Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: ERCC1 an ERCC2 Varianten virauszesoen traureg an Gastric Cancer Patients

Wat VerfÜgung

Zilsetzung VerfÜgung

ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung kritescher Rollen vun der Leeschtung Nukleotid excision Reparatur Passerelle datt effektiv Fléckaarbechte DNA Schued duerch chemotherapeutic Agenten entschlof. Dofir, funktionell Single Nukleotid schiefgang (SNPs) zu dësen Genen kéint en Impakt op Medeziner Resultater zu Kriibs Patienten hunn déi Chimiotherapie dobäi. Allerdéngs hunn puer Studien propagéieren gläichzäiteg d'Rollen vun ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung SNPs zu Medeziner Resultater am gastric Kriibs Patienten. VerfÜgung

hun Design VerfÜgung

Mir genotyped vun der TaqMan assay dräi gemeinsam, potentiel funktionell ERCC1 VerfÜgung (rs3212986) an ERCC2 VerfÜgung SNPs (rs13181 an rs1799793) an 360 gastric Kriibs Patienten. Mir benotzt souwuel Kaplan-Meier Tester an Cox proportional Risikoe Modeller d'Auswierkunge vun ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung genotypes an haplotypes op Medeziner Resultater ze zéien. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Mir hu fonnt, dass am Verglach mat ERCC2 VerfÜgung rs1799793 GG + AG genotypes, déi homozygous Variant AA genotype mat vill aarmen globale Iwwerliewe (OS) (AA vs. GG + AG verbonne war, Log-Platz P VerfÜgung = 0,012) a vill héicht Risiko Doud (AA vs. GG + AG, seng Risikoe Verhältnis [HR] 2,13; 95% CI, 1,28 bis 3,56; P VerfÜgung = 0.004). An kombinéiert gebueden, Patienten mat all eent vun den dräi encadréiere genotypes (dh ERCC1 VerfÜgung rs3212986 TT, ERCC2 VerfÜgung rs13181 GG an rs1799793 AA) haten statistesch relevant Risikoe vun aarme hätt (seng HR, 1.54 CI 95%, 1,06 bis 2,25;; P VerfÜgung = 0.025), am Verglach mat deene ouni encadréiere genotypes. Ausserdeem, d'haplotype AGG (rs1799793 /rs13181 /rs3212986) hat e groussen Impakt op OS (seng HR, 1,57; 95% CI, 1,11 bis 2,21; P VerfÜgung = 0.011), am Verglach mat der gemeinsamer haplotype GTG. VerfÜgung

Conclusioun VerfÜgung

ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung funktionell SNPs kënnen zesummen OS vun Caucasian gastric Kriibs Patienten betreffen. Weider grouss mèi Studien essentiel eis Conclusiounen ze confirméieren VerfÜgung

Fro:. Li Y, Liu Z, Liu H, Wang L-E, Tan D, Ajani JA, et al. (2013) ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung Varianten traureg an Gastric Cancer kennen virauszesoen. PLoS NËMMEN 8 (9): e71994. Doi: 10.1371 /journal.pone.0071994 VerfÜgung

Redakter: Xiaoping Miao, Tongji Medical College, Huazhong Universitéit vu Wëssenschaft an Technologie, China VerfÜgung

Arnaque: Mee 23, 2013; Akzeptéiert: 12 Juli, 2013; Publizéiert: September 2, 2013 VerfÜgung

Copyright: © 2013 Li et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dëst Fuerschung war déi Fongen vun der Texas 4000 dotéiert ënnerscheeden Professorship an der MD Anderson Schwëster Steierberoder Network Funds ënnerstëtzt. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric Kriibs ass den zweete Spëtzekandidat Ursaach vum Kriibs Doudesfäll, déi véiert stäerkste gemeinsam Kriibs an der Welt Ranking, mat ronn 989.600 nei Fäll an 738.000 Doudesfäll all Joer [1]. An den USA, waren et 21.600 nei Fäll a 10990 Doudesfäll am Joer 2013 [2] geschat. Fir gastric Kriibs Patienten, déi TNM (entholl /deelweis goufen /Metastasen) Etapp ass déi meeschten akzeptabel Moosse fir Effekter vun Therapien an hätt bewäert; awer, ass et net Verschiddenheet dass Patienten mat der selwechter entholl Etapp a Behandlung verschidde Resultater hun kann. Dofir, fir OLYMPIA an oncologists, géif et hëllefräich sinn d'Genauegkeet an en Medeziner Resultat ze verbesseren duerch genetesch Approchen Erkenntnesser déi individuell anticancer Therapie erliichtert hätt, post-operationell adjunctive Traitement a Suivi Strategien. An de leschte Joerzéngten hunn Studien fonnt dass genetesch Variatioune Rollen vun der Entwécklung an Werdegang vun gastric Kriibs Leeschtung. Eenzel Ënnerscheeder oder Variatiounen an Äntwert ze Chimioen oder radiotherapies wahrscheinlech wéinst hire verschiddene genetesch maachen-up'en, fir verschidde Krankheete Resultater Haaptfiguren. Zum Beispill, sinn eenzel Nukleotid schiefgang (SNPs) déi allgemeng propagéieren genetesch Variant Medeziner Resultater 'Patienten Afloss kann [3], [4], [5]. VerfÜgung

DNA Reparatur System spillt eng wichteg Roll am Erhalen der Stabilitéit vun bewosst Funktiounen a Frankräich Integritéit duerch d'reversal vun der beschiedegt DNA vun verschiddenen endogenous an /oder exogenous Faktoren entschlof, dorënner therapeutesch Agenten dofir, d'Provider DNA Reparatur Muecht ze Kriibs Patient Resultater bäidroen kënnen [6], [7]. Ënnert de gutt-bekannt DNA Reparatur Weeër, ass de Nukleotid excision Reparatur (NER) Passerelle eng wichteg Mechanismus datt andeems DNA Artikelen lesions oder interstrand adducts entschlof vun exogenous an /oder endogenous Faktoren Frankräich Integritéit ënnerhält [8], [9]. D'excision-Reparatur Kräiz-ergänzen complementation Grupp 1 (ERCC1) an excision-Reparatur Kräiz-ergänzen complementation Grupp 2 /xeroderma pigmentosum Grupp D (ERCC2 /XPD) Proteinen sinn déi zwee grouss Deeler vun der NER Prozess. ERCC1, encoded vun der Gentherapie um chromosome wellkomm 19q13.32, openee mat XPA /XPF an aner NER Proteinen, wéider der 5 'Trauer Aktivitéit an der NER Passerelle [10] hierkommen ERCC2, encoded vun der Gentherapie um chromosome 19q13.3 wellkomm , ass en ATP-ofhängeg helicase datt DNA unwinding fir d'Initiatioun vun NER [11]. VerfÜgung

fir Datum mediates, do sinn 36 coding SNPs zu ERCC1 VerfÜgung an 115 coding SNPs zu ERCC2 VerfÜgung gemellt goufen (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/). An deene coding SNPs, sinn d' ERCC2 VerfÜgung rs13181 an rs1799793 der nëmmen zwee nonsynonymous SNPs mat mannerjäregen allele Frequenz > 5%, an dës zwee SNPs hunn en Effekt op DNA Reparatur Muecht phenotype APESS zu, méiglecherweis duerch Wou muss ech der Aminosaier Haaptrei vun der FAQ [12], [13]. Zousätzlech, untranslated Regioun aner gemeinsam reglementaresche SNP um 3 vun ERCC1 VerfÜgung rs3212986 war Rapport mat der DNA Reparatur Muecht phenotype soll ginn [14] an e puer Effekt op ze hunn ERCC1 VerfÜgung mRNA Ausdrock [15]. Verschidde Studie berichten ugeholl datt niddereg ERCC1 VerfÜgung Ausdrock mat fräi chemotherapeutic Empfindlechkeet verbonnen ass an domat eng predictive Bewaacher fir Patiente considéréiert mat Net-kleng Zell haett Kriibs (NSCLC) behandelt mat Platin-baséiert Chimiotherapie [16], während déi aner Studien uginn dass ERCC2 VerfÜgung SNPs waren an Patienten mat NSCLC an Chinese Populatiounsschichte [17] mat aarmen Iwwerliewe assoziéiert. Ausserdeem, ERCC2 VerfÜgung rs13181 an rs1799793 SNPs gewiescht mat Kand besser prognostic dacks fir Patiente gewise ginn [18], colorectal Kriibs [19], a mëndlech Kriibs [20], mä zu Datum, hunn puer Studien prognostic propagéieren Wichtegkeet vun dësen SNPs zu gastric Kriibs Patienten. nëmmen eng kleng Étude zougedréckt Zum Beispill, datt ERCC2 Lys 751Gln VerfÜgung (rs13181) SNP engem predictive laanschtgaangen fir Resultater am schéin Patienten mat Etapp III /IV gastric Kriibs ginn [21]. VerfÜgung

Obwuel souwuel ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung op chromosome etabléiert sinn 19 a bei der NER Aktivitéit, hunn puer Studien propagéieren gläichzäiteg d'Auswierkunge vun ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung op gastric Medeziner Resultater Varianten, wéi an eiser leschter Revisioun vun engem meta-Analyse zesummegefaasst [22]. Dofir, Hypothes mir dass funktionell SNPs an haplotypes vun dësen zwou Genen kann en Impakt op gastric Kriibs hätt hunn. Am Moment studéieren, évaluéieren mir Associatiounen vun ERCC1 VerfÜgung (rs3213986) an ERCC2 VerfÜgung (rs13181, an rs1799793) SNPs mat Iwwerliewe vun gastric Kriibs Patienten. VerfÜgung

spontan a Methoden VerfÜgung

IFLA- Ausso VerfÜgung

Dës Etude Protokoll vun der Universitéit vun Texas MD Anderson Cancer Center Finanzpolitiker Kritik Board (IRB) abruecht huet, an all Patienten gëtt hir Awëllegung der IRB-guttgeheescht Awëllegung Formulaire benotzt . VerfÜgung

Patienten- Recrutement an Suivi VerfÜgung

Dës Etude och 360 Patienten, déi mat nei aus deenen ugesammelt huet festgestallte an histologically The gastric Kriibs confirméiert, onofhängeg vun Alter, Geschlecht, oder entholl Etapp, Universitéit vun Texas MD Anderson Cancer Center, Houston tëscht Februar 1990 an Abrëll 2012. déi Patienten, déi soss net nei festgestallte oder behandelt goufen ir zu MD Anderson Cancer Center huet aus dëser Etude ausgeschloss. Mir Interview all beliwwert Virentscheedung Daten op Tubak an Alkohol benotzen ze kréien. Déi gefëmmt hat manner wéi 100 Zigaretten an hir Liewensdauer sech als "ni Fëmmerten", an all anerer goufen als "schons Fëmmerten". Den Zerfall, Theme deen gedronk alkoholescht Gedrénks op d'mannst eemol pro Woch fir méi wéi 1 Joer virdrun waren definéiert als "schons drénken", an all déi aner sech definéiert als "ni drénken" haten. All Patient gespent enger eent-Zäit 10 ml vun der ganzer Blutt an enger heparinized Rouer fir genetesch Testen zréckgräifen. All abegraff d'Patienten am Moment Etude no sinn Bluttprouwen fir genotyping a Suivi Daten fir d'Resultater Fliessband. VerfÜgung

Genotyping VerfÜgung

Frankräich DNA war vun der Buffy Mantel Ëmwandlung vun der Blutt Prouf isoléiert , eng Blood Mini Kit benotzt (QIAGEN, Valencia, CA) no der Taktik vum Produzent. DNA Konzentratioune sech duerch spectrophotometric Miessung vun absorbance bei 260 nm alles an der purities sech duerch A260 /A280 Verhältnis berechent benotzt Nanodrop ND-1000 spectrophotometer (Thermo Wëssenschaftlech, Rockford, IL). Genotypes vun den dräi gewielte SNPs ( ERCC1 VerfÜgung rs3213986 G > T, ERCC2 VerfÜgung rs13181 T > G an rs1799793 G > A) sech mat der TaqMan Methodik standing zu 384-och Telleren an liesen mat der liichtkraaftarm Detektioun Software op d'Abi Prism 7900 Instrument fir d'Uweisungen d'Hiersteller no (Obwuel Biosystems, Foster City, CA). D'primers benotzt fir rs3213986 G > T, rs13181 T > G, an rs1799793 G > A sech CACAGGCCGGGACAAGAAGCGGAAG [A /C] AGCAGCAGCAGCAGCCTGTGTAGTC, TGCTGAGCAATCTGCTCTATCCTCT [G /T] CAGCGTCTCCTCTGATTCTAGCTGC, an CGGGGCTCACCCTGCAGCACTTCGT [C /T] GGGCAGCACGGGGTTGGCCAGGTGG, bzw.. All 384-gutt Plack hat véier negativ Kontrollen, eng positiv Kontroll an aacht widderhuelen Echantillon. Hinnen alleguer Reaktioune waren ënnert dëse Konditiounen gemaach: 50 ° C fir 2 min, 95 ° C fir 10 min, an dann 95 ° C fir 15 s an 60 ° C fir 1 min fir 40 zouféieren. Fir all genotypes, war d'assay Succèstaux > 99% an d'Resultater vun widderholl Echantillon 100% concordant sech VerfÜgung

statistique Analys VerfÜgung

D'Gemengeconsellje-vun-fit χ 2 Test. applizéiert den Hardy-Weinberg Gläichgewiicht vun genotype Verdeelung ze berechnen. D'Kaplan-Meier Method gouf benotzt fir globale Iwwerliewe (OS) vun dräi genotype Gruppen visualiséieren. D'OS Zäit war vum Datum vun Umeldung um M.D. Anderson dem Datum vun der leschter Kontakt oder Doud, an Patienten berechent, déi an der lescht Kontakt Liefzäite goufen waren an der Analyse censored considéréiert. D'Steiren Iwwerliewe Zäit (MST) war berechent, an d'Logbuch-Platz Test war fir Gläichberechtegung vun der Iwwerliewe distributions zu Test applizéiert. Univariate an multivariate Cox huet proportional Risikoe Modeller standing Risikoe nennen (Stonnen) an 95% Vertraue Intervalle (95% Direktiven ugeet) vun all genotype ze berechnen seng Wierkung op Iwwerliewe Devis mat oder ouni Upassung fir confounding Facteuren. Haplotypes sech opgrond vun der SAS PROC HAPLOTYPE Prozess benotzt, an Associatiounen tëscht haplotypes an OS sech duerch d'recessive genetesch Modell folgenden der xeroderma pigmentosum (Politik) genetesch Modell sech, wéi mer virdrun [23] benotzt. All Statistik Tester goufen zwee-eesäitegen, mat enger P VerfÜgung Wäert vun 0,05 bedeitendst considéréiert an all analyséiert goufen benotzt SAS Software Versioun 9.2 (SAS Institut, Cary, NC) gesuergt. Mir och de falschen-positiven Rapport Probabilitéit (FPRP) berechent de falschen-positiv association Conclusiounen ze entdecken. Fir all déi wichteg Resultater, uechtzéng mir virewech Probabilitéit vun 0,1 engem HR vun 2.0 fir eng Associatioun mat genotypes an alleles vun all SNP z'entdecken. Statistesch Muecht war och mat der online sinn PS Software Version 3.0 [24] berechent, [25]. Nëmmen déi bedeitendst Resultater mat statisteschen Muecht > 0,8 goufen an FPRP Wäert &Si besteet;. 0,2 enormen Veräin als VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Patienten- Charakteristiken a Krankheete Fonctiounen VerfÜgung

versichen a Krankheete Charakteristike vun d'Patienten sinn an Table 1. den Encadrement vun Patienten virgestallt um Diagnos mat engem Steiren Alter vun 60 Joer an engem mëttleren Alter vun 59,6 ± 12,4 Joer tëscht 19 a 89 Joer waren. Vun der 360 Patienten, waren et méi Männer (221, 61,39%) wéi Fraen (139, 38,61%), a besteet aus 224 (62.22%) Net-schéin Mof, 136 (37.78%) aner ethnicities (schéin, Schwaarz a asiatësch) , 191 (53.06%) schons Fëmmerten, an 188 (52.22%) schons Alkohol Konsument. Um leschte Suivi (September 2012), 178 (49.44%) gestuerwen, mat engem MST vun 16.02 Méint. Vun all de Patienten, 136 (37.78%) virgestallt mat Etappen sin-II an 224 (62.22%) mat Etappen III-IV. D'Verdeelung vun histological Zorte abegraff 169 (46.94%) intestinal carcinomas, 148 (41.11%) signet Ring carcinomas an 43 (11.94%) aner Zorten. D'Verdeelung vun histological hierer abegraff 113 (31.39%) moderéiert /moderéiert-aarm dat Fäll an 247 (68.61%) aarm dat Fäll. Fir d'Behandlung Kategorie, 136 (37.78%) Patienten hu chirurgesch Behandlung, 293 (81.39%) Patienten Chimiotherapie huet, an 114 (31.67%) Patienten scho radiotherapy (112 Patienten hu béid Chimiotherapie an radiotherapy). Wann all dës Verännerlechen sech zu engem Cox proportional Risikoe Réckgang Modell agebaut fir Upassung Risken ze berechnen nennen (Stonnen), Jongen Chirurgie (HR, 3,51; 95% CI, 2,37 bis 5,20; P VerfÜgung &Si besteet; 0.001) dien Etapp III-IV Krankheeten (HR, 2,54; 95% CI, 1,74 bis 3,69; P VerfÜgung &Si besteet; 0.001), an feieren radiotherapy (HR, 1,57; 95% CI, 1,11 bis 2,21; P VerfÜgung = 0.011) blouf statistesch relevant prognostic Indicateuren (umellen-Platz P VerfÜgung &Si besteet; 0,05; Table 1). Obwuel d'Brutto P VerfÜgung war 0,004 an d'Erhalen Chimiotherapie Grupp, déi seng HR net statistesch relevant ass ( P VerfÜgung = 0.902). VerfÜgung

Association tëschent ERCC1
a ERCC2 VerfÜgung SNPs an OS VerfÜgung

Mir ginn de Kaplan-Meier Method an de Cox Modell den Auswierkunge vun ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung ze diskutéieren SNPs op Patienten OS. Table 2 weist genotype distributions vun der ERCC1 VerfÜgung rs3213986 a ERCC2 VerfÜgung rs13181 an rs1799793 SNPs souwéi hir Associatiounen mat OS. D'observéiert genotypes am Patienten mat deenen eens vum Hardy-Weinberg Gläichgewiicht geschat ( P VerfÜgung = 0,466 fir rs1799793, P VerfÜgung = 0,820 fir rs13181, an P VerfÜgung = 0,789 fir rs3213986). An all Patienten, déi ERCC2 VerfÜgung rs1799793 G > A SNP weisen eng statistesch relevant Associatioun mat OS, an der MST fir Patiente mat AA genotype war kuerz wéi dat an deene mat der gemeinsamer GG genotype (13.2 Méint vs. 15,8 Méint; Log-Platz P VerfÜgung = 0,012). An der Cox Analyse, Patienten mat der Variant AG /AA genotypes zu univariate Modeller vill méi Risikoe vun Doud Schatzkummer, am Verglach mat deenen, déi d'GG genotype haten (HR, 1,46; 95% CI, 1,07 bis 2,00 a P
= 0,017 fir AG, a HR, 2,23; 95% CI, 1,33 bis 3,75 a P VerfÜgung = 0,002 fir AA, bzw.). Der Upassung vum Geschlecht, Alter, Fëmmen Status, Alkohol benotzen, entholl Etapp, nach histological Schouljoer, histological Aart a Behandlung an enger multivariate Cox Modell, den AA genotype haten statistesch oss op OS, am Verglach mat rs1799793 GG genotype (HR, 2,18; 95% CI, 1,26 bis 3,78 a P VerfÜgung = 0.006) oder GG + AG genotype (HR, 2,13; 95% CI, 1,28 bis 3,56 a P VerfÜgung = 0.004) (Dorënner 1A) . Fir déi aner zwee ERCC2 VerfÜgung rs13181 a ERCC1 VerfÜgung rs3212986 SNPs, obschons béid SNPs Associatiounen mat enger Tendenz vun fräi HR mat abezuelt genotypes zougedréckt, et war keng statistesch relevant Associatioun mat OS ënnert engem recessive genetesch Modell (Table 2). VerfÜgung

Iwwerliewe vun gastric Kriibs Patienten vun kombinéiert genetesch Risiko Faktoren VerfÜgung

de gemeinsame Effet vun der dräi SNPs op Patient hätt ze bewäerten, mir dräi Variant homozygous genotypes kombinéiert (dh, ERCC1 VerfÜgung rs3212986 TT, ERCC2 VerfÜgung rs13181 GG, an rs1799793 AA). Vun all de Patienten, déi 63 Patienten op d'mannst eng Variant homozygote genotype, an dës Patienten hu statistesch relevant Risikoe vun aarme hätt (seng HR, 1.54; 95% CI, 1.06-2.25; P VerfÜgung = 0.025), Verglach mat deene ouni (Table 2). VerfÜgung

Association tëschent ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung haplotypes an OS VerfÜgung

Well dës dräi SNPs sinn all op chromosome 19, mir lant weider hir haplotypes a bewäert hir kombinéiert Effekt op gastric Kriibs survivals. Am Allgemengen, waren et aacht haplotypes, vun deem fënnef Ofstänn haten > 5%, an déi aner dräi manner gemeinsam haplotypes waren nees eng Grupp unzeschléissen. Déi fënnef heefegen haplotypes an dëse Patienten goufen rs1799793 /rs13181 /rs3212986 G-T-G, E-G-T, G-T-T, E-G-G, an G-G-G mat der Frequenz vun 52,2%, 13,9%, 12,6%, 9,4%, an 6,8%, respektiv. Am Verglach mat de meeschte gemeinsam GTG haplotype no der AGG haplotype engem groussen Impakt op OS (seng HR, 1,57; 95% CI, 1,11 bis 2,21; P VerfÜgung = 0.011) (Table 3) (Dorënner 1B). VerfÜgung

Stratification Analyse tëscht der recessive genotypes a Punkto Iwwerliewe VerfÜgung

Mir standing stratified Analyse ze ermëttelen, ob d'SNPs an hir kombinéiert genotypes zu engem recessive Modell op Iwwerliewe 1 vun e puer wichteg clinicopathological Facteuren an Table geännert huet . Mir hunn erausfonnt, datt d' ERCC2 VerfÜgung rs1799793 AA genotype enger héijer Doud Risiko vun deenen Kranken an déi (≥60 Joer) al sinn, männlech, Net-schéin wäiss, fëmmen Geschicht anzegoen, aarm Ënnerscheed, intestinal Typ vu vireran erhéijen, an dass all Behandlung (Operatioun, Chimiotherapie oder radiotherapy). Mir och statistesch relevant aarmséileg hätt an männlech Patienten mat der ERCC2 VerfÜgung rs13181 GG genotype observéiert, an non-fumeur Patienten mat der ERCC1 VerfÜgung re3212986 TT genotype (Table 4). D'kombinéiert Analysë weisen, dass Patienten mat kengem vun den dräi Variant homozygote genotypes en héicht Risiko Doud leiden géif, besonnesch vun deenen, déi méi al waren (≥60 Joer), männlech, Alkohol Benotzer, Net-schéin wäiss, dien aarmséileg Ënnerscheed, intestinal Typ vun erhéijen mat Etappe I /II, an dass Chimiotherapie (Table 4). VerfÜgung

Endlech hu mer de FPRP Wäerter bei verschiddene virewech Probabilitéit Niveau wéi och statistesch Kraaft fir all wichteg Conclusiounen (Table 5) berechent. Fir e Welpen Probabilitéit vun 0,1, war d'HR fir spezifesch genotype unzehuelen 2.0, goufen d'FPRP Wäerter 0,044, 0,079, 0,087 an 0,197, mat statisteschen Muecht vun 0,930, 0,927, 0,903 an 0.842 (D'Type ech Fehler Wahrscheinlechkeet mat dësem Test verbonne vun dëst wäert Hypothes gëtt 0,05), respektiv, fir eng Associatioun vun den ERCC2 VerfÜgung rs1799793 AA genotype, AGG haplotype a 1-3 vun ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung Risiko genotypes, respektiv, proposéiert, datt dës zu all Persounen enormen Conclusiounen ginn, a mir géifen déi automatesch Hypothes ze refuséieren kënnen déi abezuelt a Referenzmaterial Iwwerliewe Kéiren gläich mat statisteschen Muecht > huet; 0,8. Ausserdeem goufen meescht vun de wesentleche Associatiounen an stratified Analysë als enormen well d'Wahrscheinlechkeet vun engem falschen-positive Resultat war &Si besteet; 0,2 a statistesch Muecht > 0,8 (Table 5). Trotzdem, e puer grouss FPRP Wäerter (> 0,2) sech fir e puer anere wichtegen Associatiounen an stratified Analysë observéiert (e.g. ERCC2 VerfÜgung rs13181 a ERCC1 VerfÜgung rs3213986 Variant genotypes mat gastric Kriibs OS). Fir déi bedeitendst Associatiounen mat statisteschen Muechten &Si besteet; 0,8, konnt mer net déi automatesch Hypothes refuséieren, datt d'Iwwerliewe Kéiren tëscht der Aktioun an der Referenz Gruppen selwecht waren, an déi op der grousser FPRP Wäerter goufen entspriechend (> 0,2) (Table 5) , eng méiglech Westen an dës positiv Experienz suggeréiert datt am groussen Studien an der Zukunft validéiert gin brauchen. VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

am Moment studéieren, mir ob funktionell propagéieren ERCC1 VerfÜgung rs3213986 G > T an ERCC2 VerfÜgung rs13181 T > G an rs1799793 G > a SNPs hunn all eenzel oder zesummen Auswierkungen op de Medeziner Resultater vun gastric Kriibs Patiente an engem North American Patient Populatioun. Mir hunn erausfonnt, datt d' ERCC2 VerfÜgung rs1799793 AA genotype zu engem vill méi kuerz Iwwerliewe Zäit matgehollef, am Verglach mat der AG /GG genotype. Der Upassung vun anere Medeziner Faktoren, d'Auswierkunge vun der ERCC2 VerfÜgung rs1799793 AA genotype, den Auswierkunge vun der dräi Variant homozygote genotypes, an der rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplotype AGG all blouf als bedeitendst dacks fir aarmen Medeziner Resultater dës Etude Populatioun. Ausserdeem, bleift dësen Effekter och zu stratification analyséiert. Am Allgemengen, Patienten mat der ERCC2 VerfÜgung rs1799793 AA genotype géif héich Doud Risiko hunn, besonnesch an deenen, déi méi al waren (≥60 Joer), Net-schéin wäiss, dien aarmséileg Ënnerscheed, intestinal Typ vun erhéijen, an dien Chimiotherapie oder radiotherapy. Ausserdeem, Patienten mat kengem vun de rs1799793 /rs13181 /rs3212986 Variant homozygote genotypes géif eng héicht Risiko Doud leiden, besonnesch vun deenen, déi männlech waren, non-schéin wäiss, aarm Ënnerscheed an intestinal Typ vun erhéijen mussen. VerfÜgung

et ass bekannt, datt e puer clinicopathological Charakteristiken, wéi entholl Etapp a Behandlung, mat Iwwregens hätt vun Kriibs Patienten verbonne sinn. Allerdéngs waren mir interesséiert a funktionell genetesch Varianten vun DNA Reparatur Genen dass Patienten Iwwerliewe an Äntwert ze Chimiotherapie well si kann. D'NER Prozess ass eng wichteg DNA Reparatur Mechanismus, datt Frankräich Integritéit, souwuel zu normal an entholl Zellen, an déi Ännerungen an der NER Muecht kënnen entweder méi oder reduzéieren DNA stattfannen Ofstänn als Resultat vun unrepaired beschiedegt DNA ënnerhält, déi Äntwert "Patienten ofzeänneren vläicht zu der Therapie, kann malignant Werdegang an Metastasen an domat huet. ERCC1 an ERCC2 sinn zwee Schlësselwierder Quote-limitéieren Enzymen an der multistep NER Prozess trëtt. ERCC1 ass zu DNA Schued Unerkennung Équipe, an ERCC2 ass e Member vun enger néng-subunit komplex Mënsch transcriptional Initiatioun Faktor TFIIH mat ATP-ofhängeg helicase Aktivitéit. Dofir, potentiel funktionell ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung SNPs vläicht bewosst DNA Reparatur Muecht [26] Afloss an domat mat verschidde Iwwerliewe Tauxe Kriibs Patienten observéiert verbonne ginn. VerfÜgung

virdrun Rapporten iwwert d'Associatioun tëschent ERCC1 VerfÜgung rs3212986 a Kriibs Iwwerliewe hunn kontrovers ginn. Zum Beispill, Takenaka et al. bewisen, datt ERCC1 rs3213986 SNP VerfÜgung der NSCLC hätt Afloss kënnen onofhängeg vun der ERCC1 VerfÜgung Ausdrock a Platin Empfindlechkeet vun 122 Japanesch NSCLC Patienten, déi e kompletten resection mécht [27]; Ee, KimCurran d'Etude gewisen, dass et e Mangel vun Korrelatioun war tëschent ERCC1 VerfÜgung C8092A (rs3212986) SNP an OS oder Efficacitéit /toxicity vun Platin-baséiert Chimiotherapie zu 300 Chinese NSCLC Patienten mat Chimiotherapie behandelt [28]. Doriwwer eraus, eng rezent meta-Analyse huet do keng Beweiser ERCC1 VerfÜgung C118T (fir 1187 hinzeginn Patienten) /C8092A (fir 625 hinzeginn Patienten) SNPs als prognostic Estimatioun vun Platin-baséiert Chimiotherapie zu Patiente mat NSCLC ze ënnerstëtzen huet [29]. Iwwerhaapt, am haitegen Etude vun 360 gastric Kriibs Patienten, mir hu keng association tëscht fannen ERCC1 VerfÜgung rs3212986 G > T SNP an OS. D'stratification Analyse weisen, datt nëmmen an Net-Fëmmerten, war d'rs3212986 TT genotype mat enger däitlech méi héich HR verbonne ( P VerfÜgung = 0.028) an der Upassung vun de Medeziner Facteuren. Mä no FPRP fir dës wichteg fannen oofhalen, eng grouss FPRP Wäert observéiert gouf, deen am Devis eng méiglech Westen mobiliséiert am Moment studéieren fir eng relativ kleng Prouf Gréisst wéinst Doudesfäll hunn kann. Et war keen en Wäert vun rs3212986 genotypes fir OS zu Patienten déi Chimiotherapie oder radiotherapy geduecht, besonnesch an Net-schéin Mof, déi d'Majoritéit vun all de Patiente sinn. VerfÜgung

ERCC2 VerfÜgung rs13181 an rs1799793 SNPs hunn och fir hir Rollen am Kriibs Patient Iwwerliewe propagéieren virdrun gouf. Wu et al. VerfÜgung uginn dass Patienten mat XPD Lys 751Gln VerfÜgung (rs13181) an ASPLanguage 312Asn VerfÜgung (rs1799793) abezuelt genotypes hu vill aarmen NSCLC Iwwerliewe vun Chinese Patienten [17]. Virdrun Etuden hunn och gewisen, datt ERCC2 VerfÜgung rs13181 G allele an rs1799793 A allele zu engem niddregen NER Muecht Féierung kéint, am Verglach mat der gemeinsamer genotypes [30], [31], [32] an domat Patient Resultater Afloss kënnen . Déi heiteg Etude gewisen, datt d' ERCC2 VerfÜgung rs1799793 AA genotype mat OS zu gastric Kriibs Patienten verbonne war. An weider stratification gebueden, fonnt mir datt d'Stonnen an der Ënnergrupp vun ale Alter (≥60 Joer) eropzesetzen, männlech, se fëmmen Geschicht, Net-schéin wäiss Patienten, intestinal entholl, Agrëff Therapie mussen, Chimiotherapie an radiotherapy, déi weisen, vläicht aarmen Resultater. Mir haten och rs1799793 AA genotype observéiert oss op OS vun Patienten, déi sech schlecht ënnerscheet entholl haten, awer kee groussen Ënnerscheed ass tëscht verschiddene entholl Etappen fonnt. der FPRP a statistesch Kraaft berechent zougedréckt Allerdéngs méiglech enormen Associatiounen mat aarmséileg OS nëmmen an der subgroups vun Alter, Net-schéin wäiss, schlecht ënnerscheet entholl, intestinal Typ vun entholl an Chimiotherapie oder radiotherapy mussen. Dofir, kann déi Chance puer vun eis Conclusiounen aus der stratified gebueden gin, well vun reduzéiert Prouf Gréisst vun der subgroups. Dës Conclusiounen, eemol am groussen Studien validéiert, kann an Evaluéieren Strategie Behandlung baséiert op genetesch Hannergrond fir Patiente mat verschiddene clinicopathological Charakteristiken nëtzlech gin. VerfÜgung

virdrun Studien hun och e puer contraire Donnéeën iwwert d'Roll vun bewisen ERCC2
rs13181 T > G SNP am Iwwerliewe vu Kriibs Patienten. Eng Etude vun 106 colorectal Kriibs Fäll zu enger North American Populatioun fonnt dass den rs13181 GG genotype mat méi Risiko vum Doud assoziéiert gouf [33], an aner Enquête vu 72 Spuenesch Patienten mat colorectal Kriibs gewisen, datt dës Patienten mat der rs13181 heterozygote héicht Risiko ugewisen wéi wwerreeche vun TT oder GG genotypes [34]; Am Géigesaz, Keam a Kollegen fonnt huet keen Afloss vun rs13181 genotypes op OS an enger Etude vun 73 asiatësch Patienten mat gastric Kriibs [35], an Liu et al. VerfÜgung uginn dass XPD VerfÜgung Lys 751Gln (rs13181) konnt net genetesch Projet fir mat Platin-baséiert Chimiotherapie [36] behandelt vun fortgeschratt NSCLC hätt ginn. Am Moment studéieren vu 360 Patienten mat gastric Kriibs, hu mir net all bedeitend association tëscht rs13181 genotypes a Punkto Iwwerliewe fest, nach an stratification analyséiert. Déi méiglech Erklärung dofir ass, datt d'allele Frequenz vun rs13181 SNP am verschidden ethnesch Gruppen variéiere kann (zB, déi rs13181 GG Variant genotype engem Héich Frequenz an asiatesch Bevëlkerung huet), an d'Zuel vun de Fäll zu virewech Studien waren ze kleng (manner wéi 100 Fäll an déi spuenesch an asiatesch Studien), déi biases an hir Conclusiounen agefouert hätt. Fir de beschte vun eisem Wëssen, déi heiteg Etude ass de gréisste case-eenzeg Etude op der rs13181 SNP am gastric Kriibs OS zu engem North American Populatiounsschichte mat enger Majoritéit vun Caucasians Themeschwéierpunkten, mee grouss Etuden sinn néideg fir eis Conclusiounen validéieren. VerfÜgung

d'Wierkung vun engem eenheetlechen SNP op Doud Risiko oder Krankheete Resultater, wann iwwerhaapt, kann limitéiert sinn, wéi ee géif erwaarden, an den Effete vun e puer SNPs zu ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung op der selwechter chromosome vläicht méi däitlech ginn. Iwwerhaapt, an de Grëff ze studéieren, observéiert mir dass Patienten, déi op d'mannst een vun den dräi encadréiere Variant homozygous genotypes (rs1799793 AA, rs13181 GG an rs3212986 TT) haten no engem Ofstand Risiko vum Doud fräi, am Verglach mat deene mat keent vun der encadréiere Variant homozygous genotypes. An weider stratification Analyse, fonnt mir dass d'genotype-Iwwerliewe Veräin an der Präsenz vun de meeschte clinicopathological Risiko Faktoren bedeitendst bliwwen. No FPRP a statistesch Kraaft berechent, huet de wesentleche Associatiounen fir d'subgroups vun männlech enormen, Net-schéin wäiss, schlecht ënnerscheet entholl an intestinal Typ vun gastric Kriibs Patienten, déi op d'mannst ee encadréiere rs1799793 /rs13181 /rs3212986 Variant homozygote sech Droen. Dës bruet ginn biologically plausibel, well all dës encadréiere Variant homozygous genotypes zesummen eng substantiell Effekt op d'DNA Reparatur Muecht hun kann. Doriwwer eraus, war e méi groussen Veräin mat der aarmen Iwwerliewe vun der haplotype Analyse fonnt. Patienten mat der rs1799793 /rs13181 /rs3212986 (A-G-G) haplotype haten eng wiesentlech méi aarmen Iwwerliewe, am Verglach mat Patienten mat der Show-Typ G-T-G haplotype. Dësen Effekt blouf bedeitendst der Upassung ( P VerfÜgung = 0.011), FPRP a statistesch Kraaft berechent. Entwéckele Effet vun der haplotype kéint d'Resultat vun der synergistic vun all SNP [17] ginn. Trotzdem, d'E-G-T haplotype, déi vun all rs1799793A /rs13181G /rs3212986T Variant genotypes komponéiert huet, war net Associatioun mat OS am Moment studéieren. Ee vun de méiglech Explikatioune gëtt, datt d' ERCC1 VerfÜgung rs3212986 Variant T genotype net mat OS [28], assoziéiert ass [29], mä de G genotype kéint synergistic Effekt hun mat ERCC2 VerfÜgung rs1799793 /rs13181 op OS, wat weider zu grousse Studien validéiert ze ginn brauch. VerfÜgung

déi heiteg Etude huet e puer Aschränkungen. Éischt, mir gedanzt der geneeër Mechanismus Entdeckung vun deenen ERCC1 VerfÜgung a ERCC2 VerfÜgung SNPs Afloss gastric Kriibs Iwwerliewensfro. Zweet, wann de Moment studéieren eng relativ grouss Zuel vu gastric Patienten mat abegraff, am Verglach mat virdrun publizéiert Etuden vun Caucasians, war d'Zuel vun de Fäll mat abezuelt homozygous genotypes nach kleng, wat vun der Analysë fir statistesch Westen nodeems kënnen, a mir sinn Planung ze confirméieren aktuell Conclusiounen vun eise Litige Etude vun enger grousser Etude Bevëlkerung mat enger méi Suivi Zäit. Drëttel, déi mir déi gemeinsam funktionell SNPs an eiser Enquête, déi net all Vertrieder SNPs am ganze Gentherapie gehéiert huet. Verschidden aner rar funktionell SNPs, déi Iwwerliewe Afloss kann, nëmmen gewiescht kann a muss am groussen Studien propagéieren gin. Verlaangen, wéinst der begrenzten Dauer vun erreechbar Medeziner Daten, huet mir net konnt weder d'Krankheet-gratis Iwwerliewe nach d'Potential Roll vun der SNPs duerch verschidden Chimiotherapie /radiotherapies, an fënneften ze diskutéieren, obwuel mir wichteg Resultater hat, do war keng onofhängeg Gedächtnis

Other Languages