok volt 97-100% ebben a vizsgálatban. Minden polimorfizmus az NLR jelátviteli útvonal találták a HWE a kontrollcsoportban mutató nem szignifikáns χ 2 értékeket kivéve a CARD8 katalógusa -rs12984929 (χ 2: 35.98), CARD8- katalógusa rs4802445 (χ 2: 5,87) és a CARD8- katalógusa rs6509368 (χ 2: 5,43). Huszonegy polimorfizmusok NLRP3 katalógusa (n = 5), NLRP12 katalógusa (n = 3), NLRX1 katalógusa (n = 3), ASC katalógusa (n = 4) és a CASP1 katalógusa (n = 6) úgy találták, hogy nem polimorf ebben etnikai kínai népesség (táblázat S1 táblázatokban S1). katalógusa allél és genotípus frekvenciákat valamint legkülső régiók és a 95% -os CI a fennmaradó 27 polimorfizmusok táblázatban mutatjuk be az 1. és táblázat S4 táblázatokban S1. A CARD8 katalógusa -rs11672725 TT genotípus mutatott szoros összefüggést a GC a kétváltozós statisztikai elemzés (OR: 4,80, 95% CI: 1,39-16,58). Amellett, hogy CARD8 haplotípus-alapú elemzések egy erős megközelítés, hogy elemezzék az építészet összetett betegségek. A jelenlegi vizsgálat során, az EM algoritmus szerint 25 haplotípusok gyakorisággal > 0.01 GC esetben (táblázat S5 táblázatokban S1). A fő haplotípus a kontrollcsoportban, mint a referencia haplotípus, két CARD8-NLRP12 katalógusa (Hap1 és Hap8), egy NLRP3 katalógusa (Hap3), valamint három NLRX1-CASP1 a polimorfizmus a gének a NOD-like receptor jeladás útvonal társított Helicobacter pylori fertőzés katalógusa Etnikai kínai magánszemélyek katalógusa Mivel a H. pylori katalógusa ismert, hogy az egyik legfontosabb kockázati tényező a GC, további elemzéseket végeztünk, hogy megállapítsuk a szövetség között a genetikai polimorfizmusok részt vesz a New Left Review jelátviteli útvonal és a H. pylori fertőzés együttes hatása Helicobacter pylori fertőzés katalógusa és genetikai polimorfizmusok Jelentősen növeli a gyomorrák etnikai kínai egyének további elemzések végeztünk, hogy megállapítsuk a nem csak a jelenléte vagy hiánya a kiválasztott polimorfizmusok hanem H. pylori Helicobacter pylori katalógusa Hatások a kifejezése számos molekula vesz az NOD-like receptor jeladás útvonal katalógusa további jellemzése hatása H. pylori Tekintettel arra, hogy a gyulladás fémjelzi a gyomor carcinogenesis, mi tovább vizsgálta kifejezése gyulladáskeltő citokinek és kemokinek hatására két H . pylori törzsek katalógusa. A kifejezés a kilenc kódoló gének gyulladáskeltő citokinek ( IFNB1 katalógusa, IL1B katalógusa, IL12B katalógusa, IL6 katalógusa, IL33 katalógusa és TNF katalógusa) és kemokinek ( CXCL1 katalógusa, CXCL2, CCL5 katalógusa) szignifikánsan serkentő szabályozás THP-1 sejtek megtámadta mindkét H. pylori katalógusa GC026 és 26695 törzsek (4. táblázat). Továbbá egy intenzív immunválaszt ( CXCL1 katalógusa, CXCL2 katalógusa, CCL5 katalógusa, IL6 katalógusa, IL12B katalógusa, TNF katalógusa és IFNB1 katalógusa) ellen indult H. pylori katalógusa GC026 (1A). Érdekes, hogy számos gén kódoló kemokinek ( CCL2 katalógusa és CCL7 katalógusa) és a citokinek ( IL-18 katalógusa, Tnfsf11 mellett katalógusa és CD40LG Helicobacter pylori fertőzés katalógusa Eredmények Up-szabályozás NFKB1 katalógusa egyidejű Jelzett leszabályozza NLRP12 katalógusa és NLRX1 Matton tizenhárom kódoló gének NLRs értékelték ebben a vizsgálatban, beleértve tagjai IPAF alcsalád (NAIP, NLRC4), NLRPs (NLRP1, NLRP3-6, NLRP9, NLRP12) és NOD (NOD2, NLRC5, NLRX1 és CIITA) (1B). A kifejezés öt kódoló gének NLRs szignifikánsan szabályozták a H. pylori-megtámadta sejtek (NLRC4, NLRC5, NLRP9, NLRP12 és NLRX1) (5. táblázat). Közülük NLRP12 (szétnyitható szabályozás: 0,03, p-érték: 0,016298) és NLRX1 (szétnyitható szabályozás: 0,02, p-érték: 0,01762) volt jelentősen lefelé szabályozni H. pylori GC026 provokált sejtek. Ennek validációs technika, továbbá Western blot vizsgálatok vizsgálja NLRX1 kifejezés végeztek. Egyenletesen, csökkent NLRX1 szintet találtak THP-1 sejteket megtámadta mindkét H. pylori GC026 és 26695 (alátámasztó információk ábra S3). Tekintettel arra, hogy az NF-kB negatívan szabályozza NLRP12 és NLRX1, mi további összehasonlítva kifejezése NFKB1 katalógusa és RELA katalógusa között H. pylori katalógusa GC026- és 26695-támadott sejtek. Figyelemre méltó, hogy bár a RELA Helicobacter pylori katalógusa Növeli a kifejezése PTGS2 Expression más molekulák részt nem csak a NLR jelátviteli útvonal, hanem a karcinogenezis is elemeztük összehasonlításával THP-1-sejt-válaszokat mind H. pylori törzsek katalógusa. Érdekes, PTGS2 Vita katalógusa GC most úgy egy multifaktoriális folyamat, amelyben a bakteriális, környezeti és gazda genetikai faktorok is részt vesznek különböző szakaszaiban a rák patofiziológiájában. Jelenleg ez jól megalapozott, hogy a rák keletkezik krónikusan gyulladt szövetben, és ez különösen figyelemre méltó a gasztrointesztinális traktusban [4]. Például a krónikus gyulladás a gyomor nyálkahártya a következménye, H. pylori fertőzés és Tudomásunk szerint ez az első bejelentett bizonyíték arra, hogy polimorfizmusok részt vesz a NLR jeltovábbítási útvonalhoz társított fokozott a GC egy emberi populációban. Többváltozós statisztikai elemzés kimutatta, hogy a CARD8 H. pylori katalógusa ismert, hogy a fő kockázati tényező a GC azt is megvizsgáltuk, milyen genetikai polimorfizmusok részt vesz a New Left Review jelátviteli
fertőzés, megvizsgáltuk a szerepe a genetikai polimorfizmusok és részt vevő gének expresszióját a NLR jelátviteli H. pylori fertőzés és a kapcsolódó katalógusa gyomorrák (GC). katalógusa
-rs11672725 maradt kockázati tényező (OR: 4,80, 95% CI: 1,39-16,58). Továbbá, NLRP12- katalógusa rs2866112 fokozott a kockázata a H. pylori fertőzés
(OR: 2,13, 95% CI: 1,22-3,71). Statisztikai elemzések értékelése együttes hatása H. pylori fertőzés
és a kiválasztott polimorfizmusok kiderült, hogy erősen együtt GC ( CARD8 katalógusa, NLRP3 katalógusa, CASP1 katalógusa és NLRP12 katalógusa polimorfizmusok). Génexpressziós vizsgálatok, öt kódoló gének NLRs szignifikánsan szabályozni H. pylori katalógusa -challenged sejteket ( NLRC4 katalógusa, NLRC5 katalógusa, NLRP9 katalógusa, NLRP12 katalógusa és NLRX1 katalógusa). Érdekes, kitartó up-szabályozása NFKB1 katalógusa egyidejű leszabályozza NLRP12 katalógusa és NLRX1 katalógusa figyeltek H. pylori katalógusa GC026 provokált sejtek. Továbbá, az NF-kB cél kódoló gének pro-gyulladásos citokinek, kemokinek és a molekulák részt vesznek karcinogenezis voltak jelentősen up-szabályozott H. pylori katalógusa GC026 provokált sejtek. katalógusa
lényeges etiológiai tényezője GC (IARC, 1994), azonban a korábbi tanulmányok azt sugallják, hogy amellett, hogy H. pylori
fertőzés és az étrendi tényezőket, a befogadó genetika hozzájárulnak GC [3]. Genetikai polimorfizmusok alakultak az elmúlt években meghatározó betegségre való fogékonyság és súlyosságát, ami különösen igaz a gasztrointesztinális malignus [4]. Ezért polimorfizmusok belül részt vevő gének veleszületett és adaptív immunitás játszhatnak fontos szerepet patogenezisében H. pylori fertőzés
és fejlesztése H. pylori
val kapcsolatos szövődmények, köztük a GC.
fertőzés, az első négy fizikai-kémiai akadály a nyálkaréteg, gyomornyálkahártya-sejtek, a TLR-ek és a NLRs. A korlátozott számú tanulmányban vizsgálták a kölcsönhatás a NLR jelátviteli útvonal és a H. pylori
. Például egy kezdeti tanulmány által Basak et al. [9] azt mutatta, hogy nem csak a H. pylori
lipopoliszacharid (LPS) aktiválja a kaszpáz-1, hanem, hogy ez a kaszpáz-1 aktiváció részt vesz az LPS-indukált IL-1β érlelés. Később, Hitzler et al. [10] kimutatta, hogy H. pylori
fertőzés aktiválja a kaszpáz-1, ami az IL-1β /IL-18-feldolgozás és a szekréciót, mind a tenyésztett dendritikus sejtek (DC-k) és a in vivo katalógusa. Egyenletesen, két legújabb tanulmányok humán gyomor-sejtvonalak, megszilárdítására megnövekedett expressziója a kaszpáz-1, IL-1β és IL-18- H. pylori
-fertőzött sejtek [11], [12]. Továbbá, egy friss tanulmány szerint Kim et al. [13] azt mutatja, hogy az IL-1β által dendritikus fertőzött H. pylori katalógusa igényel TLR2, NOD2 és a NLRP3 inflammasome. katalógusa
, inflammasome-függő kaszpáz-1 aktiválás kritikus generálására érett proinflammatorikus citokinek, amelyek elengedhetetlenek a Th1-reakciókat társított gyomor immunológiai. Tekintettel arra, hogy keveset tudunk a szerepe inflammasomes és más molekulák részt vesznek a NLR jelátviteli útvonal válaszul H. pylori
fertőzés, és hogy a funkcionálisan releváns polimorfizmusok gének ez a kar az immunrendszer rendelkeznek azzal a potenciállal, hogy befolyásolja a nagyságát és irányát a gazda elleni válaszreakciót a fertőzés, megvizsgáltuk a szerepe az NLR jelátviteli út, beleértve inflammasome- rokon molekulák, a H. pylori
val kapcsolatos GC azáltal, hogy meghatározzák 51 genetikai polimorfizmusok kínai magánszemélyek, egy ismert magas kockázatú populáció GC, és foglalkozik a gén kifejeződése 84 molekulák részt NLR jelátviteli egy monocita sejtvonal hatására H . pylori katalógusa.
IgG antitestek ezekben a kínai magánszemélyek használatával határozták meg egy házon enzimkötött immunszorbens vizsgálati eljárás [15] és immunoblot (MPD Helico Blot 2.1, MP Biomedicals, Ausztrália).
-rs2043211, CARD8 katalógusa -rs6509368 CARD8 katalógusa -rs12984929 és NLRP3 katalógusa -rs10754558) genotipizált MALDI-TOF tömegspektrometria véletlenszerűen kiválasztott megerősítését az eredményeket a real-time PCR. A primer szekvenciák és a termikus ciklus feltételek táblázatban mutatjuk S2 táblázat S1. Ennek érvényesítése a módszer végre a genotipizálását NLRP3- katalógusa 42 bp-VNTR, szekvenálás analíziseket 10% véletlenszerűen kiválasztott vizsgálati mintákat, a Ramaciotti Központ UNSW, Ausztráliában. Katalógusa
Gene Expression molekulák részt vesz a NOD-like receptor jeladás útvonal katalógusa
baktériumtenyészet.
törzs 26695 ( cagA
+ és a vacA
s1m1 +) izoláltuk a beteg gyomorhurut [23] (ATCC kód 700.392). Mindkét H. pylori
törzseket két napig ló vér agar lemezeken (Blood Agar Base No.2 kiegészített 6% steril defibrinált ló vér (Oxoid, Heidelberg West, Vic., Ausztrália), 37 ° C-on tartalmazó anaerob üvegbe gázképző készlet (Oxoid), hogy egy mikroaerob atmoszférában 6% O 2, 10% CO 2 és 84% N 2.
fertőzés vizsgálatban.
törzsek GC026 és 26695-t adtunk hozzá, hogy a közeg egy fertőzési multiplicitással 1, és inkubáltuk 6 órán át 37 ° C-on és 5% CO 2. A bakteriális koncentráció hozzáadott alapján határoztuk meg egy standard görbét, és az optikai sűrűséget (OD) leolvasást 595 nm-en egy Bio-Rad mikrolemez leolvasó modell 550 (Bio-Rad). A tényleges koncentrációját adjuk, és megerősítették, hogy megszámoljuk a telepképző egységek (CFU) növesztett ló vér agar lemezekre után hígítási A baktérium-szuszpenzió.
RNS extrakció, cDNS készítmény és PCR tömbök.
-challenged THP-1-sejteket izolálására használt mRNS a Qiagen RNeasy Mini Kit által leírtak szerint a gyártó (Qiagen). Az elemzéshez a gén expresszióját 84 molekulák részt vesznek a NLR jelátviteli, cDNS-t szintetizáltunk 0,8 ug teljes RNS felhasználásával RT 2 első cDNS-szál kit (Qiagen), és tovább analizáljuk Emberi Inflammasome RT 2 Profiler PCR array (PAH-097R) (Qiagen) ajánlása szerint a gyártó. Génexpressziós profilokat kaptunk három független kísérlet során az H. pylori katalógusa GC026-fertőzött, H. pylori
26695-fertőzött és a megfelelő nem fertőzött (kontroll) minta. A kísérleteket alkalmazó Rotor-Gene Q cycler (Corbett Life Sciences, Doncaster, Ausztrália). Katalógusa
fertőzést talált, hogy jelen legyen 68,7% az egyének Ebben a vizsgálatban (73/87 GC betegek és 140/223 FD kontrollok). Összehasonlítása a prevalenciája H. pylori fertőzés katalógusa GC betegek és FD ellenőrzések azt mutatták, hogy H. pylori fertőzés katalógusa volt a kockázati tényező a fejlesztési GC (OR: 2,38, 95% CI: 1,41-3,99, P katalógusa -érték: < 0,0001). Annak ellenére, hogy ebben a vizsgálatban is egyező, 5 éves korcsoportban az átlagos életkora GC beteg (65,3 év) szignifikánsan magasabb volt, mint az FD kontrollok (54,3 év) ( P katalógusa -érték: <0,0001). katalógusa
-rs11672725, újabb négy polimorfizmus megmutatta eredmények esetében a kétváltozós elemzés ( NLRP3 katalógusa -rs10754558, NLRP3 katalógusa -rs4612666, NLRP12
-rs199475867 és NLRX1 katalógusa -rs10790286) (1. táblázat). További többváltozós statisztikai elemzések, kiszűrése H. pylori fertőzés katalógusa és a férfi nem, azt mutatta, hogy a CARD8 katalógusa -rs11672725 TT genotípus maradt rizikófaktora GC ebben etnikai kínai lakosság (2. táblázat). katalógusa
(Hap21, 23 és 24) haplotípusok találták növeli a GC ebben etnikai kínai populációban. Érdekes, Hap1 hordoz a CARD8 katalógusa -rs11672725 T allél és Hap21 és Hap23 hordozzák a NLRX1 katalógusa -rs10790286 C allél, ami azt mutatja, az összhangot a kapott eredmények allél és genotípus elemzéseket.
. Érdekes, hogy a kínai származásúak eset-kontroll vizsgálat azt mutatta, hogy NLRX1 katalógusa -rs10790286, NLRP12 katalógusa -rs2866112, NLRP12 katalógusa -rs4419163 és ASC katalógusa -rs8056505 összefüggésbe hozták a jelentősen megnövekedett kockázata H. pylori fertőzés
ezekben az egyedekben (táblázat S6 táblázatokban S1). A többváltozós statisztikai elemzés megerősítette, hogy NLRP12 katalógusa -rs2866112 járt fokozott kockázata H. pylori
a kínai magánszemélyek (OR: 2,13, 95% CI: 1,22-3,71). katalógusa
állapot kapcsolatban kockázatának GC, arra törekszik, hogy meghatározza a létezését biológiai kölcsönhatás formájában szinergizmus vagy antagonizmus. Meglepő módon az egyének rejtegetése tíz kiválasztott polimorfizmusok ( CARD8
-rs10405717, NLRP3 katalógusa -rs12079994, NLRP3 katalógusa -rs3806265, NLRP3 katalógusa -rs4612666, NLRP12 katalógusa -rs2866112, NLRP12 katalógusa -rs4419163, NLRX1 katalógusa -rs10790286, CASP1 katalógusa -rs2282659, CASP1 katalógusa -rs530537 és CASP1 katalógusa -rs61751523) és fertőzött H. pylori
figyelték, hogy legfeljebb kockázata GC, ezek többsége legkülső hogy a tartományban 4,0-5,0 (3. táblázat). Ezzel szemben, annak hiányában a H. pylori fertőzés katalógusa, CARD8 katalógusa -rs2043211 jelentősen csökkent a kockázata GC (OR: 0,19, 95% CI: 0,06-0,63). katalógusa
a molekulák részt vesznek a NLR jelátviteli, megvizsgáltuk expresszióját 84 kódoló gének NLRs, egyéb inflammasome alkatrészek, negatív szabályozók, proinflammatorikus citokinek, pro-gyulladásos kaszpázok és molekulák részt vevő jelátviteli, THP-1 -eredetű makrofágok expozíciót követő két különböző H. pylori katalógusa törzsek (GC026 és 26695). H. pylori
GC026-megtámadta THP1 sejtek, 49 gén eltérően expresszált, összehasonlítva a kontroll csoport (asztal S7 táblázatokban S1 és ábra S1 ábrákon S1). Ezek közül statisztikailag szignifikáns up-szabályozás és a down-regulációja legalább két-szeres találtak 17 és 28 gének esetében (4. és 5. táblázat). Harmincöt géneket eltérően expresszált között a kontroll csoport és a csoport kitett H. pylori
26695 (táblázat S7 táblázatokban S1 és S2 kép ábrákon S1). Ezek közül statisztikailag szignifikáns up-szabályozás és a down-regulációja legalább két-szeres találtak 5. és 23. gének esetében (4. és 5. táblázat).
Helicobacter pylori
törzsek Associated gyomor rák és gyomorhurut várhatóan eltérő expressziós szintjei citokinek és kemokinek katalógusa
) arra alulszabályozott H. pylori katalógusa -challenged THP-1 sejtek (5. táblázat). katalógusa
megmutatta csökkent szintje a THP-1 sejtek ki vannak téve a mindkét H. pylori törzsek katalógusa (szétnyitható szabályozás: 0,49, p katalógusa -érték: 0,044673 és hajtsa szabályozás: 0,26, p katalógusa -érték: 0,131017 az H. pylori katalógusa GC026 és 26695-kal), statisztikailag szignifikáns up-szabályozása NFKB1 katalógusa csak figyeltek H. pylori katalógusa GC026-támadott sejtek (szétnyitható szabályozás: 2,50, p katalógusa -érték: 0,006825) (1C). katalógusa
és a BIRC3 Matton
szignifikánsan felülszabályozott THP-1-sejtek hatására mindkét H. pylori katalógusa törzsek, H. pylori katalógusa GC026-támadott sejtek (szétnyitható szabályozás: 54,03, p katalógusa -érték: 0,0247) mutató szignifikánsan magasabb expressziós szintet képest H. pylori
26695-támadott sejtek (szétnyitható szabályozás: 19,56, p katalógusa -érték: 0,016089) (1D). Továbbá egy másik részt vevő gén karcinogenezissel, BIRC3 katalógusa volt, kizárólag felfelé szabályozni H. pylori katalógusa GC026-támadott sejtek (szétnyitható szabályozás: 12,28, p katalógusa -érték: 0,001638) (1D). katalógusa
ez a baktérium kezdetben megcélzott PRRS, a betöltött szerepét vizsgáltuk a molekulák részt vesznek a New Left Review jelátviteli H. pylori
fertőzés és a kapcsolódó GC.
-rs11672725 TT genotípusú egy konzisztens kockázati tényező a GC kínai egyének. CARD8 katalógusa, található 19q13 kódolja a kaszpáz toborzó domén fehérje 8 (CARD8), más néven TUCAN, amely a beszámolók szerint kölcsönhatásba NLRP3, elnyomja az NF-kB aktiváló jelek és fokozott expresszióját humán rákos szövetekben beleértve a petefészek, a tüdő és a mellrák a szövetekben [25] - [27]. Eddig csak egy tanulmányt végzett a német lakosság, értékelte a szerepe ennek a polimorfizmus betegség [28]. Ezek a szerzők foglalkoztak a szövetség között CARD8 katalógusa -rs11672725 és végbélrák, de nem mutatott szignifikáns eredményeket (OR: 1,02, 95% CI: 0,86-1,21). [28] Különbségek a rák típusától és vizsgálati populációban tudható be ez az ellentmondásos eredményeket. Katalógusa