PLoS ONE: Hohe Vielfalt von vacA und CagA Helicobacter pylori Genotypen bei Patienten mit und ohne Magen Cancer

Abstrakt

Hintergrund

Helicobacter pylori
mit chronischer Gastritis assoziiert ist, Magengeschwüre und Magenkrebs. Das Ziel dieser Studie war, die topographischen Verteilung von H zu beurteilen. pylori
im Magen als auch die vacA
und cagA
Genotypen bei Patienten mit und ohne Magenkrebs.

Methodik /wesentlichen Ergebnisse

Drei Magen-Biopsien von vorbestimmten Bereichen wurden bei 16 Patienten mit Magenkrebs und 14 Patienten mit Dyspepsie ausgewertet. Von Krebspatienten, zusätzliche Biopsieproben wurden aus Tumorzentren und Margen gewonnen; bei diesen Proben die Anwesenheit von H. pylori vacA
und cagA
Genotypen bewertet. Positiv H. pylori
betrug 38% und 26% in Biopsien von Magenkrebs und Nicht-Krebs-Gruppen erhalten, bzw. ( p
= 0,008) und 36% in den Tumorstellen. Bei Krebspatienten fanden wir eine bevorzugte Verteilung von H. pylori
im Fundus und Corpus, während im Nicht-Krebs-Gruppe, die Verteilung einheitlich war ( p
= 0,003). Eine Mehrheit der Biopsien waren gleichzeitig cagA
Gen-positive und -negative. Der Fundus und Korpus zeigte eine höhere Positivitätsrate für den cagA
Gen in der nicht-Krebs-Gruppe ( p
= 0,036). Eine Mischung aus cagA
Gen Größen war auch signifikant häufiger in dieser Gruppe ( p
= 0,003). Zweiundneunzig Prozent aller Probanden zeigten mehr als ein vacA
Gen Genotyp; S1b und m1 vacA
Genotypen wurden überwiegend in der Magenkrebs-Gruppe gefunden. Die höchste vacA
-genotype Signal-Sequenzdiversität wurde im Korpus und 5 cm von Tumorrändern gefunden.

Schlussfolgerung /Bedeutung

High H. pylori
Kolonisation Vielfalt, zusammen mit dem cagA
Gen wurde überwiegend im Fundus und Korpus von Patienten mit Magenkrebs gefunden. Der Genotyp Vielfalt über systematisches Ganzes Orgel und Tumor Probenahme beobachtet wurde, war bemerkenswert. Wir finden, dass es nicht genügend Beweise, um die Vereinigung von einem Isolat mit einer bestimmten Krankheit, aufgrund der multistrain Natur von H zu unterstützen. pylori
Infektion in dieser Arbeit gezeigt

Citation. López-Vidal Y, Ponce de León S, Castillo-Rojas G, Barreto-Zúñiga R, Torre-Delgadillo A (2008) Hohe Vielfalt vacA
und cagA Helicobacter pylori
Genotypen bei Patienten mit und ohne Magenkrebs. PLoS ONE 3 (12): e3849. doi: 10.1371 /journal.pone.0003849

Editor: Debbie Fox, das Forschungsinstitut für Kinder im Kinderkrankenhaus in New Orleans, Vereinigte Staaten von Amerika

Empfangen: 12. Mai 2008; Akzeptiert: 10. November 2008; Veröffentlicht: 3. Dezember 2008

© 2008 López-Vidal et al. Dies ist eine Open-Access-Artikel unter den Bedingungen der Lizenz Creative Commons, die uneingeschränkte Nutzung erlaubt, die Verteilung und Vervielfältigung in jedem Medium, vorausgesetzt, der ursprüngliche Autor und Quelle genannt werden

Finanzierung:. Diese Forschung wurde durch Gewährung DGAPA PAPIIT-IN207302 von der Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), UC-Mexus und CONACyT-México 47749-M finanziert. Die Geldgeber hatten keine Rolle in Studiendesign, Datenerfassung und Analyse, Entscheidung oder Vorbereitung des Manuskripts zur Veröffentlichung

Konkurrierende Interessen:.. Die Autoren haben erklärt, dass keine Interessenkonflikte bestehen

Einführung

Helicobacter pylori
ist ein Magen-Erreger, die fast 50% der Weltbevölkerung infiziert [1]. Es ist das wichtigste Erreger der chronisch-aktiven Gastritis angesehen und in der Regel als primäre Ursache von Magengeschwüren Krankheit akzeptiert wird; es ist auch ein bekannter Risikofaktor für Magenkrebs [2]. Magenkrebs Entwicklung hat sich gezeigt, mehrere Jahrzehnte erstrecken, nacheinander, beginnend mit H. pylori
Infektion und die Entwicklung von chronischer aktiver Gastritis [3]. Glandular Atrophie und intestinale Metaplasie schließlich in einer Untergruppe von Patienten auftreten und bei Magenkrebs [4] zu beenden. H. pylori
Infektion auf ein erhöhtes relatives Risiko (RR) -on der Größenordnung von vier bis neun klappbare für die Entwicklung von präkanzerösen Bedingungen im Magen, wurde vorgeschlagen, vor allem zu führen, wenn die Infektion während der Kindheit auftritt [5]. Da nur eine Minderheit von H. pylori
infiziertem Menschen entwickeln diese Krankheit, es wird vermutet, dass die Entwicklung der Krankheit auf die Expression von spezifischen bakteriellen Virulenz-Genen abhängig ist, zum Beispiel cagA
und vacA
[6] beide, sind hoch, unabhängig von dem Krankheitszustand des Wirts exprimiert [7], [8]. Die Assoziationen zwischen Magen-Topographie, die genotypische Vielfalt der H. pylori vacA
und cagA
Gene, und die Entwicklung von Magenkrebs bleibt umstritten. Das Ziel der vorliegenden Untersuchung war es, die Verteilung der vacA
und cagA
Genotypen von H zu bewerten. pylori
bei Patienten entlang der Magen mit und ohne Magenkrebs

Hypothese: a. höhere Frequenz von H. pylori
mit frühen Stadien von Magenkrebs in Verbindung gebracht.

Methoden

Die Patienten für die endoskopische Untersuchung genannt wegen Verdacht auf Krebs oder Dyspepsie eingeladen wurden, in einer Querschnitts prospektiven Studie teilnehmen . Alle Patienten mit Krebs enthalten waren, sowie diejenigen mit nicht-Geschwür Dyspepsie und /oder Magen-Reflux. Ausschlusskriterien enthalten Gerinnungsstörungen, nicht-steroidale entzündungshemmende (NSAID) der Einnahme von Arzneimitteln innerhalb der letzten 72 Stunden, portale Hypertension, und das Vorhandensein von Lymphomen in der histologischen Untersuchung.

Alle Patienten unterzeichnet eine schriftliche Einwilligungserklärung vor in der Studie auf die Teilnahme. Das Studienprotokoll wurde von der Institutional Review Board des Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán Anchondo (INCMNSZ), Registernummer CIBH-1081 genehmigt.

Obere gastrointestinale Endoskopie wurde nach einem Standardverfahren durchgeführt. Eine systematische Biopsie-Probenahmesystem wurde wie folgt verwendet: von jedem Patienten, drei Magen-Biopsien von jedem der vier Magen-Sites erhalten (Antrum, Abwinkelung, Korpus und Fundus). Von den Patienten mit Magenkrebs, zusätzliche Biopsien wurden vom Zentrum und dem Rand des Tumors und in einem Abstand von mindestens 2-5 cm von den Tumorgrenzen erhalten.

Alle pathologischen Proben von Patienten mit Magenkrebs nach der Lauren Einstufung als diffuse, Darm wurden von einem einzigen erfahrenen Pathologen ausgewertet und klassifiziert, oder Mischtyp [9]. Die Beschreibung von fortgeschrittenem Magenkrebs wurde auf der Borrmann Klassifizierung basiert [10]. Morphologische Magenfrühkarzinomen Sub-Typen wurden nach japanischen Endoscopy Society Richtlinien eingestuft [11], [12].

H. pylori
wurde durch Verschmieren Biopsieproben an der Oberfläche des Pferdeblut-Agarplatten (10% Pferdeblut in Casman Agar Basis [BBL Microbiology Systems, Cockeysville, MD, USA]) [8] kultiviert.

Die chromosomale DNA wurde extrahiert [13], und die H. pylori-16S-rRNA
und cagA
Gen PCR wurde wie zuvor beschrieben [7]. Die vacA
Signalsequenz und mittleren Bereich wurden durch allelischen typspezifische PCR getippt, wie Morales zuvor beschrieben et al.
[8].

cagA
variable Region Gen-Amplifikation. Die cagA
3 'Wiederholungsbereiche des H. pylori
in dieser Untersuchung untersuchten Stämme wurden entsprechend ihrer Länge (aufgrund des Vorhandenseins von einer variablen Anzahl von Wiederholungssequenzen in der 3'-Region des Gens). Die erhaltenen Amplifikationsprodukte wurden durch Größe in eine von drei Gruppen eingeteilt: kurz (906 bp); Medium (1.008 bp) und lange (1.110 bp) nach Karita et al
. [14]. Amplifikation wurde unter Verwendung von Primern cagRV17-F 5'-acc ctg gtc GGT AAT GGA TTA TCT-3 'und R cag22-5'-TTA aga ttt ttg gaa acc acc ttt t-3' durchgeführt, die auf Sequenzen basieren abgerufen entworfen wurden, von Genbank ALIG (wissenschaftliche und Bildungssoftware) und ClustalW (BCM Search Launcher, multiple Sequenz-Alignments) verwendet wird.

Daten für beschreibende Zwecke relativen Häufigkeiten und arithmetische Mittel (Standardabweichung [SD]) unter Verwendung analysiert wurden, wie als angemessen. Vergleiche zwischen den Gruppen wurden durch χ ausgeführt ^{2 Analyse sowie mit Fisher-Freeman-Halton-Exact-Test für Kreuztabellen. Die Magen-Krebs-Gruppe wurde mit nicht-Geschwür im Vergleich zu Patienten Dyspepsie und /oder Reflux. Krebspatienten wurden bereits für TNM-Stadium 0, I oder II und Fortgeschrittene für III geschichtet oder IV. Die Alpha-Ebene wurde auf 0,05 festgelegt. Da mehrere gleichzeitige Vergleiche durchgeführt wurden, wurde ein nominaler Alpha-Wert-Korrektur nach dem Bonferroni Verfahren eingeführt. Folglich gelten wir Assoziationen mit p
Werte zwischen 0,05 und 0,01 als suspekt. Im Gegensatz dazu ergibt sich bei der p
≤0.0063 Ebene einigermaßen signifikant betrachtet wurden. Werte zwischen 0,01 und 0,0063 wurden als marginal angesehen. Alle Analysen wurden mit Stata Statistik-Software (Intercooled Stata 7.0 für Windows 98/95 /NT-Paket, 2002) und Stat-Xact ausgeführt (v. 4.0.1., Cytel Software Corp., 1999).}

Ergebnisse

Zweiunddreißig Patienten wurden in die Studie eingeschlossen. Basierend auf endoskopische Diagnostik wurden 18 in den Magen-Krebs-Gruppe klassifiziert und 14 in den Nicht-Krebs-Gruppe. Durch histologische Nachweis von Magenlymphom hatte jedoch zwei Patienten in der Magenkrebs-Gruppe ausgeschlossen werden, 16 Personen in dieser Gruppe zu verlassen. Das Durchschnittsalter der Patienten in der Magenkrebs und dyspeptic Gruppen war 57,6 ± 16,7 Jahre (56% männlich) und 47,2 ± 13,3 Jahre (14% männlich) sind. Zehn Patienten (63%) zeigten eine diffuse Tumor nach der Lauren-Klassifikation. Fünf Patienten hatten Magenfrühkarzinomen (Typ I, drei, II, ein, IIB, ein) und 11 fortgeschrittenem Magenkrebs (Typ IIIA, vier, IIIB, drei, IV, vier) hatte nach der japanischen Forschungsgesellschaft für Magenkrebs Richtlinien und die Klassifizierung Borrmann.

In unserer 411 Biopsieproben, H. pylori und Videos entweder Kultur oder PCR in 38% (78/203) der Biopsie-Proben aus dem Magen-Krebs-Gruppe identifiziert wurde, 26% (54/208) der Nicht-Krebs-Gruppe ( p
= 0,008) und 36% (40/110) der Tumorstellen (siehe Tabellen 1 und 2). H. pylori
zeigte eine Differential topographische Verteilung bei Patienten mit Magenkrebs, mit einer höheren Positivitätsrate im Fundus und Corpus ( p
= 0,003), Tabelle 1. Die Gruppe Nicht-Krebs zeigte keine Differential topographische Verteilung . Eine etwas höhere Positivität von H. pylori
wurde in den Tumorstellen durch Kultur oder bei Tumorränder durch PCR gefunden; jedoch waren diese Erhöhungen in Positivität statistisch nicht signifikant (Tabelle 2). Es gab keine signifikante Korrelation zwischen dem H. pylori
Positivitätsrate und TNM Krebsstadium (früh vs. spät).

Wir fanden H. pylori-CagA
Positivität in 72% der Magen-Proben aus dem Magen-Krebs-Gruppe, 73% der Nicht-Krebs-Gruppe ( p
= NS) (Tabelle 3), und 83% des Tumors Websites ( p
= nicht signifikant [NS]). Die H. pylori-CagA
topographische Verteilung war statistisch nicht signifikant in der Magenkrebs-Gruppe, während die Nicht-Krebs-Gruppe eine höhere Positivitätsrate im Fundus und Corpus demonstriert; aber die Bedeutung dieser Befunde fraglich ist ( p
= 0,036) (Tabelle 3). in den Tumorstellen, fanden wir keine signifikanten Verteilungsmuster für das cagA
Positivität Fraktion, noch gab es einen Unterschied zwischen Patienten mit frühen und fortgeschrittenen Magenkrebs wieder.

Einundachtzig H. pylori
Stämme wurden untersucht (80 cagA
+), einschließlich 46 Stämme von Patienten mit Magenkrebs und 35 aus Nicht-Krebspatienten. Nur zwei cagA
Gen Größen wurden aus dem 80 H erhalten. pylori
Stämme untersucht; keiner der mehr cagA
Sequenzen wurden gefunden. In beiden Gruppen, die kürzere cagA
war die am häufigsten festgestellt. Die Ergebnisse in Tabelle 4 zusammengefasst Interessanterweise sowohl cagA
Größen wurden von 12 (15%) Stämme amplifiziert, was darauf hindeutet, dass diese Patienten-Koinfektion mit mehreren H waren. pylori
Stämme. Dieser Befund wurde häufiger erhalten in der Nicht-Krebs-Patienten-Gruppe (28,6%) als in der Magenkrebs-Gruppe (4,4%) ( p
= 0,003).

Die vorherrschende Signalsequenz Genotyp bei Patienten mit Magenkrebs, in 39% der Gruppe, war S1b. Die S1b /s2 Kombination war in 20% der Gruppe und s2 war in 12% vorhanden ist. Sechzehn Prozent der Patienten mit Magenkrebs hatte eine nicht identifizierbare Signalsequenz (s0). Es gab keine statistisch signifikante Verteilung von vacA
Genotypen über den Magen ( p
= NS) (siehe Abbildung 1). Die häufigste vacA
Genotyp in der Nicht-Krebs-Gruppe war s1b, die in 59% der Gruppe anwesend war, gefolgt von der S1A /S1b Kombination in 11% S1A /S1b /s2 in 7%, und eine nicht identifizierbare Signalsequenz in 9% ( p
= 0,06), Bild 1. die Analyse der topographischen Genotyp Verteilung zeigte, dass Genotyp S1b von vacA
vorherrschend war in allen Zonen (Fundus, Korpus Winkelabschnitt und Antrum) des Magens in den beiden untersuchten Gruppen (Abbildung S1). Wir fanden eine deutliche und marginal signifikanten Unterschied in den Verteilungsmustern dieser Genotypen zwischen den Krebs und Nicht-Krebs-Gruppen ( p
= 0,01). Sowohl der Korpus und Fundus der Magenkrebs-Gruppe zeigte eine größere Vielfalt der Signalsequenz Genotypen, wie das Corpus in der Nicht-Krebs-Gruppe (Abbildung S1) tat.

Die häufigste vacA
Genotypen für jede der Tumorstellen (Mitte und Rand des Tumors, und mindestens 2-5 cm von den Tumorgrenzen) waren S1b und s2, die in 19% vorhanden waren; S1A /S1b und S1b /s2 anwesend waren jeweils in 17%, und S1A /S1b /2, S1A /s2 und s0 in 8% vorhanden waren. Es gab keine signifikante Assoziation zwischen dem Genotyp und Tumorstelle der Umgebung (Abbildung 2). Die Verteilung dieses Genotyps in Tumor und anatomischen Stellen bei Patienten mit Krebs war statistisch nicht signifikant ( p
= 0,06) (Abbildungen 1 und 2). Eine signifikante Assoziation ( p
= 0,02) zwischen Genotyp und Tumorstadium identifiziert wurde: S1A /S1b, S1A /S1b /s2 und S1b /s2 Genotypen in der Magenfrühkarzinomen Gruppe vorherrschend waren, während S1b, s2 und S1A /s2 Genotypen waren relativ häufig in der erweiterten Gruppe Magenkrebs (Abbildung 3).

die häufigste mittleren Bereich Genotyp bei Patienten mit Magenkrebs war m1, die in 44% der Patienten vorlag , gefolgt von m0 (untypeable Genotyp) in 26%, m2 in 21% und die m1 /m2 Kombination in 10% (Abbildung 1). In der Nicht-Krebs-Gruppe, die am häufigsten vacA
Genotyp war m1, die in 52% der Patienten vorhanden war, gefolgt von m0 bei 32%, der m1 /m2-Kombination in 11%, und m2 in 5%; es gab eine deutliche Verteilungsmuster für diese Genotypen, mit einem fragwürdigen Signifikanzniveau ( p
= 0,03) (Abbildung 1). Analyse der topographischen Verteilung über anatomischen Zonen des Genotyps Mittelbereich zeigte, daß die M1-Genotyp war überwiegend (50%) in den Winkelabschnitt, wobei der verbleibende in den Fundus (48%) und dem Korpus (42%). Der m0 Genotyp war überwiegend in der Kieferhöhle (39%) in der Magenkrebs-Gruppe (Abbildung S1). In der Nicht-Krebs-Gruppe war die m1 Genotyp am häufigsten in den Fundus (77%); 56% war im Korpus, und von 43% in der Kieferhöhle. Der m0 Genotyp wurde im Winkelbereich (62%), wobei sich kein statistisch signifikanter Unterschied zwischen den Studiengruppen (Abbildung S1) erfasst. Eine nahezu gleichmäßige Verteilung der verschiedenen Genotypen wurden in den Tumorstellen, (Abbildung 2). Es gab keinen Unterschied zwischen anatomischen Zonen und Tumorstellen bei Patienten mit Magenkrebs (Abbildung 1 und 2) oder zwischen frühen und fortgeschrittenen Tumoren (Abbildung 3).

Die Tabelle 5 zeigt die Analyse der deutlichen vacA
Genotypen innerhalb jedes einzelnen, für die mehr als eine Biopsie gefunden wurde untersucht. Zweiundneunzig Prozent (12/13) der Krebspatienten hatten mehr als ein Genotyp vorhanden. Ein ähnliches Ergebnis wurde in dem Nicht-Krebs-Gruppe beobachtet. Drei Patienten in der Nicht-Krebs-Gruppe waren durchweg positiv für die cagA
Gen, und weitere drei besaßen beide Typen (positiv und negativ) gleichzeitig. In der Krebs-Gruppe waren sechs Personen positiv für cagA
und sieben für beide Typen. Keine Themen waren für dieses Gen durchweg negativ. Abbildung 4 zeigt die Anzahl der Biopsien pro Individuum und der Anzahl der verschiedenen vacA
Gen Signalsegment (SS) Genotypen. Die niedrigste Zahl von Genotypen bei Patienten mit 10 oder mehr Biopsien war zwei, und die höchsten war fünf

Diskussion

Die vorliegende Studie in vier wichtigsten Ergebnisse zur Folge. Zuerst H. pylori
wird gleichmäßig über den Magen bei Patienten verteilt nur Dyspepsie hat; zweite, H. pylori
hat eine Präferenz für den Fundus und dem corpus bei Patienten mit Magenkrebs; drittens, bei Patienten mit Dyspepsie, H. pylori-CagA
eine bevorzugte Verteilung im Fundus und Korpus hat, und es gibt eine hohe Frequenz von gemischten cagA
Größen; Viertens, die S1b Genotyp vorherrschend war in beiden Studiengruppen und der s1a Genotyp war nur in der dyspeptischen Gruppe.

Die hohe H. pylori
Positivität im Fundus von Patienten mit Magenkrebs durch war, auf seine Nähe zum Korpus, einer Zone, die in H besiedelt ist. pylori
-induzierte Gastritis. Corpus-vorherrschende Atrophie oder der Verlust von spezialisierten Drüsenzelltypen wie parietalen und Chief Zellen scheint für Krebsprogression kritisch zu sein [15], und es ist wahrscheinlich, dass der Fundus beteiligt ist entweder vor oder nach der Korpus in Eingriff ist bereits in Krebs.

Eine relativ hohe Positivität für H. pylori
wurde an der Tumor-Ort trotz vorheriger Aussagen, dass H gefunden. pylori
kann nicht in verkümmert Schleimhaut entwickeln und dass die intestinale Metaplasie ist eine ungünstige Milieu [16]. Tang et al.
Jedoch vorgeschlagen, dass H. pylori
könnte in dem Magenepithel in Gegenwart eines karzinogenen Läsion [17] überstehen. Es wurde auch spekuliert, dass bestimmte Virulenzfaktoren eine wichtige Rolle bei der Aufrechterhaltung der H spielen können. pylori
in der Magenschleimhaut [18].

In der vorliegenden Studie haben wir festgestellt, dass H. pylori
zeigt ähnliche Kolonisierung der anatomischen Regionen des Magens und der Tumorstelle. H. pylori
Positivität in frühen und fortgeschrittenen Gruppen Magenkrebs wurde auch als sehr ähnlich gefunden; Tang et al.
Jedoch beobachtet die inverse Ergebnisse [17]. Wir glauben, dass die zwischen diesen zwei Studien beobachtete Unterschied der Anzahl von Biopsien in jedem Patienten untersucht zurückzuführen ist; wir gezeigt, dass systematische Stichprobe die Assoziation von H modifiziert. pylori
mit Krankheit.

Eine höhere Prävalenz von H. pylori CagA
Gen-Positivität wurde im Corpus und Fundus von Patienten mit Dyspepsie gefunden. Zuvor Semino-Mora et al
. zeigte, dass dieses Muster bei Patienten mit Magenkrebs [19], obwohl wir Amplifikationsfragment cagA
in der vorliegenden Arbeit verwendeten nicht vorhanden ist, eine andere . Magen neoplastische Transformation induziert und aufrechterhalten, zumindest teilweise durch in vivo
intrazellulärem cagA
expression; Dieser Effekt könnte eine Rolle, nicht nur während der frühen Magen-Krebsentstehung spielen, aber auf der Basis unserer Daten, auch später in diesem Prozess [19] auftreten könnten. Wir beobachteten, dass 15% der Stämme eine Mischung aus besessen cagA
3 'Region Größen wiederholen, was auf das Vorhandensein von Co-Infektion mit mehreren H. pylori
Stämme, vor allem in der Nicht-Krebs-Gruppe. Kidd et al
unterschiedliche Ergebnisse erhalten. während diese Autoren eine höhere Anzahl von Patienten untersucht [20] untersuchten wir eine höhere Zahl von Magen-Biopsien von denen im Magen mehrere spezifische Stellen enthalten.

Wir beobachteten zuvor die Anwesenheit von genotypische Vielfalt im Corpus Magengeschwür [8]. Diese Vielfalt wurde vorgeschlagen, um die synergistische Wirkungen zu reflektieren, die mit diesem Verfahren verbunden sind [21]. Die vorherrschende vacA
Genotyp Signalsequenz in beiden Studiengruppen festgestellt wurde S1b, in Übereinstimmung mit unseren früheren Bericht [22].

Die wichtigsten Ergebnisse unserer Studie sind, dass es eine topographische Verteilung von die vacA
Signalsequenz wird der S1b Genotyp häufig im Zusammenhang mit der nicht-Krebs-Gruppe zugeordnet und die S1b /s2 Kombination oder s2 Genotypen werden ausschließlich in der Magen-Krebs-Gruppe gefunden. Keine früheren Studien über Personen mit Magenkrebs haben die vier Tumorzonen in der vorliegenden Arbeit ausgewertet betrachtet. Der s1c Genotyp wurde festgestellt, die am weitesten verbreitete Genotyp in Asien zu sein; aber seine Verbindung mit Magenkrebs abnimmt [22], [23]. Die Vielfalt der vacA
Genotyp von H. pylori
wurde durch eine Co-Evolution-Modell erklärt [21].

In Bezug auf vacA
Mittelbereich Allele, wir m1 und m2 Genotypen, in den beiden untersuchten Gruppen, die mit m1 die am häufigsten in den vorbestimmten Bereichen des bewerteten Magen [8].

in beiden untersuchten Gruppen Genotyp zu sein, fanden wir, H. pylori
Stämme, die für die Signalsequenz und mittleren Bereich Allele aufgrund signifikante Veränderung in der vacA
Gen untypeable waren [8], [24]. Wir fanden immer wieder, dass die cagA
- und vacA
-Allel Vielfalt war größer in den Tumor, was darauf hindeutet, dass H. pylori
kann, ohne Umweltbelastung im Tumor bleiben.

Die genotypische Vielfalt über systematische ganze Organe und Tumoren in der vorliegenden Arbeit beobachtet wurde, war bemerkenswert. Die wichtigste praktische Bedeutung dieser Erkenntnis ist die Notwendigkeit, für einen ähnlichen Anspruch auf Vollständigkeit Stichprobenplan zu suchen, um einen Pathogenitätsfaktor mit der Krankheit zu assoziieren. Wir fanden, dass die Zuordnung eines einzigen Isolat-abgeleitet von einer einzigen Biopsie mit der Krankheit aufgrund der multistrain Natur nicht ausreichend ist H. pylori
in der vorliegenden Arbeit gezeigt Infektion.

Die Einschränkungen dieser Studie sind in Bezug auf seine Beobachtungs Natur und ihrer Querschnittsdesign. Wir können die Möglichkeit nicht ausschließen, dass es eine verwirrende Variable sowohl mit der Gegenwart des Helicobacter pylori
Infektion und Krebs oder dyspeptischen Status verbunden ist. Zusätzlich verhindert der Mangel an einer Längs Follow-up von uns das sequentielle Auftreten der Ereignisse zu bestätigen, wie die Entwicklung von Krebs und die anfängliche Infektion mit dem Stamm (s) von Helicobacter pylori
die schließlich festgestellt wurden.

Interessenkonflikt

Die Autoren erklären, keine Interessenkonflikte.

Hintergrundinformationen
Abbildung S1. .
Topographische Signalsequenz und mittleren Bereich Allelverteilung des vacA-Gens bei Patienten mit und ohne Magenkrebs
doi: 10.1371 /journal.pone.0003849.s001
(3,81 MB TIF)

Acknowledgments

Wir danken Rosa Isabel Amieva-Fernández, Ana Karina Martínez-Díaz, Leonor Jacobo-Albavera, und Fernando Vargas-Romero für hervorragende technische Unterstützung bei der DNA-Amplifikation.

• PLoS ONE: Hypoxie-induzierbaren Faktor 1α Bestimmt Magenkrebs Chemosensitivity über Modulation von p53 und NF-kappaB
• PLoS ONE: intratumorale Heterogenität von HER2, FGFR2-, cMET und ATM in Magenkrebs: Optimierung der personalisierten Medizin durch innovative Pathologische und statistische Analyse