Pozadina pregled
Kontroverze CpG otok methylator fenotipu (CIMP) kod raka želuca i dalje postoji, unatoč činjenici da su mnoge studije su provedena na njegov odnos s Helicobacter pylori pregled (H. pylori pregled), Epstein-Barrov virus (EBV), a mikrosatelitne nestabilnosti (MSI) i prognoza. Za pogon preciznija procjena toga pretpostavio odnos, meta-analiza provedena je na temelju postojećih relevantnih studija. Pregled Metode pregled Mi u kombinaciji pojedinačnih podataka o bolesniku iz 12 studija koje su uključeni 1000 pacijenata sa želučanim rak, koji je zadovoljila kriterije. tabelarno ćemo i analizirati parametre iz svake studije, uključujući H. pylori pregled, EBV, MSI i klinički podaci o bolesnicima. pregled Rezultati Cjelokupna OR za H. pylori pregled infekcije u CIMP pozitivne grupe vs. pregled negativna grupa pokazala je da je značajno povišenim rizikom pozitivne H. pylori pregled infekcije u prvi su se ostvarila (OR 2,23 95% CI, 1,25-4,00; P = 0,007, P heterogenost = 0,05). Isto tako, jaka veza između EBV infekcije i CIMP je postignuto ILI 51,27 (95% CI, 9,39 - 279,86 P < 0,00001, P heterogenost = 0,39). . Ukupna OR za MSI u CIMP pozitivne grupe vs pregled negativna grupa je bila 4,44 (95% CI, 1,17 - 16,88; P = 0,03, P heterogenost = 0,01). Međutim, tu se nije pojavio da se bilo korelacija s kliničkim parametrima kao što su tumorske stranice, patološkog tipa, staničnu diferencijaciju, TNM stadiju, udaljenim metastazama, limfnih čvorova metastaza, i 5-godišnje preživljavanje. Pregled Zaključci meta-analiza ukazuje na snažan odnos CIMP s H. pylori pregled, EBV i MSI, ali CIMP ne može se koristiti kao prognostički biljeg za karcinom želuca. pregled Izvor : Zong L, Seto Y (2014) CpG Otok Methylator fenotipova, Helicobacter pylori pregled, Epstein-Barr virus, a mikrosatelitne nestabilnosti i prognoza za rak želuca: sustavni pregled i meta-analiza. PLoS ONE 9 (1): e86097. doi: 10,1371 /journal.pone.0086097 pregled Urednik: Ivo G. Boneca, Institut Pasteur Pariz, Francuska pregled Primljeno: 5. lipnja 2013. godine; Prihvaćeno: 11. prosinac 2013; Objavljeno: 27 siječanj 2014 pregled Copyright: © 2014 Zong, Seto. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan financiranja. Bez struje vanjski izvori financiranja za ove studije pregled suprotstavljenih interesa. autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled Uvod pregled rak želuca je četvrti najčešći zloćudni tumor i drugi vodeći. uzrok smrti od raka u svijetu [1]. Čak i screening programa s barij photofluorography ili endoskopije omogućuju ranije otkrivanje u Japanu i Koreji, pacijenti s uznapredovalim rakom želuca su još uvijek gori u pet godina ukupnog preživljavanja. Prepoznavanje molekularne aberacije u rak želuca može poboljšati naše razumijevanje želučane karcinogeneze, prepoznati strategije za parcelizaciju pacijenata u relevantnim skupinama, te istaknuti nove molekularne ciljne agense. Iako su molekularni mehanizmi želučane karcinogeneze raka ostaju nejasni, i genetički i Epigenetske promjene su važni. Genetskim izmjenama su odgovorni za aktivaciju onceogenes i inaktivacija tumor-supresorski gen. Epigenetske promjena kroz metilacije DNA je poznato da igraju važnu ulogu u inhibiciji ekspresije gena vezana za tumor. Pregled Aberantna DNA metilacije u rak se sažeti na globalnoj hypomethylation i regionalne Hipermetilacija, koje su povezane s genomske nestabilnosti i inaktivacije tumor-supresor gena, odnosno [2]. Međutim, regionalni Hipermetilacija odnosi na poremećenim metilacije normalno nemetiliranih sekvence, od kojih su većina nakupine CpG stranicama, označeni otok CpG. Budući da više gena istovremeno se metilira u hypermethylated podtip, CIMP koncept je prvi uveo u molekularnim putovima kolorektalnog karcinoma dr Issa skupine [3]. Nakon toga, znanstvenici su otkrili da CIMP pozitivni kolorektalnog raka imaju blisku povezanost s molekularnim i kliničkopatološkim mogućnosti, a loša prognoza [4] - [6] pregled Isto tako, prisutnost CIMP-pozitivnog raka želuca. Objavljeno je od strane mnogih znanstvenika [7] - [24], ali kontroverznih podataka nije potvrdili prognostičku vrijednost CIMP za rak želuca. To je vjerojatno zbog male veličine uzorka ili brkanje varijabli. Dakle, pokrenuli smo međunarodni zajednički napor koji je rezultirao u meta-analizi podataka o pojedinom pacijentu u Grupna studija za procjenu povezanosti CIMP i zloćudne u rak želuca. Pregled Metode pregled Objava pretrage pregled Dvije elektroničkih baza podataka (PubMed i EMBASE) su tražili (zadnje tražili ažuriran je 21. studenog 2012. godine, koristeći pojmove za pretraživanje. 'rak želuca "i" CIMP' su preuzete Svi imaju pravo studija, a njihova bibliografije su provjereni za drugim relevantnim publikacijama. Pregledajte članke i literaturu drugih relevantnih studija identificirane su ručno pretražili identificirati ispunjavaju uvjete studija. uključeni su samo objavljene studije s full-text člancima. Kada se isti populacija bolesnika bio uključen u nekoliko publikacija, samo najnovije ili potpuna studija je korištena u ovom meta-analizi pregled kriteriji uključivanje kriteriji bili su kako slijedi:. (a) procjenu odnosa između CIMP i H. pylori pregled, EBV, MSI ili kliničkih prognostičke parametre; (B) metilacije promotora; i (c) dovoljan je objavio podatke za procjenu omjer izgleda (OR) s 95% interval pouzdanosti (CI). pregled Podaci Ekstrakcija pregled Informacije pažljivo je izvađen iz svih prihvatljivih studija s dva od autori (Zong L i Seto Y), u skladu s kriterijima uključivanja gore navedenih. Sljedeći podaci su prikupljeni iz svakog istraživanja: prvo prezime autora, datum objave, metoda studija, veličina uzorka, ukupan broj bolesnika s pozitivnim CIMP i negativnog CIMP, a broj bolesnika podijeljenih prema dobi, spolu, tumora stranice, patološkog tipa, stanica diferencijacija, TNM stadij, limfni čvor metastaze, udaljena metastaza i 5-godišnje preživljavanje kod onih sa i bez CIMP, respektivno. Nismo definirati minimalni broj pacijenata za uključivanje u naš meta-analize. Pregled Statistička analiza pregled Odd omjere s 95% CI su korišteni za procjenu povezanosti CIMP s H. pylori pregled, EBV i MSI i prognozu, prema metodi Woolf. Heterogenost pretpostavka je potvrđena od strane X 2-based Q-test. P-vrijednost veću od 0,10 za Q-testa pokazuje nedostatak heterogenosti među ispitivanjima, dakle, OR procjena za svaku studiju je izračunata modela fiksne efekte. Inače, korišten je model slučajnih učinaka. Značaj udružuje OR određena je Z-testom i p > 0,05 smatrana je statistički značajnom. Analize osjetljivosti su provedena kako bi se utvrdilo izmjena kriterija za uključivanje ove meta-analize utjecalo na konačne rezultate. Procjena potencijalne pristranosti objave provedena je pomoću lijevka zemljište, u kojem je planirao ili za svaki studij protiv svoje log (OR). Asimetrične zemljište predložili moguću pristranost objavljivanja. Lijevak zemljište asimetrija je izveden korištenjem Egger je linearne regresije testa, linearne regresije pristup za mjerenje toka zemljište asimetriju na prirodni logaritam skali od OR. Značaj sjecištu određena je t-testa, na što upućuju Eggera (P < 0.05 je smatran prikazuje statistički značajne publikacije pristranosti). Svi statistički testovi su provedeni s Review Manager, verzija 5.0 (Cochrane kolaboracije, Oxford, Engleska). Pregled Rezultati Studijski Karakteristike Ukupno 18 publikacija susreo osnovnu uključivanje kriteriji [7] - [24]. Studija Ouea i sur Korelacija s virus zaraza i molekularnu stabilnosti pregled Cjelokupna OR za H. pylori infekcije Korelacija s kliničkih informacija meta-analiza obje dobne distribucije i spolu u CIMP-pozitivni vs. pregled -negativno skupine nisu dostigle statističku značajnost (OR 1,10 95% CI, 0,63-1,93; P = 0,74, P heterogenost = 0.52) i (OR 0,69 95% CI, 0,48-1,00; P = 0,05, P heterogenost = 0,91). . Ukupna OR za tumor stranica u CIMP-pozitivnih vs Korelacija s prognostički pokazatelji pregled. Iako su neke studije su izvijestili da CIMP može korelirati s boljom prognozom kod raka želuca, bez obzira na TNM stadiju, udaljenim metastazama, limfnih čvorova metastaza, ili čak pet godina stopa preživljavanja, CIMP nije imala nikakvu korelaciju sa jednim od im u našoj analizi (Tablica 2 i Slika 4). pregled Objava Bias pregled Begg u lijevak za zemljište je provedena za procjenu objavljivanje pristranost. Heterogenost testovi za uspoređivanje 12 kombiniranih studija pokazala je heterogenost u nekim analizama, kao što su MSI, patološkog tipa, udaljenim metastazama i 5-godišnje preživljavanje. Međutim, niti jedna studija pod utjecajem skupno ili kvalitativno, kako pokazuje analiza osjetljivosti (podaci nisu prikazani). Pregled Rasprava pregled Epigenetske promjene su predložili da se značajni pokreću događaji stvaranja raka [25] , Međutim, s dubokim angažman od aberacije metilacije DNA u ljudskim karcinoma postaje jasno, povremena prisutnost poremećene metilacije DNA u ne-kancerogen tkiva je prepoznala u Barrett je jednjak [26], želuca [27], debelog crijeva [28], [29 ] i jetre [30], koji je predložio sudjelovanje bivši u polje za stvaranja raka. Kronična upala, možda i specifične vrste je vjerojatno da će izazvati neprirodni DNA metilacije u normalnim tkivima i na taj način formirati "epigenetičku polje za stvaranja raka". Dostaviti dokaze, to je dobro poznato da kronična upala igra važnu ulogu u ulceroznog kolitisa za rak debelog crijeva, kronični hepatitis za rak jetre, a Barrett je jednjak za jednjak raka. Infekcija H. pylori U posljednjem desetljeću, pažljivi kvantitativna evaluacija je pokazala da su mnogi geni koji su visoko metilirani u karcinom također pokazuju nizak, ali mjerljiv stupanj metilacije u normalna sluznica [33]. Nadalje, nenormalna metilirani regija s naglaskom na promotora bogate CpG otocima predložio ključni korak u epigenetičke utišavanja gena. Stoga je nužno da se objasne metilaciju statuse panel reprezentativnih gena u pojedinoj bolesti. Da bi se postigao ovaj cilj, CPG otok methylator fenotip je uvedena od strane Toyota i sur pregled [3]. Do sada, što se dobro pokazala da CIMP je povezana s lošom prognozom u karcinomima debelog crijeva, rak pluća i neuroblastoma. Iako se koristi izraz "CIMP" na razne načine u kontekstu raka želuca [18], njegova prognostički vrijednost raka želuca još kontroverzna. Na primjer, i sur. Pregled je pokazao da CIMP, što korelira s malignim obilježja na histopatologijom, bila samostalna prognostički čimbenik u ukupnom poretku i uzrokuju specifične preživljavanje u bolesnika s rakom želuca [14], dok je Kim i sur. pregled i Zhang i sur. pregled nije poštivao udruženje [15], [20]. Park i sur. Pregled sugerira da su CIMP-visoki GCS opremljenog s karakterističnim kliničkopatološkim parametara, uključujući i lošom prognozom [22]. Međutim, za razliku od, Chang i sur. Pregled i Kusano i sur. Pregled, predložio da CIMP visoke pokazuje bolju prognozu [17], [18]. Neki znanstvenici trebali ovo odstupanje može doći iz korištenja različitih CIMP marker panela kao određivanje CIMP statusa; Međutim, postojala je zajednička točka ove studije u kojima je metiliran citirati od CIMP marker gena leži u promotora. Dakle, još uvijek predstavlja trend razinu metilacije u promotora, kojim je CIMP je značenje u nastanku tumora raka želuca. Prema našem mišljenju, budući su podaci bili manje uvjerljivi, uglavnom zbog male veličine uzorka i nedostatka statističke snage da se integriraju sporadične individualne studije. Pregled S ciljem da istraži moguću vrijednost CIMP kod raka želuca, proveli smo ovo meta-analiza objavljenih studija izvući ukupni ujedinjene procjena. Budući da su neke studije su bolesnici podijeljeni u tri skupine, CIMP-visoko, CIMP-uže, CIMP-low, kombiniramo posljednje dvije u CIMP-negativne podtipa u odnosu na ne mijenjati CIMP-visok kao CIMP pozitivne podtipa. Iz tablice 2, naši rezultati snažno sugerirao da je H. pylori pregled i EBV infekcije uzrokuju neprirodni DNK Hipermetilacija specifičnih gena i izazivaju CIMP, važan epigenetičku mehanizam nastanku tumora. Međutim, mehanizam za atipičnu Hipermetilacija DNK izazvana H. pylori pregled može biti različita od one koju EBV. Nedavna studija Huang i sur. Nadalje, snažan odnos CIMP s MSI otkriva da CIMP može imati potencijalni odnos s genske mutacije koje bi mogle surađivati jedni s drugima u razvoju i progresiji karcinoma želuca.. Međutim, meta-analiza nije pokazala povezanost s kliničkim parametrima kao što su dob, spol, tumora stranice, patološkog tipa, staničnu diferencijaciju, TNM stadiju, udaljenim metastazama, limfnih čvorova metastaza, i 5-godišnje preživljavanje. Pregled Ako CIMP bio ključni učestalost kod raka želuca, razlog zašto je CIMP u promotoru ne može se koristiti kao prognostički biljeg nije jasno. Moguće je da je gen metilacija na promotor dovodi do primarnog genezu tumora, ali ne i napreduju u raka želuca. Međutim, još jedan mogući razlog je da ograničeni metilni CpG otok mjesta ne predstavljaju pravi trend CIMP. Bez obzira na gore navedene analize, heterogenost je također jedan od važnih izvora koji nam je ograničen da bi precizniji zaključak. Dakle, bitno je da se razvije više opsežna studija velikih razmjera s perla-array tehnologije u budućnosti. Pregled popratne podatke pregled Kontrolni popis S1. pregled doi: 10,1371 /journal.pone.0086097.s001 pregled (DOC) pregled Dijagram S1. pregled doi: 10,1371 /journal.pone.0086097.s002 pregled (DOC) pregled
bila isključena, jer oni nisu kategorizirani u CIMP podskupina s meliliranom ploče gena [7]. Osim toga, studija Kanai i sur
bila isključena, jer su usredotočeni na DNA metilacije CPG otoka i centromernog satelitske regija u debelom crijevu i raka želuca. [8] Slično istraživanje provedeno Oshimo i sur
bila isključena, jer oni uglavnom analizirali odnos između epigenetičke inaktivacije RIZ1 i CIMP [9]. Studija Watanabe i sur
nije bio uključen jer su pokušali dokazati vjernost u odgovor metilaciju uzorke DNK u stanicama raka dovesti do guste metilacije na otoku CpG [10]. Druge studije su isključeni zbog nedovoljne informacije za izračunavanje ili [11], [12]. Dakle, ukupno 12 studija uključujući 1000 pacijenata korišteni su u skupljenim analizama. Tablica 1 navodi studija identificiran i njihove glavne karakteristike. Od 12 grupa, veličina uzorka u rasponu od 40 do 200 (slika 1). Pregled
. u CIMP pozitivne grupe vs pregled negativna grupa pokazala je da je značajno povišen rizik od pozitivnog H. su postignute pylori pregled infekcije u bivšoj (OR 2,23 95% CI, 1,25-4,00; P = 0,007 , P heterogenost = 0,05). Isto tako, jaka veza između EBV infekcije i CIMP je postignuto ILI 51,27 (95% CI, 9,39 - 279,86 P < 0,00001, P heterogenost = 0,39). . Ukupna OR za MSI u CIMP pozitivne grupe vs pregled negativna grupa je bila 4,44 (95% CI, 1,17 - 16,88; P = 0,03, P heterogenost = 0,01) (Tablica 2 i Slika 2). pregled
-negativno podgrupe je 0,85 (95% CI, 0,51-1,44; P = 0,55, P heterogenost = 0,17). Ukupna Ili za bilo patološki tip ili diferencijacije stanica u CIMP-pozitivni vs
-negativno podgrupe nisu pokazali nikakvu pozitivnu nalaz (ili 0,63 95% CI, 0,31-1,28;. P = 0,20, p heterogenost = 0,03 i OR 0,64 95% CI, 0,29-1,42; P = 0,027, P heterogenost = 0,68, odnosno) (Tablica 2 i Slika 3) pregled
je poznato da izazivaju teške kronične upale, koji su bili uključeni u indukciji polje za želučane raka. Osim toga, nenormalna DNA metilacije u želučanim biopsije iz H. pylori pregled + pacijenata je utvrđeno da je povezana s većim rizikom od nastanka karcinoma želuca u nekoliko studija [31], [32]. Dakle, nenormalna metilacije DNA može biti ključni događaj u tumorskom genezu raka želuca. Pregled
Podržan H. pylori pregled infekcije uzrokuje želučane sluznice upalne reakcije, što je rezultiralo u up-regulaciji interleukin-1b (IL-1b) i hiperprodukcija mutageni nitratni oksid (NO), po kojima je nenormalna DNA metilacije je inducirana [34]. Kao i za EBV infekcije, predloženo je da se metiliranje mehanizam u stanicama domaćina može biti u prvom redu za obranu od strane DNA, te da je domaćin upravljan opsežna metiliranje virusnog genoma također mogu izazvati domaćina genom metilacije [35]. Također je pokazano puta da izravnom interakcijom virusnih latentnih proteina s DNA metil transferaze (DNMT), doreguliranjem DNMT gena virusnih latentnih proteini i povećanom ekspresijom polycomb skupine proteina mogu doprinijeti preinake u metilacije DNA i histon modifikacije [35 ] - [38] pregled
Veliko istraživanje pokazalo je da je SARS-CoV-2 virusno opterećenje najniže u djece
COVID-19:Kako bolest izgleda
Otvaranje uskog jednjaka
Multi-omics pristup razvoju lijekova protiv COVID-19
Crijevni mikrobi mogu biti povezani s depresijom
Ograničenja vezana uz COVID-19 dovela su do pada zaraze norovirusom u SAD-u za 86 posto,
Mikroplastika prvi put identificirana u ljudskom otpadu
Analizom uzoraka ljudske stolice uzetih od sudionika u osam zemalja utvrđeno je da svaki ispitani uzorak sadrži mikroplastiku i da je prisutno do devet različitih vrsta plastike. Kredit za
Istraživači se nadaju da bi krvni test koji točno dijagnosticira fibromialgiju mogao biti dostupan u roku od pet godina
Istraživači Sveučilišta Ohio State imaju dokaze da uzorci krvi mogu pouzdano otkriti fibromijalgiju, bolest koja se često pogrešno dijagnosticira zbog svojih općih simptoma koji karakteriziraju niz dr
Inhibitori GSK-3 obećavaju u liječenju infekcija koronavirusom
Istraživači u Sjedinjenim Državama predložili su novi pristup liječenju infekcije koronavirusom, poput teškog akutnog respiratornog sindroma koronavirusa 2 (SARS-CoV-2)-agensa koji uzrokuje koronaviru