Ploche ONE: polymorfizmus (rs2295080) v mTOR Promoter regióne a jeho asociácie s rakoviny žalúdka v čínskej Population

abstraktné

Pozadie

Ako naliehavý súčasť PI3K /Akt /mTOR , cicavcov cieľ rapamycínu (mTOR), bolo preukázané, že zvýšenie v nádorových bunkách a nádorov žalúdka. Náš výskum skúmal vzťah medzi jednotlivým polymorfizmom (SNP) rs2295080 vo mTOR
promotorovou oblasť a riziko vzniku rakoviny žalúdka (GC).

Metódy

sedemsto päťdesiat -tri (753) pacientov s adenokarcinómom žalúdka a 854 zdravých subjektov bolo prijaté v štúdii o pridružení rakovinu a 60 tkanivá boli použité pre testovanie expresie mTOR
. Nepodmienené logistická regresia bola vybraná pre vyhodnotenie pridružení medzi rs2295080 T > G polymorfizmus a riziko GC. Potom sme sa zaoberali funkčnosť tohto promótorom genetickou variantou luciferasovou skúškou a EMSA.

Výsledky

Jedinci s G alely bolo 23% zníženie rizika GC, v porovnaní s tými, nesúci T alely (upravený OR = 0,77, 95% CI = 0,65 až 0,92). Tento ochranný účinok G alely vystupovala lepšie v mužskej skupine. Medzitým GC pacienti nesúci TG /GG genotyp tiež vykazovali zníženú hladinu mRNA mTOR
( P
= 0,004). V luciferázovém teste T alela tendenciu k zvýšeniu transkripčný aktivitu mTOR
s približne 0,5-krát nad G alely. Okrem toho EMSA testy vysvetlil, že rôzne alely rs2295080 zobrazené rôzne afinity k nejakému transkripčný faktor.

Záver

mTOR
promotér polymorfizmus rs2295080 bola významne spojená s rizikom GC. Tento SNP, ktoré účinne ovplyvniť expresiu mTOR
, môže byť nový biomarker včasnej diagnózy karcinómu žalúdka a vhodným ukazovateľom využitie inhibítor mTOR pre liečbu GC

Citácia :. Xu M, Tao G, M Kang, Gao Y, Zhu H, Gong W, et al. (2013) polymorfizmus (rs2295080) v mTOR
Promoter kraja a Asociácie jej s rakoviny žalúdka v čínskej populácie. PLoS ONE 8 (3): e60080. doi: 10,1371 /journal.pone.0060080

Editor: Paolo Peterlongo, iFOM, Fondazione Istituto di FIRC Oncologia Molecolare, Taliansko

prijatá: 26.novembra 2012; Prijaté: 21.února 2013; Uverejnené: 29. marca 2013

Copyright: © 2013 Xu et al. Toto je článok o otvorený prístup distribuovaný pod podmienkami Creative Commons Attribution licencie, ktorá umožňuje neobmedzené použitie, distribúciu a reprodukciu v nejakom médiu, za predpokladu, že pôvodný autor a zdroj sú pripísané

Financovanie :. Táto štúdia bol čiastočne podporený národná prírodná Science Foundation Číny (81230068, 30972444, 81001274 a 81102089), pričom nosným programom Natural Science Foundation v provincii Jiangsu (BK2010080), Natural Science Foundation v provincii Ťiang-su (BK2011773 a BK2012842), program Key základného výskumu Jiangsu provinčného ministerstva školstva (11KJB330002 a 12KJA330002), Qing-Lan projektu Jiangsu provinčného ministerstva školstva a prioritné Academic Program rozvoja Jiangsu vysokých škôl (verejné zdravie a preventívnej medicíny). Radi by sme tiež poďakovali Luo Y (Nanjing Červeného kríža Blood Center) za jej pomoc s funkčnými experimentov. Platcovia mal žiadnu úlohu v dizajne štúdie, zber a analýzu dát, rozhodnutie publikovať, alebo prípravu rukopisu

konkurenčnými záujmami :. Autori nevykázal žiadny konflikt záujmov

Úvod <. br>

rakovina žalúdka (GC) je najčastejšie sa vyskytujúca rakovinou na svete u mužov s 640,556 a žien s 349,042 nových prípadov a 738,069 súvisiacich s drogami v roku 2008 [1]. S ohľadom na terapeutickú účinnosť, chirurgický postup môže byť primárna následná liečba u pacientov s skoršej fáze GC [2]. Bohužiaľ, väčšina pacientov s rakovinou žalúdka, sú zistené v pokročilej fáze, počas tejto doby sa nádor sú neresekovateľného viac. Navyše relaps po operácii je ďalší hrozná udalosť pre chudobné 5-ročné prežitie. Vzhľadom k tomu, pacientov s pokročilým alebo opakujúce sa rakoviny žalúdka, nie je pochýb o tom, že objav biomarkerov a ich aplikácia sprevádzaná tradičné diagnózu by mohla byť cenným indikácie a rozsiahlu pomoc formulovať stratégiu prevencie a liečby.

cicavčie cieľovej of rapamycín (mTOR) sa skladá z 2,549 aminokyselín usporiadaných vo vysoko konzervované domény [3]. Štrukturálne, mTOR obsahuje doménu viažuci rapamycínu vo svojej strednej časti a kinasovou doménu na C-konci [4]. Ako kľúčový prvok PI3K /Akt /mTOR, mTOR je úzko súvisiace s kapitálovým bunkových procesov, ako je rast buniek, proliferácie, metabolizmu, migrácia, angiogenézy a apoptózy [5] - [7]. Až doteraz sa mTOR
produkty sa týka ako dve úplne odlišnými komplexy (tj., MTORC1 a mTORC2) s rôznou citlivosťou [8], [9]. mTORC1 je rapamycín citlivé komplex, ktorý obsahuje mTOR navyše proteín viažuci FK506 12 kDa (FKBP12), cicavčie LST8 (mLST8), a regulačné spojených s proteín mTOR (dravca). Na rozdiel od toho mTORC2 sa skladá s Sin1, mLST8 a rapamycín-necitlivé spoločník mTOR (Rictor) [10] - [12]. Dysregulácia mTOR
často objavuje v rôznych druhov rakoviny v priebehu karcinogenézy a zhoršenie. Avšak, dôvody tohto javu odchylnú sú stále zahrňovaná debát.

Rad štúdií skúmala úlohu jednonukleotidových polymorfizmov (SNP) v mTOR
gén v etiológii nádorových ochorení v rôzne orgány, vrátane rakoviny pažeráka [13], rakovina pľúc [14], rakoviny močového mechúra [15], rakoviny hrubého čreva, rakoviny konečníka [16], a akútnou lymfoblastickou leukémiou [17]. Väčšina z týchto SNP vyhľadať v exónov alebo IntronA s neznámymi funkčnými účinkami. V poslednej dobe sa stále viac štúdií sa zameralo na sedenie SNP v géne promotorové oblasti, ktoré sa ukázalo ako ovplyvňovať schopnosť väzby s niekoľkými transkripčných faktorov (TFS), a vplyv na nasledujúce génovú transkripciu. V tejto štúdii sme predpokladali, že mTOR
rs2295080 T > G polymorfizmus v oblasti promotora, môže ovplyvniť náchylnosť k GC. Pre testovanie tejto hypotézy sme genotyp frekvencii mTOR
rs2295080, aby sme otestovali jeho dôraz na riziká GC v našej trvalej, nemocnice báze, case-control štúdii u čínskej populácie. V dôsledku toho sme zistili na mTOR
hladiny mRNA s rôznymi genotypmi v tkanivách pacientov s rakovinou žalúdka. Ďalej sme sa ďalej vyznačuje funkčnosť tejto genetickej varianty na mTOR
promótor transkripcie luciferázového testu a EMSA.

materiáloch a metódach

Študijné Predmety

Táto štúdia zahŕňala 753 pacientov s histologicky potvrdené adenokarcinómom žalúdka a 854 rakovinou bez kontroly. Všetci pacienti boli regrutovanie z Cancer klinickej výskumnej základne Nanjing Lekárskej univerzity od marca 2006 do januára 2010. A to všetko demografických a klinických informácií, vrátane veku, pohlavia, veľkosť nádoru, nádorové mieste, histologických typov, hĺbkou invázie, lymfatických uzlín, vzdialenej metastázy, a TNM štádium, bola získaná pomocou krátkeho dotazníka a klinické lekárske záznamy.

frekvenčne uzavreté kontroly týchto prípadoch podľa veku (± 5 rokov) a pohlavie boli zhromaždené v rovnakej dobe a regióny nesúvisí genetický vzťah s žalúdočnými a zažívacieho ústrojenstva nádorov. Každý účastník podpísal písomný informovaný súhlas a daroval 5 ml žilnej krvi na extrakciu genómovej DNA. Výskum protokol bol schválený inštitucionálnu etickou komisiou Nanjing Lekárskej univerzity.

DNA Extrakcia a SNP genotypizácia

genómovej DNA bola extrahovaná z krvných vzoriek, ako bolo opísané skôr [18]. Genotypizácia bola dokončená TaqMan SNP genotypizácia testu za použitia ABI 7900HT real-time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) a Detection System Sequence verzie 2.4 (SDS 2.4). Sekvencie primérov a sond boli k dispozícii na požiadanie, a ovládacie prvky boli obsiahnuté pre každú dosku, aby bola zaistená presnosť stanovenia genotypu. Test genotypizácia bola vykonaná dve osoby nezávisle na slepá štúdia. Viac ako 10% vzoriek bolo náhodne vybraných pre potvrdenie, a výsledky boli 100% zhodné. Primery a sondy boli uvedené v tabuľke S1.

Bunková kultúra a konštrukcia Promoter Reporter Plazmidy

Jedna normálne žalúdočnej sliznice epiteliálne bunková línia (GES-1) a tri rôzne bunkových línií karcinómu žalúdka (BGC -823, MGC-803, a SGC-7901) boli prijaté do tejto štúdie. Všetky bunky boli kultivované v Dulbecco modifikovanom égale Medium /s vysokým obsahom glukózy médiu kultúry s 10% FBS, 10 mM HEPES, 2 mM L-glutamínu, 1 mM pyruvátu sodného, ​​100 U /ml penicilínu a 100 ug /ml streptomycínu pri 37 ° C, vo zvlhčenej atmosfére obsahujúcej 95% vzduchu a 5% CO _{2. Väčšina činidiel boli získané od GIBCO (Burlington, Ontario, Kanada)}

V luciferázové reportéri plazmidy, ľudský mTOR
promočné sekvencie s rôznymi alel pre rs2295080 T >. G polymorfizmus boli syntetizované a konštruované do pGL3-basic vektora (Promega, Madison, WI, USA) Generate Company (Shanghai, Čína). Všetky plazmidy boli potvrdené DNA sekvenovaním. Primery zapojené do testu boli uvedené v tabuľke S2.

prechodnú transfekciu a Luciferase Assay

GES-1, BGC-823, MGC-803, a SGC-7901 bunky boli transfekovány Lipofectamine 2000 (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) s 0,8 ug každého postavené vektora, a to buď s T alelou alebo G alely. Súčasne, 10 ng PRL-SV40 na jamku bol tiež transfekovány ako vnútorná kontrola pre korekciu účinnosť transfekcia. Pred tým, bunky boli schovať na 24-jamkových doštičkách cez noc s cieľom zabezpečiť 90% -95% zhlukovania v dobe transfekcia. Dvadsaťštyri hodín po transfekciu, aktivita luciferázy bola meraná v Dual-Luciferase Reporter Assay System (Promega, Madison, WI, USA) a bola vyjadrená ako pomer luciferázy svetlušiek do Renilla luciferázové aktivity. Všetky bunky boli vykonané v troch opakovaniach sa za rovnakých podmienok

Shift Elektroforetická mobilita Assay (EMSA)

sense sondy sekvencie boli nasledovné: rs2295080 T sonda, 5'-AGGGTTCCCATCCCTGAGGAC-3 ';. rs2295080 G sonda, 5'-AGGGTTCCCAGCCCTGAGGAC-3 '. Jadrové proteíny boli extrahované NE-Perte jadrové a cytoplazmatické Extraction Reagents (Pierce, Rock-ford, IL, USA). DNA sondy boli pripravené s Biotin 3'-koniec DNA Labeling Kit (Pierce, Rock-Ford, IL, USA). Elektroforetické mobility shift assay (EMSA) bola vykonaná s LightShift Chemoluminiscenčný EMSA Kit (Pierce, Rock-ford, IL, USA). Väzbové reakcie boli vykonávané nasledujúcim spôsobom: jadrových extraktov (8 ug proteínu) a väzobnom pufri 1 x 2,5% glycerolu, 5 mM MgCl _{2, 50 ng /ul poly (dl-dC), 0,05% NP-40, a 20 fmol biotínom značenej rs2295080 T /G rs2295080 sondy boli inkubované na ľade počas 30 minút v objeme 20 ul. Pre kompetiční štúdia bola nukleárna extrakty boli inkubované s neznačeného oligonukleotid počas 30 minút pred pridaním značeného oligonukleotidy.}

Hladiny expresie mTOR
mRNA.

celkovej RNA z 60 žalúdočných rakovinové tkanivá, ktorý je súčasťou 753 prípadov, s rôznymi genotypmi boli získané za použitia TRIzolu reagent (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). MRNA bola meraná pomocou kvantitatívnej real-time PCR (ABI 7300) po reverznej transkripcii. GAPDH bola použitá ako vnútorná kontrola pre kvantitatívne každú vzorku. Priméry použité pre amplifikáciu boli mTOR F: 5'-TTGCTTGAGGTGCTACTG-3 'a R: 5'-CTGACTTGACTTGGATTCTG-3'; Primery pre GAPDH boli F: 5'-AAGGTGAAGGTCGGAGTCAAC-3 'a R: 5'-GGGGTCATTGATGGCAACAATA-3'. Relatívna kvantifikácia mTOR
mRNA bola vypočítaná pomocou metódy 2-ΔΔCt. Sklopné zmeny boli normalizované vzhľadom k GAPDH, a každá skúška bola vykonaná trikrát.

Štatistická analýza.

Hardy-Weinberg rovnováha (HWE) bola hodnotená pomocou chi-kvadrát dobré zhody testu pre porovnanie pozorovaných frekvencií genotypov s očakávanou medzi ovládacími prvkami. Asociácia medzi genotypy a rizikom vzniku rakoviny žalúdka sa odhadli pomocou počítačových miery pravdepodobnosti (ORS) a 95% intervaly spoľahlivosti (CIS) z logistickej regresie analýz s úpravou pre vek a pohlavie. Obojstranné χ ^{2 testy štatistickej významnosti boli vykonané pomocou softvéru SAS (verzia 9.1.3; SAS Institute, Inc., Cary, NC, USA) a P Hotel < 0,05 bola považovaná za štatistický význam.}

Výsledky

charakteristika študijných predmetov

vybrané vlastnosti týchto prípadov a kontrol sú zhrnuté v tabuľke 1. prípady a kontroly sa zdalo byť dostatočne uzavreté na tomto vek ( P
= 0,424) a sex ( P
= 0,406). Z 753 prípadov nádorových miesta zaradené 295 rakovine CARDIA (39,2%) a 458 rakoviny non-kardia (60,8%). Pacienti s difúznym typom (437, 58,0%) vykazoval mierne vyšší pomer ako črevnú typu (316, 42,0%). o klasifikácii TNM spoločného výboru amerického rakoviny (AJCC rakovina pracovné príručky, 6 ^{th edition) [19], 17,3%, 17,3%, 50,6%, vztiahnuté, a 14,8% pacientov malo T1, T2, T3, a T4, v danom poradí. Medzitým 60,6% pacientov prezentované pozitívnych lymfatických uzlín a 13,0% existovali vzdialenej metastázy. V súlade s týmito klinickými charakteristikami, všetci pacienti boli nakoniec identifikovaný fáze I, II, III a IV s 26,8%, 21,9%, 35,3% a 16,0%, resp.}

celkových účinkov rs2295080 polymorfizmus na riziko GC

genotypu rozvody a alel frekvencie rs2295080 sú uvedené v tabuľke 2. genotypu kmitočty v kontrolách boli v súlade s modelom HWE ( P
= 0,569). Ako je uvedené v tabuľke 2, genotypu frekvencia rs2295080 boli medzi ovládacie 64,0%, 32,7% a 3,3% pre genotypy TT, TG, a GG medzi prípadmi, a 58,2%, 35,7% a 6,1%, v danom poradí. Rozdiel medzi prípadmi a kontrolami bol štatisticky významný ( P =
0,008). Tiež frekvencia alely G bol významne nižší u prípadov než kontrolami (19,7% oproti 23,9%, P
= 0,003). Okrem toho, kombinované TG /GG genotyp frekvencia bola nižšia u prípadov než kontroly (36,0% oproti 41,8%, P
= 0,016). Ak sa vezme TT genotyp ako referencie, sme zistili, že varianty genotypy (TG a GG), boli spojené so zníženým rizikom GC v závislosti na dávke a odozvy v porovnaní s genotypom TT (upraveného OR = 0,83, 95% CI = 0.67-1.02 TG, a 0.49, 0.30-0.80 pre GG; P
_{trend = 0,003). Rovnako tak tiež zistené, že kombinované TG /GG genotypy súvisiace so štatisticky významne nižší náchylnosti k GC v porovnaní s genotypom TT (0,78, 0.64-0.96). Dohromady tieto údaje naznačujú, že mTOR
rs2295080 G alela môže byť domnelý ochranný alela.}

Muži boli náchylnejší k rakoviny žalúdka u rs2295080 polymorfizmus

Pretože sa jedná dobre zavedený, vek a pohlavie boli dôležitými faktormi nádorové karcinogenéze vrátane rakoviny žalúdka. Podľa analýzy stratifikačný s veku a pohlavia faktorov, sme zistili, že významná súvislosť bola pozorovaná u samčie skupiny, skôr než v skupine žien (tabuľka 3). U mužov, nesúci alelu rs2295080 G bol významne znížil rizikový faktor (OR = 0,72, 95% CI = 0.56-0.93 pre TG /GG proti TT), v porovnaní s T nesúci alelu. Avšak, tam nebol žiadny štatisticky významný rozdiel medzi mladými a starými predmety.

vrstevnaté Analýza asociáciou medzi rs2295080 polymorfizmus a klinických premenných na žalúdočné rakovinu

Vykonali sme analýzu rozvrstvenie rs2295080 polymorfizmus v všetky subjekty podľa klinickými príznakmi GC. Zo všetkých nezávislých premenných, ochranné účinky boli prevažne pozorované u skupín pacientov s rakovinou žalúdka kardia (OR = 0,68, 95% CI = 0.52-0.91), typ črevnej (0,73, 0,56 - 0,96), T3 hĺbky invázie (0.78, 0.60 -1,00), uzlín pozitívnych lymfatických (0,79, 0,62 - 1,00), negatívne vzdialených metastáz (0,76, 0,62 - 0,94), a lokalizované fáza (0,76, 0,59 - 0,98) (tabuľka 4).

Vplyv rs2295080 polymorfizmus na transkripčný aktivitu

Ak chcete získať vhľad do biologického funkčného účinku rs2295080 polymorfizmus na mTOR
transkripcie, GES-1, BGC823, MGC803 a SGC-7901 bunky boli transfekovány s rôznymi luciferázy správa plazmidy, vrátane divokého typu (T alela) a mutačné typu (G alely). Ako je znázornené na Obr. 1A, sme zistili, že transkripčný aktivita T alely bola vyššia ako G alely s približne 1,5 krát vo vyššie uvedených štyroch bunkových línií, čo naznačuje, že rs2295080 G alely pracoval ako obranca pre rakovinu žalúdka znížením transkripcie mTOR
.

Nuclear Protein väzbovú aktivitu variantov v rs2295080

Ďalej sme vykonali experiment EMSA analyzovať biologické dôsledky rs2295050 polymorfizmus v SGC-7901 buniek. Jeden silný pás (proteínový komplex) bol posunutý, keď boli jadrové extrakty sa inkubujú s biotínom značenej sondy rs2295080 T, zatiaľ čo slabší skupina bola pozorovaná, keď boli jadrové extrakty inkubovali s biotín-značená rs2295080 G sondou. Posunutá pásy boli významne inhibovaná molárneho prebytku neznačeného rs2295080 T alebo G rs2295080 konkurenta v dávke závislé na spôsobe (obr. 1B). Tieto výsledky ukazujú, že rs2295080 G alela by mohla znížiť väzbovú aktivitu jadrového proteínu do určitej miery.

pridružení medzi mTOR
rs2295080 polymorfizmus a expresie Úrovne mTOR
mRNA

Šesťdesiat tri žalúdočné rakovinové tkanivá, s rôznymi genotypmi boli k dispozícii mTOR
rs2295080 v našej súčasnej štúdii. Vzhľadom k nízkej frekvencii genotypu GG, sme ho pridané do vzoriek s TG genotypom pre analýzu. Ako je znázornené na Obr. 2, hladiny expresie mTOR
mRNA bol výrazne vyšší u jedincov s genotypom TT ako u pacientov s TG alebo genotypom GG (priemer ± SEM z TT proti TG /GG: 12,35 ± 1,51 v porovnaní s 6.17 ± 1.32, P
= 0,004).

Diskusia

V tejto štúdii, Ukázali sme, že G alela mTOR
promótor polymorfizmus rs2295080 bolo spojené s výrazne zníženie rizika GC. Zistili sme, že T G zmena rs2295080 podstatne nezmenili transkripčný aktivitu mTOR
gén prostredníctvom ovplyvňovania väzby nejaký transkripčného faktoru. Ďalej poznamenal, že mTOR
rs2295080 T alela bola spojená s vyšším mTOR
expresné hladiny mRNA in vivo
.

Cicavčie cieľ rapamycín (mTOR) , tiež známy ako FRAP1, je nutné členom PI3K /Akt /mTOR a centrálne metabolické signalizáciu [20], [21]. To môže byť aktivovaný pomocou inzulínu, inzulínu podobné rastové faktory a iné rastové faktory, a inaktivované počas bunkového hladovania. mTOR existuje dva rôzne druhy komplexu, pomenované mTORC1 a mTORC2, respektíve [22]. MTORC1 komplex fosforizuje svojho nadväzujúceho effecter p70S6K, ktorá by mohla vyvolať degradáciu receptora inzulínu podkladu a ďalej zvyšovať Akt aktivitu inzulínu pohonom. MTORC2 komplex fosforizuje C-koniec Akt na Ser473, čo by mohlo viesť k celej aktivácii Akt [9]. Ako terapeutický cieľ v iných zhubných nádorov [4], [8], [23] - [27], mTOR by tiež ukázal sa ako potenciálny cieľ pre liečbu rakoviny žalúdka, spontánne. Sirolimus [28] a [29] everolimus, inhibítory mTOR, boli identifikované za následok G1 zastavenie bunkového cyklu a inhibuje proliferáciu bunkových línií žalúdka. V poslednej dobe, nový potenciálny mTOR
promótor polymorfizmus rs2295080 bola popísaná v niekoľkých štúdiách [30] - [32]. Avšak, nedostatočné funkčné boli vykonané štúdie pre vyhodnotenie role tejto genetickej varianty v regulácii mTOR
výraz. V GC, naše zistenia poskytla dôkazy, že rs2295080 T alelu by mohli zvýšiť transkripčný aktivitu mTOR
do istej miery GES-1 bunkové línie po transfekovány in vitro
. A ďalej luciferázového testu v troch žalúdočných rakovinových bunkových líniách (tj BGC-823, MGC-803, a SGC-7901), ďalej potvrdili tento efekt rs2295080 polymorfizmus. Tieto výsledky v našej štúdii boli v súlade s výsledkami v obličkovej bunková línia karcinómu krčka maternice a rakovina bunkové línie [32]. V EMSA teste, rs2295080 bola predpovedaná pre lokalizáciu na potenciálne väzobné miesto, ktorého polymorfné varianty môžu mať vplyv na nábor transkripčných faktorov (pomocou programu p-zápas, ktorý používa väzobné miesta v TRANSFAC; www.gene-regulation.com). Brať tieto výsledky dohromady, je pravdepodobné, že mTOR
rs2295080 polymorfizmus môže ovplyvniť hladinu expresie mTOR stroje a individuálne náchylnosti k rôznym druhov rakoviny.

SNP rs2295080, ako ako ďalšie intronom SNP rs11121704, bola prvýkrát zaznamenaná podľa Hildebrandt et al.
nájsť v mTOR
potenciál promótor región [13]. Ako je popísané v rakoviny pažeráka, rs2295080 zdalo žiadnu spojitosť alebo funkcie s prežitia po chemorádioterapiu a chirurgie. Ale až teraz, niekoľko štúdií identifikoval účinok tejto polymorfizmus v mTOR
k riziku rakoviny [30] - [32], z ktorých všetky posudzované rs2295080 T alely ako rizikový faktor. V súčasnej štúdii, vzťah medzi rs2295080 T alely a riziko GC bol v súlade s výsledkami predchádzajúcich troch štúdií [30] - [32]. Okrem toho, naše výsledky tiež naznačujú, že tento polymorfizmus môže byť biologická podstata vo vývoji GC. Z dôvodu rôznych populácií a rôznymi mechanizmami medzi výskytom, vývoj a prežitie, sme špekulovali etnika rozdiely a mechanistické rozdiely by mohli vysvetliť tieto discordances.

Ďalší román výsledok pochádza zo vzťahu medzi pohlaviami a mTOR
rs2295080 polymorfizmus rozvrstvené analýzy. Táto rs2295080 polymorfizmus odhalila viac silný význam u mužov ako u žien. Navyše Hartgrink et al
. (2009) oznámila, že pomer mužov k ženám infikovaných rakovinou žalúdka je cca 02:01 ročne [33]. Ďalšie vysvetlenie pre pripojenie týchto výsledkov je potrebné usilovať, a rôzne druhy hormónov prejavu u mužov i žien sa stal najlepším úvaha, racionálne. V štúdii rakoviny prsníka, Galoian et al.
Dal dáta, ktoré prolinerich polypeptid-1 vykazuje antiproliferatívne účinok inhibíciou mTOR kinázy v ER-negatívne MDA-231, ale žiadny inhibičný účinok existuje v luminální T47 D bunka, ktorá vystupuje ako bunkové línie ER-pozitívnych [34]. Avšak, pre štúdium androgénu, sa verilo, že androgény by mohli stimulovať aktivitu mTOR v bunkách karcinómu prostaty Ptení s deficitom. Nedávna štúdia na androgénny receptor zlepšila úlohu androgénu v up-reguláciu mTORC2 aktivitu [35]. Je pravdepodobné, že androgén, namiesto toho, estrogénu, môže zvýšiť mTOR
výraz; androgénov môže viesť k vysokému výskytu rakoviny žalúdka u mužov a silnom význame mTOR
rs2295080 vo samčie skupiny v našej štúdii.

Niektoré obmedzenia našej štúdie je potrebné poukázať na takto , Po prvé, rs2295080 nebol jediný polymorfizmus významne pôsobí na mTOR stroje a význam prepojenia SNP bolo zanedbané v našej štúdii. Po druhé, ako rozhodujúcich faktorov pri žalúdočnej karcinogenéze sa postráda Helicobacter pylori
informácie, fajčenie informácií a pitie informácie boli tiež nedostatočné v našej štúdii, je nežiaduce pre nás pre ďalšie sledovanie účinku polymorfizmus. Okrem toho, vzhľadom na relatívne malej veľkosti vzorky v našej štúdii, žiadne významné výsledky Zdalo sa, že sa nachádzajú v určitej vrstvy (vekových podskupín, ženské podskupine, a ďalšie klinicko-patologické podskupín) rozvrstvené analýzy (Tabuľka S3 a S4). Očakávalo sa ďalej väčšie štúdie s ďalšími informáciami k overeniu naše zistenia.

Na záver, naše štúdie osvetlila mTOR
rs2295080 umiestnenie v promotorové oblasti mTOR
gén bol významne spojené s rizikom rakoviny žalúdka v čínskej populácie.

podporné informácie
tabuľke S1.
Primery a sondy použité pre genotypizáciu
doi :. 10,1371 /journal.pone.0060080.s001
(DOC)
tabuľke S2.
Primery pre konštrukciu plazmidov
DOI: 10,1371. /journal.pone.0060080.s002
(DOC)
Tabuľka S3.
Interakcie analýzy mTOR
rs2295080 polymorfizmus a vek alebo pohlavie stavu v case-control štúdii
DOI: 10.1371 /. journal.pone.0060080.s003
(DOC)
tabuľke S4.
Interakcie analýzy mTOR
rs2295080 polymorfizmus a vek /pohlavie alebo klinické znaky v prípade iba štúdie
doi :. 10,1371 /journal.pone.0060080.s004
(DOC)

poďakovanie

radi by sme poďakovali Luo Y (Nanjing Červeného kríža Blood Center) za jej pomoc s funkčnými experimentov.

• Ploche ONE: pridružení medzi glutatión S-transferáza T1 Null genotypu s rakovinou žalúdka riziko: meta-analýze 48 štúdií
• Ploche ONE: Asociácie medzi polymorfizmy v géne EGFR exónov, životný štýl a riziká rakoviny žalúdka s rozdielmi medzi pohlaviami v čínskej Han predmetov