célkitűzés
genetikai variánsai szabályozó a gazdaszervezet immunrendszere hozzájárulhat a fogékonyság a fejlesztési gyomorrák. Keveset tudunk a szerepe a veleszületett védettséggel és non-Hodgkin-limfóma (NHL) -függő gének gyomorrák kockázatát. Ez eset-kontroll vizsgálatot végeztek azonosítani jelölt gének gyomorrák kockázata a további vizsgálatok. Katalógusa
Módszerek katalógusa
A Discovery fázisban 3072 SNP 203 veleszületett védettséggel és 264 NHL-kapcsolt gének a fénybe GoldenGateTM OPA Panel elemezték 42 illesztett eset-kontroll szett kiválasztott koreai Multi-center Cancer kohort (KMCC). Hat jelentős SNP négy veleszületett immunitás ( DEFA6, DEFB1, JAK3, katalógusa, és ACAA1 katalógusa), és 11 SNP kilenc NHL kapcsolatos gének ( INSL3, CHMP7, BCL2L11, TNFRSF8, RAD50, CASP7, Chuk, CD79B, katalógusa, és CLDN9 katalógusa) egy permutált p katalógusa -érték < 0,01 újból genotipizált a replikációs fázis között 386 esetben, és 348 kontroll. Esélyhányadosok (OR) gyomorrák kockázatát becsültük az életkor, a dohányzási státusz, és H. pylori katalógusa és CagA szerológiai pozitivitás. Összefoglalva legkülső régiók a teljes vizsgálati populációban (428 esetben, és 390 kontroll) mutatjuk be a pooled- és metaanalízis. Katalógusa Eredmények katalógusa Négy SNP nem volt heterogenitás az egész szakaszból áll: a meta elemzés, DEFA6 katalógusa rs13275170 és DEFB1 katalógusa rs2738169 egyszerre volt a 1,3-szor magasabb esélyhányados (OR) gyomorrák (95% -os CI = 1,1-1,6 és 1,1-1,5-kal) . INSL3 Következtetések katalógusa Eredményeink arra utalnak, hogy egyes változatok a veleszületett immunitás és az NHL kapcsolatos gének befolyásolják a gyomorrák kockázatát, talán modulálja fertőzés-gyulladás immunitás mechanizmusok még meg kell határozni. katalógusa Citation: Park SK, Yang JJ , Oh S, Cho LY, Ma SH, Shin A, et al. (2012) a veleszületett immunitás és Non-Hodgkin limfóma (NHL) rokon gének egy eset-kontroll tanulmány gyomorrák kockázata. PLoS ONE 7 (9): e45274. doi: 10,1371 /journal.pone.0045274 katalógusa Szerkesztő: Georgina L. Tartás, University of Aberdeen, Egyesült Királyság katalógusa Beérkezett: May 10, 2012; Elfogadva: augusztus 14, 2012; Megjelent: szeptember 21, 2012 katalógusa Copyright: © Park et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa Forrás: Ez a munka támogatott a támogatás a Basic Science Research Program a Nemzeti Kutatási Alapítvány Koreai Minisztérium támogatja az Oktatási, Tudományos és Technológiai [2009-0066258] és BRL (Basic Research Laboratory) programot a Nemzeti Kutatási Alapítvány Koreai támogatott az Oktatási Minisztérium, Tudományos és Technológiai [2011-0001564]. A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa Bevezető a gyomorrák a második leggyakoribb oka a daganatos halálozás a világon [1] a megjelölt földrajzi és etnikai előfordulás gyakorisága és halálozási [2]. Helicobacter pylori katalógusa ( H. Pylori katalógusa) fertőzés, amely a Nemzetközi Ügynökség Rákkutató (IARC) a gyomorsav rákkeltő, egy bevált oki tényezője gyomorrák [1], [2]. Mindazonáltal néhány epidemiológiai tanulmány arról számolt be, annak ellenére magas H. pylori katalógusa előfordulási gyakorisága, előfordulása gyomorrák alacsony néhány ázsiai és afrikai lakosság, az úgynevezett ázsiai /afrikai talány [3], [4]. Ez rejtély oka lehet, hogy a többi kockázati tényezőt különbségek az egyéni hajlam a gyomorrák. Katalógusa H. pylori Tekintettel arra, hogy 1) a személy genom egy tényező az egyéni érzékenység; és 2) H. pylori bizonyítékok alapján feltételeztük, hogy a genetikai variánsok a normális immunválasz ( vagyis a veleszületett immunitás kapcsolatos gének) és normál immunválasz (azaz az NHL kapcsolatos gének) befolyásolhatja a gyomorrák kockázatát modulálja az egyéni hajlam különbségeket. Ahhoz, hogy értékelni tudjuk a hipotézist, végeztünk egy kétlépcsős genetikai elemzés többek között: 1) a Discovery fázis hogy vizsgálja meg a 1536 SNP 203 veleszületett immunitás gén és 1536 SNP 264 NHL kapcsolatos gének felhasználásával GoldenGate (Illumina) oligonukleotid medence vizsgálattal (OPA) és 2) a replikációs fázis tovább elemezzük a legjelentősebb SNP Discovery fázisban. katalógusa anyagok és módszerek katalógusa szakterületektől katalógusa az alanyokat választott koreai Multi-központ rák kohort (KMCC) ebben a populációban alapú eset-kontroll vizsgálat. A kialakítás és a mintavételi stratégia az KMCC már részletesen ismertetjük másutt [10] - [12]. Röviden, 1993-2004, összesen 19.688 résztvevőt toboroztak négy városi és vidéki területek Koreában. Minden résztvevő 1) írásos beleegyezését formában, mielőtt a kohorsz; 2) kitöltött részletes standardizált kérdőívet személyes interjú; 3) levett vér és vizeletmintát; és 4) passzívan követik nyomon a rekord kapcsolatok a nemzeti halotti bizonyítvány, egészségügyi biztosítás az orvosi nyilvántartási adatbázisok és a Nemzeti Rákregiszter. katalógusa 2001 decemberében összesen 100 eset gyomorrák esetet újonnan azonosított szerint a betegségek nemzetközi osztályozása 10. Revision (BNO-10, C16). Közülük 42 esetben 42 illesztett kontroll életkor, nem, regisztrációs területet, és az év vontak be a Discovery fázisban sikeresen genotipizált a GoldenGate (Illumina) oligonukleotid medence vizsgálattal (OPA) panelek. A replikáció fázisában, a tanulmány népességek a következők: 1) az ugyanazon módszertan esetében megállapítások, a fent említett, 199 gyomorrákos esetet továbbá meghatározott a KMCC 2008 decemberében és kiegyenlített 01:01 ellenőrzéseknek kor szerint ( ± 5 év), a szex és a beiratkozási év; 2) a Chungnam Egyetemi Kórház és Hanyang Egyetem GURI Hospital, 189 újonnan diagnosztizált gyomorrák esetek verbuválódtak 2002. március 2006. szeptember írásos beleegyezését adta, és a vérmintákat a diagnózis időpontjában vagy azt megelőzően gyomorrák műtét és 3) összesen 189 közösségi alapú ellenőrzések igazítottuk az életkor (± 5 év), a szex és a beiratkozási év véletlenszerűen kiválasztott KMCC. A 388 eset-kontroll mérkőzések, két esetben és negyven ellenőrzések megszűntek miatt rossz genotípus-ráta és genomi DNS szinten. Végül 386 esetben és 348 kontroll elemezték a replikációs fázis. Katalógusa Emellett alapuló szerológiai alapú érzékelés, H. pylori fertőzés katalógusa és CagA /VacA szeropozitivitást értékeltük között a vizsgálati alanyok szereplő mindkét fázisban. Az immunoblot Helico blot 2.1 ™ (MP Biomedicals Asia Pacific, Szingapúr), ami biztosítja a magas érzékenység (99% mindkét pylori katalógusa és CagA szeropozitivitás), valamint specificitás (98% H . pylori Etikai Nyilatkozat katalógusa A vizsgálati protokollt az KMCC és a genetikai vizsgálat hagyta jóvá az intézményi etikai bizottság a szöuli Nemzeti Egyetemi Kórház (H-0110-084-002, és a C-0603-161-170 -kal). Ezen kívül, a kórház-alapú gyomorrák jóváhagyta a vizsgálatot az intézményi Review Board Hanyang University Hospital (IRB no.2003-4). Minden vizsgálatban résztvevők írásos beleegyezését formában, mielőtt a vizsgálat. Katalógusa SNP Selection és genotípusmeghatározó katalógusa A Discovery fázisban a Illumina GoldenGate ™ OPA Panel célja az volt, 203 veleszületett immunitás és 264 NHL kapcsolódó jelölt gének felhasználásával SNP a SNP500Cancer projekt (http://snp500cancer.nci.nih.gov) ismert re-szekvencia adatokat és génnel kapcsolatos karcinogén mechanizmusok [14]. Fókuszálás a régiót, amely a 20 kb-5 'kezdete transzkripció (exon 1) és 10 kb 3' végén az utolsó exon (N) minden egyes jelölt gén jelölt SNP-t előzetesen átvizsgáljuk. Ezt követően, Tag SNP-t választott a tervezhető sor SNP, amelyek részei voltak a Nemzetközi HapMap Project (http://www.hapmap.org/index.html) és a későbbi ismétléseket, szoktuk TagZilla (http: //tagzilla .nci.nih.gov) szerint az alábbi kritériumoknak: 1) minor allél gyakorisága (MAF) > 0,05; 2) tervezés pontszám = 1,1; és 3) r 2 > 0,8 cut-off használatával dbSNP származó HapMap kaukázusi (CEU) (nem közölt adatok). 55% -a az SNP-k található a intronok, 22% -kal a promoterek (határoló régió, UTR), 15% 3 'a stop kodont (STP), és 9% a exonok; között az SNP-k voltak elhelyezve exon, 73% -uk nem szinonim és 27% -uk nonsynonymous változások [15]. katalógusa Ezek a 1536 SNP rendelt veleszületett immunitás kapcsolatos gének, 384 SNP miatt zártak ki a MAF <0,05 (151 SNP), a HWE p katalógusa -érték < 0,0001 (1 SNP), monomorphism (162 SNP), és a vizsgálati problémák (71 SNP). Az NHL kapcsolatos panel, levettük 396 SNP egy HWE p katalógusa -érték < 0,0001 (2 SNP), a MAF < 0,05 (143 SNP), esszé problémák (50 SNP), és monomorphism (201 SNP). Végül, a statisztikai elemzés tartalmazza 1151 SNP a veleszületett immunrendszer panel és 1140 SNP az NHL-ben panel 42 eset-kontroll szett igazítottuk az életkor, a nem, a területen, és a beiratkozási év. Katalógusa A genotipizálást genomikus DNS kivont perifériás vérben a Gentra Puregene Blood Kit (Gentra, Minneapolis, USA), a Core Genotyping Facility (KGA) az osztály a Cancer Epidemiology és Genetikai National Cancer Institute. Ebben a vizsgálatban a genotípus befejezése genomi DNS-mintákon meghaladta a 95%. Katalógusa A replikáció fázisában hat SNP négy gén a veleszületett immunitás gén panel ( DEFA6 katalógusa rs2738120, DEFB1 Statisztikai elemzés katalógusa A Hardy-Weinberg (HWE) a kontroll csoportot is értékelték, a chi négyzet próbát vagy Fisher-féle egzakt tesztet egy cut-off szint HWE < 0,0001. A kiválasztott jellemzők alkalmazásával értékeltük χ 2 kategorikus változók és t katalógusa tesztek folyamatos változók. Mi értékelte a szövetség között egyes SNP-k és a gyomorrák kockázatát alapján mind a nyers és permutált p katalógusa -értékei hogy számították a valószínűsége hányados teszt (LRT) 1 fokú szabadságot a trend (additív) modell . A trend teszt feltételezi egy dózis-hatás hatás (azaz lineáris hatás) egyre több variáns allélek. Permutált p katalógusa -értékei becsültük 10000 permutáció vizsgálatok. Esélyhányadosok (OR) és a 95% -os konfidencia intervallum (95% CI) becsülték logisztikus regressziós modell az életkor, a dohányzás állapot (igen vs. Katalógusa nincs), H. pylori katalógusa fertőzőképesség és CagA virulens tényezők (pozitív vs. Annak elkerülése érdekében hamis asszociációkat hamis pozitív eredmények, kiválasztottuk az összes SNP legjelentősebb p katalógusa -érték minden gén és Benjamini- Hochberg téves elfogadási arány (BH-FDR) korrigált p katalógusa -értékei egyes SNP számítottuk szerint a gének száma [18]. Elsősorban kiválasztott jelentős SNP egy permutált p katalógusa -érték < 0,01 és BH-FDR p katalógusa -érték < 0.2. Katalógusa A replikáció fázisában, a legjelentősebb SNP azonosított Discovery fázisban átértékelte. Alapján az adalékanyag, vagy recesszív modell, gyomorrák kockázatát becsülték a legkülső régiók és a 95% -os logisztikus regressziós modell beállításával azonos kovariáns fent említett. Összefoglalva az eredményeket a Discovery és a replikációs fázis pooled- és meta-analízist végeztek. A fix-hatás modellt, a legkülső régiók és össze 95% -os számoltunk. Ezen túlmenően, a heterogenitás az egész tanulmányok értékeltük a Cochran Q statisztika [19]. Minden statisztikai analízist végzünk a Plink szoftver verzió 1,06 (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/Plink) és a SAS szoftver verzió 9.1 (SAS Institute, Cary, North Carolina). katalógusa Eredmények katalógusa esetek és a kontrollok hasonló volt az életkor, H. pylori fertőzés A genotípusok gyakoriságát minden SNP nem tért el a Hardy-Weinberg (HWE) ( p katalógusa > 0,0001). katalógusa a Discovery fázisban hat SNP négy gént ( DEFA6, DEFB1, JAK3 katalógusa, és ACAA1 katalógusa ) között 1152 SNP választott veleszületett immunitás kapcsolatos gének és 11 SNP kilenc gén ( INSL3, CHMP7, CASP7, RAD50, Chuk, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11, katalógusa, és CLDN9 katalógusa) között a 1104 SNP 246 NHL kapcsolatos gének szignifikáns összefüggést mutattak a gyomorrák kockázatát szerint permutált p katalógusa -értékei ( p katalógusa < 0,01). Kijavítása után a többszörös összehasonlítások, csak két SNP, DEFA6 katalógusa rs2738120 és DEFB1 katalógusa rs2702829 maradt marginálisan szignifikáns gyomorrák (FDR = 0,08 és FDR = 0,08), ami azt mutatta, fokozott kockázata gyomorrák (OR [95% CI] = 4,1 [1,6-10,4] és 2,9 [1,3-6,1] esetében). Az NHL kapcsolatos gén panel egyik SNP kilenc gén maradt marginálisan szignifikáns (FDR-BH p katalógusa -érték = 0,09); INSL3 katalógusa rs10421916 járt egy jelentősen csökkent gyomorrák (OR [95% CI] = 0,6 [0,3-0,97]) (2. táblázat). Katalógusa A kombinált elemzést (azaz, összegyűjtöttük és meta analízis), amely tartalmazza a Discovery és replikációs fázis, két SNP, DEFA6 katalógusa rs13275170 és DEFA1 katalógusa rs2738169 a veleszületett immunitás gének és INSL3 Vita katalógusa A kétlépcsős genetikai asszociációs vizsgálat 1536 SNP 203 veleszületett immunitás kapcsolatos (vagyis a normális immunválasz kapcsolódó) gének és 1536 SNP 264 NHL-függő (azaz a kóros immunválasz kapcsolódó) gén hogy meghatározzuk változatok veleszületett immunitás és NHL összefüggő géneket társított gyomorrák. A Discovery fázisban hat SNP négy veleszületett immunitás gén ( DEFA6, DEFB1, JAK3 katalógusa, és ACAA1 katalógusa), és 11 SNP kilenc NHL kapcsolatos gének ( INSL3, CHMP7 , CASP7, RAD50, Chuk, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11, katalógusa, és CLDN9 katalógusa) szignifikáns összefüggést mutattak a gyomorrák kockázatát (permutált p katalógusa < 0,01); és miután a BH-FDR teszt a gének 42 db esetek és kontrollok, DEFA6 katalógusa és DEFB1 katalógusa a veleszületett immunitás gén panel és a INSL3 katalógusa az NHL-ben val kapcsolatos gén panel szignifikáns összefüggést mutattak a gyomorrák kockázatát (BH-FDR p katalógusa < 0,1). A replikációs genotípus-fázis több eset-kontroll készletek és a meta- és analízisével, DEFA6, DEFB1 katalógusa, és INSL3 katalógusa még szignifikáns összefüggést a gyomorrák kockázata nélkül heterogenitás az egész fázisban. DEFA6 katalógusa (defenzin alpha 6, Paneth sejt-specifikus) és a DEFB1 katalógusa (defenzin beta 1), amely tartozik a defenzin családtagok, áll 6 humán béta-defenzinek (hBD1-hBD6) és két humán alfa-defenzinek (HD5-HD6), és döntő szerepet játszanak a gazdaszervezet védekezésében mechanizmus, különösen az antimikrobiális aktivitását és citotoxicitását a neutrofilek [20], [21]. Defensinekről indukálható gyulladás vagy fertőzés ellen tud állni a bakteriális kolonizáció a hámsejtek felületeken, beleértve a gyomor-nyálkahártya [22] - [24]. Különösen defenzin kötődik lipopoliszaharid a H. pylori katalógusa sejtfalon és a defensin- H. pylori A INSL3 katalógusa gén fehérjét kódolja INSL3, ami egy inzulin- mint hormon. A INSL3 fehérje keletkezik elsősorban gonadális szövetekben az emberi szervezetben; Azonban már azonosították a tumor szövetekben a gyomor-bél traktus [29]. Keveset tudunk arról, hogyan INSL3 katalógusa gén beavatkozik az emberi kialakulásában. Ezen túlmenően, ez nem jól ismert, hogy a genetikai variánsai a INSL3 Számos gének (azaz JAK3, CHMP7, CASP7, RAD50, Chuk, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11 katalógusa, és CLDN9 katalógusa) mutatott szignifikáns összefüggést a gyomorrák, a Discovery fázisban, bár nem jelentős a BH-FDR teszt. JAK3 katalógusa, TNFRSF8 katalógusa, és Chuk katalógusa érintheti a krónikus gyulladás és immunitás H. pylori Bár ez a vizsgálat egy két szakaszban genetikai asszociációs vizsgálat számos korlátozás a tanulmány. Először is, a legtöbb a gének nem legyőzni a heterogenitás egész Discovery és replikációs fázis. A heterogenitás tulajdonítják, hogy a különböző statisztikai ereje minden fázis: A minta kis mérete, a Discovery fázisban eredményezett elfogult legkülső (azaz túlértékelni), és az eredmény statisztikailag különböztetni a normál becsült értékeket a replikációs fázis. Bár a megoszlása a környezeti tényezők között az esetek megállapítható egy közösség kohorszvizsgálatban és kórházi alapú esetekben némileg eltér egymástól, a MAFs legtöbb SNP volt kicsi a különbség. Másodszor, rétegzett elemzés kapcsolatos változatos jellemzőit gyomorrák (azaz szövettani altípus, a szív vs. Katalógusa nem szív eredetű; diffúz típusú vs. Katalógusa bél típusú, és TNM) és /vagy független kockázati tényezők (pl életkor, nem, és H. pylori fertőzés katalógusa állapot) nem lehetett elvégezni, mert 1) a homogén jellege a vizsgált populáció (azaz a legtöbb betegnél nem szív-típusok vagy határozatlan típusú, és 95%, és az intesztinális és diffúz típusú volt kevesebb, mint 3%); és 2) egy részlet hiánya információk a kórszövettani adatok miatt passzív nyomonkövetési adatok felhasználásával kötés módszerek. Harmadszor, mivel a tag SNP alapján szelektálták adatokat a kaukázusi populációban, az ázsiai-specifikus genetikai markerek lehet figyelmen kívül hagyni a tervezési szakaszban. Végül, de nem tudtuk megerősíteni a funkcionális hatás az SNP molekuláris szinten. Így az eredmények óvatosan kell értelmezni. Annak ellenére, hogy a korlátozásokat, a tanulmány szemben stabil több torzítást, amik a retrospektív tervek miatt populáció alapú eset-kontroll kialakítása. Katalógusa Összefoglalva, eredményeink arra utalnak, DEFA6 katalógusa DEFB1 katalógusa, és INSL3 katalógusa genetikai variánsok hajlamosító tényezők a gyomorrák kialakulásával. További vizsgálatok a nagyobb esetszám és egy jelentős genomi lefedettség lehetővé teszi számunkra, hogy feltárja a patológiás mechanizmusok gyomorrák. Ezenkívül további biológiai vizsgálatok középpontjában ezek a gének tisztáznia kell saját szerepét a gyomorrák kialakulásában. Katalógusa alátámasztó információk katalógusa alátámasztó információk S1. Köszönetnyilvánítás katalógusa Köszönjük dr. Stephen J. Chanock, Robert Welch, Nathaniel Rothman, aki segít a kezdeti genotípus-ben az Egészségügyi Minisztérium és Humán Szolgáltatások, Core Genotipizálás szolgál az Advanced Technology Center A National Cancer Institute, és az osztály Cancer Epidemiology és Genetikai National Cancer Institute Bethesda, Maryland, USA katalógusa
rs10421916 és rs11088680 egyszerre volt a 0,8-szeres, csökkent vagy gyomorrák (95% -os CI = 0,7-0,97 és 0,7-0,9 -kal). Katalógusa
fertőzések, krónikus gyomor gyulladás lép fel, és ahhoz vezet, hogy immunválaszt, amely tartalmazza a normális (azaz, a veleszületett immunitás) és abnormális immunválasz, amely gyakran előfordul a non-Hodgkin-limfóma (NHL) [5] - [8]; és ezek a folyamatok vezetnek atrófiás gasztritisz, majd metaplázia és diszplázia, és végül csatlakoztassa a fejlődés a gyomorrák [5] - [8]. Így azt feltételezzük, hogy normális immunválasz által kiváltott H
. pylori fertőzés katalógusa köze lehet az abnormális immunválasz a közvetlen és /vagy közvetett módon, és végül, talán meg a végső kimenetele, mint a gyomor adenokarcinóma, limfóma és más rosszindulatú. Katalógusa
fertőzés gyomor szöveti gyulladáshoz vezet, ami viszont indukálja normális /abnormális immunválasz, kódoló gének fehérjék kapcsolódó fogadó normális és /vagy rendellenes immunitás fontos lehet az egyéni fogékonyság gyomorrák kockázatát. Számos epidemiológiai vizsgálatok kimutatták, hogy a gének kapcsolódnak a gazda immunválaszát kritikus szerepet játszanak a gyomor karcinogenezis: 1) proinflammatorikus fogadó genotípusok indukált hypochlorhydric /atrófiás válaszok gyomor H. pylori fertőzés katalógusa, amely halad noncardia gyomor adenokarcinóma [6]; 2) egy genetikai variánsát TLR9
amely fontos szerepet játszik a veleszületett immunrendszer, szignifikánsan összefüggött a H. pylori katalógusa indukált humán papillómavírus gyomor változások [7]; 3) TLR4 katalógusa Asp299Gly lehet genetikai fogékony tényező gyomornyálkahártya-asszociált lymphoid szövet (MALT) lymphoma [8]; és 4) a CD14 katalógusa genetikai variánsok szerepe lehet a fejlesztés gyomor MALT lymphoma [9]. katalógusa
és 90% CagA szeropozitivitás) között a koreai lakosság [13], a szérum mintákat és egymással összhangban a gyártó utasításai szerint. Tekintettel arra, hogy CagA termelő H. pylori katalógusa jelentősen kapcsolódó fokozott kockázata gyomorrák, H. pylori katalógusa és CagA szeropozitivitást kezelték hatásos kovariánsoknak gyomorrák és korrigált statisztikai modelleket. katalógusa
rs2702829, DEFA6 katalógusa rs13275170, JAK3 katalógusa rs2286662, DEFB1 katalógusa rs2738169, és ACAA1 katalógusa rs2239621) és 11 SNP kilenc gének NHL panel ( INSL3
rs10421916, CHMP7 katalógusa rs7463256, BCL2L11 katalógusa rs686952, TNFRSF8 katalógusa rs755398, INSL3
rs11086080, RAD50
rs17772583, CASP7 katalógusa rs11196422, Chuk katalógusa rs2230804, CD79B katalógusa rs2003549, CLDN9 katalógusa rs11862306, és TNFRSF8
rs641941) választottak szerint az alábbi kritériumoknak: a SNP-1) egy permutált p katalógusa -érték + 0,01; és /vagy 2) Benjamini- Hochberg téves elfogadási arány (BH-FDR) korrigált p katalógusa -értékei < 0,2 a legjelentősebb SNP az összes gén, a Discovery fázisban. Genotipizálás segítségével végeztük Illumina VeraCode GoldenGate tesztben, BeadXpress szerint a gyártó utasításai (Illumina, San Diego, CA, USA) [16]. Megbízhatósága érdekében a genotipizáló módszerekkel a két fázisban, 188 mintákat genotipizált kétszer mindkét módszerrel. A konkordancia arány > 98,4%. Két eset és negyven ellenőrzések elégtelen DNS vagy genotípus-lehívási mérték < 90% kizárták. Katalógusa
negatív), amelyekről azt állítják rizikófaktorai gyomorrák, bár a változók nem voltak szignifikánsak adatainkat. Ha az adatok gyér és aszimptotikus közelítés alapján logisztikus regressziós modellek megbízhatatlan, pontos következtetést kell tekinteni [17]. Így, ha a genotípus gyakoriság akár az esetek vagy vezérlők kevesebb volt, mint 10% (N = 4), pontos logisztikus regressziós analízist végeztünk kiszámítja a legkülső régiók és a 95% -os. Katalógusa
, CagA /VacA szeropozitivitást, ivás állapotát, és gyomorfekély története. A marginálisan szignifikáns és jelentős különböző eloszlás cigarettázás között esetek és a kontrollok volt megfigyelhető a replikáció és analízisével (1. táblázat). Katalógusa
rs10421916 és rs11086080 a az NHL kapcsolatos gének szignifikáns maradt járó kockázat gyomorrák (meta OR = 1,3 [95% CI: 1,1-1,6]; meta OR = 1,3 [95% CI: 1,1-1,5]; meta OR = 0,8 [95% CI : 0,7-0,97]; meta OR = 0,8 [95% CI: 0,7-0,9] esetében). Nem volt heterogenitás egész elemzések (Cochran Q-teszt, p katalógusa > 0,05) (3. táblázat). Katalógusa
komplex aktiválja a NF-kB jelátviteli útvonal gyomor karcinogenezis [25]. A legújabb vizsgálatok azt mutatták, defenzinek szerepet játszanak a rák fejlődését fejeztük különféle humán tumorok, beleértve a gyomorrák [26] - [28]. Mint az egyik potenciális ügynökök gyomor karcinogenezis defenzinekkel kölcsönhatásba léphet H. pylori fertőzés katalógusa mindkét ellenállás és védelme, valamint a rendellenes tevékenységek indukálják az első lépés a gyomorrák fejlődését. Így lehetséges, hogy egyes variánsok DEFA6
és a DEFB1
befolyásolja a fogékonyság gyomorrák módosításával a gyulladásos válasz megváltoztatása révén az expresszióját vagy funkcióját azokat a fehérjéket. Eredményeink arra utalnak, hogy a DEFA6 katalógusa rs2738120 (intron található) és a DEFB1 katalógusa rs2702829 (található a 3 'STP) potenciális genetikai hatások a gyomorrák kialakulásával. Sokfélesége ellenére a felfedezés és replikációs szakaszra, a többi helyen a DEFA6 katalógusa (rs2738120) és a DEFB1 katalógusa (rs2702829) szintén jelentős eredményeink. További vizsgálatokat kell végezni, hogy vizsgálja meg a pontos biológiai funkciója a SNP kapcsolódó defenzin aktivitás és /vagy celluláris kapacitás. Katalógusa
gén kapcsolódik a gyomor karcinogenezis, de az E vizsgálat eredményei azt mutatják, hogy legalább két SNP (rs10421916 található az intron és rs11086080 található 3 'STP) erős kapcsolódási egyensúlyban (D' = 0,86, LOD = 13,42, és r 2 = 0,56) úgy tűnik, hogy van egy erős szövetség kockázatának csökkenésével gyomorrák. Bár a kísérleti bizonyíték arra, funkcionális hatása SNP molekuláris szinten nem elegendő a dátum, úgy véljük, hogy INSL3 katalógusa rs10421916 és rs11086080 befolyásolhatják az egyéni érzékenység a gyomor kialakulásában. A további kutatás, beleértve a mélyreható in vivo katalógusa és állatkísérletekből kell tenni, hogy tisztázza az oksági mechanizmusok és a INSL3 katalógusa genetikai hatásokat, amely az emberi gyomor kialakulásában. Katalógusa
kolonizáció felé gyomorrák, ami fontos a gyomor karcinogenezis a következők: 1) JAK3
részt vesz a citokin-receptor által közvetített intracelluláris jelátvitel, és a citokin-receptor-ben gyakran megtalálható a humán gyomorrák szövet [30]; 2) TNFRSF8
közvetített jelátviteli aktiválásához vezet az NF-kB [31]; és 3) a Chuk katalógusa részt vesz az NF-kB jelátviteli aktivált H. pylori
a gyomorrák-sejtek [32]. Tekintettel arra, hogy az emberi gyomor kórokozó H. pylori katalógusa fejti sok a kórokozó képesség indukálva DNS-károsodás és apoptózist fogadó gyomornyálkahártya-sejtek [33], BCL2L11, CASP7 katalógusa, és CD79B
jelentett, hogy kapcsolódik az apoptózis [34 ] - [38], és RAD50 katalógusa és ACAA1 katalógusa jelentett, hogy kapcsolódik a DNS-károsodás és javítási rendszer vonatkozásában gyomorrák fejlesztés [39], [40] az is kiderült, biológiai valószínűsége . CLDN9
viselkedik, mint egy tumorszuppresszor gén játszik az intesztinális típusú gyomorrák [41].
részletes információ a kiválasztott SNP 203 veleszületett immunitás gén és 264 NHL kapcsolatos gének: A felfedezés szakaszában. katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0045274.s001 katalógusa (XLSX-) hotelben
A kutatók azt remélik, hogy a fibromyalgiát pontosan diagnosztizáló vérvizsgálat öt éven belül elérhető lesz
Intézkedések a SARS-CoV-2 szennyvízen keresztüli terjedésének megakadályozására a szegény régiókban
Erős mikrobiom a korai életben, kevesebb légúti fertőzéshez kötve
Bizonyos bélbaktériumok jelenléte az anyákban megvédheti a csecsemőket az ételallergiáktól
A mikrobák előre jelezhetik a halálos kimenetelű szellőztetett COVID-19 betegeknél
Az antibiotikum -rezisztencia mindössze két évtized alatt megduplázódik
Miért érdemes természetes rostforrásokat bevonni az étrendbe?
Az elmúlt években nőtt az érdeklődés az alacsony szénhidráttartalmú étrend, például a ketogén diéta vagy az Atkins iránt. Azonban, mint a rossz zsírok és a jó zsírok , a szénhidrátokat cukorszintüktől
A bélbaktériumok erősebb izmokhoz kapcsolódnak idős embereknél
Egy merész új tanulmány azt sugallja, hogy az idősebb felnőttek izomerője nagyobb lehet a következők miatt:részben, bélbaktériumokat érintő mechanizmusok. A bélbaktériumok az izomtömeghez és a fizik
A bélfokozó ételek világszerte véget vethetnek a gyermekkori alultápláltságnak
A kutatók új típusú élelmiszereket fejlesztettek ki, amelyek javítják a bélbaktériumokat az alultáplált gyermekeknél, és jobban képesek elindítani a növekedést, mint a szokásos élelmezési terápia.