PLOS ONE: Aktivera transkriptionsfaktor 4 ger en multiresistens fenotyp till Gastric cancerceller genom transaktivering av SIRT1 Expression

Abstrakt

Bakgrund

Multiresistens (MDR) i magcancer fortfarande en stor utmaning klinisk behandling. Aktivera transkriptionsfaktor 4 (ATF4) är en stressreaktion gen som är involverad i homeostas och cellulära skydd. Dock förblir uttryck och funktion ATF4 i magcancer MDR okänd. I denna studie undersöker vi om ATF4 spela en roll i magcancer MDR och dess potentiella mekanismer.

Metodik /viktigaste resultaten

Vi visade att ATF4 uttryck confered MDR fenotypen till gastric cancerceller, medan knockdown av ATF4 i MDR varianter inducerade åter sensibilisering. I denna studie visade vi också att NAD ^{+ - beroende histondeacetylas SIRT1 krävdes för ATF4-inducerad MDR effekt i gastric cancerceller. Vi visade att ATF4 underlättas MDR i gastric cancerceller genom direkt bindning till SIRT1 promotor, vilket resulterar i SIRT1 uppreglering. Signifikant hämning av SIRT1 Musik av små störande RNA (siRNA) eller en specifik inhibitor (EX-527) återinfördes terapeutisk känslighet. Dessutom var en ökad Bcl-2 /Bax förhållandet och MDR1 uttryck nivån i ATF4-överuttryckande celler.}

Slutsatser /Betydelse

Vi visade att ATF4 hade en nyckelroll i regleringen av MDR i gastric cancerceller som svar på kemoterapi och dessa fynd tyder på att rikta ATF4 kan lindra terapeutiska motstånd i magcancer

Citation. Zhu H, Xia L, Zhang Y, Wang H, Xu W, Hu H, et al. (2012) Aktivera transkriptionsfaktor 4 ger en multiresistens fenotyp till Gastric cancerceller genom transaktivering av SIRT1 uttryck. PLoS ONE 7 (2): e31431. doi: 10.1371 /journal.pone.0031431

Redaktör: Wael El-Rifai, Vanderbilt University Medical Center, USA

Mottagna: 5 september 2011. Accepteras: 8 januari 2012, Publicerad: 17 februari 2012 |

Copyright: © 2012 Zhu et al. Detta är en öppen tillgång artikel distribueras enligt villkoren i Creative Commons Attribution License, som tillåter obegränsad användning, distribution och reproduktion i alla medier, förutsatt den ursprungliga författaren och källan kredit

Finansiering:. Denna studie stöddes av kombinerade bidrag från National Natural Science Foundation i Kina (NO.81090270, NO.81090273 och NO.81000864), den kinesiska forskar Science Foundation (NO.20100471776), National Key och grundforskningen Development Program Kina ( NO. 2010CB529302) och National Kommunal Science and Technology Project (2009ZX09103-667 och 2009ZX09301-009-RC06). Finansiärerna hade ingen roll i studiedesign, datainsamling och analys, beslut att publicera, eller beredning av manuskriptet

Konkurrerande intressen:.. Författarna har förklarat att inga konkurrerande intressen finns

Introduktion

multi~~POS=TRUNC resistens~~POS=HEADCOMP är vanligtvis den främsta orsaken till misslyckande kemoterapi mot maligna tumörer, inklusive magcancer [1] .Det termen multiresistens är klassiskt används för att definiera ett motstånd fenotyp där celler blir resistenta samtidigt olika läkemedel utan uppenbar strukturell likhet och med olika cellulära mål [2]. MDR förekommer oftare med nya läkemedel som har större effektivitet efter sin första ansökan vid cancerbehandling. Den kliniska användbarheten av flera läkemedel är begränsad av både naturliga och förvärvade tumörcellresistens, som nästan alltid är multifaktoriell i naturen [3]. De faktorer som kan påverka läkemedelskänslighet inkluderar: accelererad läkemedelsutflödes, drog aktivering och inaktivering, förändringar i läkemedelsmål, DNA-metylering, bearbetning av läkemedelsinducerad skada, och undandragande av apoptos [4]

Gastric cancer. är relativt okänslig för kemoterapeutika. MDR mekanismer i gastric cancerceller har i stort sett undersökts i vårt laboratorium och på andra håll [1], [4], [5], men de har inte helt klarlagd, vilket tyder på att andra okända molekyler eller vägar kan vara involverade i utvecklingen av MDR.

i däggdjursceller, eukaryota translationsinitiering faktor 2 α-subenhet (eIF2α) fosforyleras av olika eIF2α kinaser som svar på olika stresssignaler, inklusive anoxi /hypoxi, endoplasmatiskt retikulum stress, aminosyra deprivation, och oxidativ påfrestning. Denna fosforylering händelse leder till en snabb minskning av den globala proteinbiosyntes samtidigt med induktion av translationella uttryck av gener, inklusive ATF4
som fungerar för att lindra cellskador från stress [6], [7]. Även ATF4 kan spela en pro-apoptotiska roll under förhållanden med allvarlig eller långvarig stress, ATF4
är en potent spänningskänslig gen tros spela en skyddande roll genom att reglera cellulär anpassning till ogynnsamma omständigheter i den integrerade stressrespons ( ISR) [8], [9], [10]. Nyligen var överuttryck av ATF4 rapporterats vara framträdande i ett stort antal olika tumörer och för att skydda tumörceller mot multipla stressfaktorer, samt en rad cancer terapeutiska medel [11], [12], [13], [14], [15], [16], [17]. De potentiella mekanismer som ansvarar för detta skydd inkluderar autophagy induktion, främjande av DNA-skador reparation och uppreglering av intracellulär glutation [12], [13], [14], [17]. Dock förblir uttryck och funktion ATF4 i magcancer MDR okänd.

I denna studie, rapporterade vi att ATF4 var betydligt uppreglerad i MDR svar av gastric cancerceller jämfört med föräldrakontroll celler. Knockdown av ATF4 Musik av siRNA signifikant sensibiliserade celler med MDR till en mängd olika kemoterapeutiska medel, medan uppreglering av ATF4 i SGC7901 och AGS celler gjort dem multiresistent. Vi visade också att ATF4 främjade magcancer MDR dels genom uppreglering uttryck av SIRT1. Och SIRT1 inhibition kan delvis vända magcancer MDR fenotypen förmedlas av ATF4. Dessa data tyder på att rikta kan ATF4 åstadkomma ett nytt behandlingsalternativ för att vända den kliniska magsäckscancer MDR.

Resultat

ATF4 modulerar MDR fenotypen av gastric cancerceller

För att avgöra om ATF4 är involverad i utvecklingen av MDR i gastric cancerceller, var ATF4 nivåer detekteras genom Western blöt och qPCR i SGC7901 cellinje och dess MDR-varianter, SGC7901 /video och SGC7901 /ADR. Både protein och mRNA-nivåer av ATF4 var mycket högre i de resistenta cellinjerna än i moderceller (Fig. 1A).

För att undersöka om ATF4 uttryck är tillräcklig för att inducera en MDR fenotypen i gastric cancerceller, ATF4
expression cDNA transfekterades stabilt in i SGC7901 och AGS-celler. Först CDDP känslighet testades med hjälp av en kolonibildningsanalys. Såsom visas genom kvantifiering av kolonibildningsanalys, ATF4 överuttryck resulterade i en nästan 3-faldig ökning av koloniantal jämfört med tomma vektoruttryckande celler (Fig. 1B). MTT-analyser visade också att IC _{50 värden för SGC7901-ATF4 för ADR, video, CDDP, och 5-FU ökade signifikant jämfört med tomma vektor transfekterade celler (Fig. 1D).}

Som ATF4 nivåerna är förhöjda i MDR gastric cancerceller, ville vi vidare för att bestämma huruvida inriktning ATF4 kunde åter medvetande cellinjerna MDR. Knockdown av ATF4 Musik av siRNA i SGC7901 /ADR och SGC7901 /VCR-celler ledde till en 2- till 3-faldig minskning av antalet celler när de används i kombination med CDDP (Fig. 1C). Data i fig. 1E tyder också på att nedreglering av ATF4
signifikant reverserar resistansen hos SGC7901 /ADR-celler som svar på kemoterapi.

Som inhibering av apoptos är en av viktiga mekanismer för MDR, vi undersökte också kapaciteten hos de SGC7901 /ADR-celler transfekterade med den specifika ATF4
siRNA att genomgå CDDP-inducerad apoptos genom Hoechst färgnings och DNA fragmenteringsanalyser. Behandling av SGC7901-ATF4 och SGC7901 /ADR-SCR-celler med de angivna koncentrationerna av CDDP under 36 timmar inducerade inte någon apoptos, som bedöms av Hoechst nukleär färgning (Fig. 1F) och DNA-fragmentering analyser (Fig. 1G). I motsats härtill SGC7901-vektor och SGC7901 /ADR-siATF4 celler uppvisade betydande apoptos, med den mer frekventa uppträdandet av kondenserade och fragmenterade kärnor och DNA-stege bildning. Dessutom var mer uppenbar klyvning av procaspase-3 observerades efter behandling med CDDP i SGC7901-vektor och SGC7901 /ADR-siATF4 celler jämfört med SGC7901-ATF4 och SGC7901 /ADR-SCR-celler, respektive (Fig. 1 H).

Sammantaget indikerar dessa resultat att ATF4 förlänar en MDR-fenotyp till gastriska cancerceller och att inriktnings ATF4 tillhandahåller en metod för sensibilisering av resistenta celler till kemiska behandlingar.

ATF4 uppreglerar uttrycket av SIRT1, MDR1 , Bcl-2 och Bax i gastric cancerceller

Tidigare studier har rapporterat att celler som överuttrycker SIRT1 visas minskad känslighet för kemoterapi genom multipla mekanismer [18], [19], [20], [21]. Vi var nyfikna att avgöra om SIRT1
, som är en stressrelaterad gen avgörande för MDR utveckling, kan vara nedströms mål för ATF4 ansvarar för att medla ATF4-inducerad MDR i gastric cancerceller.

SIRT1 nivåer i LV-vektor och LV-ATF4 stabilt transfekterade SGC7901 celler analyserades med qPCR och Western blot. Överuttryck av ATF4 var associerad med ökad SIRT1 uttryck både transkriptions (Fig. 2A, vänster) och translationella nivåer (Fig. 2B, till vänster). Däremot siRNA knockdown av ATF4
i SGC7901 /ADR-celler resulterade i en betydande minskning av endogena SIRT1
uttryck (Fig. 2A och 2B, till höger). Dessa resultat tyder på att ATF4 uppreglerar SIRT1
uttryck i gastric cancerceller.

För att ytterligare undersöka de molekylära mekanismer som är inblandade i ATF4 relaterade MDR av magcancer, vi har även granskat MDR1, MRP, BCL-2 och Bax expressionsnivåer i gastric cancerceller används ovan. Såsom visas i fig. 2B, ATF4-kompetenta celler uttryckte mer MDR1 jämfört med kontrollcellerna. Samtidigt var ingen uppenbar skillnad i MRP uttryck återfinns i någon av dessa cellinjer. Intressant nog både Bcl-2 och Bax expressionsnivåerna var uppreglerat i ATF4-kompetenta celler, jämfört med kontrollcellinjer, medan uttrycket av Bax uppvisade endast små förändringar, vilket indikerar att en upp-reglering av Bcl-2 till Bax förhållandet kan undertrycka läkemedelsinducerad apoptos i ATF4-överuttryckande gastriska cancerceller.

Dessa resultat indikerar att ATF4 främjar MDR förmågan hos gastriska cancerceller genom flera mekanismer.

ATF4 transaktiverar SIRT1 promotoraktivitet och direkt binder till SIRT1 promotorn

för att avgöra om ATF4 förmedlar SIRT1
gentranskription, 293T-celler samtransfekterades med 1,2 kb SIRT1
promotor reporterplasmid och ATF4
expressionsplasmiden. Luciferas reporteranalysen visade att SIRT1
promotoraktiviteten markant aktiveras av ATF4 på ett dos-beroende sätt (fig. 3A).

I ett försök att få specifik insikt i mekanismerna för SIRT1
induktion har vi granskat de möjliga induktions vägar från ATF4. Genom att analysera 5'-flankerande sekvensen av SIRT1
gen med bioinformatik mjukvaror (Tfsitescan service, Tess och Genomatix), två ATF4 förmodade bindningsställen identifierades inom -950 till -600 bp region av SIRT1
promotorn (Fig. 3B).

för att avgöra om SIRT1
är ett direkt mål för ATF4, chip med ATF4 antikroppen med användning SGC7901-ATF4 celler visade anrikning av både bindningsställen inom SIRT1
promotorregionen, vilket indikerar att RNA och efterföljande proteinnivån ökar i SIRT1
i ATF4 uttryckande cellinjer är sannolikt på grund av en direkt interaktion mellan ATF4 med SIRT1
genpromotorn (fig. 3C).

för att undersöka rollen av de två ATF4 bindningsställen i regleringen SIRT1 transaktivering, var riktad mutagenes används för att mutera dessa platser. Luciferasrapportör-test visade att antingen mutera bindningsstället 1 eller bindningsställe 2 reducerade SIRT1 promotoraktivitet inducerad av ATF4. Vidare mutation av båda bindningsställen avskaffade SIRT1 promotoraktivitet. Dessa resultat antydde att både ATF4 bindningsställen är inblandade i transaktivering av SIRT1 promotorn (Fig. S1).

Sammantaget indikerar dessa resultat att SIRT1 är en direkt transkriptionell mål på ATF4.

SIRT1
hämning av siRNA delvis vänder MDR fenotypen av ATF4-överuttryckande gastriska cancerceller

identifieringen av ATF4-medierad SIRT1
uttryck nivån ökar i gastric cancerceller, uppmanas oss att analysera rollen av denna väg i magcancer MDR. För att lösa detta, jämfört vi In vitro
läkemedelskänslighet i ATF4 stabilt transfekterade gastric cancerceller efter transfektion av SIRT1
siRNA eller förvrängd siRNA av kolonibildning och MTT-analyser. Knockdown av SIRT1 Musik av siRNA i SGC7901-ATF4 celler ledde till en > 40% minskning av koloniantalet vid användning i kombination med CDDP (Fig. 4A, övre). Denna effekt observerades även i AGS-ATF4 celler (Fig. 4A, lägre). Dessutom data från MTT-analysen visade också att knockdown av SIRT1
kunde åter medvetande SGC7901-ATF4 celler till kemiska droger, men detta inte ske i scrambled siRNA transfekterade celler (Fig. 4B).

för att avgöra om SIRT1 skyddar cellerna från CDDP-inducerad apoptos, SGC7901-ATF4 celler transfekterade med SIRT1
siRNA eller förvrängd siRNA behandlades med CDDP och märkt med Annexin V och PI. De apoptotiska celler identifierades genom Annexin V märkning. Den apoptotiska procentandel av SIRT1 siRNA transfekterade SGC7901-ATF4 celler var betydligt högre än den hos kontrollceller (fig. 5A, 72,8% mot 25,9%). Utseendet på kondenserade och fragmenterade kärnor ökades också i SIRT1 siRNA transfekterade celler jämfört med kontrollcellerna (fig. 5B). Dessutom var klyvning av procaspase-3 observerades så tidigt som 12 timmar efter behandling med 10 | ig /ml CDDP i SIRT1 siRNA transfekterade SGC7901-ATF4 celler, men inte i scrambled siRNA behandlade celler, även efter 24 h av CDDP-behandling (Fig. 5C ). Dessa resultat tyder på att SIRT1 uttryck trycker CDDP-inducerad apoptos.

För att studera effekten av nedreglering av SIRT1 av siRNA på MDR associerade molekyler, vi granskade MDR1, MRP, BCL-2 och Bax uttrycksnivåer i SGC7901-ATF4 celler efter transfektion med SIRT1 siRNA eller oordning siRNA. Nedreglering av MDR1 observerades i de SIRT1 siRNA-behandlade celler (Fig. 5D) jämfört med kontrollcellerna. I kontrast, var ingen uppenbar skillnad på MRP, Bcl-2, och Bax expressionsnivåer hittades mellan proverna.

Dessa observationer indikerar att SIRT1 medierar ATF4-inducerade MDR effekt i gastriska cancerceller.

Hämning av SIRT1 aktivitet åter sensibiliserar ATF4 transfekterade celler till DNA-skadande medel

för att bevisa att SIRT1 katalytisk aktivitet är också ansvarig för ATF4-inducerad MDR, SGC7901-ATF4 celler förbehandlats med EX-527 , en roman, potent och specifik småmolekylära hämmare av SIRT1, och följt av behandling med olika kemiska läkemedel. Först bestämde vi den basala cytotoxiciteten hos EX-527 i LV-vektor och LV-ATF4 stabilt transfekterade SGC7901 celler. MTT-analysen avslöjade att EX-527 vid koncentrationer upp till 10 | iM inhiberade inte, utan snarare ökat något, livskraft båda cellinjerna (Fig. 6A). Därefter undersökte vi SIRT1, ATF4, MDR1, MRP, Bcl-2 och Bax uttrycksnivåer efter 24 timmars inkubation med eller utan de angivna doserna av EX-527 i magsäckscancer celler som används ovan. Bara ett uttryck för MDR1 ades ned-regleras av EX-527 på ett koncentrationsberoende sätt (fig. 6B). Sedan vi förinkuberades SGC7901-ATF4 celler med vehikel eller EX-527 (0,5, 1, 2, 4, och 10 ^ M) under 24 timmar, och därefter CDDP- och 5-FU-förmedlad celldöd övervakades. Såsom visas i fig. 6C, EX-527 ökade signifikant cytotoxiciteten av båda läkemedlen på ett dos-beroende sätt. Vi bestämde också den möjliga synergistiska effekten av EX-527 på olika doser av CDDP- och 5-FU-medierad hämning av cellproliferation i SGC7901-ATF4 celler. Som väntat, är tillräcklig 10 pM EX-527 för att potentiera cytotoxiciteten av båda läkemedlen (fig. 6D).

Dessa resultat antyder att SIRT1 aktivitet spelar också en kritisk roll i ATF4-inducerad gastrisk cancer MDR och detta roll kan medieras delvis genom MDR1 uttryck.

Diskussion

MDR innebär betydande kliniska utmaningar för effektiv kemoterapi av många humana maligniteter. De mekanismer genom vilka celler förvärvar motstånd är många och komplexa, så mer omfattande förståelse av dem, samt identifiering av nya mekanismer för chemoresistance, kommer att vara särskilt användbar för att tillhandahålla bättre terapeutiska möjligheter. Denna studie är den första rapporten att höga nivåer av ATF4, allmänt sett i tumörceller under stressiga förhållanden, ger gastric cancerceller med en MDR-fenotyp, och den identifierar att denna effekt medieras delvis genom trans av SIRT1 uttryck.

ATF4 Mössor och SIRT1
är evolutionärt konserverade stress gener som är involverade i ett brett spektrum av biologiska processer, av vilka många är välgörande för homeostas och cellulära skydd [22], [23], [ ,,,0],24]. Båda dessa gener induceras som svar på en mängd olika spänningar, inklusive syreförlust (hypoxi /anoxi), oxidativ stress, DNA-skada, närings deprivation, och chemotoxic stress. Levenson VV et al.
Först rapporterade att förändringar i uttryck av ATF4 skulle kunna spela en roll i den pleiotropa resistens mot olika klasser av DNA-inriktning läkemedel [16]. Under de senaste åren hade flera studier funnit att ATF4 var inblandad direkt eller indirekt i utvecklingen av läkemedelsresistens genom autophagy, glutation-beroende redox-system, och DNA-skador reparation [11], [12], [13], [14] [15], [16], [17], [25], [26]. Här visar vi att den skyddande förmågan hos ATF4 förmedlar verkligen en MDR fenotyp i ATF4-överuttryck gastric cancercellinjer som svar på kemoterapi. Våra resultat visar tydligt att överuttryck av ATF4 i gastriska cancerceller associerades med mer motstånd, medan knockdown av ATF4 inducerad åter sensibilisering. Dessa data tyder på att ATF4 är förmodligen en viktig nedströms förmedlare av motstånd som orsakas av flera mekanismer och är därför ett värdefullt terapeutiskt mål. Men som en av de viktigaste transkriptionella mediatorer av ISR som aktiverar ett antal olika målgener som främjar återupprättande av homeostas, ATF4 kan också förmedla resistens genom andra mekanismer. I vår studie var SIRT1 befanns vara uppreglerade i ATF4-överuttryckande celler jämfört med vektor transfekterade celler. I motsats, knockdown av ATF4 hotell med ATF4 specifik siRNA ledde till en nedreglering av SIRT1 i MDR gastric cancerceller. Våra resultat tyder på att SIRT1 kan vara en nedströms förmedlare av ATF4-inducerad magsäckscancer MDR.

Som medlem av ATF underfamiljen grund-regionen leucinblixtlåset (bzip) transkriptionsfaktorer [22], har ATF4 den potential att fungera som antingen en transkriptionsaktivator eller en transkriptionsrepressor via ATF eller cAMP responselement (CRE) bindningsställen [22]. Konsensusbindningsställe för ATF definierades som TGACGT (C /A) (G /A) [27], som är en sekvens identisk med den CRE konsensuselementet (TGACGTCA) [28]. Även den mycket konserverade kärn motiv - ACGT - kan i de flesta Cres [29] binda till olika bzip faktorer, beroende på de flankerande baser kärn motiv [22], [30], [31]. I vår studie två förmodade ATF-CRE-bindningsställen påträffades i de 1,2 kb SIRT1
promotorregion, och ATF4 direkt aktiveras SIRT1
transkription via bindning till båda bindningselement. Men hur de två bindningsställen spela sina roller med detaljerade spännings omständigheter förblir okänd och kräver ytterligare utredning.

Däggdjur SIRT1
är närmast homolog av jäst Sir2 Mössor och den mest omfattande studerat SIRT familjemedlem. Det är starkt inblandad i regleringen av cellulära processer som styr livslängden, inklusive anti-apoptos, neuronal skydd, och cellulärt åldrande eller åldrande [32]. Nyligen, ett ökande antal studier har inblandad ökat uttryck av SIRT1 med resistens mot kemoterapi och joniserande strålning [18], [19], [20], [33], [34], [35], [36]. Exempelvis har SIRT1 överuttryck hittats i läkemedelsresistent neuroblastom, osteosarkom, bröst, äggstocks-, prostata-, kolon-, och lungcancer-cellinjer jämfört med deras läkemedelskänsliga motsvarigheter. Alla dessa läkemedelsresistenta effekter av SIRT1 skulle kunna vara på grund av dess anti-apoptotiska effekt [37], [38] och tysta tumörsuppressorgener [39]. Slutligen kan vi förutsäga att om SIRT1 är involverat i ATF4-inducerade MDR, bör inhibering av SIRT1 påverka känsligheten av ATF4-överuttryckande celler som svar på kemoterapi. Som väntat, både siRNA och farmakologisk hämning av SIRT1 kunde åter medvetande ATF4-överuttryckande celler till kemiska droger. Dessutom visar vår studie att SIRT1 skyddar cellerna från döden dels genom en anti-apoptotisk effekt.

Det har rapporterats att MDR1 var uppreglerad i celler med ökad SIRT1 uttryck [18], [36]. I denna studie visade vi också att MDR1 är uppreglerat i ATF4-överuttryckande celler, och knockdown av SIRT1 med SIRT1 specifik siRNA eller inhibera dess aktivitet med EX-527 skulle kunna leda till nedreglering av MDR1, vilket överensstämmer med ett läkemedel resistenta roll genom SIRT1. Men Bcl-2 /Bax förhållandet, som var upp-regleras i ATF4-överuttryckande celler, var SIRT1 oberoende, vilket tyder på att SIRT1 oberoende mekanismer spelar också en roll i ATF4-inducerade MDR i gastric cancerceller.

Sammanfattningsvis visar vi att ATF4 ger en MDR fenotypen till gastric cancerceller, och denna effekt delvis medieras av transaktivering av SIRT1 uttryck. Dessutom är ATF4 ett giltigt mål i läkemedelsresistenta gastric tumörer, och utveckling av effektiva inhibitorer av ATF4 bör beaktas i framtiden. Dessa resultat ger nya insikter i rollen som ATF4 i kontrollen SIRT1 uttryck och i sina stressmotstånds funktioner i tumörbildning och kemoterapi. Detta är särskilt viktigt för klinisk behandling, som ATF4 kan vara upp-regleras av syrebrist, oxidativ stress, närings deprivation och nästan alla de negativa faktorer i en tumör mikro, som kan kapas av cancerceller att undvika spridning inhibition och celldöd i svar på kemoterapi. Därför får insatserna bygger på att störa stressinducerad ATF4 uttryck i cancerceller vara effektiva i att kringgå eller upphäva läkemedelsresistens i magcancer.

Material och metoder

För detaljerade metoder, se Text S1 .

cellodling och reagens

de humana magcancer-cellinjer SGC7901 (erhållen från Academy of Military Medical Science, Beijing, Kina) och MDR varianter, SGC7901 /ADR och SGC7901 /video (fastställs och upprätthålls i vårt laboratorium), och AGS (erhållna från cellbank av Chinese Academy of Sciences, Shanghai, Kina) odlades i RPMI-1640-medium kompletterat med 10% fetalt bovint serum (Hyclone) och penicillin /streptomycin. 293T-celler (också erhållna från cellbank av Chinese Academy of Sciences) odlades i DMEM kompletterat med 10% fetalt bovint serum. Att bibehålla MDR-fenotypen, adriamycin (med en slutlig koncentration av 0,5 | ig /ml) och vinkristin (med en slutlig koncentration av 1 | j, g /ml) sattes till odlingsmedia för SGC7901 /ADR och SGC7901 /VCR-celler, respektive. EX-527 (Sigma) löstes i DMSO vid de angivna koncentrationerna. Adriamycin (ADR), vinkristin (VCR), cisplatin (CDDP), och 5-fluorouracil (5-FU) löstes i normal saltlösning vid angivna koncentrationer.

Cell transfektion och stabil cellinjer

Den mänskliga ATF4
expressionsplasmiden (pCMV5-ATF4) tillhandahölls vänligen av professor Amy S. Lee [25]. Lentivirusvektor som kodar siRNA specifika för ATF4
och kontroll siRNA genererades med användning av PLKO.1-TRC (Addgene) och betecknades LV-siATF4 och LV-SCR-kontroll, respektive. Lentivirusvektor som kodar för humant ATF4 genen konstruerades i FUW-teto (Addgene), betecknad som LV-ATF4. Den tomma vektorn användes som negativ kontroll, betecknad som LV-vektor. Stabila cellinjer genererades genom transfektion av indikerade lentivirala konstruktioner följt av selektion i puromycin eller zeocin (Invitrogen), respektive. Celltransfektion och generering av stabila cellinjer utfördes med användning av standardförfaranden. Sekvenserna för de siRNA-konstruktioner kan hittas i text S1.

Immunoblotting

Insamlingen av proteinextrakt och immunoblotting-analys utfördes med användning av standardförfaranden. För källor antikropps se text S1.

kolonibildningsanalys

kolonibildningsanalys utfördes, såsom tidigare beskrivits [40], med smärre ändringar (Text S1).

Annexin V färgning och FACS-analys

Annexin V färgning och FACS-analys utfördes med användning av standardprocedurer. Celler negativa för både PI och Annexin V färgning klassificerades som levande celler, celler som färgade positivt för Annexin V endast klassificerades som tidiga apoptotiska celler och PI positiva och Annexin V positiva celler var celler som genomgår sena stadier av apoptos.

DNA-fragmentering analys

DNA-fragment extraherades med DNA Ladder Extraction Kit med Spin Column (C0008, Beyotime Co., Beijing, Kina) enligt tillverkarens protokoll. DNA-fragmenten separerades med användning av gelelektrofores på en 1% agarosgel innehållande 0,1 ^ g /ml etidiumbromid.

Hoechst färgnings

Hoechst Färgning utfördes enligt tillverkarens protokoll (C0003, Beyotime Co. ). Celler visualiserades med en DP70 invertsocker Immunofluorescens mikroskop (Olympus). Celler med kondenserade och fragmenterade kärnor bedömdes vara apoptotiska.

In vitro
läkemedelskänslighet analys

ADR, video, CDDP, och 5-FU var alla nyberedd före varje experiment. Läkemedelskänslighet mättes med användning av en 3- (4,5-dimetyltiazol-2-yl) -2,5-difenyl-tetrazoliumbromid (MTT) analys enligt standardprotokoll (Text S1).

Kvantitativ real -tid PCR (qPCR) Review

Kvantitativ realtids-PCR utfördes med användning av ett LightCycler 480 II-systemet (Roche) och SYBR Green detektion (TaKaRa). Sekvenser av de primers som kan hittas i text S1.

Kromatin immunoprecipitation (chip) analys

ChIP-analyser utfördes enligt tillverkarens protokoll (P2078, Beyotime Co.) med smärre ändringar. Kromatin lösningar sonikerades och inkuberades med anti-ATF4 eller med kontroll-IgG, och roterades över natt vid 4 ° C. DNA-protein tvärbindningar var omvänd och kromatin DNA renades och utsattes för PCR-analys. Primrarna 5'-ACC CCT CGT TTT ACA TCT-3 'och 5'-TTT GGA GTC CTT CCT TTC-3' användes för att amplifiera den SIRT1
distala promotorsekvens (A1, nukleotiderna -974 till - 843), och primrarna 5'-ACC CAA CAA ACC CAT TCT-3 'och 5'-CCT CCT GGG AAG ACC TTT-3' användes för att amplifiera den SIRT1
proximala promotorsekvens (A2, nukleotider -781 till -647). Primrarna för GAPDH
, 5'-TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG-3 'och 5'-TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA-3', användes som en negativ kontroll. Som en positiv kontroll för ATF4-DNA interaktion, primrarna 5'-TGG TTG GTC CTC GCA GGC AT-3 'och 5'-CGC TTA TAC CGA CCT GGC TCC T-3', som utformades för att amplifiera asparaginsyntetaset ( ASNS
) promotorregionen som innehåller åtminstone två platser rapporterats binda ATF4 [41], användes också. Efter amplifiering, var PCR-produkter upplöstes på en 1,5% agarosgel och visualiserades genom etidiumbromidfärgning

reportergenanalys

1,2 kb humant SIRT1
promotorsekvens (. - 1100-100 bp) syntetiserades och klonades in i Xhol- och Hindlll-ställena i pGL3-Basic vektor. Den resulterande konstruktionen bekräftades genom DNA-sekvensering. 293T-celler samtransfekterades sedan med SIRT1
promotor reporterplasmid, den pRL-TK-plasmid (Promega, USA), och pCMV5-ATF4 plasmiden genom att använda Lipofectamine2000 (Invitrogen). Fyrtioåtta timmar efter transfektion tvättades cellerna tre gånger med kall fosfatbuffrad saltlösning (PBS). Därefter lyserades cellerna i 100 ^ Passive Lysis Buffer (Promega) och skakades under 15 minuter. Eldflugeluciferas och Renilla luciferas aktiviteter mättes med hjälp av Dual-Luciferase Reporter Assay System (Promega) med en Varioskan Flash mikroplattläsare (Thermo Scientific). "Relativ aktivitet" definierades som förhållandet av firefly luciferasaktiviteten till Renilla luciferasaktivitet och beräknades genom att dividera luminescensintensiteten erhölls med analysen för eldflugeluciferas med det arbete som Renilla luciferas. Alla mätningar utfördes i triplikat, och analyserna upprepades tre gånger i 293 T celler.

Statistisk analys

Varje experiment upprepades minst tre gånger. Alla data presenteras som medelvärde ± standardavvikelse Skillnaden mellan medelvärdena analyserades med Students t-test. Alla statistiska analyser genomfördes med användning av SPSS16.0 programvara (Chicago, IL). Signifikans inställd på nivå 5%.

Bakgrundsinformation
figur S1.
Effekt av muterade ATF4 bindningsställen på aktiviteten av SIRT1 promotorn. 293T-celler samtransfekterades med pCMV-ATF4 och vildtyp SIRT1, SIRT1-MUT1, SIRT1-Mut2 eller MUT1 + Mut2 reporter, och den relativa luciferasaktiviteten bestämdes. Luciferasaktiviteten av mock pCMV-Taq-gruppen utsågs till 1,00. Resultaten är medelvärdet ± S.D. av tre experiment utfördes i duplikat. *, P < 0,05. Den vänstra sidan är en schematisk representation av de reporter genkonstruktioner. De stapeldiagram på höger sida representerar de relativa nivåerna av luciferasaktivitet i vart och ett av de transfekterade prover
doi:. 10,1371 /journal.pone.0031431.s001
(TIF) Review Text S1.
Kompletterande Material och metoder.
doi: 10.1371 /journal.pone.0031431.s002
(DOC) katalog

Tack till

Vi tackar professor Amy S. Lee för vänligt ger oss den pCMV5-ATF4 plasmid . Vi vill också tacka Mr Taidong Qiao och Zheng Chen för deras utmärkta teknisk assistans.

• PLOS ONE: genetisk känslighet på CagA-interagerande molekyler och Gen-miljöinteraktion med fytoöstrogener: en förmodad riskfaktor för Gastric Cancer
• PLOS ONE: S100A6 Protein Negativt Reglerar CacyBP /SIP-medierad hämning av Gastric Cancer Cell Proliferation och tumörbildning