PLoS One: ERCC1 és ERCC2 változatok Tippelje Survival gyomorrákban Patients

absztrakt katalógusa

Cél katalógusa

ERCC1 katalógusa és ERCC2
kritikus szerepet játszanak a nukleotid excíziós javítás útvonal, amely hatékonyan javítás DNS-károsodás által indukált kemoterápiás szerek. Ezért a funkcionális egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) ezen gének hatással lehet a klinikai kimenetelre a rákos betegek kemoterápiás kezelésben részesült. Ugyanakkor kevés tanulmány vizsgálta egyszerre szerepeinek ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa SNP klinikai eredmények gyomorrákos betegek. Katalógusa

Kísérleti elrendezés katalógusa

genotipizált a TaqMan assay három gyakori, potenciálisan funkcionális ERCC1 katalógusa (rs3212986) és a ERCC2
SNP (rs13181 és rs1799793) 360 gyomorrákos betegek. Mi egyaránt használható Kaplan-Meier tesztek és Cox modellek hatásainak értékelésére ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa genotípus és haplotípus klinikai eredmények. Katalógusa

Eredmények katalógusa

Azt találtuk, hogy míg a ERCC2 katalógusa rs1799793 GG + AG genotípus homozigóta variáns AA genotípus szignifikánsan rosszabb teljes túlélés (OS) (AA vs GG + AG, log-rank P katalógusa = 0,012), és jelentősen magasabb a halálozás kockázata (AA vs GG + AG, korrigált veszélyek arány [HR] 2,13; 95% CI, 1,28-3,56; P katalógusa = 0,004). Kombinált elemzések betegek egyike a három kedvezőtlen genotípus (vagyis ERCC1 katalógusa rs3212986 TT, ERCC2 katalógusa rs13181 GG és rs1799793 AA) volt statisztikailag szignifikáns veszélyt a rossz prognózis (Átalakított HR, 1,54 95% CI, 1,06-2,25; P katalógusa = 0,025), szemben azokkal nélkül kedvezőtlen genotípusok. Továbbá a haplotípus AGG (rs1799793 /rs13181 /rs3212986) jelentős hatással volt az OS (Átalakított HR, 1,57; 95% CI, 1,11-2,21; P katalógusa = 0,011), míg a közös haplotípus GTG.

Következtetés katalógusa

ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa funkcionális SNP együttesen befolyásolják OS kaukázusi gyomorrákos betegek. További nagy prospektív vizsgálatok elengedhetetlenek megerősítik a megállapításokat. Katalógusa

Citation: Li Y, Z Liu, Liu H, Wang L-E, Tan D, Ajani JA, et al. (2013) ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa változatok Tippelje túlélés gyomorrákos betegek. PLoS ONE 8 (9): e71994. doi: 10,1371 /journal.pone.0071994 katalógusa

Szerkesztő: Xiaoping Miao, Tongji Medical College, Huazhong Egyetem Természettudományi és Technológiai, Kína katalógusa

Beérkezett: May 23, 2013; Elfogadva: július 12, 2013; Megjelent: szeptember 2, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Li et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: A kutatás támogatott alapok a Texas 4000 felruházott Kiváló Professzori és az MD Anderson nővér Intézet Network alapok. A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák a második vezető oka a rákos halálesetek, rangsor negyedik leggyakoribb daganat a világon, mintegy 989.600 új esetet és 738.000 haláleset évente [1]. Az Egyesült Államokban, a becslések szerint 21600 új esetet és 10990 halálesetek 2013 [2]. Mert gyomorrákos betegek, a TNM (tumor /góc /metastasis) szakasz a legelfogadhatóbb mérés kiértékelésére hatásai terápiák és prognózis; azonban ez nem ritka, hogy a betegek az azonos tumor stádiuma és a kezelés lehet különböző eredményeket. Ezért a sebészek és onkológusok, hogy hasznos lenne, hogy javítsa a pontosság előrejelzésére klinikai eredmény azonosításával genetikai döntéshozók, amely megkönnyítheti a személyre szabott rákellenes terápia, a művelet utáni kiegészítő kezelésére és nyomon követési stratégiák. Az utóbbi évtizedekben, tanulmányok azt találták, hogy a genetikai variációk is szerepet játszik a kialakulásában és progressziójában gyomorrák. Egyéni különbségek és változatra válasz kemoterápiás vagy sugárterápiák valószínűleg miatt különböző genetikai-up, ami a különböző klinikai kimenetelt. Például egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) a leggyakrabban vizsgált genetikai variáció, hogy befolyásolhatja a betegek klinikai kimenetelt [3], [4], [5]. Katalógusa

DNS-javító rendszer játszik fontos szerepet játszik a stabilitásának celluláris funkciók és genom integritásának a megfordításával a sérült DNS által kiváltott különböző endogén és /vagy exogén tényező, többek között terápiás szerek; Ezért a gazda DNS javítási kapacitás hozzájárulhat a rákos beteg eredmények [6], [7]. Között a jól ismert DNS javító mechanizmusokat, a nukleotid kimetszés javítás (NER) útvonal egyik fontos mechanizmus, amely azt állítja, genom integritásának eltávolításával DNS terjedelmes elváltozások vagy a szálak közötti adduktok által kiváltott exogén és /vagy endogén tényezők [8], [9]. A kimetszés-javítás határokon kiegészítve komplementáció 1. csoport (ERCC1) és kimetszés-javítás határokon kiegészítve komplementációs csoport 2 /xeroderma pigmentózumot D csoport (ERCC2 /XPD) fehérjék a két fő összetevője a NER folyamat. ERCC1, a gén által kódolt található kromoszóma 19q13.32, kölcsönhatásba lép a XPA /XPF és más NER fehérjék, irányítja az 5 'bemetszés aktivitás a NER útvonal [10], mivel ERCC2, a gén által kódolt található kromoszóma 19q13.3 , egy ATP-függő helikáz, ami közvetíti a DNS kikapcsolódáshoz megindítására irányuló NER [11]. katalógusa

a mai napig összesen 36 kódoló SNP-k ERCC1 katalógusa és 115 kódoló SNP-k ERCC2 katalógusa számoltak be (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/). Azokban kódoló SNP-k, a ERCC2
rs13181 és rs1799793 az egyetlen két nonsynonymous SNP kisebb allél gyakoriság > 5% -ot, és ez a két SNP kimutatták, hogy hatással van a DNS-javító kapacitást fenotípus, esetleg megváltoztatásával az aminosav szekvencia a fehérje [12], [13]. Ezen kívül egy másik közös szabályozási SNP a 3 'nem régiója ERCC1 katalógusa rs3212986 jelentették, hogy összefüggésben lehet a DNS-javító kapacitása fenotípus [14], és van némi hatása ERCC1 katalógusa mRNS kifejezés [15]. Egyes vizsgálatok arra utalnak, hogy az alacsony ERCC1 katalógusa kifejezés társul fokozott kemoterápiás érzékenységét, s ezért tekinthető prediktív marker betegek számára nem kissejtes tüdőrák (NSCLC) kezelt platina-alapú kemoterápia [16], míg más vizsgálatok azt mutatták, hogy a ERCC2 katalógusa SNP kapcsolódó szegényebb betegek túlélésének NSCLC kínai lakosság [17]. Továbbá, ERCC2
rs13181 és rs1799793 SNP-k már kimutatták, hogy prognosztikai előrejelzője a betegek oszteoszarkóma [18], a kolorektális rák [19], és a szájüregi rák [20], azonban a mai napig kevés tanulmány vizsgálta prognosztikai fontosságát, hogy ezek SNP gyomorrákos betegek. Például csak egy kis tanulmány kimutatta, hogy ERCC2 Lys ^{751Gln katalógusa (rs13181) SNP lehet prediktív készítő eredmények spanyol stádiumú III /IV gyomorrák [21]. Katalógusa}

Bár mindkét ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa vannak kromoszómán helyezkedik el 19, és részt vesznek a NER aktivitás, kevés tanulmány egyidejűleg vizsgáltuk az ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa variánsok gyomor klinikai eredményeket, össze a korábbi felülvizsgálat egy meta-analízis [22]. Ezért azt feltételeztük, hogy a funkcionális SNP-k és haplotípusok e két gének hatással gyomorrák prognózisa. A jelen tanulmányban értékelte társulásai ERCC1 katalógusa (rs3213986) és a ERCC2 katalógusa (rs13181, és rs1799793) SNP túlélést gyomorrákos betegek. Katalógusa

Anyagok és módszerek

Etikai nyilatkozat katalógusa

Ez a tanulmány protokollt jóváhagyta a University of Texas MD Anderson Cancer Center Intézményi Review Board (IRB), és a betegek mindegyike beleegyezését az IRB által jóváhagyott beleegyezési nyilatkozat .

A beteg felvételi és nyomon követése katalógusa

Ez a vizsgálat 360 beteg, akik felhalmozott azoktól újonnan diagnosztizált és szövettanilag igazolt gyomorrák, tekintet nélkül korra, nemre, vagy a tumor stádiuma, a The Texas Egyetem Anderson Rákkutató Központ, Houston, Texas között 1990. február és 2012. április Azok a betegek, akik nem újonnan diagnosztizált és kezelt máshol mielőtt a MD Anderson Cancer Center kizárták a vizsgálatból. Interjút minden jogosult résztvevők, hogy gyűjtsenek adatokat a dohányzás és az alkoholfogyasztás. Azok, akik szívtak, kevesebb mint 100 cigarettát élete során figyelembe vették a "soha nem dohányzók", és az összes többi tekintettük "valaha dohányzók". Hasonlóképpen, az alanyok, akik ittak alkoholtartalmú italok legalább egyszer egy héten több mint 1 évvel korábban definiáltuk "egyre ivók", és az összes többit meghatározása: "soha nem ivók". Minden beteg adományozott egy egyszeri 10 ml teljes vért egy heparinos cső genetikai vizsgálatok. Valamennyi beteg szerepel a jelen tanulmányban volt elérhető vérmintát genotípus és a nyomon követés adatok értékeléséhez az eredményeket. Katalógusa

Genotyping katalógusa

A genomi DNS-t izoláltunk a buffy coat frakció a vérminta , egy Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) alkalmazásával a gyártó utasításai szerint. DNS-koncentrációkat határoztuk meg spektrofotometriás mérésével 260 nm-en, és a tisztaságukat számítottuk ki A260 /A280 arány alkalmazásával Nanodrop ND-1000 spektrofotométerrel (Thermo Scientific, Rockford, IL). Genotípusok A három kiválasztott SNP ( ERCC1 katalógusa rs3213986 G > T, ERCC2 katalógusa rs13181 T > G és rs1799793 G > A) segítségével végeztük TaqMan módszer 384 lyukú lemezekre, és olvassa el a a Sequence Detection szoftver az ABI Prism 7900 szerinti készülék a gyártó utasításai (Applied Biosystems, Foster City, CA). A használt primerek rs3213986 G > T, rs13181 T > G és rs1799793 G > A-t CACAGGCCGGGACAAGAAGCGGAAG [A /C] AGCAGCAGCAGCAGCCTGTGTAGTC, TGCTGAGCAATCTGCTCTATCCTCT [G /T] CAGCGTCTCCTCTGATTCTAGCTGC, és CGGGGCTCACCCTGCAGCACTTCGT [C /T] GGGCAGCACGGGGTTGGCCAGGTGG, ill. Minden 384-lyukú lemez négy negatív kontrollok, egy pozitív kontroll és nyolc ismétlés mintát. PCR-reakciókat végeztünk a következő körülmények között: 50 ° C 2 perc, 95 ° C-on 10 percig, majd 95 ° C-on 15 s és 60 ° C 1 perc 40 cikluson keresztül. Minden genotípus, a vizsgálati siker aránya volt > 99%, és az eredményeket az ismétlődő minták 100% az egyezés. Katalógusa

Statisztikai elemzés katalógusa

A jóság az illeszkedés χ ^{2 teszt alkalmazták kiszámításához a Hardy-Weinberg egyensúly a genotípus eloszlás. A Kaplan-Meier-módszerrel láthatóvá a teljes túlélés (OS) három genotípus csoportok. Az OS időt attól a naptól számítják a regisztráció M. D. Anderson a dátum az utolsó érintkezés vagy halál, és a betegek, akik még életben voltak az utolsó érintkezés tartották cenzúrázták az elemzés. Az átlagos túlélési idő (MST) kiszámítottuk, és a log-rank próbával teszteljük az egyenlőség, a túlélési eloszlásában. Egy- és többváltozós Cox modellek alapján kiszámítottuk veszélyek arány (HR) és a 95% -os konfidencia intervallum (95% -os CI) az egyes genotípus megbecsülni annak hatását a túlélésre, vagy anélkül korrekció zavaró tényezőket. Haplotípusokat következtethet a SAS PROC haplotípus folyamat, és összefüggést haplotípusok és az OS által meghatározott recesszív genetikai modellt követve xeroderma pigmentózumot (XP) genetikai modell, ahogy azt korábban alkalmazott [23]. Minden statisztikai tesztek kétoldalas, egy P katalógusa értéke 0,05 jelentősnek tekinthető, és minden analíziseket SAS szoftver verzió 9.2 (SAS Institute, Cary, NC). Azt is számított a fals pozitív jelentés valószínűség (FPRP) érzékeli a fals pozitív összefüggést megállapításokat. Az összes jelentős eredményeket, akkor kap egy előzetes valószínűsége 0,1 felismerni a HR 2.0 társulás genotípusok és allélek az egyes SNP. A statisztikai számításokat is kiszámították az online elérhető PS szoftver Version 3.0 [24], [25]. Csak a jelentős eredményeket statisztikai ereje > 0,8 volt és FPRP érték < 0,2 tekinthető érdemleges kapcsolatot. Katalógusa}

Eredmények katalógusa

A betegek jellemzőit és klinikai jellemzői katalógusa

A demográfiai és klinikai jellemzői a betegek 1. táblázat mutatja a kor betegek között 19 és 89 év a diagnózis időpontjában a medián életkor 60 év az átlagéletkor 59,6 ± 12,4 év. Közül 360 beteg, nem volt több férfi (221, 61,39%), mint a nők (139, 38,61%), amely 224 (62,22%) nem latin-amerikai fehérek, 136 (37,78%) egyéb etnikumok (hispán, fekete és ázsiai) , 191 (53,06%) valaha dohányzók és 188 (52,22%) valaha alkoholt fogyasztók. A legutóbbi nyomonkövetési (2012. szeptember), 178 (49,44%) halt meg, egy MST 16,02 hónap. Az összes beteg, 136 (37,78%) bemutatva szakaszában I-II és 224 (62,22%) szakaszokkal III-IV. A szövettani megoszlás hulladékfajta 169 (46,94%) a bél karcinóma, 148 (41,11%) pecsétgyűrű carcinoma és 43 (11,94%) más típusú. A szövettani megoszlás fokozat szereplő 113 (31,39%) mérsékelt /közepes-gyenge differenciálódás esetekben és 247 (68,61%) gyenge differenciálódás esetben. A kezelés kategória, 136 (37,78%) betegnek sebészeti kezelés, 293 (81,39%) beteg vett kemoterápia és 114 (31,67%) beteg kapott sugárkezelést (112 beteg volt mind a kemoterápia és sugárkezelés). Amikor az összes ezeket a változókat vontunk be a Cox-féle regressziós modell kiigazítás kiszámításához veszélyek arány (HR), műtéten átesett (HR, 3,51; 95% CI, 2,37-5,20; P katalógusa < 0,001) , amelynek színpadi III-IV betegségek (HR, 2,54; 95% CI, 1,74-3,69; P katalógusa < 0,001), és sugárkezelésben részesülő (HR, 1,57; 95% CI, 1,11-2,21; P katalógusa = 0,011) statisztikailag szignifikáns maradt prognosztikus indikátorok (log-rank P katalógusa < 0,05; 1. táblázat). Bár a nyers P katalógusa volt 0,004 a kemoterápiában részesülő csoport, a korrigált HR nem volt statisztikailag szignifikáns ( P katalógusa = 0,902). Katalógusa

közötti társulás ERCC1
és ERCC2 katalógusa SNP-k és OS katalógusa

Mi használt Kaplan-Meier módszerrel és Cox-féle modellel, hogy értékelje a hatását ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa SNP-k a betegek OS. A 2. táblázat mutatja genotípus megoszlása ​​az ERCC1 katalógusa rs3213986 és ERCC2 katalógusa rs13181 és rs1799793 SNP, valamint azok társulásai OS. A megfigyelt genotípus a betegek megegyeztek megbecsülhető a Hardy-Weinberg ( P katalógusa = 0,466 az rs1799793, P katalógusa = 0,820 a rs13181, és P = katalógusa 0,789 számára rs3213986). Az összes beteg esetében a ERCC2
rs1799793 G > A SNP mutatott statisztikailag szignifikáns összefüggést OS és az MST betegek számára AA genotípusú rövidebb volt, mint, hogy azokban a közös GG genotípus (13,2 hónap vs. 15,8 hónap log-rank P katalógusa = 0,012). A Cox analízis, a beteget a variáns AG /AA genotípusú állatkísérletekben szignifikánsan megnövekedett veszély halál egyváltozós modell, azokkal szemben, akik a GG genotípus (HR, 1,46; 95% CI, 1,07-2,00 és P
= 0,017 az AG, és a HR, 2,23; 95% CI, 1,33-3,75 és P = 0,002 katalógusa AA-kal). A beállítás után a nem, a kor, a dohányzás állapot, alkoholfogyasztás, a tumor stádiuma, szövettani grade, szövettani típus és a kezelés a többváltozós Cox modellben az AA genotípus maradt statisztikailag jelentős hatással OS, míg rs1799793 GG genotípus (HR, 2,18; 95% CI, 1,26-3,78 és P katalógusa = 0,006), illetve GG + AG genotípus (HR, 2,13; 95% CI, 1,28-3,56 és P katalógusa = 0,004) (1A ábra) . A másik két ERCC2 katalógusa rs13181 és ERCC1
rs3212986 SNP, bár mindkét SNP megmutatta egyesületek hajlamos fokozott HR variáns genotípus nem volt statisztikailag szignifikáns összefüggést OS alatt recesszív genetikai modell (2. táblázat). katalógusa

a túlélés gyomorrákos betegek kombinált genetikai rizikófaktorok

Annak felmérése együttes hatása a három SNP a betegek prognózisa, ötvöztük három variáns homozigóta genotípus (azaz ERCC1 katalógusa rs3212986 TT, ERCC2 katalógusa rs13181 GG, és rs1799793 AA). Az összes beteg közül 63 betegnél legalább egy variáns homozigóta genotípus, és ezek a betegek statisztikailag jelentős veszélyek a rossz prognózis (korrigált HR, 1,54; 95% CI, 1,06-2,25; P katalógusa = 0,025), szemben azokkal nélkül (2. táblázat). katalógusa

közötti társulás ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa haplotípusok és OS katalógusa

Mivel ez a három SNP minden kromoszómán 19-ben tovább vizsgálni a haplotípusok és értékelte azok együttes hatása gyomorrák túlélést. Összességében nem volt nyolc haplotípusok, amelyek közül öt volt frekvencián > 5%, és a másik három, kevésbé gyakori haplotípus egyesítjük egy csoportba. Az öt leggyakoribb haplotípusok ilyen betegekben rs1799793 /rs13181 /rs3212986 G-T-G, A-G-T, G-T-T, A-G-G és G-G-G a gyakorisága 52,2%, 13,9%, 12,6%, 9,4%, illetve 6,8% volt. Összehasonlítva a leggyakoribb GTG haplotípus, az AGG haplotípus jelentős hatással volt az OS (korrigált HR, 1,57; 95% CI, 1,11-2,21; P katalógusa = 0,011) (3. táblázat) (1B).

rétegződése elemzés között a recesszív genotípusok és a teljes túlélés katalógusa

végeztünk rétegzett elemzés annak vizsgálatára, hogy a SNP-k és ezek együttes genotípusok recesszív modell túlélés módosított néhány fontos klinikopatológiai faktorok az 1. táblázatban . Azt találtuk, hogy a ERCC2 katalógusa rs1799793 AA genotípus magasabb volt a halál kockázata azoknál a betegeknél, akik idősebbek voltak (≥60 év), a férfi, nem latin-amerikai fehér, miután a dohányzás történetét, amelyek gyenge eltérés, bél típusú daganatok, és miután minden kezelés (műtét, kemoterápia, sugárkezelés). Azt is megfigyelték, statisztikailag szignifikáns rossz prognózissal férfi betegek a ERCC2 katalógusa rs13181 GG genotípus, és nemdohányzó betegek a ERCC1 katalógusa re3212986 TT genotípus (4. táblázat). Az egyesített elemzések azt mutatták, hogy a betegek minden a három változat homozigóta genotípus szenvedne magasabb a halálozás kockázata, különösen azok, akik idősebbek voltak (≥60 éves), férfi, alkohol felhasználók, nem latin-amerikai fehér, amelyek gyenge eltérés, intesztinális típusú a daganatok szakaszokkal I /II, és miután a kemoterápia (4. táblázat). katalógusa

Végül kiszámítottuk a FPRP értékek különböző előzetes valószínűségi szinteket, valamint a statisztikai erő minden szignifikáns (5. táblázat). Egy előzetes valószínűsége 0,1, feltételezve, hogy a HR-specifikus genotípus 2,0, a FPRP értékek 0,044, 0,079, 0,087 és 0,197, statisztikai ereje 0,930, 0,927, 0,903 és 0,842 (I. típusú hiba valószínűsége társított teszt ez nullhipotézis 0,05), illetve az egyesület a ERCC2 katalógusa rs1799793 AA genotípusú AGG haplotípus és 1-3 ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa kockázat genotípusok illetve arra utal, hogy ezek lehetnek figyelemre méltó megállapításokat minden egyén, és képes lenne elvetjük a nullhipotézist, hogy a variáns és a referencia túlélési görbék azonos statisztikai erő > 0.8. Ezen kívül, a legtöbb szignifikáns összefüggést a rétegzett elemzés tartották figyelemre méltó, mert a valószínűsége, hogy a fals pozitív eredmény < 0,2 és statisztikai erejének > 0,8 (5. táblázat). Mindazonáltal néhány nagyobb FPRP értékek (> 0,2) figyeltek meg néhány más szignifikáns összefüggést a rétegzett elemzések (például ERCC2 katalógusa rs13181 és ERCC1
rs3213986 variáns genotípus gyomorrák OS). Azoknak szignifikáns összefüggés a statisztikai hatásköre < 0,8, de nem tudtuk elutasítani azt a nullhipotézist, hogy a túlélési görbék azonos a variáns és a referencia csoportok, és amelyek megfelelnek a nagyobb FPRP értékek (> 0,2) (5. táblázat) , ami arra utal, néhány lehetséges elfogultság e pozitív leletek, amelyeket meg kell érvényesíteni a nagyobb tanulmányok a jövőben. katalógusa

Vita katalógusa

a jelen tanulmányban azt vizsgáltuk, hogy a funkcionális ERCC1 katalógusa rs3213986 G > T és ERCC2 katalógusa rs13181 T > G és rs1799793 G > a SNP bármilyen egyedi vagy együttes hatását a klinikai kimenetelre a gyomorrákos betegek az észak-amerikai betegcsoportban. Azt találtuk, hogy a ERCC2 katalógusa rs1799793 AA genotípus hozzájárult ahhoz, hogy jelentősen rövidebb a túlélési idő, míg az AG /GG genotípus. A beállítás után az egyéb klinikai tényezők hatásai a ERCC2 katalógusa rs1799793 AA genotípus, az együttes hatása a három variáns homozigóta genotípus és az rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplotípus AGG minden maradt szignifikáns előrejelzője rosszabb klinikai kimenetelt eredményez ebben a vizsgálati populációban. Továbbá, ezek a hatások is maradt rétegződése elemzéseket. Összességében a betegek, akiknek a ERCC2 katalógusa rs1799793 AA genotípus volna nagyobb halálozási kockázatot, különösen azokban, akik idősebbek voltak (≥60 év), nem latin-amerikai fehér, amelyek gyenge eltérés, bél típusú daganatok, és miután a kemoterápia vagy sugárkezelés. Emellett a betegeknek bármelyik rs1799793 /rs13181 /rs3212986 variáns homozigóta genotípus szenvedne magasabb a halálozás kockázata, különösen azok, akik a férfi, nem latin-amerikai fehér, amelyek gyenge eltérés és a bél típusú daganatok. Katalógusa

jól ismert, hogy néhány klinikopatológiai jellemzőit, mint például a tumor stádiuma és a kezelés, társított prognózisa rákos betegeknél. Ugyanakkor kíváncsiak voltunk a funkcionális genetikai variánsok DNS javító gének, amelyek módosítják a betegek túlélését a kemoterápiára adott válasz. A NER folyamat fontos DNS-javító mechanizmus, amely fenntartja genomi integritás, mind a normál és a tumorsejtek, és a változásokat a NER kapacitás ha növelni vagy csökkenteni DNS mutációs gyakoriság eredményeként javítanak károsodott DNS-t, amely megváltoztathatja a betegek válasza a terápia, és így vezethet malignus progresszió és metasztázis. ERCC1 és ERCC2 két kulcsfontosságú sebességmeghatározó enzim eljárva a többlépéses NER folyamatot. ERCC1 részt vesz a DNS-károsodás felismerés, és ERCC2 tagja egy kilenc alegység komplex humán transzkripciós iniciációs faktor TFIIH az ATP-függő helikáz aktivitást. Tehát esetlegesen funkcionális ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa SNP befolyásolhatja a sejt DNS javítási kapacitás [26], és így kapcsolatba hozható különféle túlélési arányt a rákos betegeknél. Katalógusa

Előző jelentéseket a szövetség között ERCC1 katalógusa rs3212986 és a rák túlélési már ellentmondásos. Például Takenaka et al. kimutatták, hogy a ERCC1
rs3213986 SNP befolyásolhatja NSCLC prognózis függetlenül a ERCC1 katalógusa kifejezés és platinaérzékenység 122 japán NSCLC átesett betegek teljes reszekció [27]; azonban KimCurran tanulmánya azt mutatta, hogy nincs összefüggés a ERCC1 katalógusa C8092A (rs3212986) SNP és az OS vagy hatékonysági /toxicitását platina-alapú kemoterápia 300 kínai NSCLC betegek kemoterápiával kezelt [28]. Továbbá egy nemrégiben metaanalízis nem volt bizonyíték, hogy támogassa ERCC1 katalógusa C118T (az 1187 egyesített beteg) /C8092A (a 625 egyesített beteg) SNP prognosztikus előrejelzője platina alapú kemoterápiával tüdőrákban szenvedő betegek [29]. Valóban, a jelen tanulmányban 360 gyomorrákos betegek, nem találtunk összefüggést az ERCC1 katalógusa rs3212986 G > T SNP és az OS. A rétegződés elemzés azt mutatta, hogy csak a nem dohányzók rs3212986 TT genotípus összefüggött egy szignifikánsan magasabb HR ( P katalógusa = 0,028) kiigazítást követően a klinikai tényezők. De kiszámítása után FPRP erre lényeges megállapítása, nagyobb FPRP érték figyelhető meg, ami arra utal, lehetséges torzítás a becslés azért történhetett, mert a viszonylag kis minta a jelen tanulmányban. Nem volt előrejelző értéke rs3212986 genotípusok OS kapó betegeknél a kemoterápia vagy sugárkezelés, különösen a nem hispán fehérek, melyek többsége a betegek. Katalógusa

ERCC2 katalógusa rs13181 és rs1799793 SNP-k már korábban is vizsgálták a szerepük a daganatos betegek túlélését. Wu et al. Katalógusa jelezte, hogy a betegek XPD Lys ^{751Gln katalógusa (rs13181) és a Asp 312Asn katalógusa (rs1799793) variáns allél szignifikánsan rosszabb NSCLC túlélési kínai betegek [17]. Korábbi tanulmányok is kimutatták, hogy ERCC2 katalógusa rs13181 G allél és rs1799793 A allél vezethet alacsony NER kapacitású, míg a közös genotípusok [30], [31], [32], és így befolyásolhatják a betegség lefolyása . A jelen tanulmány azt mutatta, hogy a ERCC2 katalógusa rs1799793 AA genotípus járt OS gyomorrákos betegek. További rétegződés elemzések azt találtuk, hogy a HR emelték alcsoportjában idősebb korban (≥60 év), a férfi, miután a dohányzás történetét, nem latin-amerikai fehér betegek bélrendszeri daganat, a műtétre terápia, kemoterápia és sugárkezelés, ami arra utalhat, szegényebb eredményeket. Azt is megfigyelték, rs1799793 AA genotípus jelentős hatással volt az OS, akiknél rosszul differenciált tumor, de nem volt szignifikáns különbség a különböző daganatos szakaszaiban. Azonban a FPRP és statisztikai erejének kiszámítása megmutatta lehetséges megjegyezni egyesületek rossz operációs rendszer csak a alcsoportban az idősebb életkor, nem latin-amerikai fehér, gyengén differenciált tumor, bél daganat típusa és amelyek a kemoterápia vagy sugárkezelés. Ezért néhány állítást a rétegzett elemzés lehet véletlen, mert a csökkentett minta mérete az alcsoportok. Ezek az eredmények, ha validált nagyobb tanulmányok, hasznos lehet az értékelő kezelési stratégia alapján genetikai hátterének betegek különböző klinikopatológiai jellemzők. Katalógusa}

A korábbi vizsgálatok azt is kimutatták, néhány ellentmondásos adatok szerepére vonatkozó ERCC2
rs13181 T > G SNP rákos betegek túlélési. A tanulmány 106 végbélrák esetben az észak-amerikai népesség megállapította, hogy a rs13181 GG genotípus járó megnövekedett halálozási kockázatot [33], és egy másik vizsgálatot 72 spanyol kolorektális rákban szenvedő betegek azt mutatta, hogy ezek a betegek a rs13181 heterozigóta megjelenő magasabb kockázati mint hordozói a TT vagy GG genotípus [34]; Ezzel szemben a Keam és munkatársai nem találtak semmilyen befolyása rs13181 genotípusok OS egy tanulmányban 73 ázsiai gyomorrákos betegeknél [35], és Liu et al. Katalógusa jelezte, hogy XPD katalógusa Lys ^{751Gln (rs13181) nem lehet genetikai meghatározója prognózisa NSCLC kezelt platina-alapú kemoterápia [36]. A jelen vizsgálatban a 360 gyomorrákos betegeknél, mi nem észleltünk szignifikáns összefüggést rs13181 genotípusok és a teljes túlélés, sem a rétegződés elemzéseket. A lehetséges magyarázat az, hogy az allél gyakorisága rs13181 SNP eltérhetnek a különböző etnikai csoportok (pl rs13181 GG variáns genotípus nagyon alacsony gyakorisággal ázsiai populáció), és a számok az esetek korábbi tanulmányok túlságosan kicsi (kevesebb, mint 100 esetek spanyol és ázsiai tanulmányok), amely bevezette torzításokkal eredményeiket. A legjobb tudásunk szerint, a jelen tanulmány a legnagyobb ügy egyetlen tanulmány középpontjában a rs13181 SNP gyomorrákban OS az észak-amerikai populációk többsége kaukázusiak, de nagyobb vizsgálatok szükségesek az eredmények validálása. Katalógusa}

a hatás egyetlen SNP elhalálozás kockázata, illetve a klinikai eredmények, ha van ilyen, korlátozott lehet ahogy azt várják, és az együttes hatása számos SNP ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa ugyanazon a kromoszómán nagyobb jelentőségűek lehetnek. Valóban, a jelen tanulmányban azt figyelték meg, hogy a betegek, akiknek legalább az egyik a három kedvezőtlen változat homozigóta genotípus (rs1799793 AA, rs13181 GG és rs3212986 TT) is markánsan megnövekedett halálozási kockázatot, azokkal szemben, sem a kedvezőtlen változat homozigóta genotípus. A további rétegezés elemzés azt találtuk, hogy a genotípus-túlélés egyesület jelentős maradt jelenlétében legtöbb klinikopatológiai kockázati tényezők. Miután FPRP és statisztikai erejének kiszámítása, a szignifikáns összefüggés volt említésre méltó az alcsoportok a férfi, nem latin-amerikai fehér, gyengén differenciált tumor és a bél típusú gyomorrákos betegek, akik, amelyek legalább egy kedvezőtlen rs1799793 /rs13181 /rs3212986 variáns homozigóta. Ezek az eredmények biológiailag kézenfekvő, mert ezek a kedvezőtlen változat homozigóta genotípus kollektíven jelentős hatást a DNS-javító kapacitást. Továbbá, egy szignifikáns összefüggést találtak a szegényebb túlélés a haplotípus analízis. A betegek az rs1799793 /rs13181 /rs3212986 (A-G-G) haplotípus szignifikánsan rosszabb túlélés, szemben azokkal a betegekkel a vad típusú G-T-G haplotípus. Ez a hatás szignifikáns maradt korrekció után ( P katalógusa = 0,011), és a statisztikai FPRP erőszámítás. A kumulatív hatása haplotípus lehet az eredménye, a szinergikus egyes SNP [17]. Mindazonáltal, az A-G-T haplotípus, amely által összeállított minden rs1799793A /rs13181G /rs3212986T variáns allél, nem volt kapcsolata az OS a jelen tanulmányban. Az egyik lehetséges magyarázat az, hogy a ERCC1 katalógusa rs3212986 variáns T genotípus nem jár OS [28], [29], de a G genotípus lehet szinergikus hatást ERCC2 katalógusa rs1799793 /rs13181 OS, amely tovább kell érvényesíteni nagyobb tanulmányok. katalógusa

A jelen tanulmány bizonyos korlátai. Először nem tudtuk, hogy vizsgálja meg a pontos mechanizmus, amellyel a ERCC1 katalógusa és ERCC2 katalógusa SNP befolyásolni gyomorrák túlélést. Másodszor, bár a jelen tanulmányban szereplő viszonylag nagyszámú gyomor beteg, míg a korábban publikált vizsgálatok kaukázusiak, az esetek száma a variáns homozigóta genotípus még kicsi, ami ahhoz vezethet, hogy a statisztikai torzítás az elemzések, és azt tervezzük, hogy erősítse jelenlegi eredmények a mi folyamatos vizsgálata egy nagyobb tanulmány lakosság hosszabb követési idő. Harmadszor, használtuk a közös funkcionális SNP-k a vizsgálatot, amely nem tartalmazza az összes képviselő SNP gén teljes. Néhány más ritka funkcionális SNP, amely befolyásolhatja a túlélést, lehet, hogy kimaradt, és meg kell vizsgálni a nagyobb tanulmányok. Forth, mivel a korlátozás nem elérhető klinikai adatok nem tudtuk értékelni sem a betegségmentes túlélés, sem a lehetséges szerepét a SNP különböző kemoterápiás /sugárterápiák, és az ötödik, de mi volt jelentős eredményeket, nem volt önálló replikáció