Swanson irodalom alapú felfedezés összpontosít feltámadó korábban megjelent, de elhanyagolt tudás. Ebben a vizsgálatban, javaslatot teszünk egy kétlépéses modell a felfedezés folyamat, és generál egy hipotézis között az anandamid és a gyomorrák. Továbbá, a potenciális kapcsolat megerősítette utánkövetés kísérletezést. Az anandamid kezelés eredményezett sejtciklus újraelosztása gyomor rákos sejteket. A legfontosabb, hogy a variációs sejtciklus által közvetített bizonyos gének a B-feltételek a zárt felfedezés, jelezve a potenciális szerepét a B-feltételeket. Swanson irodalom alapú felfedezés nemcsak gyűjti adatait lehetséges kölcsönhatásokat, de azt is előírja a lehetőség, hogy tartsa be a nagyobb hátteret ezeket a közvetlen kapcsolatok és felbecsülhetetlen felfedezés eszköz biztosítása terén. Katalógusa
Citation: Dong W, Liu Y, Zhu W, Mou Q, Wang J, Hu Y (2014) szimulációja Swanson irodalom-alapú Discovery: az anandamid kezelés gátolja a gyomorrák sejtek In vitro katalógusa és In Silico katalógusa. PLoS ONE 9 (6): e100436. doi: 10,1371 /journal.pone.0100436 katalógusa Szerkesztő: Valli De Re, Centro di Riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institute, Olaszország katalógusa Beérkezett: január 12, 2014; Elfogadva: 25. május 2014; Megjelent: június 20, 2014 katalógusa Copyright: © 2014 Dong et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa Forrás: Ez a tanulmány finanszírozta a kínai Geriátriai onkológiai Társaság (onkológiai program ad CGOS-03-2013-1-1-00600). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa Bevezető A gyors fejlődés a tudomány vezetett exponenciális növekedés a tudásbázis. Következésképpen ez nagy kihívás az orvosi vizsgálatot letölteni, és beépítik a legfontosabb, frissített információkat a napi özönvíz kiadott szakirodalom. Például az összes publikáció indexelt a keresési kifejezés "gyomorrák megnövekedett több mint 4-szeres, 2012-ben, mint a 1980 Gyakran a legrelevánsabb információkat hajlamos figyelmen kívül hagyni vagy elhanyagolni az aktuális tanulmány [1]. Ezen kívül, a specializáció növelése területén a tudomány és a technológia, nagyobb kihívás előtt áll az információk megosztását határokon funkcionálisan, mint tudományos ismeretek egyre jobban összpontosított, és kevésbé változatos. Azonban egy értelmes kapcsolatnak kell léteznie között a különböző kutatási területeket. Ezért sokkal fontosabb, hogy meghatározza a figyelmen kívül hagyott tudást, mint az információs növekedés önmagában. [2] katalógusa Swanson (1990) kifejlesztett és megvalósított új eszközt, hogy az enyém a meglévő tudásbázist a bejelentett vagy a valóságosnál kisebb kapcsolatokat, és feltámasztani korábban publikált, de elhanyagolt hipotéziseket, a folyamat néven ismert irodalmi alapú felfedezés [3]. Ez a folyamat működik, mint egy utat mutat a 2. látszólag független megállapítások másként ebben a formában: ha "A összefügg B" és "B kapcsolódik C", akkor azt a hipotézist, mely szerint "A okoz C" erősen ajánlott [4 ]. Bár ez a megközelítés nem nyújt meggyőző bizonyíték, a felfedezés, önmagában nagyon hasznos feltárásában eddig ismeretlen kapcsolatokat [5]. Továbbá, ez segíthet a kutatók elérheti az összefüggésben, és az enyém a tudás, amely nem tárt fel egy hagyományos keresés. Katalógusa A jelen tanulmányban, végeztünk egy 2 lépésből álló megközelítést szimulálni Swanson irodalom alapú felfedezés módszer 2 területek biológiai szakirodalom, amelyek általában nem szakirodalommal csatlakozva: gyomorrák és a pszichológia. Gyomorrák egyik leggyakrabban diagnosztizált rák, a második vezető oka a rák okozta halál világszerte, és súlyos közegészségügyi probléma [6]. Korábbi kutatások azt is kimutatták, hogy a különböző pszichológiai tényezők jelentősen befolyásolják a fizikai betegségek. Azonban a kapcsolat gyomorrák és a pszichológia már korábban elhanyagolt. Ezért ezek a 2 kutatási területeket választottak, azzal a céllal, hogy találnak egy elhanyagolt közös kapcsolat. Katalógusa A 2 lépés felfedezés folyamat során hipotéziseket közötti korreláció anandamid és a gyomorrák és feltéve egy lehetséges közös molekuláris hálózat, amely közvetítheti a hatásokat. A hipotézis ezután vizsgálták kísérletileg. Az anandamid találtak, hogy gátolja a növekedést 4 gyomor rákos sejtvonalak, ideértve a BGC823, SGC7901, AGS, és N87. Áramlási citometria adatok azt mutatták, hogy a jelenléte anandamid által kiváltott G2 /M sejtciklus AGS és N87 sejteket. Továbbá, azt megerősítette, hogy az anandamid működhet, hogy szabályozzák a sejtciklus gének azonosítására, beleértve CHEK1, CDKN1A, CDKN2A nyert a zárt felfedezés folyamatát. Együttesen ezek az adatok azt jelzik, hogy az anandamid befolyásolja a sejtciklus eloszlása gyomorrák sejtek szabályozása által a B-feltételek sejtciklus szelepből, egy hipotézist, hogy validáltuk kísérletileg ebben a vizsgálatban, ezáltal vizsgálók egy alternatív nézet szerepére vonatkozó anandamid. Ezzel a módszerrel tudtuk sikeresen összerak egy korábban rejtett kapcsolata 2 különböző területeken, és hozzá a teljes tudásbázis. Katalógusa módszerek és anyagok katalógusa A cikkek MEDLINE adatbázisban katalógusa A National Institutes of Health (NIH) által szponzorált MEDLINE /PubMed adatbázis linkeket tartalmaz megjelent cikkek több mint 5500 vezető folyóiratokban. Hogy megszerezzék a legteljesebb cikksorozatot a "gyomorrák," befogadó sorozat keresési kifejezések (daganat, gyomor vagy gyomor neoplasma vagy daganatok, gyomor vagy daganatok, Gyomor, illetve Gyomor daganatok vagy Gyomor neoplasma vagy daganat, Gyomor, illetve rák Gyomor vagy gyomorrák vagy gyomorrák vagy rák; gyomor vagy daganatok, a gyomor vagy a gyomorrák vagy gyomor- vagy rák; gyomor, illetve daganatok és gyomor, illetve gyomorrák vagy gyomor daganatok) használtunk letölteni a megfelelő cikkeket. Ez a keresés lekért 86.536 bejegyzések (elérhető október 27-én, 2011), amely tartalmazza az összes publikáció beviszik ebbe az adatbázisba. Továbbá, hogy megszerezzék a legteljesebb cikksorozatot a "pszichológiai" befogadó sorozat karakterláncokat (pszichológia vagy Side Effects, pszichológiai vagy pszichológiai mellékhatásai vagy lelki mellékhatása vagy mellékhatás, pszichológiai vagy pszichoszociális tényezők faktor vagy; Pszichoszociális vagy tényezők; pszichoszociális vagy pszichoszociális tényező vagy pszichológiai tényezők, vagy tényezők, pszichológiai vagy faktor, illetve pszichológiai és pszichológiai tényező vagy pszichológusok vagy pszichológus) letöltött 911.793 rekordokat. Mindezek a kiadványok mentett Medline formátumban gyűjtésére Medical tárgyszórendszere (mesh) szempontjából. Katalógusa MeSH kifejezéseket Mesh ellenőrzött szókincs szinonimaszótár a National Library of Medicine. MeSH áll készlet szempontjából úgynevezett leíró hogy vannak elrendezve mind alfabetikus és hierarchikus struktúrák, tehát MeSH kifejezéseket képes azonosítani a fő hangsúly a kiadvány, és fel lehet használni az index Medline rekordokat. Ebben a vizsgálatban ezek leírásokat szűrjük hálóval stoplist a 5569 leírásokat kifejezetten a témakörben a tanulmány. Katalógusa Stoplists katalógusa A stoplist egy szólistát, amelyet ki kell zárni, vagy mert túl tág, vagy értelmetlen célpontjául a keresést. Stoplists lehetnek akár több száz funkcionális szavak, amelyek nem esnek orientált. Ebben a vizsgálatban a hosszú stoplist a 5569 szót állították össze, hogy kiszűrje a MeSH kifejezéseket. A Mesh által megadott kategóriák a Medline adatbázisban, és a vizsgáló megítélése összeállítottunk listái stop-feltételek, a felső szintű MeSH megjelenített kategóriák 1. táblázat részletes információ háló kategória megtalálható a http: //www.nlm.nih .eu /háló /2012 /mesh_bro-wser /MeSHtree.Dhtml. katalógusa Megnyitás felderítési folyamat katalógusa a nyitott felderítési folyamat kezdődik a tudományos problémát, és a generációs egy hipotézis. Ebben a vizsgálatban, a mezők a gyomorrák és pszichológiai választottak keressen rejtett kapcsolatokat. Mi letölteni a kiadványok a gyomorrák és a pszichológia a korábban leírtak szerint. Továbbá a háló profil szerkesztettünk kezdeményező az A vagy a B téma. Mi épített téma profilok azonosítására vonatkozó részét jellemző kifejezéseket a kijelölt szöveg. Feltételek nyerték a dokumentumok és értékelni azok relatív fontosságát, mint leírások a téma. Ebben a vizsgálatban a profilok voltak súlyozott vektorok MeSH kifejezéseket, az alábbiak szerint a téma X i: katalógusa (1), ahol m j jelentése háló kifejezés, w i , j jelöli a súlya, és összesen n elemének a Mesh szókincs [7]. katalógusa Miután témák a és B épültek, a végső elegy-C profil-ben épített egy Java applet, hogy mi fejlett. Ebben az eljárásban a kifejezésekkel az A és a B profilok kiestek együtt tekintve, hogy csak jelen a profil. Végül a háló kifejezéseket, amelyek csak jelen a B profilt, és csak ritkán jelent meg a profil kiválasztását, és az úgynevezett C profilt. A kifejezéseket a C elemzés szerint szoros kapcsolat a témát B és kevés vagy semmilyen linkeket téma A. Más szóval, ezek a fogalmak maradt szorosan összefügg a "pszichológia", de ritkán jelentettek együtt "gyomorrákban." Azonban a korábban be nem jelentett kapcsolat áll fenn közöttük, amelyek fedetlen a későbbi eljárás során. katalógusa zárt felderítési folyamat katalógusa a zárt felderítési folyamat végeztünk web-alapú modell Arrowsmith (http: //arrowsmith.psych. uic.edu/arrowsmith_uic/index.html, University of Illinois, Chicago, Pszichiátriai Tanszék), amelynek célja, hogy segítse a megértést és elismerést rejtett összeköttetések az a és C irodalom komponensek [8], [9]. Kezdeményeztük a zárt felderítési folyamat az első 2 Medline keresések segítségével Arrowsmith feldolgozás: A téma profil keresés és C kifejezést irodalom keresést. Ezután a program által generált Arrowsmith kifejezések listája, amely megtalálható a címek mind az A és C irodalom visszakeresés. Ezek a szavak elemeztük, hogy létrehoz egy B-lista, egy harmadik szűrési lépése szerint: katalógusa Végül, mi generált listánkat B-koncepciók, majd nézett a megfelelő AB és BC irodalom visszakeresés. katalógusa Sejtkultúra Az alkalmazott sejtvonalak a jelen vizsgálatban mind a gyomorrák sejtvonalakon. Az N87 és AGS sejtvonalakat az American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA, USA). AGS sejtvonal származik fragmentumokat egy tumor reszekált egy betegtől, aki egy 54 éves kaukázusi nő, és nem kapott előzetes kezelést. N87 sejtvonal származik májmetasztázisos a jól differenciált gyomor carcinoma egy kaukázusi férfi előtt vett citotoxikus terápia. AGS és N87 sejteket tenyésztettünk Dulbecco-féle módosított Eagle-féle tápközegben (DMEM; Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), kiegészítve 10% magzati borjúszérummal (FBS). A sejtvonalak BGC823 és SGC7901 hoztak létre Kínában. A BGC823 sejtvonal 1984-ben alakult át 60 részeket sejttenyésztés időtartama 2 év sebészeti példány egy gyomor rákos beteg amelyet diagnosztizálták alacsony differenciált adenocarcinoma. SGC7901 sejtvonal 1979-ben alakult, és nyert egy nyirok metasztázis a gyomor adenokarcinóma egy 56 éves kínai nő. A BGC823and SGC7901 sejteket tenyésztettünk Dulbecco-féle módosított Eagle-féle tápközegben (DMEM; Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), kiegészítve 5% magzati borjúszérumot (FBS); Az összes sejtvonalat 37 ° C hőmérsékleten 5% CO 2. AGS és N87 sejteket (1 × 10 5) rutinszerűen betakarított tripszines emésztéssel végzett kezelés után az anandamid (Sigma, A0580), PBS-sel mostuk, és a rögzített hideg 75% -os etanollal 4 ° C hőmérsékleten egy éjszakán. Festés után propidium-jodid (Pl) oldat 30 percig, sejtciklus analízist végeztünk fluoreszcens aktivált sejtválogatással (FACS), hogy meghatározza a százalékos aránya és eloszlása a sejtek a G1, S és G2 /M fázisban. kimutatására a foszfatidil externalizáció, tripszinezett sejteket duplán festettünk fluoreszcein-izotiocianát (FITC) konjugált annexin-V (20 ng /ml) és a PI (50 ng /ml) alkalmazásával a gyártó protokollja (Biosea; Nelson, Új-Zéland ). Tízezer sejteket összegyűjtöttük, és analizáltuk FACSorter, és a sejtciklus profilok alkalmazásával elemeztük Cell Quest szoftver (Becton-Dickinson, Franklin Lakes, NJ, USA). BGC823, SGC7901, AGS, valamint N87-sejteket szélesztettünk 96 mérőhelyes szövettenyésztő lemezeken, és inkubáltuk anandamid különböző koncentrációkban, ezt követi a 3- (4,5-dimetil-tiazol-2-il) -2,5-d-iphenyltetrazolium-bromidot (MTT) 24, 48, 72 és 96 óra. Miután 4-H inkubálást 37 ° C-on, 5% CO 2, 200 pl dimetil-szulfoxid (DMSO) adunk a szolubilizáljuk a formazán termék. Az abszorbanciát 570 nm-en határoztuk meg mikrotiterlemez-leolvasó (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA). A 2 különböző RT2 Profiler PCR tömbök (SA Biosciences , QIAGEN) alkalmaztunk, hogy elemezzék az expressziós szintek a 84 részt vevő gének szabályozásában sejtciklus (Human Cell Cycle tömb, PAH-k-020) in AGS kezelt sejtek anandamid vagy a jármű. A sejteket betakarított után 24 anandamid kezelés és a teljes RNS-t extrakciós RNeasy Plus kit (Qiagen). A szintetikus cDNS-t használjuk templátként, hogy végre kvantitatív polimeráz láncreakció (PCR) analízis. A RT2 Profiler PCR Array adatokat elemző szoftver (V3.5) használtunk a PCR-array adatok elemzésére. Azért választottuk a GAPDH és ACTB referencia géneket. Gének expressziós szeres közötti változásokat a minták nagyobb, mint a 2. kiválasztott eltérés géneket. Protein lizátumokat elválasztottuk 12% -os Tris-glicin poliakrilamid gél elektroforézis és a polivinilidén-fluorid ( PVDF) membrán (GE Healthcare, Little Chalfont, Egyesült Királyság). A membránokat inkubáltuk felismerő egér monoklonális ellenanyag a humán Chk1, p-Chk1 (ABCAM; Cambridge, Egyesült Királyság), CDC25A, CyclinB1 (Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA, USA), majd torma-peroxidázzal (HRP) jelzett kecske-anti -egér IgG-t (PTGLab, Chicago, IL, USA). β-aktin (Sigma Chemicals; St. Louis, MO, USA) alkalmaztunk fehérje terhelési kontrollként. A HRP konjugátum detektáltuk egy chemioluminescence ECL készlet (Amersham), és autofluorography. Protein intenzitás számszerűsítésére a LANE 1D Analyzer szoftver (Sage Creation, Peking, Kína). Katalógusa A statisztikai elemzés katalógusa A Student-féle t-tesztet használják, hogy elemezzék a jelentősége különbség a két csoport a adat. P < katalógusa 0,05 értéket tekintettük statisztikailag szignifikánsnak. Katalógusa Eredmények katalógusa beszerzése MeSH kifejezéseket gyomorrák és a pszichológia katalógusa A nyílt folyamat során, az első lépés az volt, hogy vonjuk ki a MeSH kifejezéseket a szakirodalomban visszakeresés. Mi generált 12.001 MeSH kifejezéseket (Profile A) a szövegben "gyomorrák." Ezek a MeSH kifejezéseket részt aspektusait gyomorrák, amelyek magukban foglalják a diagnózis, a kezelés, a gyógyszerek, a túlélés, a rák szakaszban, a sejtek működését, gének, fehérjék, és néhány vegyi anyagok mint észterek. Létrehoztunk 9635 MeSH kifejezéseket (B profil) a szöveg "pszichológia", amely szorosan kapcsolódik a társadalmi környezet, a viselkedés, személyiség, érzelmek, féle betegség, kezelés, gyógyszerek, vegyi anyag, stb Az első tíz MeSH kifejezéseket minden téma jelenik meg a 2. táblázatban katalógusa Discovery anandamid a C profilt (BA) hotelben a fent említett Java applet kihagytuk kifejezésekkel az a profilt a B profil, így csak feltételek jelen a B profilú, de nem jelenik meg a profil. Ez az új tanulmány szerint a "C profil." Kifejezések a C profil számoltak be, hogy több mint 1 kapcsolat a pszichológia, de kevés vagy semmilyen publikáció egyszerre hivatkozik a pszichológia és a gyomorrák. Azonban a korábban be nem jelentett kapcsolat áll fenn, hogy nem fedeztek fel, vagy nem vették figyelembe. Katalógusa Ahhoz, hogy tovább vizsgálja a lehetséges kapcsolatokat az e területek közti osztályoztuk a feltételeket a C profil 6 kategóriába, beleértve a viselkedés, orgona és szövet, hangulatok, betegségek, gyógyszerek és vegyi anyagok, és a többi. Mindegyik kifejezés rendelkezett saját frekvencia; feltételei rendelkező magasabb frekvenciák és reprezentativitása táblázat mutatja 3. Végül, a kiválasztott 1 kifejezés a gyógyszer és vegyi anyag kategóriát, az anandamid, további vizsgálat céljából. Az okok a kínálatunk az alábbiakban foglaljuk össze: katalógusa Bár néhány tanulmány talált vizsgálata is anandamid és a gyomorrák együtt [10], [11], a munkánk feltámadás elemzésére összpontosít utak vagy mechanizmusok esetleg nem ismert. katalógusa Jóslás közötti kapcsolat anandamid és a gyomorrák katalógusa a hipotézis az anandamid és a gyomorrák teszteltük a zárt felfedezés folyamatát. Ezt a folyamatot végeztünk a web-alapú modell Arrowsmith; kiindulva a betegség a gyomorrák (A) és az anyag az anandamid (C), kerestünk közös közbenső B-szempontból. A B-lista tartalmazza cím szavakat és kifejezéseket (feltételek) megjelent mind az A és C irodalomban. Mivel az utak között található A és C egyre gyakoribbak lettek, úgy nőtt a várható Hipotézisünk. Miután a szükséges előbb említett szűrőlépések, 446 feltételei voltak jelen a jelenlegi B-lista szerinti sorrendben megjósolt jelentősége. Következő lépésként korlátozzák ezeket a kifejezéseket szemantikai kategóriái Genes &Molekuláris Sorozatok és Gene & Fehérje nevek és összegyűjtjük a célgének részt a különböző jelátviteli utak, beleértve a sejtciklus, az apoptózis, a gyulladás és ETC (4. táblázat). Egyidejűleg egy útvonal hálózat került kialakításra, hogy megjelenjen a közös molekuláris szabályozási hálózat között a gyomorrák és anandamid akció. Amint az 1. ábrán látható, ezek a gének mutatott magas függőség jelezve a szabályozási kapcsolatot közöttük. Ahhoz, hogy tovább vizsgálja az érvényességét ezen cél gének különböző fehérjéket /géneket választottuk példaként, hogy ellenőrizze a kapcsolatukat gyomorrák vagy anandamid keresztül Arrowsmith SYSTEM. És mint az 5. táblázatban látható, egy csoport kritikus gének számos útvonalban vesz részt, amelyek kapcsolódnak mind a gyomorrák és anandamid. Mindezek a nyomokat vélelmezett potenciálisan rejtett összefüggés anandamid és a gyomorrák, ami megérdemli a további vizsgálatot. Katalógusa kimutatása hatását anandamid a gyomorrák sejtek katalógusa Az anandamid, tagjaként az endokannabinoid család, más néven N Hogy vizsgálja meg a hatását anandamid a proliferációját gyomorrák-sejtek, BGC823, SGC7901, AGS, és N87 kezeltük növekvő koncentrációban szintetikus anandamid. Ezt követően, a proliferációját ezen sejtvonalak detektáltuk MTT. Eredmények igazolták, hogy az anandamid erősen csökken a proliferáció mértékének a 4 gyomor rákos sejtvonalak dózis-függő módon, statisztikailag szignifikáns csökkenést ( P < 0,01 Az anandamid csökkentette a növekedés képességét AGS és N87-sejtek, míg csekély hatása volt a apoptózist AGS és N87-sejtek (ábra 2D). Ezért nem kell más okok vezettek a csökkent proliferáció. Katalógusa Effect anandamid kezelés sejtciklus eloszlása gyomorrák sejtek katalógusa Ahhoz, hogy tovább vizsgálja a jellemzői a növekedés gátlása anandamid a sejtciklus fázist érzékelt áramlási citometriával. Az AGS és N87 cellák időszak logaritmikus növekedési inkubáltuk 10 uM anandamid vagy etanol oldószerben 24 órán át, majd megállt a G2 fázis sejtciklus (3A és 3B ábrák). Hatásának vizsgálatára anandamid a sejtciklus részletesebben, AGS és N87 sejteket szinkronizálja a G1 fázisban szérum éhen. A sejtciklus analizáljuk, amikor a sejteket eltávolítjuk a blokád teljes közeg jelenlétében vagy távollétében anandamid. A sejteket etanollal kezeljük oldószer helyett anandamid alkalmaztunk kontrollként. Amint az ábrán látható 3C, AGS sejteket szinkronizálva több mint 70% G1 fázisban DNS-tartalom után növesztettünk szabad-szérum kultúrát. 6 H, körülbelül 46% a kontroll sejtek G1 fázisban van, és 12 órán át, a többség (57,45%) volt S fázisban. 12 és 24 óra, a sejteket a G2 /M fázisban, és ment gyors mitózis, és 24 óra, beléptek a következő sejtciklusban. Azonban, ha a sejteket kezeltük anandamid felengedése után a G1 fázisban, 33.47% a kezelt sejtek letartóztattak G2 /M fázis legfeljebb 24 órás, és mutatott késleltetett lépését a következő sejtciklusban. Hasonló tendencia is megfigyelhető volt N87-sejtek (ábra 3D). Együttesen ezek az eredmények azt mutatják, hogy az anandamid kezelés hatására a G2 /M letartóztatás megfigyelt AGS és N87 sejteket. Katalógusa Effect anandamid sejtciklus szabályozó Annak érdekében, hogy elemezzék a molekuláris mechanizmusok felelősek fokozott sejtciklus által okozott anandamid, használtuk 2 különböző RT2 Profiler PCR tömbök (SA Biosciences, QIAGEN), hogy meghatározzuk az expressziós szintek részt vevő gének a sejtciklus szabályozásában. Gének expressziós szeres közötti változások kezelt sejtek az anandamid és a jármű nagyobb, mint 2, kiválasztjuk, mint differenciális géneket. Az eredmények azt mutatták, hogy az AGS kezelt sejtek anandamid 24 órán megjelenített általános növekedése a kifejezés a G2 /M letartóztatás kapcsolatos gének, beleértve a GADD45 és P21 WAF, és látszólagos csökkenése G2 sejtciklus szabályozóknak beleértve CHEK1, CHEK2, CDC25, CCNA2, CCNB1, CDKN1A, CDKN2A stb (4A). Ahhoz, hogy tovább vizsgáljuk, hogy az anandamid okozott sejtciklus által G2 /M ellenőrző pont szabályozás, végeztünk egy Western-blot-elemzésének AGS sejtek alábbi anandamid kezelés 24. A sejteket etanollal kezeljük oldószer helyett anandamid alkalmaztunk kontrollként. Ahogyan a 4b ábrán látható, és a 4C, anandamid okozott növekedést Chk1 foszforiláció és csökkent az expressziós szintjét Ciklin B1 és CDC25A összehasonlítva a megfigyelések a kontroll sejtekben. Ezek az adatok azt javasolta, hogy az anandamid kezelés növelte a tevékenység G2 /M ellenőrző pontok. Katalógusa Vita katalógusa A Swanson irodalom alapú felfedezés módszer, kutatók meghatározhatják újszerű közötti kapcsolatok látszólag független területeken, és feltámasztani a korábban közzé, de elhanyagolt hipotézisek [15]. A jelen tanulmányban azt szimulált Swanson irodalom alapú felfedezés módszer 2 orvostechnikai szakirodalom, amelyeket nem szakirodalommal csatlakozva: gyomorrák és a pszichológia. Miután egy 2 lépéses folyamat során, az anandamid lett kiválasztva, és megjósolta, hogy kapcsolódik a gyomorrák. Ezután a potenciális közötti kapcsolat a gyomorrák és az anandamid megerősítette utánkövetés kísérletezést. Így sikeresen szimulált irodalom alapú felfedezések, mert a hipotézisek generált új kapcsolat, hogy bebizonyosodott, hogy megbízható. Katalógusa A gyomorrák multifaktoriális betegség, számos kiváltó változók miután számoltak be, beleértve H . pylori katalógusa, magas nátriumtartalmú étrend, ivás és a dohányzás. [16] Korábbi tanulmányok a laboratóriumban szakosodott gyomorrák; ezért a cél az volt, hogy új ismereteket a gyomorrák kutatás területén. Ez a megközelítés, a Swanson irodalom alapú felfedezés, azonosításához vezetett anandamid, tagja a endocannabinoidok. Az anandamid leírták, hogy mutatnak az anti-proliferációs tulajdonságait kezelésében bizonyos típusú rákos megbetegedések, beleértve a neuroblasztóma, prosztata karcinóma és melanoma [17] - [20]. Mayato [21] is beszámolt, kutatás anandamid a gyomorrák. Vizsgálták a gátló hatását anandamid a gyomor rákos sejteket, és tisztázta a funkciója anandamid, hogy fokozza a citotoxikus hatás a paclitaxel, és azok vonatkozó következtetések hatásait anandamid sejtnövekedésre összhangban vannak E vizsgálat eredményei. Azonban bizonyos gének (CHEK1, CDKN1A, CDKN2A, CCNB1, stb), a B-feltételeket a közeli felfedezés volt sejtciklus szabályozó, ami arra utal, hogy az anandamid lehetnek kapcsolatban sejtciklus gyomorrákban. Amint az várható volt, a valós idejű PCR és Western blot assay észleltük, hogy a kifejezések ezen sejtciklus szabályozóknak szignifikánsan megváltoztatta következő anandamid kezelést. Áramlási citometria vizsgálatok megerősítették továbbá, hogy az anandamid által kiváltott G2 /M sejtciklus gyomorrák sejtek révén aktív G2 /M ellenőrző pontok. Ez jelenti az első alkalom, hogy a sejtciklus újraelosztó volt kimutatható gyomorrák sejtek után kezelik az anandamid közvetlenül és külön-külön. Továbbá, az eredmények azt mutatják, hogy a B-kifejezések potenciálisan működni, hogy közvetítsen a effektorok között a betegséget, és a felfedezés célokat. Katalógusa A biológiai vizsgálatot, tartása up-to-date a jelenlegi közzétett kutatás kritikus eleme bármely nyomozó munkaköri leírása, és szinte minden megjelent cikk egy lehetőség arra, hogy új kapcsolatokat gyógyszer és a betegség. Ugyanakkor a jelenlegi mennyiség a rendelkezésre álló biológiai tudomány óriási. A tájékozott hagyományos kereső, kutató megfigyelhetik korlátozott közötti kapcsolatok gyógyszer /molekula és a betegség, de nem ismeri fel a nagyobb környezetben, amelyen keresztül a kapcsolatok működnek, sem azonosítani más potenciális belüli kapcsolatok, hogy a környezet. Ezért az információ tudományok és visszakeresés nagyon hasznos eszközök biológiai tudósok. Swanson irodalom alapú felfedezés középpontjában feltámadó korábban megjelent, de elhanyagolt hipotézisek. Ha a közvetlen kapcsolat, amely úgy tűnik, hogy az elhanyagolt észlel, akkor a munka feltámadás kiderül, hogy az elemző utak vagy mechanizmusok esetleg nem ismert. Más szóval, a Swanson irodalom alapú felfedezés módszer nemcsak a bányák adatait kölcsönhatás a betegség és a betegség, a betegség és a kábítószer, vagy betegség és molekula, hanem biztosítja számunkra a lehetőség, hogy tartsa be a nagyobb háttér mögött közvetlen kapcsolat, mint a molekuláris útvonal hálózat vizsgálatunkban arra utal között összefüggés lehet a gyomorrák és anandamid akció. Adatait elemezve ebben az összefüggésben, megkaptuk a kölcsönhatások és a mechanizmusok közötti látszólag független témák és azok klinikai jelentőségét és fontosságát. Ezért Swanson 's irodalom alapú felfedezés hatékony eszköz, hogy törekedjen a csatlakoztatott meglévő ismeretek empirikus eredmények hozza napvilágra kapcsolatok szerepet játszanak, és még "elhanyagolt" (Marc Weeber, 2001). Katalógusa Azt is felmerült kihívásokkal a felfedezés folyamatában. Az egyik probléma az volt, a MeSH kifejezéseket, magukat, és a további szemrevételezés volt szükség extrakció a mi egyéni Java applet. A nyílt felfedezés folyamatát, gyakran képtelenek felismerni rövidítések, amely képviseli a különböző szavakat, és ezért figyelmen kívül hagyja őket, annak ellenére, hogy a potenciális fontosságát. Továbbá, néhány kifejezés begyűjtött kisegítő szóval, a leépítés. Sőt, voltak olyan esetek, amikor szinonimák kezdetben külön-külön számítanak, mert a helyesírás, és ezek a duplikációk kellett oldani kézzel. Annak ellenére, hogy ezek a kérdések, a szakirodalom alapján felfedezés módszer növekedése egyértelműen mutatja egy előnye a folyamat felfedezni új kapcsolatok a különböző kutatási területek. Katalógusa Swanson eredetileg a szakirodalom alapján felfedezés módszertan és már finomítani ezt az eljárást 30 év, azzal a céllal, hogy segítse a nyomozók felfedezni ismeretlen vagy nem azonosított közötti kapcsolatok tanulmányok; a probléma, hogy továbbra is nehezen érthető, egészen mostanáig. Ezzel a Discovery módszert találtunk egy potenciális kölcsönhatás anandamid és a gyomorrák, amely mélyen eltemetve a hatalmas mennyiségű adat áll rendelkezésre, és amelyet most megbízhatóan megerősítette a kísérletezést.
áramlási citometriás elemzését sejtciklus állapot és az apoptózis
MTT assay
génexpressziós analízis
Western-blot-analízis
-arachidonoylethanolamine vagy AEA, kimutatták, hogy aktiválja 2 különböző G-fehérjéhez kapcsolt kannabinoid receptorok, a cannabinoid receptor 1-es típusú (CB1) és a cannabinoid receptor 2-es típusú (CB2) [ ,,,0],12]. Anandamid szintetizált N-arachidonoil foszfatidil-etanolamin (NAPE) és annak lebomlási elsősorban katalizálja a zsírsav amid hidroláz (FAAH) enzim, ami szintén katalizálja a downstream átalakítás anandamid figyelembe etanol-amin és az arachidonsav. A szerkezet a anandamid magában foglalja a funkciós csoportok az amidok, észterek és éterek, a hosszú szénláncú, többszörösen telítetlen zsírsavak [13]. Ezek a vegyületek "kannabimimetikus tevékenység"; Más szavakkal, úgy működnek, mint a "D-9-tetrahidrokannabinol (THC) mimetikumok", a hatóanyaga a kannabisz. Az anandamid szerkezet részvények kritikus farmakofórok THC [14] (2A ábra).
) 100 uM. Sőt, az AGS és N87 sejtvonalak megjelenik egy érzékenyebb és drámai csökkenést ( p < 0,01 katalógusa), még a 50 nmol koncentráció (2B). Továbbá megvizsgáltuk a hatását anandamid alacsonyabb koncentrációk sejtproliferációra a gyomor rákos sejtek. Amint a 2c ábrán látható, egy szignifikáns, dózisfüggő csökkenését ( P < 0,01
) elburjánzását AGS és N87-sejtek volt megfigyelhető gátlási. Azonban, az anandamid alacsonyabb koncentrációban termelt kis hatása BGC823 és SGC7901 sejtvonalak (az adatokat nem mutatjuk be). Ezért AGS és N87 sejtvonalak érzékenyebbek voltak anandamid mint BGC823 és SGC7901 sejtvonalak.
Miért érdemes természetes rostforrásokat bevonni az étrendbe?
A migráció befolyásolja a bél mikrobiotáját, ami viszont hatással van az egészségkutatókra
Új modell a hüvelyi mikrobiomátültetéshez
A SARS-CoV-2 fertőzés meghosszabbítja a vírusszaporodást és a limfociták elvesztését rákos betegeknél
Mi a helyzet a hepatitis C -vel?
Bizonyos donorok székletátültetése jobb, mint másoké
A növényi étrend meggyógyíthatja a reumás ízületi gyulladást
A legfrissebb áttekintés szerint A növényi étrend elfogadása enyhítheti az ízületi duzzanatot és a rheumatoid arthritis (RA) fájdalmát. Az RA autoimmun eredetű, fájdalmas ízületi rendellenesség, ame
Az ősi főemlősök mikrobiomái több információt adhatnak az emberi fejlődésről
Az ősi emberi mikrobiomák a mikroszkóp alatt vannak, amit a tudósoknak mondanak a régen élő emberekről. Új tanulmány jelent meg a folyóiratban Határok az ökológiában és az evolúcióban 2020 februárjá
Az X-206 antibiotikum hatékony SARS-CoV-2 ellen in vitro
A COVID-19 világjárvány továbbra is számos súlyos és halálos kimenetelű tüdőbetegséget okoz, gyakran végződik többszervi diszfunkcióval és szív- és érrendszeri összeomlással. Vakcina vagy bizonyított