Ploche ONE: Identifikácia HSA-MIR-335 ako prognostický podpis v žalúdku Cancer

abstraktné

Pozadie

rakovinou žalúdka (GC) je jedným z najčastejších malignity a primárna príčina úmrtia u pacientov s rakovinou čínskych. Opakovanie je významným faktorom vedúcim k zlyhaniu liečby a po chirurgickej resekcii nízkej úrovni 5-ročné prežitie u pacientov s GC. Z tohto dôvodu identifikácie biomarkerov s potenciálom v predpovedanie rizika recidívy je kľúčovým problémom prognózou u pacientov s GC.

Pacienti a metódy

Celkom 74 pacientov GC boli vybrané pre systematickú analýzu, ktorá sa skladá 31 pacientov s recidívou a 43 pacientov bez recidívy. Po prvé, miRNA microarray a bioinformatika metódy boli použité pre charakterizáciu diferenciálnej vyjadrené miRNA z primárnych nádorových vzoriek. Nasledovať sme použili metódu ROC vybrať podpis s najlepším citlivosti a presnosti. Nakoniec sme overený podpis vo vzorkách GC (mrazené čerstvé a krvných vzoriek) pomocou kvantitatívnej PCR.

Výsledky

Zistili sme 12 rozdielové miRNA vrátane 7 up-regulované a 5 down-regulované miRNA v opakovaní skupine. Metódou ROC, budeme ďalej zistilo HSA-MIR-335 ako podpis rozpoznať opakovanie a non-opakovanie prípadov, vo vzorkách odbornej prípravy. Navyše sme overený tento podpis pomocou metódy kvantitatívnej metódou PCR v 64 testovaných vzoriek s konzistentný výsledok s trénovacej množiny. Vysokofrekvenčné recidíva a zlá prežitie bolo pozorované na GC s vysokou úrovňou HSA-MIR-335 ( P Hotel &0,001). Ďalej sme hodnotili, že HSA-MIR-335 sa podieľajú na regulácii cieľových génov v niekoľkých onkogénnych signálnych ciest, ako je p53, MAPK, TGF-β, Wnt, ErbB, mTOR, Toll-like receptor a fokálna adhézie.

Záver

Naše výsledky ukazujú, že HSA-MIR-335 má potenciál rozpoznať riziko recidívy a vzťahujú sa na prognózu chorých GC

Citácia :. Yan z, Xiong Y, W Xu, Gao J, Cheng Y, Z Wang, et al. (2012) Identifikácia HSA-MIR-335 ako prognostický podpis v rakoviny žalúdka. PLoS ONE 7 (7): e40037. doi: 10,1371 /journal.pone.0040037

Editor: Alfons Navarro, University of Barcelona, ​​Španielsko |

prijatá: 21.února 2012; Prijaté: 30.května 2012; Publikované: 03.7.2012

Copyright: © 2012 Yan et al. Toto je článok o otvorený prístup distribuovaný pod podmienkami Creative Commons Attribution licencie, ktorá umožňuje neobmedzené použitie, distribúciu a reprodukciu v nejakom médiu, za predpokladu, že pôvodný autor a zdroj sú pripísané

Financovanie :. Títo autori nemajú žiadnu podporu ani finančné prostriedky hlásiť

Konflikt záujmov: .. autori vyhlásili, že žiadne konkurenčné záujmy neexistujú

Úvod

V súčasnej dobe, chirurgia je stále hlavnou alternatívou pre liečbu rakovina žalúdka (GC), avšak ani po vykonaní kuratívny resekcia, približne 40 až 65% pacientov GC bude dochádzať k opakovaniu choroby prípadne zahŕňajúci lokálne recidíva, peritoneálnej šírenie alebo hematogénne metastázy [1], [2]. Z tohto dôvodu je 5-ročné prežitie u pacientov GC bola ešte v nízkej úrovni. Veľkou výzvou pre zlepšenie klinických výsledkov je lepšie pochopiť molekulárne mechanizmy a rozpoznať robustný podpisy pre prognózu GC.

Niekoľko rizikových faktorov vrátane patologickej seróza stavu, stavu marže, zmeny hustoty tumor mikrociev a expresie génov súvisiacich s opakovanie boli popísané [3], [4]. Navyše, niekoľko prediktívne alebo diagnostické metódy boli použité pre vyhodnotenie rizika opakovania na základe profilovania génovej expresie alebo sady klinických premenných [5] - [8]. Avšak, tieto viac pozorovaní vrátane niekoľkých génových alebo proteínové zmeny môžu brániť ich klinickú aplikáciu. Spoľahlivé a pohodlné molekulárne markery pre klinické praktiky sú nutné pre prognózu v GC.

A nedávno objavil na miRNA sú vysoko konzervované v genómoch bezstavovcov, stavovcov a rastlín. Slúži kritické funkcie v rôznych biologických procesov [9] vrátane vývojovej načasovanie, vzorovanie a embryogenézy, diferenciácie, organogenézy a apoptózy [10]. Vzhľadom k jeho mnohopočetné základné biologické funkcie, to nie je prekvapujúce, že vyjadrením abnormálne miRNA povedie k ochorenia a dokonca aj rakoviny [11].

miRNA boli prezentované ako účinné potenciálnych biomarkerov pre vysledovania tkaniva pôvod v malígnych nádorov neznáme primárny pôvod [12]; miRNA expresné profily sú schopné odrážať vývojové línie a diferencovaný stav nádorov [11]. Systematická analýza na stabilitu miRNA, rovnako ako optimalizované podmienky pre analýzu expresie za použitia parafínových a krvných vzoriek formalínom fixovaných boli popísané skôr [13] - [15], vrhá svetlo na ich neočakávaného diagnostické možnosti. Existuje obmedzený počet miRNA [16] v ľudskom genóme, ktoré je známe, že regulovať približne 30% génov [17]. Tieto atribúty miRNA nám môže poskytnúť jednoduchý spôsob odhadu rizika recidívy u pacientov s nádorovým ochorením.

V tejto štúdii sme identifikovali miRNA (HSA-MIR-335), ktorý má potenciál predpovedať riziko opakovania GC založené na čipe a klinických dát vzorky malej veľkosti u pacientov s čínskymi GC. Naše výsledky ukázali, že HSA-MIR-335 by mohol byť akt ako klinický prognostický podpisu pre GC.

Metódy

klinických vzoriek

Táto štúdia bola schválená etickou komisiou Wuhan General Hospital Guangzhou velenia, PLA. Všetci pacienti s rakovinou žalúdka a non-onkologickí pacienti s chorobami zažívacieho poskytovaných písomný informovaný súhlas v našej štúdii.

U pacientov podstupujúcich gastrektómii pre prostredie s nebezpečenstvom tvrditelného GC na všeobecnej nemocnice Wuhan vojenského velenia Guangzhou boli subjekty v tejto štúdii. Spôsobilosť na zaradenie do tejto štúdie boli zahrnuté histologicky potvrdený adenokarcinóm žalúdka alebo gastroezofageálneho spojenia. Všetci pacienti dostali kompletnú resekcia vrátane pokusu o úplné odstránenie nádoru sa zahrnutím širokými negatívnych okrajov a predĺžená retroperitoneálny lymfadenektómia (typ D2). Informácie o patologickým, terapeutických a parametre Výsledok u pacientov od mája 2005 do februára 2012 bolo odobratých so spätnou platnosťou. Rakovina staging bola vykonaná podľa piateho vydania zmiešanej komisie amerického o kritériách Cancer TNM.

recidíva bola definovaná ako akákoľvek rakoviny opakovania, vrátane lymfatických uzlín, zvyškov žalúdka, lokálne, peritoneálnej a hematogénne metastázy. Všetci pacienti, ktorí zažili recidívy rakoviny bola diagnostikovaná klinicky alebo rádiologicky a potvrdená biopsiou cez hornej časti gastrointestinálneho endoskopu alebo perkutánnej punkcia. RTG štandard pre diagnostiku recidívy zahrnuté CT alebo MRI sken z hrudníka, brucha, panvy, hlavy a kostí, alebo iné diagnostické testy, ktoré boli použité iba za zvláštnych okolností. Všetky vzorky boli získané z chirurgických vzoriek pacientov s adenokarcinómom žalúdka a všetci pacienti dal písomný súhlas s použitím týchto tkanív na výskumné účely. Vybrali sme vzorky (vrátane čerstvých mrazených a krvných vzoriek) z 74 pacientov s a bez GC recidívy.

miRNA Microarray

Analýza miRNA microarray bolo vykonané ako je podrobne opísané na internetovej stránke CapitalBio ( http://www.capitalbio.com) a tiež v súlade s postupom Hua je [18]. V stručnosti, 50 až 100 ug celkovej RNA bolo použité na extrakciu miRNA pomocou miRNA Isolation Kit AM1560 (Ambion, USA). Značeného fluoresceínom miRNA boli použité pre hybridizácii na Affymetrix miRNA čipe, ktorý obsahuje 1075 sond. Fluorescenčné signál bol snímaný GeneChip Scanner 3000 7G (Affymetrix, USA). Hrubé údaje boli normalizované a analyzované v GeneChip Command Console 1.1 softvér (Affymetrix, USA).

RNA extrakcie z čerstvých mrazených a vzorky krvi

RNA bola extrahovaná z čerstvých mrazených GC tkanív pomocou štandardného TRIzolu protokol (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). Pre vzorky krvi, miRNA boli získané s použitím súpravy miRNease (Qiagen). V stručnosti, 700 ul QIAzol činidla sa pridá ku 200 ul vzorky plazmy a inkubované po dobu 5 minút pri teplote miestnosti. Potom bolo pridané 140 ul chloroformu, na vortexe počas 15 sekúnd a inkubujú sa po dobu 3 minút pri teplote miestnosti. Toto bolo nasledované odstredením 14000 otáčkach za minútu pri teplote 4 ° C počas 15 min. Horný, vodnatá fáza sa odstráni a 1,5 krát jeho objeme pridanej v 100% etanolu. Každá 700 ul zmesi sa umiestni na kolónu a centrifugován pri 13000 otáčkach za minútu pri teplote miestnosti po dobu 15 sek. Po 500 ul pufru RPL sa pridá na kolónu a centrifugován pri 13000 otáčkach za minútu pri teplote miestnosti po dobu 2 min. Kolóna sa potom odstredí pri 13000 otáčkach za minútu pri teplote miestnosti, čím sa jeho vysušeniu. Vkladá bol Krok eluovanie s 20 ul vody bez nukleázy. Eluovaný RNA bola skladovaná pri -70 ° C.

Real-time kvantitatívne PCR

Staršie Mirna sekvencie boli získané z Sanger Institute miRBase Sequence Database (http://microrna.sanger.ac .uk /sekvencie /). Kmeňové slučkové reverznej transkripcie (RT) boli navrhnuté priméry podľa Chen [19]. Reakčná podmienky RT používa zúčastnené inkubácie pri 16 ° C počas 30 minút; 37 ° C počas 30 minút a potom 72 ° C počas 10 minút. Tepelné cykly protokol pre PCR zahŕňa počiatočnú denaturačný krok pri 95 ° C po dobu 5 minút, nasleduje 40 cyklov pri teplote 95 ° C počas 30 s, 57 ° C počas 30 s a 72 ° C počas 30 s. Tavenina krivky pre každú PCR boli starostlivo analyzované pre stanovenie akejkoľvek nešpecifickej amplifikácia. Expresia každého miRNA bola vypočítaná za použitia 2 ^{-ΔΔ C
_{T vzorec a normalizované na U6 snRNA expresie [20].}}

neriadená Algoritmus

SAM [21] bola použitá na výpočet bez dozoru clustering. Limitnej významnosť bola stanovená pomocou parametra ladenie delty, užívateľ zvolil na základe falošne pozitívnych a predstavuje hodnota q. Vybrali sme záhyb zmena väčšia ako 2 a q = 0 as výberových kritérií pre rozdielnu expresiu miRNA.

ROC a Kaplan-Meier prežitie Curve Analýza

Analýza ROC krivka bola vykonaná za použitia že MedCalc softvérové ​​balíky (Verison 8.2.1.0; Mariakerke, Belgicko). Hodnota AUC krivky za predpokladu mieru celkový výkon diagnostického testu. Pomer intenzít signálu miRNA a Ct hodnoty každého miRNA boli použité pre výpočet ROC vo vzorkách. Prežitie analýzy boli vykonané aj pomocou softvérového balíka MedCalc.

Štatistická analýza

Klinické údaje boli analyzované pomocou testu Chi-kvadrát. Kumulatívne krivky prežitia bol porovnaný pomocou log-rank testu. Pri všetkých analýz, rozdiel s P
. ≪ 0,05 bola považovaná za štatisticky významnú

miRNA cieleného génu Predikcia a signálne dráhy Analýzy

využil cieľovú databázu gén predikcie miRNA TargetScan (http://www.targetscan.org) vyberte realistickú diferenciálnej vyjadril miRNA. Integrovaný gén ontológie databázy molekulárnej anotácie systém (MAS3.0, http://www.capitalbio.com) bola použitá na sledovanie miRNA cielené gény a ich zapojenie do rôznych signálnych dráh.

Výsledky

Klinické charakteristiky GC Pacienti

celkom 74 pacientov s /bez recidívy boli vybrané pre systematickú analýzu. 31 pacientov malo opakujúce GC, ktorý bol osvedčený patologicky biopsiou pri anastomózou miestam cez endoskopii. 43 pacientov bez recidívy boli vybrané ako kontrolnej skupine s zápasov pohlavie, vek v čase diagnózy, TNM staging, liečbe a počtu zúčastnených lymfatické uzliny (Tabuľka 1).

Neboli zistené žiadne významné rozdiely v pohlaví ( P
= 0,469), vek ( P
= 0,502), umiestnenia nádoru ( P
= 0.299), diferenciácia ( P
= 0,511) , resekcia lymfatických uzlín ( P
= 0,217) a stavu adjuvantnej chemoterapie ( P
= 0,214). Tam bol významný rozdiel v UICC fáze ( P
= 0,108) a pomer prežitia /úmrtia pripomenúť (8/23 recidívy skupine oproti 34/9 v non-opakovanie skupiny, P Hotel <0,001), s mediánom prežitia 18,9 mesiacov v recidívy vs. 43,9 mesiacov v non-opakovanie skupiny v danom poradí ( P
. < 0,001) (tabuľka 1)

miRNA Expression profily pridružené GC opakovanie

sme použili miRNA microarray čip pre meranie úrovne expresie miRNA v 10 vzorkách GC s /bez recidívy (5/5) ako tréningový set. Pri porovnaní miRNA expresie medzi skupinami, 7 up-regulované a 5 down-regulované miRNA bolo zistené, že boli štatisticky významné v GC opakujúce sa skupiny (tabuľka 2). Týchto 12 miRNA by mohli byť použité na rozlišovanie medzi GC a bez recidívy na základe hierarchickej zhlukovej analýzy (obrázok 1).

HSA-MIR-335 je najlepší podpis pre klasifikáciu GC s alebo bez recidívy u Training Set

sme použili metódu ROC analyzovať citlivosť a špecifickosť kandidátnych biomarkerov na základe údajov miRNA microarray. Získali sme 2 miRNA HSA-MIR-335 a HSA-MIR-128b s najlepšou citlivosťou a špecifickosťou v klasifikácii vzoriek GC s a bez recidívy (obrázok 2, tabuľka 3). V kombinácii s hodnotou FC (FC _{HSA-MIR-335 = 4,675; FC HSA-MIR-128b = 1,453) každého biomarkeru, zvolíme HSA-MIR-335 k ďalšiemu štúdiu}

Overenie podpisu v skúšobných vzoriek real-time PCR

hladina expresie HSA-MIR-335 bola detekovaná pomocou real-time PCR v 64 vzorkách teste GC v porovnaní s prispôsobeným susedné tkaniva ako kontrola. Výsledky ukázali, že v 26 prípadoch sa recidívy, 21 prípadov (21/26, 80,8%) boli vysoko exprimovaný HSA-MIR-335; a v 38 prípadoch bez recidívy, 29 prípadov (29/38, 76,3%) boli nízke exprimovaného HSA-MIR-335 (obrázok 3). Rovnaké výsledky boli pozorované vo vzorkách krvi za použitia vzorky zmiešané krvi od 20 bez nádorového ochorenia u pacientov s choroby zažívacieho ústrojenstva je kontrola: V 26 prípadoch sa recidívy, 19 prípadov (19/26, 73,1%) boli vysoko exprimovaný HSA-MIR -335; a v 38 prípadoch bez recidívy, 30 prípadov (30/38, 78,9%) boli nízke exprimovaného HSA-MIR-335 (obrázok 3). Bolo 11 prípadov (11/64, 17,2%) nemá v úrovňou expresie HSA-MIR-335 v porovnaní výsledkov medzi mrazené čerstvé a krvných vzoriek.

Okrem toho sme zistili, hladiny expresie HSA-MIR-128b v 64 vzorkách GC krvi pomocou real-time PCR. Výsledky ukázali, že v 26 prípadoch sa recidívy, 18 prípadov (18/26, 69,2%) boli vysoko exprimovaný HSA-MIR-128b; a v 38 prípadoch bez recidívy, 27 prípadov (27/38, 71,1%) bola nízka-vyjadrený HSA-MIR-128b. Hodnota FC HSA-MIR-128b a HSA-MIR-335 boli 1,647 a 3,589 v porovnaní recidíva sa vzorkami non-opakovanie, a to v tomto poradí (obrázok 4A). Tiež sme analyzovali citlivosť a špecifickosť HSA-MIR-335, HSA-MIR-128b a HSA-MIR-335 /založené na real-time dáta PCR 128b (v kombinácii s Mir-335 a mier-128b ako podpis). Výsledky ukázali, že HSA-MIR-335 bol viac citlivý a špecifický s AUC hodnoty 0,88, než HSA-MIR-128b (AUC = 0,79) a HSA-MIR-335 /128b (AUC = 0,84) pri klasifikácii recidívy a non vzorky opakovania (obrázok 4B, tabuľka 3).

HSA-MIR-335 ako progresia ochorenia Podpis predpovedať opakovanie riziko v GC pacienti

74 pacientov GC boli rozdelení do dvoch skupín, vrátane 31 pacientov s recidívy ako skupiny a 43 pacientov bez recidívy ako skupina. Pacienti, ktorí prekonali opakovanie GC mal výrazne zníženú sadzbu medián prežitia ( P Hotel < 0,001; Obrázok 5A). Zistili sme, expresných hladín HSA-MIR-335 vo všetkých 74 vzoriek GC. Významný rozdiel bol pozorovaný v dvoch skupinách, ktoré predstavujú vysoko exprimovaný HSA-MIR-335 a skupiny s nízkou vyjadrený HSA-MIR-335 skupiny nasledujúcim spôsobom: Mir-335 (+) a mier-375 (-). GC pacientov (n = 35), s MIR-335 (+) sa významne znížila medián prežívanie v porovnaní s pacientmi (n = 39), s MIR-375 (-) ( P Hotel &0,001, Obrázok 5B).

signalizačné dráhy a Gene Ontology Analýzy HSA-MIR-335 cielených génov

Za účelom skúmania možných regulačných mechanizmov na HSA-mir-335 v procese GC recidívy, sme použili databázy bioinformatiky pre výber vierohodných cieľov tohto miRNA. Celkom 255 génov sa určili ako cieľových génov HSA-MIR-335. Signálne dráhy analýzy vyplynulo, že väčšina z cieľových génov, ktoré boli regulované HSA-MIR-335 bolo zapojených v rovnakých dráhach, ako je napríklad p53 MAPK, TGF-β, Wnt, ErbB, mTOR, Toll-like receptorov, fokálnej adhézie ( tabuľka 4, Obrázok 6). Navrhli sme, že tieto viac dráh zmeny môžu byť zapojené do klinických patologických rysov a výsledok pacientov GC. Medzitým, sme použili integrovanej databázy génovej ontológie k anotácii molekulárnej funkcii miRNA cieľových génov. Výsledky ukázali, že gény regulované HSA-MIR-335 sa zúčastnil väčšiny významných biologického procesu spojeného s ľudskými nádormi (tabuľka 5).

Diskusia

recidíva je častá u pacientov po operácii GC; preto je dôležité identifikovať prípady s vysokým rizikom recidívy. Tradičné klinika patologické faktory sú niekedy nedostatočné pre predikciu recidívy u jednotlivcov a mnohými výskumnými skupinami sa pokúsili identifikovať biomarkery s využitím nových technológií, ktoré by mohli rozlišovať tieto prípady vysoko rizikové. Rad nedávnych výskumov dokumentujú miRNA zmeny, ktoré sa podieľajú na vzniku a progresie rakoviny u ľudí. miRNA expresie profilovanie ľudských nádorov určili výraz podpisy spojené s diagnostikou, staging, progresie, prognóze a odpovede na liečbu.

V tejto štúdii sme analyzovali primárne prípady, GC, aby sa predvídať recidívu ochorenia a definovaná ako opakujúce prípadoch, ako sú bez GC po dobu minimálne jedného roka po kuratívny resekcii. Identifikovali sme HSA-MIR-335 ako hodnoverné prognózy podpisu GC na základe údajov z microarray z 10 vzoriek GC ako tréning setu. Ďalej overená tento podpis na 64 testovaných vzoriek s v priemere viac ako 85% citlivosti a osobitosti. Prežitie analyzuje výsledky ukázali, že pacienti s vysokými hladinami expresie HSA-MIR-335 sa znižuje celkové prežívanie v porovnaní s pacientmi s nízkou expresiou HSA-MIR-335. Tieto výsledky naznačujú, že tento podpis má potenciál predvídať recidívu GC.

Technológia DNA čipov sa výrazne vyvinula a stať sa komplexné a užitočný spôsob, aby nám pomohli lepšie chápe rakoviny [22]. To je teraz široko používa na štúdium funkčnej role miRNA u mnohých typov rakoviny [23], s niekoľkými významnými miRNA účinky na onkogény a tumor supresorových génov identifikovaných. Z celkového počtu 12 identifikovaných miRNA v tejto štúdii, HSA-MIR-373 bol jedným z down-regulované miRNA v opakujúce sa skupiny. To môže byť onkogén fungujúce cez známu p53, ktorý je zapojený do karcinogenézy [24]. Niektoré miRNA, ako je napríklad HSA-MIR-19a a HSA-MIR-32, sa nachádza v nádorových spojených s oblasťou genómu, ktoré môžu byť zapojené do nádorových ochorení pomocou delécie, amplifikácie, alebo epigenetických mechanizmov modifikácie [25]. Navyše, HSA-MIR-429 bola up-regulovaná v opakujúcich sa prípadoch a zoskupené na chromozóme 1, čo potvrdzuje, že niektoré miRNA, ako je HSA-MIR-200b sú združené s HSA-Mir-429 a je schopný spolupracovať regulovať cielených génov [26 ].

Doteraz miRNA určené v tejto štúdii pre predikciu rizika recidívy GC neboli dobre charakterizované. HSA-MIR-335, ktorá je transkribovaných z genómovej oblasti chromozómu 7q32.2, bolo hlásené, že rozdiel vyjadrený v benígnych a malígnych nádorov [27]. Dôležité je, že to je tiež preukázané, že mier-335 reguluje proliferáciu buniek RB1 a kontroluje takým spôsobom, p53-závislej [28]; sa podieľa na rozvoji rakoviny prsníka [29]; reguluje rast a inváziu malígnych buniek [30]. Najnovšie výskumy uvádza, že mier-335 môže fungovať ako supresor metastáz v GC zacielenie Bcl-2 a SP1, a môže byť ďalej vytvorený ako potenciálny prognostický faktor [31]. Ak zhrnieme vyššie uvedené názory, funkcia MIR-335 bol sporný. Naše výsledky ukazujú, že HSA-MIR-335 bola up-regulovaná vo vzorkách GC recidívy a zúčastňujú väčšiny onkogénnych signálnych dráh, ako je napríklad p53, MAPK, TGF-β, Wnt, ErbB, mTOR, receptoru Toll-like, fokálnej adhézie , Tieto viac signálov dráha zmeny, najmä vrátane dráhy p53, by mohol rozumne mať vplyv na klinický výsledok vrátane GC recidívy rizika [32]. Hoci prognostická úloha HSA-MIR-335 u karcinómu žalúdka je neznáma, naše poznatky sú povzbudivé.

Krv je najdostupnejší vzorka v nemocniciach. Klinický význam identifikácie biomarkerov, ktoré by mohli byť ľahko detekované, rovnako ako HSA-MIR-335 je samozrejme. Okrem toho archivované vzorky parafínu zaliate sú tiež jedným z bežne dostupných materiálov v nemocniciach, ktoré sú často chované s dobre zdokumentované klinicko-data. Predstavujú vynikajúce zdroje pre prognostickú uplatnenie ako v základnom výskume a klinických štúdií. miRNA líšia čo do veľkosti od 19-25 nt a sú chránené tlmenie hluku komplex RNA-indukovanej, čo môže spôsobiť ich menej náchylné k degradácii RNA v porovnaní s mRNA v týchto tkanivách [33]. Preto sme boli schopní detekovať miRNA expresie v parafínových vzoriek a sa zameral na systematickú analýzu s použitím tohto podpisu príslušnej aktivity prognostickú hodnotu. Klasifikačné metóda PCR-based preto sa zdá, že nám poskytnúť takým spôsobom, s použitím ľahko dostupných klinických vzoriek, predvídať recidívu ochorenia.

V súhrne sme identifikovali prognózu súvisiace Mirna, ktoré môžu predpovedať riziko opakovania pacienti GC. Kombináciou tohto podpisu s konvenčnými patologickým faktorov, mali by sme byť schopní predpovedať výsledok ochorenia pacienta presnejšie. Navyše identifikáciu vysoko rizikových pacientov by viedlo na zváženie ďalšieho terapeutického zásahu, a teda môžu informovať lekára o lepší nasledujúci program.

Poďakovanie

Ďakujeme Dr. Li Wang (National Institute of Environmental Health Sciences, USA) k nahliadnutiu pripomienky a rukopisu editáciu.

• Ploche ONE: znížená expresie génu v ARID1A je spojená s horšou prognózou v primárnej rakoviny žalúdka
• Ploche ONE: Klinická Potenciál metylácie DNA v rakoviny žalúdka: metaanalýza