Namen
ERCC1 genotipizacijo smo ki jih je TaqMan testom tri skupne, lahko funkcionalni ERCC1 Rezultati Ugotovili smo, da je v primerjavi s ERCC2 Zaključek ERCC1 Navedba. Li Y, Liu Z, Liu H, Wang L-E, Tan D, Ajani JA, et al. (2013) ERCC1 Urednik: Xiaoping Miao, Tongji Medical College, Huazhong univerza za znanost in tehnologijo, Kitajska Prejeto: 23. maj 2013; Sprejeto: 12 julij 2013; Objavljeno: 2. september 2013 Copyright: © 2013 Li et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo Financiranje:. Ta raziskave je bila podprta s sredstvi iz The Texas 4000 obdarjen Distinguished profesor in MD Anderson Sister zavoda mreže skladov. Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi Uvod rak želodca je drugi najpogostejši vzrok smrti zaradi raka, razvrstitev četrti najpogostejši rak na svetu, s približno 989.600 novih primerov in vsako leto 738,000 smrti [1]. V Združenih državah Amerike, so se po ocenah 21.600 novih primerov in 10990 smrtnih žrtev v letu 2013 [2]. Pri bolnikih z rakom želodca je TNM (tumor /vozlički /metastaze) faza je najbolj sprejemljivo merilo za ocenjevanje učinkov terapije in prognozo; Vendar pa ni neobičajno, da imajo pacienti z isto stopnjo in zdravljenje tumorjev različne rezultate. Zato je za kirurge in onkologi, bi bilo koristno, da se izboljša natančnost pri napovedovanju rezultatov kliničnih raziskav, ki jih ugotavljanje genetskih oblikovalce, da bi olajšali individualizirano terapijo proti raku, post-operativno dopolnilno zdravljenje in nadaljnje strategije. V zadnjih desetletjih so študije pokazale, da genetske variacije igrajo vlogo pri razvoju in napredovanju raka želodca. Individualne razlike ali razlike v odzivu na kemoterapije ali radiotherapies verjetno zaradi različnih genetskih make-up, ki vodi do različnih kliničnih izidov. Na primer, mononukleotidnih polimorfizmov (SNP), so najbolj pogosto raziskovali genetske variacije, ki lahko vpliva na klinične rezultate pacientov [3] [4] [5]. popravilo DNA sistem igra ključno vlogo pri ohranjanju stabilnost celičnih funkcij in genomske integritete prek odprave poškodovanega DNK različnih notranjih in /ali zunanjih dejavnikov, vključno s terapevtskimi sredstvi inducirane; Zato lahko gostitelj DNK popravilo sposobnost prispevati k rezultatom rak pacientov [6] [7]. Med znanimi poti popravljanja DNK, nukleotid izrezu popravila (NER) pot je pomemben mehanizem, ki vzdržuje genomske integriteto z odstranitvijo DNA voluminozno poškodbe ali interstrand adukte s eksogenih in /ali endogenih faktorjev inducirane [8], [9]. V izrezu popravila cross-dopolnjevanjem dopolnjevanja Skupina 1 (ERCC1) in izrezu za popravila dopolnjevanje skupina 2 /pigmentne kseroderme skupina D (ERCC2 /XPD) beljakovine-cross dopolnjujejo sta dve glavne sestavine procesa NER. ERCC1, kodiran z genom, ki se nahaja na kromosomu 19q13.32, komunicira z XPA /XPF in drugih ner proteinov, usmerjanje 'rez dejavnost 5 v NER poti [10], medtem ko ERCC2, kodiran z genom, ki se nahaja na kromosomu 19q13.3 , je ATP-odvisne helikaza da posreduje DNA odvijanje za začetek NER [11]. Do sedaj je 36 kodiranja SNP v ERCC1 Čeprav sta ERCC1 Etika izjava Ta študija protokol je bil odobren z Univerze v Teksasu MD Anderson Cancer Center Institutional Review Board (IRB), in vsi bolniki so pod njihovo informirano soglasje uporabo IRB-odobril, obveščati obrazec za soglasje . zaposlovanje pacientov in spremljanje To študijo je bilo vključenih 360 bolnikov, ki so bili, ki so nastali od tistih, ki imajo na novo diagnosticirano in histološko potrjeni raka na želodcu, ne glede na starost, spol ali stopnjo tumorja, na University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, Texas med februarjem 1990 in aprilom 2012. Tisti bolniki, ki niso bili na novo diagnosticiranih ali obdelane na drugem mestu pred prihodom v MD Anderson Cancer Center so bili izključeni iz te študije. razgovor smo vsakega upravičenega udeleženca za pridobitev podatkov o kajenju tobaka in alkohola. Tisti, ki so v svojem življenju pokadili manj kot 100 cigaret, so bile obravnavane kot "nikoli kadilcev", in vsi drugi so se šteli kot "doslej kadilcev". Podobno so osebe, ki so imeli pili alkoholne pijače vsaj enkrat na teden, za več kot 1 leto prej opredeljena kot "doslej pivcev", in vsi drugi so bili opredeljeni kot "nikoli pivcev". Vsak bolnik podarila enkratni 10 ml polne krvi sestavljen v heparinizirane cevi za genetsko testiranje. Vsi bolniki v tej študiji so imeli na voljo vzorci krvi za genotipizacijo in nadaljnjih podatkov za oceno rezultatov. genomske DNK smo izolirali iz buffy coat frakcije vzorca krvi z uporabo Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA), v skladu z navodili proizvajalca. Koncentracije DNA smo določili s spektrofotometrično merjenjem absorbance pri 260 nm in čistosti so izračunani z razmerjem A260 /A280 z uporabo Nanodrop ND-1000 spektrofotometer (Thermo Scientific, Rockford, IL). Genotipov treh izbranih SNP ( ERCC1 Statistična analiza χ 2 test dobrota-of-fit. je bila uporabljena za izračun Hardy-Weinberg ravnovesje distribucije genotipa. Metoda Kaplan-Meier je bila uporabljena za vizualizacijo celokupno preživetje (OS) za tri genotipov skupine. Čas OS je bila izračunana od datuma prijave na doktor Anderson do dneva zadnjega stika ali smrti, in pri bolnikih, ki so bili še živi v zadnjem stiku so bile upoštevane cenzurirani v analizi. Čas Mediano preživetje (MST) smo izračunali, in je bil uporabljen test log-rank za testiranje enakosti porazdelitve za preživetje. Univariatne in multivariatne Cox sorazmernih tveganj modeli so bili izvedeni za izračun razmerja nevarnosti, (h) in 95% intervali zaupanja (95% CIS) vsakega genotipa za ocenjevanje vpliva na preživetje, z ali brez prilagoditve za zavajajočih dejavnikov. Haplotipov so pridobi z uporabo postopka haplotip SAS PROC in združenja med haplotipov in OS so določena z recesivno genetsko modela po pigmentne kseroderme (XP) genetskega modela, kot smo vajeni že prej [23]. Vsi statistični testi so bili dvostranski, z P Rezultati Značilnosti bolnikov in klinične značilnosti Demografske in klinične značilnosti bolniki so prikazani v tabeli 1. starost bolnikov je bila med 19 in 89 let po diagnozi s srednjo starostjo 60 let in povprečna starost 59,6 ± 12,4 let. Med 360 bolniki, je bilo več moških (221, 61,39%) kot žensk (139, 38,61%), ki je sestavljena iz 224 (62,22%), non-Hispanic belci, 136 (37,78%), druge narodnosti (Hispanic, Črno-azijskih) , 191 (53,06%) kdaj kadilci in 188 (52,22%) kdaj alkohol potrošniki. Na zadnjem pregledu (september, 2012), 178 (49,44%) je umrl, z MST od 16.02 mesecev. Od vseh bolnikov, 136 (37,78%) je fazah I-II in 224 (62,22%) pri stopnjah III-IV. Porazdelitev histoloških tipov vključenih 169 (46,94%) črevesnih karcinomov, 148 (41,11%) pečatni prstan karcinomov in 43 (11,94%), druge vrste. Porazdelitev histoloških razredov vključenih 113 (31,39%) zmerne /zmerno slabe primere diferenciacije in 247 (68,61%) slabe primere diferenciacije. Za kategorijo zdravljenja, je bilo 136 (37,78%) bolnikov kirurško zdravljenje, 293 (81,39%) bolnikov je kemoterapijo in 114 (31,67%) bolnikov je prejemalo radioterapijo (112 bolnikov je imelo tako kemoterapijo in obsevanje). Ko so vseh teh spremenljivk, vključenih v Cox sorazmernih tveganj regresijskih modelih za prilagoditev za izračun nevarnosti razmerja (ur), v postopku kirurgija (HR, 3,51; 95% IZ, 2,37-5,20; P Uporabili smo metodo Kaplan-Meier in model Cox za oceno učinkov ERCC1 preživetje bolnikov želodca z rakom po kombinaciji dejavnikov genetska tveganja Da bi ocenili skupni učinek vseh treh SNP na prognozo bolnikov, smo združili tri variantne homozigotni genotipov (tj, ERCC1 zveza med ERCC1 Ker so te tri SNP vse na kromosomu 19, smo podrobneje preučiti svoje haplotipov in ocenili njihov skupni učinek na želodcu preživelih raka. Na splošno je bilo osem haplotipov, od katerih so imeli pet frekvenc > 5%, in ostali trije manj pogosti haplotipi so bile združene v eno skupino. Pet najpogostejših haplotipov pri teh bolnikov je bilo rs1799793 /rs13181 /rs3212986 G-T-G, A-G-T, G-T-T, A-G-G in G-G-G s frekvenco 52,2%, 13,9%, 12,6%, 9,4%, 6,8% oz. V primerjavi z najpogostejšo GTG haplotipom imela AGG haplotip pomembno vplivajo na OS (prilagojena HR, 1,57; 95% IZ, 1,11-2,21; P analiza stratifikacija med recesivnih genotipov in celokupno preživetje opravili smo slojevito analizo, naj preuči, ali bi bila SNP in njihovi kombinaciji genotipov v recesivna modela za preživetje je bila spremenjena z nekaterimi pomembnimi clinicopathological dejavnikov v tabeli 1 . Ugotovili smo, da je ERCC2 na koncu smo izračunali vrednosti FPRP na različnih ravneh pred verjetnosti pa tudi statistično moč za vse večje ugotovitev (tabela 5). Za predhodno verjetnostjo 0,1, ob predpostavki, VP za posebno genotipa bila 2.0, so bile vrednosti FPRP 0,044, 0,079, 0,087 in 0.197, s statistično močjo 0,930, 0.927, 0.903 in 0.842 (verjetnostjo napaka tipa I, povezano s tem testu to ničelne hipoteze je 0,05), v tem zaporedju, za združenja za ERCC2 Pogovor v tej študiji smo raziskovali, ali funkcionalno ERCC1 znano je, da nekatere clinicopathological značilnosti, kot fazi in zdravljenje tumorjev, povezana s prognozo bolnikov z rakom. Vendar pa nas je zanimalo, funkcionalnih genetskih variant popravljanja DNA geni, ki lahko modulirajo preživetje bolnikov odziv na kemoterapijo. Proces NER je pomemben mehanizem popravljanja DNA, ki ohranja genomske celovitost, tako v normalnih in tumorskih celic in spremembe v zmogljivosti NER lahko bodisi poveča ali zmanjša pogostnost mutacije DNK zaradi nepopravljene poškodovano DNK, ki lahko vplivajo na odziv bolnika za terapijo in s tem povzroči maligni napredovanje in metastaz. ERCC1 in ERCC2 dve ključni mere omejuje encimi, ki delujejo v večstopenjski proces NER. ERCC1 se ukvarja s prepoznavanjem poškodbe DNA in ERCC2 je član devet podenote kompleksno človeško transkripcijski začetni faktor TFIIH z ATP-odvisne helikaza dejavnosti. Zato lahko funkcionalna ERCC1 Prejšnja poročila o pridružitvi med ERCC1 ERCC2 Prejšnje študije so pokazale tudi nekatere nasprotujoče si podatke o vlogi ERCC2 učinek samega SNP v smrtni nevarnosti ali klinične izide, če sploh, se lahko omeji, kot bi pričakovali, in kombinirani učinki več SNP v ERCC1 Ta raziskava ima nekatere omejitve. Prvič, nismo mogli raziskati natančen mehanizem, s katerim ERCC1
in ERCC2
igrajo ključne vloge v popravilo poti na nukleotidov ekscizijski da učinkovito popravila DNA poškodbe, povzročene s kemoterapevtiki . Zato bi lahko funkcionalni polimorfizmi enega nukleotida (SNP) v teh genov vplivajo na klinične izide pri bolnikih z rakom, ki so prejemali kemoterapijo. Vendar pa je le malo študij hkrati raziskovali vlogo ERCC1
in ERCC2
SNP v kliničnih izidov pri bolnikih z rakom želodca.
Eksperimentalni model
(rs3212986) in ERCC2
SNP (rs13181 in rs1799793) pri 360 bolnikih z rakom želodca. Uporabili smo tako teste Kaplan-Meier in Cox sorazmernih tveganj modelov za vrednotenje učinkov ERCC1
in ERCC2
genotipi in haplotipov na klinične izide.
rs1799793 GG + AG genotipi je homozigotno varianta AA genotip je bil povezan z bistveno slabšo celokupno preživetje (OS) (AA primerjavi GG + AG, log-rang P
= 0,012) in bistveno večje tveganje za smrt (AA vs, Prilagojeni nevarnosti razmerje [HR] 2,13 GG + AG; 95% iZ, 1,28-3,56; P
= 0,004). V kombiniranih analizah (na primer ERCC1
rs3212986 TT, ERCC2
rs13181 GG in rs1799793 AA) so imeli bolniki z enem od treh neugodnih genotipov statistično pomembne nevarnosti slabo prognozo (korigirano HR, 1,54; 95% IZ, 1,06-2,25; P
= 0,025), v primerjavi s tistimi brez neugodnih genotipov. Poleg tega je imel haplotip AGG (rs1799793 /rs13181 /rs3212986) pomembno vpliva na OS (Prilagojena HR, 1,57; 95% IZ, 1,11-2,21; P
= 0,011), v primerjavi s skupnim haplotip GTG.
in ERCC2
funkcionalne SNP lahko skupaj vplivajo na OS pri belcih bolnikov z rakom želodca. Dodatne velike prihodnje študije so bistvenega pomena za potrditev naše ugotovitve
in ERCC2
Variante Napovedati preživetje v želodčnih bolnikih z rakom. PLoS ONE 8 (9): e71994. doi: 10,1371 /journal.pone.0071994
in 115 kodiranje SNP v ERCC2
so poročali (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/). V teh kodiranje SNP, ERCC2
rs13181 in rs1799793 sta edini nonsynonymous SNP z manjšo alelov frekvenco > 5%, in ti dve SNP so dokazali, da vplivajo na popravilo DNA zmogljivosti fenotip, po možnosti z spreminjanjem aminokislinsko zaporedje proteina [12], [13]. Poleg tega je še en skupni regulativni SNP na neprevedene regije 3 ' ERCC1
rs3212986 so poročali, da se povezana z fenotipa v popravilo DNA zmogljivosti [14], in da imajo nekaj vpliva na ERCC1
mRNA izraz [15]. Nekatere študije so pokazale, da je nizka ERCC1
izraz je povezan s povečano kemoterapevtskim občutljivostjo in tako štejejo napovedni marker za bolnike z nedrobnoceličnim pljučnim rakom (pljuč), zdravljenih s kemoterapijo na osnovi platine [16], medtem ko drugi študije so pokazale, da je ERCC2
SNP so bile povezane s slabšim preživetjem pri bolnikih z nedrobnoceličnim rakom pljuč kitajskega prebivalstva [17]. Poleg tega, ERCC2
rs13181 in rs1799793 SNP so pokazale, da je napovedni napovednika za bolnike z osteosarkom [18], kolorektalnega raka [19], in rakom ustne votline [20], vendar do danes, le malo študij raziskati prognostični pomen teh SNP pri bolnikih z rakom želodca. Na primer, le majhen Študija je pokazala, da je ERCC2 Lys 751Gln
(rs13181) SNP lahko napovedni avtomat za izide v Hispanic bolnikih s stadijem III /IV rak želodca [21].
in ERCC2
se nahaja na kromosomu 19 in sodelujejo v dejavnosti NER, nekaj študij so hkrati preučevali učinke ERCC1
in ERCC2
variante na želodčnih kliničnih rezultatih, kot je povzeto v našem prejšnjem pregledu v meta-analizo [22]. Zato smo predpostavili, da imajo lahko funkcionalne SNP in haplotipov teh dveh genov vpliva na želodčno prognozo raka. V tej študiji smo ocenili združenja ERCC1
(rs3213986) in ERCC2
(rs13181 in rs1799793) SNP pri preživetju bolnikov z rakom želodca.
Materiali in metode
genotipizacijo
rs3213986 G > T, ERCC2
rs13181 T > G in rs1799793 G > A) so bile izvedene v skladu z metodologijo TaqMan v 384 vdolbinami in v povezavi s Software Sequence Detection na ABI Prism 7900 instrumenta v skladu z navodili proizvajalca (Applied Biosystems, Foster City, CA). Primerji, ki se uporabljajo za rs3213986 G > T, rs13181 T > G, in rs1799793 G > a so CACAGGCCGGGACAAGAAGCGGAAG [A /C] AGCAGCAGCAGCAGCCTGTGTAGTC, TGCTGAGCAATCTGCTCTATCCTCT [G /T] CAGCGTCTCCTCTGATTCTAGCTGC in CGGGGCTCACCCTGCAGCACTTCGT [C /T] GGGCAGCACGGGGTTGGCCAGGTGG oz. Vsak 384-tudi plošča je imel štiri negativne kontrole, eno pozitivno kontrolo in osem ponavljanju vzorcev. PCR reakcije smo izvedli pod naslednjimi pogoji: 50 ° C za 2 min, 95 ° C za 10 minut, nato pa 95 ° C 15 sekund in 60 ° C, 1 minuto pri 40 ciklih. Za vse genotipov, je bila stopnja uspešnosti test > 99% in rezultati ponavljajočih se vzorcev je bilo 100% skladnih
vrednost 0,05 šteje za pomembno in vse analize so bile opravljene z uporabo SAS različico programske opreme 9.2 (SAS Institute, Cary, NC). Prav tako smo izračunali poročilo verjetnost lažno pozitiven (FPRP) za odkrivanje lažno pozitivnih ugotovitvah združenja. Pri vseh pomembnih rezultatih, smo dodeljena predhodno verjetnost 0,1 odkriti HR 2,0 za združenje z genotipov in alelov vsakega SNP. Statistična moč je bila izračunana tudi s pomočjo spletnega voljo PS programsko opremo različice 3.0 [24] [25]. Le pomembne dosežke s statistično močjo > 0,8 bili in FPRP vrednost. ≪ 0,2 velja omeniti združenje
< 0,001) ob fazi III-IV bolezni (HR, 2,54; 95% IZ, 1,74-3,69; P
< 0,001), in sprejemanje radioterapijo (VP, 1.57; 95% CI, 1.11 do 2.21; P
= 0,011) ostala statistično pomembne napovedni kazalci (log-rank P
< 0,05; tabela 1). Čeprav surova P
je bilo 0.004 v sprejemnem kemoterapije skupine, prilagojena HR ni bila statistično značilna ( P
= 0,902).
zveza med ERCC1
in ERCC2
SNP in OS
in ERCC2
SNP na OS bolnikov. Tabela 2 prikazuje genotipa porazdelitev ERCC1
rs3213986 in ERCC2
rs13181 in rs1799793 SNP, kot tudi njihova združenja z OS. Opažene genotipov pri bolnikih strinjal s tistimi, ocenjen od Hardy-Weinberg ravnovesje ( P
= 0,466 za rs1799793, P
= 0,820 za rs13181 in P
= 0,789 za rs3213986). Pri vseh bolnikih, ERCC2
rs1799793 G > SNP je pokazala statistično pomembno povezavo z OS, in MST za bolnike z genotipom AA je bil krajši kot pri tistih, ki s skupnim GG genotipa (13,2 meseca v primerjavi z 15,8 mesecev, log-rank P
= 0,012). Pri analizi Cox, Razstavljal bolniki z variantnih genotipov AG /AA znatno povečale nevarnosti smrti v enolastnostnimi modelih, v primerjavi s tistimi, ki so imeli GG genotip (HR, 1,46; 95% IZ, 1,07 do 2,00 in P
= 0.017 za AG, in HR, 2,23; 95% IZ, 1,33-3,75 in P
= 0,002 za AA, v tem zaporedju). Po prilagoditvi glede spola, starosti, kajenja, uživanja alkohola, stopnjo tumorjev, histološke zgradbe, histološki tip in zdravljenje v multivariatno Cox modela, genotip AA ostali so imeli statistično značilno vplivala na OS, v primerjavi z rs1799793 GG genotipom (VP, 2.18; 95% IZ, 1,26-3,78 in P
= 0,006) ali GG + AG genotip (HR, 2.13; 95% CI, 1,28 do 3,56 in P
= 0,004) (Slika 1A) . Za druga dva ERCC2
rs13181 in ERCC1
rs3212986 SNP, čeprav sta SNP pokazala združenja s težnjo povečane VP z varianto genotipov, ni bilo statistično značilne povezave z OS točke a recesivna genetska model (tabela 2).
rs3212986 TT, ERCC2
rs13181 GG, in rs1799793 AA). Od vseh bolnikov je bilo 63 bolnikov vsaj eno varianto homozigoti genotip, in ti bolniki so imeli statistično pomembne nevarnosti slabo prognozo (prilagojena HR, 1,54; 95% IZ, 1,06-2,25; P
= 0,025), v primerjavi s tistimi brez (tabela 2).
in ERCC2
haplotipov in OS
= 0,011) (tabela 3) (slika 1B).
rs1799793 AA genotip so imeli večje tveganje za smrt pri bolnikih, ki so starejši (≥ 60 let), moški, non-Hispanic bela, ki podatke o kajenju, ki imajo slabo diferencial, črevesno vrsta tumorjev, in ki imajo katero koli zdravljenja (operacija, kemoterapijo ali radioterapijo). Prav tako smo ugotovili statistično značilno slabo prognozo pri moških bolnikih s ERCC2
rs13181 GG genotipa in nekadilske bolnikov z ERCC1
re3212986 TT genotipa (tabela 4). Združene Analize so pokazale, da bolniki s katero koli od homozigoti genotipov treh variantnih trpijo večje tveganje smrti, še posebej pri tistih, ki so bili starejši (≥ 60 let), moški, uporabniki alkohol, non-Hispanic bela, ima slabo diferencial, črevesne tip tumorjev z fazah I /II, in ki ima kemoterapijo (tabela 4).
rs1799793 AA genotip, AGG haplotipom in 1-3 ERCC1
in ERCC2
genotipov tveganja, oziroma, kar kaže, da so ti lahko omembe vredna ugotovitev pri vseh, in mi bi lahko zavrnemo ničelno hipotezo, da so variantne in referenčni krivulji preživetja enaka s statistično močjo > 0.8. Poleg tega so bile upoštevane večina pomembnih združenj v stratificiran analiz omeniti, ker je verjetnost lažno pozitiven rezultat je bil < 0,2 in statistično moč > 0,8 (tabela 5). Vendar pa nekatere večje vrednosti FPRP (> 0,2) smo opazili pri nekaterih drugih pomembnih združenj v stratificiran analizah (na primer ERCC2
rs13181 in ERCC1
rs3213986 variantne genotipov z želodčno OS raka). Za tiste pomembnih združenj s statističnimi pooblastili < 0,8, ne moremo zavrniti ničelne hipoteze, da so krivulje preživetja enaka med varianto in referenčnih skupin, in da so bili ustreza večjih vrednostih FPRP (> 0,2) (tabela 5) , kar kaže na kakšno morebitno pristranskost v teh pozitivnih rezultatov, ki jih je treba potrditi v večjih študij v prihodnosti.
rs3213986 G > T in ERCC2
rs13181 T > G in rs1799793 G > SNP imate individualne ali skupne učinke na klinične izide pri bolnikih z rakom želodca v severnoameriškem populacije bolnikov. Ugotovili smo, da je ERCC2
rs1799793 AA genotip prispevala k bistveno krajši čas preživetja, v primerjavi z AG /GG genotipa. Po prilagoditvi za druge klinične dejavnike, učinki ERCC2
rs1799793 AA genotip, kombinirani učinki treh variant homozigoti genotipov in rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplotip AGG vse ostalo kot pomembne predvidevanja za revnejše kliničnih izidih v tej populaciji v študiji. Poleg tega ti učinki ostala tudi v analizah razslojevanje. Na splošno se bolniki s ERCC2
rs1799793 AA genotipa bi imeli večje tveganje smrti, še posebej pri tistih, ki so bili starejši (≥ 60 let), non-Hispanic bela, ob slabo diferencial, črevesno vrsto tumorjev, in ob kemoterapiji ali radioterapije. Poleg tega bi bolnike s katerim koli od rs1799793 /rs13181 /rs3212986 variantnih homozigoti genotipov trpijo večje tveganje smrti, še posebej pri tistih, ki so bili moški, non-Hispanic bela, ob slabo različno in črevesno vrsto tumorjev.
in ERCC2
SNP lahko vplivajo na celično popravilo DNA zmogljivosti [26], zato je lahko povezano z različnimi stopnjami preživetja opazili pri bolnikih z rakom.
rs3212986 in preživetja raka so bila sporna. Na primer, Takenaka sod. je pokazala, da ERCC1
rs3213986 SNP bi lahko vplivale na NSCLC prognozo ne glede na ERCC1
izražanja in platina občutljivost v 122 japonskih nedrobnoceličnim rakom pljuč bolnikov, ki je doživel popolno resekcijo [27]; Vendar pa študija KimCurran je pokazala, da je bilo pomanjkanje korelacije med ERCC1
C8092A (rs3212986) SNP in OS ali učinkovitosti /strupenosti kemoterapijo na osnovi platine pri 300 bolnikih, kitajski nedrobnoceličnim rakom pljuč, zdravljenih s kemoterapijo [28]. Poleg tega je nedavna meta-analiza je pokazala, ni bilo dokazov, da podpirajo ERCC1
C118T (za 1187 združeni bolnikov) /C8092A (za 625 zbranih bolnikov) SNP kot prognostični napovedovalec kemoterapijo na osnovi platine pri bolnikih z nedrobnoceličnim pljučnim rakom [29]. Dejansko je v tej študiji 360 bolnikov z rakom želodca, nismo našli nobene povezave med ERCC1
rs3212986 G > T SNP in OS. Analiza je stratifikacija je pokazala, da je le pri nekadilcih, je rs3212986 TT genotip povezana z občutno višjim VP ( P
= 0.028), po prilagoditvi za klinične dejavnike. Toda po izračunu FPRP za te pomembne ugotovitve, so opazili večjo FPRP vrednost, ki kaže, bi lahko prišlo do možna pristranskost pri oceni zaradi relativno majhnega vzorca v tej študiji. Ni bilo Predvidevanje vrednost rs3212986 genotipov za OS pri bolnikih, ki so prejemali kemoterapijo ali radioterapijo, zlasti v non-Hispanic belci, ki so večina vseh bolnikov.
rs13181 in rs1799793 SNP so bili v preteklosti raziskovali tudi za njihove vloge v raka preživetju bolnikov. Wu et al.
Je pokazala, da pri bolnikih s XPD Lys 751Gln
(rs13181) in Asp 312Asn
(rs1799793) variantne genotipov imeli bistveno slabše nedrobnoceličnim pljučnim rakom preživetje v kitajskih bolnikov [17]. Prejšnje študije so tudi pokazale, da je ERCC2
rs13181 alel G in rs1799793 alela lahko vodi k nizki zmogljivostjo NER, v primerjavi s skupnimi genotipov [30], [31], [32] in s tem bi lahko vplivale na izid bolezni pri bolniku . Sedanja Študija je pokazala, da je je ERCC2
rs1799793 AA genotip povezano z OS pri bolnikih z rakom želodca. V analizah dodatna razčlenjenost, smo ugotovili, da so bile ur v podskupini starosti (≥ 60 let), moški, ki ima zgodovino kajenja, non-Hispanic belih bolnikih, črevesne tumor povečala, ob kirurgija zdravljenje, kemoterapija in radioterapija, kar lahko pomeni, slabše rezultate. Opazili smo tudi rs1799793 AA genotip je imel velik vpliv na OS pri bolnikih, ki so imeli slabo diferenciran tumor, vendar ni bistvene razlike je bilo med različnimi stopnjami tumorjev. Vendar pa je FPRP in izračun statistične moči pokazala morebitne opazne zveze s slabim OS samo v podskupinah starosti, non-Hispanic bela, slabo diferenciran tumor, črevesne vrste tumorja in s kemoterapijo ali radioterapijo. Zato so lahko nekatere naše ugotovitve iz stratumov analiz se po naključju, zaradi zmanjšane velikosti vzorca v podskupinah. Te ugotovitve, ko so potrjeni v večjih študij, so lahko koristne pri ocenjevanju strategije zdravljenja, ki temelji na genetsko ozadje za bolnike z različnimi clinicopathological značilnosti.
rs13181 T > G SNP pri preživetju bolnikov z rakom. Študija 106 debelega primerov raka v severnoameriški prebivalstva, je pokazala, da je bila rs13181 GG genotip povezana s povečanim tveganjem za smrt [33], in še ena preiskava 72 španskih bolnikov s kolorektalnim rakom je pokazala, da ti bolniki z rs13181 heterozigotnosti prikaže večje tveganje kot nosilci TT ali GG genotipov [34]; V nasprotju s tem, Keam in kolegi niso našli nobenega vpliva rs13181 genotipov na OS v študiji 73 azijskih bolnikih z rakom želodca [35], in Liu et al.
Pokazala, da XPD
Lys 751Gln (rs13181) ne more biti genetski dejavnik za prognozo naprednih nedrobnoceličnim pljučnim rakom, zdravljenih s kemoterapijo na osnovi platine [36]. V tej študiji je 360 bolnikov z rakom želodca, nismo signifikantne povezave med rs13181 genotipov in celokupno preživetje, niti analize razslojevanje. Možna razlaga je, da se lahko alel pogostost rs13181 SNP se razlikujejo po različnih etničnih skupin (npr je rs13181 GG varianta genotip ima zelo nizke frekvence v azijskih prebivalcev), in število primerov v predhodnih študijah, je bila tudi majhna (manj kot 100 primerov v španskih in azijske študije), ki bi lahko uvedli pristranskosti v svojih ugotovitvah. Kolikor nam je znano, ta študija je največji primer samo študija osredotoča na rs13181 SNP v želodcu OS raka v severnoameriški populacije z večino belci, vendar so potrebne večje študije za potrditev naše ugotovitve.
in ERCC2
na istem kromosomu lahko bolj pomembna. Dejansko je v tej študiji, smo ugotovili, da so imeli bolniki, ki so imeli vsaj enega od treh neugodnih variantnih homozigotno genotipov (rs1799793 AA, rs13181 GG in rs3212986 TT) izrazito poveča tveganje za smrt v primerjavi s tistimi z nobenim neugodne variante homozigotne genotipi. V nadaljnji analizi razslojevanja, smo ugotovili, da genotip-preživetje združenje ostal znaten v prisotnosti večine clinicopathological dejavnikov tveganja. Po FPRP in izračun statistične moči, so bile pomembne združenja omeniti za podskupine moškega, non-Hispanic bela, slabo diferenciran tumor in črevesne tip bolnikov želodca z rakom, ki so nosilci vsaj ena neugodna rs1799793 /rs13181 /rs3212986 varianta homozigoti. Te ugotovitve so biološko verjetna, saj lahko vse te neugodne variantne homozigotne genotipi skupaj imele velik vpliv na zmogljivost za popravilo DNA. Poleg tega je bila bolj pomembna povezava našel s slabšim preživetjem v analizi haplotip. Bolniki z rs1799793 /rs13181 /rs3212986 (A-G-G) haplotipom imela precej slabše preživetje, v primerjavi z bolniki z divjim tipom G-T-G haplotip. Ta učinek je ostal velik po prilagoditvi ( P
= 0,011), FPRP in izračun statistične moči. Kumulativni učinek haplotipom lahko posledica od sinergistično vsakega SNP [17]. Kljub temu, A-G-T haplotip, ki je sestavljena iz vseh rs1799793A /rs13181G /rs3212986T variantnih genotipov ni bila zveza z OS v tej študiji. Ena od možnih razlag je, da je ERCC1
rs3212986 varianto T genotip ni povezana z OS [28], [29], vendar je G genotip morda sinergistični učinek z ERCC2
rs1799793 /rs13181 na OS, ki mora biti potrjena tudi v večjih študij.
in ERCC2
SNP vplivajo na preživetje raka želodca. Drugič, čeprav je ta študija je vključevala tudi relativno veliko število želodčnih bolnikih, v primerjavi s prej objavljenih študij belci, je bilo število primerov z variantnih homozigotno genotipov še vedno majhen, kar lahko privede do statističnih odstopanj pri analizah, in načrtujemo potrjujejo trenutne ugotovitve v našem teku študija večji populaciji v študiji z daljšim časa sledenja. Tretjič, smo uporabili skupne funkcionalne SNP v naši raziskavi, ki ne vključujejo vse reprezentativne SNP v celotni genom. Nekatere druge redke funkcionalne SNP, ki lahko vplivajo na preživetje, so morda zamudili in jih je treba raziskati v večjih študij. Forth, zaradi omejitev niso na voljo kliničnih podatkov, nismo mogli oceniti niti za preživetje brez bolezni niti potencialno vlogo SNP po različnih kemoterapije /radiotherapies in peti, čeprav smo imeli pomembne rezultate, ni neodvisna replikacija
Rastlinska prehrana bi lahko ozdravila vaš revmatoidni artritis
Po zadnjem pregledu, uporaba rastlinske prehrane bi lahko olajšala otekle sklepe in bolečine pri revmatoidnem artritisu (RA). RA je avtoimunskega izvora, boleče motnje sklepov, ki jih povzroča vnetj
Je carski rez dober za zdravje otrok?
Nedavna študija, ki jo je objavil Inštitut za ekonomske raziskave VATT, kaže, da je nenačrtovan CS opravil za indikacijo, ki bi se ji morda lahko izognili, ima vzročno-posledično povezavo z astmo že o
Podeželska in mestna mikrobiota se od mladosti razlikujeta,
najde novo študijo Nova študija je pokazala, da se razlike v mikrobiomu človeškega črevesja med ljudmi, ki živijo na podeželju, v primerjavi z mestnimi območji Nigerije, začnejo že zelo mladi.
