PLOS ONE: ERCC1 e ERCC2 Variantes prever a sobrevida em pacientes com câncer gástrico

Abstract

Purpose

ERCC1
e ERCC2
desempenham papéis críticos na via de reparo por excisão de nucleotídeos que efetivamente repara danos no DNA induzidos por agentes quimioterápicos . Portanto, polimorfismos funcionais de nucleotídeo único (SNPs) nesses genes podem ter um impacto sobre os resultados clínicos em pacientes com câncer que receberam quimioterapia. No entanto, poucos estudos têm investigado simultaneamente os papéis de ERCC1
e ERCC2
SNPs em resultados clínicos em pacientes com câncer gástrico.

Experimental Design by

Nós genotipados pelo ensaio TaqMan três comum, potencialmente funcional ERCC1
(rs3212986) e ERCC2
SNPs (rs13181 e rs1799793) em 360 pacientes com câncer gástrico. Nós usamos ambos os testes de Kaplan-Meier e Cox modelos de riscos proporcionais para avaliar os efeitos do ERCC1
e ERCC2
genótipos e haplótipos sobre os resultados clínicos.

Resultados

Descobrimos que, em comparação com ERCC2
GG rs1799793 + genótipos AG, o genótipo variante homozigoto AA foi associado à sobrevida global significativamente mais pobres (oS) (AA vs. GG + AG, log-rank P
= 0,012) e significativamente maior risco de morte (AA vs. GG + AG, perigos Ajustado ratio [HR] 2,13; IC 95%, 1,28-3,56; P
= 0,004). Em análises combinadas, pacientes com qualquer um dos três genótipos desfavoráveis ​​(ou seja, ERCC1
TT rs3212986, GG ERCC2
rs13181 e rs1799793 AA) tiveram riscos estatisticamente significativos de mau prognóstico (HR ajustado, 1,54 IC 95%, 1,06-2,25; P
= 0,025), em comparação com aqueles sem quaisquer genótipos desfavoráveis. Além disso, o AGG haplótipo (rs1799793 /rs13181 /rs3212986) teve um impacto significativo no OS (HR ajustado, 1,57; IC 95%, 1,11-2,21; P
= 0,011), em comparação com o GTG haplótipo comum.

Conclusão

ERCC1
e ERCC2
SNPs funcionais podem afetar conjuntamente OS em pacientes com câncer gástrico caucasianos. Adicionais grandes estudos prospectivos são essenciais para confirmar nossas descobertas

Citation:. Li Y, Z Liu, Liu H, Wang L-E, Tan D, Ajani JA, et al. (2013) ERCC1
e ERCC2
Variantes prever a sobrevida em pacientes com câncer gástrico. PLoS ONE 8 (9): e71994. doi: 10.1371 /journal.pone.0071994

editor: Xiaoping Miao, Tongji Medical College, Huazhong Universidade de Ciência e Tecnologia, China

Recebido: 23 de maio de 2013; Aceito: 12 de julho de 2013; Publicação: 02 de setembro de 2013

Direitos de autor: © 2013 Li et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Esta pesquisa foi apoiado por fundos do Texas 4000 Endowed Professorship Distinguished ea irmã Instituição fundos rede MD Anderson. Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

o câncer gástrico é a segunda principal causa de mortes por câncer, ocupando o quarto câncer mais comum no mundo, com cerca de 989.600 novos casos e 738,000 mortes por ano [1]. Nos Estados Unidos, não foram estimados 21.600 novos casos e 10990 mortes em 2013 [2]. Para pacientes com câncer gástrico, o TNM (tumor /nódulo /metástase) fase é a medida mais aceitável para avaliar os efeitos de terapias e prognóstico; No entanto, não é raro que os doentes com a mesma fase do tumor e o tratamento pode ter vários resultados. Portanto, para os cirurgiões e oncologistas, que seria útil para melhorar a precisão na previsão de desfecho clínico, identificando os tomadores genéticas que poderiam facilitar a terapia anticâncer individualizado, tratamento adjuvante pós-operacional e estratégias de acompanhamento. Nas últimas décadas, os estudos descobriram que as variações genéticas desempenham um papel no desenvolvimento e progressão do cancro gástrico. As diferenças individuais ou variações em resposta a quimioterapias ou radioterapias são provavelmente devido a suas diferentes make-ups genéticos, levando a diferentes resultados clínicos. Por exemplo, polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) são a variação genética mais comumente investigados que podem influenciar os resultados clínicos dos pacientes [3], [4], [5].

sistema de reparo do DNA desempenha um papel vital na manutenção a estabilidade das funções celulares e integridade genómica através da inversão do DNA danificado induzida por vários factores endógenos e ou /exógenos, incluindo agentes terapêuticos; por conseguinte, a capacidade de reparação do ADN do hospedeiro podem contribuir para os resultados dos pacientes do cancro [6], [7]. Entre as vias de reparação do ADN bem conhecidos, a via de reparação de excisão de nucleótidos (NER) é um importante mecanismo que mantém a integridade do genoma por eliminação de lesões de ADN volumosos ou aductos intercadeias induzidas por exógeno e /ou factores endógenos [8], [9]. O grupo de excisão-reparação cross-complementando complementação 1 (ERCC1) e excisão-reparação D (ERCC2 /XPD) proteínas grupo de complementação 2 /xeroderma pigmentoso grupo-complementando transversais são os dois principais componentes do processo NER. ERCC1, codificada pelo gene localizado no cromossoma 19q13.32, interage com XPA /XPF e outras proteínas NER, guiando a 'actividade de 5 incisão na via NER [10], enquanto que ERCC2, codificada pelo gene localizado no cromossoma 19q13.3 , é uma helicase dependente de ATP que medeia desenrolamento de DNA para o início de NER [11].

Até o momento, existem 36 codificação de SNPs em ERCC1
e 115 de codificação de SNPs em ERCC2
foram relatados (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/). Naqueles SNPs de codificação, o ERCC2
rs13181 e rs1799793 são os únicos dois SNPs nonsynonymous com menor freqüência do alelo > 5%, e esses dois SNPs foram mostrados para ter um efeito sobre o reparo do DNA fenótipo capacidade, possivelmente alterando a sequência de aminoácidos da proteína [12], [13]. Além disso, um outro SNP regulador comum na região não traduzida a 3 'de ERCC1
rs3212986 foi relatado para ser correlacionada com o fenótipo capacidade de reparação do ADN [14] e para ter algum efeito sobre ERCC1
ARNm expressão [15]. Alguns estudos sugeriram que a baixa ERCC1
expressão está associada com aumento da sensibilidade quimioterápico e, portanto, considerado um marcador preditivo para os doentes com cancro do pulmão de células não pequenas (NSCLC) tratados com quimioterapia à base de platina [16], enquanto outros estudos indicaram que ERCC2
SNPs foram associados com pior sobrevida em pacientes com NSCLC em populações chinesas [17]. Além disso, ERCC2
rs13181 e rs1799793 SNPs foram mostrados para ser preditores de prognóstico para pacientes com osteosarcoma [18], o cancro colorectal [19], e câncer oral [20], mas até à data, poucos estudos têm investigado prognóstico importância desses SNPs em pacientes com câncer gástrico. Por exemplo, apenas um pequeno estudo mostrou que ERCC2 Lys ^{751Gln
(rs13181) SNP pode ser um fabricante preditivo para os resultados em pacientes latino-americanos com a fase III /IV câncer gástrico [21].}

Embora ambos ERCC1
e ERCC2
estão localizados no cromossomo 19 e participar da atividade NER, poucos estudos têm investigado simultaneamente os efeitos do ERCC1
e ERCC2
variantes sobre os resultados clínicos gástricos, como resumido na nossa revisão anterior em uma meta-análise [22]. Portanto, a hipótese de que SNPs funcionais e haplótipos destes dois genes podem ter um impacto no prognóstico do câncer gástrico. No presente estudo, avaliou-se associações de ERCC1
(rs3213986) e ERCC2
(rs13181 e rs1799793) SNPs com a sobrevivência em pacientes com câncer gástrico.

Materiais e Métodos

Ética declaração

Este protocolo de estudo foi aprovado pela The University of Texas MD Anderson Cancer Center Institutional Review Board (IRB), e todos os pacientes desde que o seu consentimento informado usando o formulário de consentimento informado IRB-aprovado .

O recrutamento dos pacientes e acompanhamento

Este estudo incluiu 360 pacientes que foram acumulados por aqueles com diagnóstico recente e histologicamente confirmada câncer gástrico, independentemente da idade, sexo ou estágio do tumor, ao Universidade do Texas MD Anderson Cancer Center, em Houston, Texas, entre fevereiro de 1990 e abril de 2012. Aqueles pacientes que não eram recém-diagnosticados ou tratados em outros lugares antes de chegar a MD Anderson Cancer Center foram excluídos deste estudo. Entrevistamos cada participante elegível para obter dados sobre o consumo de tabaco e de álcool. Aqueles que fumaram menos de 100 cigarros em sua vida foram considerados como "não fumantes", e todos os outros foram considerados como "nunca fumantes". Da mesma forma, os indivíduos que ingeriu bebidas alcoólicas pelo menos uma vez por semana por mais de 1 ano antes foram definidos como "sempre bebedores", e todos os outros foram definidos como "nunca bebedores". Cada doente doou uma só vez 10 ml de todo o sangue retirado para um tubo heparinizado para testes genéticos. Todos os pacientes incluídos no presente estudo teve amostras de sangue disponíveis para genotipagem e dados de acompanhamento para avaliar os resultados.

A genotipagem

O DNA genômico foi isolado a partir da fracção creme leucocitário da amostra de sangue , utilizando-se um sangue Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) de acordo com as instruções do fabricante. As concentrações de ADN foram determinadas por medição espectrofotométrica da absorvância a 260 nm e as purezas foram calculadas pela razão A260 /A280 usando espectrofotómetro Nanodrop ND-1000 (Thermo Scientific, Rockford, IL). Genótipos dos três SNPs seleccionados ( ERCC1
rs3213986 G > T, ERCC2
rs13181 T > G e rs1799793 G > A) foram realizados utilizando a metodologia TaqMan em placas de 384 poços e ler com Software sequência de detecção no ABI Prism 7900 instrumento de acordo com as instruções do fabricante (Applied Biosystems, Foster City, CA). Os iniciadores utilizados para rs3213986 G > T, rs13181 T > G, e rs1799793 G > A foram CACAGGCCGGGACAAGAAGCGGAAG [A /C] AGCAGCAGCAGCAGCCTGTGTAGTC, TGCTGAGCAATCTGCTCTATCCTCT [G /T] CAGCGTCTCCTCTGATTCTAGCTGC, e CGGGGCTCACCCTGCAGCACTTCGT [C /T] GGGCAGCACGGGGTTGGCCAGGTGG, respectivamente. Cada placa de 384 poços tinha quatro controlos negativos, um controlo positivo e oito amostras repetidas. As reacções de PCR foram efectuadas nas seguintes condições: 50 ° C durante 2 min, 95 ° C durante 10 min, e em seguida 95 ° C durante 15 s e 60 ° C durante 1 min durante 40 ciclos. Para todos os genótipos, a taxa de sucesso do ensaio foi > 99% e os resultados das amostras repetidas foram 100% concordantes

Análise Estatística

O χ ^{2 teste goodness-of-fit. foi aplicada para calcular o equilíbrio de Hardy-Weinberg da distribuição dos genótipos. O método de Kaplan-Meier foi usado para visualizar a sobrevida global (OS) por três grupos de genótipos. O tempo OS foi calculado a partir da data de registo na M.D. Anderson para a data do último contato ou morte, e os pacientes que ainda estavam vivos no último contato foram considerados censurados na análise. Foi calculado o tempo médio de sobrevivência (MST), e o teste de log-rank foi aplicado para testar a igualdade das distribuições de sobrevivência. modelos uni e multivariada riscos proporcionais de Cox foram realizadas para calcular as razões de riscos (HR) e intervalos de confiança de 95% (95% IC) de cada genótipo para estimar seu efeito sobre a sobrevivência, com ou sem o ajuste para fatores de confusão. Haplótipos foram inferidas usando o processo de haplótipo SAS PROC e associações entre haplótipos e OS foram determinados pelo modelo genético recessivo seguindo o modelo genética xeroderma pigmentoso (XP), como se usou anteriormente [23]. Todos os testes estatísticos foram bilaterais, com um valor P
de 0,05 considerado significativo e todas as análises foram realizadas utilizando software SAS versão 9.2 (SAS Institute, Cary, NC). Também calculamos o relatório probabilidade de falso-positivo (FPRP) para detectar os resultados de associação falso-positivos. Para todos os resultados significativos, atribuímos uma probabilidade prévia de 0,1 para detectar uma HR de 2,0 para uma associação com os genótipos e alelos de cada SNP. O poder estatístico também foi calculada usando a versão on-line disponível software PS 3.0 [24], [25]. Apenas os resultados significativos com poder estatístico > 0,8 foram e FPRP valor. ≪ 0,2 considerada associação notável}

Resultados

As características dos pacientes e características clínicas

As características demográficas e clínicas dos os pacientes são apresentados na Tabela 1. a idade dos pacientes tinham entre 19 e 89 anos no momento do diagnóstico, com uma idade média de 60 anos e uma idade média de 59,6 ± 12,4 anos. Entre os 360 pacientes, houve mais homens (221, 61,39%) do que mulheres (139, 38,61%), constituída de 224 (62,22%) brancos não-hispânicos, 136 (37,78%) outras etnias (hispânicos, negros e asiáticos) , 191 (53,06%) nunca fumantes e 188 (52,22%) de todos os tempos álcool consumidores. No último acompanhamento (setembro de 2012), 178 (49,44%) morreram, com uma MST de 16,02 meses. De todos os pacientes, 136 (37,78%) apresentaram fases I-II e 224 (62,22%), com estágios III-IV. A distribuição dos tipos histológicos incluídos 169 (46,94%) carcinomas intestinais, 148 (41,11%) carcinomas em anel de sinete e 43 (11,94%) outros tipos. A distribuição dos graus histológicos incluídos 113 (31,39%) moderada pobres casos moderados /diferenciação e 247 (68,61%) casos de diferenciação pobres. Para a categoria de tratamento, 136 (37,78%) pacientes tiveram tratamento cirúrgico, 293 (81,39%) pacientes tomaram a quimioterapia, e 114 (31,67%) pacientes receberam radioterapia (112 pacientes tinham ambos quimioterapia e radioterapia). Quando todas essas variáveis ​​foram incluídas em um modelo de regressão de riscos proporcionais de Cox para o ajuste para calcular riscos ratios (HR), submetidos a cirurgia (HR, 3,51; IC 95%, 2,37 a 5,20; P Art < 0,001) , tendo estágio doenças III-IV (HR, 2,54; IC 95%, 1,74-3,69; P Art < 0,001), e receber radioterapia (HR, 1,57; IC 95%, 1,11-2,21; P
= 0,011) permaneceram indicadores prognósticos estatisticamente significativa (log-rank P Art < 0,05; Tabela 1). Embora o crude P
foi de 0,004 no grupo quimioterapia de recepção, o HR ajustado não foi estatisticamente significativa ( P
= 0,902).

Associação entre ERCC1
e ERCC2
SNPs e oS

Foi utilizado o método de Kaplan-Meier eo modelo de Cox para avaliar os efeitos do ERCC1
e ERCC2
SNPs no OS do paciente. A Tabela 2 apresenta as distribuições de genótipos do ERCC1
rs3213986 e ERCC2
rs13181 e SNPs rs1799793, bem como suas associações com OS. Os genótipos observadas nos pacientes concordaram com os estimados a partir do equilíbrio de Hardy-Weinberg ( P
= 0,466 para rs1799793, P
= 0,820 para rs13181, e P
= 0,789 para rs3213986). Em todos os pacientes, o ERCC2
rs1799793 G > A SNP mostrou associação estatisticamente significativa com o OS, e do MST para pacientes com genótipo AA foi menor do que naqueles com o genótipo GG comum (13,2 meses versus 15,8 meses; log-rank P
= 0,012). Na análise Cox, os pacientes com a variante genótipos AG /AA apresentaram aumentaram significativamente os riscos de morte em modelos univariados, em comparação com aqueles que tinham o genótipo GG (HR, 1,46; 95% CI, 1,07-2,00 e P
= 0,017 para a AG, e HR, 2,23; 95% CI, 1,33-3,75 e P
= 0,002 para AA, respectivamente). Após o ajuste para sexo, idade, tabagismo, uso de álcool, estágio do tumor, grau histológico, tipo histológico e tratamento em um modelo de Cox multivariada, o genótipo AA permaneceu teve impacto estatisticamente significativo sobre OS, em comparação com o genótipo rs1799793 GG (HR, 2,18; IC 95%, 1,26-3,78 e P
= 0,006) ou GG + AG genótipo (HR, 2,13; 95% CI, 1,28-3,56 e P
= 0,004) (Figura 1A) . Para os outros dois ERCC2
rs13181 e ERCC1
SNPs rs3212986, embora ambos os SNPs mostraram associações com tendência de aumento da FC com genótipos variantes, não houve associação estatisticamente significativa com a OS sob uma genética recessiva modelo (Tabela 2).

a sobrevida dos pacientes com câncer gástrico por fatores de risco genéticos combinados

Para avaliar o efeito conjunto das três SNPs no prognóstico do paciente, que combinou três variantes genótipos homozigotos (ou seja, ERCC1
TT rs3212986, ERCC2
rs13181 GG e rs1799793 AA). De todos os pacientes, 63 pacientes tiveram pelo menos um genótipo variante homozigoto, e esses pacientes tiveram estatisticamente significativos riscos de mau prognóstico (HR ajustado, 1,54; IC 95%, 1,06-2,25; P
= 0,025), em comparação com aqueles sem qualquer (Tabela 2).

Associação entre ERCC1
e ERCC2
haplótipos e oS

Uma vez que estes três SNPs são todos no cromossoma 19, exploramos ainda mais os seus haplótipos e avaliou seu efeito combinado sobre sobreviventes de câncer gástrico. No geral, havia oito haplótipos, dos quais cinco tiveram frequências > 5%, e outros três haplótipos menos comuns foram combinados em um único grupo. Os cinco haplótipos mais comuns nestes pacientes eram rs1799793 /rs13181 /rs3212986 G-T-G, A-G-T, G-T-T, A-G-G e G-G-G, com a frequência de 52,2%, 13,9%, 12,6%, 9,4% e 6,8%, respectivamente. Comparado com o haplótipo mais comum GTG, o haplótipo AGG teve um impacto significativo no OS (HR ajustado, 1,57; IC de 95%, 1,11-2,21; P
= 0,011) (Tabela 3) (Figura 1B).

análise de estratificação entre os genótipos recessivos e sobrevida global

foi realizada análise estratificada para investigar se o SNPs e seus genótipos combinados em um modelo recessivo na sobrevivência foram modificados por alguns fatores clínico-patológicos importantes na Tabela 1 . Descobrimos que o ERCC2
genótipo rs1799793 AA tiveram um risco de mortalidade mais elevada nos pacientes que eram mais velhos (≥ 60 anos), do sexo masculino, brancos não-hispânicos, com história de tabagismo, tendo pobre diferencial, tipo intestinal de tumores, e com qualquer tratamento (operação, quimioterapia ou radioterapia). Observamos também mau prognóstico estatisticamente significativa em pacientes do sexo masculino com o ERCC2
rs13181 genótipo GG, e os pacientes com o ERCC1
genótipo TT re3212986 (Tabela 4) para não fumadores. As análises combinadas mostrou que pacientes com qualquer um dos genótipos homozigotos três variantes sofreria um maior risco de morte, particularmente naqueles que eram mais velhos (≥ 60 anos), do sexo masculino, usuários de álcool, brancos não-hispânicos, tendo pobre diferencial, tipo intestinal de tumores com estádios I /II, e tendo quimioterapia (Tabela 4).

Finalmente, foram calculados os valores FPRP em diferentes níveis de probabilidade prévia, bem como poder estatístico para todos os resultados significativos (Tabela 5). Para uma probabilidade anterior de 0,1, assumindo o HR para o genótipo específico foi de 2,0, os valores FPRP foram 0,044, 0,079, 0,087 e 0,197, com poder estatístico de 0,930, 0,927, 0,903 e 0,842 (A probabilidade de eu erro tipo associado com este teste de esta hipótese nula é de 0,05), respectivamente, para uma associação do
ERCC2 rs1799793 genótipo AA, AGG haplótipo e 1-3 de ERCC1 Comprar e genótipos de risco ERCC2
, respectivamente, sugerindo que estes podem ser descobertas notáveis ​​em todos os indivíduos, e nós seria capaz de rejeitar a hipótese nula de que as curvas de variantes e sobrevivência de referência eram iguais com poder estatístico > 0,8. Além disso, a maioria das associações significativas para análises estratificadas foram considerado digno de nota porque a probabilidade de um resultado falso positivo foi < 0,2 e poder estatístico > 0,8 (Tabela 5). No entanto, alguns valores FPRP maiores (> 0,2) foram observadas para algumas outras associações significativas na análise estratificada (por exemplo, ERCC2
rs13181 e ERCC1
genótipos variantes rs3213986 com OS câncer gástrico). Para essas associações significativas com poderes estatísticos < 0,8, não foi possível rejeitar a hipótese nula de que as curvas de sobrevivência eram iguais entre a variante e os grupos de referência, e que foram correspondentes aos maiores valores FPRP (> 0,2) (Tabela 5) , sugerindo algum possível viés nestes resultados positivos que precisam ser validados em estudos maiores no futuro.

Discussão

no presente estudo, nós investigamos se funcional ERCC1
rs3213986 G > T e ERCC2
rs13181 T > G e rs1799793 G > a SNPs tem quaisquer efeitos individuais ou conjuntas sobre os resultados clínicos de pacientes com câncer gástrico em uma população norte-americana paciente. Descobrimos que o ERCC2
genótipo rs1799793 AA contribuiu para um tempo de sobrevivência significativamente menor, em comparação com o genótipo AG /GG. Após o ajuste para outros fatores clínicos, os efeitos do ERCC2
genótipo rs1799793 AA, os efeitos combinados dos três genótipos variante homozigotos, ea rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplótipo AGG todos permaneceram como preditores significativos para os resultados clínicos mais pobres na população estudada. Além disso, estes efeitos também permaneceu em análises de estratificação. Em geral, os pacientes com a ERCC2
genótipo rs1799793 AA teria maior risco de morte, em particular naqueles que eram mais velhos (≥ 60 anos), não-hispânica branco, tendo pobre diferencial, tipo intestinal de tumores, e com a quimioterapia ou radioterapia. Além disso, os pacientes com qualquer um dos rs1799793 /rs13181 /genótipos homozigotos variante rs3212986 sofreria um maior risco de morte, particularmente naqueles que eram do sexo masculino, brancos não-hispânicos, tendo pobre diferencial e tipo intestinal de tumores.

é bem sabido que algumas características clinicopatológicas, tais como a fase do tumor e tratamento, estão associados com o prognóstico dos doentes com cancro. No entanto, estávamos interessados ​​em variantes genéticas funcionais de genes de reparo de DNA que podem modular a sobrevivência dos pacientes em resposta à quimioterapia. O processo NER é um importante mecanismo de reparação do ADN que mantém a integridade genómica, tanto em células normais e tumorais, e as alterações na capacidade de NER podem aumentar ou reduzir a frequências de mutação de ADN como um resultado do DNA danificado reparado, o que pode alterar a resposta dos pacientes para a terapia, e pode assim levar a progressão maligna e metástase. ERCC1 e ERCC2 são duas enzimas limitantes da velocidade-chave que atuam no processo NER várias etapas. ERCC1 está envolvido no reconhecimento de danos no ADN, e ERCC2 é um membro de uma subunidade de nove complexo do factor de iniciação da transcrição TFIIH humana com actividade de helicase dependente de ATP. Portanto, potencialmente funcional ERCC1
e ERCC2
SNPs podem afetar a capacidade de reparo do DNA celular [26] e, portanto, pode estar associada com várias taxas de sobrevivência observados em pacientes com câncer.

Anterior relatórios sobre a associação entre o rs3212986 e sobrevivência de câncer ERCC1
têm sido controversos. Por exemplo, Takenaka et al. demonstrou que ERCC1
rs3213986 SNP podem influenciar o prognóstico NSCLC independentemente do ERCC1
expressão e de platina sensibilidade em 122 pacientes com NSCLC japoneses que foram submetidos a uma ressecção completa [27]; No entanto, o estudo de KimCurran mostraram que houve falta de correlação entre ERCC1
C8092A (rs3212986) SNP e OS ou eficácia /toxicidade da quimioterapia à base de platina em 300 pacientes chineses NSCLC tratados com quimioterapia [28]. Além disso, uma recente meta-análise mostrou não havia nenhuma evidência para apoiar a ERCC1
C118T (para 1187 agrupados pacientes) /C8092A (para 625 pacientes em pool) SNPs como preditor de prognóstico da quimioterapia à base de platina em pacientes com NSCLC [29]. De fato, no presente estudo de 360 ​​pacientes com câncer gástrico, não encontramos nenhuma associação entre ERCC1
rs3212986 G > T SNP e OS. A análise estratificada mostrou que apenas em não-fumantes, o genótipo rs3212986 TT foi associado com uma HR significativamente maior ( P
= 0,028) após o ajuste para fatores clínicos. Mas depois de calcular FPRP para este achado significativo, observou-se um valor maior do FPRP, o que sugere um possível viés na estimativa pode ter ocorrido devido a um tamanho relativamente pequeno da amostra do presente estudo. Não havia nenhum valor de previsão de genótipos rs3212986 para OS em pacientes que receberam quimioterapia ou radioterapia, particularmente em brancos não-hispânicos, que são a maioria de todos os pacientes.

ERCC2
rs13181 e rs1799793 SNPs foram também já foi investigado por seu papel na sobrevivência paciente com câncer. Wu et al.
Indicou que pacientes com XPD Lys ^{751Gln
(rs13181) e Asp 312Asn
(rs1799793) genótipos variantes tinha NSCLC significativamente mais pobres sobrevivência em pacientes chineses [17]. Estudos anteriores também mostraram que ERCC2
rs13181 alelo G e rs1799793 alelo pode levar a uma baixa capacidade de NER, em comparação com os genótipos comuns [30], [31], [32] e, portanto, pode influenciar os resultados dos pacientes . O presente estudo mostrou que o ERCC2
genótipo rs1799793 AA foi associada a OS em pacientes com câncer gástrico. Nas análises ainda mais a estratificação, descobrimos que os RHs foram aumentadas no subgrupo de idade mais avançada (≥60 anos), tendo a história do sexo masculino de fumar, pacientes brancos não-hispânicos, tumor intestinal, com terapia de cirurgia, quimioterapia e radioterapia, o que pode indicar resultados mais pobres. Observamos também rs1799793 genótipo AA teve impacto significativo sobre a OS em pacientes que tinham tumores pouco diferenciados, mas não houve diferença significativa entre os diferentes estágios tumorais. No entanto, o FPRP e cálculo de potência estatística mostrou possíveis associações notáveis ​​com má OS apenas nos subgrupos de idade mais avançada, brancos não-hispânicos, tumor pouco diferenciado, tipo intestinal de tumor e com quimioterapia ou radioterapia. Portanto, alguns dos nossos resultados das análises estratificadas pode ser por acaso, por causa do tamanho reduzido da amostra nos subgrupos. Estes resultados, uma vez validados em estudos maiores, pode ser útil na avaliação de estratégia de tratamento com base no fundo genético para pacientes com diferentes características clínico-patológicas.}

Estudos anteriores demonstraram também alguns dados conflitantes sobre o papel da ERCC2
rs13181 T > G SNP na sobrevida de pacientes com câncer. Um estudo de 106 casos de câncer colorretal em uma população norte-americana descobriu que o genótipo rs13181 GG foi associado com maior risco de morte [33], e outra investigação de 72 pacientes espanhóis com câncer colorretal mostrou que estes pacientes com o heterozigoto rs13181 apresentada maior risco de portadores de genótipos TT ou GG [34]; Em contraste, Keam e colegas não encontraram nenhuma influência de genótipos rs13181 no OS em um estudo de 73 pacientes asiáticos com câncer gástrico [35], e Liu et al.
Indicou que XPD
Lys ^{751Gln (rs13181) não poderia ser determinante genético para o prognóstico de NSCLC avançado tratados com quimioterapia à base de platina [36]. No presente estudo de 360 ​​pacientes com câncer gástrico, não observamos qualquer associação significativa entre genótipos rs13181 e sobrevida global, nem em análises de estratificação. A possível explicação é que a freqüência do alelo de rs13181 SNP pode variar em diferentes grupos étnicos (por exemplo, o genótipo rs13181 variante GG tem uma frequência muito baixa na população asiática), e os números de casos em estudos anteriores eram muito pequenos (menos de 100 casos em estudos espanhóis e asiáticos), que poderia ter introduzido vieses em seus achados. Para o melhor de nosso conhecimento, o presente estudo é o maior estudo de caso somente com foco no SNP rs13181 em OS câncer gástrico em uma população norte-americana com a maioria dos caucasianos, mas estudos maiores são necessários para validar os nossos resultados.}

O efeito de um único SNP sobre o risco de morte ou resultados clínicos, se houver, pode ser limitado como seria de esperar, e os efeitos combinados de vários SNPs em ERCC1
e ERCC2
no mesmo cromossoma pode ser mais significativa. De fato, no presente estudo, observamos que os pacientes que tiveram pelo menos um dos genótipos três variantes desfavorável homozigotos (AA rs1799793, GG rs13181 e rs3212986 TT) tinha uma acentuadamente maior risco de morte, em comparação com aqueles com nenhum dos variante desfavorável genótipos homozigótica. Em uma análise mais aprofundada estratificação, descobrimos que a associação genótipo-sobrevivência permaneceu significativo na presença da maioria dos fatores de risco clínico-patológicas. Após FPRP e cálculo poder estatístico, as associações significativas foram notáveis ​​para os subgrupos de sexo masculino, brancos não-hispânicos, mal tumor diferenciado e tipo intestinal de pacientes com câncer gástrico, que levavam pelo menos um rs1799793 desfavorável /rs13181 /rs3212986 variante homozigoto. Estes resultados são biologicamente plausível, porque todos esses genótipos homozigotos variantes desfavorável pode coletivamente ter um efeito substancial sobre a capacidade de reparo do DNA. Além disso, uma associação mais significativa foi encontrada com a sobrevivência mais pobre na análise de haplótipos. Os pacientes com a rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplótipo (A-G-G) tiveram uma sobrevida significativamente mais pobres, em comparação com pacientes com o tipo selvagem G-T-G haplótipo. Esse efeito permaneceu significativa após o ajuste ( P
= 0,011), FPRP e cálculo do poder estatístico. O efeito cumulativo do haplótipo pode ser o resultado da sinérgica de cada SNP [17]. No entanto, o haplótipo A-G-T, que foi composta por todos os genótipos rs1799793A /rs13181G /variante rs3212986T, não houve associação com o OS no presente estudo. Uma das possíveis explicações é que os ERCC1
rs3212986 variante T genótipo não está associada a OS [28], [29], mas o genótipo G pode ter efeito sinérgico com o ERCC2
rs1799793 /rs13181 no OS, que precisa ser mais bem validado em estudos maiores.

O presente estudo tem algumas limitações. Em primeiro lugar, não fomos capazes de explorar o mecanismo exato pelo qual ERCC1
e ERCC2
SNPs influenciar sobrevivência de câncer gástrico. Em segundo lugar, embora o estudo incluiu um número relativamente grande de pacientes gástricas, em comparação com estudos publicados anteriormente de caucasianos, o número de casos com a variante genótipos homozigotos ainda era pequena, o que pode levar a viés estatístico nas análises, e estamos planejando confirmar os resultados atuais do nosso estudo em curso de uma população de estudo maior, com um maior tempo de seguimento. Em terceiro lugar, foram utilizados os SNPs funcionais comuns em nossa investigação, que não incluem todos os SNPs de representação em todo o gene. Alguns outros SNPs funcionais raras, que podem influenciar a sobrevivência, pode ter sido perdida e precisa ser investigado em estudos maiores. Forth, devido à limitação de dados clínicos indisponíveis, não fomos capazes de avaliar nem a sobrevida livre de doença nem o papel potencial dos SNPs por diferentes quimioterapia /radioterapias, eo quinto, mas teve resultados significativos, não houve replicação independente

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