PLOS ONE: Atomic Insight para o Altered Arquitetura Protein O6-metilguanina-ADN metiltransferase em Câncer Gástrico

Abstract

O ^{metiltransferase 6-metilguanina-DNA (MGMT) é uma das principais proteínas de reparo do DNA que neutraliza a alkalyting danos no DNA induzidos por agente, substituindo O 6-metilguanina ( lesão mutagênico) de volta para guanina, eventualmente, suprimir os erros de incompatibilidade e ligações cruzadas fita dupla. exônico alterações na forma de polimorfismo de nucleótidos podem resultar na estrutura de proteína alterada que por sua vez pode conduzir à perda da função. No presente estudo, enfocamos a população temia pela alta exposição a agentes alquilantes, devido aos seus hábitos típicos e especializados alimentares. Para este fim, os pacientes com cancro gástrico reunidas para fora a partir da população foram seleccionadas para o rastreio de mutações de um erro região propensa específico do gene MGMT. Nós descobrimos que quase 40% das amostras neoplásicas estudadas abrigava mutação missense no códon 151 resultando em Serina à variação isoleucina. Esta variação resultou na realização da desordem estrutural, subsequentemente que se seguiu a uma grande variação estequiométrica no domínio de reconhecimento, de ligação do substrato e circuito de selectividade do local activo da proteína MGMT, tal como observadas ao microscópio virtual de simulação de dinâmica molecular (MDS). A visão atômica em proteína MGMT pela abordagem computacional mostrou uma mudança significativa no padrão de ligação de hidrogênio molecular intra, levando a anomalias estruturais observadas. Continuar a analisar as implicações de mutação em plugues reguladoras dos MGMT que contém a proteína em uma posição DNA vinculativo, uma análise baseada MDS foi realizado em diante, todos os aminoácidos fisicamente interagindo conhecidos essencialmente agrupados em grupos baseados em sua posição e função. Os resultados gerados por agrupamento físico-funcional da proteína indicaram que a mutação identificada na vizinhança do local activo da proteína MGMT provoca a desestabilização local e global de uma proteína por qualquer eliminando as pontes de sal de estabilização em conjunto C3, C4 e C5, ou por desestabilizar localmente a "estabilização Hing proteína" mapeado no conjunto C3-C4, que precede o local activo}

citação:. Chikan nA, S Bukhari, Shabir N, Amin a, Shafi S, Qadri RA, et ai. (2015) Atomic Insight para o O ^{6-metilguanina-ADN metiltransferase Arquitetura proteína alterada no câncer gástrico. PLoS ONE 10 (5): e0127741. doi: 10.1371 /journal.pone.0127741}

Editor do Academic: Reiner Albert Veitia, Institut Jacques Monod, França

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