Cilj
Zaslon in opredelitev reproduktivnih variante za E-kadherina (CDH1) Metode 59 GK, GC, smo analizirali 59 prva stopnja sorodniki (FDRs) 20 avtoimunske metaplastic atrofični gastritis (AMAGs) in 52 krvodajalci (BD) za CDH1 Rezultati V GK, 4 missense variante (p.G274S;. P.A298T; p.T470I, p.A592T), 1 mutacije v 5'UTR (-71C > G) in 1 mutacije v intronskih IVS12 (c.1937-13T > C) regija bilo mogoče najti. Prva patogeni učinek p.A298T mutacije je napovedoval protein 3D modeliranje. Nove p.G274S mutacija je pokazalo tudi ni jasno funkcionalno pomena. Poleg tega je prvič, intronskih IVS12 (c.1937-13T > C) je mutacija dokazano, da bo privedel do odstopanja v CDH1 Na splošno je naša raziskava izboljšuje sedanje karakterizacijo CDH1 Navedba: Garziera M, Canzonieri V, Cannizzaro R, Geremia S, Caggiari L, De Zorzi M, et al. (2013) Identifikacija in karakterizacija CDH1 Urednik: Amanda EWART Toland, Ohio State University Medical Center, Združene države Amerike Prejeto: 29. april 2013; Sprejeto: 5. september 2013; Objavljeno: 29 oktober 2013 Copyright: © 2013 Garziera et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo Financiranje:. Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC De Re N. 10.266 in AIRC Cannizzaro Posebni program Molekularna Clinical Oncology 5x1000 N. 12214), in Direzione Centrale del Lavoro, FORMAZIONE, Univerza e Ricerca Della Regione Autonoma Friuli Venezia Giulia, Codice Progetto 200502027001. blagajnami imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa nasprotujočimi si interesi. Dr. Valli De Re izjavlja, da je soavtor in urednik član uprave za Plos ONE. To ne spremeni pripadnost avtorjev vseh PLoS ONE politike o izmenjavi podatkov in materialov. Rak želodca (GC) ostaja četrti najpogostejši malignom na svetu, čeprav je njegova razširjenost in s tem povezane stopnje umrljivosti so se znižali v zadnjih desetletjih. GC prognoza je tesno povezana s stopnjo bolezni ob diagnozi [1]. Zgodnji začetek želodčni rak (EOGC) je definiran kot GC predstavitvi pri starosti 45 let ali manj [2] in ima slabo skupnega preživetja [3], [4]. Večina GK so občasna in pogosto nastajajo Helicobacter pylori Najbolj splošno sprejeta GC histopatološki razvrstitev (klasifikacija Lauren) [7] razlikuje med dvema vrstama GC:. Črevesne tipa in razpršeno tipa. Difuzna GC kaže večjo dedno osnovo in na splošno slabšo prognozo v primerjavi s črevesno podtipa [8]. CDH1 v tej študiji smo analizirali CDH1 karakterizacija bolnikov in CDH1 Medicinski in histopatološke značilnosti GC, FDR in AMAG predmetov so povzete v tabelah 1 in 2. med bolniki, GC 59, 2 (3,4%) imajo družinsko anamnezo GC (S15 je brat S16), ne izpolnjujejo meril za dedno razpršenega GC, kot ga zahteva Mednarodna želodca raka povezava Consortium (IGCLC) opredeljena ob odvzemu vzorca. V našem GC seriji, so 5 občasnih bolnikov zgodaj GC (starih ≤45 let) prisotni, vendar ne CDH1 CDH1 Druge spremembe posledica skupnih polimorfizmov (pogostnosti vsaj 1% v populaciji) ali tihe mutacije, ki kodo za ni statistično združenje opazili isto amino kisline od prvotne usmeritve. med štirimi skupinami bolnikov, testiranih za ID 4, ID 6 ali ID 19 variant. RefSNP (rS) številke za identifikacijo genetske variante že objavljene kot tudi njihove poročali frekvenc (NIEHS okolja Genome Project, Seattle, WA (URL: http://evs.gs.washington.edu/niehsExome/Pridobljeno avgust 2013); ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/phase1/analysis_results/paper/Accessed december 2012), so navedene v tabeli 3. Vsi CDH1 Pogostost mutacije in variant je bilo izračunano v osebah brez GC ali AMAG bolezni (52BDs + 59FDRs, n = 111). Šestnajst FDRs so bili prvi sorodniki stopinjski našega GC serije; ko je bil prisoten v GC in z njo povezano primeru FDR eden od variante, smo izključili FDR posameznika iz izračuna frekvence. ID4 na primer, je bila prisotna v 5 FDRs, povezanih z našo GC naše serije; Zato frekvenca nadzor prebivalstva spremenilo od skupno 111 do 106 posameznikov (7FDRs + 8BDs /106; 14,5%). Slika 1 prikazuje zaporedja kromatograma o novih mutacij, ki smo jih najdemo. Smo že poročali kromatogram ID 10 v drugem dokumentu [26]. missense mutiral ostanki ki smo jih našli, so vsi lokalizirani na E -cadherin zunajcelično domeno. Kodon položaj v nezreli in zrel (po N-terminalnih razpada) proteinov in podatkov iz PolyPhen-2 in presejanje v silicij Ker glede na preostalih dveh missense mutacij, imajo manj jasno funkcionalno veljati poročala tudi v tabeli 4. str. T470I (ID 12) substitucija [28] spreminja površino AA extradomain ES3 v zrelega proteina (slika 2C). V obeh murinega E-kadherina in N-kadherina sekvence (oznaka PPP: 3Q2W) se treonin navadno najdemo O če želite raziskati, če bi intronskih mutacije odkrite v našem GC seriji (tabela 3) lahko povzročijo vpliva na spajanje, smo izvedli CDH1 za ID 5 in ID 7 intronskih mutacij, smo pomnožili regijo, ki zajema del eksonu 1 del eksonu 5, za ID 17 mutacijo, ekson 10 do 13 (slika 3). RT-PCR eksonu 1 do 5 fragmenti pokazala nobenih razlik, ko deluje na 4% agaroznem gelu (slika 3A), niti po dvosmerno sekvenciranje (podatki niso pokazali,); ga nasprotna ID lahko 17 intronskih varianta vpliva na spleti vodi v nenormalno manjše CDH1 Analiza CDH1 primerjava E-kadherina ravni mRNA izražanja je bila izvedena iz EBV ovekovečena limfociti, dobljeni iz periferne krvi S10 in S190 (mutacija ID 17), S97 (ID 9) in S189 (no CDH1 Imunohistokemijsko analiza na tumorja želodca tkivo intronskih ID 17 primerih (code bolnik S10, Slika 5E) je pokazala zmanjšano ekspresijo membransko vezan E-kadherina v tumorskih celicah Pečatnjak (črni puščici), medtem ko so bili prisotni pri običajnem epitela sta membrana in citoplazemskega barvanja. Enako pacient kazali zmanjšano β-catenin obarvanja v Pečatnjak celic v primerjavi z močnim ekspresijo tega proteina v normalne sosednjih celic (slika 5H). Izguba obeh E-kadherina in β-catenin obarvanjem bil tudi opazen za drugo bolnikov (S46), ki imajo enak intronskih ID 17 mutacijo in vpliva na GC preveč (slika 5F in 5i, oziroma za E-kadherina in beta-catenin) . Pogovor bolniki GC so običajno slabo prognozo [29]. Identifikacija bolnikov s povečanim tveganjem za razvoj GC in zgodnje odkrivanje GC so obetavni pristopi za zmanjšanje obolevnosti in umrljivosti za GC. FDR bolnikov GC je znano, da imajo 2-3 krat večje tveganje za GC, verjetno zaradi izpostavljenosti do enakih okoljskih dejavnikov tveganja in /ali podedoval dovzetnost za raka [30]. uničenje parietalnih celic najdemo v AMAG v kombinaciji s pomembno vlogo e-kadherina v epitela polarnosti in želodca žleznega arhitekture, predlaga, da bi bilo reproduktivnih spremembe v CDH1 Leta 1998, Guilford in sodelavci opisali prvič reproduktivnih mutacij v CDH1 Moč naše raziskave je zbirka 59 kavkaških bolnikov s sporadično GC, 59 FDRs in 20 AMAGs ki obiskoval našo gastroenterologija storitev v zadnjih letih za želodčne simptomi in diagnozo ali izključitev GC po endoskopsko in ocenjevanje histološko tkiva. Kot je povzeto v tabeli 3, so različne drugačne spolne celice CDH1 ID 10 (p.G274S) je nov missense mutacije, ki jih najdemo v starem moškem z GC mešano histotype. Ta varianta ni bila odkrita na 187 prosto z rakom posameznikov (108BDs + 59FDRs + 20AMAGs), s čimer je izključen polimorfizem. Patogena učinek ID 10 mutacija ni bila podprta po funkcionalni (seštevanje in invazije) in vitro ID 11 (p.A298T) zamenjava v eksonu 7 CDH1 ID 12 (p.T470I) je bilo v 57-letnega moškega (S39) z diagnozo GC . Ta sprememba je bila prvič opisana v družini Maori etničnosti s EOGC, vendar ni bila prizadeta predmet prikazuje to mutacijo GC v času študije [28]. Tukaj smo ugotovili, da je spremembo, p.T470I AA prenašajo presejanje in tudi z analizo modeliranja. Na žalost je bil tumor bioptičnega tkiva vzorec ne zadostujejo za izvedbo E-kadherina IHC madeže. Zamenjava ID 15 (p.A592T) je bila odkrita v vsakem kliničnem skupini testirano, ki kažejo na verjetno polimorfne difuzijo. Kljub temu, ta varianta je bila pred tem poročali, povezane z ščitničnih tumorjev in lobularni raka dojke [41] - [43]. Naša analiza konstrukcij in in vitro kot nedavni smernicami za klinično upravljanje priporoča [44], nadzor endoskopija je treba vsako leto opraviti v teh posameznikih z mutacijami nedoločenega pomena (npr missense). Po našem mnenju so preiskovanci zatočišča ID 15 in tudi ID 10, mora slediti do 10 let, preden brez vlogo, čeprav šibka za to spremembo v patogenezi GC. V ID 2 smo ugotovili, C -to-G sprememba pred start kodon (-71C > G, CDH1 intronskih ID 17 variantnih (IVS12 c.1937-13T > C). Ugotovljeno je bilo v 2 ženskah z GC (2/59 GK = 3,4%) pozitivnih na okužbo s HP, in ugotovljeno je bilo tudi v 1 BD (1/52 = 1,9%, tabela 3). Enaka sprememba je bila že poročali v lobularnega rakom dojke z visoko frekvenco (12/53 = 23%) [47], v HDGC družin (27/02 = 7,4%) [48] in pri bolnikih EOGC (7/79 = 8,9% ) [46], ampak tudi v relativnem kontrolno populacijo [46]. Pomembno je omeniti, smo dokazati, prvič, da je ta zamenjava vodi do odstopanja v CDH1 v skupini FDR predmetov, z izjemo polimorfnih in tihih CDH1 ID 1 (5'near genov-176c > T) je varianta odkrili pri 32-letni ženski, ki ima status okužbe neznanega HP. Ta varianta je bila že vložena v številnih zbirkah podatkov, vendar je njen pomen ni znan ID 3 (5'UTR-54G > C). Varianta je bilo v 72-letnega moškega pozitivni na okužbo s HP. Interesa, je ta mutacija že odkritih v zdravem 41-letni japonski temi, brez klinično zaznavne tumorja ob vpisu, in opisana redko varianto ki lahko zmanjša transkripcijski dejavnost CDH1 ID 9 (intronskih IVS4 c.532-18C > T). ugotovljeno je bilo v 41-letni moški ob negativnem za okužbo HP. ID9 so prvič poročali v dveh EOGC bolnikov iz Anglije in Portugalske, oziroma [56], v dveh HDGC nemških bolnikov in 1 kontrolni predmet vpisan v isti študiji [35]. Nedavno je bil predlagan niso patogeni vlogo tej varianti [2]. Nismo opazili nobenega vpliva na CDH1 bolniki AMAG ima 3-krat povečano relativno tveganje za razvoj GC in niso bila nikoli raziskana za CDH1 Skratka, naši rezultati kažejo, da je dobro znan patogen ID 11 mutacij (p.A298T) je mogoče zaznati tudi pri bolnikih, občasna GC ne izpolnjuje stroga merila za HDGC. Poleg tega smo pokazali, škodljiv učinek ID 17 variante (IVS12 c.1937-13T > C) na CDH1 na koncu, v FDR posameznika na tveganje za GC, smo našli varianto ID 3 (5'UTR-54G > C). s potencialnim učinkom povečanja status hypermethylation o CDH1 Severovzhodna Italija predstavlja visoko GC pojavnosti in umrljivosti čeprav je nižja zvezi s centralnimi regijami, kot sta Toskana in Marche [57] . Naše ugotovitve kažejo razširjenost v missense CDH1
pri bolnikih, ki niso dedni rak želodca (PK) in pri osebah, pri tveganje za GC.
z neposrednim sekvenciranja, strukturno modeliranje in bioinformatike. Funkcionalna vpliva na spajanje smo ocenili za intronskih mutacij. E-kadherina /β-catenin Imunohistokemijsko in E-kadherina mRNA kvantifikacija s pomočjo RT-PCR smo izvedli
Prepis z ekson 11 izbrisom. Ta mutacija je bilo v 2 GK in 1 BD. V FDRs, smo ugotovili 4 variante: polimorfna (p.A592T) in 3 mutacije neprevedenih regijah z neznano funkcionalne vloge, razen za 5'UTR (-54G > C), ki je bilo ugotovljeno, da zmanjšanje CDH1
prepis. V AMAGs, smo odkrili 2 sprememb: 1 missense (p.A592T) in 1 novo različico (IVS1 (c.48 + 7C > T)) brez učinka na CDH1
spajanje. Več tiho in polimorfnih substitucije so na voljo v vseh skupinah raziskovali.
Sklepi
mutacije in njihovo funkcionalno vlogo v GC in pri osebah, ki jim grozi GC. najdemo v neprevedenih regijah in podatkov o spajanje učinkih mutacije zaslužijo posebno pozornost, kot je povezana z zmanjšano količino E-kadherina. Uporabnost CDH1
prebiranje, poleg identifikacijo drugih dejavnikov tveganja, bi bilo koristno za zgodnje odkrivanje GC pri osebah s tveganjem (tj FDRs in AMAGs), in zagotavlja, nadaljnje študije.
reproduktivnih variante v sporadični Rak želodca bolnikov in posameznikov, ki jim grozi želodca raka. PLoS ONE 8 (10): e77035. doi: 10,1371 /journal.pone.0077035
Uvod
(HP) -associated gastritis [5], [6]. Vendar pa družinske študije združevanja poudaril tudi pomen genetske predispozicije na sporadične razvoj GC. Pogostost družinske želodca združevanja je približno 10%
kodira E-kadherina je bilo ugotovljeno, da imajo vzročni vlogo v približno 30% -50% od dedna razpršenega GC (HDGC), sindrom avtosomno dominantna GC in lobularni dovzetnost za raka dojke predstavljajo 1-3% od družinsko grozdenja GK [9], [10] in v difuzni GC podtipa [11] . CDH1
zarodne mutacije (kot mutacija se prenaša na vsako celico v telesu potomcih je) so posebej povezana z HDGC (približno 30% -40% primerov); Velik CDH1
črtanja so ugotovili pri približno 6,5% primerov [12]. Družinska črevesnega raka želodca (FIGC), s pozitivno družinsko anamnezo so tudi opisani, vendar doslej ni reproduktivnih CDH1
pomanjkljivosti so bile povezane z FIGC ali črevesne GK. To pomanjkanje dokazov o CDH1
mutacije v črevesni podtipa je privedla do hipoteze, da je družinsko povezovanje v teh primerih določi skupnih okoljskih dejavnikov, v nasprotju s prirojeno genetsko predispozicijo. Vendar pa zadnji podatki kažejo, da je CDH1
somatske spremembe (take spremembe kopičijo v rakavih celicah telesa nad življenjsko dobo osebe), so pogoste v črevesju, kot je v difuzni GC [13], kar kaže na pomembno vlogo CDH1
v obeh histotypes. Kljub temu, natančno razširjenost CDH1
reproduktivnih spremembe v črevesni GK še ni znan. CDH1
promotor hypermethylation je najpogostejši drugi genetski hit v GC kancerogenega procesa [14], [15]. CDH1
mutacije so povezana tudi s povečano občutljivostjo za invazivne in metastatskega [16] [17], debelega črevesa, mehurja, prostate, dojk in ginekoloških raka [18] - [20]. E-kadherina je transmembranski glikoprotein, ki igra pomembno vlogo pri ohranjanju epitelne arhitekturo tkiva z vključevanjem Ca 2+ interakcije odvisne od mobilnega celic [21], [22]. E-kadherina obsega citoplazemske domene, kratko transmembransko domeno in pet zunajcelične ponovite kadherina podobnih domen (EC1-5), ki obsegajo eksonov 4-13 in vsebujejo visoko konzerviranim regijam kalcij veže [23], [24] in ohranjena cistein, ki bi lahko da tvorijo disulfidnih mostov [25]
zarodne mutacije v nizu zaporednih primerih naključno GC in posameznike, ki jim grozi GC.; predvsem prva stopnja GC-Sorodniki (FDRs) in avtoimunske bolniki metaplastic atrofični gastritis (AMAG) usmerjena na našem inštitutu za gastrointestinalni simptomi in endoskopsko vrednotenja. Raziskati vlogo E-kadherina izražanja, strukturnih, funkcionalnih in imunohistokemičnim analize so bile opravljene na vzorcih z CDH1
zarodne mutacije. Namen raziskave je bil ugotoviti prisotnost in označevanje CDH1
zarodne mutacije v nizu zaporednih bolnikov sporadičnih GC nimajo meril za razvrstitev HDGC in v izbranem ogroženega prebivalstva razvoja GC, za testiranje njegova uporabnost kot označevalec izboljšati zgodnje odkrivanje tumorjev. Podatki, pridobljeni bi jih lahko uporabili za razvoj orodja, ki se hitro in poceni zazna CDH1
mutacije v glavnem prisotna v naši populaciji.
Rezultati
reproduktivnih genetski screening
spremembe so bile ugotovljene pri teh bolnikih. Mediana starost FDRs je bila 49 let (razpon, 28-78 let) in za AMAGs 56 let (razpon, 31-72 let). Med bolniki, GC 59, je bilo 16 preiskovancev prvo stopnjo glede vključeni v študiji (16/59 FDRs). FDRs in AMAGs prišel v naše institucije za gastroenterologijo obisk in gastroskopija izpit, se kaže z različnimi simptomi, vendar niti raka niti intestinalno metaplazijo /displazije bil prisoten na teh predmetih.
genetski rezultati pregleda so navedene v tabeli 3 z nove
mutacij: 1 intronskih (ID 5), 1 missense (ID 10) in 2 tiho (ID 13 in ID18). Splošno smo ugotovili 4 variante, ki kodirajo za amino kisline (AA) nadomestnega (1 romana (ID10) in 3 predhodno objavljene v drugih populacijah (ID 11, ID 12, ID 15), 1 v 5'near gensko regijo in 2 mutacije v neprevedene (UTR) regulatornega elementa (ID 1, ID 3, smo že poročali) in 6 substitucij intronskih regijah (tri mutacije: ID 5, ID 9, ID 17, tri intronskih polimorfne različice: ID 4, ID 6, ID 8, verjetno brez vpliva na GC kancerogenezo). Ni izbrisi ali vložki so našli v mejah eksonu.
variante so v heterozigotnem stanju, z izjemo ID 4, ID 19, v kateri je bila odkrita tudi homozigotno stanje.
bioinformatika predvidevanjem vloga in strukturno modeliranje rezultati missense variant našel
analize so predstavljeni v tabeli 4. Vsi štirje missense variante so potencialno škodljive zaradi PolyPhen -2, vendar le p.A298T (ID 11) in p.A592T (ID 15) zamenjave lahko vplivajo na delovanje proteinov s presejanje analizo (preglednica 4). V p.G274S (ID 10), da smo pred kratkim opisani [26], pa ne motijo lokalno okolje, ampak predstavlja potencialno ostanek za fosforilacijo in glikozilacije, ki imajo lahko morebitne učinke na stabilnost in integriteto E-kadherina Kot smo hipotezo [26]. Patogeni učinek ID 11 substitucije bila predhodno določena [27], vendar je tu prvič pokazala strukturne analize. Kot je prikazano na sliki 2A je sprememba AA v eksonu 7 p.A298T (ID 11) nameščena v bližini interaktivni območju med promotorji ES1 in EC2. Tako lahko alanin-treonin polar zamenjavo preostanek vožnje tvorbo H-vezi, ki je s svojim oxydrilic skupini in to lahko vpliva na lokalne strukture proteina v regiji, ki je ključnega pomena za Ca 2 + interakcij. Treonin na položaju 144 je sterično dokazano, vsiljiv, ker je povezana z dvema ostanki asparaginske kisline (Asp136 in Asp 138), ki so neposredno vključeni v Ca 2+ zavezujoč. Poleg tega so dolžine obveznic še posebej poudaril, da je manj kot 3 A (slika 2B).
-glycosylated kaže pomembno vlogo pri tem ostanka v strukturi proteina. Vendar, kot je razvidno v sliki 2D, spremembe v izolevcina, nepolarno AA s hidrofobno stransko verigo, ki ne morejo opraviti posttranslacijsko modifikacijo, kažejo nobenega posebnega intermolekularno napetosti. Smo hipotezo, da je v zunajcelični mediju prisotnost izolevcinske ostanka na istem mestu kot treonin lahko vzpodbudi beljakovine beljakovine interakcije, in to mutacijo bi tako prevzame zaščitno pomen. Zadnji mutacija poročajo, p.A592T (ID 15), je bilo v vseh testiranih skupin (glej tabelo 3), kar kaže na neverjeten učinek na GC patogenezo. V tem primeru, alanin na extradomain EC4 zrelega E-kadherina (slika 2E) določa prilagoditveno svobodo, tudi če v bližino Ca 2 + vezavnih mest. Nadomestitve treonin tukaj ima omejen učinek na lokalne strukture in torzijskih kotov proteina. Vendar pa ne moremo izključiti možnosti, da bi lahko bil oxydrilic lateralno verigo post-translacijskih spremeni v določeni situaciji in s tem vpliva na strukturo in funkcijo CDH1
(slika 2F).
prepis analizo intronskih zarodne mutacije
analiza prepis. Polimorfnih in tihe variante so bili izključeni iz te analize, saj verjetno nimajo patogeno vlogo. cDNA proizveden iz periferne krvi izbranih GC posameznikov zasidrana intronskih ID 5, ID 9 ali ID 17 mutacij (tabela 3) so v primerjavi s iz dveh zdravih krvodajalcev, eno samo, ki ima isti ID 17 mutacij kot bolniki GC (BD koda S190 ) in drugo (BD oznaka S189), ne da bi CDH1
mutacija.
prepis (slika 3B). Po izolaciji in zaporedja, smo ugotovili, da je manjša skupina povzročila preskočene prepis primanjkuje eksonu 11, z eksonu 10 neposredno spojene z EXON 12. To zmotno Zapis je bil zaznan tudi v BD S190, ki nosi isto zarodne imunoglobulinske proge menjavo (slika 3B).
protein številčnost in mRNA ravni pri osebah, ki prikazuje CDH1
intronskih mutacije
mutacij) predmetov. Ob S10 je prizadet zaradi raka želodca predmet S97 je prva stopnja sorodnik bolnika z rakom želodca (FDR), medtem ko so bili S189 in S190 sta krvodajalci. Opazili smo med darovalcem kontrola krvi (S189), ki nimajo CDH1
mutacijo in bolniki, relativno močan upad E-kadherina izražanja (približno 60%, slika 4) v S10 bolnika, ki ima hkrati ID 17 mutacijo in A GC, medtem ko je le približno 2% zmanjšanje darovalca krvi S190 je ob isti ID 17 mutacijo ( p
< 0,05, v zvezi z GC S10). Za S97 (mutacije ID 9, FDR predmet), smo opazili podobno E-kadherina izraz, kakršen je pri nadzoru S189.
dodaten dejavnik tveganja za razvoj GC v AMAG bolnika [31].
gena [28]. Kasneje so poročali različni tipi mutacij v družinah različnih narodnosti z difuzno GC [32], [33]. Prvi CDH1
reproduktivnih mutacija je bil opisan v italijanski družini v letu 2006, pri bolniku, ki je izpolnjeval kriterije IGCLC za HDGC [34]. Vendar pa je zelo malo študij poroča CDH1
zarodne mutacije v sporadični primeri GC brez družinsko seštevanja ali pri osebah obstaja tveganje za razvoj GC [35], [36]. Poleg tega je v teh študijah funkcionalne učinke CDH1
variantah pogosto niso opravili.
variante bila odkrita. V seriji 59 GC, razen polimorfne in tihe spremembe, ki jih verjetno ne patogeno vlogo, smo ugotovili, 6 različnih substitucije v 9 bolnikih (9/59 GK = 15,2%): 4 tipa missense (ID 10, ID 11, osebne 12, ID 15) v 4 različnih bolnikih (6,8%) in 2 tipa, missense (ID 2 in ID 17) v 5 različnih GK (3,4%).
teste, kot smo pred kratkim poročali, [26], kljub temu podatki silico
opredelitve mutacije in zmanjšanje β-catenin izražanja najdemo v tumorskem tkivu ni mogoče povsem izključiti pomen te mutacije pri razvoju GC. Tako je danes ID 10 ostaja roman CDH1
mutacija s patogenezo nejasnim pomenom.
je opisan v 36-letni mladi kavkaški Moški v družini HDGC [27]. V naši seriji, je ta varianta zaznali le v 1 moškega (S47) od 74-year-old z mešanim histotype. Potencialni patogeni učinek te mutacije je bila potrjena s vitro
funkcionalnih študij v različnih laboratorijih [27], [37], [38]. Tu Prvi rezultati modeliranja (Slika 2A-B) z analizo 3D beljakovin-ligand zavezujoče interakcije, močno podpirajo možnosti za spremenjenem delovanju beljakovin in vodi v morebitno molekularni mehanizem, ki ohranili ta proces. Potencial spremenila funkcija beljakovin je bila podprta tudi presejanje analize (tabela 4), z dobrim rezultatom. Poleg tega je nedavna študija, z uporabo silico
oblikovanju beljakovin FoldX algoritmično pristop [39], ponovno poudarja patogeno vlogo ID 11 (p.A298T) zamenjavo, ki temelji na izračunu spremembe domačih državnih stabilnosti (ΔΔG > 0,08 kcal /mol) [40]. Avtorji značilna bolnikov zatočišča to missense mutacijo, da ima mlajšo starost ob diagnozi in difuzno histotype. Naš primer je poudaril, da lahko ID 11 mogoče zaznati tudi v starem bolniku z mešanim GC.
[35] in silico
študij [38], [40] ne podpirajo patogeno vlogo za to varianto v PK.
5'UTR regija), ki je predstavljal najpogostejši varianto, povezano z GC v naši seriji, ki se pojavlja v treh od 59 bolnikov GC ( 5,1%). Ta varianta so poročali tudi v finski študiji [45] v 1 od 13 (7,7%) bolnikov GC in pri 2 od 51 kontrol (3,9%), pa tudi v dveh EOGC bolnikov Severne ameriškega porekla (3,4%) [46] . Skupni podatki iz teh študij kažejo, da je ID 2 a precej pogoste mutacije, vendar avtorji niso poročajo podatke o ID 2 variante v zvezi s statusom izraz E-kadherina. ID 2 je na voljo v naši seriji v enem črevesju, eno mešano in eno razpršenih GC histotypes. Vsi ti bolniki so imeli več kot 50 let na diagnozo in so bili negativni na okužbo s HP. Nihče od kontrolne skupine (n = 111), testiranih brez GC, je pokazala to mutacijo (tabela 3). in situ
ocene ali korelacije med ID 2 in E-kadherina izražanja ni bilo mogoče izvesti zaradi pomanjkanja tumorja materiala. Potencialni patogeni učinek te promotor variante na E-kadherina nivo ekspresije zasluži nadaljnje študije
prepis skrivanje izbris CDH1
eksonu 11. Exon 11, skupaj z delnih zaporedij spremljajoče eksonov , kodificira za ES4 domeno zrelega proteina [25]; ID 17 je izven okvirja izbris in vodi do nastanka prezgodnje stop kodonu pri legi 384 promotorja ES4. Zato je prevedena protein iz CDH1
ID 17 sklop bi lahko pomanjkanje domeno transmembranski in citoplazemske rep, ki je vpletena v beta catenin zavezujoč. Oba S10 in S46 bolniki GC, ki ima ID 17 mutacijo, je pokazala zmanjšanje izražanja E-kadherina in β-catenin z imunohistokemijo analiz (slika 5); GC S10 pacient z rakom celično pečat obroča, je bil diagnosticiran pri starosti 61 let, in GC S46 bolnik z razpršeno adenokarcinoma, je bil diagnosticiran pri starosti 58 let. Poleg tega, vrednotenje E-kadherina izražanja z EBV ovekovečena B-limfociti so pokazale močno znižanje (60%) v GC S10 zatočišča ID 17 mutacijo v primerjavi s kontrolo BD (S189) brez CDH1
sprememb, vendar tudi v primerjavi z enim samim krvi darovalca (S190), ki nosi isti ID 17 varianto. Ker so vsi subjekti, ki se ID 17 mutacijo heterozigotna za CDH1
gena, naši podatki kažejo, da je S190 posameznika, ne pa tumorske celice S10 in S46 bolnikih lahko izkoristijo nekaj kompenzacijski mehanizem, ki deluje nasproti E-kadherina navzdol ureditev. Tumorjev, ki je E-kadherina pod ekspresijo povezana z izboljšano β-catenin transkripcijsko aktivnostjo, glavni efektorja NT poti [49]. Izraz velikega števila genov, povezanih z napredovanja tumorja, vključno s tistimi za ciklin D1, c- je myc
, vaskularni endotelijski rastni faktor, in survivina nadzorovan prek NT /β-catenin steze [50]. veže na beta-catenin preprečuje njegovo translokacijo v jedro E-kadherina; zato lahko znižanje E-kadherina izražanja prednost GC patogenezo s povečanim kopičenjem jedrske β-catenin. Bolniki S10 in S46 z ID17 varianti sta oba ženske kažejo Helicobacter pylori (HP) okužba, predvidevamo, da bi lahko ID 17 povezana s spolnim specifične prognostični faktor (znano je, da je pojavnost GC višja pri moških kot pri za ženske) in /ali okužbe HP. Izbris eksona 11 v CDH1
gen je bil opisan tudi v HDGC bolnika, ampak v tem zadnjem primeru je zmotno spajanje povezan z drugim intronskih mutacije (IVS11 c.1711 + 5G > A) [27] . Zanimivo, alternativno spojeno nefunkcionalen E-kadherina transkript, ki nima ekson 11 gena so poročali tudi v nekaterih glave in vratu rakavih celic [51] in kroničnih primerih limfocitno levkemijo (KLL), in čeprav je na nižji ravni v primerjavi s KLL, tudi v normalnih celic B [52]. V teh primerih so opazili genske spremembe v eksonu 11 ali v njenih spremljevalnih intronskih regijah; ne-funkcionalna prepis ima predčasnega prenehanja kodon in se razgradi v neumnosti posredovana RNA razgradnje [52]. Spajanje dejavniki, ki so zavezujoči v regiji eksona 11 CDH1
, bi lahko spremenjene ravni izražanja ali stanja aktivacije v KLL celic v primerjavi z normalnimi B-celic, kot je pred kratkim izkazalo, [53].
mutacij, smo opazili 3 substitucije (ID 1, ID3 in ID 9), ki niso bile ugotovljene v GC.
[54]. Predpostavljamo, da je ta mutacija z uvedbo otok CpG v CDH1
promotor regija poveča verjetnost CDH1
hypermethylation, znan dogodek daje prednost transkripcijski inaktivacijo, zgodnji dogodek v HP gastritis [ ,,,0],55] in ključni dejavnik tveganja, povezana z razvojem GC
spajanje.
reproduktivnih mutacij do zdaj. V AMAG seriji smo našli le polimorfne variante z izjemo ID 5, nova intronskih mutacija blizu eksonu 1 (IVS1 c.48 + 7C > T). ID 5 je bilo v ženski 51-letnik z hipergastrinemije. Nismo našli nobene truncations ali premikom bralnega okvira za proizvodnjo proteina, povezane s to mutacijo. Čeprav je naša serija omejena (n = 20), se zdi, da ti podatki ne podpirajo ustrezno vlogo CDH1
genskih sprememb, povezanih z AMAG bolezni.
spajanje in povezano zmanjšanje E-kadherina izražanja in tudi za P-catenin. Enako ID 17 mutacij in preplete učinek najdemo v 1 krvi darovalca, vendar z omejenim učinkom na E-kadherina ravni mRNA, je zanimiva in si zasluži nadaljnje študije. Glede na povezanost med posebnimi CDH1
reproduktivnih spremembah in histotype tumorja, smo ugotovili, da je 8,3% (1 od 12 GK), mešane (ID11) in 7,7% (2 z dne 26. GK) razpršenih (ID17) podtipov , izvajajo potencialno patogene mutacijo
, znan dogodek, tveganje, povezano z razvojem GC in napredovanje.
zamenjave v primerjavi z ne-missense sprememb, kot je navedeno v nedavnem metanalysis za srednje visoko ogroženih območij GC kot v srednji Italiji [58].
Migracije vplivajo na črevesno mikrobioto, kar posledično vpliva na zdravje raziskovalcev
Ustvarjanje fizičnega in genetskega zemljevida Cannabis sativa
Znanstveniki razvijajo 3D natisnjene tablete, ki vzorčijo bakterije, ki jih najdemo v črevesju
Znanstveniki razvijajo peptide, ki obnovijo ravnovesje v črevesnih bakterijah in obrnejo aterosklerozo
Ljudje s simptomi IBS, ki imajo verjetno nizko raven vitamina D,
Dodatek kratkih verig maščobnih kislin izboljša okrevanje po možganski kapi,
Če ste starejši od 50 let,
Čas je za kolonoskopijo Ljudje odlašajo z nekaterimi stvarmi - čiščenjem garaže, prebarvanje dnevne sobe, umivanje oken ... in kolonoskopija. Toda kolonoskopija je verjetno najboljša možnost za odkri
Soočanje s sindromom razdražljivega črevesja
Sindrom razdražljivega črevesja (IBS) naj bi prizadel od 25 do 45 milijonov Američanov, večinoma ženske od poznih najstnikov do zgodnjih 40 -ih. Stanje je mešanica nelagodja v trebuhu ali bolečine in
Nekatere bakterijske vrste lahko povečajo tveganje za HIV pri ženskah,
najde novo študijo Nedavna študija, objavljena v Nalezljive bolezni Lancet, opisuje sedem vrst vaginalnih bakterij, ki lahko znatno povečajo tveganje za okužbo s HIV pri ženskah. Zasl