Sažetak pregled
Swanson književnost na bazi otkriće fokus na uskrsnuće prethodno objavljene, ali zanemarene znanje. U ovom istraživanju, predlažemo dva koraka model procesa otkrivanja je i generiranje hipoteza između anandamidom i raka želuca. Nadalje, potencijalni odnos je potvrdio follow-up eksperimentiranja. Tretman anandamid rezultiralo staničnog ciklusa preraspodjeli želučanih stanica raka. Što je najvažnije, varijacija staničnog ciklusa je posredovana nekih gena iz B-smislu zatvorenog otkrića, što ukazuje na potencijalnu ulogu B-uvjetima. Otkriće Swanson književnost na bazi collates ne samo podatke za moguće interakcije, ali također pruža mogućnost za promatranje veći pozadinu ove izravne veze i neprocjenjiv alat za otkrivanje za istražitelje pregled
Izvor:. Dong W, Liu Y, Zhu W, Mou Q, Wang J, Hu Y (2014) Simulacija Literatura bazi Discovery Swanson je: Anandamid Liječenje inhibira rast raka želuca stanica In vitro Urednik: Valli De Re, Centro di Riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institute, Italija pregled Primljeno: 12. siječnja 2014.; Prihvaćeno: 25. svibnja 2014; Objavljeno: 20. lipanj 2014 pregled Copyright: © 2014 Dong et al. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan financiranja. Ova studija je financiran od strane kineske Gerijatrijski onkologiju društva (onkologije programa, daje CGOS-03-2013-1-1-00600). U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled Uvod pregled brz razvoj znanosti doveo je do eksponencijalnog rasta u našoj bazi znanja. Prema tome, to je vrlo zahtjevna za medicinski istražitelji za popravljanje i ugraditi najrelevantnije, ažurirane informacije iz dnevnog poplave objavljenoj literaturi. Na primjer, ukupan broj publikacija indeksiranih traženi pojam 'rakom želuca' porastao više od 4 puta u 2012 u odnosu na 1980. Često najrelevantniji podatak sklon previdjeti ili zanemariti u tekućim istraživanjima [1]. Osim toga, s povećanjem specijalizaciju u područjima znanosti i tehnologije, veći izazovi postoje u dijeljenju informacija cross-funkcionalno, kao znanstveno razumijevanje postaje sve više fokusiran i manje raznolika. Međutim, smislen odnos mora postojati između različitih područja istraživanja. Dakle, to je važnije da se utvrdi ignorirati znanje od rasta informacijskog sama [2]. Pregled Swanson (1990) razvija i provodi novi alat za protuminsko postojeće baze znanja za neprijavljenih ili prijavljuju odnosa, i uskrsnuti prethodno objavljene, ali zanemarene hipoteze, proces poznat kao otkriće literature bazi [3]. Ovaj proces funkcionira kao način povezivanja 2 naizgled nepovezanih nalaza, ako nije drugačije navedeno u ovom obliku: ako je "A se odnose na B" i "B odnosi se na C", onda je pretpostavka da je "A uzrokuje C" je snažno sugerirao [4 ]. Iako ovaj pristup ne pružaju uvjerljiv dokaz, otkriće je, samo po sebi, vrlo korisna u otkrivanju do sada nepoznatih odnosa [5]. Nadalje, to može pomoći istražiteljima pristup kontekst i moje znanje da ne bi mogli biti otkrivena koristeći tradicionalne pretragu. Pregled U ovom istraživanju, proveli smo dva koraka pristup je za simulaciju književnost na bazi metodologiju otkrivanja Swanson je u 2 područja biološkog istraživanja literature koja se obično ne bibliografski povezana: rak želuca i psihologije. Rak želuca je jedan od najčešće dijagnosticiranih karcinoma, drugi vodeći uzrok raka povezanih smrti u svijetu, a ozbiljan zdravstveni problem [6]. Prethodna istraživanja također pokazala da različiti psihološki faktori mogu imati značajan utjecaj na fizičke bolesti. Međutim, odnos između raka želuca i psihologije je prethodno bio zanemaren. Dakle, ove 2 područja istraživanja su odabrani s ciljem pronalaženja zanemareno zajedničku vezu. Pregled Proces otkrivanja u 2 koraka ostvarila hipotezu o povezanosti anandamida i raka želuca i pod uvjetom mogući zajednički molekularnu mrežu koja može posredovati djelovanje. Hipoteza je tada istraživali eksperimentalno. Anandamid ustanovljeno je da inhibira rast 4 želučanim tumorskih staničnih linija, uključujući BGC823, SGC7901, AGS i N87. Protočna citometrija podaci pokazuju da prisutnost anandamid inducirane G2 /M staničnog ciklusa u AGS i N87 stanica. Nadalje, utvrdili smo da anandamid se reguliraju stanični ciklus povezanih gena, uključujući CHEK1, CDKN1A, lokusu CDKN2A, dobiven iz zatvorenog procesu istraživanja. Zajedno, ovi podaci ukazuju na to da anandamid utječe na raspodjelu staničnog ciklusa želučanih stanica raka tako što regulira regulatore B-termini staničnog ciklusa, hipotezu da je potvrđen eksperimentalno u ovom istraživanju, čime se osigurava istražiteljima zamjenskim pogled o ulozi anandamida. Koristeći ovaj pristup, bili smo u mogućnosti uspješno spojiti prethodno skriveni odnos između 2 različitih područja i doprinijeti ukupnom baze znanja. Pregled Načini i materijali za pregled Članci u bazu podataka Medline Netlogu National Institutes of Health (NIH) -sponsored MEDLINE /PubMed baza podataka sadrži linkove na članke objavljene u više od 5500 vodećih časopisa. Za stjecanje najpotpuniji seriju članaka za "rakom želuca", inkluzivnog serija za pretraživanje žice (novotvorina, želudac ili želuca neoplazme ili novotvorine, želuca ili novotvorine Želučane ili Želučani novotvorine ili želuca neoplazme ili novotvorine, Želučane ili raka želuca ili želudca ili raka želuca ili raka, želuca ili rak, želuca ili raka želuca ili želuca rak ili želučana ili rak i želuca ili karcinome želuca ili u želucu novotvorine) se koristi za preuzimanje odgovarajuće članke. Ovo pretraživanje preuzeti 86,536 evidencije (pristupljeno 27. listopada 2011. godine), u kojem su sve publikacije ušli u ovu bazu podataka. Osim toga, kako bi stekli najpotpuniji seriju članaka za "psihologiju", koji uključuje i niz od žice za pretraživanje (psihologiju ili nuspojave, psihološke ili fiziološke nuspojave ili psiholoških nuspojava ili nuspojava, psihološki ili psihosocijalnih čimbenika ili faktor, psihosocijalni ili Čimbenici; Psihosocijalni ili psihosocijalna Factor ili psiholoških čimbenika i čimbenika; Psihološki ili faktor i psihološke ili psihološki faktor ili psihologa ili psihologa) preuzete 911,793 zapisa. Sve ove publikacije su spremljene u Medline formatu za prikupljanje tezaurusa (mesh) uvjete. Pregled MeSH pojmovi MeSH je kontrolirani rječnik sinonima Nacionalne knjižnice medicine. MeSH se sastoji od seta smislu zove deskriptori koji su raspoređeni u oba abecednom i hijerarhijskih struktura, dakle, mesh Uvjeti mogu identificirati primarni fokus objave, a može se koristiti za indeks MEDLINE zapisa. U ovom istraživanju, ovi opisi su filtrirane upotrebom mrežica stoplist od 5,569 deskriptora specifične za predmetnih područja ove studije. Pregled Stoplists pregled stoplist je popis riječi koje treba isključiti ni jer su preopćenite ili su besmislene kao cilja za pretraživanje. Stoplists može uključivati čak nekoliko stotina funkcionalnih riječi koje nisu predmeti smjera. U ovom istraživanju, dugo stoplist od 5,569 riječi sastavio za filtriranje uvjete mrežice. Korištenje kategorije Mesh koje se nalaze u Medline baze podataka i istraživač presude, sastavio smo popise stop-pojmova, s kategorijama mesh na najvišoj razini prikazane su u tablici 1. Detaljne informacije o kategorijama mrežica može se naći na http: //www.nlm.nih .gov /mesh /2012 /mesh_bro-wser /MeSHtree.Dhtml. pregled open Discovery proces pregled na otvorenom otkriće proces počinje sa znanstvenog problema i generiranja hipoteza. U ovom istraživanju, izabrani su polja od raka želuca i psihologije u potrazi za skrivenim vezama. učitavaju se publikacije odnose na rak želuca i psihologije kako je prethodno opisano. Dalje, što se mrežasti profil je konstruiran za pokretanje A ili B temu. konstruirali smo temu profile identificiranje relevantnih podskupa karakterističnim uvjetima od odabira teksta. Uvjeti su izvađeni iz dokumenata i ocijeniti njihove relativne važnosti kao deskriptora u temi. U ovom istraživanju, naši profili su vagani vektori Mesh uvjetima, kao što je prikazano u nastavku za temu X i: pregled (1) gdje je m j predstavlja mrežasti pojam, w I , j predstavlja njegovu težinu, s ukupno n uvjeta u mreži rječnikom [7]. pregled Nakon što su izgrađene teme a i B, konačna kombinacija-C profila konstruiran korištenjem Java applet da smo razvijena. U ovom postupku, pojmovi koji se pojavljuju u oba A i B profila eliminirani su, zajedno s uvjetima koji su bili prisutni samo u profil. Na kraju, što se mrežasti pojmovi koji su bili prisutni samo u profilu B i rijetko se pojavio na profil odabrani su i nazvao C profil. Pojmovi u profilu C pokazao bliske veze s temom B i malo ili uopće nema veze na temu A. Drugim riječima, ti pojmovi ostao je usko povezana s "psihologije", ali su rijetko prijavljeni zajedno sa "raka želuca." Međutim, prethodno neobjavljena mogu postojati veza, koja može biti otkriven pomoću naknadnog postupka pregled zatvoreni proces otkrivanja pregled zatvoreni proces otkriće je izvedena pomoću web-based modela Arrowsmith (http:. //arrowsmith.psych. uic.edu/arrowsmith_uic/index.html, University of Illinois u Chicagu, Odjel za psihijatriju), koji je osmišljen kako bi se pomoglo razumijevanju i prepoznavanju skrivenih veza između dijelova literature na a i C [8], [9]. Pokrenuli smo zatvoreni proces otkrivanja s prva 2 Medline pretraživanja pomoću Arrowsmith obradu: A pretragu topic profila i C pojam literature pretragu. Dalje, Arrowsmith program generira popis pojmova koji bi se mogao naći u naslovima oba literature retrievals A i C. Ove riječi su analizirani za generiranje B-listu, koristeći treći korak filtriranja po: pregled na kraju, generira našu listu B-pojmova, a zatim gleda odgovarajuće AB i BC književnost retrievals. pregled kultura stanica pregled stanične linije korištene u ovom istraživanju bili su želučani stanične linije raka. Je N87 i AGS stanične linije dobivene su od American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA, USA). AGS stanična linija izvedena iz fragmenata tumora resected od pacijenta koji je bio 54-godišnji bijelac žena, a nije dobila nikakvu prethodnu terapiju. N87 stanična linija izvedena iz metastaze jetre od dobro diferenciranih želuca karcinoma bijelac mužjaka uzet prije citotoksične terapije. AGS i N87 stanice uzgajane su u Dulbeccovom modificiranom Eagle mediju (DMEM, Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), uz dodatak 10% fetalnog goveđeg seruma (FBS). Stanične linije BGC823 i SGC7901 su osnovana u Kini. Stanična linija BGC823 osnovana je 1984. godine kroz 60 prolaza stanične kulture u razdoblju od 2 godine od kirurškog uzorku pacijenata oboljelih od raka želuca, koji je dijagnosticiran kao niska diferenciranog adenokarcinoma. SGC7901 linija stanica je osnovana 1979. godine, a potječe iz limfnog metastaze želučanog adenokarcinoma od 56-godišnje kineske žensko. A BGC823and SGC7901 stanice uzgajane su u Dulbeccovom modificiranom Eagle mediju (DMEM; Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), uz dodatak 5% fetalnog goveđeg seruma (FBS); Sve stanične linije su održavane na 37 ° C u 5% CO 2. Pregled Analiza protočnom citometrijom status staničnog ciklusa i apoptoze Netlogu AGS i N87 stanice (1 × 10 5) rutinski su sakupljene tripsinek digestije nakon tretmana s anandamida (Sigma, A0580), ispere s PBS i fiksirane u hladnu 75% etanolu pri 4 ° C preko noći. Nakon bojenja s propidij jodid (PI) otopinu tijekom 30 min, analiza staničnog ciklusa izvedena je pomoću fluorescentne aktivira sortiranje stanica (FACS), kako bi se odredio postotak i distribucija stanica u G1, S i G2 /M fazi. Pregled za detekciju fosfatidilserina objelodanjenje, tripsinizirane stanice su dvaput obojani s fluorescein izotiocijanatom (FITC), koje je konjugirano aneksina V (20 ug /mL) i PI (50 ug /mL) u skladu s protokolom proizvođača (Biosea, Nelson, New Zealand ). Deset tisuća stanice su sakupljene i analizirane FACSorter, a stanični ciklus profili su analizirani korištenjem Cell Quest softver (Becton Dickinson, Franklin Lakes, NJ, USA). Pregled MTT test pregled BGC823, SGC7901, AGS i N87 stanice su stavljene u kulturu pločama s 96 jažica i inkubirano s anandamida pri različitim koncentracijama, a zatim 3- (4,5-dimetiltiazol-2-il) -2,5-d-iphenyltetrazolium bromida (MTT) na 24, 48, 72 i 96 sati. Nakon 4 h inkubacije pri 37 ° C u 5% CO 2, doda se 200 ul dimetilsulfoksida (DMSO) da se otopi formazan produkta. Apsorbancija pri 570 nm je određena upotrebom čitača mikroploče. (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA) pregled ekspresija gena profiliranje analiza pregled 2 različita RT2 Profiler PCR Nizovi (SA Biosciences , QIAGEN) su korišteni za analizu razine ekspresije 84 gena koji sudjeluju u regulaciji staničnog ciklusa (Human staničnog ciklusa polja, PAH-020) u AGS stanice tretirane anandamida ili vozilo. Stanice su sakupljene nakon 24 h, nakon anandamid liječenja i ukupna RNA se ekstrahira koristeći RNeasy Plus kita (Qiagen). Sintetski cDNA je upotrijebljena kao šablona za izvođenje kvantitativna lančana reakcija polimeraze (PCR) analize. RT2 profilerica PCR Array Data software (v3.5) korišten je za PCR analizu array podataka. Odabrali smo GAPDH i ACTB kao referentna gena. Gene s ekspresijom mnogostrukost promjene između uzoraka veći od 2, izabrani kao diferencijalni gena. Pregled Western blot analiza pregled Proteinske lizati su razdvojeni 12% tris-glicin elektroforezom na poliakrilamidnom gelu i prenese u poliviniliden fluorid ( PVDF) membrane (GE Healthcare, Little Chalfont, Velika Britanija). Membrane su inkubirane s mišjim monoklonskim protutijelom protiv ljudskog CHK1, p-CHK1 (Abcam, Cambridge, UK), CDC25A, CyclinB1 (Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA, USA), a zatim peroksidazom hrena (HRP) -označeni kozjim-anti -mouse IgG (PTGLab, Chicago, IL, USA). β-aktin (Sigma Chemicals, St. Louis, MO, USA) je korišten kao kontrola protein punjenja. HRP konjugat detektiran pomoću chemioluminescence ECL kita (Amersham) i autofluorography. Intenzitet Protein je kvantitativno pomoću LANE 1D analizator softver (Kadulja za izradu, Peking, Kina). pregled Statistička analiza pregled t-test je korišten za analizu značaja razlika između dviju skupina podaci. P . ≪ pregled, 0,05 se smatrala statistički značajna pregled Rezultati Stjecanje mrežaste uvjete za rak želuca i psihologije Netlogu U otvorenom procesu otkrivanja, prvi korak je da ekstrakt uvjete mesh iz retrievals literature. generira Mi 12,001 Mesh uvjete (profil), koristeći tekst za "raka želuca." Ove mrežaste uvjete koji su uključeni aspekti raka želuca koji uključuju dijagnozu, liječenje, lijekove, preživljavanje, stadij raka, funkciju stanica, gena, proteina i nekih kemijskih tvari kao što su esteri. generira Mi 9,635 Mesh uvjete (Profil b) korištenjem tekst za "psihologiju", koje su usko vezane uz društvenu okolinu, ponašanje, osobnost, osjećaje, vrste bolesti, terapije, lijekovi, kemijske tvari, itd Deset MeSH pojmovi iz svaka tema prikazani su u tablici 2. pregled Otkriće anandamida u profilu C (BA) pregled gore navedeni Java applet, eliminirani smo pojmovi koji se pojavljuju u profil od profila B, ostavljajući samo izrazi prisutni u profilu B, ali nikad se pojavljuju u profil. Ovaj novi set je bio identificiran kao "C profilom." Uvjeti u profilu C su prijavili da imaju više od 1 odnos s psihologije, ali malo ili nimalo publikacije istovremeno pozivom obje psihologije i rak želuca. Međutim, prethodno je odjavilo veze mogu postojati da nisu otkriveni, ili su zanemareni. Pregled Kako bi se dodatno istražiti potencijalne veze između tih područja, klasificirana smo uvjete profilu C u 6 kategorija, uključujući i ponašanje, organa i tkiva, raspoloženja, bolesti, lijekovi i kemijskih tvari, i druge. Svaki pojam posjeduje vlastitu frekvenciju; pojmovi koji imaju više frekvencije i reprezentativnosti prikazani su u tablici 3. Konačno, odabrali smo 1 pojam iz kategorije lijekova i kemijskih tvari, anandamida, za daljnje istraživanje. Razlozi za našu selekciju su prikazani u nastavku: pregled Iako su nekoliko istraživanja pokazala ispituje kako anandamide i raka želuca zajedno [10], [11], naš rad uskrsnuća usredotočuje na analizu putova ili mehanizme koji možda ne zna. pregled Predviđanje odnosa anandamid i rak želuca pregled Naša pretpostavka u vezi anandamid i karcinom želuca je testiran kroz zatvorena procesu istraživanja. Ovaj postupak je izveden korištenjem webu modela Arrowsmith; počevši od bolesti raka želuca (A) i tvar anandamida (C), tražili smo zajednički intermedijer B-uvjetima. U B-lista sadržavala title riječi i izrazi (pojmovi) koji su se pojavili u oba A i C literature. Kako su putevi pronađene između A i C postali su uobičajeni, povećan je vjerojatni valjanost naše hipoteze. Nakon potrebnih koraka navedenih filtera, 446 uvjeti bili prisutni na trenutnom B-liste, rangirani prema predviđenom važnosti. Dalje, ograničeni smo ove uvjete semantičke kategorije gena & Molekularna Nizovi i Gene & Protein imena i prikupljaju ciljnih gena koji su uključeni u različitih signalnih puteva uključujući staničnog ciklusa, apoptozu, upalu i sl (tablica 4). Istovremeno put mreža je izgrađena za prikaz zajednički molekularni regulatorni mrežu između karcinoma želuca i Anandamid djelovanja. Kao što se vidi na slici 1, ovi geni pokazao je visoku ovisnost označava regulatorne odnose između njih. Kako bi se dodatno ispitati valjanost tih ciljnih gena, nekoliko proteina /geni su izabrani kao primjere kako bi potvrdili svoju vezu na rak želuca ili anandamida kroz Arrowsmith SYSTEM. Te kao što je prikazano u tablici 5, grupa gena kritičnih sudjeluje u nekoliko puteva koji su povezani i raka želuca, te anandamida. Sve te tragove implicira potencijalno skrivenu vezu između anandamida i raka želuca, koji je bio vrijedan daljnje istrage. Pregled Detekcija učinka anandamida na želučane stanice raka Anandamid, kao član endocannabinoid obitelj, također poznat kao N Kako bi istražili učinak anandamida na proliferaciju stanica želuca raka, BGC823, SGC7901, AGS i N87 su tretirani s rastućim koncentracijama sintetička anandamid. Nakon toga, proliferacija tih staničnih linija se detektira MTT. Rezultati su pokazali da anandamid snažno smanjuje proliferaciju stope ta 4 staničnih linija raka želuca na način ovisan o dozi, a statistički značajno smanjenje ( p < 0.01 pregled) pri 100 uM. Štoviše, AGS i stanične linije N87 prikazuje više osjetljiv i dramatičan pad ( p < 0,01 pregled), čak i na 50 koncentraciji JM (slika 2b). Nadalje, ispitan je učinak anandamida pri nižim koncentracijama na staničnu proliferaciju u stanicama raka želuca. Kao što je prikazano na Slici 2C, značajna, smanjenje ovisan o dozi ( p < 0.01 pregled) u proliferaciji AGS i N87 stanica promatrana inhibicijom. Međutim, anandamid pri nižim koncentracijama proizveo mali učinak na BGC823 i SGC7901 stanicama (podaci nisu prikazani). Dakle, AGS i N87 stanične linije su više osjetljivi na anandamida nego BGC823 i SGC7901 staničnim linijama. Pregled Anandamid smanjena sposobnost rasta AGS i N87 stanica, dok je imao malo utjecaja na apoptozu u AGS i N87 stanica (Slika 2D). Dakle, mora postojati i drugi razlozi koji su doveli do smanjenja širenja. Pregled Utjecaj Anandamid tretmana na raspodjelu staničnog ciklusa želučanih stanica raka pregled Kako bi se dodatno ispitati karakteristike inhibicije rasta od anandamida je faze staničnog ciklusa je otkriven protočnom citometrijom. U AGS i N87 stanice na period logaritamskoj fazi rasta su inkubirani s 10 uM anandamida ili etanol otapala tijekom 24 h, zatim zaustavljen u G2 fazi staničnog ciklusa (slika 3A i 3B). Da se istraži efekt anandamida na progresiju staničnog ciklusa u detalje, i N87 AGS stanice su sinkronizirano u fazi G1 seruma gladi. Stanični ciklus je analiziran kada stanice se oslobađaju iz ovog blokiranja sa kompletnom mediju u prisutnosti ili odsutnosti anandamida. Stanice tretirane sa etanolskom otapalu umjesto anandamida su korišteni kao kontrole. Kao što se vidi na slici 3C, AGS stanice su sinkronizirani s više od 70% u fazi G1 DNA sadržaja nakon što su uzgojene u kulturi slobodnog u serumu. Od 6 sati, oko 46% kontrolnih stanica su u G1 fazi, a po 12 sati, većina (57.45%) bilo je u S fazi. Između 12 i 24 sati, stanice su u G2 /M fazi i prošao brzo mitoze, a do 24 sati, ušli su sljedeći stanični ciklus. Međutim, kada se stanice tretiraju s anandamida nakon oslobađanja iz G1 faze, 33.47% tretiranih stanica uhićeno G2 /M fazi i do 24 sata, te je pokazao odgođeno ulazak u sljedećem staničnog ciklusa. Sličan trend zabilježen je u N87 stanicama (Slika 3D). Uzeti zajedno, ovi rezultati pokazuju da anandamid tretman uzrokovao G2 /M uhićenje promatrati u AGS i N87 stanica. Pregled Utjecaj anandamida na regulatora staničnog ciklusa U svrhu analize molekularne mehanizme odgovorne za povećana arest staničnog ciklusa uzrokuje anandamidom, koristili smo 2 različita RT2 Profiler PCR polja (SA Biosciences, Qiagen) za određivanje razine ekspresije gena koji su uključeni u regulaciju staničnog ciklusa. Geni s izrazom fold promjene između stanica tretiranih sa anandamida i vozila veći od 2 su izabrani kao diferencijalne gena. Rezultati su pokazali da AGS stanice obrađene anandamida 24 sati prikazuje ukupno povećanje ekspresije G2 /M prijelazu vezane gene uključujući GADD45 i p21 waf i očito smanjenje G2 staničnog ciklusa regulatora uključujući CHEK1, CHEK2, Cdc25, CCNA2, CCNB1, CDKN1A, lokusu CDKN2A itd (Slika 4A). Kako bi se dodatno istražiti da li anandamid uzrokovane staničnog ciklusa od G2 /M kontroli kontrolne točke, Izvršili smo western blot analizu AGS stanicama prema Anandamid tretman za 24 h. Stanice tretirane sa etanolskom otapalu umjesto anandamida su korišteni kao kontrole. Kao što je prikazano na Slici 4B i 4C, anandamid uzrokovalo porast od CHK1 fosforilacije i smanjene razine ekspresije ciklin B1 i CDC25A usporedbi s opažanja u kontrolnim stanicama. Ovi podaci sugerirao da anandamid liječenje dovelo do povećane aktivnosti u G2 /M kontrolne točke. Pregled Rasprava pregled Korištenje literature temelji na metodologiju otkrivanja Swanson je, istražitelji mogu utvrditi nove odnose između naizgled nepovezanih područja, i uskrsnuti ranije objavljeni ali zanemarena hipoteze [15]. U ovom istraživanju, smo simulirali literature temelji na metodologiji otkriće Swanson je u 2 područja medicinske istraživačke literature koji nisu bibliografski povezani: rak želuca i psihologije. Nakon otkriće procesa u 2 koraka, anandamid je izabran i predviđa se da će biti povezan s rakom želuca. Dalje, potencijalni odnos između raka želuca i anandamida potvrdila je follow-up eksperimentiranja. Dakle, uspješno simulirao otkrića književnost bazi jer su hipoteze generira novi odnos koji je dokazano da su pouzdana. Pregled Rak želuca je multifaktorijalna bolest, uz brojne uzročni varijable što je prijavio, uključujući i H , pylori pregled, high-natrij dijeta, piće i pušenje [16]. Prethodna istraživanja u našem laboratoriju smo specijalizirana za rak želuca; Stoga je cilj ovog istraživanja bio je pronaći nova znanja u istraživanju raka području želuca. Ovaj pristup, koristeći otkriće Swanson književnosti bazi, dovelo do identifikacije anandamida, član od endokanabioida. Anandamid je izvijestila da pokazuju anti-proliferacije svojstva pri liječenju određenih vrsta raka, uključujući i neuroblastoma, raka prostate i melanoma [17] - [20]. Mayato [21] Također je izvijestio istraživanje o anandamida u raka želuca. Su istraživali inhibicijski učinak na anandamida želuca stanica raka i razjasniti funkciju anandamida povećati citotoksični učinak paklitaksela, i njihove zaključci o učincima anandamida na rast stanica u skladu s rezultatima ove studije. Međutim, neki geni (CHEK1, CDKN1A, lokusu CDKN2A, CCNB1, itd) iz B-smislu bliskom otkrića su regulatori staničnog ciklusa, što sugerira da anandamid može biti povezano s staničnog ciklusa kod raka želuca. Kao što se očekivalo, real-time PCR i Western blot testovi otkrili su da su izrazi tih regulatora staničnog ciklusa značajno su promijenjeni sljedeće Anandamid liječenja. Protočna citometrija ispitivanja nadalje potvrđeno da anandamid induciran G2 /M staničnog ciklusa u želučanim stanica raka kroz aktivni G2 /M kontrolne točke. To će biti prvi put da je stanični ciklus preraspodjela je otkriven u želučanim stanicama raka nakon što je tretirana s anandamida izravno i pojedinačno. Osim toga, rezultati su pokazali da su B-termini potencijalno mogla funkcionirati posredovanja efektore između bolesti i ciljeva otkriće. Pregled Za biološke istražiteljima, čuvanje up-to-date s trenutnom objavljenog istraživanja je kritična komponenta svakog istraživača opisom posla, a gotovo svaki objavljeni članak je prilika za pronalaženje novih veza između lijeka i bolesti. Međutim, trenutni volumen dostupnih bioloških znanosti je ogroman. Korištenje informiranu tradicionalnih pretraživanje, istraživači mogu promatrati ograničene veze između droge /molekule i bolesti, ali ne može prepoznati veće okruženje kroz koje djeluju odnosi, niti identificirati potencijalne odnose u tom okruženju. Dakle, Informacijske znanosti i dohvat su vrlo korisni alati za biološke znanstvenika. Otkriće Swanson književnost na bazi usmjerena je na uskrsnuti ranije objavljene, ali zanemarene hipoteze. Ako se otkrije izravna veza koja izgleda kao da se zanemariti, onda djelo uskrsnuća ispada da se analizira putove ili mehanizme koji možda ne zna. Drugim riječima, Swanson književnost na bazi metodologija otkriće nije samo rudnike podaci za moguće interakcije između bolesti i bolesti, bolesti i lijeka, odnosno bolesti i molekula, ali i pruža nam se s potencijalom za promatranje veći pozadinu ove izravne veze, poput molekularne mreže put u našoj studiji ukazuje na moguću vezu između raka želuca i anandamid djelovanja. Analizom podataka u ovom kontekstu, dobili smo interakcije i mehanizme između naizgled nepovezanih tema i njihovu kliničku važnost i značaj. Stoga, otkriće književnost na bazi Swanson je je učinkovit alat za traženje povezanog postojeće znanje iz empirijskih rezultata donosi na svjetlo odnosima koje su umiješane i još "ne brinu" (Marc Weeber, 2001). Pregled Također smo naišli neki izazovi u procesu istraživanja. Jedan od problema je bio s uvjetima mreže, sami, a dodatna vizualna provjera bila potrebna nakon ekstrakcije pomoću naše prilagođene Java applet. U otvorenom postupku otkrivanja, često nisu u stanju da prepoznaju skraćenice koji može predstavljati različite riječi, i zato smo ih ignorirali bez obzira na njihovu potencijalnu važnost. Osim toga, neki od pojmova su prikupljeni pomoćne riječi, što rezultira otpremnine. Osim toga, bilo je slučajeva kada sinonimi su u početku brojati zasebno zbog svoje pravopis, a ti duplikati morao biti riješen ručno. Unatoč tim problemima, otkriće povećanje metodologija literatura temelji na jasno predstavlja prednost u procesu otkrivanja novih odnosa iz različitih područja istraživanja. Pregled Swanson je izvorno razvio metodologiju otkrivanja literature bazi, te je rafiniranja ovaj proces za 30 godina s ciljem pomaganja istražitelji otkriti nepoznate ili neidentificiranih odnose između studija; problem koji je ostao slabo razumio do sada. Koristeći ovu metodologiju Discovery, našli smo o mogućoj interakciji anandamida i raka želuca, koji je duboko zakopano u ogromnim količinama dostupnih podataka, a koji je sada pouzdano potvrdila eksperimentiranja.
i kompjutora pregled. PLoS ONE 9 (6): e100436. doi: 10,1371 /journal.pone.0100436 pregled
-arachidonoylethanolamine ili AEA, pokazalo se aktivirati 2 različita G kanabinoidne receptore protein, tipu receptora kanabinoida 1 (CB1) i tip kanabinoida receptora 2 (CB2) [ ,,,0],12]. Anandamid sintetizira iz N-arahidonoil fosfatidiletanolamina (NAPZ) i njezina razgradnja se prvenstveno katalizirana masne kiseline hidrolaze (FAAH) enzima koji katalizira pretvorbu nizvodno anandamida u etanolamin i arahidonske kiseline. Struktura anandamida obuhvaća funkcionalne skupine amida, estera, i etere dugog lanca polinezasićenih masnih kiselina, [13]. Ti spojevi pokazuju "kanabimimičkih aktivnost"; drugim riječima, da mogu djelovati kao "D-9-tetrahidrokanabinol (THC) mimetike", aktivni sastojak kanabisa. U anandamid struktura dijeli kritične farmakofora s THC [14] (Slika 2). Pregled
Gornja endoskopija
Metakarkodiranje DNA moglo bi poboljšati analizu ljudske prehrane
Istraživanja pokazuju da invazije crijevnih parazita smanjuju ozbiljnost COVID-19
Vodikov dah nije s atola Bikini
Sigurno je hraniti kućne ljubimce sirovom hranom,
Dobre vijesti za oboljele od IBS -a jer istraživači identificiraju "svrbež u crijevima"
Dijabetes tipa 1 povezan je s mikrobiomom crijeva i genetskim čimbenicima
Novo istraživanje sa Sveučilišta Lingköping u Švedskoj i Sveučilišta u Floridi otkrilo je da se crijevni mikrobiom djece s visokim genetskim rizikom od razvoja dijabetesa tipa 1 znatno razlikuje od dj
Je li carski rez dobar za zdravlje djece?
Nedavna studija koju je objavio VATT Institut za ekonomska istraživanja sugerira da je neplanirani CS izveden radi indikacije koja se možda mogla izbjeći, ima samo uzročno-posljedičnu vezu s astmom od
Zašto biste trebali uključiti prirodne izvore vlakana u svoju prehranu
Zanimanje za dijete s niskim udjelom ugljikohidrata, poput ketogene dijete ili Atkinsa, poraslo je posljednjih godina. Međutim, poput loših masti i dobrih masti , ugljikohidrati se također mogu razdvo