PLoS One: Helicobacter pylori fertőzés szinergista Három gyulladással kapcsolatos genetikai variánsai a GWASs növeli a kockázatot a gyomorrák a kínai népesség

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

Három legutóbbi genomot egyesület tanulmányok (GWASs) számolt be, hogy három SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) található gének kapcsolódó fogadó gyulladásos válasz lényegesen kapcsolódó a fogékonyság gyomorrák (GC) kínai populációban. Helicobacter pylori
fertőzés is fontos kockázati tényező a GC keresztül okozó gyulladásos válasz a gyomor nyálkahártyáját. Azonban nem tanulmány megállapította, hogy vannak olyan lehetséges gén-környezet interakció közötti genetikai variánsok és H. pylori katalógusa fertőzés kockázatának GC. katalógusa

Módszerek katalógusa

genotipizált három polimorfizmus (rs4072037 a 1q22, rs13361707 a 5p13 és rs2274223 a 10q23) 335 kínai gyomor adenokarcinóma betegek és 334 ellenőrzéseket. H. pylori
szerológia vizsgáltuk enzimmel kapcsolt immunszorbens vizsgálattal. Többváltozós logisztikus regressziós modellt alkalmaztunk, hogy értékelje a változók közti kapcsolat és GC kockázat. Katalógusa

Eredmények katalógusa

megerősítette, hogy a három SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) szignifikáns összefüggést mutattak a GC érzékenység. H. pylori fertőzés katalógusa is jelentős mértékben növelte a GC. Emellett nem volt közös hatások között H. pylori
fertőzés és a három SNP-k a kockázata GC. A legnagyobb kockázata megnövekedett GC találták alanyok H. pylori katalógusa szeropozitivitás és AA genotípus az rs4072037 [esélyhányados (OR) 3,95; 95% -os konfidencia intervallum (CI), 2,29-6,79], H. pylori
szeropozitivitás és CT /CC genotípusok rs13361707 (OR 2,68; 95% CI, 1,62-4,43), H. pylori
szeropozitivitás és AG /GG genotípusok rs2274223 (OR 2,45; 95% CI, 1,55-3,88), mint azok, amelyek H. pylori
szeronegativitás és más genotípusok egyes SNP. Jelentős figyeltek meg kölcsönhatásokat H. pylori katalógusa szeropozitivitás és a három SNP (összes P katalógusa _{G x E < 0,05), hogy a kockázatot a GC. katalógusa}

Következtetés katalógusa

Ezek az eredmények azt mutatják, hogy a három SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) azonosított GWASs kölcsönhatásba léphet H. pylori
fertőzés növeli a GC.

bevezető hivatkozás: Li M, Huang L, Qiu H, Fu Q, Li W, Yu Q, et al. (2013) Helicobacter pylori fertőzés katalógusa szinergista Három gyulladással kapcsolatos genetikai variánsai a GWASs növeli a kockázatot a gyomorrák a kínai népesség. PLoS ONE 8 (9): e74976. doi: 10,1371 /journal.pone.0074976 katalógusa

Szerkesztő: Qing-Yi Wei, a University of Texas MD Anderson Cancer Center, Amerikai Egyesült Államok katalógusa

Beérkezett: január 28, 2013; Elfogadva: augusztus 12, 2013; Megjelent: szeptember 19, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Li et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka támogatott Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína (N0. 81.071.832, N0. 81272492). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák (GC) egy világszerte betegség és a második leggyakoribb oka a rák összefüggő halálesetek [1]. Az előfordulási GC földrajzilag változó és 70% az új megbetegedések és halálesetek fordulnak elő a fejlődő országokban. Kínában, 0,4 millió új esetet és 0,3 millió ember halálát okozza becsültük GC 2005-ben [2]; Ezért megelőzésére és szabályozására ez rosszindulatú daganat továbbra is kulcsfontosságú közegészségügyi kérdés. Széles körben elfogadott, hogy a gyomor carcinogenesis multifaktoriális folyamat, amely összefügg az életmóddal (például a dohányzás, az alacsony zöldség /gyümölcs fogyasztás és a magas só /nitrát bevitel), társadalmi-gazdasági helyzet, vészes vérszegénység, Helicobacter pylori fertőzés katalógusa, és a fogadó polimorfizmusok [3,4]. katalógusa

H. pylori fertőzés katalógusa jól rizikófaktor gyomor karcinogenezis és besorolása az I. osztályú emberi rákkeltő anyagok a World Health Organization (WHO) az epidemiológiai bizonyítékok [5]. Prevalenciája H. pylori katalógusa magasabb a fejlődő, mint a fejlett országokban. [6] H. pylori
lehet betartani, hogy a fogadó gyomornyálkahártya és okoz átmenet a normális nyálkahártya krónikus felszínes gastritis, ami aztán növeli a atrófiás gasztritisz és intesztinális metaplázia, és végül kialakulásához vezet a GC néhány a fertőzött egyének több éven [4]. Bár GC társul H. pylori
fertőzés a gyomor, csak egy kis hányada kitett egyének fejlesztése ezt a közös malignitás élete során, jelezve a fontos szerepet a fogadó genetikai tényezők a etiológiájában GC.

A közelmúltban, három genome- szintű asszociációs vizsgálatok (GWASs) kapcsolódó GC a kínai lakosság tették közzé [7-9]. Ezek a vizsgálatok azonosított néhány új genetikai fogékonyság iokusza GC egy nagy minta a kínai lakosság. Ezek érzékenység loci utóbb lesz egy új kutatások középpontjába, és fontos, hogy megértsék a patogenezis és prognózisa GC [10,11]. A jelenlegi tanulmányban különösen érdekelt a három GWAS azonosított egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) találhatók kapcsolatos gének fogadó gyulladásos válaszokat. Közülük, rs4072037 a 1q22 egy szinonim SNP második exonjában mucin1 (MUC1), amely kapcsolatban van a csillapítást intracelluláris szintjét a reaktív oxigéngyökök (ROS), valamint az epithelialis fertőző és gyulladásos betegségek [12]. Rs13361707 az index SNP közül több az egész 5p13.1 régióban társított GC fogékonyság GWAS [9], és ez található, közel a gént prosztaglandin E receptor 4 (PTGER4). PTGER4 egy prosztaglandin (PG) E2-receptor, hogy a fő termék a ciklooxigenáz (COX) -2, amely fontos szerepet játszik az immunválaszban. Emellett, rs2274223 lokalizálódik a 26. exon a foszfolipáz C ε1 (PLCE1), tagja a PLC fehérje család, amely kapcsolódik a kifejezés a gyulladás faktorok tumor-asszociált gyulladás [13].

Azt egyre inkább elfogadott, hogy az etiológiája és mechanizmusa GC, nem csak a genetika vagy a környezeti tényezők önmagukban, hanem a közöttük lévő interakciókat [14]. Számos tanulmány kimutatta, hogy a H. pylori
fertőzés társul polimorfizmusainak néhány gyulladásos tényezők befolyásolják a kockázata GC [15,16]. Ahhoz azonban, hogy a legjobb tudásunk, nem végeztek vizsgálatot a lehetséges gén-környezet közötti kölcsönhatásokat H. pylori
fertőzés, és a fenti genetikai lókuszok annak a kockázata, GC. A jelenlegi független eset-kontroll vizsgálatban 335 GC esetekben és 334 vezérlők a kínai népesség végeztek, hogy vizsgálja meg a lehetséges kölcsönhatásokat a három SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) és a H. pylori katalógusa fertőzés kockázatának GC. katalógusa

Anyagok és módszerek katalógusa

Vizsgálati csoport és adatgyűjtés katalógusa

Minden vizsgálatban résztvevők írásos beleegyezését adta előtt vérmintákat gyűjtöttünk. A tanulmány által jóváhagyott Etikai Bizottsága Tongji Medical College. Összesen 335 GC betegek egymás válogattunk be a Tongji Kórház Huazhong Egyetem Természettudományi és Technológiai 2011. február 2012. augusztus Minden esetet az újonnan diagnosztizált és szövettanilag is megerősítették gyomor adenokarcinóma nélkül egy korábbi rosszindulatú daganat bármely más szerv vagy daganatellenes terápia előtt vérminta levételét. A tumor-node-metasztázis (TNM) szakaszában alapján értékeltük az American Joint Committee on Cancer Cancer Staging Manual, 6. kiadás. Továbbá, a betegek, akik kaptak semmilyen vérátömlesztés volt az elmúlt 6 hónapban, vagy akiket immunszuppresszív terápiában részesülő betegeket kizárták. Háromszáz harmincnégy rák-mentes ellenőrzéseket véletlenszerűen kiválasztott egyének, akik mentek keresztül az egészségügyi vizsgálat ugyanabban a kórházban egy időben. A felvétel kritériumai kontrollok hiánya történelem rák és frekvencia-egyezés az esetekben az életkor (± 5 év) és a szex. Az összes esetek és kontrollok voltak genetikailag nem rokon, és csak han kínai etnikum. Demográfiai és epidemiológiai adatok, köztük az életkor, a nem, az etnikai hovatartozás, a testtömegindex (BMI, számítva a testtömeg kilogramm, magassága méterben képlet szerint: kg /m ^{2), a dohányzás és az alkohol állapotát, kórtörténetét és családjában rákos rögzítettük egy kérdőív segítségével face-to-face interjúk képzett orvos vagy orvostanhallgató. A kinevezés után 5 ml perifériás vénás vért vettünk minden résztvevőtől. Katalógusa}

Válogatás a SNP és genotípusmeghatározó katalógusa

Régebben a National Center for Biotechnology Information (NCBI) 's PubMed adatbázis (http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/). Sok újonnan azonosított érzékenység lókuszai nemrég közzétett GWASs GC Kínában [7-9]. Mi csak a kiválasztott SNP található gének kapcsolódó fogadó gyulladásos válaszokat. Mivel öt SNP a gén PLCE1 a 10q23 volt erős páros kapcsolódási egyenlőtlenség (LD) a GWAS [7], úgy döntöttünk, a legjelentősebb nonsynonymous változatok. Ezért három ilyen SNP, rs4072037 a 1q22, rs13361707 a 5p13 és rs2274223 a 10q23 vontunk be a vizsgálatba. A genomiális DNS-t extraháltunk perifériás vér felhasználásával Fuji teljes vér DNS készlettel (Fujifilm Corporation, Tokió, Japán), a gyártó utasításait, és -80 ° C-on a felhasználásig. Három SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) mind a genotípus TaqMan assay ABI 7900HT valós idejű PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) az előzőekben leírtak szerint [17]. A hívás arányát az egyes SNP volt > 95%. A genotipizálás eredményeket analizáltuk SDS 2.3 allél diszkrimináció szoftver (Applied Biosystems). Tíz százalék a mintákat véletlenszerűen kiválasztott ismételt genotipizáláson és az eredmény 100% az egyezés. Katalógusa

H. pylori katalógusa szerológiai vizsgálat katalógusa

teszteltük H. pylori fertőzés
Egy H. pylori
IgG enzimmel kapcsolt immunoszorbens assay (ELISA) kit (Shenzhen Yahuilong Biotech Company, Shenzhen, Kína), a gyártó utasításai szerint. Minták optikai denzitás (OD) leolvasott magasabb, mint a küszöbérték 10AU /ml úgy tekintettünk, hogy H. pylori
szeropozitivitást. Azt is véletlenszerűen választottuk 10%, a minták és a kapott 95,5% -os egyezést a ismételt vizsgálatokkal. Katalógusa

A statisztikai elemzés katalógusa

A χ ^{2 tesztet használtuk, hogy vizsgálja meg a forgalmazási demográfiai jellemzők közül a GC és a kontroll csoport szempontjából nem, életkor, BMI, dohányzás, az alkoholfogyasztás, a H. pylori fertőzés
. Hardy-Weinberg egyes SNP kiértékelését a jóságát fit χ 2 teszt között az ellenőrzések. Logisztikus regressziót alkalmaztunk, hogy elemezzék korrigált esélyhányados (OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) a vizsgált SNP-k, külön-külön vagy együttesen, annak a kockázatát, GC. Gene × környezet interakciós számítottuk elvégzésével 1 fokos szabadságfokú Wald teszt egyetlen kölcsönhatás paraméter (gén × H. Pylori fertőzés katalógusa) logisztikus regresszió az életkor, a nem, a BMI, a dohányzás és az alkoholfogyasztás állapot kovariánsként korábban leírtak máshol. [18] Egyesület elemzése H. pylori katalógusa szerológiai és genotípusok tovább rétegezni TNM daganat stádiuma. Benjamini és Hochberg módszerét alkalmaztuk, hogy állítsa P
értékek többszörös tesztelés, hogy minimalizálja a lehetőségét, 1-es típusú hiba. Minden adat analíziseket az SPSS for Windows 17.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA). Minden statisztikai tesztek kétoldalas, és P katalógusa < 0,05 fogadtuk el statisztikailag szignifikánsnak. Katalógusa}

Eredmények katalógusa

Jellemzői vizsgálati alanyok katalógusa

A frekvencia megoszlása ​​nem, kor, BMI, dohányzás, az alkoholfogyasztás, a H. pylori katalógusa fertőzés tünetei és a GC esetek és kontrollok 1. táblázat foglalja össze Két jellemző, dohányzási és H. pylori fertőzés katalógusa, szignifikánsan gyakoribb esetben GC, mint a kontrollcsoportban ( P = 0,002 katalógusa a dohányzási és P katalógusa = 0,0003 A H. pylori katalógusa fertőzés). Nem volt szignifikáns különbség a megoszlása ​​életkor, nem, BMI és az ivás állapot közötti esetek és a kontrollok. A 335 GC esetben 78 (23,3%) minősült cardia GC és 257 (76,7%), mint a nem-cardia GC. Emellett 96 esetben (28,7%) bemutatott színpadi I /II és 239 (71,3%) stádiumú III /IV-betegség. Katalógusa változók
esetekben ( n katalógusa = 335)
Controls ( n katalógusa = 334) hotelben P katalógusa érték ^{a
n katalógusa
% Matton n Matton% Matton Age (years)0.575<404212.53410.240–6020460.920461.1>608926.69628.7Sex0.660Male23068.722467.1Female10531.311032.9Body mass index (kg /m 2) 0,806 < 18.5144.2113.318.5-23.916649.617552.4≥2415546.314844.3Smoking status0.002Never18755.822667.7Ever14844.210832.3Drinking status0.450Never21463.922366.8Ever12136.111133.2 H. pylori
infection0.0003Never13239.417853.3Ever20360.615647.7Tumor positionCardia7823.3Non-cardia25776.7TNM stageI vagy II9628.7III vagy IV23971.3Table 1. megoszlása ​​kiválasztott változók betegeknél GC és a rák-mentes ellenőrzéseket. katalógusa aχ 2 teszt közötti megoszlása ​​esetek és a kontrollok. CSV letöltése CSV}

Szövetsége rs4072037, rs13361707 és rs2274223 kockázatával GC katalógusa

A genotípus eloszlása ​​ezen változatok közül az ellenőrzések voltak összhangban Hardy-Weinberg ( P katalógusa = 0,242 az rs4072037, P katalógusa = 0,985 az rs13361707 és P katalógusa = 0.184 az rs2274223). A genotípus és allél frekvenciák a három SNP között esetek és a kontrollok és az egyesület kockázata GC táblázat 2. egyének minden variáns allél a három SNP szignifikáns összefüggést a megváltozott kockázat GC korrekció után nem, a kor , BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát, és H. pylori katalógusa szerológiai meg allél szint (korrigált OR = 0,51, 95% CI: 0,37-0,69 az rs4072037; korrigált OR = 1,46, 95% CI: 1,17-1,82 számára r13361707 és korrigált OR = 1,31, 95% CI: 1,00 -1,71 az rs2274223). Ugyanakkor a domináns modell, amelyben genotípusok egy vagy két variáns allélt feltételezhetően az ugyanolyan betegség kockázata, mint a széles típus genotípusok, nincs szignifikáns kapcsolat volt megfigyelhető rs2274223 és a kockázat a GC (korrigált OR = 1,33, 95% CI : 0,97-1,84; P katalógusa = 0,079). Továbbá alcsoport elemzés szerint rétegzett tumor helyén jött létre, hogy értékelje az egyesület a genetikai variánsai három SNP kockázati altípusa GC (táblázat S1). Az uralkodó modellekkel, G hordozói rs4072037 következetesen szignifikánsan csökkent kockázatával GC között mind a két alcsoportra, míg a rs13361707-C hordozók csak összefüggött egy szignifikánsan megnő a nem-cardia GC (korrigált OR = 1,74, 95% CI: 1,17-2,57; P katalógusa = 0,006) és az rs2274223 G fuvarozók csak összefüggött egy szignifikánsan emelkedett kockázatát cardia GC (korrigált OR = 2,28, 95% CI: 1,38-3,80; P katalógusa = 0,001). katalógusa SNP katalógusa genotípusok katalógusa Controls ( n katalógusa = 334) hotelben esetekben ( n katalógusa = 335)
P katalógusa érték ^{egy fiatal korrigált OR egy (95% CI) hotelben Rs4072037AA220 (65,9) 266 (79,4) 1,00 (ref.) AG98 (29,3) 64 (19,1 ) 0.0010.53 (0,37-0,77) GG16 (4,8) 5 (1,5) 0.0170.28 (0.10-0.80) AG + GG114 (34,1) 69 (20,6) 1,3 × 10 -4 b0.50 (0,35-0,71 ) AlleleA538 (80,5) 596 (89,0) 1,00 (ref.) G130 (19,5) 74 (11,0) 2,0 × 10 -5 c0.51 (0,37-0,69) Rs13361707TT102 (30,5) 71 (21,2) 1,00 (ref. ) CT165 (49,4) 167 (49,9) 0.0531.46 (0.99-2.12) CC67 (20,1) 97 (29,0) 0.0012.10 (1.34-3.26) CT + CC232 (69,5) 264 (78,8) 0,007 b1.64 (1,14-2,34) AlleleT369 (55,2) 309 (46,1) 1,00 (ref.) C299 (44,8) 361 (53,9) 0,001 c1.46 (1,17-1,82) Rs2274223AA217 (65,0) 197 (58,8) 1,00 (ref. ) AG109 (32,6) 122 (36,4) 0.1701.26 (0.91-1.75) GG8 (2,4) 16 (4,8) 0.0622.33 (0.96-5.65) AG + GG117 (35,0) 138 (41,2) 0,079 b1.33 (0,97-1,84) AlleleA543 (81,3) 516 (77,0) 1,00 (ref.) G125 (18,7) 154 (23,0) 0,047 c1.31 (1,00-1,71) 2. táblázat genotípusok és allélek a három SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) és ezek kapcsolata GC kockázatát.
aAdjusted korra, nemre, BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát, és H. pylori katalógusa szerológiai logisztikus regresszió model.bfor domináns genetikai models.cat allél szinten. CSV letöltése CSV}

Közös hatásait H. pylori katalógusa szeropozitivitás és változatai rs4072037, rs13361707 és rs2274223 veszélyére GC katalógusa

Arra törekedtünk, hogy tisztázza a hatását a lehetséges kölcsönhatások között változatai a három SNP és H. pylori
szeropozitivitás a kockázata GC (3. táblázat). A kockázat a GC-ben jelentősen emelkedett, akiknél a H. pylori fertőzés katalógusa (OR 1,75; 95% CI: 1,28-2,40), kiigazítva az nem, életkor, BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapot (nem közölt adatok). Összehasonlítva egyének rs4072037 AG /GG genotípus és a H. pylori katalógusa szeronegativitás, azok az AA genotípus és a H. pylori katalógusa szeronegativitás azt találtuk, hogy egy OR 2,46 (95% CI, 1,42-4,27) GC kockázat, akiknek AG /GG genotípus és a H. pylori katalógusa szeropozitivitás jártak OR 2,30 (95% CI, 1,23-4,31) és az AA genotípus és a H. pylori katalógusa szeropozitivitás jártak OR 3,95 (95% CI, 2,29-6,79). Hasonlóképpen, míg egyének rs13361707 TT genotípusok és H. pylori katalógusa szeronegativitás a kockázata, GC megnövelt körében TC /CC genotípus és a H. pylori katalógusa szeronegativitás (OR 1,50; 95% CI, 0,90-2,50), és a TT genotípusok és a H. pylori katalógusa szeropozitivitás (OR 1,51; 95% CI, 0,81-2,80). A kockázat csak jelentősen emelkedett a csoport TC /CC genotípus és a H. pylori katalógusa szeropozitivitás (OR 2,68; 95% CI, 1,62-4,43). Továbbá, míg a egyének rs2274223 AA genotípus és H. pylori katalógusa szeronegativitás, egyének AG /GG genotípus és a H. pylori
szeronegativitás volt szinte változatlan kockázata GC (OR: 1,01; 95% CI, 0,63-1,62), míg a kockázata a GC fokozott körében AA genotípus és a H. pylori katalógusa szeropozitivitás (OR 1,44, 95% CI, 0,97-2,14), és AG /GG genotípus és a H. pylori katalógusa szeropozitivitás (OR 2,45; 95% CI, 1,55-3,88). 3. táblázat azt mutatja, hogy a legtöbb fokozott kockázata GC találtak egyének H. pylori
szeropozitivitás és a kockázati genotípust mind a három SNP.
H. pylori katalógusa állapot katalógusa genotípusok katalógusa Controls (n = 334) Matton esetek (n = 335) hotelben Korrigált OR (95% CI) ^{egy fiatal P katalógusa _{c katalógusa érték a
n Matton% Matton n
%
Rs4072037-AG /GG6318.9236.91.00 (ref.) - AA11534.410932.52.46 (1,42-4,27) 0,003 + AG /GG5115.34613.72.30 (1,23 -4,31) 0,017 + AA10531.415746.93.95 (2,29-6,79) 6,5 × 10 -6G × E1.95 (1,41-2,69) 4,9 × 10 -5 bRs13361707-TT5717.1329.61.00 (ref. ) -CT /CC12136.210029.91.50 (0,90-2,50) 0,157 + TT4513.53911.61.51 (0,81-2,80) 0,218 + CT /CC11133.216449.02.68 (1,62-4,43) 5,4 × 10 -4G × E1 0,95 (1,42-2,69) 3,9 × 10 -5 bRs2274223-AA11032.98224.51.00 (ref.) - AG /GG6820.45014.91.01 (0,63-1,62) 0,964 + AA10732.011534.31.44 (0,97-2,14 ) 0,105 + AG /GG4914.78826.32.45 (1,55-3,88) 3,7 × 10 -4G × E2.09 (1,41-3,10) 2,5 × 10 -4 bTable 3. Közös hatásait H . pylori katalógusa szeropozitivitás és változatai a három SNP veszélyére GC.
egy P katalógusa értékeket korrigálni Benjamini és Hochberg módszerét és korrigált kora, neme, a BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát logisztikus regresszió model.b P katalógusa értékei közötti kölcsönhatások genotípusok a három polimorfizmus és H. pylori katalógusa szerológiai logisztikus regressziós modell korrigált életkor, nem, BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát. G x E: gén × környezetben. CSV letöltése CSV}}

A módosítás hatását jelzi jelentősen multiplikatív közötti kölcsönhatások H. pylori katalógusa szeropozitivitás és változatai a három SNP (OR = 1,95, 95% CI, 1,41-2,69 számára rs4072037; OR = 1,95, 95% CI, 1,42-2,69 számára rs13361707 és OR = 2.09,95% CI: 1,41 -3,10 az rs2274223). Sőt, a tesztelés kölcsönhatások szignifikáns maradt (összes P katalógusa _{G x E < 0,05) a három SNP-k és H. pylori katalógusa szerológiai.}

Közös hatása H. pylori katalógusa szeropozitivitás és kombinált változatai három SNP veszélyére GC katalógusa

Tekintettel arra, hogy a három SNP-t az összes kapcsolódó fogadó immunválasz, amit tovább vizsgálták az együttes hatása a kombinált genotípus három SNP-k és H. pylori
fertőzés kockázatának GC. Minden egyénnek tovább alapján csoportosítják a számok kockázati genotípus, az alábbiak szerint: (a) az alacsony kockázatú csoportban (0 vagy 1 kockázati genotípus); (B) a közepes kockázatú csoportban (két kockázati genotípus); és (c) magas kockázati csoportba (három kockázati genotípus), amint azt a 4. táblázat A kockázat genotípusok GC ebben a vizsgálatban voltak AA rs4072037, CT /CC rs13361707 és AG /GG az rs2274223. Összehasonlítva azokkal az alacsony kockázatú csoportba H. pylori katalógusa szeronegativitás egyének más csoportokban minden kockázata nagyobb volt a GC, de jelentős GC kockázatot találtak csak azoknak a magas kockázatú csoportba H. pylori katalógusa szeronegativitás (OR = 2,40; 95% CI, 1,26-4,63), közepes kockázatú csoportba H. pylori katalógusa szeropozitivitás (OR = 2,91; 95% CI, 1,75-4,84), és a nagy kockázatú csoportba H. pylori katalógusa szeropozitivitás (OR = 4,70; 95% CI, 2,49-8,86). katalógusa H. pylori katalógusa állapot katalógusa Kombinált három SNP ^{egy fiatal Controls ( n katalógusa = 334) Matton esetekben ( n katalógusa = 335)
P katalógusa _{c katalógusa érték b katalógusa korrigált OR (95% CI) b
n katalógusa % Matton n katalógusa%
Low-kockázat group7221.63510.41.00 (ref.) - közepes kockázatú group7723.16419.10.0861.63 (0,96-2,77) -Nagy -risk group298.7339.90.0132.40 (1,26-4,63) + Alacsony kockázatú group60184513.40.1941.46 (0,83-2,57) + Közepes kockázatú group7221.610330.71.0 × 10 -42,91 (1,75-4,84) + High- kockázat group247.25516.49.0 × 10 -64,70 (2,49-8,86) 4. táblázat együttes hatása H. pylori katalógusa szeropozitivitás és kombinált változatai három SNP veszélyére GC. katalógusa alow rizikójú (0 vagy 1 kockázati genotípus); közepes kockázatú csoportban (2 kockázati genotípus); magas kockázatú csoportban (3 kockázati genotípus); A kockázat genotípusok AA rs4072037, CT /CC rs13361707 és AG /GG rs2274223.b P katalógusa értékeket korrigálni Benjamini és Hochberg módszerét és korrigált kora, neme, a BMI, a dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát logisztikus regressziós modell. CSV letöltése CSV}}

Effect kölcsönhatásai H. pylori katalógusa szeropozitivitás és változatai három SNP GC kockázati rétegezni TNM katalógusa

Végeztünk alcsoport-analízis szerint rétegzett TNM a tumor stádiuma, hogy értékelje a módosító hatásait változatai a három polimorfizmus közötti összefüggés H. pylori katalógusa szerológiai és kockázatát GC (5. táblázat). Jelentős figyeltek meg kölcsönhatásokat H. pylori
szeropozitivitás és a három SNP-k mind a korai (I vagy II) és késői (III vagy IV) szakaszban GC (mind p
_{G × E < 0,05). A módosító hatásai változatai rs4072037 és rs2274223 a kapcsolódó kockázatot H. pylori katalógusa szeropozitivitás hangsúlyosabb volt az stádiumú képest színpadi III-IV GC. Azonban az rs13361707, a módosító hatás nem jelentősen megváltozott a korai és késői szakaszában GC. Katalógusa H. pylori katalógusa állapot katalógusa genotípusok katalógusa I. vagy II stádiumban Matton III vagy IV stádium
Ca /Co (96/334) hotelben P
c katalógusa érték ^{egy fiatal korrigált OR (95% CI) egy Matton Ca /Co (239/334) hotelben P katalógusa c katalógusa érték egy fiatal korrigált OR (95% CI) egy fiatal rs4072037-AG /GG4 /631.00 (ref.) 19 /631.00 (ref.) - AA31 /1150.0373.83 (1.28-11.44) 78 /1150.0242.17 (1.20-3.92) + AG /GG14 /510.0543.70 (1.13-12.10) 32 /510.0991.95 (0.98-3.86) + AA47 /1050.0046.75 (2.31-19.76) 110 /1055,1 × 10 -43,32 (1,85-5,94) G × E b0.0012.22 (1.38-3.57) 0.0011.85 (1.30-2.62) rs13361707- TT6 /571.00 (ref.) 26 /571.00 (ref.) - CT /CC29 /1210.1042.31 (0.90-5.93) 71 /1210.4341.31 (0.75-2.28) + TT15 /450.0553.02 (1,07-8,51) 24 /450.8051.14 (0.57-2.26) + CT /CC46 /1110.0084.06 (1.62-10.15) 118 /1110.0102.32 (1.36-3.97) G × E b0.0071.91 (1,19-3,06) 1,7 × 10 -41,94 (1,38-2,74) rs2274223-AA22 /1101,00 (ref.) 60 /1101,00 (ref.) - AG /GG13 /680,986 1,01 (0.47-2.15) 37 /680.9651.01 (0.60-1.69) + AA32 /1070,2441 .48 (0.79-2.75) 83 /1070.1881.40 (0.91-2.16) + AG /GG29 /490.0023.27 (1.67-6.39) 59 /490.0072.16 (1.32-3.56) G × E B3.2 × 10 -42,75 (1.59-4.78) 0.0041.87 (1.22-2.87) 5. táblázat együttes hatásai H. pylori katalógusa szeropozitivitás és változatai három SNP GC kockázati rétegezni TNM.
egy P katalógusa értékeket korrigálni Benjamini és Hochberg módszerét és korrigált kora, neme, a BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapot, és H. pylori
szerológiai logisztikus regressziós modellben. Ca: esetek; Co: controls.bInteractions genotípusok között a három polimorfizmus és H. pylori katalógusa szerológiai logisztikus regressziós modell korrigált életkor, nem, BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát. G x E: gén × környezetben. CSV letöltése CSV}}

Vita katalógusa

megerősítette a szövetség három GWAS azonosított SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) GC érzékenység beállítása után a nem, életkor, BMI, dohányzás és az alkoholfogyasztás állapotát, és H. pylori
szerológiai független eset-kontroll vizsgálatban 335 GC esetek és 334 vezérlők a kínai populációban. Az eredmények összhangban voltak az egyesület három GWASs [7-9] és az egyéb nemrég publikált független replikációs tanulmány Kínában [19-21]. Ezek a vizsgálatok azonban minden hiányzott adat H. pylori fertőzés
, és nem voltak képesek alkalmazkodni az esetleges hatást H. pylori fertőzés
. Ezen felül, a tanulmány úgy vélik, hogy az első független replikációs megerősíteni a szövetség között rs13361707 és a kockázat a GC. Emellett rétegződése elemzése daganat helyét mutatta, genetikai variánsai rs13361707 csak társítható jelentősen megnövekedett kockázatát nem-cardia GC, míg genetikai variánsai rs2274223 specifikusan társított jelentősen megnövekedett kockázatát cardia GC a jelen tanulmányban.

Egy másik új elváltozás a vizsgált azonosítása volt jelentős multiplikatív közötti interakciók három SNP-k és H. pylori
fertőzés kockázatának GC. A legjobb tudásunk szerint, ez az első tanulmány a szövetség GWAS azonosított genetikai lókusz GC kockázat figyelembevételével H. pylori fertőzés
. Azt találtuk, hogy a három gyulladással kapcsolatos SNP (rs4072037, rs13361707 és rs2274223) a GWAS szinergizált a H. pylori katalógusa szeropozitivitás felé hajlik a fejlesztési GC. A bemutató közötti interakciók három genetikai variánsok és H. pylori fertőzés katalógusa arra a következtetésre jutottunk, hogy a kockázat a GC nagyobb lesz azok számára, akik a magas kockázatú genotípus és H. pylori
szeropozitivitást. Egyének magas kockázatú genotípus legyen éber, hogy elkerüljék és felszámolása H. pylori fertőzés
. További rétegezés végeztek minden polimorfizmus által TNM daganat stádiuma és azt találtuk, hogy az együttes hatásának H. pylori katalógusa szeropozitivitás és változatai a három SNP a kockázata GC tűnt nyilvánvalóbb a korai stádiumú GC az rs4072037 és rs2274223 mint késői stádiumú GC, de nem jelentősen megváltozott az rs13361707. Ez arra utal, hogy az egyének a kockázat genotípusok a két SNP (rs4072037 és rs2274223) és a H. pylori fertőzés katalógusa ezért valószínűbb, hogy korai stádiumú GC. katalógusa

Ebben a populációban a Hubei tartomány, Kína, H. pylori fertőzés katalógusa aránya 60,6% között, a esetek 47,7% között, a kontroll és pozitív összefüggés azonosították a H. pylori fertőzés
és GC kockázatot. H. pylori katalógusa érintheti tumorogenezisben keresztül sok utat, beleértve gyomornyálkahártya proliferációját és apoptózist, és a gyulladásos választ. A gyulladásos válasz, H. pylori
nemcsak képes aktiválni proinflammatorikus COX enzimek, különösen a COX2, hogy katalizálják a fő lépéseket kialakulását gyulladásos prosztaglandinok [22], hanem, hogy aktiválja a foszfolipáz A2 enzimet, amely katalizálja a kialakulását a prosztaglandin prekurzor arachidonsav [23,24]. A gyulladásos válasz által kiváltott H. pylori
vezet a termelés a mutagén anyagok, mint például az indukálható nitrogén-oxid szintáz, amely indukálja a ROS vagy reaktív nitrogén fajok DNS-károsodást okoznak a gyomor hámsejtek [25,26]. Bebizonyosodott, hogy a gén polimorfizmus számos gyulladásos tényezők, mint például az interleukin (IL) -1β [15], a tumor nekrózis faktor (TNF) -α és IL-10 [16], befolyásolja a fehérje expresszió és amelyek kapcsolatban vannak egy fokozott kialakulásának kockázata hypochlorhydria, gyomor atrófia és gyomor adenokarcinóma kapcsolatos H. pylori
. Emellett, számos tanulmány arról számolt be, hogy a gén polimorfizmusok, beleértve a citokin vagy kemokin gének (például az IL-1β, a TNF-α, IL-10 és IL-8) és a veleszületett immunválasz gének (például a Toll-like receptor és mannóz- kötelező lectin2) reagált a H. pylori fertőzés katalógusa, amelyek kapcsolatban vannak a GC érzékenység [27-30]. katalógusa

Gén-környezet interakciók bonyolultak, ezért a pontos mechanizmust szabályozó közötti kölcsönhatások három genetikai variánsok és H. pylori fertőzés katalógusa még nem tisztázott. Egyes tanulmányok kimutatták, hogy a három GWAS azonosított polimorfizmust 1q22, 5p13 és 10q23 mindegyike a gének, amelyek fontosak a fogadó immunválaszt. Először is, rs4072037 a MUC1 ismert, hogy meghatározza a splicing akceptor hely a szignál peptid régiót [31], és hatással van a MUC1 promóter aktivitás a gyomornyálkahártya [10]. Ezen túlmenően a MUC1 egy receptor számára H. pylori katalógusa [32,33], és egy védőgátat, amely korlátozza akut és krónikus kolonizációja H. pylori
, valamint korlátozza a gyulladás által indukált H. pylori fertőzés katalógusa [33]. További eredmények kimutatták, hogy MUC1 allél hossza jár érzékenység H. pylori katalógusa gyomorhurut és a GC [34,35], és hiányos egerek MUC1 fogékonyabbak a H. pylori katalógusa gastritis [33]. Másodszor, az SNP rs13361707 található, az első intronját PRKAA1 (kódoló-protein-kináz, AMP-aktivált, alfa 1 katalitikus alegység) a 5p13.1. Számos SNP-k egész 5p13.1 régióban társított GC érzékenység és a csúcs jeleket történt a rs13361707 index SNP GWAS [9]. Libioulle et al. [36] azt találták, hogy a genetikai variánsok a 5p13.1 régió közel vannak a PTGER4 gén található, 270 KB-re az irányt a centromer, és korrelál a kvantitatív expressziós szintjét PTGER4.

• PLoS One: leszabályozza a claudin-18 társított proliferatív és inváziós potenciált a gyomorrák a Invazív Front
• PLoS One: CCR7 Expression és Intratumoralis Foxp3 + szabályozó T-sejteket korrelálnak az összesített túlélés és nyirokcsomó-metasztázis Gyomor Cancer