Ploche ONE: Identifikácia a charakterizácia CDH1 zárodočnej línie variantov v Sporadické rakovina žalúdka pacientov au osôb ohrozených rakoviny žalúdka

abstraktné

Cieľ

na obrazovku a charakterizovať zárodočné varianty pre E-cadherinu (CDH1)
v non-dedičnej rakoviny žalúdka (GC) pacientov au predmetov na riziko GC.

Metódy

59 GCs, 59 prvý stupeň príbuzní (FDRS) GC 20 autoimunitné metaplastická atrofická gastritída (AMAGs) a 52 darcov krvi (BDS) boli analyzované na CDH1
priamym sekvenovania, štrukturálne modelovanie a bioinformatiky. Funkčné vplyv na zostrihu bola hodnotená IntronA mutácií. Boli vykonané E-cadherin /β-katenin imunohistochemické farbenie a E-cadherin mRNA kvantifikácia pomocou RT-PCR

Výsledky

V GC, 4 missense variantov (p.G274S;. p.A298T; p.T470I, p.A592T), 1 mutácie v 5 'UTR (-71C > G) a 1 mutácie v intronom IVS12 (c.1937-13T > región C) boli nájdené. Prvý patogénne účinok p.A298T mutácie bol predpovedal 3D modelovanie proteín. Román p.G274S mutácie ukázal žiadnu jasnú funkčný význam. Okrem toho, prvý, intronové IVS12 (c.1937-13T > C) mutácia bola preukázaná viesť k aberantne CDH1
transkript s exón 11 zmazanie. Táto mutácia bola nájdená v 2 GC a 1 BD. V zapisovačov letových údajov sme identifikovali 4 varianty: polymorfné (p.A592T) a 3 mutácie v nepreložených regiónoch s neidentifikovaným funkčné role s výnimkou 5'UTR (-54G > C), ktoré bolo zistené, že pokles CDH1
transkripcie. V AMAGs sme zistili, 2 zmeny: 1 missense (p.A592T) a 1 nový variant (IVS1 (č.48 + 7C > t)) bez vplyvu na CDH1
zostrihu. Niekoľko tiché a polymorfné substitúcie boli nájdené vo všetkých sledovaných skupín.

Závery

Celkovo naše štúdie zlepšuje súčasnú charakterizáciu CDH1
mutácie a ich funkčné úloha v GC a u jedincov s rizikom GC. Mutácie nájdené v nepreložených oblastí a údajov o fúziách účinkoch si zaslúži osobitnú pozornosť, ako spojené so zníženým množstvom E-cadherinu. Užitočnosť CDH1
screening, okrem identifikácie ďalších rizikových faktorov, by mohli byť užitočné pre včasnú detekciu GC u jedincov s rizikom (tj FDRS a AMAGs), a vyžaduje ďalšie štúdium.

Citácia: Garziera M, Canzonieri V, Cannizzarova R, S Geremia, Caggiari L, De Zorzi M, et al. (2013) Identifikácia a charakterizácia CDH1
zárodočnými varianty v ojedinelých rakovina žalúdka pacientov au osôb ohrozených rakoviny žalúdka. PLoS ONE 8 (10): e77035. doi: 10,1371 /journal.pone.0077035

Editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Spojené štáty

• Ploche ONE: Kvantitatívne meranie organických kyselín v tkanivách od rakovina žalúdka pacientov naznačujú Zvýšenie metabolizmu glukózy v žalúdku Cancer
• Ploche ONE: Ochranný Úloha infekcie Helicobacter pylori v prognóze rakoviny žalúdka: Dôkaz od 2454 pacientov s žalúdočnej Cancer