Stomach Health > Желудок Здоровье >  > Gastropathy and Symptoms > Язва желудка

PLoS ONE: Метаболомика в сочетании с данными и многовариантного анализа Pathway на потенциальных биомаркеров при язвенной болезни желудка и вмешательство Эффекты Corydalis yanhusuo алкалоида

Абстрактный
<р> Метаболомика, систематический анализ потенциальных метаболитов в биологическом образце, все чаще применяется к открытию биомаркеров, определения возмущенных путей, измерения терапевтических мишеней, и открытие новых лекарств. Путем анализа и проверки существенных различий в метаболических профилях и изменениях метаболита биомаркеров, метаболомика позволяет нам лучше понять вещества метаболических путей, которые могут прояснить механизм традиционной китайской медицины (ТКМ). хохлатки yanhusuo
алкалоид (CA) является одним из основных компонентов Qizhiweitong (QZWT) рецепт, который используется для лечения язвенной болезни желудка в течение многих столетий и его механизм остается неясным полностью. Метаболиты профилирование проводили с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с временем пролета масс-спектрометрии (ВЭЖХ /ESI-TOF-MS) и в сочетании с анализом многомерных данных и анализа путей. Статистики программного обеспечения Mass Profiller Prossional (MPP) и статистический метод, включая ANOVA и анализа главных компонент (PCA) были использованы для обнаружения новых потенциальных биомаркеров для уточнения механизма СА при лечении крыс кислоты вводят при язве желудка. Изменения в метаболической профилирования были возвращены к значениям базовой линии после обработки СА по балльной оценке участков PCA. Десять различных потенциальных биомаркеров и семь ключевых метаболических путей, способствующими лечения язвенной болезни желудка были обнаружены и идентифицированы. Среди путей, sphingophospholipid метаболизм и метаболизм жирных кислот, связанные с сетью остро возмущенной. Количественные в режиме реального времени полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР), анализ проводили для оценки экспрессии генов, связанных с двумя путями для выполнения перечисленных выше результатов. Результаты показывают, что измененные биомаркеров и пути могут предоставить доказательства проникновения в механизмы действия препарата и позволяют повысить производительность исследований к открытию метаболомика наркотиков
<р> Цитирование:. Тяньцзяо L, Шуай W, Xiansheng M, Yongrui B, Шаньшань G, Бо L, и др. (2014) Метаболомика в сочетании с данными и многовариантного анализа Pathway на потенциальных биомаркеров при язвенной болезни желудка и вмешательство Эффекты Corydalis yanhusuo
алкалоида. PLoS ONE 9 (1): e82499. DOI: 10.1371 /journal.pone.0082499
<р> Редактор: Ракеш К. Шривастава, Университет Канзаса медицинский центр, Соединенные Штаты Америки
<р> Поступило: 15 мая 2013 года; Принято: 24 октября, 2013 года; Опубликовано: 15 января 2014
<р> Copyright: © 2014 Тяньцзяо и др. Это статья с открытым доступом распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution, которая позволяет неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальный автор и источник кредитуются

Финансирование:. Эта работа была поддержана грантами от ключа программы природного научного фонда государства (№ 81241111). Aglient и спонсорам не играет никакой роли в дизайн исследования, сбора и анализа данных, решение о публикации или подготовки рукописи
<р> Конкурирующие интересы:. Авторы заявляют, что их рукописи не имеет отношения с Agilent Technologies Co, Ltd., относящиеся к занятости, консультации, патенты, продукты в развитии или продаваемые продукты и т.д. Это является частью проекта master~s и стоит отдельно от любого внутреннего проекта. Одним из соответствующих авторов, Xiaorong Ран, нанимается Agilent Technologies Co, Ltd., который помог в дизайн исследования, эксперименты и /или анализов. Лей Ван также используется на Agilent Technologies Co, Ltd., который курировал исследования и помогли в изменении грамматических ошибок в рукописи. Авторы подтвердили, что занятия Agilent Technologoies не изменяет свою приверженность какой-либо из политики PLoS ONE данных и материалов общего доступа.

Введение
<р> Язва желудка является широко распространенным заболеванием, которое поражает многих людей во всем по всему миру из-за его более высокой и более высокой заболеваемости. Согласно статистическим данным 2005 года, заболеваемость язвенной болезни желудка было до 80%, особенно западного мира. Он имеет 40-80% от рецидивной частоты во всем мире. Язва желудка у людей часто возникают из-за различных эндогенных и экзогенных факторов, таких как стресс, курение, недостаток питания, соляная кислота, пепсин, хеликобактерной
, нестероидные противовоспалительные наркотиков (НПВС), алкоголь и инфекция [1]. В то время как эти факторы были как полагают, вовлечены в патогенез язвы желудка, механизм образования язв пока точно не понял [2], [3]. TCM приобрел более широкое признание во всем мире в последние годы, и, как правило, рассматривается как естественное и безобидное [4], [5]. Методы лечения в совокупности называемые TCM обычно используются для лечения язвы желудка, которая включает в китайской травяной медицины и т.д. рецепт
<р> QZWT рецепт состоит из хохлатки yanhusuo
, Radix Glycyrrhizae
и Radix Bupleuri
ЭСТ. широко используется для лечения язвенной болезни желудка в течение многих столетий в Китае, благодаря своему значительному терапевтическому производительности в клиническом применении [8] - [10]. Мы очистили CA из растений "Corydalis yanhusuo W.T. Wang" с чистотой 92%. Химические компоненты хохлатки yanhusuo
были исследованы в нашем предыдущем исследовании. Tetrahydropalmatine, corydaline, протопин и др были виды биологической активности хохлатки yanhusuo
. Были рассмотрены структуры составляющих. СА признан основным активным компонентом в хохлатки yanhusuo
[6], и показал, чтобы иметь эффект противоязвенной используется в китайской клинической практике в течение многих лет [7]. Кроме того, было сообщено, что CA обладает противовоспалительным действием [8], [9]. Однако детальный молекулярный механизм СА при лечении язвенной болезни желудка не очень хорошо понял.
<Р> Для объяснения механизма действия лекарственных средств, методология метаболомика широко используется [10]. Метаболомика является важным компонентом системной биологии, особенно при определении глобального метаболического профиля путем обнаружения тысячи мелких и крупных молекул в различных средах, начиная от клеточных культур для биологических жидкостей человека, таких как моча, слюна, и крови [11], [12] , [13]. Она имеет большое влияние на исследования обнаружения биомаркеров, а также выявление возмущенных путей из-за болезни или лекарственной терапии [14]. На основе анализа и проверки конкретных ранних биомаркеров заболевания, метаболомика позволяет нам лучше понять вещества метаболических путей, которые могут прояснить механизм действия [15].
<Р> Последние достижения контрольно-измерительных приборов и вычисления позволили одновременный анализ большое количество метаболитов. ВЭЖХ в сочетании с МС было доказано, чтобы быть эффективным сочетание для метаболитов идентификаций и количественными из-за его отличным разрешением и чувствительностью. Целью настоящего исследования было получить системный взгляд рассекать механизм СА в качестве эффективного лечения язвенной болезни желудка. Специфические и уникальные биохимические пути эффективности лекарственного препарата могут быть идентифицированы, когда в сочетании с многомерными методами анализа данных. Целью данного исследования является выявление нескольких метаболитов, которые могли бы облегчить понимание механизма действия СА и помочь их включения в будущие улучшения ТКМ терапии.

Материалы и методы

2.1 Этическое Заявление
<р> Все эксперименты проводились в соответствии с утвержденными протоколами животных и руководящими принципами, установленными Комитетом по рассмотрению медицины по этике для экспериментов на животных Ляонин университет традиционной китайской медицины.

2.2 Обработка и животных Подготовка образцов <бр> <р> Семь-недельных самцов крыс SD весом 200-250 г, были предоставлены экспериментальным животным центром Далянь медицинского университета. Уход и обращение с крысами производили в соответствии со стандартом специфических патогенов. Язва желудка вызывали у крыс в соответствии со способом в предыдущем докладе, с небольшими изменениями [16], [17]. Через три дня после того, как производство язвенной болезни желудка крыс были рандомизированы на пять групп: контроль, модель, CA высокая доза группы (32,4 мг /мл), CA средняя доза группы (10,8 мг /мл) и CA низкой группе дозы (3,6 мг /мл). Все крысы, в группах вводили перорально активной группы раствора 1,5 мл один раз в день (модельные и контрольные группы с физиологическим раствором) в течение 7 дней. Крысы были запрещены любую пищу в течение 12 часов до экспериментов, но разрешили доступ к воде свободно.
<Р> В последний день, крысы были глубоко под наркозом, а затем умерщвляли. Кровь собирали, плазмы и сыворотки крови разделяли с помощью центрифугирования при 3000 оборотах в минуту в течение 15 мин при температуре 4 ° С. Образцы плазмы собирали и хранили при -80 ° C Температура вспышки не замораживают в жидком азоте до анализа Метаболомика были выполнены. Затем желудки были разрезаны вдоль большой кривизны, промывают солевым раствором. Область язвы измеряли с помощью компаса для измерения индекса язвы. Площадь язвы равна ширине раз язвенные длины кишки. Для гистологического исследования, образцы желудочные ткани фиксировали в нейтральном забуференном формалине в течение 24 часов. Желудочные секции были обезвожены с градуированной этанолом, пропускали через ксилол и заливали в парафин. Парафиновые срезы (толщиной 5 мм), окрашивали гематоксилином /эозином (HE). Другие желудка язвенного ткани были быстро удалены и замораживали в жидком азоте до экстракции тотальной РНК ткани.

2,3 Метаболический Профилирование

2.3.1 хроматографии.
<Р> После хроматографии проводили с использованием высокоэффективной жидкостной хроматографии серии системы Agilent 1100, оборудованный четвертичным насосом, онлайн дегазатора, автосамплером и термостатированной отделение колонны. Объем инъекции был установлен на уровне 4 мкл. Все образцы выдерживали при 4 ° С в течение анализа. Разделение проводили на 4,6 * 100 мм, ZORBAX SB-C18 колонки (Agilent, США). Температуру колонки была установлена ​​на уровне 45 ° С. Подвижные фазы состояли из 0,1% муравьиной кислоты в воде (растворитель B) и 0,1% муравьиной кислоты в ацетонитриле (растворитель А), скорость потока была установлена ​​в 1 мл /мин с раздельным отношением 1:3, градиент был использован в качестве следующим образом: линейный градиент от 70- 33% B в течение 5,0 мин начально, 33 -98% в течение 5.0-12.0 мин. Очищенную был введен в масс-спектрометр непосредственно. После того, как через каждые 10 образцов инъекций, объединенный образец в качестве образца QC следует пустая впрыскивают для того, чтобы обеспечить стабильность и воспроизводимость систем LC-MS.

2.3.2 Масс-спектрометрия.
<р> Для масс-спектрометрии, использовали Agilent 6220 TOF-MS с источником ионизации электрораспылением (ESI) в отрицательном режиме. Расход окрасочного газа (N2), была установлена ​​на уровне 9 л /мин. Распылитель была установлена ​​на уровне 45 фунтов на квадратный дюйм. Другие оптимальные условия были следующими: умирая температуры газа 350 ° С, напряжение фрагмент 120 В. Данные были собраны в режиме полного сканирования от т /г от 50 до 1050 а.е.м. в течение 0-12 мин. Данные МС были собраны в центроида режиме.

2.3.3 Многомерный анализ данных.
<Р> Процедура анализа данных показана на рис. 1. Алгоритм Молекулярная характеристика экстрактор (МКЭ) в программном обеспечении Качественный анализ масс-Hunter был использован для извлечения молекулярные особенности-неопознанные, нецелевые соединения - в каждой из данных. Алгоритм МКЭ ищет массовых сигналов (ионов), которые ковариантны во времени, рассматриваются возможные химические отношения (изотопы, аддукты, димеры, несколько состояний заряда), и генерирует извлеченный масс-спектр соединения хроматограммы и соединения для каждой молекулярной функции. Извлеченный список соединение для каждого файла было экспортировано в виде файла соединения Exchange Format (CEF). Для дальнейшего массового Profiler Professional (версия B.2.00, Agilent) статистического анализа. Полученные файлы функция для каждого образца были обработаны с помощью ANOVA и PCA анализа с использованием программного обеспечения MPP, который выровненный, нормализуется, визуализировали и фильтруют молекулярные особенности (MFS), для дальнейшей обработки [18], [19], [20], [ ,,,0],21]. Впоследствии, иерархическая кластеризация (состояние дерева) был применен к файлам данных. Иерархическая кластерный анализ представляет собой статистический метод для образцов группы без присмотра в разных кластерах или ветвей иерархического дерева. Таким образом, отношения между различными группами показаны. Условие дерево отображается в виде карты тепла. Идентичность биомаркеров со значительными изменениями в группах определяется особенностями ID Browser МРР.

2.3.4 биомаркеры Идентификация.
<Р> Идентификация потенциальных биомаркеров была определена с помощью Q-TOF (Xevo G2). Энергия столкновения МС 35ev, и данные были получены в режиме отрицательных ионов, (MassLn1 В4.) Программное обеспечение х использовалась для анализа данных. Идентичность специфических метаболитов были подтверждены элементы информационного сравнения их масс-спектров с использованием информации элементного состава, предусмотренной программным обеспечением.

2.3.5 Сеть и Pathway анализ.
<Р> MPP программного обеспечения была использована чтобы все значимые (изменение папки > 2) до регулируемых и вниз регулируемых метаболитов и связанных с ними биологических путей. Потенциальные маркеры, выявленные были сопоставлены с точным соотношением масс заряда в некоторых базах данных, в том числе HMDB, KEGG, Метлин, липидный MAPS и PubChem, чтобы обнаружить связанные пути. T-тест и сгиб-альтер были использованы для определения статистической значимости в пути. Значение P &л; 0,05 и изменение папки > 2 считается критерии статистически значимыми и будет выбран

2.6 Молекулярные данные
<р> Суммарную РНК экстрагировали из тканей желудка в том числе управления, модели и СА. группы с использованием реагента TRIzol (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) в соответствии с инструкциями изготовителя. кДНК синтезировали из тотальной РНК (1 мкг) с использованием TransScript для синтеза первой цепи кДНК Синтез СУПЕРМИКС набор (Пекин трансгенной Biotech, Китай). Количественная ПЦР в реальном времени (CFX96, Bio-Rad, США) проводили с использованием TransStart ™ Top Green КПЦР СУПЕРМИКС комплект (Beijing трансгенной Biotech, Китай). Праймеры для амплификации S1Pr1, S1Pr3, SphK1, Got2 и Fabp1 были от Invitrogen (S1Pr1: GenBank соотв нет NM_017301, S1Pr3:.. GenBank Acc нет XM_225216, SphK1:.. GenBank Acc нет NM_133386, Got2:... GenBank Acc Нет . NM_013177.2, Fabp1:.. GenBank, Acc нет NM_012556.2) и экспрессия этих транскриптов количественно против гена домашнего хозяйства бета-актина, который амплифицируют с использованием праймеров 5'-TGGCACCACACTTTCTACAATGA-3 'и 5'-AGGGACAACACAGCCTGGAT- 3 '. Уровни экспрессии генов-мишеней были проанализированы с помощью менеджера системы CFX (Bio-Rad, США).

2.7 Статистический анализ
<р> Данные выражены в виде среднего значения ± SEM. SPSS 19.0 для Windows, была использована для статистического анализа. Данные были проанализированы с помощью ANOVA, с р &ЛТ; 0,05 задается как уровень статистической значимости

Результат

3.1 Влияние СА на уксусной кислоте впрыскивается-индуцированной язвы желудка модель
. <р> экспериментальная модель уксусной кислоты впрыскивают-индуцированного повреждения слизистой желудка у крыс часто используется для скрининга соединений для противоязвенной активности в том, что она служит в качестве ведущей причиной язвенной болезни желудка у человека [22]. Уксусная кислота впрыскивается индуцированный интенсивный желудка повреждение слизистой оболочки при образовании язвы в модельной группе (фиг. 2А) у крыс, что имеет значительно разница по сравнению с контрольной группой (фиг. 2B). Патологический наблюдение было использовано для confirme повреждения уксусной кислоты индуцированных в поверхностных слоях слизистой оболочки желудка ulteriorly. Уксусная кислота-индуцированной язвы желудка (рис. 2С) оказывает эффект эрозии слизистой оболочки, которое сопровождалось мышечной трещиной и инфильтрация воспалительных клеток в слоях по сравнению с контролем (фиг. 2D). Результаты показали, что модель язвы желудка была успешно воспроизведена. Результаты времени курса показали на рис. 2E иллюстрируют, что площадь язвы у крыс, получавших СА оставались значительно меньше по сравнению с соответствующими значениями в модельных крыс на седьмой день, поэтому мы образцы выбрал седьмой день для анализа. Для того, чтобы оценить влияние СА, как показано на рис. 2F, площадь язвенной болезни желудка в дозовых групп СА было значительно снижено по сравнению с модельной группой (р &л; 0,01). Наши экспериментальные результаты свидетельствуют о том, что СА может эффективно вылечить язву желудка, в частности среднюю дозу группу. Кажется, что существует значительное перекрытие между нейронными патогенетических путей, участвующих в язвенного генеза и депрессии. Поэтому не удивительно, что лекарства для лечения депрессивных эпизодов также может оказывать сильное защитное действие против язвы желудка [23]. Причина, почему CA средняя группа дозы имеют лучший терапевтический эффект, чем высокой группе дозы могут быть CA высокие дозы группа играет роль ингибировать нерв. Эффект СА был рассмотрен для дальнейшего изучения механизма.

3.2 метаболомики исследование

3.2.1 Получение и обработка данных метаболического профиля.

Представительные всего хроматограмм ионов ( TIC) образцов плазмы, полученных из-под контроля, модели и CA дозовых групп в отрицательных режимах приведены на рис. 3 с использованием оптимальных условий ЖХ-МС, описанных выше. Низкомассовых метаболиты молекулярных могут быть разделены и в короткий промежуток времени 15 мин. Для того чтобы лучше визуализировать тонкие сходства и различия между этими сложными наборами данных, несколько методов распознавания образов были использованы для фенотип плазмы Метаболом крыс. Здесь, иерархический кластерный анализ и РСА были использованы для классификации метаболические фенотипы и идентифицировать differenting метаболитов. Иерархическая кластеризация анализ данных метаболомики показал явное разделение между контролем, модельной группой и группой дозы СА (рис. 4). В баллами PCA, каждая точка представляет отдельный образец. Результаты PCA отображаются в виде нотных участков с указанием разброс образцов, которые указывают на аналогичные Метаболомика композиции, когда группируются вместе и композиционно различных metabolomes при распылении. PCA оценки участок может разделить различные образцы плазмы в различных блоках, соответственно, предполагая, что метаболические профили изменились. Что касается информационного аналитика PCA в нашем эксперименте показал на рис. 5, контрольные и модельные группы были значительно разделены на два класса, с указанием, что модель уксусной кислоты-индуцированной язвенной болезни желудка была успешно воспроизведена. Более тонкие изменения могут быть найдены с помощью распознавания образов подход-бальной участков PCA. Результаты PCA отображения, что модель группа была далеко от остальных четырех групп, что свидетельствует о том, что измененный метаболический узор в результате уксусной кислоты индуцированных может существенно отличаться от других. Положение группы лечения была близка к контрольной группе, предполагая, что измененный метаболический картина была вызвана CA. Результаты очевидно, что СА может изменить ненормальное метаболический статус и может иметь другой механизм обработки уксусной кислоты индуцированных язва желудка.

3.2.2 Определение потенциальных биомаркеров.
<Р> низкомолекулярный метаболиты существенных различий (T-тест, р &л; 0,05) были найдены с помощью программного обеспечения MPP. Потенциальные маркеры были идентифицированы с помощью "ID" браузер для поиска в базе данных Метлин (http://metlin.scripps.edu/) и по сравнению с точным отношением масс заряда в некоторых базах данных, в том числе HMDB (HTTP: //WWW. hmdb.org/), KEGG (http://www.genome.jp/kegg/), липидный MAPS (http://dev.lipidmaps.org:25424/) и PubChem (HTTP: //pubchem.ncbi. nlm.nih.gov/). Мы можем знать, вероятное название потенциальных биомаркеров через первый шаг. В настоящем исследовании, 10 потенциальных биомаркеров были идентифицированы (Таблица 1). Точная молекулярная масса соединений со значительными изменениями в группах определялась в пределах погрешности измерений (&ЛТ; 5 частей на миллион) с помощью Waters Xevo G2 QTOF, а между тем, потенциал элементный состав, были получены степень ненасыщенности и фракционной изотопного обилие соединений. Предполагаемая молекулярная формула обыскали в ChemSpider (http://www.chemspider.com/~~HEAD=pobj), HMDB и других баз данных в целях выявления возможных химических конституций, а также данные MS /MS были обследованы для определения потенциальных структур ионов. Сфингозин-1-фосфат (S1P) и стеариновой кислоты были взяты в качестве примеров для иллюстрации фрагментов структуры и процесса оценки. Информация первичной и вторичной масс-спектрометрии анализировали с помощью MassLynx (видения 4.1, воды) программного обеспечения, по сравнению с базой данных, а также ионные фрагменты 379.2488 (С <подразделам> 18H <суб> 38NO <суб> 5P) были показаны на рис. 6 A. Основные ионы фрагмент анализировали с помощью MS /MS скрининга были м /г 224,080, 165,1254 и 82,0238, которые могли бы соответствовать утраченной C <подразделам> 7H <суб> 15NO <суб> 5P, C <суб> 11H <суб> 17О, C <суб> 4H <югу> 4NO соответственно. И, наконец, было предположение, как S1P после ссылаюсь и в зависимости от их размера полярности. В то же время, ионные фрагменты стеариновой кислоты 284.2715 (С <суб> 18H <суб> 36о <суб> 2) (рис. 6 В) были 212,2419 (C <суб> 15H <суб> 32), 143,1359 (C <суб> 9Н <суб> 19O), 117,0962 (C <суб> 6Н <суб> 13o <суб> 2) и 83,0962 (C <суб> 6Н <суб> 11).
<р> биомаркеры, описанные выше, были доказаны есть близко отношения с образованием и лечения язвенной болезни желудка. Значительно выше регулируемой D-глюкозы, лизина, мочевая кислота, пировиноградная кислота, кортикостерона, сфингозинфосфат-1-фосфата и вниз регулируется триптофана, гликохолат, hexadecanedioic кислота, стеариновая кислота наблюдались в модельной группе по сравнению с контрольной группой (рис. 7 ). Это различие метаболитов может обозначать свой потенциал в качестве целевых биомаркеров для дифференциации язвенной болезни желудка и нормальных состояний. Мониторинг изменений этих метаболитов может предсказать развитие язвы желудка. Биомаркеры 1, 2, 3, 4, 7, 8 уменьшались после лечения СА, наоборот, вызывали увеличены другие биомаркеры. Кроме того, для того, чтобы охарактеризовать противоязвенной эффекты CA более четко, изменения в относительной концентрации целевых метаболитов, выявленных в разных группах были проанализированы, мы обнаружили, что содержание этих ключевых маркеров ближе к нормальной группе. Результаты показывают, механизм для лечения язвы желудка может быть достигнуто за счет регулирования этих маркеров значительно и их взаимодействие, как рис. 8. Например, стеариновая кислота, которая называется 17FA, имеет отношения с thapsic кислотой, хотя белка Fabp1 (жирная кислота-связывающий белок 1). Сеть не только указывает на взаимодействие между биомаркеров, но также дает информацию о потенциальном белков, генов, ферментов и биологических процессов. Это способствует открытию мишени во время возникновения и лечения язвенной болезни желудка и является проводящим к разработке нового препарата для лечения язвы желудка.

3.3 Определение уровней мРНК для подтверждения биомаркеров
<р> Для того, чтобы подтвердить наши метаболомика выводы, нам нужны некоторые молекулярные данные, таким образом, мы определили 5 мРНК, которые связаны с 4-х потенциальных биомаркеров и 2 метаболических путей с RT-PCR. Сфинголипидов метаболизма, в том числе S1Pr1, S1Pr3 и SphK1 были рассмотрены как показано на рис. 8. Результаты представлены на рис. 9. Уровень мРНК S1Pr1, SIPr3 и SphK1 были значительно повышающей регуляции в модельной группе, уровни экспрессии были 5,21, 2,54, 6,57 раза по сравнению с контрольной группой, что согласуется с нашими предыдущими данными и данными. После обработки CA, уровни экспрессии S1Pr1, S1Pr3 и SphK1 вернулись к исходному уровню. С1Ф образован двумя киназ, сфингозинкиназа 1 и 2 (SphK1 и SphK2), но никаких различий не наблюдалось в выражении SphK2 среди всех групп (данные не показаны), результат согласуется с нашими сетевыми выводами. Здесь мы можем объяснить потенциальный механизм СА при лечении язвенной болезни желудка путем блокирования S1P увеличивается. Мы также обнаружили уменьшение экспрессии Fabp1 и Got2 в модельной группе (рис. 9), по сравнению с контрольной группой. Но работает СА группы были близки к контрольной группе, что подтвердило, что терапевтический эффект СА был связан с метаболизмом жирных кислот из молекулярном уровне.

3.4 Тропинка Анализ
<р> Более детальный анализ путей и сетей под влиянием язвенной болезни желудка проводили MPP. Проанализированы пути, полученные показывает в таблице 2. Мы используем высококачественные KEGG метаболических путей в качестве основы бэкенд знаний для определения наиболее соответствующих путей, таких как сфинголипидов метаболизма, цикл tricarboxylicacidcycle кислоты, биотин обмена веществ и так далее, в которых 7 уникальных путей ( приведены в таблице 1) для модели группы была определена. Потенциальные биомаркеры, связанные с метаболизмом фолиевой кислоты, метаболизм жирных кислот, и сфинголипидов путей метаболизма также соответствовали. Из 6 различных метаболитов, определенных из этих путей, многие из них в различных этапах развития язвы желудка. Некоторые значительно измененные метаболиты, такие как гликохолат, hexadecanedioic кислота и стеариновая кислота были найдены и использованы для объяснения механизма жирных кислот. Эти результаты свидетельствуют о том, что эти целевые пути показать отмеченные возмущения по поводу формирования язвенной болезни желудка и может способствовать развитию язвенной болезни желудка.

Обсуждение
<р> Язвы желудка у людей часто повторяются, и трудности при лечении им обозначается поговорке "После того, как язва, всегда язва» [24]. Многие факторы могут увеличить частоту язвенной болезни желудка, но механизм не был четко понимать. Таким образом, эффективность лекарственной терапии зависит не только от снижения повреждающих факторов, но и на измененных метаболитов, которые регулируют метаболизм пути. В частности, открытие биомаркеров, которые предсказывают риск язвенной болезни желудка даст возможность диагностировать и разрешать фармакологическое лечение своевременно. QZWT был использован для лечения язвенной болезни желудка в течение многих лет в Азии, хотя его механизм остается неясным. Метаболомика в сочетании с инструментами многомерных данных, которые одновременно количественному тысячи метаболитов в живом организме был использован для анализа биомаркеров при язвенной болезни желудка [25]. Кроме того, понимание биомаркеров вызвало новый интерес в области программ обнаружения наркотиков и мониторинга заболеваний, обеспечивая ценное в прицелов о сложных механизмах болезни [26]. Таким образом, это исследование было разработано для дальнейшего выяснения основного механизма СА на желудочную регуляции язвы от метаболических путей в глобальной точки зрения.
<р> Модель язвы желудка у крыс была успешно воспроизведена. Образцы плазмы анализировали с помощью ВЭЖХ /ESI-TOF-MS и многомерного статистического анализа. Результаты показали, что площадь язвы и динамических метаболических профилей после обработки СА были закрыты для контрольной группы, продемонстрировав, что СА была терапевтическую эффективность. Согласно анализу Метаболомика, 10 потенциальных биомаркеров и 7 связанных с ними метаболических путей были выявлены в нашем исследовании. Значительно вниз регулируется D-глюкоза, лизин, мочевая кислота, пировиноградная кислота, кортикостерона, сфингазина-1-фосфата и до регулируется триптофан, гликохолат, hexadecanedioic кислота, стеариновая кислота наблюдались в группе СА по сравнению с модельной группой. Кроме того, метаболизм фолиевой кислоты, метаболизм жирных кислот, и сфинголипидов метаболизма и многие другие метаболизма были подтверждены, чтобы оказывать влияние на язву желудка. У нас есть определить экспрессию мРНК, связанных с сфинголипидов метаболизм и метаболизм жирных кислот, чтобы проверить механизм. Многие другие потенциальные белки, гены, ферменты и биопроцессов закрыты для других путей необходимы будущие эксперименты для проверки.
<Р> На основе анализа и проверки конкретных ранних биомаркеров заболевания, метаболомика позволяет нам лучше понять патологические процессы и пути метаболизма вещества , Мы считаем, что биомаркеров и пути анализа имеют большой потенциал для изучения и уточнения терапевтическое действие TCM. В настоящем исследовании мы охарактеризовали биомаркеров взаимодействие Сетей, которые охватывают белки, гены, ферменты и биопроцесс, как показано на рис. 8. S1P акт внеклеточно в качестве лиганда для его специфическими рецепторами-S1PRs, в настоящее время признается в качестве регулятора многих физиологических и патофизиологических процессов, в том числе воспалительных заболеваний, таких как ревматоидный артрит, воспалительное заболевание кишечника и сепсис [27], [28]. Воспаление, что происходит в слизистой оболочке желудочно-кишечного тракта, таким образом, вызывает желудочно-кишечные язвы [29]. Наши результаты показывают, что СА может уменьшить экспрессию S1P и его рецепторов, в том числе и S1Pr1 S1Pr3, чтобы уменьшить проблемы, воспаление, чтобы облегчить образование язв желудка [30]. С1Ф образована SphK1 и SphK2 [31]. SphK1 может активен NF-kB путь, который инициируется основной молекулы воспалительное сигнализации TNF-alpha. Вкратце, NF-kB и ФНО-α тесно связано с образованием и залечить язву желудка [32], [33]. Мы также обнаружили, что дефицит SphK1 (не SphK2) значительно ингибирует язва желудка, указывая, что SphK1 может играть ключевую роль при язвенной болезни желудка. Таким образом, сфинголипидов метаболизм может быть жизнеспособной мишенью для лечения язвы желудка.
<Р> стеариновая кислота, гликохолат и hexadecanedioic кислота изменила вызывают метаболизм жирных кислот, закрывание расстройство заболеваемости и реабилитации язвенной болезни желудка [34], [35] , Жирные кислоты, в том числе стеариновой кислоты и т.д., обычно рассматривается в качестве источника энергии, привлекли интерес для научных исследований и общественного здравоохранения, из-за их воздействия на здоровье человека и болезней. Жирные кислоты полезны для здоровья, способствующих. Стеариновая кислота, гликохолат и hexadecanedioic регулируются Fabp1, фермента жирных кислот связывающего белка 1. В анализе ОТ-ПЦР, низкая экспрессия Fabp1 в модельной группе предполагает, что Fabp1 активность ингибирования может уменьшить стеариновую кислоту, гликохолат и hexadecanedioic кислоты и привести к жирной кислоты метаболизма расстройства. Поэтому увеличили воспалительную реакцию и митохондриальную дисфункцию и способствуют образованию язв. Тем не менее, CA может сбалансировать этот беспорядок путем повышения экспрессии Fabp1 [36]. Глутамат-щавелевоуксусной трансаминазы 2 (Got2) является важным ферментом в цикле tricarboxylicacidcycle кислоты (ЦТК). Сильно ингибирование TCA, вызванное снизилась на Got2 будет способствовать формированию язвы желудка. Метаболиты аминокислот, таких как триптофан и его метаболитов в естественных условиях имеют обширную роль в метаболизме триптофана. Наиболее важным является то, что триптофан нарушения обмена веществ может вызвать расстройство TCA. TCA играют определенную роль в лечении язвы желудка [37]. Понижающая регуляция экспрессии мРНК Got2 в модельной группе и повышающей регуляции в группах СА были продемонстрированы ранее в нашем результате. Все эти данные ясно показывают, что молекулярный механизм СА лечения язвенной болезни желудка была тесно связана с его баланса эффектов на ТСА. Эти результаты вовлекают эффекты CA могут быть опосредованы через белка, ферментов и метаболизма пути.

Язва желудка

Other Languages