Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: Polymorphism vun DNA Methyltransferase 3B a Association mat Entwécklung an hätt am Gastric Cancer

Wat VerfÜgung

Objective- VerfÜgung

DNA methyltransferase 3B (DNMT3b) spillt eng wichteg Roll am Manque methylation während tumorigenesis. Polymorphism vun der DNMT3b VerfÜgung Gentherapie Afloss kann DNMT3b VerfÜgung Aktivitéit a mat Kriibs Risiko verbonnen gin. Dës Etude fir d'Associatioun tëschent eenzelne Nukleotid schiefgang (SNPs) vun der DNMT3b VerfÜgung Gentherapie, an waat an hätt vun gastric Kriibs ze ermëttelen. VerfÜgung

Method VerfÜgung

Véier honnert an forty- siwen histologically-bestätegt gastric Kriibs Fäll, 111 gastric atrophy Fäll an 961 entholl-gratis Kontrollen waren an der Etude iwwregens. Fënnef Markéierung SNPs (rs6119954, rs1569686, rs4911107, rs4911259 an rs8118663) vun der DNMT3b VerfÜgung Gentherapie sech duerch TaqMan assay genotyped. DNMT3b Ausdrock war zu 104 Kriibs Stoffer vun immunohistochemistry Method bewäert. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

D'Steiren Suivi Zäit fir 422 gastric Patienten mat Iwwregens hätt Informatiounen war 55.1 (51.8-58.5) Mount. Mir hu fonnt, datt Persounen mat der rs1569686 Variant genotype (TG /GG) huet däitlech mat aarmséileg hätt verbonne zu gastric Kriibs am Verglach zu deene Saachen déi TT genotype (HR = 1,43, 95% CI: 1.02-1.99). Dësen Trend ass méi evident an der langfristeg Iwwerliewe vun gastric Kriibs. Ähnlech Resultater ware fir d'G allele wwerreeche vun rs4911107 an T allele wwerreeche vun rs4911259 observéiert wéi dës zwee Siten an komplett linkage disequilibrium mat rs1569686 goufen. D'rs8118663 GG wwerreeche Lien kuerz ze liewen wéi AA /AG genotype (HR = 2,72, 95% CI: 1.45-5.12) an Patienten wunnen méi wéi 2.0 Joer. Keen vun de fënnef SNPs war mat de Risike vun gastric Kriibs oder gastric atrophy assoziéiert. An huet kee Relatioun tëschent eenzel vun de fënnef SNPs an DNMT3b Ausdrock fonnt. VerfÜgung

Konklusiounen VerfÜgung

Dës Etude stellt Beweiser datt DNMT3b VerfÜgung schiefgang soe kann langfristeg Iwwerliewe vun gastric Kriibs . Mä, si weider Studien waren d'Basisdaten biologescher Rollen vun DNMT3b VerfÜgung polymorphism VerfÜgung

Fro opgedeckt:. Wang C, Jia Z, Cao D, Dir L, Jin M, Wu X, et al . (2015) Polymorphism vun DNA Methyltransferase 3B a Association mat Entwécklung an hätt am Gastric Cancer. PLoS NËMMEN 10 (8): e0134059. Doi: 10.1371 /journal.pone.0134059 VerfÜgung

Redakter: Valli De Re, CENTRO di Riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institut, Italien VerfÜgung

Arnaque: 16. Abrëll 2015; Akzeptéiert: 3 Juli 2015; Publizéiert: 11. August 2015 zu

Copyright: © 2015 Wang et al. Dëst ass eng oppen Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz CC BY verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt si vum original Auteur an d'Quell Kaiser VerfÜgung

Data Disponibilitéit: All Daten sinn bannent de Pabeier a seng Ennerstëtzung Informatiounen Fichieren VerfÜgung

Funding:. vun der National Natural Science Foundation of China (81072369, JJ), National Natural Science Foundation of China (81373084, JJ), National Natural ënnerstëtzt Dës Aarbecht huet Science Foundation of China (81273065, XYC), Norman Bethune plangen vun JILIN University (2013025, JJ), de Youth Foundation vun déi éischt Hospital vun JILIN University (JDYY42013014, ZFJ), de Youth Foundation vun déi éischt Hospital vun JILIN University (JDYY42013018 DHC,), an Wëssenschaft an Technologie Development plangen vun JILIN Province (20150414014GH, JJ). D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric Kriibs (GC) ass eent vun de meescht genannten malignant erhéijen an China an et ass déi zweet Virwaat Ursaach vum Kriibs Zesummenhang Doud [1, 2]. Helicobacter pylori VerfÜgung ( H VerfÜgung. pylori VerfÜgung) huet als Grupp ech carcinogen vun gastric Kriibs vun IARC 1994 séiert ginn [3]. H VerfÜgung. pylori VerfÜgung ass och eent vun de Risiko Facteure fir gastric atrophy (GA), déi zu der Entwécklung vun gastric Kriibs Équipe ass [4, 5]. Obwuel d'Halschent vun der Bevëlkerung an d'Welt huet H VerfÜgung. pylori VerfÜgung Wonn, nëmmen e klengen Deel vun hinnen op chronescher atrophic gastritis Fortschrëtter an dann gastric Kriibs. Dës schloen eng méiglech Roll vum Provider genetesch Facteuren an Äntwert ze chronescher H VerfÜgung. pylori VerfÜgung Wonn an gastric Kriibs Entwécklung, dono [6]. VerfÜgung

DNA methylation ass ee vun der epigenetic modulations an ass an Transkriptiouns Regulatioun an chromatin Struktur Remodeling wichteg [7]. Aberrant DNA methylation zu Nepgen-grouss hypomethylation a regional hypermethylation Resultat hätt, deen als eng méiglech Mechanismus vun inactivation vun entholl suppressor Genen Kloeren ass [8-10]. DNA methyltransferase-3B (DNMT3b) ass e de Novo VerfÜgung methyltransferase an iwwer ass zu ville erhéijen, wéi haett Kriibs [11], Broscht carcinomas [12], hepatocellular carcinoma [13] a grousse Adoption ausgedréckt Zell lieft [14]. Eis virdrun Aarbecht gewisen, datt DNMT3b ausgedréckt bedeitend méi héich an Otemschwieregkeeten gastric Kriibs am Verglach zu deem vun der vläit Kontroll Echantillon [15]. A héichen Niveau vun DNMT3b sech gemellt an lymph Node Metastasen vun spillt Kriibs Équipe ze ginn [16] a kuerz globale Iwwerliewe vun de Fouss Servicer sinn Leukämie [17]. Dës proposéiert de méiglech Roll vun DNMT3b zu der Entwécklung an Werdegang vun erhéijen. VerfÜgung

DNMT3b VerfÜgung locates zu chromosome 20q11.2 mat engem total Gréisst vun 47kb. Et war geduecht, datt eenzel Nukleotid schiefgang (SNPs) bannent de Promoteur Regioun vun DNMT3b VerfÜgung Gentherapie Gentherapie Ausdrock Niveauen änneren kann [18]. Virdrun Etuden hunn dat SNPs vun dës DNMT3b VerfÜgung sech mat der waat verschidde Cancers soll, wéi hepatocellular carcinoma [19], haett Kriibs [18], nasopharyngeal carcinomas [20], Broscht Kriibs [7] an gastric Kriibs [21], an Azad et al [22] hu bewisen, dass DNMT3b VerfÜgung rs2424913 polymorphism mat eng fräi iwwerschloen Risiko am Kapp an Hals Kriibs soll war. Dës SNPs sech fonnt der Aktivitéit vun DNMT3b VerfÜgung op DNA methylation un Afloss vun den Niveau vun DNMT3b änneren, esou de waat fir Kriibs modulating [23, 24]. VerfÜgung

Allerdéngs, esou wäit wéi mir wëssen, war kee Pabeier op d'Roll vun DNMT3b VerfÜgung polymorphism an hätt vun gastric Kriibs sinn. Am Moment studéieren, iwwerpréift mir de Veräin tëscht schiefgang vun DNMT3b VerfÜgung Gentherapie an waat gastric Kriibs souwéi gastric atrophy, an clinicopathological Fonctiounen a Punkto Iwwerliewe vun gastric Kriibs an enger chinesescher Populatioun. VerfÜgung

spontan a Methode VerfÜgung

IFLA- Ausso VerfÜgung

Dës Etude vun der Ethik Comité vun der éischt Hospital vun JILIN University ofgeseent gouf. Schrëftlech informéiert Autorisatioune goufen Welpen vun all de Sujeten kritt Deel vun dëser Fuerschung ze huelen. VerfÜgung

Sécuritéit Populatiounsschichte VerfÜgung

nei festgestallte gastric Fäll Kriibs amgaang tumorectomy waren am Departement vun Gastric un der Etude invitéiert an Colorectal befënnt, Eischt Hospital vun JILIN University (Changchun, China) während 2008 bis 2010. a Ganzen 447 Fäll mat histopathologically gastric Kriibs diagnostizéiert sech och an keent vun de Fäll goufen Chimiotherapie oder radiotherapy virewech ze gesin kritt. D'Haapt Medeziner Charakteristiken sech aus dem medezineschen records oder iwwer Telefon Interview gesammelt. Mir definéiert Chimiotherapie wéi eng efficace Behandlung fir op d'mannst 3 zouféieren. D'Patienten scho puer Thes Chimiotherapie regimens, dorënner FOLFOX-4 regimen (Kombinatioun mat 5-fluorouracil, leucovorin an oxaliplatin); XELOX regimen (capecitabine an oxaliplatin); Wéinst Chimioen wéi capecitabine oder 5-fluorouracil gehalen. An der selwechter Period, examinees der Gesondheet Check-up Zentrum ouni entholl Geschicht Richterskala sech am selwechte Spidol zu der Kontroll Grupp invitéiert an 1072 Persounen ënnerschriwwen d'Awëllegung. Ënner hinne waren 150 Sujeten fonnt gastric atrophy vun serum pepsinogen Examen ze hunn an 111 goufen déi Fro an histopathology bestätegt an huet als gastric atrophy Grupp abegraff. Déi reschtlech Sujeten (961) waren an der Kontroll Grupp abegraff. Fënnef milliliters Randerscheinung Blutt war vun all de Bedeelegten gesammelt a gespäichert bei -80 ° C bis Frankräich DNA erauszéien. VerfÜgung

Gastric Kriibs Fäll goufen duerno-up telefonesch Appeller dräi Méint, sechs Méint, an ee Joer no der tumorectomy an all ee Joer méi spéit bis Doud oder de leschten geplangte Suivi. Fäll wier net an d 'Iwwerliewe Analyse agebaut ginn wann (i) si verluer goufen zu Suivi bei der éischte Kéier vun Telefonsnummer Interview, oder (II) si vun komplizéiert vun der chirurgesch Operatioun an der perioperative Zäit gestuerwen. D'Iwwerliewe Zäit war wéi d'Dauer vun der Datum vun chirurgesch Operatioun un der Datum vum Doud definéiert wann d'Patienten gestuerwen waren oder dem Datum vun der leschter erfollegräich Interview wann de Patienten bis d'Enn vun der Etude ze Suivi oder lieweg verluer huet . Survival Zäit war richteg censored ausser datt d'Patienten vun gastric Kriibs gestuerwen waren. VerfÜgung

Grënn vun H VerfÜgung. pylori VerfÜgung Wonn an Diagnos vun gastric atrophy VerfÜgung

Serum Immunoglobulin G (IgG) antibodies zu H VerfÜgung. pylori VerfÜgung, pepsinogen ech (PGI) an pepsinogen II (PGII) vun Aktivitéit-Hausnummeren bewäert goufen immunosorbent assay (Elisa) folgenden d'Uweisunge vum Fabrikant (Biohit, Finnland). Jiddferee mat PGI &Si besteet; 82,3 Dummeldéng /ml an der nennen vun PGI /PGII &Si besteet; 6,05 sech positiv fir Duerchmusterung gastric atrophy an duerno duerch Fro an histopathology duerch gastroscopy [25] validéiert. D'interday souguer gemaach vun Variatiounen (CV) vun der Kontroll Echantillon ënnert Trikoten waren 4,5%, 4,3% an 4,7% fir H VerfÜgung. pylori VerfÜgung IgG, PG sin an PG II, bzw..

IV Empfänger SNPs Auswiel VerfÜgung

Eechenholz der Regioun vun DNMT3b VerfÜgung benotzt SNPbrowser Software v4.0 analyséiert baséiert op der Han Chinese Bevëlkerung an der HapMap Project (06-02-2009 HapMap). Véier IV Empfänger SNPs (tagSNPs, rs6119954, rs4911107, rs4911259 an rs8118663) sech ausgewielt, déi de 22. SNPs vun DNMT3b VerfÜgung mat engem Minimum minor allele Frequenz (MAF) vun 0,05 an engem Pair-schlau Cover konnt r VerfÜgung 2 vun 0,8 oder méi [26]. Zousätzlech, dräi aner SNPs, rs2424913, rs6087990 an rs1569686, huet gehofft och als Kandidat SNPs ausgewielt ginn. Allerdéngs waren nëmmen rs1569686 genotyped als rs2424913 ze niddreg MAF haten (0,012, Daten aus HapMap Project) an rs6087990 war an en absolute LD ( D VerfÜgung '= 1 an r VerfÜgung 2 = 1) mat rs4911107. Endlech, fënnef SNPs, rs6119954 (intron), rs1569686 (Promoteur), rs4911107 (intron), rs4911259 (intron) an rs8118663 (3 'Reliefsailen Regioun) huet fir genotyping ausgewielt. VerfÜgung

Genotyping VerfÜgung

Frankräich DNA war vum ganze Blutt Prouf mat Blutt Frankräich DNA Extraktioun Trikoten folgenden Fabrikant d'Instruktioune (Axygen Biosciences, USA) ofgebaut. Genotypes vun all SNP sech mat der TaqMan genotyping assays folgenden Fabrikant d'Protokoll vun der 384-gutt Placke (Obwuel Biosystems, USA) sech. Message vun primers an Ämter sinn op Ufro sinn. Polymerase Kette Reaktioune (Hinnen alleguer) sech wéi follegt zesummen: 1 Zyklus vun 95 ° C fir 10 min, gefollegt vun 40 Zykle vun 95 ° C fir 15 s an 60 ° C fir 1 min. D'amplification Prozesser sech op BIO-RAD S1000 thermesch cyclers (Bio-Rad, California) Leeschtung an der Final Produiten op eng Abi PRISM 7900 HT liichtkraaftarm heescht liesen sech d'liichtkraaftarm heescht Software V2.3 (Obwuel Biosystems, USA) benotzt. Zwee eidel Kontrollen waren an all 384-gutt assay abegraff d'Software Saachen genotypes z'identifizéieren. Fënnef Prozent vun zoufälleg-ausgewielt zweete Echantillon waren an all 384-gutt Placke fir Qualitéitskontroll abegraff, an d'gesamt concordant Taux huet 99,91%. VerfÜgung

Immunohistochemistry VerfÜgung

DNMT3b Ausdrock vun entholl Otemschwieregkeeten évaluéieren war vun 104 gastric Kriibs Patienten vun immunohistochemistry Method. D'4μm-décke Sektiounen aus Otemschwieregkeeten Bleck sech excised, deparaffinized an Kierchefënster engem streptavidin-biotin immunoperoxidase Technik benotzen. Kuerz, déi Otemschwieregkeeten Rubriken huet Nuecht op 4 ° C mat anti-Mënsch DNMT3b polyclonal antibody (: 200 verdënntem, sc-20704, Santa Cruz, USA 1) incubated. Signaler sech visualized mat 3: 3-Diaminobenzidine (botzt) an der drënner waren mat hematoxylin counterstained. Wéi déi negativ Kontrollen, waren der drënner mat der isotype IgGs als Ersatz vun der Primärschoul antibodies behandelt. D'grousst drënner waren déi zwee onofhängeg pathologists évaluéiert, deen aus Medeziner Donnéeën blinded goufen. D'Fuerscher akzeptéiert HSCORE System gouf benotzt staining Intensitéit an Prozentzuelen vun der Zellen mat engem spezifeschen Magnitude vun Intensitéit Kierchefënster ze bewäerten. D'HSCORE war déi folgend Equatioun berechent: HSCORE = ΣPi (i) (ech = 0, 1, 2, 3, Pi = 0-100%). D'i heescht d'Intensitéit vun staining, i.e. kee staining = 0, schwaach staining = 1, moderéiert staining = 2 a staark staining = 3. Pi duerstellt Prozentzuelen vun Kierchefënster Zellen mat intensities vun 0 op 100% verännerlech. D'HSCORE laut vun 0 bis 300. VerfÜgung

statistique Analyse VerfÜgung

Lafend Daten wéi den Alter an HSCORE Fändelen vun DNMT3b Ausdrock sech als Steiren (25. bis 75. percentiles) zesummegefaasst an am Verglach zur Mann-Whitney U Test oder Kruskal-Wallis Test. Diskussioun Date goufen als Frequenz an Prozentsaz beschriwwen an am Verglach mat χ 2 Test oder Fisher genau Test wann ubruecht. D'Ofstänn vun genotypes vun all SNP sech via direkt Zielen an deviation aus Hardy-Weinberg Gläichgewiicht zu Kontroll Grupp gouf vun engem Gemengeconsellje-vun-fit χ 2 Test évaluéieren alles. Linkage disequilibrium (LD) tëscht Puer biallelic loci war mat zwou Mesuren alles, D VerfÜgung "an r VerfÜgung 2. Geknäppt Logistikzenter Réckgang Analyse gouf benotzt Chance nennen (Örs) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet), mat Upassung fir méiglech confounders (Alter wéi enger Skala Variabel, Geschlecht als Nominalphrasen Variabel an H VerfÜgung ze berechnen. pylori VerfÜgung antibody wéi engem Zweck Variabel). Survival Funktiounen vun der gastric Kriibs Patienten an all SNP sech duerch Kaplan-Meier Method opgezeechent an Verglach vun Log-Gemeng Test. Hazard nennen (SH) mat 95% Well sech benotzt den Afloss vun genotypes vun all SNP op Punkto Iwwerliewe zu ofgedonkelt an sech mat Cox Réckgang Modell berechent. Fir haplotypes mat Ofstänn > 1%, Risiken op waat an Doud iwwerschloen sech un d'Referenz haplotype (grouss haplotype an der Kontroll Grupp) mat der Fra Logistikzenter Réckgang Modell an Cox Réckgang Modell respektiv mat der THESIAS Versioun 3.1 Software [27 bewäert vergläichen, 28]. All Statistik Tester goufen zwee-tailed a P VerfÜgung Wäert &Si besteet; 0,05 war als statistesch relevant ze ginn. Anescht gesot, Analysë uewen waren an SAS 9.1.3 Software (SAS Institut INC, USA) gesuergt. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Betreff Charakteristiken VerfÜgung

A Ganzen 1519 Sujeten, 447 gastric Kriibs Fäll, 111 gastric atrophy Fäll an 961 entholl-gratis Kontrollen waren an dëser Etude mat abegraff. De Charakter vun alle Sujeten am Table 1. De Bäitrëtt Faktoren, Alter a Geschlecht zesummegefaasst sinn, goufen an der dräi Gruppen net uniform verdeelt datt de GC Grupp méi männlech an eeler Sujeten haten. An 69,1% vun de GC Fäll goufen positiv fir H VerfÜgung pylori VerfÜgung, vill méi héich ass wéi d'Kontroll Grupp (49.7%, P VerfÜgung &Si besteet; 0.001). Hierkommen Net- vill méi niddereg wéi den gastric atrophy Grupp (75.7%, P VerfÜgung = 0.176). Well dës Facteuren ënnert d'Auswierkunge vun SNPs, Vergläicher vun genotype Verdeelung verwiesselt ka vun Alter, Geschlecht ugepasst waren an H VerfÜgung. pylori VerfÜgung Wonn. Déi meescht gastric Kriibs Fäll haten intestinal Typ vu Kriibs (87.3%) an 140 Patienten scho Thes Chimiotherapie (31,3%). VerfÜgung

Association vun SNPs mam Risiko vun gastric Kriibs oder gastric atrophy VerfÜgung

Véier SNP loci , rs1569686, rs4911107, rs4911259 an rs8118663, sech konsequent mat der Hardy-Weinberg Gläichgewiicht an der Kontroll Grupp ( P VerfÜgung war 0,321, 0,341, 0,362 an 0,874 bzw.). D'rs6119954 nët, war awer séier aus ass ( P VerfÜgung = 0.0331) emgeleed ginn. Trotzdeem, war dëst nët an der läschter Analyse abegraff zënter der concordance Taux vun der zweete Echantillon vun rs6119954 100% war. Pair-schlau Miessunge vun linkage disequilibrium waren am S1 Table opgezielt. Dräi loci, rs1569686, rs4911107 an rs4911259 zougedréckt komplett linkage disequilibrium ( D VerfÜgung '> 0,98, r VerfÜgung 2 > 0.96). Dofir, nëmmen rs1569686 sech rs4911107 an rs4911259 analyséiert vertrëtt. VerfÜgung

fir déi gemeinsam genotype vun all SNP addéieren, war keen Ënnerscheed op der distributions vun den dräi loci tëscht gastric Kriibs Grupp an d'Kontroll Grupp fir Alter no ugepasst observéiert , Sex an H VerfÜgung. pylori VerfÜgung Wonn (Table 2). Keen allele oder haplotype war mam Risiko vun gastric Kriibs assoziéiert. Ähnlech negativ Resultater goufen op de Risiko vun gastric atrophy (Table 2) kritt. Desweideren, kee Associatiounen sech tëscht SNPs oder haplotype a Gefor vun H VerfÜgung. pylori VerfÜgung Wonn an d'Kontroll Grupp (S3 Table). VerfÜgung

Association vun SNPs mat clinicopathologic Parameteren observéiert vun gastric Kriibs VerfÜgung

Genotypic distributions vun SNPs sech no clinicopathologic Parameteren wéi entholl Gréisst, der Bühn, mannerwäerteg an fernen Metastasen zu gastric Kriibs Fäll analyséiert. Patienten der AA genotype vun rs6119954 Droen déi héich Frequenz vun fernen Metastasen (25.6% vs VerfÜgung. 9,1%, P VerfÜgung = 0.003). An Patienten der AA genotype vun rs8118663 hu méi Undeel vun entholl Gréisst ≥5 cm dotéiert (33.5% vs VerfÜgung. 23,3%, P VerfÜgung = 0.040) (S4 Table). VerfÜgung

Association vun SNPs mat Iwwerliewe vun gastric Kriibs VerfÜgung

Follow-up Informatioune fir 435 (97.3%) gastric Kriibs Patienten bis Februar 2015. Dräizéng Patienten sinn ass gestuerwen vun Thes komplizéiert bannent 30 Deeg um Ufank vun der Etude an dëse Fäll goufen aus der Analyse vun Effekter vun SNPs op Iwwerliewe ausgeschloss. Endlech, waren 422 Fäll vun der Iwwerliewe Analyse abegraff. Während de Suivi, 195 (46.2%) gestuerwen Patienten aus gastric Kriibs, 14 (3,3%) Fäll vun aner Ursaachen gestuerwen, 203 Patienten (48.1%) gelieft a 10 (2,4%) Patienten goufen Suivi verluer. D'Steiren Suivi Zäit war 55,1 Méint (rangéiert vun 1,1 bis 79,2 Méint) fir all Fäll an der Iwwerliewe Analyse abegraff. VerfÜgung

Analysë Cox Réckgang war standing der Associatioun vun DNMT3b VerfÜgung genotypes ze diskutéieren op Iwwerliewe vun gastric Kriibs der dominant oder recessive Modell benotzt. Mir hu fonnt, datt rs1569686 TG /GG Variant genotype mat engem statistesch relevant 43% geklomm Risiko vu Doud am Verglach zu den TT genotype an der dominant Modell verbonne war. Desweideren, Tendenz vun Auswierkungen op langfristeg Iwwerliewe konnt aus der Iwwerliewe Diagrammen observéiert ginn. Dofir Analysë Ënnergrupp waren an Patienten wunnen méi wéi zwee Joer gesuergt. Patienten Träger G allele (TG oder GG genotype) vun 1569686 gouf fonnt ze liewen kuerz wéi déi vun TT genotype (HR = 2,46, 95% CI: 1.29-4.69, P VerfÜgung = 0.006) no fir Alter ugepasst, Geschlecht, TNM Etapp an Chimiotherapie der tumorectomy (Lalumi 1A). Ähnlech Resultater ware fir d'G allele wwerreeche vun rs4911107 an T allele wwerreeche vun rs4911259 am Allgemengen Iwwerliewe vun gastric Kriibs (Table 3) observéiert. An deene Saachen GG genotype vun rs8118663 Lien wéi enger allele wwerreeche kuerz Iwwerliewe Zäit ze hun (AA oder AG) no ugepasst fir Alter, Geschlecht, TNM Etapp an Chimiotherapie der tumorectomy (HR = 2,72, 95% CI: 1.45-5.12, P VerfÜgung = 0.002) (Lalumi 1B). VerfÜgung

Association tëscht SNPs an Ausdrock vun DNMT3b VerfÜgung

DNMT3b Ausdrock vun kriibserreegend Otemschwieregkeeten vun 104 gastric Kriibs Fäll benotzt immunohistochemical Method bewäert huet. DNMT3b Ausdrock gouf meeschtens zu Zell Keimzell observéiert an Niveau vun Ausdrock sech héich (HSCORE > 200) an 64 Fäll (61.5%), moderéiert (100 &Si besteet; HSCORE≤200) an 30 (28.8%), déif (HSCORE≤100) an 2 (1,9%) an negativ (HSCORE = 0) zu 8 (7.7%). Resultater vun Ausdrock laut genotypes vun den dräi SNP loci zu Table 4. Mä dës waren, konnt keen Ënnerscheed vun DNMT3b Ausdrock ënnert genotypes vun all SNP observéiert ginn. VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

Am Moment studéieren , mir d'Roll vun Varianten vun DNMT3b VerfÜgung Gentherapie zu der Entwécklung an hätt vun gastric Kriibs zu enger grousser Populatioun systematesch lant. Mir hu fonnt, datt rs1569686 TG /GG genotypes vill mat aarmséileg Iwwerliewe vun gastric Kriibs verbonne waren. Ausserdeem, observéiert mir dass DNMT3b VerfÜgung schiefgang langfristeg Iwwerliewe vun gastric Kriibs Afloss an den Effet ass och staark an Patienten wunnen méi wéi zwee Joer. VerfÜgung

Déi meescht Wierker nëmmen op d'Roll konzentréieren publizéiert vun DNMT3b VerfÜgung an der carcinogensis vun verschiddenen malignancies. Souwäit mir wëssen, ass dat déi éischte Rapport d'Associatioun tëschent DNMT3b VerfÜgung polymorphism an gastric Kriibs Iwwerliewe vun enger chinesescher Populatioun beschreiwen. Eis aktuell Etude gewisen, dass DNMT3b VerfÜgung zu der langfristeg Iwwerliewe vun gastric Kriibs matgehollef Varianten. D' DNMT3b VerfÜgung rs1569686 Variant TG oder GG genotype wwerreeche zougedréckt fräi HR mat enger P VerfÜgung -value vun 0.036 (HR = 1,43, 95CI: 1.02-1.99) wann Verglach mat TT Wildwest-Typ. Nieft, eenzel dotéiert G allele vun rs1569686 (TG oder GG) hunn 2.46-fantastesch Erhéijung vun veruerteelt Risiko wéi Net G allele wwerreeche zu Patienten wunnen méi ewéi 2 Joer (Lalumi 1A), an Individuen rs8118663 GG genotype Droen éischter héicht Risiko ze hunn an der langfristeg Iwwerliewe (Lalumi 1B). VerfÜgung

Mir weider fir d'éischte Kéier propagéieren der Associatioun tëschent DNMT3b VerfÜgung schiefgang a Krankheete Charakteristiken vun gastric Kriibs Patienten. Patienten déi rs6119954 AA genotype Droen déi méi dacks vu wäit Metastasen suggeréiert datt rs6119954 polymorphism kann an der Werdegang vun gastric Kriibs Équipe ginn. Den Zerfall, Patienten mat genotype rs8118663 AA Lien groussen entholl Gréisst (≥5cm) ze hunn, proposéiert, datt rs8118663 SNP eng Roll an der entholl Werdegang vun GC Patienten spille kann. Geholl zesummen, all dëse Conclusiounen Gewise predictive Wäert vun DNMT3b VerfÜgung schiefgang fir de Werdegang an Iwwerliewe hätt an Patienten mat gastric Kriibs. VerfÜgung

Den DNMT3b VerfÜgung Gentherapie encodes DNMT3b, engem Familljemember vun DNA methyltransferase datt zu engem Netzwierk vu biologesche Prozesser bedeelegt, dorënner entholl Entwécklung an tumorgenesis [29]. E puer hun virdrun Studie gewisen datt schiefgang vun DNMT3b VerfÜgung sinn an enger Rei vun erhéijen mat Kriibs Entwécklung assoziéiert. Shen et al [18] gemellt éischtens, dass d'wwerreeche vun T alleles, besonnesch heterozygous (Kosovo) vun rs2424913, hu bal 2-fantastesch fräi Risiko vun haett Kriibs Risiko Verglach zu der homozygous CC genotype vun Caucasian Populatioun. Ausserdeem, dat C-ze-T gemeinsam genetesch Variant am DNMT3b Promoteur huet un ëmmer Erhéijung mRNA Ausdrock fonnt [30]. Allerdéngs konnt d'Roll vun rs2424913 op Kriibs an Chinese negligible gin wéi den C allele zu chinesesch Populatioun feelen oder rare ass [20], d'Bedeitung vun enger grousser Diversitéit vun DNMT3b VerfÜgung SNP Verdeelung wéinst verschidden ethnesch Gruppen kënnen onbekannter Ëmwelt- Faktoren oder de System léisst tëscht Ëmwelt Faktoren a genetesch predisposition. D'rs1569686 war gemellt fir mat de waat haett Kriibs verbonne ginn [31] an gastric Kriibs [21] awer net zu hepatocellular carcinoma [19], esophagus Kriibs [32] an nasopharyngeal carcinoma [20]. An enger leschter Analyse meta-baséiert op 24 case-Kontroll Studien, déi DNMT3b VerfÜgung rs1569686 G allele als niddereg Risk Faktor ass fir Entwécklungslänner colorectal Kriibs [33] identifizéiert. D'rs1569686 ass am CpG aarmséileg Promoteur Regioun läit. Kënschtlech Promoteur assay hunn bekannt ginn dass rs1569686 polymorphism net de transcriptional Aktivitéit vun der heescht Afloss DNMT VerfÜgung Promoteur [34], mee genau Mechanismen schiddene onbekannt. Eng Etude vun Lee et al [35] weisen datt d'rs6087990 an de Promoteur Regioun vun DNMT3b VerfÜgung, déi am komplette LD mat rs1569686 war, hätt de Promoteur Aktivitéit vun DNMT3b VerfÜgung, déi Transkriptiouns änneren Aktivitéit vun den T allele war vill méi niddereg am Verglach mat der C allele, mä de rs1569686 polymorphism Afloss net de Promoteur Aktivitéit. An eiser Etude, huet awer mir net all Veräin vun rs1569686 mat der Entwécklung vun gastric Kriibs oder gastric atrophy, eng wichteg Risk Faktor fir gastric Kriibs (Table 2) fest. Och, mir hu fest keng Ennerscheeder vun DNMT3b Ausdrock am genotypes vun all SNPs immunohistochemistry Method benotzt. D'Basisdaten Mechanismus vun DNMT3b VerfÜgung op gastric Kriibs brauch an Zukunft Studien Keess ze ginn. Anere Siten, rs2424908, déi am komplette linkage disequilibrium mat rs8118663 ass ( r VerfÜgung 2 = 0.956), huet och zu entholl gin Équipe, wéi esophagus Kriibs [32] an colorectal Kriibs fonnt ginn [ ,,,0],34]. Allerdéngs, an eise studéieren, konnt keen positiven Associatioun mat gastric Kriibs observéiert ginn. Ähnlech fir eis Conclusiounen, Yang et al gemellt dass DNMT3b VerfÜgung rs2424908 schiefgang sech net mat dem waat bis gastric Kriibs am Süde chinesescher Bevëlkerung verbonnen [36]. Dofir, méi Studien gebraucht gin kann d'Roll vun genetesch polymorphism vun DNMT3b VerfÜgung zu der Entwécklung vun gastric Kriibs ze schléissen. VerfÜgung

Zwee Aschränkungen soll an eiser Etude gezu ginn. One war déi eenzeg SNPs mat engem Minimum minor allele vun 0.10 oder méi sech wéinst der Selektiounscritèren abegraff. Low Frequenz Variatioune kann och mat Kriibs Entwécklung wéi rs2424913 vergläichen [22]. Weider Etude der SNPs mat niddereg Frequenz Eechenholz ass waren. Wéinst eent ass, datt de Suivi Zäit fir gastric Kriibs Fäll schéngt genuch als meeschte Fäll op der rietser Säit vun der Iwwerliewe Diagrammen censored sinn. Aflëss vun SNPs op langfristeg Iwwerliewe net komplett Adress kéint wann e Trend observéiert ginn hätt. Allerdéngs, wann déi Fäll un Ënnergrupp stratified lieft méi wéi zwee Joer, eng bedeitend Veräin op langfristeg hätt observéiert ginn hätt. Trotzdeem, Roll vun DNMT3b VerfÜgung op gastric Kriibs wäerten an Zukunft revaluated an aktualiséiert ginn, wéi de Suivi nach éierlechen ass. VerfÜgung

Konklusiounen VerfÜgung

Am Resumé, mir fannen schiefgang vun DNMT3b VerfÜgung kann de globale Iwwerliewe vun gastric Kriibs betreffen, proposéiert d'Potential vun DNMT3b VerfÜgung SNPs als nëtzlech Bewaacher globale Iwwerliewe vun gastric Kriibs ze soe, besonnesch bei Patienten Eos méi wéi zwee Joer. Mä mir hu fest keng bedeitend Associatiounen tëscht DNMT3b VerfÜgung Varianten an Risiko vun gastric Kriibs oder gastric atrophy. Weider Ermëttlungen gi waren ze voll d'Roll vun den DNMT3b VerfÜgung op gastric Kriibs an aner ethneschen Populatiounsschichte klären. VerfÜgung

Informatiounen Ennerstëtzung VerfÜgung S1 Table. Linkage disequilibrium Ech ( D VerfÜgung ') a r VerfÜgung 2 tëschent DNMT3b VerfÜgung htSNPs VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s001
(DOCX) VerfÜgung S2 Table. Séminairen Donnéeën vun gastric Kriibs Patienten VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s002 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung S3 Table. Association vun SNPs a H VerfÜgung pylori VerfÜgung Wonn an d'Kontroll Grupp VerfÜgung Doi:.. 10,1371 /journal.pone.0134059.s003 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung S4 Table . Distributions vun genotypes no Medeziner Parameteren an gastric Kriibs Fäll VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s004 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung S1 Data ënnerstëtzen. D'Medeziner Donnéeën an genotype Ofstänn vun DNMT3b Gentherapie schiefgang zu Fäll a Kontrollen VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s005 VerfÜgung (XLS) VerfÜgung

Arbeschterlidder VerfÜgung

D'Auteuren géif gären all vun deene Merci, déi, virun allem zu Ying Song fir hir Aarbecht op Suivi vun de Sujeten an Chang-Song Yinan fir seng technesch Ënnerstëtzung vun dëser Etude deelhuelen. VerfÜgung

Other Languages