PLoS One: Plazma mikroRNS, a miR-223, miR-21 és miR-218, a Novel potenciális biomarkerek gyomorrák érzékelés

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

A mikroRNS (miRNS), endogén kis nem-kódoló RNS-ek, amelyek stabilan kimutatható a humán plazmában. A korai diagnózis a gyomorrák (GC) is nagyon fontos, hogy javítsa a terápia hatása és meghosszabbítja a betegek túlélését. Célunk az volt, hogy azonosítsa, hogy négy miRNS (miR-223, miR-21, miR-218 és miR-25) szorosan kapcsolódik a tumorigenezis vagy áttét a GC szolgálhat új potenciális biomarkerek GC kimutatására. Katalógusa

Módszertan

kezdetben mért plazmaszintje a négy miRNS-ek 10 GC beteg és 10 egészséges kontroll alanyok által kvantitatív reverz transzkripciós polimeráz-láncreakció (qRT-PCR), majd a szemben a plazma miRNS eredmények azzal a kifejezések rákos szövet nyolc GC betegeknél. Végül, az miR-223, miR-21 és miR-218, a plazmát érvényesített 60 GC betegek és 60 egészséges kontroll személy, és a területek a vevő működési karakterisztika (ROC) görbék ezen miRNS elemezték.

Eredmények katalógusa

Azt találtuk, hogy a plazmaszintje miR-223 ( P katalógusa < 0,001) és a miR-21 ( P katalógusa < 0,001) szignifikánsan magasabb volt a GC betegekben, mint az egészséges kontroll, míg a miR-218 ( P katalógusa < 0,001) szignifikánsan alacsonyabb volt. A ROC analízis engedett AUC értékei 0,9089 a miR-223, 0,7944 a miR-21 és 0,7432 a miR-218, és a kombinált ROC analízis kimutatta a legmagasabb AUC értéke 0,9531 lehet megkülönböztetni GC betegek egészséges kontroll. Sőt, a plazmaszintje miR-223 ( P katalógusa < 0,001) és a miR-21 ( P katalógusa = 0,003) szignifikánsan magasabb volt GC stádiumú én, mint az egészségesekben. Továbbá a plazmaszintje miR-223 szignifikánsan magasabb volt a GC betegek Helicobacter pylori katalógusa (Hp) fertőzés, mint azoknál, akik nem ( P katalógusa = 0,014), és jelentősen magasabb az egészséges kontroll személyek a Hp fertőzés, mint azoknál, akik nem ( P katalógusa = 0,016). katalógusa

Következtetések katalógusa

plazma miR-223, miR-21 és miR-218 újak potenciális biomarkerek GC kimutatására .

bevezető hivatkozás: Li Bs, Zhao Yl, Guo G, Li W, Zhu Ed, Luo X, et al. (2012) Plazma mikroRNS, a miR-223, miR-21 és miR-218, a Novel potenciális biomarkerek gyomorrák Detection. PLoS ONE 7 (7): e41629. doi: 10,1371 /journal.pone.0041629 katalógusa

Szerkesztő: Ajay Goel, Baylor University Medical Center, Amerikai Egyesült Államok katalógusa

Beérkezett: december 21, 2011; Elfogadva: június 27, 2012; Megjelent: július 30, 2012 katalógusa

Copyright: © Li et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka támogatott a támogatás Természettudományi Alapítvány Kína (NSFC, No. 81071412). A finanszírozók volt szerepe az adatok gyűjtése és elemzése, de nem szerepe a vizsgálatban tervezés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető katalógusa

a gyomorrák a negyedik leggyakoribb rosszindulatú daganat a világon, és a második vezető daganatos halálok mindkét nemnél világszerte. A legmagasabb a halálozási ráták becslése kelet-ázsiai [1]. Az 5 éves túlélés a gyomorrák kevesebb, mint 20% -25% az Egyesült Államokban, Európában és Kínában. [2] Jelenleg a teljes sebészi eltávolítást a leghatékonyabb kezelés, mely kiváló (90%) az esélye a gyógymód betegek korai gyomorrák [3]. Az előrehaladott gyomorrák, annak ellenére, kuratív műtét, körülbelül 80% -a a beteg hal meg rövid idő lokoregionális kiújulás (87%) és /vagy a távoli metasztázis (30%) [4]. Ezért javulás korai diagnózis növelheti az esélyt egy kúra elején GC betegek vagy meghosszabbítja a betegek túlélési korai stádiumú GC. Azonban a legtöbb korai stádiumú GC nehéz észlelni [5]. A hagyományos szérum markerek GC, mint például a szénhidrát antigén 19-9 (CA19-9) és karcinoembrionális antigén (CEA), nem rendelkeznek elegendő érzékenységet és specificitást, hogy megkönnyítsék a korai felismerés.

A mikroRNS (miRNS-ek) között a kis, nem -coding RNS hogy poszttranszkripciós génexpressziót. Aberráns expresszióját miRNS összefüggésbe hozták számos betegség, beleértve a rákot [6]. Korábbi tanulmányok azt mutatták, hogy a szöveti miRNS expressziós profilok lehet tekinteni, mint diagnosztikai biomarkerek rák [7] - [9]. Azonban ez a diagnosztikai módszer korlátozott annak hatékonyságában, szövetmintából nem kényelmes hozzáférést és invazív szerezni. Egyre több papírok számoltak be, hogy a keringő miRNS stabilan kimutatni a különböző testnedvek, beleértve a szérum és plazma [10], [11]. A keringő miRNS mint új, stabil biomarkerek lenne az egyik legígéretesebb eszköze a diagnózis, mert a plazma és a szérum könnyen hozzáférhetők és nem invazív megszerezni. Az utóbbi időben több ígéretes szérum vagy plazma miRNS biomarkerek GC kimutatására azonosítottak [12], [13]. Katalógusa

Hogy vizsgálja, hogy az új plazma miRNS aláírásokat lehet megkülönböztetni betegek GC (különösen a korai szakaszban GC) egészséges ellenőrzések kiválasztottunk négy miRNS (miR-223, miR-218, miR-25 és miR-21), amelyet előzőleg közölték, hogy gyakran megbomlik GC szövetek és szorosan összefügg a tumorigenezis vagy metasztázis GC [14] - [21] . Feltételeztük, hogy a plazmában három miRNS (miR-223, miR-218 és miR-25) volt aberráns GC betegek, valamint azok a miR-21, ami arra utalt, hogy ezt az aláírást is szolgálhat biomarker GC kimutatására [12]. Azonban a plazmaszintek miR-21 GC betegek különböző TNM szakaszaiban nem azonosítottak. Ebben a vizsgálatban összehasonlítottuk a vérplazmában a négy miRNS GC betegek és az egészséges kontrollok, és értékelte a megvalósíthatóságát a négy miRNS mint új noninvazív biomarkerek GC kimutatására. Katalógusa

Anyagok és módszerek katalógusa

a betegek és a mintákat

Minden gyűjtöttünk együttműködő személyek jegyzőkönyveknek megfelelően jóváhagyta az etikai bizottsága a harmadik Katonai Orvosi Egyetem. Összesen 70 beteg GC mielőtt bármilyen kezelést és 70 egészséges kontroll alanyok Southwest Hospital (Chongqing, Kína) vontuk be a vizsgálat 2010 és 2011 között A 70. GC betegek, elemeztük a szövettani típus a GC szövetekben, köztük 56 adenocarcinoma, 13 Mucinosus adenokarcinóma és 1 pecsétgyûrûsejtes karcinóma és meghatároztuk a tumor helyszíneken, többek között a 34 gyomor- test, 24 gyomor antrumban, 8 cardia és 4 másik (felső gyomor, gyomor szög, gyomor csonkja). A GC betegeket megfelelően kell besorolni klinikai TNM szakaszában, beleértve a 12 szakasz I (medián életkor: 53 év [tartomány, 36-70 év]; 8 férfi, 4 nő), 11 szakasz II (átlagéletkor 61 év [tartomány, 36-77 év]; 7 férfi, 4 nő), 36 színpadi III (átlagéletkor 55 év [tartomány, 30-71 év]; 26 férfi, 10 nő), és a 11. szakasz IV (medián életkor: 53 év [tartomány , 46-66 év], 9 férfi, 2 nő) .A állapotát Hp fertőzés teszteltük Anti-HP antitestek ELISA diagnosztikai kitek (S20010005), (Peking BEIER BIOENGINEERING CO., LTD), amely 43 GC betegek Hp fertőzés és 27 nélkül. A 70 egészséges kontroll alanyok, 44 férfi és 26 nő volt benne, és a medián életkor 51 év volt [tartomány, 26-75 év]. Az eredmények a Hp fertőzés teszt azt mutatta, 31 egészséges kontroll alanyok Hp fertőzés és 39 nélkül. (1. táblázat).

sejtmentes plazmát izolálunk Minden vérmintát 2 órán belül a gyűjtemény segítségével egy kétlépéses protokollt (1500 rpm, 10 perc, 12000 rpm-mel 2 percig), hogy megakadályozzák a szennyeződés a celluláris nukleinsavak. A plazma átvittük egy friss csőbe, így egy fix magasság 0,5 cm vérplazma-felülúszóból felett az üledéket, hogy ne zavarják a pellet [11]. Ezt -80 ° C-on 450 ul aliquot. Nyolc pár szöveti mintákat gyűjtöttünk nyolc GC betegek magasabb plazma miR-223 és miR-21, és alacsonyabb a plazma miR-218, mint az egészséges kontrollok műtéti eltávolítása után, és körülbelül vágott 1 mm-es négyzetekre és azonnal lefagyasztottuk folyékony nitrogénben.

RNS kivonása

Teljes RNS-eket extraháljuk 400 ul plazmát a Mirvana PARIS Kit (Ambion), a gyártó protokollja, és eluáljuk 105 ul előre melegített ( 95 ° C) elúciós oldat. Annak érdekében, hogy normalizálására minta-To-minta variáció az RNS izolációs lépésben 10 ul 0,05 uM szintetikus C. elegans
miR-39 (szintetikus RNS oligo-nukleotidok által szintetizált GenePharma) adunk minden egyes denaturált minta után egyesíti a plazma mintát denaturáló oldattal [11]. Fagyasztott szövetek teljes RNS-t extraháltunk TRIzol reagens (Invitrogen) alkalmazásával a gyártó protokollja, és végül újra szuszpendáljuk 60

• PLoS One: A meta-analízis interleukin-10 -592 promoter polimorfizmus társult gyomorkarcinóma Risk
• PLoS One: β, β-Dimethylacrylshikonin indukál mitokondrium függő apoptózis révén ERK Humán gyomorkarcinóma SGC-7901 Cells