PLOS ONE: en polymorfism (rs2295080) i mTOR Promoter Region och dess anslutning med Gastric Cancer i en kinesiska befolkningen

Abstrakt

Bakgrund

Som en nödvändighet del av PI3K /Akt /mTOR-vägen, mammalian target of rapamycin (mTOR) har visat sig öka i gastric cancerceller och tumörer. Vår forskning undersökt sambandet mellan single nucleotide polymorphism (SNP) rs2295080 i mTOR
promotorregionen och risken för magcancer (GC).

Metoder

sjuhundrafemtio -Tre (753) magsäckscancerpatienter och 854 matchade friska försökspersoner rekryterades i cancer associationsstudie och 60 vävnader användes för att testa uttrycket av mTOR
. Ovillkorlig logistisk regression valdes för att utvärdera sambandet mellan rs2295080 T > G polymorfism och GC risk. Vi undersökte sedan funktionaliteten hos denna promotor genetisk variant av luciferas analys och EMSA.

Resultat

Individer med G-allelen hade en 23% minskad risk för GC, jämför med de som bär T-allelen (justerat OR = 0,77, 95% CI = 0,65-0,92). Denna skyddande effekt av G-allelen stod bättre i manliga gruppen. Samtidigt GC patienter som bär TG /GG genotypen visas också en minskad mRNA-nivå av mTOR
( P
= 0,004). I luciferasanalys, T-allelen tenderade att öka den transkriptionella aktiviteten av mTOR
med en ungefärlig 0,5-faldigt över G-allelen. Dessutom EMSA test förklarade att olika alleler av rs2295080 visas olika tillhörighet till viss transkriptionsfaktor.

Slutsats

mTOR
promotor polymorfism rs2295080 var signifikant associerad med GC risk. Denna SNP, som effektivt påverkade uttrycket av mTOR
kan vara en ny biomarkör för tidig diagnos av magcancer och en lämplig indikator på att utnyttja mTOR-hämmare för behandling av GC

Citation. Xu M, Tao G, Kang M, Gao Y, Zhu H, Gong W, et al. (2013) en polymorfism (rs2295080) i mTOR
Promoter regionen och dess Association med magcancer i en kinesiska befolkningen. PLoS ONE 8 (3): e60080. doi: 10.1371 /journal.pone.0060080

Redaktör: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto FIRC di Oncologia Molecolare, Italien

Mottagna: 26 november 2012, Accepteras: 21 februari 2013, Publicerad: 29 mars 2013

Copyright: © 2013 Xu et al. Detta är en öppen tillgång artikel distribueras enligt villkoren i Creative Commons Attribution License, som tillåter obegränsad användning, distribution och reproduktion i alla medier, förutsatt den ursprungliga författaren och källan kredit

Finansiering:. Denna studie delvis med stöd av National Natural Science Foundation i Kina (81230068, 30972444, 81001274 och 81102089), Key Program of Natural Science Foundation i Jiangsu-provinsen (BK2010080), Natural Science Foundation i Jiangsu-provinsen (BK2011773 och BK2012842), Key Program för grundforskning i Jiangsu Provincial Department of Education (11KJB330002 och 12KJA330002), Qing-Lan Project i Jiangsu Provincial Institutionen för pedagogik och Priority Academic Program utveckling av Jiangsu högskolorna (folkhälsa och förebyggande medicin). Vi vill också tacka Luo Y (Nanjing Röda Korset Blood Center) för hennes hjälp med funktionella experiment. Finansiärerna hade ingen roll i studiedesign, datainsamling och analys, beslut att publicera, eller beredning av manuskriptet

Konkurrerande intressen. Författarna har förklarat inga intressekonflikter

Inledning <. br>

Gastric cancer (GC) är den vanligast förekommande cancer hela världen bland män med 640.556 och kvinnor med 349,042 nya fall och 738,069 relaterade dödsfall i 2008 [1]. Med tanke på den terapeutiska effektiviteten, kan kirurgisk resektion vara primär botande behandling för tidigare skede av GC patienter [2]. Tyvärr är de flesta patienter med ventrikelcancer upptäcks i framskridet stadium, under vilken period tumören är inoperabel längre. Dessutom återfall efter operation är en annan fruktansvärda händelse för en dålig 5-års överlevnad. Med tanke på patienter med avancerad eller återkommande magsäckscancer, är det ingen tvekan om att upptäckten av biomarkörer och deras tillämpning tillsammans med traditionell diagnos kan vara en värdefull indikation och en omfattande hjälp att formulera strategin förebyggande och behandling.

mammalian target av rapamycin (mTOR) består av 2,549 aminosyror arrangerade i starkt konserverade domänen [3]. Strukturellt mTOR innehåller en rapamycin-bindande domän i sin centrala del och en kinasdomän i C-terminalen [4]. Som en viktig del av PI3K /Akt /mTOR-vägen, är mTOR nära relevant kapital cellulära processer såsom celltillväxt, proliferation, metabolism, migration, angiogenes och apoptos [5] - [7]. Hittills mTOR
produkter berörs som två skilda komplex (dvs mTORC1 och mTORC2) med olika känslighet [8], [9]. mTORC1 är en rapamycin-känsliga komplex som inkluderar mTOR plus FK506-bindande protein 12 kDa (FKBP12), däggdjurs LST8 (mLST8), och det föreskrivande associerade proteinet av mTOR (rovfågel). Däremot mTORC2 består med Sin1, mLST8, och rapamycin okänsliga följeslagare mTOR (Rictor) [10] - [12]. Dysreglering av mTOR
visas ofta i olika typer av cancer under carcinogenes och försämring. Men orsakerna till detta avvikande fenomen fortfarande glutted med debatter.

Ett antal studier har undersökt rollen av single nucleotide polymorphisms (SNP) i mTOR
genen i etiologin av cancer i olika organ, inklusive matstrupscancer [13], lungcancer [14], blåscancer [15], tjocktarmscancer, ändtarmscancer [16], och akut lymfatisk leukemi [17]. De flesta av dessa SNP lokalisera i exoner eller introner med okända funktionella effekter. På senare tid har ett ökande antal studier fokuserade på SNP sittplatser i genpromotorregionen, som visat sig påverka bindningsförmåga med vissa transkriptionsfaktorer (TFS) och slag följande gentranskription. I denna studie hypotesen vi att mTOR
rs2295080 T > G polymorfism inom promotorregionen kan påverka känsligheten för GC. För att testa denna hypotes, genotypas vi frekvensen av mTOR
rs2295080 att testa dess betydelse GC risk i vår pågående, sjukhusbaserad, fall-kontrollstudie i en kinesisk befolkning. Följaktligen upptäckte vi mTOR
mRNA-nivåer med olika genotyper i vävnader hos patienter med ventrikelcancer. Dessutom, kännetecknat vi funktionaliteten hos denna genetiska variant på mTOR
promotor transkription av luciferas analys och EMSA.

Material och metoder

försökspersoner

Denna studie omfattade 753 patienter med histologiskt bekräftad magcancer och 854 cancerfria kontroller. Alla patienter rekryterades från Cancer Clinical Research Base i Nanjing Medical University mellan mars 2006 och januari 2010. Och allt demografiska och klinisk information, inklusive ålder, kön, tumörstorlek, tumörstället, histologiska typer, djup invasion, lymfkörtel metastas, fjärrmetastaser, och TNM stadium erhölls genom att använda ett kort frågeformulär och kliniska journaler.

frekvensmatchade kontroller till dessa fall efter ålder (± 5 år) och kön samlades vid samma tid och regioner orelaterade genetisk relation med gastric sjukdom och matsmältningssystemet tumörer. Varje deltagare undertecknat ett skriftligt informerat samtycke och donerade 5 ml venöst blod för genomisk DNA-extraktion. Forskningen Protokollet godkändes av Institutional Review Board Nanjing Medical University.

DNA-extraktion och SNP genotypning

Genom-DNA extraherades från blodprover såsom beskrivits tidigare [18]. Genotypning genomfördes av TaqMan SNP genotypning analysen med ABI 7900HT realtids-PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) och Sequence Detection System version 2.4 (SDS 2,4). Sekvenserna för primers och prober fanns tillgängliga på begäran, och kontroller som finns för varje platta för att säkerställa riktigheten av genotypning. Genotypning Analysen utfördes genom två personer oberoende av varandra i en blind fashion. Mer än 10% av proverna slumpvis utvalda för bekräftelse, och resultaten var 100% överensstämmande. Primers och prober anges i tabell S1.

Cell Culture och konstruktion av Promoter Reporter plasmider

En normal magslemhinna epitelceller linje (GES-1) och tre olika gastric cancercellinjer (BGC -823, MGC-803, och SGC-7901) antogs i denna studie. Alla celler odlades i Dulbeccos modifierade Egale Medium /Hög glukoskulturmedium med 10% FBS, 10 mM HEPES, 2 mM L-glutamin, 1 mM pyruvat natrium, 100 U /ml penicillin och 100

• PLOS ONE: Föreningen mellan glutation S-transferas T1 Null genotyp och Gastric Cancer Risk: en metaanalys av 48 Studies
• PLOS ONE: Föreningen bland polymorfismer i EGFR Gene exoner livsstil och risk för magcancer med könsskillnader i kinesiska Han ämnen