Цель
<р> Генетические варианты, регулирующие иммунную систему хозяина, может внести свой вклад в восприимчивость к развитию рака желудка. Мало что известно о роли врожденной immunity- и неходжкинской лимфомы (НХЛ) генов для информации о связанных желудка риск развития рака. Эта вложенная исследование случай-контроль проводился с целью идентификации генов-кандидатов на риск развития рака желудка для будущих исследований.
Результаты Выводы Финансирование:. Эта работа была поддержана грантом программы научных исследований в области фундаментальных наук в рамках Национального исследовательского фонда Кореи, финансируемой Министерством образования, науки и техники [2009-0066258] и программы в рамках Национального исследовательского фонда Кореи финансируемого BRL (Basic Research Laboratory) Министерством образования, науки и техники [2011-0001564]. Доноры не играет никакой роли в дизайн исследования, сбора и анализа данных, решение о публикации или подготовки рукописи Введение Материалы и методы Учебные предметы По состоянию на декабрь 2001 года, в общей сложности 100 случаев заболевания раком желудка были недавно идентифицированы в соответствии Международной статистической классификации болезней и проблем, связанных со здоровьем 10-го пересмотра (МКБ-10, С16). Из них 42 случая и 42 из контрольной группы по возрасту, полу, область охвата и год были включены в стадии открытия и успешно генотипирование с GoldenGate (Illumina) анализа олигонуклеотид пула (OPA) панелей. В фазе репликации популяции исследования были выбраны следующим образом: 1) по той же методике, для случая ascertainments упомянутых выше, 199 случаев рака желудка были дополнительно определены из KMCC в декабре 2008 года и соответствует 1:1 к элементам управления в соответствии с возрастом ( ± 5 лет), пол, и зачисление в год; 2) в больнице и Ханьян университета Гурий больницы Chungnam университета, 189 вновь диагностированных случаев рака желудка были приняты на работу с марта 2002 г. по сентябрь 2006 г. Они дали письменное информированное согласие и образцы крови на момент постановки диагноза или до желудочной хирургии рака; и 3) в общей сложности 189 управления общинными подобранных по возрасту (± 5 лет), пола и зачисление год были выбраны случайным образом из KMCC. Из 388 матчей случай-контроль, два случая и сорок контроля были исключены из-за плохой скорости генотипирования и геномного уровне ДНК. И, наконец, 386 и 348 случаев управления были проанализированы в фазе репликации. Этика Заявление Для фазы репликации, шесть полиморфизмов четырех генов в врожденного иммунитета панели генов ( DEFA6 Статистический анализ Результаты Обсуждение DEFA6 Подтверждения
<р> Четыре ОНП не имели разнородность поперек фаз:. В мета- анализ, DEFA6
rs13275170 и DEFB1
rs2738169 оба 1,3-кратное увеличение отношение шансов (OR) для рака желудка (95% ДИ = 1,1-1,6 и 1,1-1,5 соответственно) , INSL3
rs10421916 и rs11088680 оба 0,8-кратное снижение или рака желудка. (95% ДИ = 0.7-0.97 и 0.7-0.9, соответственно)
<р> Наши результаты показывают, что некоторые варианты в врожденного иммунитета и НХЛ связанных генов влияют на риск развития рака желудка, возможно, путем модулирования инфекционно-воспалительный-невосприимчивости механизмы, которые еще предстоит определить
<р> Citation:. Парк SK, Ян JJ , О S, чо LY, Ма SH, Шин А, и др. (2012) врожденный иммунитет и Неходжкинской лимфома (НХЛ) генов, связанных с вложенной в исследовании случай-контроль для рака желудка риска. PLoS ONE 7 (9): e45274. DOI: 10.1371 /journal.pone.0045274
<р> Редактор: Джорджина Л. обездвиживания, Университет Абердина, Великобритания
<р> Поступило: 10 мая 2012 года; Принято: 14 августа 2012 года; Опубликовано: 21 сентября 2012
<р> Copyright: © Park и др. Это статья с открытым доступом распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution, которая позволяет неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальный автор и источник кредитуются
<р> Конкурирующие интересы:.. Авторы заявили, что не существует никаких конкурирующих интересов
<р> рак желудка является второй наиболее распространенной причиной смерти от рака в [1] мире с выраженным географическим и этническим различий в заболеваемости и смертности [2]. хеликобактерной
( H. Пилори
) инфекции, которые были определены Международным агентством по изучению рака (IARC) как канцероген желудка, является проверенным причинным фактором развития рака желудка [1], [2]. Тем не менее, некоторые эпидемиологические исследования сообщили, несмотря на высокий H. Pylori
показатель распространенности, заболеваемости раком желудка низок в некоторых азиатских и африканских популяций, известный как азиатский /африканский загадке [3], [4]. Эта загадка может быть связано с другими факторами риска, связанных с различиями в индивидуальной восприимчивости к раку желудка.
<Р> В H. Pylori
инфекции, хроническое воспаление желудка происходит и приводит к иммунной реакции, который включает нормальный (то есть врожденный иммунитет) и ненормальных иммунных реакций, которые обычно встречаются в неходжкинской лимфомой (НХЛ) [5] - [8]; и эти процессы приводят к атрофическим гастритом с последующим метаплазии и дисплазии, и в конечном итоге подключиться к развитию рака желудка [5] - [8]. Таким образом, предполагается, что нормальные иммунные реакции вызваны H
. пилори
инфекция может быть связано с аномальными иммунных реакций в прямом и /или косвенным образом, и, наконец, может определить конечный результат, такие как аденокарциномы желудка, лимфомы и других злокачественных опухолей.
<Р> Учитывая, что 1) генома человека является фактором для индивидуальной восприимчивости; и 2) H. пилори
инфекция в желудочной ткани приводит к воспалению, что в свою очередь вызывает нормальный /патологические иммунные реакции, гены, кодирующие белки, имеющие отношение к хосту нормальной и /или патологический иммунитет может иметь важное значение для индивидуальной восприимчивости к желудочной риска развития рака. Несколько эпидемиологических исследований показали, что гены, связанные с иммунной реакции организма хозяина играют критическую роль в желудочном канцерогенезе: 1) провоспалительные генотипы хозяева индуцированные hypochlorhydric /атрофические ответы к желудочному H. Pylori
инфекции, которые прогрессирующих к некардиальных отделов аденокарциномы желудка [6]; 2) генетический вариант TLR9,
который играет важную роль в системе врожденного иммунитета, была в значительной степени связано с H. Pylori
индуцированный предраковые изменения желудка [7]; 3) TLR4
Asp299Gly может быть генетическая восприимчивыми фактором для слизистой оболочки желудка-ассоциированной лимфоидной ткани (MALT) лимфома [8]; и 4) CD14
генетические варианты по всей видимости, участвует в развитии лимфомы желудка MALT [9].
<р> На основании данных, мы предположили, что генетические варианты в нормальной иммунной реакции ( то есть врожденный иммунитет, связанные гены) и нормальный иммунный ответ (то есть связанные с НХЛ гены) могут повлиять на риск развития рака желудка путем модуляции индивидуальные различия восприимчивости. Для того, чтобы оценить нашу гипотезу, мы провели генетический анализ двухступенчатую в том числе: 1) этап обнаружения для изучения 1536 ОНП в 203 врожденных генов иммунитета и 1536 ОНП в 264 связанных НХЛ генов с использованием (Illumina) анализа олигонуклеотид пула GoldenGate (OPA) и 2) фаза репликации, что дальнейший анализ наиболее значимых ОНП в фазе Discovery.
<р> Субъекты были выбраны из корейского многоцентровое Рак Когорта (KMCC) в данном исследовании, вложенная случай-контроль на основе населения. Конструкция и отбор проб стратегия KMCC были подробно описаны в работах [10] - [12]. Если коротко, то с 1993 по 2004 год, в общей сложности 19,688 участников были набраны из четырех городских и сельских районов в Корее. Все участники 1) подписали форму информированного согласия перед входом в когорту; 2) завершены подробные стандартизированные анкеты методом личного интервью; 3) донорской крови и мочи; и 4) пассивно прослежены через рекордными связи с национальным свидетельство о смерти, медицинское страхование медицинских записей базы данных и национальный реестр рака
.
<Р> Кроме того, на основе обнаружения серологического на основе, Н. Pylori
инфекции и CagA /VacA сероположительность были оценены среди всех изучаемых предметов, включенных в обеих фазах. Использование иммуноблота Helico Blot 2.1 ™ (MP Biomedicals Asia Pacific, Сингапур), которая обеспечивает высокую чувствительность (99% для обоих H.pylori
и CagA сероположительность), а также специфичность (98% для H . пилори
и 90% для CagA серопозитивностью) среди корейского населения [13], образцы сыворотки были проанализированы и взаимосвязаны в соответствии с инструкциями изготовителя. Учитывая, что CagA-продуцирующие H. пилори
значительно связаны с повышенным риском развития рака желудка, H. пилори
и CagA сероположительность рассматривались как мощные ковариатами для рака желудка и скорректированных в статистических моделях.
<р> Учебные протоколы KMCC и генетического исследования были одобрены институциональные советы по рассмотрению Сеульском больнице университета (H-0110-084-002, а также C-0603-161-170, соответственно). Кроме того, исследование рака желудка на базе больниц был одобрен Институциональным наблюдательным советом больницы Ханьянг университета (IRB no.2003-4). Все участники исследования подписали форму информированного согласия перед входом исследования.
SNP Выбор и генотипирование
<р> В фазе открытия, OPA Панель Illumina GoldenGate ™ был разработан с 203 врожденного иммунитета и 264 НХЛ связанных генов-кандидатов с использованием ОНП в проекте SNP500Cancer (http://snp500cancer.nci.nih.gov) с известными данными повторной последовательности и канцерогенных механизмов, связанных с генными [14]. Фокусирование на регионе, который был 20 кб 5 'до начала транскрипции (экзон 1), и 10 кбайт в положение 3' конца последнего экзона (N) для каждого гена-кандидата, кандидаты ОНП были предварительно просеивают. После этого тега SNP, были выбраны из DESIGNABLE множества полиморфизмов, которые входили в состав Международного проекта HapMap (http://www.hapmap.org/index.html~~HEAD=pobj) и в последующих итераций, мы использовали TagZilla (HTTP: //tagzilla .nci.nih.gov) в соответствии со следующими критериями: 1) минорного аллеля частота (MAF) > 0,05; 2) дизайн балл = 1,1; и 3) г 2 > 0,8 отсечка с использованием dbSNP от HapMap Кавказа (CEU) (данные не показаны). Около 55% из ОНП были расположены в интронов, 22% в промоторах (фланговые область, UTR), 15% 3 'стоп-кодона (STP), и 9% в экзонов; среди ОНП, которые были расположены в экзоне, 73% были синонимами и 27% были несинонимичными изменения [15]
. <р> Среди 1536 ОНП, присвоенных врожденных генов, связанных с иммунитетом, 384 ОНП были исключены из-за МАФ и ЛТ; 0,05 (151 ОНП), A HWE р
-value &л; 0,0001 (1 SNP), мономорфизме (162 ОНП) и анализа проблемы (71 SNP). Для НХЛ связанной панели, мы удалили 396 ОНП с HWE р
-value &л; 0,0001 (2 ОНП), A MAF &л; 0,05 (143 ОНП), проблемы анализа (50 ОНП), и мономорфно (201 ОНП). Наконец, статистический анализ включал 1151 ОНП в врожденной иммунной панели и 1140 ОНП в панели НХЛ для наборов 42 случай-контроль подобранных по возрасту, полу, площади и регистрации года.
<Р> генотипирование проводили с использованием геномной ДНК экстрагируют из периферической крови с Gentra Puregene Kit крови (Gentra, Миннеаполис, США) в ядре генотипирования фонда (СГП) Отдела эпидемиологии рака и генетики, Национальный институт рака. В этом исследовании, завершение генотипа на образцах геномной ДНК превышала 95%.
rs2738120, DEFB1
rs2702829, DEFA6
rs13275170, JAK3
rs2286662, DEFB1
rs2738169 и ACAA1
rs2239621) и 11 ОНП девяти генов в НХЛ панель ( INSL3
rs10421916, CHMP7
rs7463256, BCL2L11
rs686952, TNFRSF8
rs755398, INSL3
rs11086080, Rad50
rs17772583, CASP7
rs11196422, CHUK
rs2230804, CD79B
rs2003549, CLDN9
rs11862306, и TNFRSF8 <бр> rs641941) были выбраны в соответствии со следующими критериями: при регистрации ОНП с 1) перестановкой р
-value &л; 0,01; и /или 2) Benjamini-Хехберга ложных обнаружения (BH-FDR) исправил р
-значения &л; 0,2 на наиболее значимых ОНП всех генов в фазе Discovery. Генотипирование проводили с использованием Illumina Veracode GoldenGate анализа с BeadXpress в соответствии с инструкциями изготовителя (Illumina, Сан-Диего, штат Калифорния, США) [16]. Для того, чтобы обеспечить надежность методов генотипирования в двух фазах, 188 образцов были проведено генотипирование дважды каждым методом. Скорость была конкорданс > 98,4%. Два случая и сорок управления с недостаточной ДНК или скоростью генотипирование вызова и ЛТ; 90%. Исключенные
<р> Харди-Вайнберга (HWE) в контрольной группе оценивали с помощью ци -Square тест или точный критерий Фишера с уровнем отсечки HWE &ЛТ; 0,0001. Выбранные характеристики были оценены с использованием χ 2 для категориальных переменных и т
тесты для непрерывных переменных. Мы проанализировали связь между отдельными полиморфизмов и риском развития рака желудка на основе как сырой и перестановкой р
-значения, вычисленным с помощью теста отношения правдоподобия (LRT) с 1 степенью свободы в тренде (аддитивная) модель , Тест тенденция предполагает эффект ответа от дозы (т.е. линейный эффект) с увеличением числа вариантов аллелей. Перестановкой р
-значения были оценены 10000 перестановок тестов. Отношение шансов (ОШ) и 95% доверительный интервал (95% ДИ) были оценены с использованием модели логистической регрессии с поправкой на возраст, статус курения сигарет (да против.
нет), H. Pylori
инфекционность, и CagA вирулентных факторов (положительная против.
отрицательный), которые предполагаемые факторы риска развития рака желудка, хотя переменные не были значимыми в наших данных. Когда данные разреженные и асимптотические приближения на основе логистической регрессионной модели являются ненадежными, точный вывод, следует считать [17]. Таким образом, если частота генотипа либо в случаях или контроля составляло менее 10% (N = 4), точный логистический регрессионный анализ был проведен для расчета ОШ и 95% ДИ.
<Р> Чтобы избежать ложных ассоциаций с ложным положительные результаты, мы выбрали все ОНП с наиболее значимыми р
-Value для каждого гена, и ложной скорости обнаружения Benjamini-Hochberg (BH-FDR) скорректированного р
-значения каждого SNP была вычислена в соответствии с количеством генов [18]. Мы в первую очередь выбирают значительные ОНП с перестановкой р
-value &л; 0,01 и BH-FDR р
-value &л;. 0,2
<р> В фазе репликации, наиболее значимым ОНП, выявленные на этапе Discovery были переоценены. На основе кумулятивным или рецессивных модели, риск развития рака желудка оценивали как ОШ и 95% ДИ с использованием модели логистической регрессии с поправкой на тех же ковариат, упомянутых выше. Для подведения итогов от открытия и фазы репликации, были проведены pooled- и мета-анализов. С помощью модели фиксированного эффекта, суммированные ОШ и 95% ДИ были вычислены. Кроме того, гетерогенность во всех исследованиях оценивали по статистике Cochran Q [19].
<Р> Все статистический анализ был проведен с Plink программного обеспечения версии 1.06 (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/палить) и SAS версии программного обеспечения 9.1 (SAS Institute, Cary, North Carolina).
<р> случаи и контроля были сопоставимы по возрасту, H. пилори
инфекции, CagA /VacA серопозитивностью, питьевой статус и желудка истории болезни. Более существенное и значительное другое распределение для курения сигарет между случаями и контролем наблюдалось в репликации и Обобщённые анализ (таблица 1).
<Р> Генотип частоты для всех ОНП не отклоняться от равновесия Харди-Вайнберга (HWE) ( р
> 0,0001).
<р> В фазе Discovery, Шесть ОНП в четырех генов ( DEFA6, DEFB1, JAK3
и ACAA1
) среди 1152 ОНП, выбранных из врожденных генов, связанных с иммунитетом и 11 ОНП в девяти генов ( INSL3, CHMP7, CASP7, Rad50, CHUK, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11,
и CLDN9
) среди в 1,104 ОНП в 246 NHL-родственных генов были связаны с риском развития рака желудка в соответствии с перестановкой р
-значения ( р
&л; 0,01). После коррекции для множественных сравнений, только два ОНП, DEFA6
rs2738120 и DEFB1
rs2702829, остается незначительно значимым для рака желудка (FDR = 0,08 и FDR = 0,08, соответственно), которые показали увеличение риск рака желудка (или [95% ДИ] = 4.1 [1.6-10.4] и 2.9 [1.3-6.1], соответственно). Из НХЛ связанной панели генов, один SNP в девяти генов оставались незначительно значительным (FDR-BH р
-value = 0,09); INSL3
rs10421916 был связан с значительным снижением рака желудка (или [95% ДИ] = 0,6 [0.3-0.97]) (таблица 2).
<Р> В комбинированном анализе (т.е. объединяют и мета-анализ), который включал открытие и репликации фазы, два ОНП, DEFA6
rs13275170 и DEFA1
rs2738169 в генах врожденного иммунитета и INSL3
rs10421916 и rs11086080 в НХЛ-родственные гены оставались в значительной степени связано с риском развития рака желудка (мета OR = 1,3 [95% ДИ: 1,1-1,6]; мета OR = 1,3 [95% ДИ: 1,1-1,5]; мета OR = 0,8 [95% ДИ : 0.7-0.97]; мета- или = 0,8 [95% ДИ: 0,7-0,9], соответственно). Там не было гетерогенность через анализы (тест Cochran Q, р
> 0,05). (Таблица 3)
<р> Двухстадийная генетическая связь исследования с 1536 ОНП в 203 врожденного иммунитета связаны между собой (то есть, связанные с нормальной иммунной реакции) генов и 1536 ОНП в 264 НХЛ, связанных с (т.е. аномальный иммунный ответ, связанные) генов было проведено с целью выявления вариантов в врожденного иммунитета и НХЛ-родственных генов-кандидатов, связанных с рак желудка. В фазе Discovery, шесть ОНП в четырех врожденных генов иммунитета ( DEFA6, DEFB1, JAK3
и ACAA1
) и 11 ОНП в девяти НХЛ связанных генов ( INSL3, CHMP7 , CASP7, Rad50, CHUK, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11,
и CLDN9
) были значительно связаны с риском развития рака желудка (перестановкой р
&л; 0,01); и после испытания BH-FDR для генов в 42 наборов случаев и контроля, DEFA6
и DEFB1
в врожденного иммунитета панели генов и INSL3
в НХЛ панель генов информации о связанных были связаны с желудочной риск развития рака (BH-FDR р
&Лт; 0.1). В фазе репликации генотипирования с несколькими наборами случай-контроль и в мета- и суммарном анализе, DEFA6, DEFB1
и INSL3
по-прежнему в значительной степени связано с риском развития рака желудка без гетерогенности поперек фаз.
(дефенсина альфа-6, Панет для соты) и DEFB1
(дефенсина бета-1), которые принадлежат членам семьи дефенсина, состоит из 6 человека бета-дефензины (hBD1-hBD6) и два человека альфа-дефензины (hd5-hd6) и играют решающую роль в механизме защиты хозяина, особенно в отношении к антимикробной активности и цитотоксичности нейтрофилов [20], [21]. Дефенсины индуцируемые воспалением или инфекциями могут противостоять бактериальной колонизации на эпителиальных поверхностях, включая желудочно-кишечного эпителия [22] - [24]. В частности, дефенсина связывает липополисахарида на H. Pylori
клеточной стенки и defensin- H. Pylori
комплекс активирует путь передачи сигнала NF-кВ для желудочного канцерогенеза [25]. Недавние исследования показали дефензины, участвующие в развитии рака были выражены в различных человеческих опухолей, включая рак желудка [26] - [28]. В качестве одного из возможных средств для желудка канцерогенеза, дефенсины могут взаимодействовать с H. Pylori
инфекции как для сопротивления и защиты, а также их ненормальные действия могут вызвать первый шаг к развитию рака желудка. Таким образом, вполне возможно, что некоторые варианты в DEFA6
и DEFB1
влияют на восприимчивость к раку желудка путем изменения воспалительного ответа через изменения в экспрессии или функции этих белков. Наши результаты показывают, что DEFA6
rs2738120 (расположен в интроне) и DEFB1
rs2702829 (находится в 3 'STP) имеют потенциальные генетические влияния на развитие рака желудка. Несмотря на неоднородность стадии открытия и репликации, другие местоположения DEFA6
(rs2738120) и DEFB1
(rs2702829) были также значимыми в наших результатах. Дальнейшие исследования должны быть проведены, чтобы исследовать точные биологические функции полиморфизмов, связанных с деятельностью дефенсина и /или сотовой емкости.
<Р> INSL3
ген кодирует белок INSL3, который является инсулин как гормон. Белок INSL3 производится в основном в тканях половых желез в организме человека; Тем не менее, она была обнаружена в опухолевых тканях желудочно-кишечного тракта [29]. Мало что известно о том, как INSL3
ген препятствует в человеческом канцерогенеза. Кроме того, он не очень хорошо известно, являются ли генетические варианты элемента INSL3
гена связаны с канцерогенеза желудка, но результаты этого исследования показывают, что по крайней мере два ОНП (rs10421916, расположенные в интрона и rs11086080 расположен в 2 = 0,56) появится 3 'STP) в сильном неравновесном сцеплении (D' = 0,86, LOD = 13,42 и т иметь сильную связь с пониженным риском развития рака желудка. Хотя экспериментальные данные, что указывает на функциональное влияние полиморфизмов на молекулярном уровне недостаточно на сегодняшний день, он предположил, что INSL3
rs10421916 и rs11086080 могут влиять на индивидуальную восприимчивость в желудочном канцерогенезе. Необходимы дальнейшие исследования, включая углубленные В естественных условиях
и исследования на животных должно быть сделано для выяснения причинно-следственные механизмы и INSL3
генетические эффекты участвуют в канцерогенезе желудка человека.
<Р> Ряд генов (то есть, JAK3, CHMP7, CASP7, Rad50, CHUK, TNFRSF8, CD79B, BCL2L11
и CLDN9
) показали статистически значимую связь с раком желудка в стадии открытия, хотя и не значительным в тестах BH-ОУП. JAK3
, TNFRSF8
и CHUK
может повлиять на хроническое воспаление и иммунитет с H. пилори
колонизация к раку желудка, что имеет важное значение в желудочном канцерогенезе следующим образом: 1) <ЕМ> JAK3
участвует в цитокиновой рецептор-опосредованного внутриклеточного сигнальной трансдукции, и рецептор цитокина обычно находится в желудочной ткани рака человека [30]; 2) TNFRSF8
опосредованной трансдукции сигнала приводит к активации NF-kB [31]; и 3) CHUK
участвует в NF-kB сигнального пути, активированного H. пилори
в раковых клетках желудка [32]. Учитывая, что патоген человека желудка <ет> Н. пилори
оказывает большую часть своей патогенности, индуцируя повреждение ДНК и апоптоз в хозяина эпителиальных клеток желудка [33], BCL2L11, CASP7
и CD79B
сообщается, связан с апоптозом [34 ] - [38] и Rad50
и ACAA1
сообщается, связана с системой повреждения и восстановления ДНК в отношении развития рака желудка [39], [40] также показали биологическое правдоподобие , CLDN9
действует как ген-супрессор опухолей причастного рака кишечного типа желудка [41].
<Р> Несмотря на то, что это исследование является двухступенчатая исследование генетической связи, существует несколько ограничений исследования. Во-первых, большинство генов не преодолели гетерогенность через фазы открытия и репликации. Неоднородность объясняется различной статистической мощности в каждой фазе: Небольшой размер выборки в фазе Discovery привело к смещению ОШ (т.е. завышена), и результаты были статистически отличаются от нормальных-оценочных значений в фазе репликации. Хотя распределение экологических факторов между случаями на основе изучения когорты на уровне общин и больничных случаев на основе была немного отличаются друг от друга, MAFs большинства полиморфизмов было мало разницы. Во-вторых, слоистые анализа в отношении различных характеристик рака желудка (т.е. гистологических подтипов, сердца против
несердечная;. Диффузного типа против
кишечного типа,. И стадии TNM) и /или независимыми факторами риска (то есть, возраст, пол, и <ЕМ> Н. пилори
статус инфекции) может не проводиться из-за 1) однородной природы исследуемой популяции (то есть, большинство пациентов несердечная типов или неопределенные типы, > 95%, а также кишечных и диффузные типы были менее 3%); и 2) отсутствие подробной информации о данных гистопатология за счет пассивных последующих с использованием методов сопоставления данных. В-третьих, так как были выбраны теги ОНП на основе данных из кавказского населения, Азиатско-специфические генетические маркеры могут пренебречь на стадии проектирования. Наконец, мы не смогли подтвердить функциональный эффект SNP на молекулярном уровне. Таким образом, полученные результаты следует интерпретировать с осторожностью. Несмотря на ограничения, наше исследование является стабильным против нескольких уклонов, которые распространены в ретроспективных конструкций из-за его населения на основе вложенного дизайна случай-контроль.
<Р> В заключение, наши результаты показывают, DEFA6
, DEFB1
, и INSL3
генетические варианты являются восприимчивость факторами развития рака желудка. Дальнейшие исследования с большим числом случаев и более существенной геномной базы позволит нам выяснить патологические механизмы рака желудка. Кроме того, дополнительные биологические исследования, ориентированные на эти гены должны прояснить свою роль в желудочном канцерогенезе.
Поддержка Информация
Поддержка Информация S1.
Подробная информация о выбранных полиморфизмов в 203 врожденного иммунитета генов и 264 связанных генов НХЛ: В стадии открытия
DOI:. 10,1371 /journal.pone.0045274.s001
(XLSX)
<р> Мы ценим DRS. Стивен Дж Chanock, Роберт Уэлш, Натаниэль Ротман, которые помогают первоначальный генотипирование в Департаменте здравоохранения и социальных служб, Core генотипирования фонда в Advanced Technology Center Национального института рака, и Отдел эпидемиологии рака и генетики, Национальный институт рака , Bethesda, штат Мэриленд, США
Нездоровый микробиом кишечника снижает синаптическую обрезку мозга,
Фастфуд может быть главной причиной подростковой депрессии
Ученые извлекли полный геном человека из «жевательной резинки» возрастом тысячи лет.
Миграция влияет на микробиоту кишечника, что, в свою очередь, влияет на здоровье.
Болезнь Крона
Что делать с гепатитом С?
Микробы на языке могут быть использованы для диагностики рака поджелудочной железы
Исследователи медицинского факультета Чжэньцзянского университета, Китай обнаружил, что нарушение микробного состава оболочки языка может служить биомаркером ранней стадии рака поджелудочной железы.
Как массовые обследования помогли выявить больше случаев глютеновой болезни у детей
Новая программа массового обследования детей школьного возраста в Италии показала, что общая распространенность целиакии почти удвоилась за последние 25 лет. Инфографика целиакии. Кредит
Проблемы роста у недоношенных детей, связанные с измененными кишечными бактериями
Недоношенные дети, которые не растут должным образом или не могут нормально развиваться, могут иметь проблемы с развитием своего микробиома. новое исследование предполагает. Группа исследователей из